4OWGA

Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-pep complex
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
SRKFFVGGNWKMNGRKKNLGELITTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIAVAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALSEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-PEP complex
rcsb
total genus 90
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2014-02-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4owgA00
2DZVA 2WSQA 4ZQPA 1WXJA 2A6LA 3G1XA 4LRTA 3BO9A 4CCDA 4JTSA 3HMJG 1H5YA 3DH7A 4P2VA 4AF0A 2GQ9A 3N3MA 3TH6A 3PUEA 4DF1A 4XBSA 4UCGA 4BI6A 1L6WA 2NV2A 1UJPA 1LZOA 5AHLA 5CKSA 3HPZA 5DCBA 2FTPA 4M7TA 3SECA 2ZRZA 3W23A 3WJSA 3L65A 1EEPA 3RLUA 1SR9A 2XN1A 3L67A 1IIHA 4S1FA 3DFOA 1HUVA 5KINA 1A50A 4NQ1A 3C4UA 3FLUA 4O54A 2C6QA 2HS8A 3CWOX 1QFEA 1RVGA 4QJ1A 1KTNA 1KV8A 4NXSA 3NM1A 1ZCOA 3KFTA 4WY0B 4MYAA 3B0VC 4O19A 3EKZA 1SSDA 3W1MA 1KTBA 1F05A 3G0UA 4QSHA 1V7YA 2ISSA 4FX6M 4K36A 1QPOA 5D2TA 3LLFA 2A1YA 2QUTA 1FQ0A 1LRNA 5HINA 2YFNA 3O06A 2DORA 3NPVA 1W5OA 3NEVA 3QMSA 2EAWA 3HQ1A 2ZZ6A 1I2OA 3ZS4A 2C0AA 4N6FA 2E5BA 4HSOA 3W70A 4DBDA 5F4SA 3HIJA 1EP1A 2TSYA 3CEPA 2ALDA 3NL3A 1H62A 2WO5A 1Q6OA 5EL1A 1G67A 1OK4A 3L2IA 4CNOA 3QJAA 1OFDA 3OBKA 3STGA 2A7NA 1XDMA 1U83A 1AL8A 3W87A 2GUUA 1F74A 2YGYA 3WK0A 3G24A 1VPXA 2CZ5A 4R53A 2IQTA 2JBMA 3NQ6A 3F4NA 3OG3A 2E6AA 4ADUA 4N9CA 2ZYFA 3NM3A 3LERA 1YYAA 2V8ZA 1FWTA 1GYLA 4RXFA 4MLJA 4ZZ9A 5F2LA 1QOQA 1Z41A 3N19B 4W9TA 1F6PA 4K8EA 3L5AA 5CPLA 1KFLA 3G1AA 3HGSA 5HJLA 1O4UA 4LVAA 4O4WA 1IGSA 3UWYA 4MZ1A 3PAJA 3I7RA 1KFJA 3TSBA 2VFEA 3NOEA 4WJEA 2HTMA 4WXZA 1FCQA 2GPTA 5F1UA 3UWUA 4JYEA 4LOCA 4UTJA 2ZZ5A 3RMJA 2NUXA 3LM7A 4WX2A 3DFQA 5G1TA 3W7QA 2RHGA 3TW6A 4XTIA 3W86A 3NPWA 2PC4A 2QJGA 2OZ0A 3UYCA 3LBCA 4GUIA 1BWKA 3IIXA 2WJZA 5I3KA 1W5QA 1NAL1 2V2HA 1M7PA 5A8GA 3MUXA 3CB8A 4N9EA 3O16A 4FHAA 2GJLA 4S2CA 1JUBA 1ZJIA 7TIMA 3W84A 2ZRVA 4JX6A 4LY8A 3M5XA 2VEPA 4O0KA 4AMAA 1K8ZA 3W7DA 2WV8A 1OYCA 2E09A 1H7XA 4IX0A 4DXVA 1TTPA 1I4NA 3WJZA 2ZRWA 4UTIA 4BI5A 3W7KA 4Q33A 3W85A 4IXHA 2QJHA 4JX5A 3W71A 1SPQA 3TKFA 4TMBA 3BPWA 4K7VA 3T7VA 3T4CA 5CZJA 4BI7A 3FOKA 1W3IA 5J5DA 3S0CA 4OV4A 3EX2A 4O12A 4HNTA 1U5JA 1ONRA 1FBAA 4YXGA 1I2QA 2NX3A 4M19A 2J27A 4WOZA 1ME8A 3B4UA 3QSTA 5CPOA 2R94A 5EKYA 3FYOA 5TBOA 3A24A 3AJXA 5CGQA 1WQ5A 3NQ7A 3RU6A 2PCQA 5IM51 1R30A 1KBIA 4JTEA 5I3JA 5AOUA 1IXNA 1DOSA 4CQAA 2FPTA 4XBKA 4KFNA 3TCEA 1FXQA 3TSMA 3I7SA 1TREA 4PODA 3TJXA 1G7UA 2ZRUA 3QH2A 4FB7A 3R2GA 1UBSA 2CLHA 4N4QA 3CM4A 5BNKA 3GDLA 5EA9A 2P1FA 2DZPA 1OG0A 3PBUA 3W2LA 4CNNA 5HWJA 1H7RA 5DBUA 1KTCA 3MP3A 3NXFA 2RKXA 1QOPA 3LDVA 4LRSA 3GAYA 4WY0A 2QCDB 3SR7A 1G4PA 2E5DA 5T26A 5AHFA 4FIRA 5L9FA 1TPFA 5F4XA 3PB0A 4M6VA 2Q3RA 3C56A 1DBTA 3G1SA 2EHHA 1VJIA 1TV7A 1W5MA 3NQAA 1PVNA 4A3UA 1P5BA 3W76A 3KVMA 3LXBA 3QYQA 3W2NA 3WK1A 3KVJA 4CCEA 2DZXA 2FLIA 3L66A 2YXGA 3GDRA 3M41A 4YCPA 1VHNA 1ME9A 4O8RA 1KFBA 1VLWA 2DZWA 4O4VA 3LV6A 1EUNA 3H54A 2CZEA 4U4MA 1JULA 4OV9A 3W7RA 3DHDA 3IIOA 4LW7A 1W56A 1WYIA 4MLRA 2NXIA 3M0ZA 3LX9A 4O16A 5H2ZA 4N9DA 4UTLA 1LBFA 2B7NA 3BLEA 3PG8A 1KBJA 1H63A 4MY1A 1BEUA 1JVNA 2Y7FA 4EF9A 2EPHA 3P82A 4NT0A 3MWAA 2ZTKA 1TSIA 1VYSX 3BLFA 4TR9A 4TO8A 3GDKA 3HG3A 4PH6A 5MHBA 4O53A 2G96A 5KTLA 3GIYA 1VCGA 1PCKA 4UTMA 2YX0A 3B05A 3TMLA 3NQCA 5KMYA 1F5ZA 4RX0A 1XUZA 4RZ6A 4HPJA 4NJHA 4UFKA 3MJYA 3E96A 4CQ8A 1BKSA 3DZ1A 3INPA 1EWEA 2NX1A 1N55A 3R8RA 4KFOA 1JCXA 3ABRA 3N2MA 4MZ8A 4O57A 1G7VA 3TQKA 5F2GA 1T99A 2QCGA 1FWWA 1GQNA 1B9BA 4G1KA 3EWYA 3EX6A 1JCNA 3SJ3A 1LOQA 4O50A 3LRLA 4LWWA 3W7CA 4ALDA 4PFMA 5E1QA 4JTFA 1N7KA 1B4KA 4QNWA 3W2KA 1TCDA 4HHPA 5AYXA 4TU1A 3OIXA 2A6NA 1PV8A 1GEQA 1K3UA 3W1UA 4K8HA 3NL2A 1SZGA 3TSDA 3WJYA 1RR2A 1OFPA 2V2CA 1HL2A 4HSNA 1K7EA 1EUAA 1AW5A 3W7GA 4UTWA 2A5HA 5DXYA 1L6YA 1RPXA 2NWSA 4PC8A 1YLVA 1KM1A 1YXYA 4AWUA 3ZR4A 1DVJA 1XBYA 2Y6ZA 5CPMA 5G2IA 2QUVA 3P5YA 5DY3A 1KM0A 4N2YA 3O8AA 3LLDA 3LHWA 3A22A 1TMHA 1OYBA 1T8XA 4JNMA 3IIZA 2DJXA 1YTKA 4N9BA 2J6XA 2FDSA 2BWGA 3NO5A 2X1RA 5G4WA 2C3ZA 4WUIA 2PE4A 3ATZA 5TIMA 4IJBA 1J5TA 3P74A 4C1LA 4HNVA 4ZQCA 3BK0A 3LTYA 1VH7A 3O15A 1IXOA 5AYYA 2ZZ2A 1I45A 5HUOA 4IX2A 4FNUA 3GYEA 3MYOA 3E02A 2RDTA 4MY9A 3W1LA 3SI9A 1OFOA 2C13A 4GBUA 4K37A 4FF7A 5G2HA 4A29A 1C9DA 4IPIA 1W5PA 3C2FA 1SZEA 4KWVA 4O11A 4ZQOA 2ZRXA 3LXAA 4N6EA 2V30A 2BXVA 4XWUA 2CU0A 5FI8A 4NJKA 3TQ0A 3V1PA 3TW7A 4C1KA 2P0OA 1ICSA 5LNWA 1KM2A 2YYUA 2DJLA 2Y7DA 3TXVA 4LUIA 1ZAIA 1SSGA 4U28A 1YTEA 3EB2A 4QM1A 4MUZA 4Z08A 2RH9A 1I2PA 5AN7A 2HMCA 2H3BA 3W7PA 3P60A 3K30A 5D09A 1Z44A 4OT7A 1H7NA 2FB2A 5IBXA 1HO4A 2QCDA 2GOUA 1S3HA 3DBPA 5GVJA 4EIVA 3QQ1A 2TYSA 1W3TA 1T96A 2VC6A 4DPPA 5A5WA 1PCWA 2JGYA 5DBTA 1JQVA 3GDTA 2E5CA 4LS2A 2FPYA 1LORA 3EWZA 2C16A 2HSAA 1OFQA 2X1UA 2OMAA 4GNJA 5HUPA 5AB3A 2W6RA 5DY2A 4MY8A 1XXXA 3W7JA 2WNNA 4ML9A 3C52A 2J9XA 3FEMA 2BLEA 3Q37A 2H90A 4UC5A 3TA6A 4M6QA 4NX0A 3HGJA 3HGRA 2Z6IA 1ZNNA 5EPDA 3L5MA 4IMEA 2EF9A 3GAKA 3FJ6A 2E6DA 2EGZA 1B3OA 2OX1A 3W2JA 3MW7A 1DORA 1O5KA 4WY0F 4BF9A 2VEKA 2Y89A 3UWWA 5CSRA 2O7SA 4AWSA 3W1XA 2W79A 3UPWA 2ZBTA 3S5NA 3I7QA 3F03K 5U4NA 3F4WA 1ZENA 3EWXA 3NPUA 1O60A 1LLWA 1ZY9A 1KLZA 1TRDA 2QUUA 5FEZA 4FIQA 3N14A 2ABAA 3LXCA 1EP3A 4I7VA 3VNDA 3B06A 3UPBA 3VE7A 5KITA 3P62A 4QAIA 4CNPA 1ADOA 1TV8A 4R33A 2BTMA 4DBEA 2AGKA 2WQPA 4LVDA 1OF8A 2CLOA 3G1DA 1OVDA 1ZFJA 1FCUA 3TV8A 5DXXA 1VGAA 3LOTA 1SO6A 1N8FA 1TYGA 3A5VA 3VCRA 3A23A 4RLIA 4UMBA 4IUOA 5D2XA 3NAVA 2TPSA 5AHIA 1JUKA 3SGUA 4ZL1A 4HT3A 1W3NA 5BW6A 3V75A 2YSWA 3W1TA 3OVPA 2FPVA 3I65A 3FJLA 4QITA 1A5CA 1J4EA 3UD6A 3NQGA 5K4ZA 3TROA 4CCCA 2C15A 3HO8A 3NA8A 1SQ7A 4LVBA 1FDJA 2ZDRA 4NVTA 5ABTA 2FFCA 3QZEA 3C8FA 2Y85A 3DFNA 3QEZA 1Y0EA 3QPYA 3C3NA 2P10A 1OX4A 2Q8ZA 3N2XA 1L6SA 1A5BA 1AG1O 3UWZA 1NF7A 1EX5A 2NWRA 1THFD 3CTLA 2Q3OA 4ADSA 3PVFA 4AHOA 5HWMA 3GXTA 3E9AA 3HG5A 1VRDA 2ISWA 3SY5A 3T44A 4Z0JA 3UWVA 1NSJA 3DU0A 3QRHA 4NJIA 4FNTA 2FB3A 3M7WA 4ONVA 3L0NA 4UMAA 3W1RA 3FKKA 1TJPA 4Y8FA 3NYZA 5AFDA 3T40A 2G95A 3LI0A 1RV8A 2B7QA 4Y90A 1P1XA 2H8XA 2WSYA 4QISA 1FXPA 5EMUA 4HPXA 3M5VA 4LNYA 3ZWTA 5BRBA 3LI1A 1GYNA 1DJQA 4TMCA 3ZWSA 3BG5A 3CPRA 4O13A 1R2TA 5AHNA 3DI0A 3M6YA 3F1QA 3SZ8A 2C18A 5LGXA 3ZFHA 5AC8A 1ZAHA 2QCCA 2YW4A 1KLYA 2F84A 3DFSA 4JTTA 4MFDA 4I9AA 3JR2A 4UFLA 2ZFAA 2GJNA 1SW3A 4BWLC 4UTTC 1ZAJA 3P61A 4A22A 3QPZA 3W7EA 5KZMA 4JR5A 4YLWA 5C55A 3E12A 3U8GA 2CZDA 3W6YA 2TRSA 4AB4A 3TAOA 2QCHA 4Z0SA 3PM6A 3LV5A 2ATSA 1W8SA 4L4LA 5KZDA 3W7HA 3SIZA 2CFFA 1QCWA 4JTIA 3VE9A 1MXSA 1WOBA 1A5SA 3M5YA 3TNOA 3W3OA 1K8YA 1KM6A 2FQIA 1WBHA 2NXGA 1AK5A 3PR2A 3W1NA 4A21A 4XKYB 5C54A 1DJNA 1MSSA 2ZZ4A 4EVZA 1YDOA 3KRZA 1X6UA 4UXDA 1RQBA 3GLCA 3ATYA 1TTJA 2Z1BA 3W72A 1JUEA 3UY7A 1TPH1 4GC4A 1AL7A 4Y6GA 4K7YA 4AEOA 5C2XA 3PS7A 3HF3A 1BTMA 3STCA 5DN1A 2D73A 4UNKA 3B03A 3L68A 3CQ0A 2I9EA 1DQWA 3S5ZA 1NF0A 3KRSA 3RK8A 1F7BA 4O1CA 1EWDA 1YTDA 4EWND 1SFJA 1UB3A 3OVQA 1PHWA 4LC6A 4JTGA 2ZA3A 4JDYA 3UY8A 3W9ZA 2I14A 2X2GA 4ZQNA 4Q32A 3PF3A 3MI3A 4GUHA 1DQXA 3FS2A 5U7SA 4LV4A 3UXDA 1LCOA 1R2RA 4OE7A 1VLIA 4UR7A 1R47A 2A7RA 4K39A 1WDWA 1GTEA 3QQ0A 1GJPA 3TC7A 3NQ2A 4N4PA 3DGRA 1OF6A 3NZRA 3ANYA 1TIMA 4AVFA 3P7YA 4RJEA 1T0OA 1XBXA 1WA3A 2ZA1A 4NNCA 3LHYA 1TPVA 3S1UA 2BX7A 3P5ZA 3O1NA 5HR7A 5D04C 1H7OA 4UMCA 4JXCA 4JEQA 2Y7EA 3DKJA 3Q2DA 1B57A 1MZHA 3KXQA 2WNZA 2DZUA 3D0CA 4NUWA 3GR7A 3W1QA 4H4IA 4O15A 1TPEA 2I1OA 2VFDA 5SWUA 3BVJA 3NNTA 3KRUA 3BW2A 3STFA 4O1BA 1L9WA 3LHUA 3S42A 3ABQA 1IXPA 5I3HA 1W31A 4DEFA 3JRKA 4DPQA 3SGZA 5D2WA 2B4GA 1OFAA 5EBUA 4JTJA 3W74A 3KX6A 2O7QA 3LRMA 1F76A 4PL2A 1K03A 4JYFA 2GVGA 3G8RA 1GTHA 3FFSA 3LHVA 4MYXA 3S6DA 2ZZ3A 5F2MA 1VYPX 4LUJA 3G1FA 1GPWA 4AXKA 4LVGA 5EYWA 1OFEA 3O6CA 1XDLA 1F73A 3IRDA 1XBZA 3NQ8A 4WOQA 4E38A 1WBJA 1C8VA 1OK6A 2CZFA 2VELA 2V5LA 5HNRA 1TTQA 2B0MA 3KVLA 3QC3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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