4HPXA

Crystal structure of tryptophan synthase at 1.65 a resolution in complex with alpha aminoacrylate e(a-a) and benzimidazole in the beta site and the f9 inhibitor in the alpha site
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Allostery and substrate channeling in the tryptophan synthase bienzyme complex: evidence for two subunit conformations and four quaternary states.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 103
structure length 268
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2012-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4hpxA00
2NWRA 1PVNA 3S42A 2QJIA 3MHUA 2ZRWA 2BWGA 4JTHA 1P5BA 3P7YA 1JRBA 3C6CA 3LHZA 3N73A 4JNMA 1GTHA 1FDJA 2J6XA 2OJPA 2PC4A 3TXZA 3B06A 4HPJA 2H3DA 2BX7A 3LXAA 3F1QA 5AYZA 4CQAA 3QPYA 4WOQA 5K9CA 5FF7A 2R94A 3A21A 3NQDA 4LY8A 1NFBA 2C1HA 3TC7A 3L5AA 4I7WA 2FB3A 2JGYA 4MZ1A 4EOUA 1EUNA 2ZA2A 3M16A 4GUJA 3L21A 1KM0A 3WJXA 2OZ0A 3LTYA 4K37A 3B8DA 1K3UA 3LHVA 4HT3A 1W5OA 3MP4A 1DORA 1Q3NA 2CLLA 5LNVA 5F2MA 2JBMA 1KLYA 1OK6A 3LCFA 1KTBA 4Z0JA 2WSRA 4E2DA 1TRIA 4TMBA 4UXDA 2NXGA 4A2RA 1GVQA 5CPMA 4XUGA 3PVFA 5AFDA 4CNNA 1F76A 1ZNNA 1D3GA 1OX6A 7TIMA 3C2RA 6TIMA 3NR0A 4N2YA 1ZENA 2E09A 4WXZA 1MO0A 3PBWA 4AF0A 3W22A 4UTMA 2Y62A 3W1NA 2V0TA 4KFPA 3W1AA 1VRDA 3T78A 2ABBA 1NSJA 4LVFA 3UWVA 1MSSA 1XUUA 1ZAIA 2GQAA 4IMCA 2YR1A 3C52A 2XN1A 3W75A 2QKFA 2WSYA 1VJIA 3NAVA 1EUAA 3CC1A 1C8VA 1WA3A 5AN7A 1TV5A 4A2SA 2VFIA 3IIVA 1A5CA 3OVQA 3KX6A 3G24A 4YXGA 4O15A 2VEPA 5LNSA 5LNWA 3CQ0A 3TFXA 3TK7A 3MYOA 1VLWA 2FPTA 1TSIA 1X6UA 5HR6A 3DFTA 1H63A 5DY2A 3S1VA 4QSHA 1CW2A 1Q6OA 1TV8A 2CZDA 3DBPA 3NNTA 3KVMA 4PL1A 3PAJA 4AWSA 4LT9A 3P74A 2XN0A 4Z08A 3M5YA 1S3HA 4FXRA 3P8IA 2YX0A 3TQ0A 2PCQA 1A5SA 5AYYA 1AW5A 5G1YA 3USBA 1YYAA 3GLCA 1I45A 3QC3A 2FIQA 5CGQA 1SFJA 1K7FA 1VQTA 5G4WA 3QSTA 2ZDRA 4JDBA 3W1XA 4ZL1A 4AXKA 2YFNA 3VKJA 2CFFA 5T26A 2WPBA 1G6CA 1RQHA 3M41A 5BMXA 1VLIA 2ISWA 4BF9A 1UUOA 2YW4A 1LRTA 1V7YA 3TW6A 1SSDA 5D2TA 5C6MA 5AHNA 1PS9A 3NXFA 1PV8A 4TO8A 2QCMA 1Q6QA 4RKAA 1DL3A 4R34A 4UTHA 5L6UA 1OFQA 4MYXA 4WXYA 1LZOA 1F05A 5EKYA 3M5ZA 5CZ0A 1VZWA 3GKFA 3UXAA 3LBMA 3GKAA 1I2PA 3W9ZA 1QDSA 4Q33A 4WUIA 1H1ZA 4JY9A 4UR7A 4YCPA 2R14A 2E77A 3LRKA 4JEQA 4QISA 5CG7A 5F4WA 1EB3A 3DFNA 1S5WA 1AMKA 2BLEA 4UMAA 3EKLA 5DCEA 2VC6A 3JR2A 4Y8FA 3PUEA 4O16A 1UBSA 3PSWA 3TW7A 4GUGA 3NQ8A 3O1NA 5G2IA 3DFQA 2BSLA 5D05A 5K4ZA 4I9AA 4MZ8A 4LS2A 4AWTA 4WY0B 3DI1A 4AHQA 4LV9A 4ZQCA 4IUOA 4GNJA 2J9ZA 2AAMA 2G5WA 4O4WA 5HINA 4O1DA 3A9IA 2YGYA 3HF3A 4NVTA 2YXGA 2VKZG 3VE9A 5A8GA 1EWEA 1TRDA 2B0MA 3UY8A 3GX9A 4K7YA 1U5JA 2QCFA 3W7RA 1D3HA 3U2OA 4EF8A 5KZMA 5HR7A 3NA8A 2B7QA 3W07A 2VEKA 4H6KA 5KZDA 2CZEA 2BZNA 2JK2A 3KVLA 4JTGA 3U6WA 5DELA 3IRDA 1E51A 3V1PA 1XBXA 1KFJA 3C61A 3N19B 3HO8A 3OEXA 4TU1A 1Q6LA 5G1TA 3W2MA 4JICA 1ZJIA 4HNNA 4OT7A 2CZFA 1RZMA 4OV4A 2Y70A 1H5YA 5D02A 2E1DA 1KM1A 4E2BA 3QSRA 3QMTA 3G0SA 4GRSA 3MI3A 1FXPA 2O7QA 3I68A 4LVBA 4P2VA 2AGKA 4N9EA 5KTLA 3S1WA 4GJ1A 1G69A 4HSOA 3LI1A 4GUFA 3BK0A 4UCGA 1H50A 1UJPA 4N9CA 3E9AA 2CLIA 4IXXA 3TE9A 5K4XA 4MJZA 1DKWA 4GUHA 4KWWA 3WK0A 2WNQA 2W79A 2RDTA 3EX1A 5U4NA 3W2UA 3N2XA 3PWAA 2DZTA 1H7OA 3UY7A 4O52A 1SW7A 1ZAJA 3M7WA 3TC6A 4M6QA 3VCRA 4WY0F 1H7RA 3LCGA 5D2YA 4PL2A 1J4EA 4JR5A 2TSYA 1KW1A 1YLVA 3G1YA 5G2HA 2Y89A 3HG4A 4WD0A 1WXJA 1FWNA 1IF2A 4O0ZA 3R8RA 3W2NA 3VNDA 1TPDA 1TPVA 3LB0A 1YTEA 1SW0A 1O95A 3MW7A 3S6DA 2ISVA 5F2LA 4RZ4A 1ZCOA 3W86A 2C14A 1I4NA 3GXTA 4E38A 2HSAA 3W71A 4HN4A 3HIJA 2A6NA 3TIMA 1MEIA 5LZLA 1I8JA 4NZFA 3GAYA 4HNUA 1U83A 1A5AA 3UWYA 3HGOA 5CPNA 1KFLA 3LHWA 2PRHA 2WNZA 1FCBA 3O06A 1YTKA 4CNOA 3OG3A 5AHEA 3W84A 1QOPA 2GOUA 3CWOX 1BTMA 1W0MA 3SJ3A 3G18A 2B4GA 1FY6A 3HGSA 5F2IA 4OHQA 4C1LA 5LNRA 1G4EA 1I2NA 4M19A 1ZALA 5FF2A 5LSMA 3HPZA 5CKSA 5KZEA 2E6AA 1YXDA 1OFRA 4OBTA 1VCGA 2R91A 4DO5A 2QCGA 1G4PA 2Y7GA 3DXIA 1WV2A 5HWMA 1QMLA 2CZ5A 2X1SA 3TSBA 2IQTA 1BKSA 1FCVA 5K9DA 1KV8A 4TIMA 4QJ1A 2DU2A 1QFEA 5F4XA 1XUZA 3IGUA 3OVPA 1YPFA 1L9WA 1MEHA 2RKXA 3NL6A 4PEKA 4NQ1A 5C55A 3NZRA 2FPVA 4UTTC 3TCEA 2ALDA 4RR4A 1THFD 3G1FA 3RNDA 1W5NA 4UMBA 3HG3A 4ZQOA 4HNTA 2QCDA 1EA0A 4NJKA 1FUYA 3KRSA 1FDYA 3W7KA 4G1KA 4RJEA 3VI2A 1KFEA 4O28A 4K6AA 4WX2A 3G1XA 4DQWA 5CSRA 3JS3A 3N9RA 1LTDA 1H62A 3ANYA 4TR9A 1RD5A 3TJXA 3PC0A 2FLIA 1DJQA 1HUVA 1O4UA 4ZZ9A 5BOOA 3EB2A 3NL3A 3MP3A 4U28A 3TSMA 3UZ5A 3P60A 4YMZA 3HOJA 4IPJA 4O1AA 1FQ0A 4K39A 3Q37A 5D30A 3FYOA 2H90A 2X16A 1IIGA 5K2ZA 3L0NA 2OX1A 1KTCA 2GQ8A 4ORIA 3U8GA 5G4EA 1SPQA 2WQPA 3NQEA 1WDWA 3W7OA 1W54A 3OHIA 1QAPA 1N7KA 2CWNA 1VR6A 1W5QA 1EEPA 5DCDA 4QM1A 1GEQA 3SI9A 2V30A 5CPOA 3F4WA 3H55A 4NX0A 4RK8A 3B0UX 2DORA 4QIUA 3BLFA 2C19A 1B4EA 3A5FA 3W88A 3N9SA 2E6FA 3SGZA 3LXBA 2NUYA 3QZEA 1XL9A 3G1VA 2NV1A 1IXNA 2Z6IA 4GXMA 1EP1A 3STCA 4IX2A 3TMLA 2X2GA 3T40A 3MHGA 2J24A 2XN2A 2NX1A 3LTPA 4JTIA 3M44A 4UFKA 1HTIA 1JULA 3SY5A 1GVOA 3E49A 3CT7A 3WJYA 5EYWA 1X1OA 3LV6A 3TXVA 3UD6A 5DBTA 2NLIA 3RLVA 3WK3A 4AHPA 4XTDA 5AC8A 3CM4A 5I3FA 2CLHA 4CQ8A 1VGAA 2PRLA 5DXYA 1PHQA 4NJGA 4JIPA 3Q94A 2VFFA 4M7SA 1HG3A 3OA3A 2Z0IA 3QPZA 1AW1A 4DPQA 3MJYA 3TNOA 2H8ZA 3SZ8A 3HGJA 4ADTA 1KLZA 3LHYA 1G4TA 2RDUA 4A22A 3BVJA 4LW7A 2GVJA 4UR8A 4NZJA 5E1QA 3W7PA 1SU5A 1S5TA 3R2GA 3GDLA 5BNKA 3UPWA 2QEZA 3SSJA 2VFGA 1JJKA 3C56A 3IIOA 3KFTA 3W2KA 4O1CA 1X8FA 3EXTA 4AWUA 4FF7A 4Z1CA 5DXXA 4QNEA 3P5YA 5KSWA 4DXVA 4BI7A 4FNTA 1K02A 3VE7A 4UTUA 1TJRA 3B0PA 4M6VA 3EWUA 1DVJA 4QQ3A 1ADOA 2NV2A 3B04A 4FNUA 3GXPA 2RDWA 4JX6A 1O5XA 1T8XA 4RLIA 2PRMA 3BV4A 3I6RA 5FF3A 4FHAA 3L67A 1L6WA 1VYPX 3I65A 2E5CA 3O6DA 3EX6A 1TIMA 4O13A 4NX5A 2Z6JA 4LC6A 4UFJA 5FEXA 4ZQNA 5EPDA 2VFDA 5CPLA 1JUEA 4LUJA 1DJNA 2GQ9A 3W7IA 1OFPA 3DFSA 2H3BA 3QW4B 4ML9A 3D0CA 4ICNA 5I3GA 4MOZA 5C2XA 5J5DA 5KMYA 2J88A 2FPYA 3FLUA 3SR7A 2C16A 1JCYA 2E6DA 3PB0A 3NO5A 3O8AA 3ZS4A 4IMFA 3TDFA 1LM1A 1TV7A 4RZ6A 3EXRA 3LLDA 3TR2A 1K8YA 2QCCA 4MIMA 3I7QA 3B4UA 3G0XA 5BW6A 3PR2A 2CU0A 2VELA 5HQEA 5DBUA 4NJJA 1C9DA 3TAOA 3TMQA 2XFWA 2Y7EA 2YW3A 5LKYA 4JYEA 5D2WA 1ML1A 3S9YA 3O05A 3W73A 4ADSA 1FX6A 3DH7A 3LV5A 4MFDA 3VFLA 4LS0A 5K3VA 3CU2A 2OCZA 4NXKA 4IWWA 1JCXA 4BI5A 1TYGA 5D09A 1GYNA 5AB3A 3HQ1A 5LHEA 2J27A 1OFOA 1N55A 4UFMA 3E02A 4EIVA 3MWAA 3RLUA 4PTNA 4MPQA 1KA9F 4UUIA 4PCFA 3T55A 1KFBA 1H7XA 3HGRA 2FJKA 2Y6ZA 2C18A 4E0CA 5DLCA 4IXHA 1F73A 3N34A 1GJPA 1K03A 1YXCA 1JUKA 2ATMA 4CNPA 2A4AA 4NJHA 3G1DA 3WFAA 1QPOA 2B7PA 1B9BA 1I2OA 2CLOA 4C1KA 1GTEA 1FWTA 1ZY9A 2F7FA 4Z0SA 1TTQA 1LLWA 3KOFA 4LOCA 1XC4A 3S8HA 3C2VA 2BXVA 3P5ZA 4FXSA 1GWJA 4J9JA 5TQLA 4AVFA 1TPUA 2ZRZA 3C4UA 4NXSA 4O4VA 3ZWSA 4UNLA 1Z42A 6ALDA 4JTUA 3LM7A 4IX0A 5IM51 3INPA 2JGQA 2HS6A 4KKXA 5CZTA 2YYUA 4XQ6A 2QCLA 2FB2A 2DZSA 3G0UA 4NNBA 3LXCA 1NF0A 3DFPA 4H4IA 3BG5A 1X1ZA 2Z2UA 2HTMA 2I1OA 3CTLA 4UNKA 3MYPA 4O14A 1PE1A 4CCEA 3LCLA 4K38A 3S1XA 2I14A 2EHHA 2W6RA 4Q32A 3YPIA 4QITA 2A7PA 3KVJA 4N02A 3W7CA 4XZ9A 1I2QA 1A53A 3GIYA 3SGUA 3M5VA 3O63A 2CLFA 1OG0A 2V5BA 1YTDA 2ZRXA 3O16A 4JN6A 2QR6A 2DZWA 4N4QA 3W7MA 1XI3A 4K36A 5KITA 4ZVJA 5DN1A 3LBCA 1RQBA 4UTTA 2CLEA 3MBFA 1LOLA 2HMCA 1OFAA 1NVMA 4BWLA 1JQVA 3IIPA 1TPC1 2QAFA 3FFSA 3NPUA 1XCFA 3G3DA 1TQJA 4EVZA 3P67A 1AK5A 3NOEA 2ZZ6A 3NDOA 3PULA 5I3HA 3QF0A 4UTWC 3TFCA 1VPXA 4R7JA 1GVRA 1TPH1 3A23A 4ADUA 4YLWA 1SW3A 1QR7A 3MBDA 4L4LA 5FEZA 3ZR4A 3CWNA 1TTJA 3H54A 1XBVA 3DU0A 4I7UA 1SZGA 2YZRA 1VYSX 2NZLA 3MP5A 4OU1A 5D38A 1S5VA 3LCWA 5DY3A 2QUTA 1EX5A 1SO3A 2ZYFA 5EBUA 2Y7FA 1QPQA 3GDTA 1G4SA 2QJHA 2VEIA 1F5ZA 1SO5A 1QPRA 1W56A 1R46A 4DO6A 3M9YA 4O12A 3F03K 4WOZA 1JCLA 2YCEA 2DP3A 4O11A 2YPIA 4IPIA 1LBFA 3RK8A 5E93A 2WSQA 4FO4A 4GWEA 1CI1A 2WJZA 1PL9A 3IGXA 1ONRA 1GVSA 1SZEA 4R33A 4UMCA 3ZFHA 3L0GA 3C8FA 2QCDB 3SFKA 2Y85A 3B05A 2C0AA 1R2SA 3M43A 4GBUA 4O0KA 4W9TA 3STEA 2ZTJA 1O5KA 2Q3RA 4MY8A 3EKZA 1T99A 3TJLA 3QMSA 4HSNA 2ZRYA 3THAA 3Q58A 1EP3A 4Q4KA 3W1TA 1R2TA 4IMDA 2TRSA 1SSGA 2X1UA 2VEMA 1DHPA 3ZWTA 1GG0A 5I3IA 4YL2A 5SWUA 3M1ZA 1TTIA 3G3MA 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 1P0N A;  1TQX A;  1XBY A;  1EPX A;  4O8R A;  2NX3 A;  4TMC A;  2QDG A;  1GVF A;  1ALD A;  1HL2 A;  4ZQP A;  1W31 A;  3TA6 A;  1G7V A;  4JTL A;  3PUO A;  5L9F A;  4Y90 A;  4HPX A;  3C3N A;  1YPI A;  5HNR A;  3BLE A;  2CW6 A;  1DV7 A;  3PG8 A;  4Y96 A;  1IGS A;  3BW4 A;  3BLI A;  2GJL A;  3QYQ A;  2YSW A;  2NUW A;  1ZFJ A;  2J9X A;  1LBL A;  3PBY A;  4MYA A;  3F4N A;  3W87 A;  3IIZ A;  2NUX A;  3TSD A;  1WBJ A;  2ZZ3 A;  4UFL A;  3OBK A;  1LOS A;  1LOQ A;  4IME A;  1LP6 A;  3LHU A;  2D73 A;  1QWG A;  1TMH A;  1J5T A;  1OK4 A;  2ZFA A;  1ICP A;  4TX9 A;  5TBO A;  4AF0 B;  3GAK A;  4S2C A;  3HG2 A;  3WJW A;  3NQG A;  4NJI A;  1JRC A;  5D2V A;  3W1U A;  2QUV A;  4AHO A;  3WJS A;  2V8Z A;  3BG3 A;  1CX9 A;  4ZMG A;  2GJN A;  4GE8 A;  5K9X A;  3NQF A;  1K8X A;  3UPB A;  2DZX A;  1XM3 A;  3UWZ A;  2A7R A;  1HO4 A;  5HUO A;  4JS3 A;  4X22 A;  3HJZ A;  4BFA A;  3NQC A;  4LNY A;  3CPR A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1PVN A;  3S42 A;  2G41 A;  1UWI A;  4AVN A;  4N42 A;  3M0H A;  1P5B A;  2WVV B;  3QYS A;  1JRB A;  2W63 A;  4GK8 A;  1V8E A;  3LHZ A;  4JNM A;  1IT0 A;  3N2C A;  3Q65 A;  1EZW A;  3N6H A;  2GGE A;  2PC4 A;  3EPM A;  3VIK A;  2VQU A;  3BCF A;  4CQA A;  4GAC A;  4JQA A;  2VR2 A;  3TLL A;  1MMF A;  3C0Q A;  2G50 A;  2OEK A;  4LY8 A;  3FA3 A;  2ZA2 A;  2ZUW A;  3M16 A;  1KM0 A;  1WXY A;  1Q65 A;  4K37 A;  4DLF A;  4HT3 A;  3LHV A;  3IAQ A;  3SCU A;  2CLL A;  4CN6 A;  2JBM A;  3RYS A;  2RJG A;  4B5S A;  2VWS A;  1KLY A;  3LCF A;  2R1N A;  4E2D A;  4DN1 A;  3VKD A;  4WKA A;  4TMB A;  4IIH A;  3IS4 A;  1ZRQ A;  4FK9 A;  5HDR A;  4KWU A;  1ZNN A;  1TVN A;  5LIW X;  4AF0 A;  4UTM A;  5FOO A;  2Y62 A;  3H2C A;  4KFP A;  3PPC A;  4QBX A;  4QE1 A;  1XUU A;  2UZ9 A;  1A5M C;  3N4A A;  2YR1 A;  2ADA A;  3KCO A;  4MAV A;  1S2V A;  1G01 A;  2VC5 A;  3C52 A;  3QZA A;  5LXX A;  5HAT A;  4ACY A;  2WSY A;  1X38 A;  3CC1 A;  5A69 A;  2Q71 A;  4E4P A;  3VIJ A;  3UZX A;  2JF6 A;  3EYP A;  2VFI A;  3W0K A;  3SRK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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