4O4WA

Crystal structure of trichomonas vaginalis triosephosphate isomerase ile45-gly mutant (tvag_497370)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
RTFFVGGNWKANPKTVEEAEKLIEMLNGAKVEGNVEVVVAAPFGFLPTLQQKLRKDWKVSAENVFTKPNGAFTGEVTVPMIKSFGIEWTILGHSERRDILKEDDEFLAAKAKFALENGMKIIYCCGEHLSEREAGKASEFVSAQIEKMIPAIPAGKWDDVVIAYEPIWAIGTGKVASTQDAQEMCKVIRDILAAKVGADIANKVRILYGGSVKPNNCNELAACPDVDGFLVGGASLEPGFINIVNSNVHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Engineering mutants with altered dimer-monomer equilibrium reveal the existence of stable monomeric Triosephosphate isomerases
rcsb
source organism Trichomonas vaginalis
total genus 88
structure length 250
sequence length 250
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4o4wA00
4NT0A 3H54A 1XL9A 4O18A 1S5TA 4WY0B 1W0MA 5LNWA 1GEQA 5K3VA 1EX5A 5D38A 3KX6A 4WD0A 5AOUA 1DORA 4O0ZA 2CLFA 1OF6A 2Y6ZA 5AYYA 3C52A 1U83A 3M7WA 1KW1A 1Z41A 4CQ9A 3JS3A 1A53A 4NJGA 4AHOA 4W9TA 4UTJA 1AW2A 5LSMA 1JQVA 1VRDA 1Q45A 4LUIA 1W5QA 3BLFA 1X6UA 2TPSA 3NM3A 4LRTA 1ICPA 2YDAA 3SW6A 4Y96A 3RLUA 2QUTA 2Z0IA 3GK0A 3M5VA 3E49A 4Q33A 1OFPA 3MYOA 4LU0A 1FDYA 1EA0A 2IQTA 1TJRA 4XBSA 5HR6A 3FYPA 1TTPA 1VHNA 1OFOA 4FX8A 3HQ1A 3KAOA 1H1YA 3KVKA 3QQ0A 4AWSA 4MY8A 2OMAA 2NV1A 3GKAA 4M7TA 1RV8A 3P61A 5CSSA 4S2BA 1PHWA 1YADA 4ZZ9A 1YYAA 5I3FA 5D09A 1CX9A 1JCMP 3DKLA 3P62A 4HT3A 5HWJA 1GTHA 4UFHA 1A5CA 2QCHA 4A29A 3NQEA 5BNKA 3HIJA 1ZCOA 1LRTA 4ZVJA 1G4EA 3UY8A 4HN4A 4FF7A 4MZYA 2NX1A 3M0ZA 4WY0A 3W7DA 3PG9A 1LP6A 3RNDA 4ZQNA 4GUGA 2VENA 3TROA 4U28A 3CLMA 1K03A 4LVGA 3P8IA 4GUFA 2XN0A 3TW7A 3Q2DA 2NXGA 1VJIA 4PFMA 4NXKA 4WXZA 1L2UA 1H7XA 2RH9A 3VNDA 3BW3A 1U5JA 2ZRXA 5D05A 2XFWA 5U4NA 2B7QA 4JTKA 3G1VA 3W23A 3LCIA 3UWYA 2AQWA 1D3HA 1C8VA 3SFKA 1I2NA 4IMDA 3S5OA 3NPVA 1QAPA 4O16A 4QNEA 2WNZA 2A21A 4ZL1A 5G2HA 1JCLA 5A5WA 3P74A 4GRSA 5G5IA 3GDLA 1W37A 4JIQA 4A2SA 3MI2A 3PBUA 1JULA 4NJHA 4EF8A 5K4ZA 3EX2A 3LTSA 4FIQA 2CU0A 4HPXA 3C2RA 1BKSA 3M16A 3BLIA 2ZA2A 3KVLA 3B05A 4Y90A 1WA3A 2JK2A 5HQEA 1XDLA 1ZJIA 5CZJA 4BR1A 3LTYA 3SGUA 3ZS4A 2C15A 1TV8A 3EWBX 5FF4A 2CZ5A 1EEPA 4ORIA 1Q3NA 3RLVA 3V75A 2B7OA 1GYNA 2Q8ZA 3O1NA 4IX0A 2ZRVA 2ZZ2A 5HR7A 3W1AA 2B7PA 1XM3A 4DO6A 3TUUA 1P0KA 4NNBA 2HS6A 4JGDA 1RZMA 1ADOA 3N73A 5E1QA 3R5EA 3N9RA 4NJJA 2B7NA 4JX5A 5TIMA 4EOUA 2ZYFA 1ZNNA 3E02A 3O16A 4BK9A 3G8RA 4TO8A 1NAL1 4MOZA 2GUUA 4OT7A 4UTHA 3W2JA 1LORA 3HG4A 3N19B 1H7PA 1H63A 4JDYA 1OYAA 3M6YA 4J9JA 2W0UA 3M41A 2CLKA 3S5ZA 4GXMA 2Y70A 2Y62A 2ZRWA 1UUOA 4A22A 2QCNA 1OFQA 2CZFA 4N9BA 1TB3A 3OVQA 3UD6A 1JR1A 1S5VA 4RZ5A 1JCJA 1LZOA 3MHFA 5D2WA 3LXBA 1TREA 4P2VA 3WJZA 3IVUA 2OX1A 1SO5A 2ZA3A 1NF7A 3ATZA 1YXYA 3L67A 3KRSA 3BW4A 3NG3A 4B5NA 5BMXA 3A5VA 1Q6QA 4FB7A 4QM1A 4M6QA 5LNSA 1VH7A 4MIMA 1M7OA 3HPZA 3KOFA 3T40A 3CEPA 1FY6A 1SSGA 3G0XA 3QFEA 3W86A 1T0OA 3EX6A 1HTIA 1UCWA 2WJZA 3HF3A 3NO5A 1NSJA 1SZEA 3W73A 1FWSA 4FNSA 2QUVA 1KM6A 1TSIA 3CT7A 3PB0A 4OQVA 5DCBA 1EB3A 3R12A 1PE1A 3VKJA 4O12A 4MVAA 1YTKA 2CFFA 1TPB1 3KHJA 2FPYA 2G97A 5LGXA 1SU5A 3LCFA 4MYXA 4YCPA 5FEXA 3MBDA 3NA8A 2GOUA 3NEVA 1WV2A 4TIMA 3RF9A 4O1DA 3BPWA 1SZNA 3W2UA 3S42A 2J9ZA 4JIPA 3HG2A 4O4VA 1MZHA 2P10A 2PC4A 3O05A 2FPVA 3DH7A 5EY5A 4A3UA 4TMCA 1TTIA 3QEZA 5EA9A 1GVQA 1X1ZA 4FNUA 3NM1A 2X2GA 3G1DA 4IQLA 4CNPA 3WJWA 1CW2A 4ZQRA 3SY5A 3W7PA 1FQ0A 2C16A 1XDMA 3MO7A 4MY9A 1Q6OA 1H7NA 3W1PA 3W1LA 3S5YA 1NEYA 3EXRA 2KZHA 3C2OA 1AG1O 1VGAA 1M6JA 4R34A 2WO5A 3GZ3A 4UXDA 1OFRA 4UNLA 2ZZ7A 1FCVA 2YSWA 1UASA 2DORA 1JCYA 1KTBA 3GNNA 5HWMA 2NUWA 2VC6A 4ADSA 1R30A 4TU1A 2ABAA 1FCQA 1DJNA 3GKFA 2DZUA 3WJSA 2JKEA 1ZFJA 1QPOA 4LVAA 5HWNA 1O4UA 2CLIA 7TIMA 4JY9A 3P5YA 1TPH1 5KINA 1OJXA 1XBXA 3NPWA 1AL8A 5HINA 1IIGA 3N14A 3S9YA 1MEHA 3GR7A 1LROA 1VYRA 1TCDA 3CB8A 3OEXA 4UR8A 5AN7A 1G7VA 3MW7A 3W7IA 5G2IA 3I68A 4PODA 3T44A 4O10A 3LCLA 1GVRA 2E5CA 5K4XA 5D30A 4HNUA 4WX2A 3G1YA 1P0NA 3OIXA 4MFDA 2ZCGA 4JTSA 4R7JA 1XXXA 1W5PA 5G4EA 4KWWA 2DJLA 3A22A 4S2CA 5KTLA 3L2IA 1F7BA 1KM1A 3TW6A 4JYFA 3NXFA 5CZTA 1WYIA 2X1UA 3P80A 2WKJA 4LVBA 3GAKA 3O07A 2NUXA 4RJEA 4K8EA 2YPIA 1OYBA 1EP1A 3O63A 5LHEA 1I2QA 4IXXA 3I7QA 4QAIA 3PAJA 5FEPA 4CLMA 4FHAA 5IM51 2RDWA 4PH6A 3GB6A 3NL3A 4U4MA 3TXZA 5AHMA 1KFLA 1XUUA 1NFBA 1W5NA 3VI2A 3GXNA 5C55A 1C9DA 3NQFA 1OFEA 1G4PA 3F4NA 3CIXA 3P7YA 3C2FA 1VYSX 4JEQA 3L9CA 3SZ8A 3STGA 2V2DA 1RR2A 1KLYA 4XZ9A 1SQ7A 3UWWA 1W3TA 2A7NA 3G1FA 3P8JA 4GE8A 1MEIA 2DU2A 5KITA 3W1RA 1FWRA 4I7WA 2FFCA 4AEOA 3NR0A 1KA9F 5FF2A 1L9WA 1O94A 1LBLA 1V7YA 3EWXA 2V5BA 3M5XA 5CPMA 5D03A 3UWQA 4NVTA 4CQ8A 4AXKA 3B4UA 3MYPA 3THQA 1UBSA 4ZQCA 4RCXA 3DFQA 3W7HA 3U2OA 1A5AA 1W8SA 2HS8A 4I7UA 1T8XA 3CHVA 1KTCA 1OX6A 2GVLA 1W3IA 3FJ6A 2NX9A 3BGGA 3TC6A 1SW3A 3IEBA 3L5AA 2YX0A 1TPDA 4UTTA 1YDVA 1KLZA 3NVTA 4JDBA 3CU2A 4MZ8A 2D73A 3M9YA 5LNUA 2A5HA 3LHVA 3MMTA 4PA8A 2W79A 1SO3A 4BWLA 1N55A 3W7RA 3BARA 5I3IA 1B3OA 1QOPA 4UR7A 3HPSA 1TO3A 3QYQA 2ZTJA 4UFKA 4IPIA 1K3UA 1VPXA 1H7WA 1J2WA 3T78A 4RX0A 4MLRA 2YW4A 3M43A 3C3NA 3STCA 3HGJA 1WOAA 4NNAA 3WK3A 2A6LA 2A85A 3LHYA 4HKPA 4O11A 3L0GA 4EF9A 3S1XA 4KKXA 4X2RA 3EWYA 4K39A 2FDSA 1Q6LA 4RK8A 3W1TA 4K36A 1H62A 1GWJA 5D2YA 4DQWA 3N9SA 2CZEA 3W71A 1R2TA 2V9DA 4N6EA 3LCGA 1A50A 3STEA 4XQ6A 3TSDA 2VEIA 1E51A 3C0JA 3UWZA 4H3DA 4M7SA 1I2PA 4JTGA 5K9DA 2RKXA 4DBEA 1YTEA 2VFFA 5LNVA 3HGRA 1OHLA 3RK8A 3PULA 3ZWSA 4BF9A 2V30A 1AL7A 1TV5A 4O54A 1OK6A 4JYDA 3NDOA 5DBUA 3V1PA 5F1VA 3AJXA 1YDNA 3EEGA 4UTWC 1OK4A 1EUAA 2YCEA 4BI6A 3W7JA 4FX6M 2QAFA 3ANYA 3W2NA 5ABTA 2XN1A 3EX4A 2FJKA 3IVSA 4IMEA 1THFD 2H3BA 1FX6A 2Y7EA 1K8ZA 4GBUA 5D02A 2QJGA 4RXFA 3NQCA 3LV5A 3W9ZA 1GOXA 3S0CA 4LC6A 1WAUA 1N7KA 5DN1A 3DHDA 3CM4A 4O0KA 4HNVA 4Z1AA 2CW6A 2Y88A 3FA5A 3QRHA 2EHHA 2X16A 2QJHA 1KFEA 2QEZA 1FUYA 5EPDA 4NJIA 4LRSA 2WSYA 2X1TA 5EL1A 2VEPA 5LZLA 4TX9A 3DI1A 3TJXA 1LLWA 1X8FA 1RQEA 3TH6A 1F6KA 1EWDA 2R14A 2Y7FA 4C1KA 2BSLA 3P60A 5F1UA 4N4QA 2Z2UA 5D37A 1Z42A 3A5FA 1V5XA 1G67A 2YFNA 3LRLA 1R2SA 1FCUA 1TPWA 4H4IA 1KTNA 4Z1CA 2GJNA 1K02A 4OU1A 3LDVA 4HNNA 3O6CA 5HNRA 4YWIA 3DENA 3KRUA 1GJPA 4UMBA 3NQ2A 3B04A 1F5ZA 2PE4A 1B9BA 5A8GA 4XTDA 2Y7GA 5EYWA 3VE9A 3R89A 3S1WA 2CLLA 3ABRA 3L66A 1FWWA 3TX9A 3W1UA 3W1QA 3LOTA 2DJXA 5LGZA 3I6RA 2VFEA 1D3GA 1SO4A 5I3HA 3H53A 1OG0A 4UTMA 5DXYA 2OZ0A 4IPJA 2J27A 4EVZA 2FLIA 2YFOA 3GIYA 2PURA 2DZPA 4O13A 3IGXA 1F05A 2A2IA 4ML9A 4UCGA 3GDKA 2JGQA 1TIMA 3M5YA 3ABSA 3G1HA 3FOKA 3LRMA 3NZRA 3W07A 1DV7A 1UB3A 3W72A 4OV4A 5D04C 4AWTA 3K30A 1RQHA 4E2BA 3QPZA 3LHZA 2EGZA 1DQXA 1SW7A 2CLHA 1TMHA 2Z1BA 2ZZ1A 1DHPA 5I3GA 1GVSA 3EB2A 2NLIA 5F4WA 2QCLA 4KFPA 3UNDA 3S1UA 5DXXA 5SWUA 4DELA 5F2GA 5CKSA 4OGZA 3PBYA 2WV8A 2ISWA 4RV8A 2Y89A 3TNOA 4MKNA 2ABBA 3ZWTA 4FNTA 1WOBA 5K2ZA 5HUOA 1ICSA 1QO2A 4H6KA 4KFOA 2BWGA 2A7RA 1H7RA 1HUVA 3W1XA 3CEUA 4N02A 1WBHA 4M6PA 4JNMA 5AB3A 4X9SA 2PCQA 3EWUA 4BFAA 2QKFA 1LRQA 3PUDA 1W5OA 3QZEA 4ICNA 2F84A 1P5BA 1OX5A 1S5WA 2C13A 3S5NA 3WK2A 4XUGA 2CLOA 5I3KA 2Z6JA 4MJZA 2E6YA 4IMCA 5AYXA 3W7EA 4CCDA 1QFEA 1GTEA 3LCWA 3CWNA 1P4CA 4MPQA 3IIXA 4MYAA 2QCFA 1TPFA 4LV9A 2EF9A 3LCXA 3PC0A 2GVJA 1PIIA 3C61A 4UFLA 1GZGA 3INPA 2ZQ0A 3PSWA 4AB4A 2VFDA 4DF1A 4UC5A 2A4AA 4DBDA 5TQLA 2I14A 3CIWA 1ALDA 3L68A 4ADTA 2V8ZA 1KFBA 1WXJA 4GJ1A 3MUXA 4UTTC 2H90A 3NL6A 1VS1A 1KFJA 4RLIA 3WJXA 3HB9A 2QCGA 1OFDA 5EMUA 1Z48A 3BV4A 5KMYA 1TYGA 3QMTA 1K8YA 1KFCA 1LM1A 1CI1A 1PL9A 1GVOA 2HTMA 1LTDA 2Y7DA 5AHEA 3QM3A 3ZR4A 3L65A 3TKFA 1PV8A 2FIQA 1PHQA 4UUIA 1UJPA 1RQBA 1SFLA 1JCNA 3TFCA 1DJQA 1KM0A 2WPBA 1EPXA 3HGOA 3QMSA 2H8ZA 3LBMA 1MEWA 3MP3A 5EKYA 3QPYA 4E38A 4RZ4A 1I4NA 4KFNA 5AYZA 1I45A 1QPNA 3AO0A 5DCDA 4LS1A 2QCDB 3B0UX 3HO8A 5AHLA 4BI5A 2NXHA 1KBIA 4UNKA 2E6FA 5F4XA 3GDTA 4Z0JA 5F2IA 2RDTA 3IIVA 3HG5A 3TMQA 5FEWA 1IXNA 2QJIA 1VYPX 3I7RA 1AW5A 2PRMA 4JICA 2C1HA 1H61A 4AAJA 4YCOA 1JCXA 1QOQA 4JN6A 4N6FA 5AHNA 5DLCA 2TYSA 3A23A 4GUIA 4A2RA 5DY2A 3G24A 5E93A 2NV2A 1JRBA 3EKZA 1H50A 3PS7A 3PUEA 4E0CA 2X1SA 4UTKA 2E68A 4X3ZA 2C18A 2CLEA 5HMSA 5C6MA 1L6WA 3UPBA 3PR2A 3PB2A 4NJKA 3W75A 2RFGA 3FFSA 1TPEA 3LHTA 3QSTA 5FESA 4TMBA 5IBXA 1LLZA 3P67A 2F7FA 1X7FA 4GFSA 3QMRA 1XBZA 3VCRA 8TIMA 5LNRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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