4GUFA

1.5 angstrom crystal structure of the salmonella enterica 3-dehydroquinate dehydratase (arod) e86a mutant
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
260
structure length
252
Chain Sequence
ENLYFQSNAMKTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKAGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVISVADLRTVLTILHQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
publication title Reassessing the type I dehydroquinate dehydratase catalytic triad: Kinetic and structural studies of Glu86 mutants.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 93
structure length 252
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2012-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4gufA00
2E09A 4M19A 1ALDA 1ZAIA 1EWEA 3UWVA 3W7PA 3CM4A 4HHPA 1AW5A 2QUUA 3Q94A 4M6VA 4MPQA 2R91A 3VE9A 4UTJA 2NX1A 3BVJA 3W1NA 5DN1A 3BW3A 4JTKA 3LHZA 1DQXA 4MZ1A 4NJJA 3K30A 1QAPA 4UNLA 1ME8A 5MHBA 3HGJA 4Y8FA 1GTHA 1SZNA 1IGSA 3THAA 4Y9AA 3L0GA 3E96A 2FLIA 3N2XA 3O6YX 2X1RA 4HKPA 4NZJA 1NF7A 2DU2A 3EXSA 3C2OA 3QM3A 2NXHA 3O07A 1LOLA 5CZ0A 3PB0A 3SY5A 1VHCA 1MSSA 1XBYA 4X3ZA 4LU0A 1G67A 3TSDA 4K38A 5K9XA 3GXNA 1W3IA 3M41A 1ZNNA 1P0KA 3W74A 3PY2A 1F2JA 1GZGA 1I2OA 3W1LA 4L4MA 4WD0A 4ML9A 5EMUA 3L5MA 3NO5A 4UTKA 4MJMA 2FDSA 3QFEA 1VPXA 3TK7A 3TKFA 1TIMA 2Z6JA 1OYBA 4A22A 4PEKA 3HPSA 1G4PA 2C13A 5E93A 3UYCA 4LUJA 1OFRA 4PC8A 2NUYA 1PS9A 4CQAA 5G1TA 2DZSA 3G1SA 2JK2A 4JYEA 1G7VA 3WK1A 3B06A 3S9YA 1MXSA 4KFNA 1I2QA 3WK3A 4AF0A 1OABA 3MI3A 5F4XA 3HG5A 4DELA 3W3OA 4CNNA 1I4NA 3HB9A 4RR4A 1ONRA 3WJXA 3DU0A 2CWNA 1OFEA 2A5HA 2Z1BA 4JIQA 5AHFA 3W7EA 1O5XA 2A6LA 5BMXA 3LCHA 4JX4A 4UMCA 1F7BA 2C14A 3ZWSA 5J5DA 4LC8A 1V7YA 4CCDA 3SIZA 4PH6A 3MO7A 1OYCA 4BI7A 4GJ1A 4IXXA 4JTSA 2OCZA 1RQEA 5FF3A 2WJZA 4RXFA 4Z1AA 1H61A 3PG8A 3TXZA 3W71A 4FNPA 2Y89A 4FX8A 2W0UA 1YXCA 3EX2A 2FFCA 5D02A 2DZVA 3FJLA 4BK9A 2ZFAA 4JDYA 1WDWA 4IMDA 3W07A 4GNJA 4JTEA 1EP1A 4DEFA 3LHVA 1CI1A 4I7VA 2GOUA 1LDCA 2E5CA 1J5TA 3UPWA 2F84A 1QOPA 3HPZA 3T78A 2NWRA 1VHNA 1K03A 1WOAA 2ZTKA 3WJSA 4NT0A 4TO8A 4M5PA 4H3DA 3SW6A 1LBFA 4GRSA 3BG9A 5D2WA 1H7WA 4I9AA 3C61A 5K9CA 3W7DA 3DFSA 4R33A 3Q2DA 3LLFA 3PSVA 3KRUA 4WUIA 1OFBA 4LVFA 4LVGA 4RLIA 3BGGA 1Q3NA 1A5BA 4FO4A 5ABTA 3KVJA 3STGA 3G8RA 3W70A 5D33A 3FIGA 3G1YA 4YLWA 4IPJA 3NOEA 3MP3A 3N3MA 3GAKA 1GVSA 3SGUA 1KM0A 1S3HA 3CWNA 1SO6A 1HO1A 4JNMA 2J9ZA 2PRLA 4RJEA 2C6QA 1EIXA 1U83A 2A4AA 5CZSA 3S1UA 1RQBA 3A23A 1TMHA 4O4VA 3L21A 3ZFHA 4LS2A 4TIMA 1JCJA 1KBJA 1V5XA 4UTLA 4AMAA 1WV2A 1OK4A 1WBJA 3QC3A 4DBEA 3KXQA 3NG3A 3CWOX 2DJXA 5LNVA 1OFDA 3E49A 4QAIA 3B05A 4QITA 2VFFA 3GDMA 4NU7A 4QM1A 1EB3A 2XN1A 3IGXA 4UFMA 4WY0A 3M44A 3UWQA 4O50A 3A5VA 2V0TA 4A21A 2CZDA 3G3DA 3MBDA 5KITA 4QJ1A 2Y88A 2DZWA 3PC0A 3KAOA 3NPWA 3HGOA 3O6CA 1Q6OA 1X1OA 2CLIA 2RKXA 4N4PA 4RK8A 4IJBA 1I2RA 3QPYA 5CG7A 1XUUA 1MZHA 2QDGA 3QW3A 4XWUA 4O12A 3ABSA 2E1DA 4O8RA 3TW6A 4N6EA 3PR2A 4K37A 1QNVA 5K9DA 3MHFA 3NM1A 5EYWA 3BV4A 3M16A 3W6YA 1KFEA 3BG5A 3P61A 1BWLA 2YYUA 2AGKA 2B0MA 5D2TA 3IIXA 3USBA 3KHJA 3NZRA 1C29A 3TFXA 4PFMA 3I68A 5CSRA 5AFDA 5AN7A 4I7UA 4LW7A 4O17A 3P5ZA 4ZMGA 1G6CA 3S42A 2FB2A 5DY3A 3NGJA 2Y7FA 5I3JA 4LOCA 3G1AA 4MJZA 5KSWA 3TMQA 5HJLA 1F73A 3W72A 2OT0A 3FA5A 4FX6M 3FYPA 4XBKA 1T99A 4AXKA 2CZFA 1VS1A 3R5EA 2YFNA 1P1XA 3TE9A 5FF0A 1O94A 2DZTA 1YPFA 2QF7A 2GVGA 2G97A 2NX9A 3F4NA 4HIBA 1LP6A 2TMDA 4GUIA 4JTIA 3HG2A 2JBMA 1YLVA 5H2ZA 2WSYA 3L5AA 3FEMA 1WA3A 1GT8A 1W5NA 5C6MA 4RCXA 3MYOA 1IF2A 1XDMA 3F4WA 5F2LA 4AVFA 1DQWA 3A9IA 4TX9A 2YR1A 4LY8A 3C52A 3O1NA 4LWWA 4GBUA 1VYRA 3W76A 3CHVA 2C18A 4K36A 3TQKA 3LV6A 5GVJA 3DHFA 3SECA 1FQ0A 1DKWA 3SZ8A 3G22A 4Z08A 3T7VA 4XTIA 2Y61A 3O05A 3EEGA 4UIOA 5G4WA 3W1TA 3UWYA 5CPNA 4W9TA 3QYQA 2YZRA 4ORIA 1QCWA 4M7SA 1X8FA 3L66A 2Z0IA 4YMZA 1MEHA 1QPNA 1OX4A 4O4WA 1EPXA 4AHPA 1BWKA 3P60A 1R47A 3L0KA 3IIZA 1HO4A 3W2UA 2O7QA 1AMKA 5AC8A 1OFOA 2ZTJA 3GIYA 2HS6A 3EWXA 1TPEA 4HPXA 1HUVA 1U5JA 1W5PA 3GDLA 2CFFA 4NJGA 4JX5A 3CT7A 2ZYFA 1KFKA 1H62A 2V5LA 4O16A 5U7SA 1ME9A 2E6YA 1KA9F 1JJKA 3ABQA 3EX3A 4LV4A 2OZ0A 3BPWA 3IV3A 1N7KA 1MEWA 5C55A 1VYSX 3LRKA 3G1DA 4DQWA 4MY9A 2V8ZA 1KM5A 1W3TA 3PVFA 4FNUA 1H60A 1QMLA 1LTDA 2JKPA 3NAVA 4MFEA 4WJEA 1SW0A 4MZYA 4WOQA 2X1TA 1W54A 3WJWA 1LRNA 2VFEA 2J88A 3STCA 4O0KA 1IXQA 2NZLA 1ML1A 3C2EA 3R2GA 3W2NA 1VYPX 4AAJA 1ZCOA 1MO0A 2HMCA 3I7QA 3GK0A 4AB4A 3S5ZA 1C9DA 1I2PA 1FUYA 2BZNA 1ZENA 3INPA 3E9AA 4O1CA 3M47A 5G2IA 2WOQA 5DCEA 4WXYA 3C56A 1JCXA 1OX5A 2E6AA 3W7JA 1NEYA 5DCDA 3HMJG 3P81A 5C2XA 3HF3A 1R30A 5LNWA 4D2JA 3CIWA 1VC4A 2PC4A 2VC6A 3T55A 2VEKA 4UTWC 3S8HA 3TH6A 1SSDA 4MY8A 1D3GA 4IMEA 3M5ZA 4GC4A 3UD6A 4NVTA 2EAWA 4ZZ9A 4CNPA 1SO4A 2QCDA 4O1BA 3NL3A 1TPDA 3LTPA 4UFJA 4YWIA 3HGRA 3BK0A 2HS8A 2D73A 4IMFA 3GNDA 4XQ6A 3UXAA 5EPDA 4IOTA 2NXGA 3NM3A 5I3GA 3U2OA 3WFAA 1WBHA 1KM1A 1YXYA 1PVNA 2PCQA 3MYPA 3W83A 2QCEA 2FPTA 3G1XA 1F74A 3EX4A 3HJZA 4FX7A 1JCLA 3LI1A 3PM6A 1O5KA 2J9XA 5AYXA 3W7NA 2BWGA 3U8GA 1EUAA 4FHAA 3HPXA 4GWEA 3P8JA 3MUXA 3RLVA 2J9YA 3R13A 3FKRA 1UB3A 1ZALA 4JTHA 3C6CA 1XUZA 5HMSA 1KLZA 3S5NA 1B4EA 1YDNA 4WXZA 4LRSA 4S2CA 3RMJA 3SJ3A 1SZGA 2YDAA 2B4GA 1QPRA 3LDVA 4NX5A 1L6WA 3PUEA 5FEPA 3TSBA 2E6DA 3DGRA 2QAFA 1FCBA 3P80A 2CZ5A 4O10A 5CZJA 2P0OA 4MUZA 5HQEA 4PA8A 4KWWA 2WPBA 2Y63A 5D30A 4S1FA 4UFIA 4WZHA 1JCNA 4Y6GA 5K3VA 4ALDA 1TPC1 3GNNA 1NVMA 3MHUA 4O57A 5CSSA 4R34A 5K2ZA 5LHFA 4UTWA 3HIJA 1HTIA 1T8XA 3EB2A 5TIMA 3FJ6A 1TPVA 3O63A 4OV4A 3PBWA 4DF0A 3LHUA 1JCMP 2QJIA 1VR6A 5AYYA 3TIMA 1UUMA 3LHYA 5H91A 2WV8A 1B57A 4MYAA 4BWLC 3NL6A 5D09A 2NUXA 1Z48A 2R94A 2NXIA 3EXRA 4Z1BA 1XBZA 4HT3A 1WAUA 1FWTA 1KFLA 3UQNA 3DHDA 2YFOA 3EKZA 3NQGA 1F76A 3W7QA 2QCDB 3GR7A 3CU2A 1H1ZA 3V75A 1TPUA 3H54A 3W2KA 5F2GA 1KBIA 3OBKA 1TPB1 1Q6QA 2VEIA 2PURA 4ORMA 4FNTA 2A0NA 1EP3A 3OIXA 4UMBA 1JR1A 2A7PA 3MW7A 4N2YA 3BGJA 2A7NA 2P1FA 3CQ0A 4R7JA 1YTKA 4ICNA 3TNOA 4P2VA 4HNTA 1JUKA 2LLEA 4JD4A 4N4QA 4Q32A 3W7CA 3B0UX 1YXDA 2ATSA 4JTUA 3GKFA 4K8EA 1GJPA 1WYIA 1GVQA 1NFBA 1YADA 1XCFA 3DFNA 4HNVA 5LSMA 5D37A 5DCBA 4UNKA 3L2IA 1FXQA 3NDOA 3W7OA 2H8XA 2J6XA 3LCLA 5HUPA 1VLWA 4H6KA 1KM2A 1UASA 2E5DA 3KFTA 4CQ8A 4RV8A 5LGZA 4JTTA 4K8HA 3LI0A 1K7EA 4LRTA 3KVLA 4K7YA 4K7VA 3NQDA 1ZFJA 2V5BA 3P62A 4ONVA 3W1AA 5I3FA 1EUNA 4ADTA 1QO2A 1B9BA 3UWUA 1I45A 4IX0A 5G1YA 4CNOA 4KKXA 4LNYA 5LNUA 1IXPA 4BWLA 3VNDA 4O15A 2DP3A 2ZZ5A 4QNEA 3THQA 2VXNA 3LX9A 1LOSA 2ZQ0A 1RVGA 2V82A 4N9EA 5D2VA 3NQFA 5C54A 1GVRA 2NV1A 1VGAA 3R89A 1VLIA 3TJXA 4LS0A 1G69A 2YSWA 3FKKA 3LB0A 3T40A 1J4EA 3DBPA 2NV2A 1ZAHA 2ZA3A 3G24A 1H1YA 3LXCA 2V30A 1VCFA 4JTJA 2Y62A 3ATZA 3ZS4A 1YDOA 4Q4KA 2A85A 1Q6RA 3TC6A 2OMAA 3UWZA 3LM7A 8TIMA 1SQ7A 1IXOA 2ZZ2A 1TRIA 4O13A 2YX0A 1QFEA 4LC6A 2VEMA 1KTNA 1TPH1 3A24A 4JX6A 4H4IA 5CPOA 1K7XA 1IIGA 4JXCA 2QCHA 3W86A 4IWWA 7TIMA 3DFTA 4RZ6A 1P5BA 2ZA2A 3C2RA 4JS3A 4RX0A 1GPWA 1PIIA 2OJPA 5L6UA 3TSMA 4CQ9A 1PE1A 3W84A 4OBTA 3C3NA 3W9ZA 3HG4A 2BX7A 3STEA 3G8EA 3EWYA 2C15A 3GKAA 3N14A 5AOUA 4MKNA 3LGEA 4ZQPA 1RPXA 4DO5A 4UXDA 1H7PA 2XFWA 4GXMA 3W2LA 1Y0EA 3M5YA 1L2UA 3IVUA 3TU9A 3N19B 5DXYA 3M43A 3IGUA 3G1FA 4OWGA 3GXPA 2J27A 3ZWTA 2RDUA 2FB3A 3TUUA 5G4EA 4NNAA 3BW2A 5CKSA 4XKYA 2YYTA 4Z0JA 1ZHAA 4UTMA 1PHWA 3S6DA 2YW3A 2H3DA 3RLUA 1IXNA 4RKAA 4NQ1A 4IX2A 4Z1CA 3GR8A 4OU1A 5I3IA 3LRLA 3D0CA 3GB6A 4ZQMA 1A5AA 4GUJA 1SR9A 3QMTA 4O54A 3LERA 1FWRA 4UFKA 2CLEA 3PUOA 3G18A 5BRBA 1EX5A 3EWZA 4FIRA 3L5LA 1EP2A 4UFLA 5D32A 4LVAA 5FF2A 1RZMA 1YTDA 5G2HA 4DBDA 3TQ0A 3UY7A 2R8WA 4U4MA 5DELA 3PSWA 2ISSA 1KM3A 1ME7A 2WQPA 4BI5A 2TRSA 1TTQA 2X1UA 3VE7A 5AHIA 4PTNA 3SSJA 5E1QA 2EF9A 1S5VA 4MIMA 1H7XA 2A21A 1A5CA 4DPQA 3UZ5A 3NQVA 3PF3A 3BO9A 3DXIA 2ZZ7A 4ZQRA 1XDLA 1LYXA 5CPLA 3QMSA 4ZL1A 3IIPA 2FIQA 1A53A 1AG1O 3DKJA 4AWSA 2XN2A 2GVJA 1GEQA 3F1QA 1M7OA 3F03K 3JS3A 3NL5A 1PCKA 3H55A 3HOJA 2ZRXA 4S2BA 4HNNA 2VENA 2CU0A 1OF8A 4GFSA 4KFOA 1O60A 1PHQA 4WOZA 4ZQNA 1TV7A 3RFAA 4A29A 3MHGA 4JTLA 3OG3A 4X9SA 2ABAA 2JKAA 3W7LA 1VZWA 3W73A 1LRQA 4FIQA 3NL2A 2ALDA 3IEBA 3TDFA 1FDJA 3I65A 3S5YA 3SFKA 2B7NA 3W85A 4UTTC 3MP5A 4JTGA 4UTUA 3IVSA 3NQ2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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