4TR9A

Ternary co-crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase from plasmodium falciparum in complex with trap and a small molecule inhibitor
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
EYMNAPKKLPADVAEELATTAQKLVQAGKGILAADESTQTIKKRFDNIKLENTIENRASYRDLLFGTKGLGKFISGAILFEETLFQKNEAGVPMVNLLHNENIIPGIKVDKGLVNIPCTDEEKSTQGLDGLAERCKEYYKAGARFAKWRTVLVIDTAKGKPTDLSIHETAWGLARYASICQQNRLVPIVEPEILADGPHSIEVCAVVTQKVLSCVFKALQENGVLLEGALLKPNMVTAGYECTAKTTTQDVGFLTVRTLRRTVPPALPGVVFLSGGQSEEEASVNLNSINALGPHPWALTFSYGRALQASVLNTWQGKKENVAKAREVLLQRAEANSLATYGKYKGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inhibition by stabilization: targeting the Plasmodium falciparum aldolase-TRAP complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Plasmodium falciparum
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
total genus 125
structure length 347
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2014-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4tr9A00
3TFCA 4UTWC 1QPQA 1W31A 1FQ0A 1Q3NA 1P4CA 4O53A 2YYUA 5DCDA 5HWJA 2GQ8A 1ME7A 4K7VA 1NFBA 1XM3A 3SIZA 3GVGA 3LTYA 3F4WA 1OFAA 2TYSA 2V2CA 2C6QA 3UWZA 1KM0A 4X3ZA 4N9DA 3I7SA 1W37A 1R46A 5D2WA 2Z1BA 4RXGA 4N4PA 4A2RA 1A53A 2X1SA 4NJJA 3IVUA 3W1PA 3A22A 3BW4A 5EKYA 4I7WA 1G67A 3F4NA 3L9CA 1LRTA 1FCVA 3DGRA 3F03K 3C2EA 3LV5A 4GNJA 1GJPA 4ML9A 3PM6A 1TRIA 3M6YA 2V81A 1L6WA 2R14A 2B7PA 2O7SA 2Y85A 3INPA 4WZHA 4I7VA 3WJXA 1B4KA 3LHYA 2VFHA 3TJLA 1FXPA 4O57A 3S0CA 4WUIA 5CPLA 3DFOA 4PCFA 3TDFA 1D3HA 1ZAIA 5AHFA 2PRMA 2Q3RA 3KAOA 3W1UA 1JCJA 3L67A 4K36A 1SW3A 4JDBA 5C5YA 2FDSA 1KFCA 1VYPX 1YXDA 1BWKA 5C54A 1SFJA 2ZRVA 2FQIA 3EX3A 1KFKA 2E1DA 3TROA 1GG1A 4JIPA 3P74A 1QMLA 1GPWA 2HSAA 3MP5A 1LM1A 4AWSA 4IX2A 5D30A 3LM7A 3QYQA 4M19A 3STGA 3R2GA 4FIRA 4H3DA 2HS8A 3DHDA 3QM3A 1L6YA 1W5OA 2DZTA 1HFBA 3S6DA 4AH7A 1O95A 3W7NA 2NUXA 3RLVA 2QDGA 3S1UA 3W84A 1QPRA 1VC4A 2X30A 1W3NA 3C2FA 3UXAA 4NXSA 6TIMA 2C3ZA 2A7NA 4Y90A 4Z1CA 1IF2A 4BWLA 4IUOA 4N6FA 1DVJA 5I3KA 1FDYA 3P60A 2OT1A 4RCXA 1LORA 1WA3A 5CSSA 4A29A 4RV8A 2R91A 2WNZA 3UXDA 5CZ0A 1PHWA 1H1YA 1OFBA 1VCGA 4HT3A 2NXIA 4MLRA 2QUUA 3S1XA 3UD6A 3MYOA 3TE9A 3TH6A 3W22A 1MSSA 3NNTA 3W76A 3L0GA 5DY3A 2Y88A 1I2RA 1RQBA 3LDVA 4GJ1A 5E93A 1PHQA 3BK0A 3VKJA 2BZNA 4M7SA 4K8EA 1M7PA 2EF9A 3NQ2A 4GRSA 4QQ3A 3W23A 3W7RA 5HWMA 4UTKA 5EBUA 4ZZ9A 3HG4A 3NQGA 5KZEA 4O54A 4LVGA 3N9RA 4QITA 2V0TA 1W5PA 1EEPA 4UCGA 3OVPA 3I7RA 3NGJA 3G1XA 3KX6A 2GVLA 3LRLA 1KM1A 1DHPA 4K6AA 1ZFJA 4K38A 3U2OA 2NLIA 3G1AA 1LP6A 3C0JA 4MKNA 1XI3A 1YTDA 2Y7GA 3CIWA 2ZRYA 3LRKA 3OBKA 5K9XA 1LOSA 4KFOA 3PY2A 1DQXA 4DBDA 3NAVA 3CEPA 1PS9A 1XC4A 2DZXA 4PA8A 2WPBA 4HNTA 5ABTA 1YTKA 1H63A 4MZ8A 1WYIA 1I4NA 1SUXA 1ZALA 1AK5A 3PAJA 1FWSA 3W70A 2WV8A 1P0NA 1AL7A 3S1WA 1NAL1 3GNNA 1SZGA 4UTMA 2QCMA 3PF3A 1H60A 2PURA 2QCLA 4X22A 1F6KA 1LBFA 3W2JA 5DY2A 4ZQMA 3W07A 2WQPA 2YDAA 4GXMA 3TUUA 4FX6M 1FCBA 3HG3A 1VHNA 1VYRA 2GQ9A 3ZWSA 3W7HA 2FPVA 4RLIA 1TTJA 3GDTA 5BW6A 1WAUA 3A24A 2QUTA 3NQ8A 1VLWA 1Q6RA 1WXJA 3M5ZA 3GDMA 3G1HA 4JD4A 2ZFAA 1NF7A 3P62A 3LI1A 4OU1A 1KFLA 1LOQA 2FPTA 4M6VA 1KW1A 1G4PA 3SFKA 5BMXA 3W7JA 2FIQA 1AMKA 2B7OA 1TQXA 3DU0A 3EWZA 3B05A 2V5LA 2I9EA 3W2MA 4O14A 3PUEA 4O17A 1B3OA 5F2LA 3HO8A 2YFNA 5HQEA 1OYAA 2OT0A 3WJWA 2C13A 3NVTA 5HULA 1GOXA 1EWEA 2AQWA 2DZUA 3LX9A 3W1RA 1TO3A 3M43A 3TX9A 3O6CA 1G7VA 1ZY9A 2BX7A 5L6UA 1DQWA 3KVJA 1W8SA 3TFXA 3TA6A 4IMEA 5I3FA 3DAQA 2QCDB 5FEWA 1JRCA 5G4EA 5C6MA 4RZ6A 5AC6A 4LS1A 5HR7A 5HUPA 1NEYA 1UASA 1UJPA 2ABBA 3BGJA 3LB0A 1HUVA 2YXGA 2QEZA 4JYFA 2VELA 1F05A 3L5LA 3LBMA 5DXYA 3G0XA 3Q58A 3L0KA 3CHVA 3VE7A 1W54A 1SW0A 1Q6QA 1X6UA 4HKPA 2FB2A 1KV5A 3OA3A 1BTMA 1LZOA 5CG7A 3LCIA 2WJZA 3ELFA 5D05A 5KSWA 3BLFA 3PUDA 3TC6A 3BPWA 3PSWA 1W3TA 2GQAA 3GXPA 4P61A 1VR6A 3SSJA 4CCCA 5F1VA 4AF0A 4WX2A 2V2DA 1H51A 3BARA 3MJYA 1TCDA 2ZTKA 1NVMA 1TREA 2E6YA 3ABOA 1TJRA 2TPSA 4C1KA 3BVJA 4ZL1A 3IRDA 2XN1A 3L65A 3SGUA 1W0MA 1GVOA 1IXQA 1X1ZA 3P82A 1P0KA 1ZAHA 4R53A 4PEKA 2YCEA 5D2TA 4BK9A 1AG1O 2X1RA 4MLJA 1JULA 4Y8FA 1CI1A 1VCVA 3NPUA 4U4MA 3VNDA 4EIVA 3LLDA 3LXBA 3PVFA 3GK0A 3PULA 3TR2A 4XTIA 2V30A 1FX6A 5I3JA 3S5ZA 1KTBA 3SZ8A 4AXKA 3E49A 3M41A 1LCOA 3S9YA 3N2MA 1JCNA 3NEVA 1FDJA 1GG0A 4GUIA 3EEGA 4K8HA 3LCFA 1B4EA 2NUYA 4N6EA 2I14A 4AWTA 4MUZA 1R2RA 4O8RA 1K8ZA 4WXZA 4E38A 6ALDA 5TBOA 3CB8A 2Z6IA 2ABAA 4O15A 5FESA 5LNRA 3KVMA 3RMJA 3M16A 5DLCA 1K8YA 4CQ8A 4UNLA 1S5VA 5HMSA 2RHGA 3A9IA 2DZWA 3GYEA 3NA8A 3U8GA 1DJQA 1FCUA 1FWRA 3R5EA 5LGXA 2GUUA 5G2IA 4JIQA 1QNVA 1VHCA 1OYBA 1DL3A 3HJZA 1XBYA 4AMAA 2QCDA 1J4EA 4ICNA 4WY0A 1ZHAA 2V9DA 4AVFA 2GVGA 4UXDA 3HF3A 4UFHA 2GOUA 3DFPA 4EVZA 1H50A 2JKPA 4UMAA 1OFPA 5EPDA 5KZMA 3RFAA 3N2XA 2B7QA 1O5KA 3HG5A 3O1NA 3HGOA 3NDOA 3EB2A 2CU0A 4H4IA 2C0AA 1YDOA 5DELA 1K7FA 1F5ZA 2ATSA 3THAA 3LHWA 3G24A 5HUOA 3P61A 1IGSA 4DF0A 1JQVA 5A5WA 1VZWA 2QUVA 5T26A 4NXKA 3FKKA 1R2TA 3C8FA 2CLLA 2Y7DA 1R30A 2C19A 3HGJA 5G4WA 1EIXA 2NX3A 4UFMA 1TSIA 1LOLA 5AYXA 2XFWA 4JTKA 3MI2A 1U5JA 2VFDA 3TCEA 1PE1A 2I1OA 4CLMA 1Z48A 1LBLA 3BV4A 5AOUA 1TPWA 1LTDA 1OK6A 4XBKA 3BLEA 3WK1A 4LVDA 3NZRA 2Q3OA 4MY8A 2DJXA 3G0UA 5DCBA 2QR6A 1O94A 1XL9A 2V82A 1JJKA 3MO7A 4AAJA 1JCLA 2QJGA 4PL2A 2OZ0A 3DHFA 4UFKA 1OK4A 5K4ZA 1TIMA 4L4LA 1LBMA 1H7PA 2R8WA 4BWLC 2FB3A 5D38A 1J2WA 4M5PA 4O1DA 4P2VA 1KFJA 2E5BA 1K7EA 2BXVA 1KM3A 3LV6A 3W7MA 1TYGA 2QKFA 2C15A 5D03A 1K03A 3PBWA 2FJKA 4O1BA 2J27A 5D04C 5K9DA 4DEFA 3HMJG 2NXGA 1SR9A 1FCQA 4HNNA 1ZENA 4ORIA 2CZEA 1AL8A 3IV3A 3G3MA 3BG5A 4PH6A 4IMFA 3DI1A 5AYZA 4Z1DA 3KRUA 3VI2A 1C29A 3WFAA 3L2IA 3NL6A 3DZ1A 1FY6A 2UV8G 1EUNA 4UFLA 4FNQA 1H7RA 4O50A 4N9CA 1OVDA 2VEMA 4POCA 2Y61A 5AB3A 3MHGA 4LRTA 3I6RA 1EPXA 1GTEA 1X7FA 3M47A 1OX4A 2NX1A 4S2BA 5LNUA 1OABA 5G1YA 2JGYA 2FFCA 3W85A 1KM2A 2GPTA 2YGYA 3HBLA 4IXHA 3VCRA 1KFBA 4HSOA 2O7QA 1ALDA 2E5CA 4UFJA 5CGQA 3W2UA 4XQ6A 1GTHA 2G5WA 3RF9A 1OFRA 2ZZ5A 2P10A 2XN2A 3EXTA 1VS1A 2A5HA 2VEKA 3MYPA 2VFEA 5FF0A 1OX6A 3MHUA 3LLFA 1UUOA 4UUIA 4QSHA 1A5BA 2P0OA 2CZDA 1ZAJA 4Z0SA 3TMQA 3G1VA 5KMYA 4IOTA 3LRMA 2A21A 3B0UX 1JCYA 5F4XA 1FUYA 1Y0EA 1A50A 4JTIA 3DFQA 4LC6A 3R13A 1OX5A 3MMTA 3EWBX 1VQTA 4LRSA 3QPZA 3RLUA 1YDNA 3C4UA 3GXTA 5HWNA 4RR4A 2ZZ6A 1NSJA 3W6YA 2ZZ7A 3L68A 3QZEA 1WOAA 4MFEA 4JX4A 4O52A 5LNWA 2VFIA 2DZVA 4FNUA 4Y6GA 4ADSA 1VPXA 2QAPA 2E09A 3FKRA 4D2JA 1UCWA 2YX0A 4EF9A 1N8FA 5F2GA 3O06A 1LYXA 4GBUA 4EF8A 4YLWA 1YPFA 5KZDA 3BLIA 3E0IA 3SI9A 4WOZA 4QISA 3L0NA 5TQLA 2BSLA 3R8RA 1SO5A 1WQ5A 4ZQOA 3W7KA 1OYCA 3NXFA 3C2VA 3GKFA 4A2SA 2EPHA 5IBXA 4BFAA 2AAMA 1SFLA 5DXXA 4N2YA 3U6WA 1K8XA 3BG3A 1G4TA 5I3GA 1O4UA 4OBTA 1Z41A 3MP4A 4GUGA 5CPOA 5LKYA 1M6JA 2A4AA 2JGQA 1QO2A 1X8FA 3DFNA 4FX7A 4QAIA 3CTLA 3IIXA 3R89A 3CIXA 5J5RA 3B03A 1YLVA 4TMCA 5U7SA 3WJZA 2A0NA 3P80A 4I9AA 4LW7A 3ZS4A 2YZRA 3S8HA 3HB9A 5GVJA 3NM3A 2YR1A 4KWWA 1KM6A 4R34A 2A85A 5D37A 1F7BA 1K7XA 4NJHA 5D32A 3W1AA 2QF7A 3HPXA 4M6PA 2RFGA 1F76A 2CW6A 1THFD 2CLEA 2Y63A 3KVLA 2ZRZA 2JKEA 3NPWA 2NUWA 2J9YA 2X2GA 3PB2A 2DZPA 4E0CA 4MFDA 3ZWTA 1TTQA 3GDRA 4K7YA 3UWYA 4UTJA 3O07A 5K4XA 3NZ1A 3B4UA 1XUUA 4QIUA 4AF0B 3MHFA 3T7VA 5G2HA 3L21A 1GWJA 2CZ5A 3KOFA 2VENA 4YCPA 2E6FA 1VRDA 2YPIA 1TB3A 3LCWA 4NNCA 3TAOA 3FOKA 3NQDA 4IGHA 2NWSA 3T4CA 1D3GA 2IQTA 2J6XA 4XUGA 2E6DA 2H6RA 3UWVA 4NNAA 3IEBA 4IPIA 3VE9A 4QNEA 1VLIA 3G0SA 1QOPA 3C2RA 1QPNA 3STFA 3EX1A 3OG3A 3P81A 2V8ZA 2DORA 4BF9A 1C8VA 3G8RA 4G1KA 1RQEA 3PBVA 1S5TA 5I3HA 1LLZA 4XWUA 1OFDA 2WNQA 3QF0A 4O12A 3CU2A 4QJ1A 3C56A 3W1QA 3MI6A 3TW7A 3A23A 2PE4A 2YW3A 4N4QA 4UC5A 4H6KA 3TC7A 4UTUA 3FEMA 1JRBA 4JX6A 3ATYA 4R7JA 3N34A 3SY5A 1QCWA 3KRSA 2B7NA 4JEQA 3C52A 3P67A 5EYWA 4DO6A 2CLKA 4JTSA 3Q94A 1XDMA 3M9YA 4K37A 5F4WA 4NX0A 3QW3A 2Y7EA 2J88A 2X1TA 3H54A 1RQHA 2FTPA 3LHZA 4GUJA 3S1VA 3JRKA 3LI0A 4O1AA 3WK0A 1KLZA 1ME8A 4HNVA 3QFEA 1KM4A 4AHQA 2Y89A 1QR7A 2BWGA 3CC1A 4WY0B 4GUHA 1JUKA 2DZSA 3FIGA 1F74A 2EHHA 3CLMA 4JN6A 2E68A 2Y62A 4NX5A 3TU9A 1FXQA 3DFSA 1TRDA 5CKSA 1RPXA 3GAYA 3N3MA 3SECA 1EP2A 2WNNA 3W7GA 3GLCA 4BI6A 4LVFA 1S5WA 1FBAA 4NT0A 4IXXA 4LTSA 3W1MA 1H61A 1Z44A 1I8JA 1IXNA 4JICA 3STEA 4Z08A 2FLIA 1I2PA 1VCFA 3UWUA 4YWIA 2PRLA 2QCFA 2ZQ0A 1DBTA 5LHFA 1QWGA 4Z0JA 4LT9A 4Q33A 3MW7A 1HL2A 4QM1A 4Y9AA 3HPZA 3QH2A 2NX9A 3TQKA 3OVQA 3W7DA 3PR2A 5LHEA 1W5NA 5AC8A 2ZA2A 1MXSA 2C14A 2E77A 2NV2A 3C2OA 2C16A 2ZDRA 3OEXA 3SJ3A 5FF7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1EB3 A;  1GVR A;  5BRB A;  1OFE A;  1W3I A;  1EUA A;  4ZQR A;  3JR2 A;  2GJL A;  5AN7 A;  1XFB A;  3WJS A;  2HS6 A;  4FXS A;  2J24 A;  2ZZ1 A;  2VOM A;  1JVN A;  1SZF A;  3TSM A;  3W73 A;  3LXA A;  4JTT A;  2H3D A;  5KIN A;  1KM5 A;  2PRH A;  3F1Q A;  1EP3 A;  1OJX A;  1PVN A;  4CQA A;  3PG8 A;  3LOT A;  2F84 A;  4TR9 A;  4RXF A;  3B0V C;  3V75 A;  2V2H A;  3MI3 A;  3NQV A;  3TKF A;  1PCW A;  3DBP A;  3EWW A;  1N7K A;  2CWN A;  4K39 A;  4AHP A;  3W88 A;  4FIQ A;  5CZS A;  2X1U A;  3GZ3 A;  4WY0 F;  1OF8 A;  3Q37 A;  3ABS A;  3AO0 A;  2JKA A;  2R94 A;  4NJK A;  3TXV A;  4TIM A;  1YXC A;  1KFE A;  3QRH A;  1EWD A;  4HN4 A;  1MEI A;  4IMG A;  5K9C A;  2HTM A;  2WSQ A;  5BNK A;  4W9T A;  3W83 A;  1G4S A;  3ZR4 A;  1YYA A;  3LHT A;  2A1Y A;  4ZQP A;  2NZL A;  2OMA A;  4ZMG A;  2DU2 A;  4O4V A;  1I2Q A;  3NQC A;  4LVB A;  1LLW A;  4A22 A;  5CSR A;  2Z2U A;  1TPD A;  4Q32 A;  3EWU A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZM8 A;  4UTW C;  1QPQ A;  1W31 A;  1TZ9 A;  1Q3N A;  2ZUM A;  1UR0 A;  1Q65 A;  4DWS D;  2GSE A;  1R38 A;  2OXN A;  2NQL A;  4XKM A;  4H9U A;  4AD0 A;  4N9D A;  2NVC A;  3I7S A;  4GY1 A;  2Z1B A;  4N4P A;  1CPU A;  2VO5 A;  4AIU A;  3IVU A;  3A22 A;  1MRQ A;  4I7W A;  2G3N A;  5KET A;  3L9C A;  3DGR A;  3F03 K;  5A2B A;  4GNJ A;  3ABX A;  4ML9 A;  1K9F A;  3NGF A;  2W5F A;  1L8P A;  2GSH A;  3LPG A;  4HB7 A;  2DT0 A;  1UJQ A;  2FGL A;  3SCU A;  4AC1 X;  1UR4 A;  5LYR A;  4I7V A;  1B4K A;  3LHY A;  1V6Y A;  2VFH A;  4MF4 A;  3TJL A;  4FF5 A;  4TOQ A;  4F2U A;  1QOX A;  4FAL A;  3TDF A;  3TYB A;  1ZAI A;  1EC8 A;  4WHB A;  4C5Y A;  2XGB A;  4U3C A;  1W2P A;  2BVW A;  3L67 A;  1OT1 A;  3VUS A;  1VYP X;  1YXD A;  3V4B A;  4W5U A;  1QNS A;  2O4M A;  3STP A;  2E1D A;  3TRO A;  4PMR A;  3P74 A;  3WCZ A;  2DT3 A;  2PBG A;  3AZR A;  1S5M A;  3RR4 A;  4EAM A;  3WQ5 A;  1NQ6 A;  1ISX A;  4FMV A;  1ITQ A;  5LXX A;  2HS8 A;  4GGH A;  2E9L A;  2J47 A;  1L6Y A;  4AH7 A;  3UJF A;  1BVW A;  4Y9O A;  4JEJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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