4O52A

Crystal structure of trichomonas vaginalis triosephosphate isomerase ile45-val mutant (tvag_497370)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTFFVGGNWKANPKTVEEAEKLIEMLNGAKVEGNVEVVVAAPFVFLPTLQQKLRKDWKVSAENVFTKPNGAFTGEVTVPMIKSFGIEWTILGHSERRDILKEDDEFLAAKAKFALENGMKIIYCCGEHLSEREAGKASEFVSAQIEKMIPAIPAGKWDDVVIAYEPIWAIGTGKVASTQDAQEMCKVIRDILAAKVGADIANKVRILYGGSVKPNNCNELAACPDVDGFLVGGASLEPGFINIVNSNVHSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Engineering mutants with altered dimer-monomer equilibrium reveal the existence of stable monomeric Triosephosphate isomerases
rcsb
source organism Trichomonas vaginalis
total genus 88
structure length 251
sequence length 251
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4o52A00
5I3GA 4FX6M 1K02A 4LUJA 4IMFA 3NM3A 3C0JA 4OBTA 1DOSA 4OE7A 1SU5A 2HS6A 2GVJA 3PY2A 3C2RA 4GUFA 3EKZA 4JGDA 2QCLA 2Y6ZA 4MKNA 4UR8A 3SJ3A 3EWXA 4KWVA 1NF0A 3UQNA 3QQ1A 2FQIA 3S0CA 3LCHA 4UTWC 2YPIA 1XBVA 3LTYA 3R8RA 1Q3NA 4X22A 1TPFA 1JQXA 1G67A 2ZFAA 4FHAA 3STGA 4RZ6A 3W07A 3I65A 3QFEA 3C56A 3G18A 4MY1A 3DAQA 3RMJA 2QCNA 3QW3A 4ZVJA 1TV7A 2CLLA 1M6JA 3MBDA 4LOCA 3B0PA 3EX2A 3W7PA 1VR6A 1ME8A 2AQWA 1KM5A 1J2WA 1VLIA 3S1XA 1F73A 4ADSA 5AHEA 5C55A 2QAFA 3P84A 4O28A 4HNUA 3UWYA 4NU7A 3WJZA 1UCWA 1H1ZA 4X3ZA 3GDTA 3MJYA 5AYYA 5HQEA 3QQ0A 5ABTA 1SO3A 2D73A 2VFDA 1ALDA 4OV9A 4ZZ9A 1OHLA 1WBJA 1GPWA 1SFJA 1EEPA 3QZEA 2Z1BA 1TTQA 3KVJA 3N9SA 3UWZA 4DO6A 1B4KA 3A21A 3QSTA 1GZGA 4BR1A 4W9TA 2C15A 3LHTA 2WV8A 1TIMA 2HSAA 3PR2A 1JVNA 3UWVA 2X1SA 3W7HA 1ICQA 3NA8A 2GQ8A 2VENA 4NJIA 5D09A 1G7VA 5G5IA 1H7PA 1KW1A 1AW2A 2ZCGA 3ELFA 4FIRA 2VFFA 3SGUA 3GKAA 1AL8A 4ORMA 2ZRUA 3N9RA 4GRSA 4BI5A 1E51A 3DFQA 4M5PA 1TPWA 3M0ZA 3DXIA 4UNKA 1RQEA 4JTGA 3STEA 4UTHA 2FTPA 3FEMA 4HIBA 5KITA 2X16A 5BRBA 4EOUA 3IV3A 1OX5A 2J24A 1Z41A 1FCQA 3FJLA 4LW7A 1VCVA 2HS8A 3CIXA 3RLUA 3IIOA 4IPIA 1GOXA 3A5FA 1OJXA 1ZNNA 3MI3A 3G1DA 2TYSA 3L66A 1EWEA 1TTPA 3EXSA 3L5MA 3N73A 1F76A 4UR7A 3P5YA 1UB3A 1ICPA 2CLIA 3O16A 4RK8A 2Z6IA 2QCCA 1QO2A 4Q4KA 1F5ZA 5TQLA 1LLZA 4AVFA 1KM6A 3A24A 4O52A 4ADUA 4HPJA 3TAKA 2H3BA 1HTIA 4R53A 2ZZ7A 2E6YA 3M41A 4ML9A 1ONRA 3UYCA 2V30A 3U6WA 1H63A 1IXPA 4DO5A 1VC4A 3KX6A 3NG3A 1HO1A 3CIWA 5H2ZA 1SO6A 4TIMA 5CPLA 1XBYA 3MO7A 1GVOA 4O1AA 5D37A 1D3GA 1TV8A 1OF6A 1LRQA 3LBCA 1YLVA 5EMUA 1RZMA 1TPH1 1WBHA 2NX9A 2TPSA 4NJGA 4NNCA 5CG7A 4EF9A 4EVZA 3NPWA 2CLKA 2V0TA 1QPNA 2ZRXA 5I3KA 3W23A 1W37A 4MYAA 3BGJA 3GDKA 4WJEA 3TXVA 3LLDA 3GXTA 5HJLA 2YR1A 1TPVA 4ALDA 3W72A 2OMAA 1B57A 3QJAA 4JIQA 3LCXA 1EWDA 2C16A 3C6CA 1JCYA 2DZSA 5BW6A 5AYZA 4AWUA 4BK9A 1W56A 2DZUA 4IMDA 3TK7A 1NEYA 4IPJA 1OYBA 2CZDA 5D38A 5F1UA 5K9XA 3S6DA 4FXSA 3P8JA 2B7OA 1ZAIA 3OVQA 4FIQA 1YDNA 1VRDA 3LCWA 1PE1A 4GNJA 2P0OA 3HB9A 1FWRA 2NZLA 3UNDA 3NQEA 4A22A 5K9DA 3LHZA 3TXZA 1XDLA 3S5OA 3FFSA 5D2TA 4N9BA 5BMWA 2ZBTA 1WXJA 4LVGA 3R89A 1I45A 1RVGA 1UUOA 1N7KA 1K03A 2X2GA 2ZZ5A 3L0NA 4Y96A 4BFAA 1X6UA 2QUTA 1GEQA 1TPC1 1WX0A 2DU2A 5AHIA 3NGJA 4UNLA 3IVTA 4GJ1A 3S1UA 3UD6A 4LVAA 4H6KA 4UTKA 1F05A 3EX1A 3UZ5A 1A5BA 1IGSA 1TSIA 1W3NA 3PM6A 3B06A 3TFXA 3W6YA 4GC4A 5LZLA 3IGSA 1RD5A 1WAUA 1SZFA 5F4WA 3DFOA 3SI9A 1HUVA 1W5MA 1U5JA 2G5WA 1QO5A 1AL7A 4RZ4A 4OHQA 3WJXA 4JICA 1KA9F 4Q32A 1GYLA 1H1YA 2RDTA 4E38A 3PB0A 5F1VA 4N9DA 4QISA 2PC4A 3VFLA 3NXFA 5CPOA 2R8WA 1TJRA 2GQ9A 1DJQA 4LC6A 3KFTA 3MHUA 2ZA1A 5HNRA 1OFEA 4HKPA 3QC3A 5AC8A 2CWNA 3G8RA 3W2UA 2DZTA 2OZ0A 1GT8A 3BARA 5E0KA 5C6MA 1ICSA 3DHFA 3W1MA 2V8ZA 3C2EA 4MVAA 4UFJA 2ZZ3A 3BG9A 1UASA 4M7SA 1B4EA 1LRNA 3DI1A 1KFLA 3EWBX 4LS2A 4MIMA 4DQWA 2ZZ1A 4YWIA 3UWQA 1G4PA 3WFAA 1D9EA 1G69A 4O50A 4XQ6A 1R46A 1OFDA 2HMCA 4KKXA 4LNYA 1YXDA 3NQAA 1LOQA 5AN7A 5F2IA 2NV1A 3W7MA 1MXSA 1XBXA 3BGGA 3PB2A 3CQ0A 2PE4A 2CZ5A 4FB7A 2F84A 4UTIA 5I3HA 1ZY9A 3RF9A 2VEKA 1J4EA 2ZRZA 1M5WA 2ZZ4A 4O4WA 3GIYA 3ABQA 2GJNA 4MZ1A 3M5VA 2O7QA 3HGSA 1DV7A 1OFRA 4JYFA 4XBSA 1YDVA 4AB4A 2Q3OA 3WK0A 1YXYA 1LOSA 1OFPA 1PHQA 4IMEA 3RU6A 3W74A 1ZHAA 4CCEA 2QAPA 4UMAA 2XN0A 4MUZA 4O14A 3ATZA 3O1NA 2A7RA 4N2YA 1BWKA 3HG3A 3ANYA 3C2OA 1OX6A 4HSNA 3O06A 4LS1A 3DFTA 1FCVA 1OX4A 4M6VA 3NOEA 1O5KA 3CTLA 2FPYA 5IBXA 4BWLC 2ZRYA 2O7SA 3R5EA 5FEPA 4UMCA 4XTIA 1A53A 1N55A 3TW7A 3BG3A 3G0XA 1KLZA 3E02A 3FA5A 3HOJA 3GAKA 2YXGA 1L6SA 4NJJA 1K7FA 4XBKA 3G22A 3TAOA 4H4IA 1JJKA 2E6AA 3W7RA 3C61A 4MY8A 3PBVA 4DF2A 1Q6LA 4K8HA 3ABSA 4UTLA 1W0MA 4YLWA 1NAL1 4Z1DA 5LSMA 3BK0A 2A85A 2C14A 1S5VA 4Y6GA 4BI6A 4AHOA 4O17A 5T26A 3W7JA 2ZTKA 4XWUA 3Q94A 1VPXA 3QPZA 4RKAA 4YL2A 3WK3A 4JYEA 3GR8A 1W5QA 4LRTA 3W1PA 1BWLA 2ABAA 3KVLA 1J5TA 3N2MA 1JR1A 3C2VA 4AF0A 1DKWA 3CEPA 5L6UA 4QITA 3UPBA 3R2GA 4IXXA 2NXGA 3DGRA 4X2RA 1SO4A 4A2SA 1FQ0A 4JN6A 4FO4A 5CSRA 3R12A 2J88A 3HO8A 3UPWA 3Q2DA 4IXHA 1LBFA 1Y0EA 5K9CA 4O1BA 4A21A 1TMHA 3PF3A 3CEUA 1L9WA 3MYOA 4UFKA 3UY8A 3PVFA 2YFNA 3O15A 2QCMA 4JTLA 4LVFA 4JY9A 1F74A 4PFMA 2NLIA 1H50A 2EPHA 5AHFA 3EEGA 3W7DA 3TIMA 1MEHA 4FNPA 3LHVA 5G4EA 1O95A 3KAOA 3WJSA 3VCRA 4AWSA 1EP2A 4DF0A 4AAJA 1T99A 3G1SA 1HO4A 3FKRA 3HPXA 4X9SA 1EPXA 2WJZA 3PG8A 5J5DA 3QW4B 4HHPA 4O0KA 2CZFA 2FLIA 4MJZA 3NPVA 5K4ZA 3U2OA 1FY6A 3EWUA 2EHHA 5BNKA 4MFDA 2J9XA 3MP3A 2ZZ2A 4KFOA 2Y7FA 1KFKA 1TREA 1GG1A 2ISVA 2J6XA 2YZRA 5G1TA 1ZAHA 2H6RA 3PS7A 3LCLA 1Z42A 1X7FA 1LBMA 3L5AA 4WY0A 1FDYA 2WNNA 1WOAA 5CKSA 2FPVA 2EF9A 2EGZA 4O8RA 3PULA 4CNPA 1FCUA 5CZ0A 4M19A 7TIMA 3BLIA 4E2DA 5G2IA 2CW6A 1SZNA 1EP1A 1X8FA 4QNEA 3GK0A 4WD0A 3N14A 2QUUA 1ML1A 3UXDA 4CNOA 3W86A 3DHDA 4M7TA 3W83A 1NFBA 1TQXA 2YW3A 3MMTA 1TB3A 3FIGA 5F4SA 5DY2A 5GVJA 4O15A 1FCBA 3IRDA 3MW7A 2BXVA 3DU0A 3LTPA 3IGXA 5HR6A 1QOQA 1KBJA 4NT0A 3SZ8A 4AF0B 1G4TA 3TMLA 2OX1A 1A50A 1XKYA 3QM3A 4O53A 3C52A 3LHYA 3SSJA 2ZZ6A 3PSVA 3SW6A 5BOOA 4MLRA 2PURA 1ZCOA 5LNSA 1G6CA 2A7NA 5AC6A 4ADTA 1WA3A 1F7BA 2BZNA 3F03K 3D0CA 1W8SA 1XI3A 3LCGA 2HTMA 5LGZA 4QIUA 1TPB1 3QH2A 3EWWA 5AFDA 1Q6QA 3KHJA 4POCA 2VC6A 3DFSA 1XDMA 4HPXA 2JK2A 1VLWA 3VI2A 3EWYA 5I3FA 4YXGA 3S1VA 3UXAA 3HGJA 4G1KA 2TRSA 4UFIA 3L0GA 3P8IA 3VE7A 3G24A 3PBUA 1SPQA 1KFEA 1LROA 2VOMA 1H7XA 2F7FA 1Q6OA 4NUWA 3W1NA 3PWAA 3TQKA 5HWJA 1WDWA 1O60A 5DXXA 4N4QA 4JTEA 3PUDA 3ABRA 1YPIA 4FF7A 1W1ZA 3STFA 3SY5A 3W76A 1OK6A 3ATYA 3BVJA 1GVSA 3T78A 3NPUA 2P10A 3EXTA 3TC6A 2A21A 3L0KA 3PC0A 4K8EA 2W79A 3W2MA 2CLOA 1FXQA 4WY0B 4A2RA 2I14A 2WQPA 3DFNA 1GG0A 3MI6A 4CQ9A 1KM2A 4AXKA 1GTHA 1ZJIA 5FI8A 3LGEA 2ZA3A 3CLMA 3HBLA 5CSSA 1AG1O 1KFJA 2GUUA 4GWEA 2PRMA 1QNVA 1L2UA 2ATSA 2ZQ0A 4E2BA 1FDJA 2TSYA 5EY5A 3HG4A 1M7OA 2AGKA 3LDVA 5LGXA 4S2BA 3LLFA 4NJKA 5K2ZA 2B7QA 1PHWA 2H3DA 1TQJA 1JCJA 4ZQNA 1H7OA 1TTIA 5KTLA 3TSDA 4JTUA 3OVPA 1YTKA 4O11A 6TIMA 3U8GA 3P60A 3QMRA 3E12A 3ZS4A 4UUIA 3HPZA 4UFMA 3LRKA 1X1OA 1Q45A 4O16A 3W2NA 4R34A 4TMBA 3Q37A 4IJBA 1P5BA 1VQTA 3IVSA 1ZAJA 3W87A 1MEWA 1DQXA 3M44A 1FX6A 3KRZA 5FF3A 2NV2A 2VFEA 4EF8A 3MUXA 2RKXA 1K7XA 3LERA 1C29A 3B05A 4RV8A 2BX7A 3BW4A 3TCEA 4O57A 4AHPA 1XUUA 1SW0A 3PBYA 4PODA 5U4NA 3HQ1A 4RLIA 1LYXA 4NX0A 2NUWA 2WSYA 5F2GA 4JY8A 4UFHA 2A6NA 2E09A 3NDOA 3LX9A 3FJ6A 4QM1A 1S5WA 4Z0SA 4IX0A 4K6AA 1HFBA 3T44A 3W88A 2VEPA 1P0KA 3E49A 1VYPX 4LWWA 4MFEA 3PAJA 3M16A 3MBFA 1OFBA 3F1QA 3GVGA 3BLFA 4MJMA 1RV8A 5FF7A 1CI1A 2FFCA 4FXRA 5DCDA 1YDOA 2WNQA 3UZJA 1ME7A 4NJHA 5AYXA 3TROA 3P61A 2E5CA 4BWLA 5FESA 4FNUA 4LV4A 2V2DA 3DH7A 4JTKA 4KFPA 3E9AA 2QEZA 4UTMA 4FEZA 4PC8A 3NM1A 4K39A 1THFD 1N8FA 3THAA 1I2QA 1SW3A 1YTDA 4JEQA 1AW1A 5CGQA 3BW2A 3DENA 2YYUA 3L67A 2C0AA 5CZTA 1C8VA 4DXVA 1H62A 2DJXA 5EKYA 3G1HA 2W6RA 3G1XA 3CB8A 5EYWA 3NPXA 3M5YA 1WOBA 1TJPA 3KVKA 1UBSA 1KM1A 4C1KA 1F6KA 2JKPA 1QCWA 2Z0IA 4Y9AA 1VYRA 3RLVA 4Z1AA 2QJHA 3W7IA 1BKSA 2WKJA 4JS3A 4O0ZA 1OFQA 2QDGA 4UCGA 4AH7A 3W7KA 1NVMA 5HR7A 3CWNA 3N2XA 3NR0A 4TMCA 1TTJA 2E1DA 4M6PA 1JCXA 3INPA 3TU9A 2LLEA 1DVJA 5EPDA 1LLWA 5U7SA 3W9ZA 1GJPA 5DN1A 8TIMA 1TCDA 3FYOA 4FX7A 4JTJA 3EX3A 2Y7GA 4DO4A 1TPUA 3V75A 1LP6A 5LNWA 3NEVA 2QCGA 4QSHA 4TO8A 4UFLA 4LVDA 3LHUA 3NQMA 3W7QA 2C6QA 2RFGA 3GLCA 4U28A 4XKYA 2QCDA 3TFCA 1D3HA 2G95A 5TBOA 2W0UA 3LXCA 3IIVA 4GUGA 1H7RA 1HG3A 3GNNA 2B7NA 1QWGA 3L5LA 3I7RA 2QR6A 2BLEA 2IQTA 2WSRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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