4PUEA

Extracellulr xylanase from geobacillus stearothermophilus: e159q mutant, with xylotetraose in active site
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
371
structure length
371
Chain Sequence
KPHISALNAPQLDQRYKNEFTIGAAVEPYQLQNEKDVQMLKRHFNSIVAENVMKPISIQPEEGKFNFEQADRIVKFAKANGMDIRFHTLVWHSQVPQWFFLDKEGKPMVNETDPVKREQNKQLLLKRLETHIKTIVERYKDDIKYWDVVNQVVGDDGKLRNSPWYQIAGIDYIKVAFQAARKYGGDNIKLYMNDYNTEVEPKRTALYNLVKQLKEEGVPIDGIGHQSHIQIGWPSEAEIEKTINMFAALGLDNQITELDVSMYGWPPRAYPTYDAIPKQKFLDQAARYDRLFKLYEKLSDKISNVTFWGIADNHTWLDSRADVYYDANGNVVVDPNAPYAKVEKGKGKDAPFVFGPDYKVKPAYWAIIDHK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase
publication title Extracellulr Xylanase from Geobacillus stearothermophilus: E159Q mutant, with xylotetraose in active site.
rcsb
source organism Geobacillus stearothermophilus
total genus 148
structure length 371
sequence length 371
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2014-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4pueA00
1VENA 2XSAA 5A6SA 4UQDA 1VAHA 4PMQA 1UWRA 1JD9A 4HA3A 2RGLA 1GOKA 2NSXA 2GK1A 1LWJA 3GH4A 1EQPA 4QLLA 1PX8A 2G3MA 3TONA 1RP8A 1HJXA 3OZOA 1C3FA 1LQ0A 4BCEA 4M81A 4CCEA 3I3DA 4C7GA 3GBEA 2WVUA 2Z1KA 1MXDA 1EHAA 1H0GA 3AS3A 1GUVA 1NWUA 1GQJA 1JZ7A 4IM4A 2F8QA 4TX6A 2JEPA 3WNPA 1E6NA 4JFSA 1XSJA 2XVKA 2D23A 2WBKA 1K9DA 4KRTA 1V02E 5I0DA 1EDGA 3WF3A 4R5EA 4P8UA 4HOWA 1PPIA 2WMHA 4CD5A 3AS2A 3CHCA 4WKAA 1E15A 4JCLA 1HKJA 2OWXA 3LMYA 4M1RA 2J77A 3NYDA 1JFHA 3OGRA 3AHZA 2VQUA 3CMGA 3CUGA 1LWHA 1BYBA 4Q22A 1BAGA 1U2YA 4N42A 5DEZA 1E0WA 2J7EA 5M17A 2CPUA 2DQXA 5BXRA 2WKLA 1US2A 2YDRA 3WDJA 3F4VA 4W87A 1W9DM 3T0AA 3WEMA 5DMYA 3BMWA 3GZAA 1CNVA 1GCYA 2MANA 1UWIA 2QV4A 2WZIA 4F66A 4HOXA 4AY1A 1L0PA 1HT6A 2E8YA 2C8NA 1WZLA 4H7VA 2J62A 1EDTA 3U7BA 3VVGA 2XM2A 4HA1A 1LLOA 4ATDA 2GJPA 1JF6A 3WDIA 1E4NA 1OD8A 2YL9A 3WELA 2VR4A 4MNMA 4D1JA 1ODZA 3SUTA 5IDIA 3UR7A 1UWSA 3IJ9A 1H1NA 2EBNA 5IXEA 1H09A 4H41A 4A3HA 2W91A 4W5UA 3SCTA 3K8KA 3K46A 3SURA 4UNIA 2GDUA 3CHEA 3PZQA 1BQCA 4CU8A 3VKKA 5DT5A 4FF5A 1EQCA 1ZB5A 4W84A 3AHVA 2VO5A 4LYQA 2E9LA 2VL4A 2DDXA 5A6AA 1JL8A 2EO7A 3S2CA 1OCQA 2WMJA 4PUEA 1BF2A 4F9DA 1E4MM 3W81A 5FD0A 3WN6A 4JAWA 4IISA 3AMLA 5I24A 3NDYA 3WUGA 3WD4A 4HMDA 2EJ1A 1SMDA 1V0NA 4W7UA 1GNXA 1C90A 2GSJA 3UG5A 4V27A 4KGJA 3ZSTA 3GDBA 1UD6A 4CU7A 3N11A 1QNRA 3CZEA 4CCDA 1UH4A 3T09A 3T2OA 2BHUA 3TOPA 2X05A 1QI0A 4AZBA 2CETA 3B8SA 1W2PA 2BFGA 2ZXAA 1V6YA 4UFMA 1GW1A 3W0KA 3VIGA 1EDQA 2C0HA 5E6ZA 1FP8A 2J8FA 3ZR6A 1CGTA 2QLYA 2QMJA 5FOOA 4JIEA 2EPLX 1UD3A 5I6SA 5A8NA 2WCGA 2YOCA 4UZUA 2V3GA 1V03A 2CKRA 1MVYA 1VRXA 1PAMA 2W5FA 1R85A 3DHPA 4IPNB 2BY3A 1AQ0A 1KR1A 1TR1A 3M07A 4W8BA 1PIFA 4FLSA 1JZ6A 4X0NA 2OYMA 4GIAA 5ABFA 3QOMA 2YLLA 4XZWA 1E1EA 1QNPA 4BQ4A 1CXFA 1EO5A 3AFBA 2EPKX 1D3CA 1K6AA 1GOWA 1PEZA 1EH9A 3ZJ6A 3WF0A 4J3SA 2XTKA 1VBUA 4P7NA 3WDRA 4EANA 1B90A 1TCMA 4AISA 2WVVB 1QI3A 1V3JA 2RGMA 3MO4A 4JZ5A 1LL7A 5JBFA 3THDA 2YIHA 5E0FA 5CPTA 2D0HA 3L4UA 1SFSA 4N0RA 3CUHA 4M56A 2YJQA 3NJ3A 3WH9A 4ATLA 3RM8A 3SCVA 2VX4A 2E9MA 3WBAA 5E09A 4ATWA 4RE4A 5AC5A 1RPKA 3AIUA 5A69A 1O6IA 2WVVA 1V6XA 2VX6A 4PMDA 2ZICA 3CUIA 4W8AA 4LGXA 1WZKA 1UH3A 1DWFM 3VNZA 2DGAA 5C70A 5A6BD 1J0ZA 3KL5A 1GONA 1PX4A 1KWGA 1JXJA 4NRRA 3WNNA 1FP9A 5I3DA 3VMPA 4HMEA 2XYLA 5D8WA 2V3FA 2VCBA 1KB3A 1BG4A 3GTNA 4EKJA 2Y4SA 4XX6A 3ZMRA 1JF5A 3SEPA 3VDBA 3ALGA 1UR4A 3UR8A 6TAAA 3ZJKA 1L8NA 3AIWA 3WQ4A 2WBGA 3CZJA 4MDPA 4DUXA 3O9NA 4OZOA 1JDDA 1W91A 3HU7A 2WAGA 1WP6A 2VX5A 3B9DA 3IAQA 4JL1A 4Z2GA 1UWTA 3POCA 1QI2A 5DO8A 5I23A 4UFHA 4WSJA 4XV0A 2EQDA 5AY7A 4AD3A 1DWHM 2OSXA 1H3GA 2WC3A 2WMIA 1QVBA 1J0JA 4HMCA 2DSZA 1B1YA 2VUYA 2VX7A 4KRUA 1EHNA 5EBAA 1W1VA 1UKSA 4D6CA 4PMYA 4UFIA 4X0VA 5CLTA 1CTNA 2XWDA 4K68A 3AJ7A 2YL8A 5TD4A 5IFTA 2VNCA 2YKKA 5FL0A 1BYDA 9CGTA 1E4LA 3SUUA 3L2LA 3RM9A 1E6SM 3PZIA 4PMOA 1PIGA 2W61A 1QPKA 1YQ2A 1XSIA 1JNEA 1JI1A 3QHNA 4UCFA 3RCNA 1CYGA 4NI3A 3L4WA 4ZEPA 2GJXB 3AMCA 4RE2A 4XB3A 1UA7A 1IT0A 3IANA 1ZBCA 5A2AA 5E0CA 4WK9A 2GDVA 5GNXA 3OLIA 1OGSA 1EOKA 4PCTA 2OSWA 3VIJA 3VIOA 1FA2A 4FK9A 1XCWA 4CN1A 5ABHA 1AQHA 1UQYA 3RPMA 2WWDA 4MB4A 1AMYA 2D24A 4HZ7A 4B9YA 5A6LA 2V38A 2XUCA 3PTKA 1H11A 4Z2LA 3KEHA 2DT0A 5CZKA 1H0IA 3IK2A 2HISA 1W9UA 2ZIDA 2VRKA 2DSVA 1CIUA 1PBGA 3ARWA 2J75A 1HJWA 4CN6A 2YLAA 2DT1A 4PYSA 3WNMA 3WQVA 1NOUA 2WANA 1D7FA 3CO4A 2J7FA 2WHJA 4WKHA 3TTQA 3BCDA 4DWSB 3EBVA 1H2JA 1E40A 4UFKA 4L4OA 1G01A 3W82A 2DSUA 1U30A 1CECA 1ISVA 4OBRA 4MDOA 4WLCA 1W3JA 6CGTA 4GXPA 4HU8A 1U33A 3WL1A 1KGUA 1J9YA 2XIIA 3A4WA 4PMNA 3BAWA 2YA2A 4CUCA 4OKDA 4CN4A 4ACZB 1XGZA 1TA3B 1G5AA 2XFRA 3DECA 4V28A 2FHFA 8A3HA 4OOZA 1J0YA 5A2BA 3UG4A 2YDQA 1UKTA 1V0KA 1TZ7A 2E8ZA 1GHRA 3ARUA 4DM1A 4Z2JA 3FY1A 2A3BA 4BQ3A 1BFNA 4QDMA 4AZ6A 1JXKA 4B15A 2FDMA 4PN2A 2PWGA 1VFMA 4J3TA 3OIHA 4ACZA 4OBSA 3AIVA 3SCPA 2D3LA 1WZAA 5M3WA 4UOZA 2CEQA 2V3DA 4D6IA 3W25A 3U57A 1E6RA 4ZENA 1MQPA 2GK1B 3VDAA 3WEZA 2YDSA 3K4DA 1UR2A 5CQ1A 3GH5A 3I3BA 3W6MA 1Q6FA 4W93A 3PZMA 5A6KA 2A3HA 4D6JA 3NSNA 1M01A 1B2YA 1CGWA 1MW2A 3F5JA 1M7XA 4AZIA 1GJUA 3ARRA 3BH4A 3GXIA 4UQEA 1US3A 2JE8A 1C93A 2QPSA 1X6LA 3FXYA 4JFVA 2WVTA 2ESCA 3WENA 3DYPA 3OG2A 1MW3A 1J0KA 1NWTA 2XGBA 3M7SA 3MMUA 8CGTA 1CXEA 1JAEA 4MB3A 3WF2A 2G8ZA 1H41A 2XG9A 3ECQA 4QCFA 4BS0A 2VZUA 4A3YA 4F8XA 3WH6A 3SUVA 3AICA 1WE5A 3ZIZA 2YL5A 3RDKA 1W3LA 3VMOA 1PX3A 5M03A 3MUZ1 2PB1A 1XH1A 5CSYA 3UERA 2CHOA 1J10A 5DFAA 5CJ5A 2XWEA 1CEOA 1OGBA 3FHQA 4AZ7A 2J78A 3AZTA 3PZVA 1ESWA 4LYPA 1P6WA 1TVNA 4D6FA 4M80A 3ZJ7A 3RM4A 1HKMA 1BLIA 1QI5A 5EFFA 5I78A 4J27A 3ZT7A 4QFUA 3AZRA 5HOSA 1Z32X 5DT7A 5LA1A 1XHGA 2O9TA 5LA0A 3K8MA 2ZUWA 2XVNA 2BHZA 4BQ5A 5E9AA 3VGEA 3O2LA 3WY1A 1C8YA 1XCXA 2J7HA 2PC8A 4V2XA 3WD3A 1C92A 4GO9A 2D3NA 4W5ZA 3DHUA 2D0GA 4B3LA 1RH9A 1NARA 4NF7A 4PTWA 1W1TA 2O9PA 2ZX5A 3N12A 3NSMA 1E71M 3II1A 2TAAA 3QHOA 1DEDA 2FGZA 1H4PA 1WDPA 1G1YA 3CBWA 2BY1A 1KWKA 1JZ2A 2QF8A 4LX4A 2VJXA 4GI9A 1B0IA 2ZX9A 4UOQA 2OYLA 4UOJA 4URIA 3EYPA 4QLKA 1TE1A 4CD6A 3L4YA 1G0CA 4KH2A 3BAKA 2BVDA 3W38A 2IXUA 3MANA 3VGDA 2XVPA 4FLQA 1KR0A 5FL1A 3W4RA 3SCWA 2UWFA 2VR5A 3IJ7A 5JBEA 1UH2A 5D9OA 3AHYA 4AZGA 1K9TA 3OA5A 1ISZA 1VF8A 3A4AA 1UWUA 1E5JA 2FHBA 1FFRA 4HPHA 1UQZA 3UEQA 1IZJA 1ZBWA 1J0IA 5A8PA 1VBRA 2FGLA 1OIMA 1E70M 4D6HA 1BG9A 3AXXA 1GJWA 2FH8A 1AVAA 3PZOA 1BGGA 4H8VA 2WC7A 1JYNA 2ZX8A 4UTFA 2J47A 2J74A 4MB5A 5JIWA 2EPOA 2W62A 3ZM8A 6A3HA 1OBAA 4L4PA 4TX8A 2J7GA 2WMKA 5BYWA 5ABFB 3CZKA 4PTVA 1R8LA 2BVYA 2WK2A 4W88A 1EGZA 3APGA 3WDPP 3AIQA 3S6TA 3ARPA 3VNYA 4GZJA 2WHMA 4JKLA 3WUFA 3W28A 3BXWA 4HA4A 1JGIA 3FNDA 2ZWZA 1XD1A 3ZQ9A 1WDSA 3GYCA 1O7AA 1OWQA 4X9YA 1E1FA 1X1NA 1NWSA 2Y5EA 4PEEA 4JFWA 2VCCA 1UR0A 3OBAA 3W26A 1HJUA 3KZSA 2WLZA 2O9RA 1ZJAA 3WNLA 4MJ2A 4AIEA 4AD0A 4NZCA 4A4AA 1B3VA 1J18A 1NH6A 5KZ6A 2VT0A 1DP0A 1KGXA 1KQYA 1JAKA 1E72M 4BQ2A 1EA9C 4D72A 1OM0A 2VVSA 4JKMA 2VC9A 3BSGA 1H49A 4DUVA 1E4IA 1A3HA 2OYKA 3VOCA 3A4XA 2ZUNA 5JIPA 3WF1A 4EK7A 5IHRA 2ZUSA 7A3HA 3WDQA 4M24A 2VTFA 3AZSA 2HVMA 3NUKA 1CBGA 3JUGA 2IUZA 2WKGA 3OLDA 1V3HA 1V3MA 2UY4A 4TUFA 1V3LA 3BSHA 3AYSA 1JYWA 1VB9A 2WC4A 4XUYA 1TG7A 3VM7A 4CD8A 4FMVA 1CXIA 2W63A 4HOZA 3DC0A 3VDHA 4QAWA 1K9FA 3VIFA 4AZCA 2UY3A 1DTUA 4PCSA 3NCOA 1BYAA 2WHKA 2VRJA 1OT2A 1UZ4A 1TVPA 1WAWA 3HN3A 3PZTA 1KCKA 1QBAA 3SUSA 1GQLA 2WNWA 3RMEA 2XFFA 2WYSA 4CVWA 1Q6EA 1HJQA 2WMIB 2WHLA 2WMGA 3FAXA 3L4TA 2XPKA 1KFWA 2VZTA 1HNYA 3B9AA 4XZBA 4TVCA 4J28A 3CZGA 1EO7A 1VJSA 3G6LA 2G3IA 5E6YA 5C8BB 1QHPA 2Y24A 1GOQA 2C7FA 5BXTA 1C7SA 2PBGA 1E56A 1WB0A 1XH0A 4FLOA 3WUBA 3VD5A 5JUVA 3WD1A 4PRWA 5GQBA 2DPEA 1HL9A 1UD5A 3BLPX 3VDCA 4CU6A 1M03A 3QGVA 2ZX7A 2A3AA 3CUFA 3N13A 2AAAA 4AC1X 2BS9A 3AHTA 3ARSA 2VZSA 1EIBA 3TP4A 3ARVA 2EEXA 7CGTA 1J0HA 1RP9A 3VTRA 4UQCA 1HXJA 5CSUA 4MNKA 3CZ8A 1E6XM 4H8UA 1ISYA 3CH9A 2YBUA 2ZOXA 4U3AA 3DYOA 1UR1A 1GVYA 2WLYA 4H04A 2ZUTA 3T0BA 2X0YA 4TOQA 2QPUA 5BXSA 3TA9A 4RE3A 5LA2A 7TAAA 3L2MA 1CLVA 2JF6A 1QBBA 4U2YA 2XGIA 1DWAM 5C71A 1V3KA 2YL6A 4DWSD 5HPCA 4P7QA 1ITXA 1C7TA 1KGWA 2DSWA 4CCCA 1HL8A 4MJ4A 4MPKA 3MU7A 3W24A 1SMAA 5A6BA 1HKIA 1NQ6A 3RIKA 3UCQA 1OD0A 4Z2KA 1I1WA 3O6AA 4JHOA 2O92A 4GO8A 2UY5A 5JBDA 4GI8A 4W85A 4WJXA 3GNRA 1CZ1A 2BV9A 3GNOA 3AROA 3UG3A 3RO8A 3SIMA 3RJXA 3A3HA 3EMQA 1ZU8A 2FH6A 1UKPA 1TMQA 4FLRA 2ZXQA 2BXZA 2A3EA 2X09A 1E43A 2G3JA 3AIRA 3AMGA 2D0FA 5M5DA 2ZUVA 1HJSA 3AXIA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VEN A;  2XSA A;  5A6S A;  4UQD A;  1VAH A;  4PMQ A;  1UWR A;  1JD9 A;  4HA3 A;  2RGL A;  1GOK A;  2NSX A;  2GK1 A;  1LWJ A;  3GH4 A;  1EQP A;  4QLL A;  1PX8 A;  2G3M A;  3TON A;  1RP8 A;  1HJX A;  3OZO A;  1C3F A;  1LQ0 A;  4BCE A;  4M81 A;  4CCE A;  3I3D A;  4C7G A;  3GBE A;  2WVU A;  2Z1K A;  1MXD A;  1EHA A;  1H0G A;  3AS3 A;  1GUV A;  1NWU A;  1GQJ A;  1JZ7 A;  4IM4 A;  2F8Q A;  4TX6 A;  2JEP A;  3WNP A;  1E6N A;  4JFS A;  1XSJ A;  2XVK A;  2D23 A;  2WBK A;  1K9D A;  4KRT A;  1V02 E;  5I0D A;  1EDG A;  3WF3 A;  4R5E A;  4P8U A;  4HOW A;  1PPI A;  2WMH A;  4CD5 A;  3AS2 A;  3CHC A;  4WKA A;  1E15 A;  4JCL A;  1HKJ A;  2OWX A;  3LMY A;  4M1R A;  2J77 A;  3NYD A;  1JFH A;  3OGR A;  3AHZ A;  2VQU A;  3CMG A;  3CUG A;  1LWH A;  1BYB A;  4Q22 A;  1BAG A;  1U2Y A;  4N42 A;  5DEZ A;  1E0W A;  2J7E A;  5M17 A;  2CPU A;  2DQX A;  5BXR A;  2WKL A;  1US2 A;  2YDR A;  3WDJ A;  3F4V A;  4W87 A;  1W9D M;  3T0A A;  3WEM A;  5DMY A;  3BMW A;  3GZA A;  1CNV A;  1GCY A;  2MAN A;  1UWI A;  2QV4 A;  2WZI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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