4EAMA

1.70a resolution structure of apo beta-glycosidase (w33g) from sulfolobus solfataricus
Total Genus 198
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
489
structure length
483
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDGYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-galactosidase
publication title Designing allosteric control into enzymes by chemical rescue of structure.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus p2
total genus 198
structure length 483
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2012-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4eamA00
4JFSA 1E6XM 2AMGA 2CIPA 1HJXA 1UQZA 5IHSA 5A6BD 1C92A 4UFIA 1HNYA 3W0KA 1TVPA 2EPLX 2JIWA 1WKYA 5A6LA 3AICA 1UKSA 3CMJA 1WE5A 2WSKA 1JL8A 2W62A 2OLHA 3MMDA 4GI6A 2OYKA 1V02E 2QMJA 1UKTA 2J4GA 1VBRA 4S3JA 3VGGA 3WH5A 4D6HA 3GYCA 2VURA 2ZXQA 3ALFA 5CLTA 2VZSA 1HIZA 5I5RA 4WKAA 1AQ0A 4D6GA 1UD2A 4M29A 2WXDM 2WVUA 1NH6A 3MUAA 1NWSA 4D6DA 3CUFA 5EMYA 5FIPA 2V5DA 1CBGA 3JUGA 1TUXA 3A47A 2VJXA 2BXYA 5FOOA 4EK7A 2CHOA 4FLSA 4W87A 1OGGA 1GVYA 2DSVA 2OSYA 3ZMRA 3VNYA 2GUYA 2B31A 4J28A 1Z32X 1UZ4A 1UKQA 3PN8A 1OIFA 4Q7NA 4D6EA 1HX0A 2VQUA 2YKKA 2DSZA 3GH7A 1AMYA 4U31A 1JZ8A 1UR1A 4J3WA 2X0HA 1GZJA 3CLWA 2W61A 1NOFA 3CTTA 3BH4A 4Z2JA 2D3LA 1DWFM 3WNKA 4OBRA 1V6UA 4MDPA 1MWOA 4D1JA 3N04A 3RMEA 1ISXA 1E55A 2CYGA 5GNZA 1D7FA 4BQ2A 2ZUSA 1CNVA 1UD5A 2X1IA 2VMFA 3OGRA 2DT0A 4CD4A 9CGTA 1CTNA 2CEQA 2DH3A 4U5KA 1E4LA 2EPKX 1EHAA 4M56A 2XUCA 2UY3A 5E0CA 2WHMA 3AMLA 3K8KA 3CMGA 1G94A 2V3GA 3OLIA 1LWHA 2EO7A 1SYTA 1VAHA 4P7NA 1G9HA 5DFAA 5CPQA 4U5IA 2DH2A 5I79A 2O92A 3QOMA 1UWRA 4HPHA 1NWRA 5I6SA 1OT1A 4QAWA 1CZ1A 2CBIA 4B9ZA 1UWUA 2XTKA 3FW6A 3PTKA 1QPKA 3SCVA 1C93A 3F5KA 5BXPA 3ZQ9A 1U30A 4YHGA 5E0FA 2CBVA 4DWSC 1H49A 3WH7A 3QGVA 1HJSA 2GVYA 4AIEA 1A47A 4V2XA 3RM4A 4NRRA 3WNLA 1NWUA 5CGTA 3M07A 1PPIA 3VX1A 4HTYA 4GINA 4UQ9A 2DSUA 2EEXA 2VZVA 3WQWA 4HU0A 2ZUTA 2X0YA 4HPGA 4UCFA 3WF2A 2J78A 3WD1A 1KGXA 3PZMA 3VD9A 5GPRA 1GQJA 4DUVA 2J7FA 2A3AA 1UZ1A 6CGTA 3OA5A 3CHFA 1FFRA 1E6QM 1IV8A 4X0NA 3VVGA 3GBDA 3N18A 2ZX8A 1K6AA 1BAGA 4DWSD 3NSNA 4PTVA 1E3XA 2Y8KA 1RD6A 5A6BA 2DT2A 4K68A 1V0NA 4F9DA 3GXIA 2X8RA 3GXFA 2A3HA 2J7DA 4GXPA 2YOCA 3CHCA 4W84A 3SCTA 1E0XA 4W7UA 4S3KA 3B9EA 3SCWA 2CXGA 4JL1A 3U7VA 5CPSA 1XH1A 1UR4A 1KR1A 3ZM8A 1LF1A 4AD1A 2WC3A 4D6JA 4AW7A 1GHSA 2PB1A 1JNEA 5EFFA 1IZKA 2D0HA 4PUEA 3AYSA 3NYDA 3VIJA 5GNXA 4D6CA 4GZIA 5IHRA 3VPLA 2VRKA 4NSBA 1VRXA 3AZRA 2WM0A 4AD4A 5HBFA 5CLWA 1OM0A 1EO7A 5D9PA 3RCNA 4BS0A 2A3CA 1G0CA 2WBKA 1WDQA 4TOQA 2OYLA 3VMOA 3EMCA 1US3A 1JYNA 5A6MA 1B3VA 1TA3A 3L4VA 4CD5A 4GI8A 3WUBA 5JIPA 1VEOA 4AEEA 8A3HA 3DHPA 1W3JA 3CZGA 3VD3A 3WNPA 3ARQA 4GQRA 3O6AA 2MANA 1W1VA 1NOUA 1ZJAA 1OGBA 3E1F1 3SURA 3O9NA 2Y5EA 1E4MM 3HMCA 3MU7A 4AD2A 4W85A 2DSWA 5AY7A 4PTMA 5A8QA 1TCMA 5IFTA 2EXOA 4PRWA 1CGWA 1I1WA 1JXKA 4JCLA 5GQBA 4BZYA 2ZX9A 2E3ZA 3LPPA 2ESCA 3WNMA 3II1A 1GOIA 4MNKA 4W5ZA 3PZUA 5A8MA 3CZJA 3O2LA 1JZ4A 3U57A 2ZICA 3SEPA 2YLLA 4BQ3A 3ARUA 4AD5A 5JUVA 4JL2A 4CU8A 5DO8A 4A3YA 1E1FA 8CGTA 3AHTA 3UESA 2NW0A 3NSXA 3A3HA 3AQUA 3DYOA 1J11A 3WDQA 5JBDA 3ARZA 3SUUA 4E2OA 2E8ZA 2DDXA 3AMGA 4L4OA 3WQ5A 1QHZA 3OBAA 1UQYA 2BHYA 1VEPA 4IPNB 5I23A 2J7HA 1VFMA 1JF6A 2G4FA 2WVTA 4P8VA 2BXZA 1CGTA 2Y2WA 2WMGA 2DPEA 2D0GA 2QPSA 1PZ3A 3UG5A 4FMVA 4UFHA 4M82A 4ZE5A 4V28A 4XZWA 2PWHA 4J7RA 2FH8A 1UD3A 3CUIA 2ZX5A 1RPKA 4H8UA 2YL8A 4JFWA 3T0BA 3TP4A 1J0YA 1C8XA 1CPUA 4HOWA 1HF6A 4J3SA 4AISA 3WQVA 1EH9A 4Z2GA 4KMQA 1HL8A 3WQ8A 4HOZA 3CH9A 3AMCA 3VDCA 3VIHA 5KEZA 1HJUA 4XB3A 2E4TA 1JDCA 2WMKA 1ISVA 4JCMA 5HOSA 4OUEA 4UQEA 3U5YA 2OSWA 5A2AA 1QBBA 2E9LA 1W3LA 1KXVA 4GIAA 3WMBA 4HZ7A 4B3LA 2WC7A 1TZ7A 1HKJA 1QVBA 1CGYA 4X0VA 3FNDA 1XSKA 1UWQA 1KWKA 1KGWA 1DWJM 1M53A 3GH4A 3FHQA 4YN5A 5CZKA 1MXDA 3T08A 1XYFA 2ZWYA 1BQCA 1HJQA 1W1PA 3BSGA 1Y7VA 2WK2A 2WMHA 1EHNA 1LL7A 4PMVA 4KH2A 5I2UA 3M46A 4AIUA 1GQLA 3UETA 2YL9A 3VM7A 3ARYA 3THDA 4OBSA 3ARWA 2WKGA 4C7GA 1JNDA 3VDAA 2YDQA 4CD7A 5FCZA 1MQQA 1B1YA 1HN1A 1CGVA 4FK9A 1ECEA 5ABHA 2JEQA 2W66A 1C8QA 4FLQA 4OZOA 3AZTA 1ZBVA 3CUHA 1U33A 2YL6A 1B90A 1ZJBA 4HP5A 2G3IA 1HL9A 1PIFA 4CKQA 4H04A 3ZT6A 4XUYA 3POCA 4MB1A 4PMUA 3FHAA 4X9YA 3QHMA 1C91A 3PZOA 1QHPA 3UEQA 5I24A 5FL0A 4D1IA 3W37A 2BNJA 1AQHA 3W6MA 1GJUA 3CZEA 4YHEA 1U2YA 5HPOA 4WSKA 4ATWA 1QBAA 3WF3A 1KCLA 1UUQA 2WHLA 3AXXA 3L4XA 2YBUA 4QCFA 4W88A 2ZE0A 4J3UA 1W2VA 5D4YA 3BCDA 1GORA 1CDGA 1JXJA 1R8LA 2VX5A 4XZBA 2WPGA 1JZ6A 3KE0A 1W3HA 3VIKA 3TTYA 4NRSA 4U3AA 1W32A 1NP0A 3AS1A 4GI9A 1GW1A 4QFUA 3WDJA 1LLOA 4JFUA 3PZVA 1UA7A 2VZTA 5IFPA 3GBEA 4UQBA 1QI4A 1H0IA 1W1TA 1NARA 1J0ZA 1V3KA 6TAAA 3ZSSA 4MAZA 3CZKA 4AEFA 5C8BB 1UH2A 1W1YA 4URIA 2EJ1A 1HP5A 1V0KA 3IAPA 3LMYA 3EMQA 1JI1A 2PWEA 2VO5A 2XWDA 3N1AA 3K4DA 4WLCA 1UR9A 3BXWA 2VVSA 1XH0A 2BVDA 2CPUA 3VIMA 4UOZA 1QNOA 3GNOA 3WELA 2UY4A 3MUY1 1PEZA 3TA9A 4F79A 1ZS2A 4JZ5A 1MFUA 1V3JA 2WCSA 4CCDA 1EQCA 1MYRA 2G3MA 3PHAA 4MB4A 4MB3A 1PX8A 2WLZA 3VOCA 1J12A 1TE1A 3GZAA 4H7VA 3T0DA 3LPFA 5I0DA 1GCYA 1JFHA 2E9MA 3MSGA 2FH6A 3BCFA 1WZMA 2QHAA 3ALGA 1R7OA 2J8GA 1JIBA 3WF4A 2D22A 1DHKA 3BC9A 1W9BM 3ZIZA 5CJ5A 4P8XA 4OOZA 5CXPA 1TVNA 2WBGA 1IZJA 2ZXBA 4BCEA 1EOMA 1W9DM 1CXKA 2WB5A 1FP9A 3POHA 3TTOA 2X2YA 4W7WA 1EDGA 4LYQA 2GK1B 2WVVB 2BV9A 4RE3A 1W3KA 3L4WA 2YDRA 4NZCA 3W24A 3ARTA 1GOMA 3G6LA 3B9AA 2O9OA 4CN4A 4D6IA 3BAYA 3RILA 3WH9A 4TTGA 1F4AA 1MQRA 2NT0A 2V5CA 3AROA 2FGLA 5HPCA 1LL4A 3F5JA 4EAMA 2XVPA 3ARRA 3EDDA 5JIWA 3VGDA 4WSJA 1TR1A 1HT6A 3PZNA 3UERA 4PTXA 3VINA 1GQKA 1V02A 3ZJ6A 4OKDA 4W8LA 4U2ZA 1VJSA 4IUGA 2J7GA 5D9NA 4PMXA 1QI0A 1VIWA 1EDQA 3THCA 3L4UA 2DIJA 1EA9C 4N0RA 1W9VA 4WJXA 2YA0A 1JGIA 1C3FA 3VGBA 1MW1A 4QCEA 1JD7A 2IUZA 1H41A 3WL0A 2O9TA 3CIVA 1SR0A 2J7BA 1UD6A 3WSUA 2Y8VA 2WMIB 2VNCA 2WMJA 2VZOA 1WPCA 1QNQA 3WMSA 1ISZA 3VMNA 3GM8A 1JI2A 2BY2A 1WDPA 2JE8A 5BXTA 5I77A 1Q6CA 3AIUA 1V0LA 4LYPA 1B3ZA 3BLKA 1HKIA 5FKYA 1G1YA 1BPLB 4AXNA 2YIHA 1OT2A 4AIOA 4ZENA 1E6RA 1MW0A 3MANA 4HA1A 1KCKA 2CNCA 3AS3A 3CPUA 4UZUA 1GJWA 1UA3A 1I1XA 1OB0A 1X1NA 3W6LA 1J0KA 1FP8A 1H11A 3VUPA 2E9BA 4WKFA 1X6NA 1ZL1A 1F4HA 3UR8A 2XGBA 2Y24A 2ZWZA 4AD3A 2D3NA 3VIIA 1B30A 2G41A 1HJVA 3AOFA 1PIGA 4UFLA 5A1AA 4QLKA 3WD3A 2DT1A 1E40A 2BS9A 4B3KA 1ZBCA 2VX7A 5BCAA 2OSXA 4PMYA 2ZUNA 3ZR6A 1B0IA 4H8VA 1NWTA 3EMZA 4JKMA 2ZUMA 3UG3A 1ODZA 1ZBWA 3ZT5A 2G8ZA 3NCOA 4IISA 2VRJA 4P7QA 5IXEA 2G3JA 1JYXA 2X09A 1IT0A 1V6VA 2XFRA 3OZPA 1XH2A 2EQDA 2GDVA 4CU7A 1XSJA 3CZ8A 4U3CA 2GJRA 3ZSTA 3VILA 5BYWA 2J25A 4H8HA 5AYIA 3L4YA 1EIBA 3BGAA 5M03A 4Q22A 5EB8A 4LYRA 3WH6A 3A4AA 3OLGA 3AIVA 5GNYA 1PBGA 3GNRA 5A8NA 3RJYA 3WBEA 4E8CA 4MNLA 2J74A 3VDHA 1OBAA 5C71A 3IK2A 3FAWA 3T2OA 4PBGA 3MV11 2W92A 4IM4A 5M5DA 3K8LA 1G5AA 1FH7A 3KL5A 5LYRA 2PWDA 5ECUA 1UWTA 3WFLA 1RP8A 1E5JA 3W38A 2GJXB 3WUGA 2DSKA 2PBOA 4CN1A 4LQ1A 3I3BA 3EYPA 1CGXA 4TTUA 3N9KA 3VGHA 3CHEA 3UCQA 4J3VA 4MPKA 5TD4A 3OIHA 1BHGA 2WAGA 3PZQA 3HJEA 2V3FA 2W63A 1CECA 1MXGA 5JBFA 1B3XA 2XM2A 4DM2A 1G01A 1BSIA 4Z2IA 5KZ6A 5FL1A 4PMZA 1VENA 5LA1A 3GNPA 2PI6A 1GQIA 1CYGA 3VX0A 2ZX6A 1XYZA 3WUEA 3TTQA 5DF0A 1UOKA 2FGZA 1BLIA 1KB3A 4TX6A 4TX8A 3BAKA 4LPCA 1H1NA 1DWIM 1R86A 1O7AA 1JZ7A 1OD8A 2ZUWA 2QF8A 4CN6A 1GUVA 3BAIA 2WZHA 4HMDA 3VNZA 1Q6GA 1CGUA 3DYPA 1JZ5A 1LWJA 3PZIA 1XC6A 1KGUA 1QHOA 2UWFA 1OGSA 4EKJA 5EBAA 4CD8A 1E0WA 2Y4SA 1YQ2A 2XYLA 1R7AA 1WZKA 3SCNA 5DT7A 1E72M 2WANA 1W9UA 2XVGA 2BFGA 5A6SA 1XRVA 3WN6A 1W2PA 3A6OA 3AHXA 4KRUA 1FH9A 3RIKA 4GKLA 3W53A 1CXIA 1EQPA 1QI3A 2OYMA 3AIQA 4N42A 5BRQA 2WNWA 2YLAA 2RGLA 3SCQA 1WAWA 4CVWA 4FLRA 3W28A 3ZJKA 3PZGA 2GK1A 1AVAA 2WVVA 3CBWA 3DC0A 1VB9A 4R5EA 5A94A 5M17A 3AFBA 3VO0A 1M7XA 3ZJ7A 1XCWA 2NSXA 3VD5A 2VOTA 4MJ4A 1NOWA 3AXHA 4AY1A 3AI0A 1VFUA 5CQ1A 3CZLA 3MUIA 4WF7A 4P7OA 1BYBA 3VTRA 1E15A 2PWFA 3W26A 1H4PA 1QNPA 4UZSA 1E4IA 3W29A 4MDOA 1SMDA 3MMUA 1UHVA 3AIBA 2WCAA 4PCSA 1L8NA 2AOSA 1BGAA 4PTWA 5EFDA 4MJ2A 4Y7EA 1WP6A 4PMNA 1JG9A 1EGZA 3GDBA 4D6FA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4JFS A;  1E6X M;  2AMG A;  2CIP A;  1HJX A;  1UQZ A;  5IHS A;  5A6B D;  1C92 A;  4UFI A;  1HNY A;  3W0K A;  1TVP A;  2EPL X;  2JIW A;  1WKY A;  5A6L A;  3AIC A;  1UKS A;  3CMJ A;  1WE5 A;  2WSK A;  1JL8 A;  2W62 A;  2OLH A;  3MMD A;  4GI6 A;  2OYK A;  1V02 E;  2QMJ A;  1UKT A;  2J4G A;  1VBR A;  4S3J A;  3VGG A;  3WH5 A;  4D6H A;  3GYC A;  2VUR A;  2ZXQ A;  3ALF A;  5CLT A;  2VZS A;  1HIZ A;  5I5R A;  4WKA A;  1AQ0 A;  4D6G A;  1UD2 A;  4M29 A;  2WXD M;  2WVU A;  1NH6 A;  3MUA A;  1NWS A;  4D6D A;  3CUF A;  5EMY A;  5FIP A;  2V5D A;  1CBG A;  3JUG A;  1TUX A;  3A47 A;  2VJX A;  2BXY A;  5FOO A;  4EK7 A;  2CHO A;  4FLS A;  4W87 A;  1OGG A;  1GVY A;  2DSV A;  2OSY A;  3ZMR A;  3VNY A;  2GUY A;  2B31 A;  4J28 A;  1Z32 X;  1UZ4 A;  1UKQ A;  3PN8 A;  1OIF A;  4Q7N A;  4D6E A;  1HX0 A;  2VQU A;  2YKK A;  2DSZ A;  3GH7 A;  1AMY A;  4U31 A;  1JZ8 A;  1UR1 A;  4J3W A;  2X0H A;  1GZJ A;  3CLW A;  2W61 A;  1NOF A;  3CTT A;  3BH4 A;  4Z2J A;  2D3L A;  1DWF M;  3WNK A;  4OBR A;  1V6U A;  4MDP A;  1MWO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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