4GC4A

Crystal structure of the mutant r160a.r203a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
DVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTAPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGASIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: a structure-based explanation for how the 5'-phosphate group activates the enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 85
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2012-07-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4gc4A00
4O15A 1YDNA 2Z6IA 3STGA 1TPUA 2F84A 2W79A 3QQ1A 4UR7A 4HNVA 2BX7A 2QCFA 1XDMA 1GG1A 3OA3A 3U2OA 2VFFA 1G7VA 1D3GA 4BK9A 1H7OA 3TDFA 3W2NA 3W7NA 1WV2A 1BEUA 1FCQA 1I2QA 2R14A 2Y70A 3P82A 3GX9A 5CPNA 3PF3A 1THFD 1H50A 3S8HA 4ZL1A 5IBXA 4AHPA 2ISVA 1G4SA 2X30A 1VCVA 2B7OA 5G1TA 3BV4A 3UY8A 2VEPA 2WQPA 4D2JA 3EWUA 2E5CA 3W2JA 1P4CA 3DFOA 3W7QA 2DZPA 3LRLA 4N2YA 3LCLA 5AFDA 4WJEA 3O16A 1ICSA 3NL5A 1SW7A 4DO6A 4FB7A 2ZZ4A 3HO8A 3DZ1A 3G22A 2VC6A 1AL8A 4TR9A 4A29A 1LCOA 5SWUA 2YXGA 3KHJA 4BWLA 5HNRA 4Z1AA 3PSVA 2WSRA 4N9CA 1GVQA 5FF7A 1BWKA 1HFBA 3MHUA 3S5OA 1SO4A 1PL9A 2ZRXA 3T40A 1SZGA 3WJWA 1GVFA 4R34A 2JGQA 3VCRA 2J88A 3TJLA 1EUNA 3EXRA 1O5KA 3O6CA 3DFQA 3SECA 3UQNA 1T99A 2JKEA 1DV7A 4LC8A 1FWTA 4JY8A 3HG5A 3W76A 5AN7A 1PS9A 3TV8A 3C52A 3G18A 4UNLA 3QMTA 2B4GA 3QC3A 2WSYA 1GYNA 1KM0A 4M19A 2BWGA 2FDSA 1ZCOA 3I7SA 3W3OA 2YDAA 5DBTA 5D03A 1UASA 4ICNA 5EBUA 4RCXA 2ZCGA 2DZVA 5G4EA 1TV8A 3P67A 1QPNA 4O11A 3G8EA 3MUXA 1TTQA 1UCWA 1PVNA 5FEPA 2BTMA 4O1DA 3W73A 1JR1A 3BG9A 1TO3A 3P62A 3IVSA 3MW7A 3NM1A 4U28A 3TFXA 4XTDA 5D38A 1ZNNA 3GAYA 2NXIA 4NJIA 4O18A 1VYPX 1H7RA 2W0UA 4R53A 3LLFA 4OV4A 3EX3A 4MIMA 1FUYA 3VKJA 2E6AA 1LOQA 4E38A 3GXPA 3UWQA 1DL3A 2A7NA 2PURA 4NNCA 1L2UA 4QISA 3D0CA 5KMYA 2YFOA 1JCLA 1W54A 3GNDA 2V5LA 2QCEA 4HNUA 3UPBA 4OV9A 4O13A 1GEQA 1RV8A 3TU9A 4PTNA 4YL2A 4Z1DA 4RXFA 1TQXA 2ZZ7A 4PODA 1SZEA 4O0ZA 4RX0A 5F2IA 3NPXA 4KFOA 1Q6RA 4Y96A 5D04C 1KM2A 2UV8G 4LS2A 2A1YA 1WOAA 5EMUA 1L6SA 1XI3A 3U6WA 4MZYA 1TTPA 3L68A 4LVFA 2GJLA 4UTMA 3LHTA 3R8RA 4ZZ9A 1JCXA 1D9EA 4UTUA 1ME8A 1KM3A 3BGJA 4MZ1A 4HKPA 3KRUA 2J9XA 4C1LA 3TW6A 1H1ZA 4FEZA 1AW1A 1OVDA 4XTIA 3LTSA 1KFLA 1RQEA 3OIXA 3GVGA 4FHAA 4CCCA 1YPFA 3HPZA 3QPYA 4IMEA 2A6NA 2NUYA 3GK0A 1JCJA 3W07A 1C9DA 3UD6A 2DU2A 2E6FA 2VFGA 4JTIA 4XKYB 1YPIA 3TE9A 2DZTA 4HNTA 1QDSA 5F1VA 3TMQA 4GFSA 1TPEA 1VGAA 2VXNA 3NQ7A 3GLCA 4JTUA 1LOSA 2H8XA 1H63A 4LVDA 4UTWC 1OFAA 1X7FA 1QNVA 5BOOA 2I1OA 3HMJG 4KWVA 1W31A 3B8DA 3L21A 3SR7A 1OABA 2NUWA 1R2TA 3PM6A 3E9AA 2R94A 5F4XA 3DU0A 3KVMA 1R30A 2ZA2A 1WX0A 4OT7A 5C5YA 2ZZ5A 1DHPA 5CPMA 5LGXA 1KFEA 4UC5A 2TPSA 3M1ZA 3Q58A 3W88A 3W1LA 2VELA 2ZZ2A 1ONRA 2OT0A 4GNJA 3HPXA 4RV8A 5DCBA 3NGJA 1LBMA 3KVLA 1G67A 1M7OA 4W9TA 3PBVA 3NZRA 1G7UA 4NU7A 4NZJA 3VI2A 5BRBA 4UTKA 3G1SA 1IIHA 4IWWA 1VCFA 4JS3A 3L66A 3CWNA 3CC1A 3W7GA 4XKYA 3EX6A 3NQAA 3BG5A 4WX2A 1QOPA 1VPXA 3GIYA 3NL2A 1FQ0A 1K8ZA 3W75A 1YXCA 3CEUA 3EWZA 5I3KA 3S9YA 2QUTA 1GVRA 4MFDA 3OEXA 4UXDA 3C2VA 3BG3A 4QNEA 3N19B 1JVNA 5HR7A 2QDGA 3TA6A 4FIQA 1R2SA 2VEKA 3I65A 2G5WA 4RZ5A 4YCPA 1TPWA 3GYEA 3NQCA 5G1YA 3TSBA 1LROA 2YCEA 2J27A 3Q2DA 3LCXA 4UFIA 4DO5A 3S42A 4LWWA 2XN1A 2QCGA 3P61A 3W2UA 3EWBX 3VFLA 3O63A 1TJPA 3EXTA 1SZFA 1I8JA 1SO5A 5EYWA 2NX9A 1JUEA 3N9RA 4L4MA 2Y7EA 3G1VA 2QF7A 3G24A 5KZDA 1OYCA 1OF8A 1JCNA 1KFBA 4IXXA 3I6RA 1B9BA 1LLWA 4JTGA 1W8SA 4JTTA 3W2KA 1QFEA 3C61A 4TO8A 5FF0A 5LNVA 4IMDA 3PAJA 3HIJA 3LXCA 1MEIA 2ZRWA 3E02A 4IXHA 4X9SA 5KZMA 4UMBA 2Z0IA 4GUGA 3DENA 3W71A 3QMRA 3S1UA 4HSNA 1KTCA 3M6YA 4KFPA 2BSLA 5D2VA 1W37A 3LB0A 1KM5A 5EY5A 3GB6A 4DBEA 1F74A 2AAMA 2QCNA 5F2MA 2Q3OA 4MLJA 4LUJA 1OX4A 3P7YA 1B4KA 1WBHA 4K37A 5AC7A 3L0NA 4O0KA 3MP4A 3LTYA 3L65A 2FFCA 4YXGA 3MMTA 3N9SA 1H5YA 3C2FA 3KRZA 2GPTA 4JTJA 3V1PA 2AQWA 3M9YA 3FIGA 1JCMP 5EPDA 3TQVA 4LVAA 1J2WA 4I7VA 1TPC1 2B0MA 5BMWA 4N9DA 2GOUA 3W85A 3W7RA 2JKAA 4RR4A 1NSJA 2BZNA 3T7VA 3PR2A 2Z1BA 3PWAA 3W7EA 1IIGA 1NEYA 3LGEA 1C29A 5U4NA 2ABAA 3ZWTA 5I3GA 4GXMA 3QSRA 4AF0B 3JRKA 3UWZA 4GUJA 5ABTA 3HGJA 4NZFA 4P61A 2WNZA 2QJHA 3GR8A 2I14A 3TH6A 3W83A 3PUDA 2P0OA 4N6FA 3O06A 3WJSA 1TV7A 3UWVA 4DPQA 3QYQA 4LV9A 1MO0A 1SW0A 2QCMA 3IIXA 1MXSA 2XFWA 3O1NA 5FEZA 4FNQA 4EF8A 3TK7A 4FNUA 4Y8FA 1T8XA 4IJBA 1O4UA 4MY9A 1Z44A 1XUUA 1EWEA 1O95A 2Y89A 5CKSA 5AHFA 2C3ZA 4QIUA 4JN6A 1VYSX 2FTPA 2FPVA 1JCYA 3FLUA 3M0ZA 4PFMA 2TRSA 3GKFA 3W1QA 4DELA 2ZA1A 5K4ZA 5F4WA 1C8VA 2WJZA 3IGSA 3LCHA 5K9XA 1VJIA 4YLWA 2Q8LA 1GT8A 4IOTA 2NUXA 3W7CA 2X1UA 5LZLA 5FF4A 4ONVA 2QR6A 3P8JA 2DP3A 1I2PA 4I9AA 5DLCA 5AYYA 4UUIA 4Z0JA 2A0NA 5KTLA 5J5DA 4AVFA 4OBTA 5KINA 1DQWA 4I7WA 3HPSA 3N34A 1Z48A 5DELA 4UTLA 1U5JA 2PRHA 1GZGA 5G2HA 1KM1A 3HGSA 3W1MA 4Z0SA 2CLIA 3NQEA 4EOUA 4L4LA 4QQ3A 3VE7A 1PIIA 4N9BA 2YYUA 2C18A 4NXKA 4IUOA 4S2BA 1WDWA 3NPUA 5KSWA 2A6LA 1XXXA 2X2GA 1K7XA 1TJRA 2H6RA 3HG4A 3TQ0A 2EF9A 2FPYA 3TAOA 3G1HA 3FS2A 3QF0A 4R33A 3MI2A 3W72A 2FB3A 3M5VA 3KXQA 1VZWA 3UY7A 4ALDA 4Q4KA 1RR2A 1OX6A 3M43A 5CZTA 5K9DA 1OFPA 3W74A 5EKYA 3C6CA 3WJZA 1R47A 1OYBA 1TB3A 2YGYA 2QCHA 2QUUA 1UUMA 4JEQA 1BKSA 5CZJA 2FJKA 7TIMA 3WK2A 3L0KA 5LNRA 3LCFA 1OK4A 4K7VA 1ZY9A 4MJZA 5I3HA 3W7MA 4JTHA 2A21A 1OFDA 2Q3RA 1GPWA 3GDRA 1F7BA 1XUZA 3BLEA 4OGZA 2NWSA 3NEVA 1MEHA 1VYRA 4LVBA 3W23A 3CT7A 4ZQCA 3IEBA 2DZUA 2GVGA 5G2IA 4A3UA 1EA0A 2C1HA 1NF0A 4NJJA 1JRBA 4NJGA 5F1UA 4JX6A 2B7NA 1LM1A 5AHNA 2V0TA 1FBAA 5F2LA 1QO2A 1TTIA 1W3TA 5K4XA 1W5NA 2ZZ1A 3W70A 4BF9A 4JTKA 4X2RA 2BXVA 2CZFA 3FKKA 3W7LA 4DBDA 1TMHA 4DO4A 1AL7A 5AC6A 3TAKA 3IV3A 1P1XA 5FF2A 3E96A 5DXYA 2O7SA 3W6YA 4LRTA 4JX4A 4Q33A 1YTKA 1RZMA 4M6PA 2C13A 1S5TA 1ZENA 3OG3A 2V2DA 3GNNA 5KZEA 1RQHA 2NXGA 3KOFA 1WOBA 2JGYA 3CQ0A 5LHEA 1H7PA 2VFIA 3MP5A 2TYSA 4UTTA 3TSMA 5C6MA 5CPLA 5TQLA 5AHEA 8TIMA 3IRDA 1LDCA 3A21A 1PHQA 3W1AA 4UFMA 2QCDB 3INPA 1KW1A 4M6QA 1TCDA 3BPWA 3C2EA 1W3IA 4O4WA 5DXXA 4JXCA 1YTEA 1A5CA 3CLMA 2OZ0A 5F2GA 3CU2A 1ME7A 5J5RA 1VS1A 1YTDA 2Y7GA 3MYOA 3NQ2A 3W1NA 2JKPA 2YX0A 2CLKA 3HF3A 1OF6A 2WO5A 3LLDA 1KV8A 3PG9A 3O07A 4ML9A 1XL9A 1YLVA 2CZEA 5G5IA 1SO6A 3MO7A 4LS0A 1EX5A 2E1DA 2BLEA 4GRSA 4ZQMA 3IIVA 4UFJA 4WOQA 4JR5A 2A2IA 3PY2A 5D32A 2QUVA 2JK2A 2VFEA 3UZ5A 2G95A 2QJGA 2V81A 2D73A 2ZRZA 3CTLA 1R46A 2PC4A 2PCQA 4ZQPA 1B57A 3LV5A 4JYDA 1RD5A 1ME9A 4IMCA 4MKNA 4UIOA 3EB2A 4IMGA 4HIBA 1K3UA 4WOZA 1FX6A 4H6KA 3DFTA 4LRSA 3FEMA 1LORA 3G3DA 1GJPA 1OFQA 1WXJA 3DI1A 4Z1BA 2C15A 4HPJA 1W5MA 1JUKA 4B5NA 1H7NA 1LZOA 1W5PA 2OJPA 1VR6A 1X1ZA 4ADSA 1EPXA 4NT0A 2HTMA 3ANYA 4JTLA 1AMKA 4WXZA 1YXDA 4JICA 4UMAA 1UUOA 4NX5A 4E0CA 1GYLA 1TQJA 3MHFA 4G1KA 3HGOA 1Z42A 1OG0A 1KLZA 4M7TA 3MWAA 2Y7FA 4XZ9A 1EUAA 4FX6M 1YDOA 3NL3A 4IGHA 3K30A 5D33A 3UWYA 5IM51 3N2MA 1D3HA 1PE1A 3S1VA 3TQKA 1FDJA 4ZVJA 1FDYA 2YFNA 1GTHA 3P81A 6TIMA 3BGGA 1TSIA 3P80A 1QPRA 2TMDA 3ZS4A 4ORMA 3NPVA 4NX0A 3LBMA 4RZ4A 2GVJA 3W1XA 2Y62A 2ZYFA 2WKJA 4FX7A 3ATZA 2A7RA 3UPWA 1NF7A 4PL1A 3G8RA 4Y90A 1X1OA 4NNBA 1OFOA 1LOLA 3S5ZA 2ZA3A 4PH6A 3BLIA 1RQBA 3HGRA 4O12A 5CSRA 1OFEA 2EPHA 3B4UA 3KAOA 3L0GA 1VLWA 3TXVA 3W9ZA 4LC6A 1FY6A 2NV1A 1ZJIA 3HG2A 4WD0A 5D02A 3KVJA 3IIZA 4POCA 1ZAIA 5AYZA 3CEPA 3KFTA 4NVTA 4O4VA 3N2XA 3NQMA 4IQLA 3EWXA 1H7XA 2J6XA 2OT1A 2EHHA 1TRIA 4XBSA 4MZ8A 3P5YA 5BMXA 5C55A 1YDVA 4Y6GA 1W1ZA 2W6RA 3BW4A 3EKZA 2RH9A 3T78A 3R2GA 4O1BA 4FF7A 4NJKA 2Y63A 2QAPA 4LY8A 2FLIA 4MLRA 1JRCA 3NQGA 3WK3A 4MFEA 3W2LA 1N8FA 3OVPA 5D37A 1O94A 3C0JA 1AK5A 1X6UA 1WYIA 2O7QA 4XBKA 1EIXA 3LCGA 1U83A 2X1RA 3GDLA 2VFHA 3DKLA 1TPDA 2J24A 1QR7A 4QJ1A 4UNKA 2CU0A 3NDOA 3S1WA 5C2XA 2QEZA 2GQAA 4A21A 3LTPA 3MHGA 3SZ8A 3QRHA 2I9EA 2QCLA 3EX1A 4OQVA 3T55A 3YPIA 3RU6A 1R2RA 1AW5A 1ICQA 3C4UA 2H8ZA 4J9JA 4K7YA 3THAA 3BK0A 4YWIA 3GAKA 1OX5A 1XBXA 1KFJA 3TXZA 5AC8A 4IX0A 4K39A 3R89A 3QMSA 2H3BA 2ZBTA 1JJKA 3AO0A 4Q32A 5I3JA 1FWRA 4FNSA 3W7OA 1IGSA 1W5OA 3IGUA 2PRMA 1KM6A 4UTWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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