4C7GA

Structure and activity of the gh20 beta-n-acetylhexosaminidase from streptomyces coelicolor a3(2)
Total Genus 187
50100150200250300350400450050100150
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
494
structure length
494
Chain Sequence
AEPTPLDRVIPAPASVEPGGAPYRITRGTHIRVDDSREARRVGDYLADLLRPATGYRLPVTSHGHGGIRLRLAEGPYGDEGYRLDSGREGVTITARKAAGLFHGVQTLRQLLPAAVEKDSAQPGPWLVAGGTIEDTPRYAWRSAMLDVSRHFFSVDEVKRYIDRVALYKYNKLHLHISDDQGWRLAIDSWPRLATYGGSTEVGGGPGGHYTKADYEEIVRYAASRHLEVVPEIDMPGHTNAALASYAELNCDGVAPPLYTGTKVGFSTLCVDKDVTYDFVDDVLGELAALTPGRYLHIGGDQAHSTPQADFVAFMKRVQPIVAKYGKTVVGWHQLAGAEPVEGALVQYWGLDRTSDAEKAQVAAAARNGTGLILSPADRTYLDMKYTKDTPLGLSWAGYVEVRRSYDWDPAAYLPGAPAEAVRGVEAPLWTETLSDPDQLDFMAFPRLPGVAELGWSPASTHDWDTYKVRLAGQAPHWEAMGIDYYRSPQVPWT
50100150200250300350400450400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces coelicolor
publication title Structure and Activity of the Streptomyces Coelicolor A3(2) Beta-N-Acetylhexosaminidase Provides Further Insight Into Gh20 Family Catalysis and Inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
total genus 187
structure length 494
sequence length 494
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2013-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4c7gA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4c7gA01
3K4DA 3WY1A 4U3AA 1JDDA 2GVYA 4LYQA 1E4MM 5IXEA 2CYGA 4ML4A 4FLQA 1UUQA 1PX3A 4J3VA 4EANA 1HKIA 4W8AA 3VIIA 4AEEA 3ZT7A 4P7OA 2CIPA 2GJXB 3WF2A 3RPMA 1LLOA 1HT6A 4AZIA 5I79A 3N13A 3QR3A 3ARTA 1UD2A 3FNDA 4NZCA 2VJXA 1ISVA 2DH2A 3PHAA 4KGLA 4HMCA 4P8VA 3VGBA 3GDBA 1JAEA 1FH7A 2J7DA 1V6XA 3PZIA 4KWUA 1UA7A 2J74A 3I3EA 4P7LA 4NF7A 4AC1X 3UERA 5BCAA 1C90A 1QHZA 1H4PA 1O6IA 4WSKA 5E9AA 1KGUA 1XYZA 4Z2LA 5A3HA 4MB3A 1PX8A 2MANA 2XFFA 2J7CA 2HVMA 4PN2A 1W9BM 4PTVA 1C8XA 4J3WA 4Z2JA 1WDPA 1H0GA 3VILA 4P8WA 4TX8A 3ARUA 4MNLA 1E9LA 2WKLA 1VFUA 4AZHA 4CVWA 1UWRA 2WZHA 4M82A 1KWKA 4EK7A 1VAHA 3BAXA 3DHPA 3O9NA 2NT0A 1A47A 2FGZA 3OA5A 2VVNA 5HPOA 1TA3B 2Y2WA 3EYPA 1DP0A 1PIFA 3L4YA 2W5FA 3A4AA 4W7UA 4C90A 2GK1A 3GNOA 4PMQA 1EDQA 1OGSA 4AYSA 4D1IA 4XX6A 4RE4A 1MQQA 4GKLA 1DWGM 3NSMA 2W66A 4DWSA 4DUWA 3KL0A 2X8RA 5EFFA 2WCSA 2WWCA 1VFFA 4HOZA 4A3HA 3WH5A 1ZU8A 3ARXA 3BH4A 4OUEA 1E3XA 4XB3A 2DDXA 1ISYA 3BAJA 3NSNA 5DEZA 4M29A 3WDJA 1US2A 2WZEA 3UEQA 1DWFM 1WZLA 4H8VA 1LJYA 2YDQA 3WQ6A 2VCAA 1GORA 5EMYA 4QLJA 2D0HA 4XV0A 4ACZA 3BMWA 3VD9A 1JYNA 4IPLA 4V28A 1H2JA 4K68A 1OWQA 4BZYA 5BXPA 3VTRA 5I5RA 4GI6A 5A8NA 3WD2A 4PUEA 2VURA 3AIQA 3PZTA 2PF0A 1WZMA 2YLAA 4HMDA 5I3DA 2WW5A 3WENA 5CSYA 1KR1A 3K4AA 1E1EA 2WMFA 1B3YA 4PCSA 3W6LA 4C91A 5GNYA 4CCEA 2ZUTA 3AHVA 1XSKA 4JCMA 2D0GA 1B3VA 4C7DA 2VX5A 4H7VA 1SMAA 1CXKA 1NOUA 1Y7VA 2WYSA 4P7RA 3PZMA 4GPNA 1HJXA 1HJQA 1WNOA 2WNWA 4MNJA 1UWTA 1DTUA 4KRUA 3GBDA 1EDTA 2X0HA 3VNZA 3VINA 4D71A 4E2OA 1EQCA 4E8CA 1QBAA 3FHQA 4L4PA 1ZS2A 1H49A 1BPLB 1C8QA 3CZJA 1LL7A 3CUFA 4OZOA 4HPHA 4AIEA 4CGTA 3GM8A 4N0RA 4GIAA 3WD0A 3BSGA 3QOKA 3TOPA 4CD7A 4PTWA 3GTNA 1E6SM 3N9KA 2GJPA 1Q6CA 3AIWA 3MMWA 3W81A 4XUYA 1TFVA 3WUBA 1UD3A 4W93A 1QW9A 3WF0A 2YBUA 1CLXA 2CCRA 3SUVA 3MSGA 1JGIA 2FDMA 4H8HA 2EBNA 3BSHA 3F5LA 3VIHA 1V03A 4YHGA 2ZXBA 1Q6EA 3A4XA 2ZX8A 3ZQ9A 5FD0A 5D9NA 4D72A 1GOIA 4W87A 5ABEA 1CWYA 3PN8A 5A6JA 4OJYA 2WC4A 3VGHA 1UQYA 4D6IA 1N82A 1DEDA 3BGAA 1EO5A 1LL6A 1ODUA 1W2PA 3AIBA 4UFKA 2GDUA 1W91A 4FLOA 3U5YA 4AWEA 3AMCA 5DO8A 5DT7A 4S3JA 3TTSA 2WVUA 5A6BD 3U7BA 5CLTA 1H5VA 2X0YA 3BCFA 1W9UA 4CU6A 3DC0A 1UYQA 3PZUA 2G41A 3VDBA 2BVTA 3GXMA 1ISWA 3VNYA 4AZBA 4DWSC 2WWDA 4D6GA 1J12A 4NRSA 3OGVA 3T2OA 3W6MA 3VDHA 2JF6A 3W26A 2PC8A 3AICA 3ARRA 4D6HA 4TVDA 3VD4A 2CBJA 1J0KA 2OYLA 1DHKA 4H41A 3CLWA 3PBGA 1C91A 4OKDA 5AC4A 4HOXA 2CHNA 1QI3A 4A3YA 3WSUA 2E9MA 2WC7A 2J7EA 2ZX5A 4B16A 4QAWA 2WVVB 1PZ2A 1B3ZA 5LYRA 3AHXA 1UG6A 2J47A 3KZSA 3MU7A 2V3FA 2VR5A 2ZX7A 1V3LA 1DWJM 1VFOA 1RPKA 1OBAA 1MQPA 4M1RA 4W7VA 3GYCA 5ABHA 1ZJBA 1NARA 2A3BA 5CJ5A 3SCQA 2JF7A 1H09A 2PWEA 3FW6A 3PZ9A 1TG7A 3E1F1 2V3EA 1Q6DA 2VRKA 1V0LA 3D5HA 1WAWA 2D0FA 2WZIA 3DECA 1UH3A 3BAIA 2V38A 3ECQA 3WMCA 3BLPX 1WO2A 1ISXA 3VOCA 4PCTA 3WD1A 2WHLA 4R27A 5HNNA 1ZBWA 5JIPA 5A94A 3ARVA 4RE3A 1V02E 1UZ1A 1XSJA 4E4PA 3T08A 3RM4A 4J27A 1UKSA 2CNCA 3AIVA 1GOKA 1D7FA 2CBVA 2BVYA 3B9AA 3ARQA 5A95A 3WELA 2A3EA 2WMGA 2VUYA 1XH2A 1UH2A 1KGWA 2EXOA 3ZIZA 1CGWA 5JUVA 5F7UA 3GH4A 1ECEA 1R7AA 3VGEA 1GW1A 1ZB5A 4J3SA 5EB8A 4JKLA 3B9DA 1OGBA 2DQXA 1CEOA 3ARSA 2XIIA 1EIBA 5GNXA 1E5NA 3FHAA 5DT5A 3NSXA 2WLZA 2J7BA 7TAAA 1IZJA 1C7SA 3N15A 3LPPA 3WBAA 2XHYA 1B90A 3VUPA 3QHMA 5I2UA 3FXYA 4CUCA 2NW0A 2JE8A 4C7FA 5CLWA 5IDIA 5KEZA 3CZ8A 1W3LA 3WF1A 4OIFA 2UY2A 2Y8KA 3OB8A 3ZR6A 2Z1KA 1FP8A 2GJRA 3SCSA 3AXIA 1JDCA 5I78A 1JZ4A 1OSEA 5E6ZA 2FHFA 4UFMA 3WQWA 1Q6FA 3WEOA 1H41A 1QI0A 3RM8A 3ZJ8A 1W3JA 3MUZ1 4UQDA 3EDJA 2D3LA 2WHJA 2EPOA 4E8DA 5A2BA 1UWIA 4M24A 3OLGA 1VEMA 2E0PA 3TTOA 4D6JA 5HOSA 2WB5A 3SCNA 3PTKA 3IJ7A 1JD7A 4MJ2A 1FP9A 3UCQA 2QV4A 3K8KA 1KB3A 3VD3A 3UG4A 4IPNB 3VO0A 1AQMA 2YOCA 1MXDA 1UZ4A 3THDA 2CITA 2TAAA 1TE1A 2VZOA 4N42A 2X1IA 2VO5A 3VIPA 7CGTA 3SCTA 5HPCA 3UG3A 2DSVA 1W1YA 3L4VA 2O92A 1KBBA 3U57A 2Y8VA 4W84A 1BYDA 4BQ5A 1BYBA 2UY3A 2E4TA 2ZUVA 1VRXA 2QHAA 1V6WA 1W1TA 1NP0A 2DEPA 3MS8A 2OYMA 3WDIA 2BHUA 3M46A 5AY7A 5IFTA 1AQ0A 1BG9A 4PTMA 3HN3A 3SCOA 1G9HA 4ZE4A 5I6SA 2DT0A 3AISA 3WN6A 1CXFA 1KWGA 4B15A 4FLRA 2FH8A 4NSBA 4WKAA 5E6YA 5BRQA 1MVYA 2F8QA 1UD5A 1BHGA 1J9YA 2YKKA 3AQUA 4AD5A 2HISA 1EA9C 8CGTA 1H1NA 1UHVA 3GXIA 3N18A 3O6AA 4JL2A 5HDRA 3N1AA 3IANA 4IM4A 3WUFA 2WCAA 2W61A 1O7AA 1OT2A 5I0DA 4HU0A 3UR8A 4AD0A 2ZE0A 1CPUA 3F5KA 6CGTA 2DT1A 4PTXA 4UQ9A 2QMJA 3B9EA 3AZRA 4LX4A 4JFSA 1MFUA 2ESCA 5GQBA 3TTQA 1EHAA 3FAXA 3G6LA 3FAWA 2V3DA 2WSPA 1FA2A 3WNOA 3ZOAA 4AD4A 1MWOA 4AD2A 3L4WA 1UR9A 2BY1A 4NI3A 3VDCA 4CU7A 3AS1A 1OINA 4PMXA 2WK2A 1TMQA 1JYWA 3WF3A 4PSRA 2Q8XA 5A6AA 1GZJA 5FL1A 1ISZA 1VBUA 1UD4A 3PTQA 4QFUA 2DH3A 1JXKA 4PEEA 2XVNA 1EXPA 1G1YA 1CGXA 3A6OA 1FFRA 1US3A 4MDPA 4W8BA 1K9TA 1SR0A 1VFMA 2FH6A 1HL9A 3WIJA 5LA2A 4Z2IA 5ECUA 1PBGA 1X1NA 2DPEA 2WMHA 2J62A 3K1DA 3BMVA 3GNPA 4V27A 1UR2A 1MQRA 4QDMA 1J18A 1E56A 2ZUUA 1PJ9A 3VX1A 1RP9A 2VL4A 5KZ6A 4MJ4A 1J0JA 4ZFMA 1JI2A 2XM1A 4UZSA 1CYGA 4B9ZA 2E8ZA 1JNDA 1GQLA 4HZ7A 2WVVA 4ZXOA 4UOZA 1VJZA 4Q7NA 1R8LA 4BF7A 4MTVA 2OYKA 2VZSA 4WF7A 2ZXAA 5BXTA 3NUKA 1E71M 2BFGA 1XD1A 3GBEA 1CXHA 2CBUA 3AYSA 4M8UA 4H2CA 1X6NA 2W67A 2FHCA 4JKMA 1C3FA 1C7TA 1GPFA 1UR0A 2XSAA 1QW8A 1CDGA 1LG2A 1B3WA 3PZQA 1V0KA 1UH4A 3AS0A 4JFTA 4A4AA 4M56A 3K8LA 2G3JA 4B3LA 3RJYA 2WBGA 2WLYA 2W63A 4WSJA 3MV01 1RP8A 1Q6GA 2NT1A 1EQPA 3VGDA 1VENA 2CETA 1TCMA 3SCWA 3T2PA 2J75A 3T2QA 3SCUA 3VIFA 2AMGA 1E6NA 2VQTA 4TOQA 2WMIA 4F79A 1V3JA 1W3HA 1W2VA 4BQ2A 2YA1A 1UR1A 3K46A 1V6UA 2XPKA 2WVTA 4ZEPA 3VVGA 3AROA 3WQ5A 1MYRA 1B9ZA 4MADA 1MFVA 2D24A 5C8BB 4TUFA 1WDSA 4MNKA 3N12A 1UR8A 4DM2A 1CGYA 2VQUA 1QNRA 4Z2GA 1GUVA 2C8NA 1BYAA 1F4AA 1FOBA 4AZCA 3UG5A 5CGMA 2EJ1A 5I24A 3W0KA 3W53A 5IFPA 2XIBA 1VEPA 2VCBA 1LL4A 4CD6A 4F8XA 3LPOA 1J01A 5JIWA 4BQ4A 1CLVA 4MPKA 1DWIM 1XH1A 3WDQA 2W62A 4PMNA 4F66A 5I77A 3M7SA 1BGAA 1KFWA 5D9MA 4MDOA 4U2ZA 1HJUA 1RD6A 4QLLA 3HU7A 4QLKA 4PMRA 1WDRA 4GZJA 2XGBA 4H8UA 4WK9A 4LYPA 1JG9A 3MMUA 1QVBA 1RH9A 3MV11 3VIJA 1U30A 4QP0A 2YLLA 1W9DM 6TAAA 3ZJKA 2JEQA 3ALFA 4D1JA 3OLDA 3GNRA 3OBAA 3SUTA 1SMDA 1BVNP 2PB1A 1B2YA 2NSXA 4EAMA 2YL6A 5FIPA 3CZKA 1GOMA 4JCLA 5ABFA 3UESA 4W5UA 4ZXLA 1HKJA 2PWFA 3AXHA 3VX0A 1ZJAA 2ZUMA 3ZJ6A 4IUGA 2XG9A 3AXXA 1HN1A 1E0VA 1SFSA 1C93A 1WZKA 1XC6A 1K9DA 3KWXA 4U5KA 4ATWA 2ZICA 2AAAA 2VTFA 2W91A 1JF6A 1FHDA 4ATLA 8A3HA 1OB0A 1MW0A 3WD3A 3CIVA 3MMDA 1A3HA 5A6SA 3OLEA 3AMDA 5E09A 2IXVA 3MUY1 5FOOA 5A8OA 1J11A 4AD1A 1HKMA 2WXDM 4CN1A 2ZIDA 3F4VA 1FH8A 1PZ3A 1U2YA 3AMKA 4UR9A 4NRRA 2RGLA 3AS2A 1JZ7A 2EO7A 1GQKA 5BYWA 1OGGA 4BS0A 1EOKA 4UOJA 3THCA 1IV8A 2FHBA 2IUZA 3NIYA 3GZAA 4GZEA 1L0PA 3T0BA 4Q22A 3L4UA 4CN4A 4DUXA 5A6BA 1J0YA 2O9TA 2E8YA 3ZT6A 1R87A 4P7NA 3TTYA 3KL3A 1R86A 3AHYA 3CZGA 1IZKA 3OG2A 4U3CA 2PWDA 2GJXA 1L8NA 4X0NA 1ZBCA 2XSBA 1BYCA 3D3AA 1BTCA 4OOUA 2XWEA 3NJ3A 1CXIA 5BXSA 3AHZA 5GNZA 4DWSB 1BQCA 4P8UA 1WKYA 3TA9A 4BQ3A 4J28A 4L4OA 4YN5A 3AYRA 1MW2A 1JZ6A 3W38A 4HA3A 5TD4A 2WHKA 3DYOA 1EO7A 2V5CA 4CCCA 1EH9A 3WUEA 1FH9A 1W32A 5I23A 2CESA 4RL3A 2G3IA 1PEZA 5GPRA 2JIEA 3AI0A 1BLIA 3CUHA 4UTFA 2RGMA 1XSIA 2VOTA 2YDRA 4PMUA 3M07A 1UKOA 2XFRA 3U7VA 1E70M 2C0HA 2UY5A 3PZNA 3OIHA 4JAWA 3WNLA 4EE9A 4TVCA 2XFYA 4PMOA 4GI9A 1XCXA 3VMNA 3WNMA 4ZENA 3ZJ7A 2B31A 2WMJA 1AMYA 2ZWZA 4W89A 3WMBA 3NCOA 1QBBA 1KXTA 4LYRA 1EDGA 3VKKA 1W9XA 4HOWA 3L2MA 1B1YA 3DYMA 3S2CA 3VD5A 1TA3A 1BSIA 4YHEA 4CD4A 4JHZA 4PBGA 2OSWA 4UOQA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3K4D A;  3WY1 A;  4U3A A;  1JDD A;  2GVY A;  4LYQ A;  1E4M M;  5IXE A;  2CYG A;  4ML4 A;  4FLQ A;  1UUQ A;  1PX3 A;  4J3V A;  4EAN A;  1HKI A;  4W8A A;  3VII A;  4AEE A;  3ZT7 A;  4P7O A;  2CIP A;  2GJX B;  3WF2 A;  3RPM A;  1LLO A;  1HT6 A;  4AZI A;  5I79 A;  3N13 A;  3QR3 A;  3ART A;  1UD2 A;  3FND A;  4NZC A;  2VJX A;  1ISV A;  2DH2 A;  3PHA A;  4KGL A;  4HMC A;  4P8V A;  3VGB A;  3GDB A;  1JAE A;  1FH7 A;  2J7D A;  1V6X A;  3PZI A;  4KWU A;  1UA7 A;  2J74 A;  3I3E A;  4P7L A;  4NF7 A;  4AC1 X;  3UER A;  5BCA A;  1C90 A;  1QHZ A;  1H4P A;  1O6I A;  4WSK A;  5E9A A;  1KGU A;  1XYZ A;  4Z2L A;  5A3H A;  4MB3 A;  1PX8 A;  2MAN A;  2XFF A;  2J7C A;  2HVM A;  4PN2 A;  1W9B M;  4PTV A;  1C8X A;  4J3W A;  4Z2J A;  1WDP A;  1H0G A;  3VIL A;  4P8W A;  4TX8 A;  3ARU A;  4MNL A;  1E9L A;  2WKL A;  1VFU A;  4AZH A;  4CVW A;  1UWR A;  2WZH A;  4M82 A;  1KWK A;  4EK7 A;  1VAH A;  3BAX A;  3DHP A;  3O9N A;  2NT0 A;  1A47 A;  2FGZ A;  3OA5 A;  2VVN A;  5HPO A;  1TA3 B;  2Y2W A;  3EYP A;  1DP0 A;  1PIF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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