4HT3A

The crystal structure of salmonella typhimurium tryptophan synthase at 1.30a complexed with n-(4'-trifluoromethoxybenzenesulfonyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f9) inhibitor in the alpha site, internal aldimine
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Allostery and substrate channeling in the tryptophan synthase bienzyme complex: evidence for two subunit conformations and four quaternary states.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 102
structure length 268
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2012-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ht3A00
4DBEA 4GNJA 1AK5A 4QNEA 2G97A 3NPUA 1FXPA 3GAKA 5HMSA 1XI3A 1EP2A 5EPDA 2DJXA 4XUGA 4OT7A 3S1UA 4HSNA 1VLWA 2YSWA 3PUEA 5CG7A 3I7SA 3GDLA 1Q3NA 3MP3A 1JCJA 3W22A 3C0JA 4R33A 3MI2A 4LWWA 5G4WA 1DQWA 3F03K 3M16A 2X16A 1KM5A 5U4NA 1LOLA 1LBLA 3M41A 4TMCA 5D2XA 5AHEA 1R2SA 1AW2A 4O14A 1VS1A 4UTLA 1GVQA 3MMTA 5AHLA 5H91A 4IPJA 5IBXA 3B03A 2G5WA 2VKZG 3IRDA 4IMFA 4MY8A 1N8FA 3RNDA 1GJPA 1K8XA 3DI0A 4DEFA 3PR2A 4U4MA 4IUOA 4RKAA 3W1NA 3M47A 5F2IA 2J88A 3DFPA 1G67A 3EWWA 3IV3A 2FFCA 1QOPA 1FQ0A 3I7RA 1SZEA 1HUVA 5TIMA 1XDLA 3GXTA 2KZHA 2QCEA 2EGZA 3W3OA 3MI6A 3CWOX 1THFD 1X6UA 2VEIA 3LX9A 2V2DA 2FLIA 5D04C 4BR1A 3SJ3A 2VFEA 4N6EA 1VQTA 3W7OA 3LHZA 3HB9A 4ZQCA 3HGJA 1QPQA 3QRHA 3DENA 2NWSA 4HNUA 1F74A 2QCCA 2VELA 3A5FA 3GDKA 1KTBA 3E96A 1BKSA 5BW6A 6ALDA 3HG3A 4OU1A 4O16A 4LVAA 3A9IA 1BWKA 4O12A 4EWND 3NL6A 2DZVA 2ATMA 3KHJA 3W7DA 4FNQA 4IMCA 4P61A 3TW6A 2H8ZA 3MHFA 1WA3A 1Z41A 1NSJA 1TCDA 1TPC1 2PRHA 4AF0B 3DFOA 2NXGA 3W1TA 4MLJA 2BX7A 3T7VA 5F4WA 2DZXA 2XFWA 2D73A 1W3IA 4CQAA 2QUTA 5DXXA 3G22A 3NPWA 4AHQA 3KX6A 4O4VA 3TX9A 1TPFA 4FNRA 4WY0F 1GG0A 5EL1A 4FIQA 2A4AA 4HN4A 5AYYA 3MJYA 5KITA 3GZ3A 3LV5A 3DHDA 5A5WA 1N55A 2A6LA 3N19B 3IVUA 5CSSA 4W9TA 1O5KA 4MZYA 3SI9A 2Y85A 1KM1A 4LV4A 3MUXA 3C2EA 1I2OA 4E2DA 4NUWA 5G1YA 3N2XA 3ZR4A 1F6PA 3PULA 2ZTKA 3L21A 4HNTA 3R12A 1OFOA 3THAA 3TJXA 1V5XA 3W7GA 1ZNNA 2OX1A 1JR1A 4Y8FA 3CQ0A 5BMXA 3N9SA 4K7VA 4JX6A 1SPQA 1XL9A 4JD4A 1JUKA 5I3IA 1OJXA 4MZ1A 2GQ8A 1VCGA 4FX7A 1P0KA 5I3KA 1S3HA 4MY1A 2CW6A 2B7PA 3M5XA 1ZALA 1NFBA 3GAYA 4NT0A 1U5JA 2QDGA 3TNOA 4YCPA 3N34A 4UFIA 3OIXA 3BVJA 4S2CA 5I3HA 4MLRA 1TPUA 4UTIA 1T8XA 4QQ3A 1SSGA 3RFAA 5KTLA 3NVTA 4HNNA 1CX9A 4UTMA 1OVDA 1OX5A 5AHNA 1QDSA 3UZJA 4MFDA 1SZFA 1KM0A 1JVNA 3R2GA 4WX2A 2V8ZA 3UQNA 1PS9A 3HG5A 1H61A 3TSBA 1B57A 2JGYA 4Z1DA 4O18A 1XXXA 4MJZA 2Y88A 2QAFA 3RK8A 1NEYA 3A24A 3T78A 4Z0SA 4QISA 1EEPA 1TTQA 3QM3A 3P7YA 5E1QA 3QSTA 4GC4A 3L2IA 1Q6QA 3NQ6A 3LHTA 2V5BA 5TQLA 1P1XA 3ZFHA 2B7QA 1AMKA 3JS3A 4IWWA 2O7SA 3MW7A 5F2MA 1H7WA 3BARA 1L9WA 3B04A 3PS7A 4RXGA 5LGXA 5D05A 1FWNA 5LGZA 1OF8A 1PCWA 1FY6A 3LLDA 3GLCA 4ZQOA 2WJZA 3O15A 3GDTA 3BK0A 2WSRA 1B4KA 1TO3A 3PM6A 4WOQA 3W1XA 1AL8A 5D30A 2OT1A 5HNRA 3FA5A 5D02A 4JN6A 4AAJA 2WSYA 3TSDA 4LS0A 3OVQA 3EX3A 2ZTJA 2CLEA 5HULA 3FJLA 5DCEA 1DORA 1F73A 3LXAA 4A2SA 1D3HA 1FWWA 1OK4A 1W5NA 4AWTA 1D3GA 3HPZA 1QAPA 2W0UA 2ZRYA 4Y9AA 4TO8A 3S1WA 4EVZA 1WQ5A 1YTDA 2NXIA 2FB2A 3HO8A 1WXJA 3G0SA 1FWSA 2ZBTA 3F4WA 3ZWSA 1WV2A 3IIZA 5SWUA 4ALDA 4IPIA 3M7WA 3VI2A 4LW7A 1TREA 1YDVA 4GUGA 5EKYA 3LHWA 1TQJA 4E2BA 1ICQA 5CGQA 4KWWA 3EXSA 4N02A 1MEIA 4FXRA 1E51A 2NV2A 1LDCA 3QEZA 3NQFA 3UXDA 2BLEA 1S5TA 3W7KA 1YADA 1ZENA 5AYXA 1G4PA 2C19A 3GR7A 3BV4A 5LNSA 2E68A 4CCDA 3P67A 5C2XA 1SUXA 2AAMA 4OQVA 3ELFA 3I68A 3Q37A 1W5MA 3GB6A 4K38A 3G1YA 3SGZA 3NPVA 4LUJA 2NX1A 1ZAHA 4CCEA 1EB3A 3GX9A 4IX0A 4TU1A 1S5VA 5K9CA 4O8RA 1VYSX 4S1FA 4O1AA 1R30A 3LBCA 3DHFA 2ZYFA 3VNDA 2X1RA 1SW3A 4X9SA 3G1HA 4I7VA 1D9EA 1XBVA 4UTJA 5F4SA 3MWAA 5I3JA 3TDFA 2QUVA 1OX6A 2ISWA 3DI1A 3QJAA 2G96A 2HS8A 4O1DA 1KM3A 4TX9A 2YFNA 3I6RA 2DJLA 1SO5A 3MYOA 4QITA 4OBTA 1W5PA 2QJGA 4GUJA 1TQXA 4AHOA 1KFCA 3W7CA 1F05A 1WX0A 3LLFA 4ADSA 1AW5A 1L6YA 1FXQA 2UV8G 3L65A 5G5IA 2A1YA 4OWGA 4PC8A 3W1LA 2A7RA 3W07A 2YZRA 1J4EA 3TSMA 3PUDA 4PH6A 3L66A 5A8GA 1C29A 3SR7A 2R8WA 4ADTA 2ATSA 4RZ6A 4O11A 3UXAA 1KFEA 2QCNA 3MO7A 4JTFA 1HL2A 4NQ1A 3PB0A 3TR2A 2VFFA 3S6DA 4P2VA 5FF7A 5CZSA 1ZFJA 4DPQA 3G1XA 4M6VA 1K8ZA 4O13A 4TIMA 2Y7GA 5FESA 4UFJA 2EPHA 3PY2A 3RLUA 4CLMA 1OF6A 1HO4A 2ABAA 3KRUA 3DFSA 3P81A 3TQKA 3Q58A 1HFBA 2Z6JA 3R89A 5C55A 1IGSA 1QPNA 4BK9A 2YW4A 3NL2A 1KTNA 3LHYA 3W84A 3W86A 1KBJA 1JJKA 5G1TA 3C2OA 4YLWA 1XUUA 3TFCA 4KFOA 3SFKA 1EUNA 4LVGA 4LRSA 3P84A 1ZY9A 2X1TA 3T44A 4Q4KA 2X1SA 1W3NA 1EX5A 3Q2DA 3IGXA 1LORA 3CEPA 3E49A 2ZZ1A 4NX0A 1IF2A 1SO3A 1SW0A 1YPIA 4NNBA 4R34A 5AB3A 1M7OA 2QJHA 3O06A 3W7RA 1OFRA 3NQDA 1QNVA 1EP1A 3WJZA 3NQCA 2WV8A 1CI1A 2NLIA 1G69A 3NO5A 4XBKA 4O1CA 3NM1A 5EA9A 1R46A 3QC3A 5DCDA 3W2MA 3MHUA 1MEWA 5D2YA 4JDBA 3FS2A 1JRCA 2QKFA 4PFMA 5K2ZA 3W72A 5K7JA 3HBLA 1GYLA 1DJNA 4M19A 1T0OA 4ORMA 2FIQA 3UNDA 1SFJA 4GUFA 3DU0A 3IIPA 5HR6A 4M6PA 1QWGA 4PL2A 3BGJA 2CZDA 3DKLA 4DPPA 4JYFA 4XZ9A 3S1XA 2VEKA 4PA8A 4H4IA 3STCA 1PHQA 1A5AA 4Z1CA 3P60A 1C9DA 1TRIA 4DQWA 1NF7A 1O94A 3M5VA 4O53A 3P62A 3NPXA 5KZEA 1JULA 2A85A 4G1KA 4K39A 2HMCA 2DORA 1PE1A 2H8XA 1PCKA 2YXGA 2TPSA 4JICA 1W56A 4HKPA 2HTMA 3O63A 2QCHA 3B05A 3PBWA 4TR9A 3PB2A 2YCEA 2CLHA 2VEPA 4BI6A 2WOQA 3PG9A 3MHGA 4UC5A 3N3MA 3P61A 3FOKA 5FEXA 1H1YA 1F7BA 2H3BA 4WY0B 4LC6A 3QF0A 1SO4A 1L6SA 1ZAJA 3OEXA 3TAOA 3TQ0A 2GJNA 3W87A 1W0MA 4B5NA 2Q3OA 3T55A 5FF4A 4ONVA 3NM3A 1WOBA 3HF3A 3B06A 4AWSA 4K36A 1Z42A 4GUHA 1GPWA 3GKFA 1DVJA 2QEZA 3W74A 5ABTA 2Q8ZA 4CCCA 1GVFA 3BG3A 1Y0EA 4UXDA 1SO6A 3M1ZA 3LHUA 8TIMA 1XCFA 3ABOA 1VJIA 1TTPA 3NXFA 3M5YA 3WK2A 4FX6M 3CLMA 3KAOA 4LTSA 3L0KA 3EEGA 1GTHA 2TSYA 1O4UA 3CC1A 1HG3A 1G7VA 4MIMA 3GYEA 4JTSA 3C6CA 5AYZA 3PBUA 1TV7A 3W7QA 3FLUA 3B0VC 4MFEA 4JTTA 2QR6A 2QF7A 1F5ZA 2AQWA 4NNAA 1K7FA 4BI7A 1GVOA 1PVNA 2FQIA 3C3NA 4JR5A 1J2WA 2DU2A 4O28A 4MVAA 4QAIA 4RXFA 1W3TA 1XKYA 3PSVA 1ML1A 4MY9A 3STFA 2V30A 4RX0A 1IXPA 3NGJA 3QW3A 3S5NA 1G6CA 4FNPA 5HQEA 5HWNA 2YYTA 3EWUA 3MBDA 1VH7A 5G2IA 2ZRVA 3U6WA 2J9YA 4FIRA 3NQMA 1OFDA 2Y7DA 3ANYA 2E1DA 2X30A 5LSMA 4NU7A 2FB3A 3TE9A 2XN0A 5EMUA 3CHVA 1DHPA 1VCFA 3S42A 3BW3A 2H3DA 1MEHA 4Y6GA 2GQAA 2B7NA 4JX5A 4XBSA 4AH7A 3QMSA 1F76A 3WJWA 1QCWA 1YDNA 2HS6A 3STGA 1EIXA 1RVGA 3KVMA 3NL3A 4NX5A 5J5RA 2J9ZA 2ZFAA 2E6DA 1B3OA 2NUYA 4O1BA 5C6MA 4DO6A 1IXOA 1Q6RA 4H3DA 2DZUA 4Z1AA 3OVPA 1FWTA 1T99A 3R8RA 2J6XA 1JUEA 3W1AA 1KLYA 3L5AA 3S8HA 4O4WA 5F1UA 2EF9A 3R5EA 1S5WA 4AWUA 3U2OA 4KWVA 3TA6A 1IXQA 1SZGA 5FF3A 2PC4A 5HUPA 1H50A 1KA9F 1GVSA 1IIHA 5IM51 3UWYA 4XKYB 3W2JA 2QUUA 3S0CA 1FCUA 3NNTA 3TFXA 4IXHA 4MKNA 3GKAA 3W7LA 4LY8A 3NQAA 3E9AA 3G8RA 3FKKA 1NAL1 2VEMA 3MP4A 4O19A 4IJBA 1XBXA 1TPWA 1N7KA 1TJPA 3ZWTA 1I2RA 1OK6A 2DZPA 3G1DA 3W83A 1OFEA 5CPMA 3EWXA 4N9BA 4CQ8A 5LHFA 4ZZ9A 1R2TA 1G4EA 3SW6A 4OV4A 1BEUA 1K03A 4LS2A 4UFHA 3NYZA 5DY3A 1IIGA 1DKWA 1QPOA 3VCRA 4NJJA 5DN1A 4JGDA 5D33A 1TV5A 4WJEA 2XN1A 3B8DA 1EUAA 3VFLA 3EX1A 1H7XA 1QO2A 1H7RA 3QH2A 2C6QA 1W5QA 4UTTC 1LRQA 3C2VA 4DF2A 5BRBA 2Z2UA 3TUUA 4J9JA 3NR0A 2H6RA 4OGZA 5AHFA 3ABQA 5BOOA 5FEPA 2Y63A 2TMDA 3TMQA 1TPH1 3FFSA 5G2WA 5T26A 4UFKA 3V1PA 2CLKA 3OA3A 3L0GA 3UD6A 1I8JA 3M0ZA 3OBKA 3LXCA 1X1OA 3NQGA 5EY5A 1UJPA 3N14A 3UWVA 2PRMA 1GVRA 3O6CA 5TBOA 2FTPA 1UASA 5F2LA 4X2RA 3E12A 3C61A 3LRLA 3G18A 3PF3A 4IQLA 1KV8A 3CTLA 5CPNA 4I7WA 2A7NA 4AEOA 3LCHA 2TRSA 4A2RA 3ATZA 5K9XA 3BLFA 3KFTA 5I3FA 1OX4A 3C2RA 1VZWA 1UBSA 2E6FA 5EBUA 4KFPA 3T4CA 3F4NA 4WZHA 3IVSA 4PODA 1LTDA 3SY5A 3NA8A 5CZTA 3LCLA 4UCGA 4NJGA 1AW1A 1AL7A 3LBMA 2EKCA 3V75A 2VFGA 4FNTA 4X3ZA 3WJXA 3A23A 3I7QA 1TPVA 3CM4A 4UTTA 3O8AA 4D2JA 1Z44A 7TIMA 4R7JA 1WOAA 3LCFA 1QR7A 3N9RA 4AB4A 1F2JA 3BW4A 3QZEA 1GZGA 2IQTA 3BLEA 5LZLA 3FKRA 1SSDA 2V5LA 2YGYA 3LOTA 1YPFA 3CPRA 2X1UA 3NOEA 4XTIA 3M43A 3LTPA 4O52A 3W7PA 2ZRUA 3PUOA 3G1VA 1W1ZA 2Z1BA 2ZQ0A 3UWUA 1W37A 4M5PA 1HTIA 3W1PA 3L68A 3W88A 5FI8A 4DELA 3OVRA 2WNQA 2W6RA 3G3DA 3S5YA 4H6KA 4CNOA 1JRBA 1O60A 1WYIA 3UPBA 4RK8A 2YX0A 4O50A 3NG3A 1GQNA 2O7QA 1VC4A 2VFIA 4LOCA 4BI5A 1GWJA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HN8 A;  4C7F A;  1CGU A;  4P5U A;  1DWA M;  4CNS A;  5DRC A;  3NZQ A;  3TJ4 A;  5EPD A;  2J79 A;  3NUK A;  3MWC A;  1VLW A;  3N15 A;  1QHP A;  4AVN A;  3AUO A;  1FWF C;  3WD4 A;  3W22 A;  1OB0 A;  2EXO A;  1C92 A;  3MV1 1;  3BE7 A;  4OBS A;  2E25 A;  3M16 A;  2I5G A;  3VKD A;  1LOL A;  4TMC A;  4YNG A;  2XU2 A;  3GU1 A;  5AHE A;  4DNM A;  1R2S A;  4IP5 A;  4W8B A;  1TFV A;  3RX3 A;  4O14 A;  1L8N A;  3KBN A;  2WJE A;  4DXK A;  3MMT A;  5IBX A;  2G5W A;  2VKZ G;  4FA3 A;  5B80 A;  3CGT A;  3BQ6 A;  3U5U A;  2VUN A;  3DER A;  3HTW A;  1K8X A;  1ITU A;  2J62 A;  3PR2 A;  3W1N A;  4TX6 A;  2PMQ A;  5HJX A;  4NRR A;  3I4E A;  2P88 A;  5F2I A;  2J88 A;  1G1Y A;  2BGS A;  3U4F A;  3V4B A;  1RBO B;  1K6A A;  1FQ0 A;  4RDV A;  5I6S A;  5JUV A;  1F3T A;  1XDL A;  4FAM A;  2V3F A;  2EGZ A;  3MI6 A;  1JDD A;  4DI8 A;  4QRO A;  2HRO A;  2QJN A;  2V2D A;  2DZB A;  3S9I A;  2P76 A;  3VIF A;  1FP9 A;  2VFE A;  1Y5V A;  4BQ2 A;  4XD4 A;  3HGJ A;  1QPQ A;  1SR0 A;  2G41 A;  2F61 A;  2NWS A;  3GNP A;  4HNU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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