4K6A | Genus

Total Genus 98

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	98
sequence length	255
structure length	255
Chain Sequence	MRHPLVMGNWKLNGSRHMVHELVSNLRKELAGVAGCAVAIAPPEMYIDMAKREAEGSHIMLGAQNVDLNLSGAFTGETSAAMLKDIGAQYIIIGHSERRTYHKESDELIAKKFAVLKEQGLTPVLCIGETEAENEAGKTEEVCARQIDAVLKTQGAAAFEGAVIAYEPVWAIGTGKSATPAQAQAVHKFIRDHIAKVDANIAEQVIIQYGGSVNASNAAELFAQPDIDGALVGGASLKADAFAVIVKAAEAAKQA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
molecule keywords	Triosephosphate isomerase
publication title	Structural, kinetic and proteomic characterization of acetyl phosphate-dependent bacterial protein acetylation. pubmed doi rcsb
source organism	Escherichia coli
total genus	98
structure length	255
sequence length	255
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date	2013-04-15

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4k6aA00

1VHCA 4FX7A 3C56A 1FBAA 3P8JA 1W31A 3GX9A 3MJYA 1WOAA 1KFEA 3QQ0A 2A7RA 3EXSA 3G18A 3NA8A 1ALDA 3RLVA 1JCYA 2Q8ZA 3G0XA 3O8AA 3QQ1A 2R94A 3TUUA 1LOSA 1S5VA 1P4CA 2V5LA 3DFTA 2W79A 1SO6A 4UFIA 4PFMA 4AH7A 1ZENA 5TIMA 2YX0A 3MBDA 3KVJA 3P61A 2YCEA 4ORIA 3LLDA 3PB2A 2WO5A 1GVQA 4O1BA 3GAKA 4UTUA 2VEIA 1FQ0A 3S5NA 3B05A 1W5NA 3E96A 3TE9A 2CU0A 3GKFA 4XKYA 3MO7A 3P62A 2CZEA 1U5JA 3T7VA 3BW2A 3W2JA 2OT0A 4PTNA 3W7KA 2WOQA 3BW4A 4JY8A 3W7NA 4JIPA 2ZRXA 3P82A 2NX9A 2JK2A 1LYXA 1KM6A 3A5VA 3NM1A 4TX9A 4NZJA 5J5RA 2Z1BA 4M6PA 3W73A 4HHPA 1RQEA 1AW5A 3N3MA 1KFKA 1FX6A 3KVKA 4NXSA 1W5MA 1O94A 3M1ZA 4K39A 1GVSA 3LI1A 1TPWA 3GDTA 3A24A 3I7SA 5BMXA 2FB2A 4ONVA 4LNYA 2JKPA 1N55A 1FXPA 2RKXA 1H7RA 1QPRA 3D0CA 5KTLA 1KM0A 4NJKA 3IVTA 3HG4A 4H4IA 4N6FA 4O4WA 3HJZA 2VC6A 1W5OA 3BG5A 2J9ZA 1G4TA 4K37A 1YPFA 5FEZA 1W5PA 4JYDA 1T8XA 1JCMP 4CQ9A 4K8EA 4KWWA 3ZWTA 5FF4A 3R8RA 3IV3A 3NR0A 1I2QA 5LGXA 3W2UA 2RDUA 1SSGA 3USBA 1VHNA 3KVLA 2VEPA 1K8ZA 2CLFA 5HINA 4E38A 3LI0A 3STCA 3M5VA 1EB3A 3I6RA 3LM7A 3W7JA 3IVSA 4G1KA 1KBIA 4LVDA 5CPNA 2VENA 2P1FA 4DEFA 4DF2A 3DENA 1W37A 3MHUA 2PE4A 1P1XA 4Q33A 1QAPA 2NZLA 1JVNA 1JCJA 1RQHA 3W85A 1OYAA 5G4EA 5CSSA 4O10A 2YPIA 3B03A 1FWTA 1GTEA 4MZ1A 4S2CA 1QO5A 3WJSA 1PCWA 2Z0IA 5C5YA 3UQNA 3LHUA 5LGZA 2RHGA 3VCRA 2QCFA 3C2OA 4UTIA 4IX0A 3TAKA 4XBKA 4BI5A 4O0ZA 1O95A 3O63A 1O4UA 2CLOA 4YXGA 4LV9A 3BK0A 2GVGA 2EHHA 1OVDA 3G3DA 4HNTA 4IXXA 5L6UA 5DCBA 4LVAA 3OVRA 4N6EA 3HIJA 3MI2A 2YDAA 2YSWA 4B5NA 3QW4B 4ZQNA 1GYNA 1EX5A 2Y85A 4K38A 4NNAA 4BI7A 2P0OA 3NL3A 3DI0A 3Q94A 3IIVA 3LV6A 2ZDRA 4IMEA 5F4XA 5T26A 4R34A 1GVRA 3PG8A 3W75A 3EWXA 3GXNA 1TPC1 1XBZA 4WY0A 2GVLA 5K9DA 3T55A 5KITA 1YXYA 3E12A 4TMCA 2ZZ3A 3UWQA 1TTQA 3FFSA 3A22A 3RU6A 5F4WA 2I14A 1I8JA 2ABAA 1A53A 5LNSA 4AF0B 4JS3A 1G4SA 4OHQA 4RZ4A 1F2JA 1K8XA 3VKJA 4BR1A 2ZZ5A 3Q2DA 3GZ3A 3NXFA 4WD0A 5LSMA 4NJHA 3LCIA 4LS2A 3GK0A 1OABA 3HG3A 4ZZ9A 1TSIA 3KAOA 2C3ZA 3G1FA 1XKYA 4PODA 1VYSX 3LTPA 5BW6A 2E5BA 5C55A 2GQAA 4O53A 4XWUA 2DU2A 2WV8A 1QPOA 2DP3A 3BPWA 2Y7DA 3LXBA 3KX6A 3Q58A 1KV8A 3W1MA 5AC6A 3NQDA 2G97A 1XBVA 3EKZA 4Y90A 1G4PA 3U8GA 3QPYA 2B7NA 4FIQA 4NU7A 3W71A 4NJGA 1YXDA 3NZRA 5DY2A 2ZRWA 4P61A 3I65A 3SGZA 1ICSA 1JCXA 1JUBA 3G1VA 3U6WA 1FCBA 2A1YA 3O07A 1MEWA 2ZRUA 4GUGA 3S1UA 2QEZA 2ZZ4A 1FWSA 1WQ5A 3EWWA 3O6YX 3T44A 4NXKA 3QYQA 3L9CA 3HMJG 4RKAA 1OFBA 3N73A 1LM1A 1TIMA 3TW6A 4K7YA 5G2HA 1GWJA 2ZCGA 2J6XA 3WK3A 3WK2A 3L0NA 3SIZA 4JR5A 3KRSA 3LRMA 3EX4A 3G0SA 2XN1A 5DY3A 4WXZA 4IJBA 3GNNA 4U28A 5AC8A 4QAIA 4FNSA 4FXSA 4Y6GA 1UCWA 3QEZA 3IGSA 5C54A 1H1ZA 1V5XA 1KA9F 4UTMA 3M7WA 3QM3A 3ABQA 3TMQA 1DBTA 3KXQA 2QUUA 3TJLA 4LS0A 5D04C 4Z08A 3UY8A 3W7MA 4X3ZA 4BFAA 4LWWA 1H62A 4LV4A 3O1NA 3S8HA 5DCEA 3P5YA 3TU9A 3L0KA 2H90A 5KINA 5C6MA 1F76A 3IVUA 2PRMA 3N19B 3RK8A 2NUWA 4JD4A 2YGYA 2NXHA 3LERA 3QF0A 4JX5A 1Q3NA 1SZNA 3IIXA 3RLUA 3CHVA 3MBFA 1B9BA 2HS8A 3R2GA 3SJ3A 4TMBA 1CX9A 4LTSA 4DBDA 3W74A 4HNVA 1K7FA 1GZGA 3DZ1A 4CNOA 3L0GA 3C0JA 3TROA 4JTTA 3BLFA 1PVNA 4YLWA 1R30A 2VXNA 1GOXA 1TV7A 4FB7A 5D02A 3SZ8A 3TJXA 4UNKA 1KTCA 1GTHA 5KSWA 2F84A 1ZFJA 1VLWA 2AGKA 4UMAA 3GR7A 1TRIA 3PBVA 2ABBA 2X1SA 2E5CA 4GUHA 5FI8A 4HNUA 3S42A 2QCCA 3L5LA 4O18A 2V9DA 5J5DA 3S1XA 3W1AA 1F6PA 3QMSA 3G1AA 4HKPA 2NUYA 1WOBA 5I3JA 4GC4A 4ZQOA 3OIXA 1S5TA 3W3OA 3VNDA 1NVMA 3TV8A 3O15A 5FEXA 4ALDA 2CZFA 4JX4A 2CFFA 1MZHA 4MY9A 4WUIA 3TNOA 3CEPA 2ZTKA 4Y8FA 1XCFA 4H3DA 3TAOA 1M7PA 3W72A 2OT1A 2EKCA 3BG3A 1BWKA 3DU0A 3R13A 4WQ6A 1SW3A 1SO5A 2WNQA 4FHAA 3OEXA 2TYSA 4ZMGA 2ZBTA 1Q6OA 3TXZA 4UC5A 3MP5A 3G22A 4GWEA 1RD5A 1VCGA 2V81A 4RXFA 2J9XA 3HPSA 3MI6A 3PAJA 4WY0F 2E5DA 3C8FA 1FY6A 4O1CA 2FLIA 2VFGA 1KV5A 1X7FA 1A5CA 3MHGA 1W3IA 3L65A 2RDTA 5DN1A 5C2XA 3MYPA 5LNUA 1KFJA 3BLIA 4FX6M 2CLLA 3C2EA 3VI2A 1OF6A 3PSWA 3UWUA 3CEUA 4RZ5A 3ATZA 3GKAA 1GJPA 4ZQPA 1ZAIA 1VYPX 3TA6A 4JICA 4E0CA 1VYRA 4EOUA 2QCLA 5KZEA 2G96A 3QW3A 3JRKA 4MUZA 3LBMA 2WSYA 4OE7A 4LUIA 3BGJA 1PHQA 1VRDA 1F7BA 2H8ZA 2V82A 3QMTA 4IMGA 5K4ZA 2BZNA 4O8RA 1VR6A 2HSAA 1AL7A 3UXDA 4DPQA 3NPWA 3WJYA 2C19A 3E49A 3FKKA 1H60A 3N2XA 4Z1BA 2C14A 1T96A 1ZY9A 1OK4A 2HMCA 2X1UA 3HBLA 3SW6A 2YFNA 2ZA2A 5G1YA 4Z0SA 1WAUA 4N9CA 1XUZA 3PS7A 1IXNA 4DF0A 3S0CA 3GNDA 3C2VA 5GVJA 3WJZA 3W2NA 3TSBA 4JDYA 1LBFA 3UNDA 4NQ1A 5DBTA 4ORMA 1C9DA 5A5WA 3TSDA 1KTBA 1L6WA 3THQA 5HNRA 3HG5A 1EEPA 3N34A 1ZNNA 3L5AA 3HGRA 4M6VA 4BWLC 1Y0EA 1ADOA 5EKYA 2FB3A 1ICPA 4JTJA 5IBXA 3G1HA 5D38A 1OG0A 3EWUA 4CCEA 1UASA 2VFEA 2YFOA 4GUFA 3UPWA 4HN4A 4UUIA 5HMSA 3F1QA 1GG0A 3G1SA 1QR7A 1LCOA 3OG3A 5HJLA 3W6YA 5EPDA 4LC8A 3PUOA 2QKFA 1I4NA 1WBHA 3TQ0A 5FEWA 2BXVA 4PC8A 4A22A 2LLEA 4H6KA 4QITA 4R53A 4PL1A 3LCLA 5I3GA 2E68A 4M5PA 3C52A 3EX1A 3P80A 2Q8LA 3QRHA 3E0IA 4AB4A 3KVMA 5D2YA 1H63A 3OVPA 4UFJA 3S6DA 5HR7A 4A29A 4N2YA 5AHNA 1RV8A 1K3UA 1L6SA 4UXDA 2JBMA 2B7PA 3MWAA 3IEBA 2DJLA 2EAWA 3B04A 1CI1A 1F6KA 4NVTA 2VFHA 1W3TA 3QMRA 4EF8A 2Y7GA 4IPIA 1EPXA 4WX2A 2FPVA 4DO5A 1TPH1 3W83A 1FDJA 4N4PA 4BI6A 2DZTA 5G5IA 1TTIA 1FWWA 3DBPA 5AHMA 2DZSA 1TPDA 3DFOA 2CLEA 3SGUA 4PH6A 1G6CA 4MLJA 5HWMA 1ME8A 4GFSA 1HL2A 4O19A 2CW6A 3PG9A 5KZMA 5K9XA 1K7XA 4FIRA 3RNDA 4K7VA 5CSRA 1QOPA 1AMKA 4UFMA 3CWOX 3CLMA 3N2MA 2QCDB 3LCFA 1O60A 3R12A 1KFBA 3JR2A 2IQTA 4RJEA 4FXRA 3C2FA 1OX4B 4ZQRA 5G2WA 3T40A 4HIBA 1OFAA 1DV7A 2EPHA 5E1QA 2E6AA 1KFLA 3B0PA 3C3NA 1A5SA 3LDVA 4KKXA 4N9EA 4GUJA 1W8SA 4MY8A 5F1VA 2C13A 2XFWA 3M41A 4JTLA 3DFQA 3B0VC 4NX5A 3ABRA 4AHOA 2VFDA 3FYOA 1H51A 3O6DA 3NYZA 4AWUA 1AG1O 2A5HA 4JGDA 5CPMA 2Y7EA 2EGZA 3MI3A 5I3KA 4DO4A 2TMDA 2UV8G 1J2WA 3RF9A 4O12A 1YTDA 2PCQA 3NVTA 4JYFA 4X9SA 4QJ1A 1ZAHA 4O1AA 1DKWA 4MOZA 3TFCA 2FTPA 1XDLA 1DL3A 1M7OA 3WJXA 3UXAA 1OHLA 4Z0JA 5F2MA 3OBKA 5E0KA 5TBOA 4Q4KA 1BKSA 3STEA 1OFPA 1TPEA 4CCCA 3P67A 1I2NA 3EX6A 4ADUA 3QC3A 2ISSA 2CWNA 3UWYA 2XN2A 5HWJA 1QPNA 3NQ6A 1KTNA 4ZVJA 3LOTA 3EWZA 4KFPA 3NL6A 1ML1A 2O7SA 2W0UA 3QPZA 4JIQA 1VCFA 1PE1A 3EWYA 1S3HA 1VC4A 3EWBX 1NAL1 1H7NA 4E2DA 1N7KA 3V75A 4UTTA 1F73A 2X16A 2BWGA 3STGA 1LROA 3DI1A 4LT9A 3AJXA 5FF0A 1IGSA 1TO3A 3ABOA 4OWGA 4UFLA 1WYIA 1JRCA 1LOLA 4NT0A 1A5AA 3W86A 3I68A 3PWAA 4AVFA 1KM1A 3I7QA 4A2SA 2E77A 2X30A 4PL2A 3CM4A 2ZQ0A 1F74A 3LCGA 3M5YA 2E09A 5AN7A 5SWUA 3NQAA 5FF7A 3QJAA 4P2VA 2FQIA 3H54A 2V0TA 2CLHA 5BNKA 5D2XA 4N4QA 3W7LA 3S1VA 4NNCA 1ZCOA 3NGJA 3G8EA 1EWDA 2Y63A 3W23A 3H55A 3M9YA 3E9AA 3UPBA 3P8IA 4O50A 4NUWA 4GUIA 4IWWA 5BMWA 5CPLA 1D9EA 3UY7A 3DAQA 3W7CA 1QFEA 4MY1A 1Q6RA 4UTLA 4OV4A 5EA9A 4MFDA 3W7EA 2E6FA 3A5FA 5I3IA 1HUVA 3W1NA 2WNNA 1TJPA 3PB0A 2Z6IA 3MMTA 1LRQA 3W70A 1H50A 2Q3RA 1DQWA 1O5XA 4MFEA 1NSJA 3FJ6A 3NEVA 3T4CA 3W7HA 4D2JA 3ELFA 4IMFA 4K6AA 1S5WA 3S1WA 1YADA 4JEQA 2A4AA 3TCEA 3TH6A 3NM3A 1VJIA 1PCKA 3ZWSA 2VEMA 3P5ZA 5HWNA 3DFNA 4MLRA 5EMUA 1X1OA 3W7OA 1J4EA 1F5ZA 1LOQA 1ONRA 2KZHA 4IQLA 4HSNA 3CTLA 4FNRA 3NL5A 1TPFA 4AHQA 4RCXA 4TIMA 5BRBA 1TJRA 1L6YA 3ZFHA 4IXHA 4RV8A 4DF1A 3UZJA 1XUUA 1W5QA 1BEUA 2Z2UA 3M6YA 4LVGA 5KZDA 3EXTA 4JX6A 3CU2A 5K7JA 4DXVA 2G95A 1PV8A 3NQ2A 1VLIA 5FESA 1TYGA 4YCPA 2GVJA 1SZGA 3O06A 1P0KA 2PRHA 2YW3A 3VE9A 5EL1A 1FCUA 2Y61A 1MO0A 1R2SA 1OFDA 4KFNA 3F4WA 1PL9A 3TC7A 3W1LA 1VZWA 1JR1A 1KFCA 3PUDA 1HO4A 4M6QA 1KLZA 2GOUA 1VGAA 4MJZA 3OHIA 5LNRA 5U7SA 3FA5A 3THAA 1H1YA 4OGZA 3M5XA 2ATSA 4MYAA 5HQEA 2DZUA 5AHEA 5HULA 3W22A 3NG3A 2QCDA 2BLEA 1H7XA 1AW2A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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