4N42A

Crystal structure of allergen protein scam1 from scadoxus multiflorus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
GNLDIAVYWGQNFDERSLEATCDSGNYAYVIIGFLNTFGGGQTPALDISGHSPSGLEPQIKHCQSKNVKVLLSIGGPAGPYSLDSRSDANDLAVYLFNNFLLPPGHSENNPFGNAVLDGIDFHIEHGGPSQYQLLANILSSFRLKGTEFALTAAPQCVYPDPNLGTVINSATFDAIWVQFYNNPQCSYSSGNAEALMNAWREWSMKARTKKVFLGFPAHPDAAGSGYMPPAKVKFHVFPAAKKSYKFGGIMLWDSYWDTVSQFSNKILGDGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase inhibitor
molecule keywords Xylanase and alpha-amylase inhibitor protein isoform III
publication title Crystal structure of allergen protein scam1 from Scadoxus multiflorus
rcsb
total genus 91
structure length 272
sequence length 272
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4n42A00
1HJSA 1UWUA 4UCFA 4ZENA 4UQDA 4QDMA 4H7VA 3FW6A 2DSWA 1JYVA 5CGTA 4HMDA 4DWSC 1ODZA 1EIBA 3GNOA 1GPFA 1NQ6A 4J3SA 1M04A 2JEQA 3QOMA 1FOBA 1L8NA 5ABEA 4PEEA 3GXFA 3FAXA 3BSHA 3K1DA 4E8DA 4F8XA 1BYDA 3SCPA 3W27A 3LPFA 4HOXA 1TE1A 5JIWA 5F7UA 1TZ7A 4P7RA 1CLXA 4KMQA 1UD6A 2DEPA 3CUGA 2DT0A 2J7CA 1IT0A 3WQWA 2EJ1A 1J01A 3EMQA 3RPMA 3J7HA 3LMYA 1KWGA 3CZ8A 3WH9A 3VPLA 3PTKA 5I23A 3VO0A 4KRUA 1VFFA 5D9NA 3MMWA 2DIJA 2J7BA 4AD4A 4KWUA 3L4XA 5FCZA 4MDPA 2JE8A 4MAVA 1EOKA 1HXJA 1UR2A 4ATLA 4M8UA 3VMPA 1SYTA 7CGTA 2X05A 1E6XM 3AXHA 4PMQA 5D9OA 5ABFB 4UOZA 1JNEA 3AIEA 1CGWA 3VIFA 3CUHA 4X9YA 9CGTA 2BXZA 3WQ8A 3VGBA 4PMVA 3WH8A 2YDQA 3KL3A 3F5KA 3IJ7A 3OBAA 4Z2IA 3CH9A 4CGTA 5A94A 2DGAA 4A3YA 2NSXA 5A2AA 1UWSA 3BC9A 2O92A 3WH7A 1HF6A 1GQLA 5GNYA 4JFTA 2J75A 1LF1A 3SCUA 3W53A 3VX0A 4L4PA 1W3JA 1XGZA 2ZUUA 1M01A 1BTCA 1E4NA 2BS9A 2VRJA 2FHCA 2FHBA 2ZUTA 2VTFA 2WCAA 3NIYA 2GJXB 1J11A 3W4RA 3W0KA 3WH5A 2AMGA 3VILA 4J28A 1QI0A 4CD6A 1ZJBA 2CERA 1E72M 2WZIA 3AFBA 5I77A 1V0KA 2V3DA 4X0NA 5A2CA 3MUZ1 2QF8A 4W86A 1B9ZA 2C0HA 4GI8A 5CXPA 1B90A 1EQCA 2YDSA 1V02E 1E1EA 3K4DA 3N17A 4CCDA 1V6XA 1H0GA 1MW2A 4EANA 1E6SM 3PZVA 4L4OA 2EO7A 1W9PA 5I2UA 2VURA 1C7SA 2VX5A 2VT0A 1ISZA 2OYMA 4WF7A 3WD3A 2EPOA 1E6PA 4E8CA 3AIWA 1BGGA 2CKSA 1G0CA 3QHNA 3CBWA 1UZ1A 2UY3A 1UZ4A 2XYLA 3VDAA 3A4XA 4J3XA 2DT2A 1W9XA 2YBUA 4PTMA 2PF0A 1NARA 2ZUSA 5IHSA 2CITA 3PBGA 3PZNA 1NWUA 3VMOA 3I3BA 2GJPA 5A6BD 1GONA 3ZSSA 4ACYA 4LYPA 2DSVA 5CPSA 8A3HA 3WL0A 3WEMA 3AXXA 2ZXDA 1CXFA 1UD5A 3WDQA 1FP9A 4P7OA 2D1ZA 4PBGA 1CZ1A 1KXVA 1VFOA 4F66A 4QFUA 1QNSA 4MAZA 4PMYA 4FF5A 1JYWA 4P8XA 3AHYA 1LL4A 3OIHA 1NWSA 2DSZA 2GUYA 1XH0A 2XFRA 4MNLA 3W25A 5FL1A 2XVNA 1R7OA 2JF6A 4UNIA 4D71A 1JF6A 1WZKA 2XGBA 3L4WA 1KQZA 5BXSA 5HBFA 1KGWA 3EDKA 2D20A 3UG4A 1R86A 4B15A 3VD4A 1JDCA 4UFJA 3WNNA 3S2CA 1DWJM 2PWEA 2VX6A 2WKGA 3FY1A 5DT7A 3SUWA 2WVVA 1N82A 1V3LA 3JUGA 4CVUA 2EPNA 1UH3A 4MB3A 6CGTA 2CKRA 3LPPA 2CIPA 3ARWA 4M1RA 2A3AA 2QPUA 2XWEA 1EHNA 1ZBCA 3BMVA 3VD9A 1JZ5A 2D23A 4BCEA 4YN5A 1PAMA 1JYXA 1V0MA 2ESCA 5ECUA 1LL6A 5A8OA 2YL5A 3OLEA 1KR1A 1UH2A 4S3KA 1V3KA 1KXQA 1XHGA 3BAWA 4FLRA 4AD3A 3WDJA 1IV8A 3KL0A 2GVYA 1OGSA 3VIKA 3RIKA 2VJXA 3AS2A 1CXHA 2J78A 3WKZA 3G6LA 4PMDA 2WC3A 1H5VA 1VEOA 3SURA 3TTQA 1M7XA 3EDFA 1WAWA 1CGVA 3SCVA 4Q22A 3A3HA 3PZOA 2XFYA 1HKMA 2XVKA 1FHLA 3G6MA 4PUDA 2CHOA 2WPGA 3POHA 5CPTA 2WHLA 1CTNA 4NZCA 1VAHA 2E3ZA 3AMGA 4JIEA 1OIFA 3OG2A 5E0CA 1UR9A 5M17A 4DUWA 1J0HA 1ECEA 1X1NA 4HU8A 1KCKA 2YDRA 3AMDA 2WMGA 3VNYA 3VGFA 2VMFA 1VFUA 5KZ6A 2XJ7A 1UH4A 1YQ2A 1SMDA 1E3ZA 1UKQA 4QLLA 2OYKA 1RP8A 3WQ5A 3SCNA 1EDGA 1WKYA 4AD0A 4ZE4A 2VX4A 2WCSA 4WIWA 1NM9A 3SCTA 1RH9A 3SCOA 4H8HA 2V3FA 1OM0A 5M5DA 4KRTA 2ZOXA 2D0FA 2O9OA 3SUVA 4HPHA 1OGGA 2OWWA 4B16A 3AQUA 4B3KA 1BG9A 2EPMX 4LYRA 3VNZA 1BPLB 5A6AA 1H4PA 1WZMA 2G3NA 4MTVA 1FH8A 4JFVA 1FHDA 2CHNA 4AZHA 1QW8A 4CCCA 3CIVA 3T0BA 3FN9A 2ZUWA 4BZYA 1BAGA 4JL1A 1Z32X 5ABFA 1KWKA 1G94A 3MV01 1OD8A 5A69A 3L4TA 3FNDA 2D24A 1HT6A 3TP4A 1H11A 1PBGA 2HVMA 3RILA 4OIFA 5EFDA 1VFMA 1NWRA 2YIHA 4WK9A 2YKKA 3EBVA 1TA3A 5FOOA 4EK7A 5AY7A 2F61A 1KGUA 5C71A 3NSXA 3MUY1 1JZ7A 3N12A 2WANA 3WF0A 5EMYA 4NRRA 3OLGA 5IHRA 1E6NA 4MDOA 1CLVA 1Q6CA 3F5LA 4PMNA 2WVUA 2WMJA 2GJXA 1E5NA 1HP4A 5A8PA 4U31A 3VDCA 5AYIA 1W1PA 4BF7A 1GOOA 1ISWA 4W87A 2DT1A 2UY4A 4AISA 3AMKA 1E3XA 3AOFA 4J3VA 4BQ2A 4HU0A 3RM8A 5A2BA 4MB4A 7TAAA 2ZWYA 1ISVA 2Z1SA 2Y4SA 1XSKA 4HMEA 4JFSA 3NDZA 5M3WA 3AHXA 3NDYA 4M56A 3MANA 1ZJAA 3WQ6A 1MFUA 4F9JA 1J18A 2WCGA 4AD5A 4UQAA 2NT1A 1GQJA 4GI6A 4IPLA 1GVYA 2OSWA 4Z2LA 1AQHA 3BAXA 1C8XA 3II1A 3PZIA 2FHFA 1UR1A 2BHUA 5HOSA 2D3LA 5ABHA 2E9BA 3CUFA 4HA4A 4AYSA 1CXIA 2IXUA 1VBRA 3AYRA 1E73M 2VL4A 3BCDA 1WE5A 1NOFA 4XUYA 4H41A 1WCGA 4HA1A 1WDRA 3L2LA 2J62A 4GKLA 1WPCA 2EBNA 2XIIA 1EO7A 2J7DA 1NOUA 2QLYA 3AICA 3WNMA 2FGZA 3ZQ9A 3WY1A 1QW9A 1GQKA 3W82A 2BHYA 1JZ3A 1C3FA 3QHMA 1CENA 4AZCB 1W91A 4PN2A 2WAGA 4CKQA 2J77A 1PPIA 2J4GA 1C92A 1RD6A 4PTXA 3L4ZA 4CN1A 3WL1A 4LQ1A 4HOWA 4D6GA 2WC7A 1XD1A 4UFHA 3VM5A 4UQCA 3PZQA 3VGGA 1SR0A 3BLPX 1E6QM 2VOTA 4A4AA 4FK9A 3K46A 5GNXA 2O9PA 1PIFA 3PTMA 3APGA 1PEZA 4N0RA 4GO8A 1E6ZA 3AIRA 1VB9A 1OGBA 1C8YA 1KBKA 4PCSA 1TVNA 3VINA 1ISYA 4TX8A 3AIQA 3QHOA 3CGTA 2WVTA 1OINA 3B9DA 2J25A 1OSEA 2WNWA 2W5FA 1D2KA 4Z2JA 5HPCA 1M03A 1WNOA 1TMQA 3T0DA 2OSXA 1DEDA 2ZX9A 2WZHA 5DO8A 2XVPA 1LWHA 4HZ6A 1V3JA 4WSJA 2W67A 1JDAA 2YBTA 4BQ5A 4URIA 5BYWA 4W8BA 3VM7A 4W8LA 1E0XA 1XYZA 3EYPA 3VGDA 1M53A 2CYGA 1C93A 4F79A 3L4UA 3MUAA 4R5EA 1TVPA 2BVTA 1EQPA 1D7FA 2D22A 4J7RA 1J9YA 2JFEX 5BCAA 4KH2A 2YJQA 1JZ8A 2YOCA 4CN6A 3SCSA 2E8YA 4PMOA 1QI5A 3W26A 4DWSB 2CNCA 4AWEA 1AQ0A 1EO5A 1LQ0A 3W24A 4D6FA 4WJXA 4TTUA 2X0HA 4ACZB 5C70A 3TTYA 3PZGA 1D3CA 2XIBA 4PMRA 3IJ9A 5DT5A 4WKHA 2D0HA 2BY2A 3WD2A 1WO2A 3VGHA 2FGLA 5I24A 4JZ5A 4M81A 3DYOA 2GK1B 1O6IA 4AEFA 1UD4A 2XPKA 1UUQA 1VEPA 3GXMA 1CGUA 4CVWA 2VO5A 5EB8A 1JD9A 3F4VA 3WUGA 2Y24A 3BCFA 3GXIA 2FDMA 1J10A 5LA2A 3CHDA 1GOWA 1U2YA 3CPUA 4JKMA 5HNNA 3DYPA 4NF7A 1QBBA 4D6HA 4LYQA 1E9LA 2F2HA 3UESA 4WLCA 1MQRA 1DP0A 1JFHA 2DPEA 1GOIA 3SUSA 3WH6A 1W9DM 5CSYA 1FA2A 3WBEA 4UOJA 2YA1A 1E15A 2J7GA 1C91A 4CD7A 2YA2A 3VDHA 1BSIA 3RM9A 3A4WA 4E4PA 4EKJA 5LA1A 1C8QA 1R7AA 4W88A 3SUUA 1ESWA 1V6VA 4IM4A 3MSDA 4H8VA 3FAWA 1KCLA 1WZLA 1QBAA 1E1FA 2C7FA 3VIGA 3ARVA 3NCOA 4PUEA 3BAYA 1E4IA 3N13A 1MFVA 4IISA 3VDBA 3K8LA 1GW1A 4QCEA 1ZBVA 2OYLA 4W89A 2WB5A 4S3JA 5A6MA 3UETA 1GJUA 1MVYA 3PHAA 1UWRA 3MO4A 2WXDM 2BFGA 1JZ6A 3ARQA 4R27A 1XCWA 1E4MM 2WSKA 4ZFMA 2BY3A 4DWSD 3CZKA 2Q8XA 4RE4A 3NSMA 2PC8A 1CNVA 2VZSA 2E8ZA 1W1YA 4U3CA 1K9TA 5CLTA 1FFQA 1DWIM 2G8ZA 5FKYA 3OGRA 1OD0A 2D2OA 3HMCA 4TVUA 3K8KA 4AZ6A 3ZR6A 3WF3A 3VKKA 1W3KA 2D0GA 5AC4A 1JD7A 3GNPA 3WUEA 3SCWA 5AYBA 4PTVA 1CWYA 2XSAA 4AD2A 5A6JA 3ZR5A 4UFKA 3RJYA 1LL7A 3M07A 1ITXA 2DH2A 1CIUA 1GNXA 1HJQA 2IUZA 2F8QA 3OZPA 3SIMA 1IZJA 3LPOA 2NW0A 3MSGA 3NUKA 1B3XA 1V0LA 4OOZA 1CGTA 3CZEA 4PRWA 1HL9A 1UG6A 3SEPA 5BXRA 3KWXA 4U2ZA 5IFPA 3IJ8A 1QHZA 3VD5A 3AMCA 1CDGA 3MKKA 1W2VA 4AZ5A 1CXLA 1V6YA 3OLIA 1UHVA 4C7GA 4OZOA 1WDQA 1KB3A 4KGJA 4UQBA 3CMJA 2Z1KA 4IUGA 4JFWA 1HVXA 1HJXA 5D8WA 2Y8KA 2XWDA 5D9MA 4TUFA 3RM4A 1QVBA 2CBJA 5GPRA 1JI1A 1SMAA 2W4XA 3BLKA 1CPUA 3WQ4A 1W9UA 1PX3A 3HJEA 3ZJ7A 3VOCA 4QCFA 3BMWA 2G41A 4D1IA 1TR1A 3BAJA 3THDA 2WZEA 2XG9A 3B9AA 2E9MA 1OBAA 2WHKA 1CEOA 3W28A 1G01A 1VENA 2Y8VA 4P8VA 3N18A 3WSUA 1DWHM 2XUCA 3GM8A 2D3NA 4GI9A 2A3EA 3CZGA 1WDPA 1ZS2A 1QNOA 2J7FA 1ZBKA 4JHZA 3T0AA 3CLWA 4X0VA 3WD4A 1FP8A 4AEEA 2A3BA 2DQXA 2WWDA 4MNKA 1W9BM 4C7FA 5D4YA 4ML4A 4TXEA 1W1TA 4ATDA 1UR0A 5LA0A 1V3HA 2VZVA 4U3AA 4D72A 1EOMA 2CBVA 1PX8A 4HOZA 1F4HA 2WMIB 3I3EA 4D6CA 1P6WA 3ARYA 3DHPA 2X09A 2ZUNA 1OCQA 3IANA 4LXFA 3UCQA 1HKIA 4QLKA 4W84A 3VUPA 5HXMA 4W7UA 1E40A 4XX6A 3WDRA 2X1IA 2BY1A 4CUCA 2ZUVA 1AVAA 1W3HA 3OZOA 1GORA 3DHUA 3M46A 3WBAA 2WMFA 1G9HA 1VJSA 1WDSA 1UWQA 1UD2A 1KQYA 2A3HA 1W1VA 4U2YA 1UQYA 4AXNA 1XV8A 3N04A 1HVQA 3IK2A 1TUXA 3O9NA 3WNLA 1V0NA 5E9AA 5A3HA 4GQQA 1WZAA 5A6BA 4HPGA 2MANA 1UKSA 1BVZA 1L0PA 2G3IA 4PCTA 3ARRA 4RL3A 1K9FA 1HNYA 2CETA 4DM1A 5GQBA 3PZMA 2EQDA 3VD7A 5CZKA 3ZJ6A 5BRPA 1JIBA 2VQTA 3POCA 3N1AA 1ODUA 1DWAM 4GXPA 4QAWA 1B30A 3GH7A 3WDHA 5A95A 5EFFA 4OJYA 3OA5A 1JI2A 1MXGA 1XRVA 4D1JA 1V03A 1EHAA 3TA9A 2GK1A 1EDQA 1H3GA 4JKLA 2GFTA 4CD4A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HJS A;  1UWU A;  4UCF A;  4ZEN A;  4UQD A;  4QDM A;  4H7V A;  3FW6 A;  2DSW A;  1JYV A;  5CGT A;  4HMD A;  4DWS C;  1ODZ A;  1EIB A;  3GNO A;  1GPF A;  1NQ6 A;  4J3S A;  1M04 A;  2JEQ A;  3QOM A;  1FOB A;  1L8N A;  5ABE A;  4PEE A;  3GXF A;  3FAX A;  3BSH A;  3K1D A;  4E8D A;  4F8X A;  1BYD A;  3SCP A;  3W27 A;  3LPF A;  4HOX A;  1TE1 A;  5JIW A;  5F7U A;  1TZ7 A;  4P7R A;  1CLX A;  4KMQ A;  1UD6 A;  2DEP A;  3CUG A;  2DT0 A;  2J7C A;  1IT0 A;  3WQW A;  2EJ1 A;  1J01 A;  3EMQ A;  3RPM A;  3J7H A;  3LMY A;  1KWG A;  3CZ8 A;  3WH9 A;  3VPL A;  3PTK A;  5I23 A;  3VO0 A;  4KRU A;  1VFF A;  5D9N A;  3MMW A;  2DIJ A;  2J7B A;  4AD4 A;  4KWU A;  3L4X A;  5FCZ A;  4MDP A;  2JE8 A;  4MAV A;  1EOK A;  1HXJ A;  1UR2 A;  4ATL A;  4M8U A;  3VMP A;  1SYT A;  7CGT A;  2X05 A;  1E6X M;  3AXH A;  4PMQ A;  5D9O A;  5ABF B;  4UOZ A;  1JNE A;  3AIE A;  1CGW A;  3VIF A;  3CUH A;  4X9Y A;  9CGT A;  2BXZ A;  3WQ8 A;  3VGB A;  4PMV A;  3WH8 A;  2YDQ A;  3KL3 A;  3F5K A;  3IJ7 A;  3OBA A;  4Z2I A;  3CH9 A;  4CGT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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