4O4VA

Crystal structure of trichomonas vaginalis triosephosphate isomerase tvag_497370 (ile-45 variant)
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTFFVGGNWKANPKTVEEAEKLIEMLNGAKVEGNVEVVVAAPFIFLPTLQQKLRKDWKVSAENVFTKPNGAFTGEVTVPMIKSFGIEWTILGHSERRDILKEDDEFLAAKAKFALENGMKIIYCCGEHLSEREAGKASEFVSAQIEKMIPAIPAGKWDDVVIAYEPIWAIGTGKVASTQDAQEMCKVIRDILAAKVGADIANKVRILYGGSVKPNNCNELAACPDVDGFLVGGASLEPGFINIVNSNVHSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Engineering mutants with altered dimer-monomer equilibrium reveal the existence of stable monomeric Triosephosphate isomerases
rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Trichomonas vaginalis
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 86
structure length 251
sequence length 251
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4o4vA00
1EB3A 4JTTA 4MVAA 4CQ8A 3L0KA 4YCOA 1PCKA 3LTSA 3GDRA 1D3HA 3KRZA 3E49A 3CT7A 1LORA 1SFJA 2NX3A 1OFDA 3G8RA 3P5YA 4GJ1A 3C2VA 3GVGA 3L5LA 2FFCA 4NQ1A 2QEZA 4RZ4A 1YXYA 3CIWA 1OX4A 3NQDA 2ZZ3A 3LB0A 4CNNA 1JCXA 3NQMA 2F84A 3TU9A 3O6CA 1A5CA 1WDWA 4O57A 2WO5A 3GDLA 4UFKA 2DZVA 5D2YA 3QMRA 2DP3A 4HN4A 1SO4A 2B7OA 2EGZA 2XFWA 1ADOA 1Q6QA 1W0MA 2NX1A 4IMFA 2FTPA 1GVQA 1IXNA 5DCBA 3EWYA 1TRDA 3WK0A 4HNVA 2BSLA 4L4MA 5CZSA 4RXFA 1KFCA 2J9ZA 1XFBA 5AHEA 2WPBA 1G7VA 3ABOA 2YR1A 4IX0A 4CQAA 4WY0F 4CCDA 2I1OA 4TX9A 4FNQA 3M6YA 2V81A 1RVGA 1VJIA 1LLWA 3SR7A 1V5XA 3QEZA 4UMCA 1PL9A 3HMJG 2ABBA 3N9RA 1G4EA 4S1FA 1TTQA 3R12A 4BI7A 3SECA 3HPXA 3BW2A 1KA9F 3W1PA 2R94A 4LRTA 4DBEA 1V7YA 4A29A 1OX5A 6ALDA 4JN6A 3SSJA 3KOFA 3EX6A 4JY8A 4LVFA 5KZMA 2VFEA 3ABSA 1PE1A 3NXFA 1R2RA 1LCOA 1FXQA 3WJSA 1SSGA 5CPNA 3STGA 3FYOA 5DBUA 1ZAJA 3HO8A 3P7YA 1SSDA 2GVJA 3DFTA 3DFQA 4O8RA 5D03A 3VE9A 1TMHA 3DHFA 3W7IA 3PAJA 4MFEA 4BFAA 4IOTA 2PC4A 1ALDA 2Z2UA 1ME8A 2NUYA 3QPYA 4FF7A 1H7NA 1XUZA 1M6JA 4WY0B 3LBCA 3HIJA 4HPXA 1CW2A 3IGSA 5I3FA 4G1KA 1ICPA 3GDTA 1UB3A 4FX7A 3QYQA 3UNDA 4MJZA 2A2IA 1T99A 2H3DA 4UTWA 4PC8A 1XL9A 2B7QA 4OE7A 3PG9A 4NJGA 3W87A 4POCA 4IMCA 3A23A 5K9DA 1NAL1 3FKRA 3N3MA 5DCEA 2JBMA 3MJYA 4NJHA 1OFEA 1WA3A 2Y70A 5G2IA 3PUOA 1W3IA 1UASA 3R8RA 4OBTA 5AHMA 4EOUA 3HGSA 3QPZA 1WYIA 3C4UA 1IXOA 1H1ZA 2TMDA 4O50A 3LTYA 3W7KA 3EWZA 5G1YA 1K8YA 3HPZA 4FNUA 1GQNA 3EWBX 3LM7A 1TV5A 1ZENA 3ZR4A 1AMKA 1EP2A 1MEIA 3CQ0A 3LDVA 5CPLA 3DFOA 3FIGA 1PCWA 1G4PA 4QSHA 3UY8A 5A5WA 1GTHA 1OF6A 1SZNA 5FF2A 3BLEA 3LHUA 2QAFA 4R33A 1DOSA 3OIXA 1F76A 1LLZA 4YCPA 3B0PA 3E12A 1KM1A 3JRKA 2CW6A 2CZFA 3TSDA 2ZRWA 4XUGA 3N34A 4O10A 4KKXA 2TSYA 2C6QA 5DXXA 1TO3A 5FF0A 2C0AA 2PE4A 3T78A 2WOQA 3W3OA 3I7QA 2EPHA 4CLMA 4IXHA 3TX9A 4JX6A 4UC5A 3C56A 5KSWA 1XDMA 1KTCA 2NWSA 4I7VA 1KV5A 2W6RA 4NX0A 3DFSA 1KM5A 4NT0A 3DFPA 1M7OA 2WNNA 2V2HA 2A21A 3NL6A 4O19A 3HPSA 4JD4A 5HNRA 3S5OA 3P8JA 1ZNNA 4UTWC 2ZTJA 1GYNA 1SUXA 3MW7A 4TO8A 2A7RA 1FWSA 3BW4A 3LI0A 4Q33A 1RQEA 1W5QA 1Q45A 1VCGA 3H53A 5FEWA 3C6CA 3SY5A 4BK9A 4Z1DA 2NWRA 3EKLA 3R13A 3WK1A 3S1UA 3NA8A 4BWLC 5AHLA 3KRSA 4X9SA 3TSBA 4U28A 4ICNA 5I3GA 4WOQA 3H54A 1VR6A 4AWTA 4OGZA 1XBZA 1EWDA 4IUOA 4JIPA 1OYCA 4K6AA 3N14A 2QUVA 3CWOX 3W7PA 2VELA 1QNVA 4TIMA 4CNOA 3M47A 1R2SA 2TRSA 1AK5A 3QFEA 1HL2A 2DZPA 1LTDA 5F4XA 3MMTA 4ZZ9A 1KV8A 4N4PA 2A6LA 4JGDA 5HWNA 4E2BA 1J5TA 1G69A 3W7GA 3HF3A 1FCBA 1F7BA 4AF0B 2J9XA 2HMCA 3E96A 3TMQA 5D2XA 1OABA 2ZDRA 4Z0JA 1OHLA 1DVJA 3IIOA 1XDLA 4O1AA 5FESA 3VCRA 2RH9A 4JYEA 1OK6A 2Y6ZA 4NZFA 2CWNA 2ZRUA 4MZ1A 1H7RA 4M19A 4O4VA 3NM3A 1KFJA 3PSWA 1IGSA 3NQ2A 1LRNA 4ADSA 1I2NA 1OX4B 3C2RA 4JNMA 3TNOA 1XBYA 1THFD 4KFPA 5KITA 1KM6A 2C16A 3TFCA 3PB2A 1H7PA 5J5DA 4Z0SA 2ZRZA 1AW1A 4GXMA 3L21A 5F2MA 5DY2A 2C3ZA 5SWUA 3KXQA 2DZSA 3SGZA 4JS3A 4LUIA 4LT9A 1KW1A 2P1FA 4ML9A 2V2CA 2YW4A 2J24A 3GDMA 2UV8G 2FB3A 5AC6A 5CSRA 4LWWA 1XI3A 5HR6A 4RLIA 2OJPA 4O12A 4LVAA 3VKJA 1FXPA 2ZYFA 3BLIA 4U4MA 3OVQA 3TE9A 3W2MA 1Z48A 4NXSA 3S1VA 3ZS4A 3SZ8A 5G2HA 3NQFA 5K4ZA 2A7NA 1ZFJA 3GAYA 2J27A 5HINA 3CLMA 1H51A 3PVFA 5LSMA 1X7FA 3UXDA 3N2XA 3GXNA 3NQVA 4O0KA 1P5BA 1Q6LA 2BZNA 2ZBTA 2YFOA 2Q8LA 4RZ5A 3SI9A 4LV9A 4EIVA 1L2UA 3W1LA 4AEOA 1E51A 2VFGA 2BTMA 3EXSA 4NZJA 2R14A 1D9EA 1QPQA 4AMAA 3TR2A 3W2JA 4NUWA 4CCEA 4K38A 3QSRA 4GUIA 3IGUA 3O1NA 3RK8A 2VOMA 5F4WA 3PB0A 3R5EA 2WSRA 4K37A 4IX2A 3ABRA 2VFHA 3LCGA 1QCWA 1XC4A 4OWGA 3HGJA 1YDVA 1KBJA 3B4UA 3QW3A 3F4WA 3UZ5A 1YTDA 3Q2DA 4AAJA 1XKYA 3UD6A 3S42A 3GXPA 4W9TA 3UWQA 2XN0A 3CEUA 4O53A 4AHPA 4UFIA 4O4WA 3L65A 4OQVA 4AVFA 3O16A 1EA0A 3B0UX 4NVTA 3C8FA 3IIVA 2E5CA 3TSMA 3G1AA 4AWSA 3K30A 5DBTA 3SJ3A 1FX6A 2Z6IA 1JJKA 2WQPA 2GPTA 3M7WA 1MEWA 3GB6A 5F2IA 3L0GA 1GG1A 5D04C 2P10A 2GJNA 5DELA 3L66A 2CZ5A 1VGAA 1SZFA 3BARA 3T55A 1SW7A 4TU1A 1GPWA 1VYPX 3W7DA 4LV4A 4LW7A 3LHWA 3W88A 4HNNA 2ZQ0A 4FEZA 3DAQA 1H60A 3CU2A 3MYOA 1RPXA 2QCCA 3NEVA 1O5KA 2YDAA 2CZEA 3W75A 3BG3A 5CZJA 4O16A 4QIUA 2CLOA 3RMJA 3TROA 1YDNA 4HT3A 3PY2A 4BR1A 3DGRA 4RXGA 1D3GA 1P0NA 1QAPA 3B05A 3DKLA 4N02A 1FCQA 1GWJA 2Y62A 1QOQA 1TIMA 1A5AA 1H7OA 1JRCA 4S2CA 1SFLA 3IRDA 2ZZ2A 1OFQA 2ZA1A 1H7XA 1H61A 4DBDA 1ZCOA 2E1DA 4MKNA 4NX5A 2Y85A 4N9CA 2F7FA 1GJPA 5C2XA 2JKEA 3KRUA 3LXAA 3G1HA 2H8ZA 3PC0A 1G4TA 2QKFA 3N73A 3W1RA 1EUNA 3LGEA 3NNTA 3OBKA 3W74A 3UWYA 4MIMA 3SIZA 2NZLA 4LRSA 4LS0A 4IXXA 3FFSA 2ZTKA 3TMLA 1XXXA 1O5XA 1C8VA 4PEKA 1HFBA 4YLWA 1J2WA 2EF9A 2QCNA 4O11A 3QM3A 3N2MA 3HBLA 5CPMA 3WJYA 3PBWA 4IGHA 3F1QA 4UFLA 4M7TA 3O07A 4MZYA 3P80A 1R47A 1QO2A 2PURA 1LOLA 1LROA 2GQ8A 5CZ0A 1B4EA 2V30A 3LHVA 3W7OA 1W37A 5H91A 4DF1A 4FX6M 4FXRA 3N9SA 3PBVA 3P62A 2V0TA 4MLJA 4JYDA 5LNUA 5K7JA 5LNWA 2Y63A 3QH2A 2QUUA 5U7SA 3T7VA 1TJPA 1DBTA 3LRLA 3HGRA 2V5LA 1B57A 4PCFA 3CC1A 1HO4A 1MO0A 3M5ZA 1DQXA 3DH7A 3T44A 3BVJA 3C2EA 2GVGA 1QWGA 3NZ1A 3BLFA 4AH7A 3KFTA 1ME7A 3G0SA 1FQ0A 1R46A 1SO5A 2P0OA 3QJAA 2NV1A 2FB2A 1W5OA 1KM0A 3EWWA 4PTNA 3MHUA 4LC8A 3V75A 2E6DA 5H2ZA 3NPXA 4O52A 5LHFA 4LS1A 3MUXA 1QMLA 3NPUA 3W7CA 3BPWA 3NL5A 4DO5A 4RK8A 1XBXA 3C3NA 1RV8A 1JCNA 3C2OA 1NFBA 4PA8A 3W7EA 4ADTA 4S2BA 4UNKA 1OJXA 3W1TA 3ZFHA 1L6YA 3UPBA 1X6UA 2ZZ1A 1U5JA 2JGYA 1NF7A 3M16A 5AYYA 4N9DA 1OYAA 1B9BA 3CIXA 1X1ZA 3EKZA 4I9AA 2RFGA 4RZ6A 1TPUA 2DZWA 1Q6OA 1VLIA 4UNLA 3LXCA 4OT7A 4UTJA 3TAKA 4MZ8A 2NLIA 1BWLA 1S5VA 5E1QA 4MY9A 4JTSA 1VCFA 2A85A 3TQ0A 4OV4A 4DPPA 3TDFA 2VXNA 1KTBA 1W54A 3DKJA 4O17A 4HPJA 3O6YX 1W1ZA 1Q6RA 3EWXA 1OG0A 2HS6A 3W7LA 5C55A 3QRHA 2J6XA 3NAVA 3ATZA 3W7JA 1K03A 5LHEA 5AHIA 5U4NA 2ATSA 1QPNA 1OFAA 4UTTA 2X1SA 2V82A 3W23A 4FIQA 4RX0A 4BWLA 4ZMGA 2HTMA 1GYLA 5CKSA 2EKCA 2Y61A 4GNJA 4MY1A 4KFOA 1EIXA 2C14A 2DZUA 3BGJA 3VNDA 2HSAA 3UPWA 3NZRA 3GLCA 3QSTA 3W7NA 5AB3A 1HUVA 4GWEA 4K8EA 4NU7A 4D2JA 1G6CA 4N9EA 1G7UA 1A5BA 3F03K 1FCVA 2FPTA 4IMDA 5ABTA 1DORA 3W76A 4UFMA 1H1YA 5CG7A 2ZA3A 1EP3A 1GVOA 1TTJA 5E93A 2CLKA 4EWND 5D09A 4JDBA 2FPYA 5EYWA 1QFEA 4O18A 4O15A 1QPOA 5G4EA 3LCIA 3NR0A 5DCDA 5AYZA 3NOEA 3P61A 5KTLA 4J9JA 4WJEA 4JDYA 3QF0A 3VFLA 4A21A 3G24A 1Q3NA 3WJXA 4I7UA 4Z1CA 5FF7A 2QCHA 3CPRA 1I4NA 4XZ9A 3G22A 3HQ1A 2DJLA 1X1OA 3OEXA 4ONVA 4O1CA 2NXIA 4LNYA 3RU6A 3GIYA 1WX0A 3U8GA 2DU2A 4GBUA 4DXVA 1FDYA 3M9YA 4H4IA 3W73A 1RR2A 3NPWA 1KFEA 4AB4A 1UCWA 2QDGA 2Y7FA 3GK0A 4A22A 1TV7A 3M0ZA 3NQCA 2BX7A 4FXSA 4WZHA 5F1VA 2GJLA 3BG5A 4JEQA 3ATYA 3S1WA 4TMBA 1OFOA 2E77A 4IWWA 1HG3A 1PVNA 1KFLA 3RFAA 2FPVA 3A22A 2OMAA 3HGOA 2QJIA 1TQXA 3MO7A 1TPC1 4UTTC 4HSNA 3BV4A 4R7JA 3UYCA 4LS2A 3I7RA 3MI3A 1JCLA 3W2NA 1L6WA 3BK0A 1C29A 3UQNA 4C1KA 5I3IA 1DJQA 1KBIA 4EF8A 3VI2A 3NVTA 1EUAA 1TPFA 3UXAA 4NNCA 1KM2A 4HIBA 1SR9A 3TJLA 2ZA2A 3SW6A 2PRMA 4NNBA 2TPSA 5FEZA 2RDUA 5K2ZA 1BTMA 1H63A 3NL3A 3W9ZA 1VC4A 3DFNA 2OX1A 1O4UA 1PHQA 2YX0A 1GEQA 2J88A 3C52A 1I2OA 1IXPA 4UTIA 1WV2A 3HG5A 1FWWA 5F4SA 3LV5A 4EVZA 1XUUA 3KVMA 4QITA 3TK7A 3I6RA 3S1XA 3GNNA 4H3DA 1TPB1 5HULA 1F5ZA 3A5FA 3S6DA 3DXIA 3LV6A 4IMGA 2Y88A 1SZGA 4M7SA 5HUPA 3NQEA 1N7KA 3M1ZA 3W85A 4UR8A 3LHYA 3W1NA 4JTIA 4O13A 3NO5A 4OV9A 2YGYA 5K4XA 2VEKA 1EEPA 1BWKA 3BO9A 3PR2A 2E6FA 5DXYA 4RJEA 1PHWA 4UMAA 1P4CA 3ANYA 3NQGA 4Z08A 5BOOA 3TCEA 1IIHA 1LRQA 3GDKA 3LBMA 3MYPA 1JVNA 4M6QA 1G4SA 2W79A 5D30A 1LP6A 4GUGA 2J9YA 1KM3A 4EF9A 1F74A 5FF3A 1X8FA 4DF2A 5AC8A 1I2QA 3W07A 4R53A 3PBYA 1ONRA 2RKXA 4LVDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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