4QLJA

Crystal structure of rice bglu1 e386g/y341a/q187a mutant complexed with cellotetraose
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDAGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTAVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITGNGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase 7
publication title Effects of active site cleft residues on oligosaccharide binding, hydrolysis, and glycosynthase activities of rice BGlu1 and its mutants
pubmed doi rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 195
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2014-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4qljA00
4OJYA 1GOKA 3CH9A 3PZTA 3VMNA 1HN1A 1OGBA 1V3IA 1KXVA 2A3HA 3W6MA 5I6SA 4S3JA 2ZICA 1O6IA 4QLJA 3BCDA 3WIJA 3AIWA 1GORA 3L4TA 3ZSTA 1LQ0A 1UQYA 3CHCA 3APGA 3WH6A 4UQCA 3IJ8A 2WCGA 1PIGA 4CCEA 2VZSA 4IISA 1V6XA 3AJ7A 1E4LA 1QHZA 4HPHA 1W91A 2VVSA 7A3HA 4TXEA 5BXSA 3RMEA 1H4PA 1UYQA 2Y24A 5CPQA 1XRVA 2B31A 1XV8A 1EDGA 1FHDA 4OKDA 1UD5A 3GH4A 4U3AA 4ACZB 2BXYA 4ACYA 3SCPA 1CLXA 1EO5A 5IHRA 3W0KA 3ARXA 1UR2A 3WKZA 1HIZA 2W67A 1BGAA 3T09A 3PZUA 4TX6A 1JI2A 3NDYA 3DYMA 1ZS2A 1WP6A 4FMVA 4OZOA 4FLRA 2J7GA 1H49A 2OYMA 3LMYA 3MUY1 4UOZA 3FAWA 5DMYA 2VL4A 4H04A 1CLVA 1TFVA 2WAGA 1PIFA 4W8LA 1AQ0A 3K8LA 2J25A 4L4PA 1ZJBA 1A47A 1XSIA 2GK1B 3VD9A 4CVWA 1V3HA 1PZ3A 3UEQA 3WDPP 5BRPA 4KWUA 4W5UA 4ZEPA 5HPCA 1OCQA 1PBGA 5I79A 4Z2IA 5ABFB 4TUFA 4PMNA 2JE8A 2XUCA 2BVDA 4URIA 3W53A 3MV11 5HBFA 2PWGA 1JAKA 3BAWA 3G6MA 3NSXA 2YKKA 2WLYA 3A4WA 3B8SA 5GNXA 4JFUA 1MFUA 4ZXLA 1CTNA 4BZYA 1GOQA 3OBAA 3M46A 2CPUA 2XGIA 2DSWA 1V3MA 3CTTA 1H5VA 2ZX8A 1QI4A 5F7UA 3L4ZA 1HJSA 5D9PA 2E40A 2VRJA 2WC4A 5DT5A 4UFJA 2ZOXA 1Q6FA 5FL1A 5CZKA 1MVYA 2A3EA 3HMCA 1CEOA 1B9ZA 2CBIA 2D22A 3CUJA 4YHEA 3BMVA 3VDAA 1JZ8A 1LWJA 3LPGA 3WEMA 1QW9A 2XG9A 3WF3A 4CU7A 2EPOA 4DUVA 4RE4A 5DT7A 2BY0A 1JDAA 3F5LA 1KWGA 3MANA 1OB0A 3WD2A 1LL7A 1H0GA 4DM1A 4WSKA 4W84A 1UR9A 1KCLA 3AIUA 2J47A 4AZCB 1GCYA 2WMIA 3EDEA 1D7FA 2WZEA 3ZM8A 4JIEA 2PF0A 3UR8A 1CWYA 1KBKA 4J3VA 2W62A 5A2BA 3AZRA 3K4DA 4OBSA 1UWUA 4MNKA 4A3HA 1LLOA 2WVTA 3ZT7A 3AS3A 1JZ3A 5E0FA 1TG7A 2XTKA 4DWSC 3BLPX 4BCEA 1MW1A 3K4AA 1HXJA 1CXHA 1YHTA 3OGSA 3UG5A 2CKRA 2D2OA 3BAKA 4MB4A 1MW0A 1H2JA 3SCWA 2J7BA 2XPKA 2WSPA 1DHKA 1AQHA 2A3BA 5A6BD 2YLLA 1V3KA 3SCUA 1HJXA 2V3GA 5FKYA 5BXRA 3IJ7A 2YDSA 3RPMA 3PZQA 3VNYA 3U5YA 1C93A 3WH7A 2CBVA 3WSUA 4F9JA 3AXXA 3L2LA 2Q8XA 2FHCA 5GNYA 3SUWA 1OT2A 3HU7A 1E6RA 5EFDA 1BYAA 3CZLA 2VX6A 1QHOA 5LA1A 3F5JA 1QI2A 2GFTA 3G6LA 4AZ6A 1LWHA 3CGTA 4P7QA 2QMKA 2DPEA 1E6SM 3TTQA 3KEHA 3AHXA 1JNEA 4PMXA 1EH9A 4N0RA 1UD6A 3L2MA 2QMJA 3AHYA 2XHYA 3RDKA 1UZ1A 1H1NA 2CNCA 3AI0A 4H41A 4D6JA 4RE3A 3CIVA 4JKKA 1NQ6A 4UFLA 3OLIA 4ML4A 4Z2KA 4AD3A 3BAXA 1CECA 4WKFA 1FH7A 2WC7A 4DUXA 4JZ5A 1GQIA 3NDZA 5JBEA 4UFHA 4PCSA 3KWXA 3ARYA 3MUIA 5DFAA 4WF7A 1HNYA 4JFSA 1EQCA 1V6UA 1NH6A 2CESA 5AY7A 2VMFA 3ARRA 3ARTA 2MANA 5A6MA 1PX4A 1AVAA 1AQMA 3ZJ8A 1UWRA 2G3IA 4LYQA 4W7WA 2WVUA 4Z2LA 2WXDM 3NYDA 1WE5A 3T2PA 3EYPA 4NRSA 2WWDA 2D24A 3MMWA 2EBNA 1WO2A 1CXIA 1EHAA 1W3HA 1SYTA 3PTKA 2WLZA 1C90A 3FN9A 4UQBA 5HOSA 4FLOA 3WF1A 3TONA 2VRQA 5D9NA 1CGWA 1NWTA 3WFLA 2DIEA 2YBUA 1XH1A 2J7EA 4H7VA 5ABEA 1XYFA 2GUYA 2VCCA 2HVMA 1V6VA 3DC0A 3VD5A 4NI3A 3WUBA 1V02E 4DWSD 2VX7A 2E0PA 4PTMA 3NUKA 3UETA 3WQ5A 2XWEA 4MAVA 1CXEA 1Q4NX 3AS1A 1HKKA 2DH3A 1B1YA 4LXFA 2CKSA 2CIPA 1QNPA 3CHFA 4GKLA 1CENA 5IDIA 5I2UA 4MDOA 3OA5A 2ZXQA 3VIPA 3IAQA 4J28A 4UOQA 3AYSA 4W89A 5JUVA 2YJQA 4KRUA 3WMCA 5FOOA 1KXHA 1HP4A 1SR0A 4P8VA 4DWSB 3B9DA 5GPRA 1GOMA 1US2A 1M01A 4LYRA 3SUVA 3GDBA 1BQCA 4ZFMA 3WF2A 3AOFA 5CSUA 3UG3A 4U2YA 3ZT6A 3IK2A 2ZUMA 2Y5EA 1R86A 2ESCA 4HU0A 5BYWA 3VILA 4UQEA 1J18A 1PPIA 3HN3A 4M29A 4E2OA 1R7OA 1UWSA 3DECA 1GVYA 4J3UA 4C7FA 5JBDA 1WZKA 1JI1A 1E4MM 3CHEA 4LX4A 5JIWA 1BVZA 3ZMRA 5A6LA 3TTSA 3FNDA 4PMOA 4MNLA 3VM7A 3VIIA 3N04A 3SUUA 3W82A 4HZ7A 4U31A 3OLDA 4D6DA 3M6DA 2JEPA 2OWXA 1IZKA 2DSZA 2EPNA 3BSHA 2JIEA 4KGJA 4W86A 4ACZA 2W63A 1JYNA 3KL3A 1V6WA 1SMAA 2WKLA 4F9DA 5EMYA 2J77A 4XX6A 1W9BM 1B2YA 3EBVA 4MNMA 2CEQA 2W66A 3N17A 3PZOA 1JG9A 3QOMA 3SCTA 2J75A 1JL8A 2Y2WA 1MQPA 2A3AA 4C7DA 4V28A 2Z1KA 5GQBA 1VFFA 1HF6A 1HKMA 4PYSA 2W5FA 1ODZA 3T2OA 2O92A 4LGXA 1RPKA 5CPSA 4JKMA 1ECEA 2WMFA 3S2CA 3W24A 1E72M 3AXIA 3CZEA 1J0YA 2GK1A 3A4AA 2WYSA 3AIEA 1J01A 1HJUA 4CU8A 3VMPA 5ABFA 2GJRA 1VFOA 2DT3A 2J7HA 1XC6A 4F8XA 3AZTA 1E9LA 3CUFA 4RL3A 4CD6A 1QNOA 3WUFA 5DO8A 4A4AA 3ARSA 2FH6A 2PBOA 5KEZA 1FHLA 1KR1A 4U5KA 4CN1A 2W92A 4AMCA 1JAEA 3WD1A 4YN5A 1J0ZA 1C8QA 4QLKA 3WNNA 1C92A 4MJ2A 3ZJ7A 2Z1SA 4D71A 1NWSA 1GJUA 1XSJA 4FLQA 2OSYA 5D4YA 3SIMA 2WNWA 2YDRA 2G8ZA 4AZBA 3PN8A 1C3FA 1W3JA 4TVDA 4IPNB 2BS9A 1PJ9A 2WMHA 2D0GA 2WBKA 1JFXA 1HT6A 1BFNA 4J27A 4U33A 4EKJA 2IXVA 1KR0A 1QHPA 2CETA 4AD1A 1RD6A 1K9DA 3AISA 1BYCA 1W2PA 3CUGA 3VIMA 1OGGA 2ZX5A 3VGHA 5A95A 1XCWA 4PSPA 3PHAA 4AZCA 4Z2HA 1VJSA 4B16A 4JCLA 1GONA 3L4XA 1W1PA 4K68A 4BQ4A 4BQ2A 1E6QM 4PMRA 6CGTA 4LPCA 4MJ4A 1JZ7A 4D6FA 3UG4A 5A1AA 3IAPA 1OT1A 3VMOA 2X2YA 3EDJA 2XVGA 5HNNA 1BPLB 1B3VA 1E0VA 1M7XA 4H8VA 5E0CA 1QI3A 4BF7A 1M53A 1ISXA 4H8HA 4AISA 3WELA 3OLGA 1UH4A 2PWEA 4UTFA 2FHBA 2QPUA 2YA2A 5CXPA 3D5HA 4PMDA 1BF2A 1HJWA 3N18A 4KH2A 1OIFA 4KRTA 1OBAA 1MXDA 2PWFA 1LL6A 4TTGA 3GTNA 5BROA 2YBTA 1W1TA 4D6CA 3AROA 1GW1A 4V2XA 3THCA 3SCQA 4XV0A 4P7RA 4PN2A 1A3HA 1E55A 1ZU8A 3CUIA 5FIPA 3VGFA 1XSKA 2XVLA 2YOCA 3VD3A 1EA9C 3MU7A 1SMDA 1UZ4A 4U2ZA 2JFEX 3UCQA 3ZOAA 1ISVA 1J0JA 3ZJ6A 1UD3A 5A3HA 1WDRA 1B31A 3EDDA 4D6HA 2DSVA 5I5RA 2ZX6A 1CZ1A 4PUDA 3POCA 1E4NA 1MFVA 1B3WA 1UKSA 2V3FA 1KQYA 1L0PA 3O2LA 2DGAA 5D8ZA 5A6BA 1XCXA 1EOMA 4WIWA 1BTCA 3A6OA 1XD0A 5AC5A 2VR5A 1B90A 1GVIA 2XYLA 4AWEA 2BXZA 1XHGA 3AHTA 4HOXA 4JKLA 2PI6A 3DHPA 3ZO9A 4W8BA 1GPFA 1GQKA 2W4XA 3CO4A 1C91A 4W88A 1G94A 1NOWA 3SUTA 3W29A 4JFWA 3KL5A 3GH5A 2GSJA 1JXKA 1UHVA 2YLAA 4AW7A 2X05A 1Z32X 2VUYA 4PSRA 1JDCA 1QBAA 3WENA 3GNPA 3WF4A 3ARZA 1HX0A 3RCNA 2JALA 1GQJA 3W81A 2ZUNA 1WPCA 2WW5A 2CBJA 4M81A 3AIRA 1PZ2A 4HP5A 3W38A 4V27A 4CU6A 2WSKA 2J8FA 3MSGA 2JF6A 5A8NA 4GXPA 4EANA 2WHJA 3QR3A 4AIOA 1V0MA 1JZ4A 4M24A 2CHOA 4HTYA 1DWHM 3WD4A 4D6GA 1E6ZA 2ZXDA 2V5DA 2EO7A 1GOIA 1MW3A 5IFPA 3WEOA 2WHMA 2PC8A 2PBGA 2EPMX 1EOKA 2WMJA 1ITXA 3MUAA 3T2QA 4PTWA 2OYKA 3MMUA 4PBGA 3FAXA 4CD8A 3RJYA 1ITCA 4J3XA 2QLYA 3N13A 1NOFA 3WMBA 1VFUA 2ZWYA 1Y7VA 1UD8A 3VGDA 4OOUA 1IT0A 3VDBA 1H0IA 4GPNA 5LYRA 1GOOA 4ZE4A 2E4TA 4P7NA 1KFWA 3BH4A 2UY5A 2X8RA 3N11A 4EE9A 1PAMA 4PMVA 1WDQA 1C7SA 3F5KA 1V3JA 3FW6A 1JDDA 4AZIA 2XWDA 1JD7A 2J79A 1U30A 2V3EA 6TAAA 4P7OA 4OIFA 4W87A 4CUCA 4ATLA 3QHMA 1UWTA 4AZ5A 5CPTA 3AXHA 3AHVA 3NIYA 1WB0A 2DT2A 3ARPA 3WH8A 4PEEA 5HXMA 3AMGA 3W37A 1UKQA 1V6YA 3TOPA 1JXJA 4BQ3A 3MMDA 4DWSA 4CD4A 1XH0A 3GNRA 3OG2A 5EBAA 3SCOA 2VZUA 1VEMA 4WK9A 1E40A 5E6ZA 1BVNP 1HL8A 5BRQA 2A3CA 4BA0A 3GH7A 4IM4A 2VC9A 1B3YA 2C8NA 2YDQA 3B9EA 3ZQ9A 3POHA 3N9KA 4PTXA 3VX1A 1VENA 3FHAA 1XD1A 4M56A 4WJXA 4PMZA 3OLEA 1E6NA 5FCZA 3RILA 3WDHA 2OSXA 3THDA 1QNQA 1VBUA 3WNKA 1WZLA 4HA3A 1UWIA 3AMKA 4MAZA 3ECQA 2FGZA 4J7RA 2ZIDA 1VRXA 4KGLA 1BHGA 2X1IA 5D9OA 4XZBA 2Y8KA 3WNPA 1UR0A 2ZXAA 3GXIA 3GXMA 1LG2A 5A2CA 1E71M 1SFSA 3M07A 3DYPA 4U5IA 4P7LA 3TA9A 3W26A 4WLCA 1CXLA 4J3SA 2C0HA 1E0WA 1X6LA 4Q22A 4OBRA 5I24A 2EQDA 3KZSA 2IXUA 2E3ZA 1WZAA 3CZKA 2J7FA 4A3YA 1X1NA 5LA0A 3WNOA 1NP2A 3TTYA 3VGEA 5I0DA 4HMEA 1WDSA 1J0IA 2O9OA 3K46A 5C8BB 5FL0A 4B15A 3LPOA 3WDIA 3BLKA 3WL0A 1OIMA 1JZ2A 1CNVA 3AS0A 3J7HA 1LF1A 1O7AA 2YIHA 4WSJA 1JIBA 3ZT5A 1BG9A 2WVSA 3ARWA 3GM8A 4TTUA 1Q6GA 3CZGA 1G5AA 1BLIA 2EXOA 2ZUVA 3S6TA 1W2VA 3WNLA 4KMQA 2TAAA 2CBUA 3VGBA 4FK9A 2XSAA 2WPGA 1OD0A 4NF7A 2XFYA 4AXNA 1MQQA 3QGVA 4ZE5A 2VOTA 3VIHA 3LPPA 1TA3B 3WUGA 2NSXA 1KWKA 1BYBA 1CYGA 3WBEA 2RGLA 4JL2A 1MXGA 4GI9A 2WWCA 1UH3A 4J3WA 3WQWA 2ZX9A 3K8KA 2F61A 2WZHA 1VF8A 4MPKA 4AIEA 1VEOA 4IPLA 1OGSA 4AEEA 4UNIA 4MB1A 1JF6A 5A8PA 5E70A 1OD8A 5A69A 1HP5A 5CLWA 3CUHA 4W7VA 2XVNA 2PWDA 3AICA 1DEDA 2FHFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4OJY A;  1GOK A;  3CH9 A;  3PZT A;  3VMN A;  1HN1 A;  1OGB A;  1V3I A;  1KXV A;  2A3H A;  3W6M A;  5I6S A;  4S3J A;  2ZIC A;  1O6I A;  4QLJ A;  3BCD A;  3WIJ A;  3AIW A;  1GOR A;  3L4T A;  3ZST A;  1LQ0 A;  1UQY A;  3CHC A;  3APG A;  3WH6 A;  4UQC A;  3IJ8 A;  2WCG A;  1PIG A;  4CCE A;  2VZS A;  4IIS A;  1V6X A;  3AJ7 A;  1E4L A;  1QHZ A;  4HPH A;  1W91 A;  2VVS A;  7A3H A;  4TXE A;  5BXS A;  3RME A;  1H4P A;  1UYQ A;  2Y24 A;  5CPQ A;  1XRV A;  2B31 A;  1XV8 A;  1EDG A;  1FHD A;  4OKD A;  1UD5 A;  3GH4 A;  4U3A A;  4ACZ B;  2BXY A;  4ACY A;  3SCP A;  1CLX A;  1EO5 A;  5IHR A;  3W0K A;  3ARX A;  1UR2 A;  3WKZ A;  1HIZ A;  2W67 A;  1BGA A;  3T09 A;  3PZU A;  4TX6 A;  1JI2 A;  3NDY A;  3DYM A;  1ZS2 A;  1WP6 A;  4FMV A;  4OZO A;  4FLR A;  2J7G A;  1H49 A;  2OYM A;  3LMY A;  3MUY 1;  4UOZ A;  3FAW A;  5DMY A;  2VL4 A;  4H04 A;  1CLV A;  1TFV A;  2WAG A;  1PIF A;  4W8L A;  1AQ0 A;  3K8L A;  2J25 A;  4L4P A;  1ZJB A;  1A47 A;  1XSI A;  2GK1 B;  3VD9 A;  4CVW A;  1V3H A;  1PZ3 A;  3UEQ A;  3WDP P; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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