4MUZA

Crystal structure of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from archaeoglobus fulgidus complexed with inhibitor bmp
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
GSHMKQLILALDVMDGEKAMEIAKKVAEHVDRIKVNYPLVLSAGVGIMKRLSEIKPVIADFKIADVPYTSSLIARIAFENSAESVIVHGFVGSDTLREVCRVAEEFGGKVYAVTELSSPGGEEFMSAVSLKIVEKAKEAGCHGLIAPSTRIERLREIRKAAGDMEILCPGIGAQKGSIEAVKYADGIIVGRGIYASGNPAEEARKLRRVLKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Archaeoglobus fulgidus complexed with inhibitor BMP
rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 84
structure length 212
sequence length 212
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4muzA00
3NAVA 2YGYA 2CLOA 2BZNA 5G5IA 3TMLA 3OIXA 3A5FA 1O94A 3E12A 3QPZA 4A21A 1SZNA 1U83A 3G1XA 5AB3A 4DEFA 1DOSA 4ZQOA 3TU9A 4DPPA 3HG4A 4NZFA 1TQXA 5CGQA 3LBMA 2CZFA 4PEKA 3GDLA 2R94A 4UXDA 4UFHA 5DCDA 5AC7A 1E51A 5FESA 3BLIA 4GC4A 3H53A 4S1FA 3W2JA 3FKKA 1Q6QA 3LCWA 3NM3A 4EVZA 3G0XA 3DZ1A 5E1QA 5EL1A 3WJWA 2WJZA 2QCDB 3IV3A 1OABA 2JKPA 1KFJA 4ZQCA 4M6PA 4M19A 3I7SA 3PVFA 3STFA 2QUVA 1YDVA 3GZ3A 2G95A 3NA8A 3QYQA 2VENA 2R91A 3C0JA 2YYUA 3QFEA 1MZHA 1S5VA 4RV8A 1V7YA 3O6YX 1MXSA 3F4WA 3MW7A 2ZA3A 5EY5A 1OFEA 3ABOA 3PUDA 3DI0A 1FCBA 5LSMA 3G24A 2Y89A 3BLFA 5K3VA 2CLKA 3PS7A 3FFSA 4NNCA 1KTNA 1KFEA 5D05A 3OVRA 4IMEA 5D2VA 4PA8A 4K7VA 3RF9A 1G7UA 2A1YA 4RJEA 2Z2UA 1EEPA 1EWEA 3MP4A 5KINA 2WSQA 3CEUA 2Y62A 4RKAA 3WK3A 2O7SA 2JKAA 2CFFA 5LGXA 3SECA 5CPMA 3B05A 4HNUA 4MFEA 4AWTA 2YPIA 4UTJA 3O1NA 2PRLA 4XQ6A 2CLMA 1TTPA 2YCEA 1S3HA 1S5TA 4FEZA 2I1OA 3W2KA 3EB2A 3W7MA 3W2NA 4FX7A 3TV8A 3W7RA 3LHTA 3UQNA 1SO4A 4LW7A 3W1AA 3MP3A 3AJXA 3CC1A 1VLIA 2EHHA 3HQ1A 1XDLA 3UZ5A 3DFSA 4JD4A 4LV9A 1UUMA 1RVGA 4IMFA 3GR8A 3EEGA 1KFLA 4BI5A 1L9WA 5A5WA 3JR2A 5CZ0A 3EX4A 4NNBA 1G4TA 3M5VA 1YXCA 4HN4A 3BARA 2WNNA 1TB3A 4MY9A 3MBFA 2J6XA 4GBUA 3S5NA 3THQA 2Y6ZA 2A2IA 4NJJA 4XTDA 5K4ZA 1FWRA 4LV4A 3W73A 3W7KA 1RPXA 1YDOA 4UTKA 2QDHA 4C1KA 1UASA 2VOMA 2ZRYA 1PHWA 3NPWA 3FS2A 1TTQA 2E5BA 4UTWA 3WJYA 3LTYA 3CWOX 1WOAA 3O05A 4OGZA 1KFCA 3I6RA 3G1YA 3U8GA 2AGKA 4AF0A 3QQ1A 3W7CA 3HB9A 2X1TA 5FF4A 3MI2A 1VYRA 2WNQA 2F7FA 3M0ZA 3W2MA 3LERA 1JQVA 5AC8A 3HOJA 1PCWA 4TMCA 3I65A 4R33A 5HMSA 2CW6A 4O4WA 5KTLA 1TV5A 1Q6RA 3G3MA 4X9SA 4E2DA 3HGSA 3PULA 5F1VA 3TFCA 4PL2A 3MYOA 1YXYA 4CNOA 2HTMA 4OE7A 3T78A 2P1FA 4JX6A 3QSTA 4QNWA 4WZHA 3S1VA 4QQ3A 1GVRA 5I3IA 2VXNA 4O19A 1OFQA 1YDNA 1GVFA 3GKAA 3LI0A 1RZMA 1JRCA 2ZRVA 4IXHA 3DHDA 1YTKA 3W7OA 1D3HA 3W9ZA 5AYXA 4OQVA 4XKYB 2EGZA 1Z48A 2YXGA 2ZZ4A 2A21A 2G97A 3NQFA 4DF0A 1R47A 4G1KA 3GX9A 2PCQA 2VFDA 4UFMA 2CLFA 1NSJA 3ZWTA 3S0CA 2R14A 1GVQA 4ICNA 3VKJA 4MLRA 4AHPA 1ZHAA 3LM7A 1TPC1 4E2BA 2DZXA 3TFXA 5A8GA 4Y6GA 4WJEA 4KWWA 1EIXA 3UWUA 4LRSA 4A2RA 5E0KA 2A5HA 4FNPA 1WBHA 2PC4A 2TSYA 2YYTA 1UCWA 2ZCGA 4UNLA 2A4AA 1GTEA 1TRDA 3N9RA 2DU2A 4N9BA 5LGZA 1B4KA 4RCXA 5IBXA 1AW1A 4U4MA 3W7QA 5H91A 1G69A 3EX6A 3BVJA 5HINA 1JCMP 3DFNA 2H90A 1WDWA 3B4UA 4JYEA 3LI1A 4HPJA 4MZ1A 1ICQA 1QR7A 2DZSA 4O8RA 2ALDA 4FXSA 3MUXA 3NL2A 1GQNA 3G1AA 1Z41A 4K6AA 2EPHA 3LRLA 1AMKA 3IEBA 4GFSA 2E77A 4XTIA 2R8WA 4DO5A 2E09A 3DI1A 4OT7A 4Z1DA 3W2UA 4M5PA 1O5KA 4AXKA 5HUPA 3QEZA 1WV2A 4UFLA 1SFJA 1K8YA 1ZCOA 3CIWA 1TTIA 2TYSA 3L67A 1FDJA 2YX0A 3UYCA 5KZEA 3O16A 1F2JA 1X1ZA 3C2VA 1CI1A 3E96A 1SW3A 1JCNA 1EA0A 2QUTA 4MFDA 3INPA 2JBMA 1T96A 3LLFA 1RD5A 4Z1CA 3BG3A 1GVSA 1WQ5A 1XBYA 3M9YA 3EWZA 1TQJA 2GJLA 4JTTA 3LRKA 2WV8A 1F76A 1RQEA 1KTBA 4N2YA 4JTFA 3BPWA 4H4IA 4O11A 1QAPA 5AFDA 4AH7A 3WFAA 4M6VA 1QPNA 1VYPX 4XBSA 3O63A 3S5YA 3SZ8A 1TPDA 3TSBA 4UTUA 3PC0A 1QMLA 2PRMA 4LS1A 3CWNA 4YL2A 5CG7A 3LHWA 1BKSA 3U6WA 1TV7A 4MUZA 2QCMA 2QJGA 3KFTA 2JGQA 4AHOA 3LXCA 3TCEA 2VEKA 4K37A 3LTSA 4U28A 3W3OA 4WUIA 5AHNA 3BW3A 2DZPA 3ATYA 3CB8A 3GYEA 1W5OA 1O5XA 5LZLA 3DH7A 1FCQA 1OK6A 2F84A 3FOKA 2ZZ3A 4UTMA 3GLCA 2WSRA 4NJHA 4ZL1A 1JUEA 2VEMA 1JCJA 4JTJA 2O7QA 4O18A 3NQ2A 1SFLA 1THFD 4MVAA 1YYAA 1FWWA 3TC6A 3UNDA 5LHFA 3CLMA 3BGJA 4O10A 1TPH1 3W1RA 1B3OA 4LVGA 2P10A 2OJPA 5AN7A 1KFBA 3UZJA 2J9YA 4FIQA 5LKYA 3R13A 1TSIA 1TIMA 1YTEA 2ZZ1A 4AHQA 2VEPA 1T99A 4O0KA 4IJBA 4KFPA 1O60A 4HNTA 1EB3A 1SO6A 4RZ6A 3N2XA 5BMXA 3NDOA 2B7QA 4FO4A 3QZEA 2GQAA 3LB0A 1XDMA 4O12A 1K8ZA 1N7KA 5I3HA 1K3UA 1HL2A 2V8ZA 2FB2A 3UPWA 3RU6A 1G4EA 5K4XA 1ZFJA 1JULA 4JGDA 1N55A 2EF9A 1ME7A 3M16A 2XN1A 4PL1A 4UUIA 1OYAA 4W9TA 1RV8A 4WOZA 2GPTA 3L5LA 2ZZ5A 2QCGA 3G22A 3KRUA 3M44A 3Q2DA 3TQ0A 3FJ6A 2PE4A 3C6CA 3QC3A 1I4NA 2C14A 1FXPA 2G5WA 3TAKA 3KVKA 4WXZA 3PY2A 3FA5A 1Q45A 4TU1A 1NVMA 3QQ0A 4O1BA 3T55A 3GDKA 3P67A 2GQ8A 4K38A 3L9CA 4FXRA 3PUEA 2Z6IA 3C52A 5CZJA 5CZTA 4YCPA 1TO3A 3SR7A 4OBTA 4AB4A 1GTHA 5K2ZA 3NNTA 4YCOA 5CPNA 4CCCA 3P7YA 3MWAA 3RMJA 3GDMA 1EWDA 3NPUA 3F1QA 1OK4A 4R7JA 3AO0A 4I7UA 1V5XA 3CIXA 4IGHA 4K7YA 1GYLA 3KX6A 3ABQA 2HSAA 5AHLA 4Q4KA 2AAMA 4ADTA 4I9AA 4IXXA 4IX2A 3L21A 1XXXA 1QFEA 2QF7A 1Q6OA 1BEUA 2Y7EA 3PBWA 1FY6A 3FIGA 5D37A 1Q6LA 2QCFA 3DGRA 1G67A 3W7IA 2QR6A 2NX9A 3E0IA 2X16A 1DJQA 3BLEA 4IX0A 3K30A 3LHYA 2V2HA 1R46A 1GEQA 1R30A 4EOUA 1TPB1 1U5JA 3PF3A 3VE9A 2QAPA 3LCGA 2J9XA 1CX9A 1QNVA 4JN6A 5AYYA 4LVFA 5I3GA 3DBPA 2BSLA 4QJ1A 3NGJA 2ZQ0A 3B0PA 2G96A 3WJSA 1DVJA 1H5YA 2CZEA 1XKYA 5EPDA 5G2IA 2Y7GA 5EBUA 1WXJA 1GPWA 4CCDA 4GE8A 3TR2A 1FDYA 3GB6A 3G8EA 1IF2A 4Y90A 3QMRA 5IM51 5AHMA 4DPQA 1F05A 4H3DA 1P0NA 1WYIA 5GVJA 3SW6A 1I2QA 1A53A 3NQDA 3QPYA 2YFOA 2OZ0A 2RHGA 3L0GA 1OX6A 4OHQA 2V5BA 3IRDA 1F74A 1FX6A 1ONRA 1VH7A 1H7WA 1SO3A 4I7VA 2FDSA 5F4WA 1KM0A 4LC8A 1K8XA 4O0ZA 4Z0JA 4TX9A 4GUGA 3L5AA 2FFCA 2P0OA 3EX3A 3UPBA 3HIJA 3ABSA 4IOTA 1FCUA 3KVMA 3IIOA 2B7OA 1ZAHA 3W7JA 4CQAA 2CLHA 3ZFHA 1IIHA 2V9DA 1GJPA 3LCFA 3N34A 2VEIA 3EWYA 3JRKA 4GXMA 3IGSA 4NT0A 3TAOA 1R2RA 2JK2A 5D09A 4Z1BA 1O95A 3E02A 4IWWA 5EA9A 2E5CA 1ZENA 2ZRWA 1KA9F 5CKSA 1TPWA 2A7PA 1H7NA 2W79A 1VCFA 3KAOA 3ZWSA 4DF1A 1H51A 4BF9A 5DELA 3W7GA 3BV4A 3MI3A 3MHUA 2WPBA 4LWWA 2TPSA 2V5LA 2ISSA 1QOPA 4UR7A 3FEMA 4S2CA 1KBIA 2X1RA 3NPVA 2ZZ7A 2A7NA 1RR2A 2YZRA 4MJMA 1JJKA 2E6YA 3LGEA 3S5ZA 1DV7A 3OBKA 3FJLA 4HNNA 4PFMA 3LDVA 1I2PA 3M5XA 3DFTA 3G0UA 2NV2A 1SUXA 4PODA 4WQ6A 4UR8A 2ISWA 1GWJA 3EWUA 2Y70A 4OV9A 3R89A 5AHFA 1QOQA 2Q8ZA 2VKZG 3TIMA 1F5ZA 1O4UA 2D73A 3MHFA 5F4XA 1KM4A 5KSWA 1TMHA 1GVOA 4Z0SA 2VFHA 4KWVA 4JTIA 3BW2A 1ICSA 3KVJA 3PAJA 3N19B 3W1TA 3MO7A 3O6CA 1NAL1 3TUUA 3C56A 4Y96A 1IIGA 3W74A 3NZ1A 4BWLA 2QKFA 4LU0A 2QCHA 5C2XA 3I7QA 3HGRA 5TBOA 1VCGA 3WK2A 4Z1AA 1AK5A 1P1XA 3GK0A 4KKXA 3M1ZA 1XBZA 4TO8A 1SPQA 3HPSA 4A29A 1I2RA 3W83A 4MY1A 2XN0A 3KHJA 4BFAA 2OCZA 2FIQA 3NL6A 4ZQNA 3E9AA 2ABAA 1ME8A 2H8ZA 5CPLA 1X6UA 1WA3A 3GAYA 2GVGA 1JUBA 1RQHA 3N73A 1KLYA 3S8HA 1F6PA 1SSDA 2WNZA 2C13A 4OWGA 4JIPA 1W3TA 5FEPA 3TJXA 4UTLA 2NXHA 4QM1A 5HWMA 1FQ0A 1LRTA 3TQVA 3NXFA 5FF2A 4AF0B 2BXVA 3S9YA 4JDYA 1H7OA 3MBDA 2CLEA 4EF9A 2QCLA 3EX1A 4O54A 3SIZA 3DU0A 2BX7A 1K03A 1XM3A 1W37A 3CT7A 2VFFA 3CEPA 3T44A 1ALDA 5HULA 4O57A 2GJNA 2PRHA 3PBUA 1H1ZA 1OX4A 1TJPA 4YWIA 3M6YA 1OYCA 4O4VA 3L0NA 2H6RA 4K36A 3QSRA 5D32A 5E93A 4N4QA 1SQ7A 4UC5A 2Y7FA 3W76A 5HWNA 1VRDA 3M47A 5U4NA 1LORA 1OX4B 4O50A 3OA3A 1OFAA 1MEWA 2NV1A 1FWTA 2CLLA 3GR7A 3R12A 3HO8A 1T0OA 1XBVA 1D3GA 4YXGA 3W1XA 1AL8A 1DQWA 3H54A 4A3UA 4K8HA 3UWYA 2ATSA 2VFEA 3W84A 5LNUA 5LNRA 4Z08A 3A9IA 3RK8A 1SSGA 2C15A 3G3DA 4JS3A 7TIMA 3C2EA 2VFIA 3W7HA 3EKZA 1VLWA 2YW3A 1F6KA 1Q3NA 4LOCA 4JX5A 2W6RA 4ORMA 5BOOA 3PUOA 5MHBA 4JY9A 3OVPA 1C9DA 1L6WA 3F03K 1G4PA 4PTNA 4CQ8A 1EP1A 1VS1A 1H60A 1A5SA 5IBXC 4HPXA 5C55A 2B7PA 1G4SA 3NQCA 1N8FA 3P60A 1W0MA 2FPYA 4UTTC 3TQKA 4BI6A 2NWRA 3QW3A 3NQEA 3GKFA 5AOUA 5AC6A 2CLIA 3N9SA 2ZA1A 2ZRUA 2E6AA 2VFGA 3UY7A 1AW5A 2Q3RA 3CU2A 4IUOA 4DO6A 1OFDA 1JQXA 3IVUA 3NG3A 3P80A 4FHAA 4JEQA 6ALDA 1A50A 5HR7A 1TPVA 3DFQA 2NUXA 2Y7DA 4PC8A 2Q8LA 3VE7A 3FKRA 3LV5A 4XBKA 2QCCA 1LP6A 4JTEA 3GDTA 2FPTA 1SW7A 5CPOA 1LOSA 1X8FA 4PH6A 1PIIA 3LBCA 1JVNA 4I7WA 2J24A 1VJIA 4DBDA 1M6JA 3R8RA 1JCYA 3KRZA 2A6NA 4UTHA 1KFKA 2C6QA 4O28A 1XL9A 5HWJA 2E6FA 3IIPA 2CWNA 3C8FA 1TJRA 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 5D33 A;  2QJI A;  5G2W A;  3HG2 A;  2ZRZ A;  4B5N A;  3PBY A;  2QAF A;  1OJX A;  2W0U A;  5F1U A;  1WOB A;  5AHE A;  3NQ8 A;  5TQL A;  3CQ0 A;  4IQL A;  3W75 A;  5LHE A;  1FWS A;  2NX1 A;  3OVQ A;  1OF8 A;  1ZAL A;  1NFB A;  2ZZ2 A;  4ZVJ A;  3RND A;  5FF0 A;  2QCN A;  1XCF A;  3TE9 A;  3WJZ A;  5DY3 A;  3W86 A;  1DL3 A;  3CHV A;  4ALD A;  2XN2 A;  5F2I A;  1W3N A;  5DCB A;  3SI9 A;  1GZG A;  3Q58 A;  1B57 A;  4MJZ A;  1EX5 A;  2X1S A;  1H63 A;  2GVL A;  1S5W A;  3PB0 A;  4QAI A;  2X1U A;  2ZBT A;  1VQT A;  4HHP A;  5BNK A;  2FPV A;  3W88 A;  3D0C A;  3OHI A;  3O07 A;  3SFK A;  1LBL A;  2V81 A;  1H61 A;  4GUH A;  1VYS X;  3NR0 A;  1SU5 A;  5DBT A;  4LVB A;  1OFB A;  5U7S A;  2I14 A;  3MP5 A;  1YPF A;  5T26 A;  4JX4 A;  2NUY A;  1ZAJ A;  1LBF A;  3IVS A;  2FTP A;  4MLJ A;  1UB3 A;  4C1L A;  2QDG A;  2NWS A;  3A23 A;  3Q37 A;  3DHF A;  1BWK A;  4GUI A;  3W2L A;  1QWG A;  4YMZ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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