4TR9A

Ternary co-crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase from plasmodium falciparum in complex with trap and a small molecule inhibitor
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
EYMNAPKKLPADVAEELATTAQKLVQAGKGILAADESTQTIKKRFDNIKLENTIENRASYRDLLFGTKGLGKFISGAILFEETLFQKNEAGVPMVNLLHNENIIPGIKVDKGLVNIPCTDEEKSTQGLDGLAERCKEYYKAGARFAKWRTVLVIDTAKGKPTDLSIHETAWGLARYASICQQNRLVPIVEPEILADGPHSIEVCAVVTQKVLSCVFKALQENGVLLEGALLKPNMVTAGYECTAKTTTQDVGFLTVRTLRRTVPPALPGVVFLSGGQSEEEASVNLNSINALGPHPWALTFSYGRALQASVLNTWQGKKENVAKAREVLLQRAEANSLATYGKYKGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Inhibition by stabilization: targeting the Plasmodium falciparum aldolase-TRAP complex.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 125
structure length 347
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2014-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4tr9A00
4LU0A 5LNWA 3GAKA 2H8XA 3MHUA 4IXHA 1SUXA 5DLCA 1T0OA 4NJGA 1B3OA 3L66A 5K2ZA 3E49A 3LGEA 5C55A 1M5WA 4FHAA 4JDYA 3B8DA 1SPQA 4WY0A 3MI2A 3KX6A 3P62A 4N2YA 3W1AA 4N02A 4JX5A 1AL8A 2VXNA 4RR4A 3HB9A 1TV8A 3H54A 5F1VA 1S5WA 3MW7A 1H1YA 2G96A 5LKYA 3STCA 2ZZ5A 2E1DA 4LC8A 5AHMA 1ZJIA 4EIVA 5C2XA 4AWUA 1NVMA 1B57A 2ATSA 3I7SA 3GR7A 4CQ9A 3U6WA 3MYPA 3USBA 2J24A 2YSWA 1PHWA 3P81A 5H2ZA 1YDVA 5CZSA 2C19A 3CEPA 3MP4A 4BF9A 2NV1A 2RH9A 3KXQA 1XBZA 4EF9A 2WO5A 4UTWC 2HS6A 1ME9A 3S8HA 3TSMA 4Z1DA 1SZEA 3DFPA 2DZSA 2E77A 3KVLA 4H6KA 3TROA 1S5VA 1L6SA 1YXYA 4JXCA 3LCWA 3QMTA 5A8GA 4JIQA 1IIGA 1OFPA 3SY5A 2QJHA 3TSDA 3SFKA 2Z0IA 3HPSA 4UFLA 5G4WA 2Y7FA 5F4XA 1XFBA 4LWWA 1JCYA 1K8XA 1VCVA 4TU1A 1W56A 4OHQA 4WJEA 1SU5A 4NUWA 1OFQA 3B05A 1VGAA 2E09A 3HGSA 3MHFA 4M5PA 4NJJA 2GVLA 2WNZA 1KM6A 4UFHA 5HWNA 3W7HA 3L65A 2PRMA 1KFBA 1B9BA 4LS2A 5F2MA 2X16A 1F7BA 2BWGA 3TW6A 3PUOA 2R94A 3G1AA 5C54A 1D3HA 2YGYA 3QW4B 3DU0A 3PM6A 3TU9A 1LOSA 1F6KA 2QUUA 1WDWA 4UTHA 5K4XA 5HR6A 3G1SA 3CHVA 4LW7A 3T7VA 1E51A 3OEXA 4LVAA 2V8ZA 5D2YA 3NEVA 3W1PA 3W22A 2Y7DA 1YADA 3G1HA 2TMDA 3AJXA 1ZCOA 4O8RA 3C2VA 1YTKA 4ALDA 1VR6A 3LHTA 2FQIA 3SECA 3LDVA 4N9BA 4GC4A 3LLDA 4XKYB 5AYZA 3BPWA 3QPZA 3P67A 1VYPX 4NQ1A 3KRZA 1PIIA 4GUFA 4PL2A 1EWDA 4Z08A 3W7NA 1RZMA 4BR1A 3TMLA 3LCHA 1FBAA 5D05A 2EHHA 3W74A 4UNLA 1AG1O 1XM3A 2D73A 1KM5A 1SQ7A 1W5QA 1RR2A 2QAPA 4UTWA 2ZQ0A 1EB3A 4O54A 2PC4A 5I3HA 1LCOA 3TC7A 1H1ZA 1SZFA 5DELA 2WPBA 5AFDA 1JCLA 3SSJA 1UB3A 1KLZA 1QFEA 5F4WA 3W70A 5BNKA 1G7UA 3BG5A 1YDOA 4WQ6A 4GUJA 3V75A 4K37A 4MKNA 3O15A 4O15A 3NM3A 1YPFA 2XN1A 2BSLA 2J88A 3CLMA 4WY0F 1JR1A 2JK2A 2TYSA 1C9DA 1TPC1 4OWGA 5F2IA 5G5IA 4YCOA 2ZFAA 3HQ1A 1UBSA 4LOCA 4TMBA 3C52A 2OJPA 1Q6QA 3N9SA 3OIXA 1LDCA 5F2LA 1H7PA 3S1VA 4NZJA 5D04C 3IVSA 2QKFA 3M5VA 5IBXC 5EMUA 3CIWA 2TRSA 4FF7A 1S3HA 1JCMP 1JUKA 3LHVA 4IMGA 2NLIA 3LHZA 1F74A 3BLFA 4LVGA 3TXVA 1TO3A 4HPXA 4WOQA 1FXPA 3JR2A 4K7VA 3O6CA 2V9DA 5D09A 2JKAA 3VE7A 2P1FA 4OV4A 1K02A 1TRIA 4Y96A 3IV3A 4GE8A 1OFOA 3QEZA 4JTEA 4O1CA 4UCGA 5D30A 3QPYA 2Y7EA 3TSBA 1FCQA 3GX9A 1QWGA 4WXZA 3W2MA 1PCKA 3L0GA 5E1QA 1MEHA 3DENA 3UY7A 4DBEA 2FJKA 4A22A 1OABA 3GR8A 1SW7A 4E2DA 5HWJA 4IJBA 4BI7A 3G0SA 5T26A 3L5AA 2VFHA 3IIXA 3G1VA 3OVRA 5HNRA 1H7OA 3EX2A 1H50A 2FB3A 3S5YA 3KFTA 2WQPA 1MEWA 4JDBA 5DCDA 2QCEA 3G3MA 3TAKA 1KV5A 4GXMA 4PL1A 4PODA 2FPYA 2A4AA 2YCEA 1NEYA 1AW5A 3HIJA 3NQDA 4AWTA 3MI6A 3MP5A 3UWQA 4JTHA 2GVJA 1OFBA 1I2QA 2EKCA 3NL5A 3CT7A 4O14A 4RCXA 3HPZA 3VFLA 1TPVA 1W5NA 3PUEA 4M6PA 3ZWTA 1ML1A 2QUVA 3TFCA 4MJMA 3M0ZA 5FF3A 2RDTA 3ZR4A 3LTSA 3LHUA 1S5TA 1I45A 4IMEA 1OX5A 3R89A 4IOTA 1TV7A 2CLMA 3G1DA 3TA6A 3HGJA 1XDLA 3W7EA 1FCBA 5DBTA 2BXVA 1TTQA 3STEA 5D37A 1HO4A 5HUPA 2UV8G 2YFOA 3KVMA 4FNTA 1B4KA 2ISVA 3CM4A 3G3DA 2I14A 4ZMGA 3UY8A 1VRDA 4DEFA 3QZEA 5EY5A 1R2SA 2Y85A 1JVNA 5DBUA 4NXSA 1XKYA 4MLRA 1TIMA 4AMAA 2LLEA 4A2RA 3L2IA 2B0MA 4U28A 2ZZ2A 3EXSA 4JTLA 1L2UA 2IQTA 4ADSA 2OT0A 3PBYA 1FWWA 5BMXA 4DO6A 1TYGA 2VOMA 3Q37A 4X2RA 3TJXA 3VKJA 3SW6A 1ZAHA 2QCMA 5G2HA 1OJXA 3PB0A 1EUNA 5IBXA 4IPIA 4UMAA 3PB2A 1UUMA 2QEZA 4S2BA 3B0UX 3LRKA 1ZNNA 1GVRA 1GQNA 4O19A 3UZ5A 1MEIA 3EWBX 3HGRA 1YTEA 2VEIA 4AF0A 3W7KA 2PURA 2OMAA 3A5FA 1EX5A 4JN6A 3WJZA 4Z0SA 4JYFA 1BKSA 2NUYA 3N2XA 4AVFA 4TIMA 2ZZ4A 1Z42A 3NQFA 2ZRYA 5CGQA 1AK5A 3I7RA 2YFNA 2WJZA 4DF2A 1GYLA 3FLUA 1W0MA 4RLIA 1VYSX 5AC8A 2A7RA 4WXYA 5U7SA 5HJLA 1O60A 1UASA 3PVFA 2QJIA 4O1AA 4BI5A 4MJZA 2PRHA 5FF7A 5D2WA 3W87A 4HSNA 4N4QA 1T8XA 5DY3A 1W3IA 2I9EA 3OA3A 1XC4A 2QR6A 3NNTA 4JX6A 3O6YX 1RD5A 3MP3A 4UFKA 5DCBA 2VEMA 1M7OA 3L5MA 1TSIA 2CLOA 5AHEA 3TKFA 3W23A 1GVQA 3M5XA 4JR5A 3T44A 4Y6GA 5LNRA 4AAJA 4QITA 4FXRA 2OT1A 1G4EA 3PUDA 2ZZ6A 4S1FA 1A50A 4NZFA 3TAOA 3LI1A 1GOXA 1JJKA 1TPWA 4CCCA 2E5BA 1EWEA 2HS8A 4LV9A 1CI1A 4UFIA 2F7FA 1Z48A 4C1KA 2Y7GA 2NV2A 3IGUA 4A3UA 4TMCA 3BARA 3DFSA 3V1PA 4AEOA 2QCLA 2Y6ZA 1SW3A 2R8WA 3C8FA 1LRQA 3O07A 4HT3A 3HG4A 2ZZ3A 3PAJA 3BG9A 1K7EA 2PRLA 2X30A 4QAIA 1A53A 4ZQMA 2ZTJA 1FX6A 1U5JA 3W88A 1I2RA 5TQLA 4FB7A 3NO5A 2X1TA 5HQEA 2BTMA 5CPOA 2V2DA 1RPXA 4GRSA 1ICSA 3RNDA 2DZPA 4IMCA 4JEQA 2VKZG 1SR9A 1DOSA 3W7IA 1G7VA 3W1QA 4UTIA 1DORA 1OFDA 3FEMA 3W7GA 1WYIA 1PCWA 3NPWA 5I3IA 2VFIA 1TPEA 1XUZA 4NJKA 4K8HA 2RDUA 5HUOA 2JGYA 3BVJA 3PC0A 4GUIA 1VJIA 3LHWA 4RXFA 3A9IA 1WQ5A 4M6QA 5CPLA 2YW4A 3VI2A 1K03A 3E12A 4OE7A 3M1ZA 1GG1A 4NNBA 6ALDA 1OVDA 4TR9A 3W7JA 4AHOA 4BFAA 1OHLA 3A23A 2YR1A 2C0AA 3GLCA 5LZLA 2CLEA 3M16A 3CU2A 5ABTA 4AB4A 2XFWA 3M44A 4O57A 4N9DA 4OBTA 7TIMA 2G95A 5BMWA 2C15A 1W54A 5DY2A 2A6NA 4HPJA 1VC4A 2CZEA 3C0JA 5HINA 3W9ZA 4WX2A 4AH7A 1KBIA 4DBDA 5LGXA 4HSOA 3CB8A 2V5LA 3TQKA 2HTMA 2QCHA 3PF3A 3HGOA 1O5XA 4XTIA 4UTTC 5FEPA 2YXGA 3ATZA 1G67A 3LCLA 2DU2A 3UWVA 2C1HA 1OX4A 1QO5A 1KFJA 4MVAA 3CC1A 2Z1BA 3W76A 4MY8A 4O4VA 2QDHA 3GNDA 4O11A 1ME7A 2FPVA 2ZZ7A 3NAVA 3W73A 5BOOA 1FWRA 3ABOA 5I3JA 4JYEA 3NXFA 3TK7A 2GPTA 1W5PA 3R12A 5EKYA 4NXKA 3NQMA 2DJXA 4O53A 2CZ5A 1XL9A 3S0CA 3LXAA 4KFOA 3PSWA 4JGDA 1EUAA 5E0KA 1QOQA 4YMZA 2ZA3A 4ZQOA 5AYYA 2W0UA 3P7YA 4AXKA 4JTSA 1SW0A 1GZGA 3W6YA 3OBKA 4NT0A 3W2JA 1I2NA 4CQAA 2Z2UA 4UUIA 4MZYA 3M5ZA 5FESA 1KM0A 3BO9A 3Q58A 3W1LA 4K7YA 3FKKA 2YDAA 1FDZA 3GYEA 3EXRA 1MZHA 2P0OA 2E68A 3S1WA 4M7SA 2B7PA 2Z6JA 2VELA 2FIQA 4N6EA 1THFD 2ABAA 3W1XA 1SO5A 4JIPA 2QCFA 4OGZA 2GJNA 1WOAA 3GKFA 4IGHA 2RFGA 3G8EA 4MY1A 3CIXA 4O10A 5KITA 2C14A 3QFEA 5FEZA 3NQ8A 4UR7A 1J2WA 3GDRA 3P84A 4P61A 3L5LA 4UTUA 2J9ZA 2V82A 3MO7A 3M41A 3R5EA 3T40A 3D0CA 1ZHAA 2CLFA 2H8ZA 4HNVA 1OYCA 4FNRA 2CLIA 3L67A 3O6DA 4XTDA 4MOZA 1TPUA 3EWYA 3DFTA 4DQWA 4O52A 4NX5A 3FA5A 3A21A 5FF0A 4DO4A 3HOJA 4UIOA 2GJLA 3W7OA 1JCXA 3OHIA 1GG0A 4LV4A 2TSYA 4HNUA 4FNSA 4KWWA 4XBKA 4QIUA 1F5ZA 1IXNA 1VZWA 4DPQA 4C1LA 4AHQA 4H3DA 4JS3A 3ZFHA 1OG0A 1KBJA 3MWAA 4G1KA 4UTTA 5KSWA 4QQ3A 3LTYA 1YYAA 4PTNA 5KINA 3RF9A 3VE9A 3NPVA 4LNYA 2AGKA 3ZS4A 4PEKA 1VQTA 5U4NA 4DO5A 1LOQA 1Z41A 2YZRA 4UTKA 3W7LA 1QDSA 3LCIA 2DZUA 4TO8A 3N34A 1H51A 2FB2A 1QO2A 1QNVA 1XI3A 6TIMA 5D2XA 3W2NA 1QOPA 3UWUA 3FS2A 2RHGA 3TR2A 1R2TA 3QRHA 3TXZA 5F1UA 1K3UA 3SGUA 4NNCA 1ZALA 2V2HA 4K36A 4N9CA 1MO0A 3F4WA 3HG5A 3LB0A 1KA9F 2GVGA 1TJPA 3P5ZA 4RV8A 1TPDA 4K8EA 1X8FA 1FDJA 5D2TA 2ZTKA 1VCGA 1X1ZA 3N73A 1CW2A 3FIGA 2ZRZA 2CWNA 1H7WA 3LRMA 2A0NA 4DPPA 4K38A 5DN1A 1KM3A 2GQ8A 4LVDA 3TW7A 3MI3A 4I7UA 1B4EA 3NPUA 3F4NA 4Y8FA 1AW2A 1PVNA 1DVJA 1OF8A 1SZNA 1KFKA 4AHPA 1BTMA 3LV5A 1DJNA 1NF7A 2DZTA 2CZDA 3LI0A 3UWWA 4JYDA 3WK2A 3N2MA 3FJ6A 1ADOA 4WZHA 4CNPA 2J6XA 4X3ZA 1W3TA 3GVGA 2FFCA 2CLHA 1LRNA 5FF4A 4LUJA 3KOFA 3G0UA 4FIRA 1F73A 4EF8A 2E6YA 5J5RA 1H62A 1VCFA 5CSRA 5CG7A 1P0NA 3NQVA 3W2LA 3GXTA 2VFFA 1X1OA 1LORA 4GBUA 4K39A 3TQ0A 4IPJA 4YWIA 2E6FA 3DXIA 4QJ1A 1Q45A 1JQVA 3A5VA 1O94A 4IMDA 4XKYA 3W1MA 2DZVA 2VFDA 1F05A 3A24A 3HJZA 3O05A 1TPFA 4RXGA 4O13A 3W7MA 3CWNA 1WA3A 5LHEA 3O63A 3AO0A 5F4SA 2Q8LA 4YLWA 5J5DA 3S5OA 3LXBA 3VCRA 1ALDA 4DF1A 1BEUA 2ISWA 3EX4A 3W7CA 4LRTA 4LVBA 3W7DA 4O12A 5DXYA 1X6UA 4CNNA 1JRCA 4NX0A 3GIYA 3HF3A 3TNOA 1VHCA 2WV8A 2R91A 3MYOA 4YL2A 3G1XA 5G1YA 2PE4A 1DV7A 1W5OA 1W1ZA 2Z6IA 3W7QA 5AB3A 1G69A 1O95A 3UD6A 5LNUA 5FEXA 2Y63A 3DKJA 4PH6A 3I65A 3P82A 4XUGA 1KV8A 3QYQA 5H91A 1P0KA 1W5MA 3I7QA 2DP3A 3BLIA 3BW2A 2H6RA 4P2VA 2E6AA 4NJHA 1HG3A 5CKSA 4YCPA 4PFMA 3LV6A 4B5NA 2NX9A 2EAWA 1ICPA 1I8JA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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