4KKXA

Crystal structure of tryptophan synthase from salmonella typhimurium with 2-aminophenol quinonoid in the beta site and the f6 inhibitor in the alpha site
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Allostery and substrate channeling in the tryptophan synthase bienzyme complex: evidence for two subunit conformations and four quaternary states.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 102
structure length 268
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2013-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4kkxA00
3LHYA 3RNDA 5G2HA 3QQ1A 1LRNA 3G0XA 1IXQA 1WOBA 2GJNA 1OYBA 5D09A 3TSBA 3WFAA 3WJXA 1V5XA 3DU0A 3T78A 1VC4A 2JGYA 5ABTA 4UTMA 2NWSA 4PODA 4JX4A 4O17A 2Y7FA 2FB3A 3MMTA 3V75A 3T55A 1W0MA 4MYAA 1Q45A 2WO5A 1YXCA 1JJKA 4A29A 5HWNA 4O15A 2A6LA 3FS2A 3W7RA 1KBJA 2Z2UA 1LDCA 3CEPA 5FF0A 3TK7A 3W1AA 4E38A 1V7YA 3GKAA 1N8FA 3W7PA 2QJGA 1Q6LA 4FX7A 2V5LA 4O57A 3N19B 3BLIA 1PIIA 3RF9A 2GPTA 1DV7A 3BG3A 3B0UX 1A5AA 3QMTA 1TPB1 2WNNA 2P10A 4RXGA 4MJMA 2ZRUA 1DJQA 2J6XA 4UTWA 3MP4A 1KM5A 3I6RA 2A85A 3W7KA 4O52A 3B4UA 1JVNA 1KLZA 1PS9A 3B0VC 5FESA 2EHHA 2FFCA 3L65A 3NYZA 4IPJA 3SI9A 3UWVA 5H2ZA 4ADTA 7TIMA 1TTPA 4O11A 3WJSA 1YTDA 3NZ1A 1TTJA 3SY5A 4UUIA 3W87A 3RFAA 1H63A 1GYLA 2A2IA 1VHCA 1TRIA 4WY0B 5HUOA 1C29A 3FFSA 5HWJA 1LCOA 2EKCA 3B0PA 1PV8A 2H8ZA 3QJAA 4FXSA 2WJZA 4M6PA 3WK3A 1TPUA 1O60A 5EKYA 2A7NA 4RKAA 4EF9A 3LCIA 4LVFA 1FCVA 3MP3A 2QKFA 1QCWA 4LOCA 5D2YA 1IXPA 3BW2A 4IUOA 4JYEA 5D2TA 3CHVA 2H8XA 5LNWA 1LRTA 3O16A 2CZDA 3HGJA 2WKJA 5D02A 3EXRA 5D2VA 3H53A 4LTSA 1K8ZA 3O15A 1Z41A 4M19A 1NFBA 3DXIA 5U4NA 5K4XA 1K7XA 4QNWA 4ML9A 2O7QA 4AWTA 5FF3A 1TPVA 2ZZ1A 3I65A 4MJZA 4N02A 2OJPA 4Y90A 5FF2A 4A2SA 2ALDA 1RZMA 3IVUA 4Z1AA 3W2NA 4NXKA 4UFKA 3B03A 4UIOA 4YXGA 1CX9A 5G2IA 3R13A 3O6YX 1G4PA 3QRHA 1SFLA 3FIGA 3A21A 1ZCOA 4UTTC 3S5NA 4M7SA 2OCZA 3P5ZA 3EWBX 1B9BA 4UNLA 1VYRA 3CTLA 3ABOA 3W88A 1L9WA 3BGJA 3W7EA 1W5OA 3LLDA 4DF1A 4MKNA 3HPZA 5IBXC 4N2YA 3DBPA 3EX2A 3UWYA 1OYCA 3DH7A 3I7QA 4RZ5A 4DELA 5K3VA 2J88A 4A2RA 5AHMA 4JTLA 1HUVA 1H60A 3QFEA 2YCEA 3NQDA 1P0NA 4N4PA 5E1QA 1QPQA 4ZQMA 1LOQA 2QCDA 2ABAA 4BWLA 2WPBA 4WOQA 5LKYA 2YPIA 3DHDA 5A5WA 1PCKA 1YDNA 1EUNA 3MO7A 2CWNA 4UTIA 3W7HA 4ORIA 4QQ3A 3VI2A 2WSQA 1IXOA 3D0CA 1QMLA 2ZZ3A 3DAQA 2RDUA 3TXZA 5CPOA 3N14A 1J2WA 3UWWA 5K4ZA 1SQ7A 4IPIA 4FEZA 1BWLA 2FPVA 1FX6A 4HT3A 4H6KA 3T7VA 1QAPA 3TQ0A 2VKZG 2QCHA 4AXKA 3GXTA 1TYGA 4BK9A 4BFAA 2CLIA 3G0UA 4E2DA 2GQ8A 1SU5A 1MZHA 3PG9A 2AGKA 4UCGA 3DFOA 3W72A 3AO0A 4JX5A 4IMGA 2E1DA 1Q6QA 4HPXA 4UC5A 4XQ6A 4Z1BA 1SZFA 1W3TA 1T99A 3W9ZA 2A21A 4LUIA 1R30A 1IGSA 3LTYA 4CNNA 4XTIA 4O28A 1J5TA 3MW7A 2JKPA 1I2RA 2YR1A 4GUJA 1S5VA 1F05A 4MZYA 1QFEA 1ZNNA 3SJ3A 3LRLA 1ICQA 4LV9A 5HULA 4LRTA 1F2JA 4ZZ9A 3W2KA 2ZZ2A 3LBCA 3P61A 1XDLA 4TR9A 3P82A 1OK4A 3E02A 4XZ9A 4Z1DA 2YFOA 4RXFA 2DU2A 4CCDA 1TJPA 4PL2A 3THQA 2FB2A 2DJLA 3C2OA 4R34A 3KHJA 3JR2A 1DL3A 2NZLA 3GDRA 5F1VA 3MJYA 5FI8A 3L0NA 2ZRZA 3NQVA 4JTSA 4JTKA 4B5NA 4O1CA 1ICSA 1OX4A 2A0NA 1G4SA 4AF0A 3E12A 4NXSA 3G18A 4XBSA 3HO8A 1SO3A 1TPH1 3MI6A 4L4MA 3CT7A 4LWWA 4NZFA 2I14A 5AHEA 4WOZA 3P5YA 2FPTA 1X8FA 4QM1A 4MY8A 2B7PA 3CM4A 3TCEA 2RDTA 2X2GA 1M6JA 1S5TA 3B06A 1YXYA 1T8XA 1R2SA 3HOJA 4ZQRA 1LZOA 3TSMA 2DZUA 5D32A 3C52A 3NQ8A 3LLFA 3HJZA 4QISA 1ME9A 2WSRA 5DCBA 1R2TA 1KW1A 4N9EA 1IIGA 1KTCA 1FQ0A 1O94A 3P8IA 5HQEA 2X1TA 5J5RA 1KM4A 1JCLA 1XBVA 1G7VA 5C54A 3DFSA 4WXZA 1BWKA 3U2OA 4DO5A 1L2UA 2R91A 4FF7A 4PC8A 1EP2A 2ZRWA 4IMEA 2E6DA 2PRHA 1H7OA 1WDWA 3G1AA 5EL1A 3PY2A 4OWGA 2TYSA 4UNKA 3DHFA 3T40A 4A21A 4CQAA 1SPQA 1YADA 3W75A 2C16A 3NGJA 4RLIA 3GX9A 3VNDA 3C2EA 1QWGA 1X1ZA 2FJKA 3PSWA 1T0OA 2QCLA 1KA9F 3LHTA 3W2LA 1W1ZA 1ZENA 3DI1A 3HMJG 4AWUA 3TH6A 2ZCGA 2C0AA 3LCLA 4JYFA 3S9YA 3SECA 1B4EA 4RR4A 3W7IA 4LC8A 3T44A 5CSSA 5LGZA 3TNOA 3NL6A 3W70A 2QJHA 4LT9A 1QDSA 1LBLA 1F6KA 5AC8A 2CU0A 1JRBA 3TSDA 4MUZA 2YYUA 1EWDA 2W0UA 1KM2A 1J4EA 3F4WA 4RZ6A 3G0SA 2ATMA 5EY5A 3S0CA 3A5FA 4LVAA 1JR1A 4YMZA 1IXNA 2GUUA 4XWUA 5LHEA 4JR5A 5CG7A 1PVNA 1NEYA 3HF3A 1FCUA 2A7RA 3L67A 2FQIA 2X1SA 1QNVA 3NOEA 1SSGA 2LLEA 4UTUA 3QW3A 5CSRA 1JUBA 3LTSA 2DJXA 4FX8A 4UMBA 3TC6A 1TTQA 1D9EA 3W1LA 4BI5A 3NXFA 3L5MA 3BK0A 3TW6A 1VPXA 5C55A 1K8YA 1XBZA 4WY0A 1F5ZA 1UB3A 3W7OA 1GWJA 4LNYA 1C9DA 3VE9A 3A5VA 5AFDA 4EIVA 3MUXA 2W6RA 2B0MA 1UCWA 3FOKA 3O63A 4R53A 4HKPA 1THFD 4UTWC 5I3KA 4U4MA 2OZ0A 3I7RA 1TREA 3W1RA 5L9FA 4UFMA 4HNVA 3EWXA 4GUIA 3NEVA 3QEZA 4IGHA 4MYXA 1ZFJA 4WZHA 2EPHA 2A7PA 4UR7A 5LNSA 3DZ1A 3C0JA 1GEQA 1AL8A 3V1PA 2AAMA 4OHQA 1XBXA 1I2NA 3W1QA 2C1HA 1UJPA 1F6PA 5AN7A 3UD6A 1MEWA 3VKJA 2X1UA 3ABQA 3VCRA 5MHBA 3O05A 4EVZA 4JGDA 4LVDA 2HS8A 3W1PA 1OFQA 3RU6A 3QQ0A 5AHNA 4LW7A 3SSJA 3B05A 4GJ1A 4UFLA 1M5WA 5CZSA 2R14A 3PBYA 3G1SA 1GG0A 1ML1A 2UV8G 4OV9A 3UZJA 3LCGA 1YYAA 1P5BA 3QYQA 3LX9A 2E77A 1LP6A 1XUUA 3TDFA 3TE9A 4RV8A 5EYWA 3KFTA 2Z1BA 3KVKA 3VFLA 4MY9A 1O4UA 4TMBA 5LSMA 3R89A 4UR8A 4ZQOA 4O4WA 4IX0A 1XKYA 3LV6A 5D38A 1QOPA 3GAYA 4U28A 3TMQA 4I7VA 5AOUA 3TKFA 3C2VA 3TAKA 3I68A 1W37A 3W76A 3TFXA 2Y7EA 4O1DA 1YPFA 4BWLC 2NXIA 4H3DA 2VEIA 5AYYA 2TSYA 3N34A 1RV8A 1EUAA 5D30A 2VFIA 4JDBA 4BI6A 1XFBA 3B8DA 3P60A 1NF7A 2C18A 2V82A 2J9YA 4LUJA 5K2ZA 3N2XA 3W1NA 1GZGA 4ZQNA 3LCWA 3EEGA 1A50A 3EKZA 3G8EA 5DY2A 4R7JA 3GDLA 5K9CA 3NQMA 4JICA 5TBOA 1OABA 3HPSA 2QR6A 4QITA 1H61A 1WBJA 3CIXA 4NQ1A 1PHQA 3NQ6A 2G97A 2RFGA 1HL2A 2CFFA 3EWUA 2A5HA 3G1DA 1VLIA 4JNMA 3W86A 3CB8A 1TB3A 5SWUA 2CLLA 4K7YA 3G8RA 2DZSA 4O1AA 3M5ZA 1Z42A 3M9YA 4OE7A 3W83A 4FX6M 1XBYA 4NUWA 4ORMA 3IIXA 2CZEA 3TQKA 1NAL1 4LS1A 4NU7A 3QZEA 4TO8A 2ZA3A 2VELA 1UBSA 2BXVA 3NNTA 4LU0A 5I3HA 5EMUA 3TA6A 3STCA 1QR7A 3P62A 4JTTA 1P0KA 1AW2A 1VS1A 2ZDRA 3O6CA 3UWUA 4ONVA 1KLYA 2CLKA 4GUFA 4MFDA 1KTBA 1TQXA 1A53A 2H3BA 1TV7A 1JCYA 4BI7A 1G4TA 4RK8A 2VEKA 1LOSA 2B7OA 2V30A 4NJHA 3MYOA 1WXJA 2TPSA 2XFWA 5I3GA 2BTMA 2PURA 3HIJA 3PR2A 1TO3A 2DZXA 4X2RA 1KBIA 3IGXA 3MHGA 1XM3A 4LY8A 4JD4A 4AMAA 2YYTA 3QSRA 1RD5A 3EWYA 1LORA 3C2RA 5HR6A 5I3FA 5HWMA 1GVQA 5CPLA 3AJXA 2QAPA 3WJYA 2X16A 5G4WA 4XKYA 4O18A 4YCPA 3HB9A 4K8HA 1TPWA 1H7RA 3MHFA 4WXYA 4AEOA 4AHQA 4KKXA 4HN4A 1LYXA 1YDVA 3T4CA 2B7NA 2JK2A 2RH9A 3GIYA 4UMAA 2YW4A 3LM7A 3HG4A 3NVTA 2V2DA 5KITA 4GUHA 5DN1A 2WOQA 5AHIA 3S1WA 1VCVA 2W79A 3GZ3A 3TROA 5LGXA 3BVJA 3B04A 3MI2A 1EP3A 1KFJA 4DPQA 3FYOA 5KZDA 4Y8FA 5G4EA 3CC1A 2D73A 3LBMA 1EX5A 2RDWA 1K7EA 3NPWA 1SW7A 3LHZA 3P8JA 1FWRA 3OEXA 2DZVA 1I8JA 3BLFA 3OIXA 3G1XA 3N9RA 3HBLA 1DBTA 1DQXA 4UXDA 3LI0A 3DENA 1FWWA 3CWNA 1ZJIA 3FYPA 3GYEA 1EIXA 2YFNA 1MO0A 4IWWA 4X3ZA 2H6RA 2QUTA 2VEMA 3Q58A 1G4EA 2ZRXA 3G1VA 3L9CA 3STEA 1KFCA 1E51A 3C56A 1H62A 2NXHA 1ZHAA 3PSVA 4JTIA 4IOTA 2Y63A 5D2WA 3LXBA 3PVFA 3NA8A 5HJLA 3LDVA 3HQ1A 4FIRA 4O14A 5LZLA 4O10A 1L6YA 3PUOA 3TJXA 1Q3NA 3IVSA 1JRCA 2VFGA 3CWOX 3MHUA 4ZQPA 3QW4B 5D03A 3S1UA 3LXAA 3E96A 4DPPA 4OT7A 4WX2A 1G67A 4CNOA 1U5JA 1RQBA 2G95A 4MLJA 1FWNA 1TSIA 2DP3A 2QF7A 5DY3A 4IX2A 3USBA 4ZVJA 1AG1O 5D05A 2QAFA 1LM1A 4A22A 2J27A 4GNJA 2BWGA 3S1VA 4EOUA 1T96A 1KFEA 3FLUA 1SZEA 1QPNA 3R12A 4J9JA 1AK5A 3HG5A 2B4GA 1W8SA 3TU9A 6ALDA 3RK8A 1WQ5A 3LCHA 5K9XA 2ZZ4A 3W7MA 3N2MA 5GVJA 3IIVA 4K6AA 3PULA 2GJLA 3DFNA 3TUUA 5TQLA 2BX7A 3PG8A 1VH7A 1W54A 2YW3A 3ZFHA 3SZ8A 4R33A 1PL9A 1YLVA 4JTUA 1VJIA 5BMXA 3LHUA 1N7KA 3LV5A 2Y70A 3W1TA 5FEPA 4E0CA 5FEWA 5F4XA 2ZQ0A 1X6UA 3W85A 4Y9AA 4LS2A 4MOZA 5AC7A 3GR7A 5TIMA 1OX5A 4TMCA 3JS3A 2CLEA 1OX6A 3L0GA 2ZRVA 1I2OA 1SR9A 3CIWA 2Y88A 3ZWTA 4GFSA 1D3GA 3HGRA 3C4UA 5AYZA 3LB0A 3DI0A 1NVMA 2ZA1A 5D33A 1ZAJA 4IMDA 4K39A 3SGZA 3E9AA 2Z0IA 2GQAA 3C6CA 4Q4KA 3W22A 4UFHA 1JCJA 5U7SA 5CKSA 4DBEA 2P0OA 4MZ1A 3WJZA 1O5KA 4DBDA 3TIMA 3R8RA 4O19A 2GQ9A 5BMWA 2ZA2A 5HINA 3IIOA 3W7DA 1HG3A 2C14A 1O5XA 4JIPA 2Y7DA 2Y85A 3F03K 3KVLA 4XKYB 5CPNA 3G3MA 1TMHA 2QUVA 5DLCA 4JDYA 3TXVA 4DEFA 2BZNA 5H91A 3UWQA 1OFDA 3G3DA 3IIZA 3M41A 4YL2A 1LOLA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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