4U5K | Genus

Total Genus 113

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	113
sequence length	306
structure length	304
Chain Sequence	PKAVDPFEMVRKMGMGTNLGNTLEAPYEGSWSKSAMEYYFDDFKAAGYKNVRIPVRWDNHTMRTYPYTIDKAFLDRVEQVVDWSLSRGFVTIINSHHDDWIKEDYNGNIERFEKIWEQIAERFKNKSENLLFEIMNEPFGNITDEQIDDMNSRILKIIRKTNPTRIVIIGGGYWNSYNTLVNIKIPDDPYLIGTFHYYDPYEFTHKWRGTWGTQEDMDTVVRVFDFVKSWSDRNNIPVYFGAFAVMAYADRTSRVKWYDFISDAALERGFACSVWDNGVFGDNDMAIYNRDTRTFDTEILNALF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Endoglucanase H
publication title	Biochemical Characterization and Structural Analysis of a Bifunctional Cellulase/Xylanase from Clostridium thermocellum pubmed doi rcsb
source organism	Clostridium thermocellum atcc 27405
total genus	113
structure length	304
sequence length	306
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2014-07-25

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4u5kA00

1ODZA 2E8YA 3NSNA 1BVNP 1UR0A 1HKIA 3LPOA 1KXHA 1CLVA 1DWAM 4KRTA 2G8ZA 2JFEX 2DH3A 3MSDA 1LLOA 1GORA 3SCVA 3F5JA 3WNKA 1HVXA 4M1RA 4W7WA 3VX1A 2E8ZA 3PZ9A 1E6XM 1TG7A 4PMRA 3WF1A 4Q7NA 4U2ZA 3VDBA 3A4XA 3PZQA 4P7RA 2DT2A 1VAHA 2NT1A 4PN2A 3RCNA 2YLLA 2ZX8A 7A3HA 1PAMA 1VBUA 5EB8A 5AYBA 4PSPA 4AMCA 4JAWA 3K8KA 1R7OA 1MXDA 2WLZA 1UOKA 2PBOA 1QI4A 1VFFA 4ACYA 3BAKA 3WMBA 5A3HA 2XFRA 3AIVA 1ISZA 3DYMA 4MB4A 3VGEA 3BLPX 3VU2A 4D6EA 4CCDA 4GQRA 2V3FA 5M3WA 4TOQA 1B3XA 1V0LA 1OGSA 2Y24A 3WMCA 2J25A 3ZOAA 1MFVA 1XD1A 3LMYA 1SR0A 2X2YA 3AXXA 2ZIDA 1WB0A 1JF6A 3WUFA 4U3AA 2GFTA 3BAWA 3K46A 1QBBA 3AROA 3SCNA 4AWEA 2HISA 3B8SA 1XRVA 3FHQA 1O7AA 3OA5A 3B9DA 1B1YA 1V0KA 1XHGA 4QP0A 1PX3A 1E1EA 1UH4A 2X8RA 1MXGA 4AZIA 4V27A 1CNVA 3CHDA 4NSBA 3BAJA 3PTMA 2VZUA 5D8WA 3SUWA 2QF8A 3TOPA 1HX0A 4B15A 4QLJA 2F8QA 3T09A 2UY2A 2VI0A 1U2YA 1E6PA 3OLIA 4HZ8A 3ZR5A 3W38A 1GNXA 1ZBKA 2BY3A 4TTGA 5A8MA 2ZICA 4LGXA 3T08A 3MU7A 4XX6A 3MV01 2UY4A 3EDFA 4QLKA 1W9VA 4CCCA 3N17A 4KGLA 3SUSA 2WNWA 4V2XA 1D2KA 4AEFA 1E6NA 3EDKA 2DSUA 2YL8A 1UWTA 2DT0A 2Y4SA 4OUEA 1UD3A 2D20A 4D72A 5I23A 4D6FA 2VX6A 1V3KA 1ZU8A 3OGSA 3WD1A 2VZVA 1LG2A 1W9DM 5DFAA 2GVYA 4PUDA 4B3LA 3QHNA 2XTKA 1FFRA 3VVGA 4PUEA 2VVNA 1B3VA 5BXPA 4M29A 1ESWA 2WMKA 2DSVA 4TX6A 1CXFA 3I3BA 4CD6A 1ZB5A 3SCRA 1UD8A 5I24A 4X9YA 3ZO9A 3WSUA 3K8MA 3MUIA 1JD9A 1OB0A 1UWIA 5CLWA 2W66A 2FHFA 2A3EA 5GNYA 4CN6A 1OD0A 5DO8A 2FGZA 2PBGA 2VZSA 4D6DA 4WLCA 1C92A 4UFJA 2J7FA 1E4MM 4PMUA 1O6IA 4BA0A 3VGBA 4JKMA 1BPLB 2PB1A 3AMLA 4V28A 4GI9A 5JIPA 1VIWA 2PWGA 4W5UA 3AMGA 3WDRA 3FHAA 1ISVA 4Y7EA 1KR1A 4CCEA 1UKQA 4AIUA 1UR1A 4PMNA 5BROA 3GH7A 1FH8A 4YHGA 2EBNA 1JZ5A 4Z2JA 4WK9A 1NARA 1GOOA 1E3XA 4CD8A 4HA4A 1W3JA 3WQVA 1HL8A 3AIEA 2CBVA 1VB9A 3VIPA 1WO2A 3RMEA 1WKYA 4MAVA 4W85A 1LL7A 2OSWA 3UCQA 4MNMA 2VC9A 1HP4A 4HZ6A 3MO4A 1WDQA 4P8UA 4EKJA 4D6HA 1J0KA 2GJRA 5CZKA 1CPUA 1K9FA 1G5AA 4GINA 2ZX9A 3VIOA 4JHOA 1UZ1A 2O9RA 1UR9A 3VD3A 2W91A 2Z1KA 5E6ZA 5A6LA 2FH6A 3NSMA 3BMWA 2BVDA 3WEMA 4Z2IA 1GPFA 3W4RA 3TTYA 5DMYA 3DECA 1QNPA 2D22A 3AFBA 2DIEA 3ZJKA 2CBIA 1Y7VA 1TA3B 1K6AA 1XYZA 2VT0A 2ZE0A 1VFUA 3MANA 3AZSA 4J3UA 2TAAA 1IV8A 4TVDA 1QI0A 1E6RA 1OM0A 1CDGA 1QI2A 2WZIA 5BYWA 4IM4A 5CLTA 2WB5A 2ZXBA 2WM0A 1HKJA 2VRKA 4DM1A 5I6SA 3F4VA 1KCKA 1R7AA 1CBGA 2WHLA 4HZ7A 1JFXA 1XH1A 4W93A 5ABGA 3CHFA 1E73M 1GOWA 3DC0A 4HU8A 2WCGA 2WBKA 1E3ZA 1G0CA 3GM8A 1TE1A 4KGJA 2WMJA 5GQBA 3OGRA 5ABEA 2A3BA 2YOCA 3CPUA 3K4DA 1E1FA 1H4PA 1EDQA 5TD4A 2IUZA 3RJYA 4CN4A 4QLLA 3CZLA 2CKRA 3AIRA 3VIMA 2CHOA 1CGXA 1FP8A 1PJ9A 3LPPA 1ZBCA 1GVYA 1JD7A 3ALGA 3W81A 2XFFA 1X6LA 3WBEA 4MJ4A 4FF5A 2RGMA 1UH2A 4U33A 4BCEA 1KFWA 3VGHA 3CZGA 4HOZA 2WMHA 1MW2A 1XSJA 2CBUA 4W5ZA 1E0VA 1XH0A 4WKHA 1NWRA 3WNNA 2RGLA 3WDHA 2G41A 3PZNA 1UR2A 1PIGA 5FOOA 1JDDA 1KWGA 1B9ZA 1ITXA 3T0DA 3VO0A 2CPUA 3AMKA 3OB8A 4L4OA 2WXDM 1SMAA 3AS1A 3M6DA 2ZWYA 2WHMA 2CESA 2EPNA 4W7VA 1WE5A 4B9YA 2BXZA 2OYMA 3VIIA 1QHOA 3EDDA 2J7BA 1C3FA 3AXIA 3CZKA 4NF7A 2BNJA 3UG5A 2YA1A 1WPCA 2OWXA 3GBEA 1EOMA 2J4GA 3HN3A 1B90A 2OLHA 3EYPA 4TXEA 1GOIA 5A6JA 3N1AA 2GK1B 3POCA 4QDMA 4IPLA 1HP5A 3A3HA 3UETA 4DWSD 2WMFA 2ZUUA 4OBRA 3ZT7A 4AZGA 4TTUA 2OWWA 2Y8VA 3BH4A 3OGVA 4JKKA 5M03A 2CHNA 4RE4A 4QCFA 5A94A 2WHJA 3CO4A 3DYOA 1OGGA 3G6MA 3BCDA 4QCEA 3AHYA 2W4XA 2VMFA 3TTOA 4UFIA 5E0CA 1BGAA 5D4YA 1DWHM 1UKPA 4A3HA 1V6VA 2BY1A 5A8OA 1NP2A 3CIVA 5F7UA 3UR7A 2QPUA 3JUGA 1WDRA 1UR8A 3THCA 1ZL1A 4CGTA 4E2OA 3PZIA 1EHAA 4AD1A 4NZCA 1EQCA 1C90A 5A1AA 5ABHA 2J47A 3FN9A 3IK2A 3WBAA 2J7CA 5I78A 2VUYA 2ZOXA 2C8NA 2FHBA 5CPQA 2MANA 2HVMA 2WSKA 3IJ9A 5CQ1A 5JBEA 4PYSA 2PF0A 4P7LA 2CNCA 3RM4A 1PEZA 3VDHA 2ZUSA 1W32A 4C7DA 2WC7A 1Q6DA 2WKGA 4CUCA 1I75A 4UFKA 1JI1A 1W91A 2XVNA 5DF0A 3AISA 4UFLA 2E9MA 1UA7A 2GSJA 3WDJA 1C8XA 3GDBA 1E43A 1FHLA 1X6NA 2VVSA 1KXVA 4B3KA 3MMWA 2X1IA 4PEEA 1OBAA 4AD0A 1AVAA 5AC4A 2IXUA 4J27A 1JZ2A 4DWSB 1GVIA 3WEOA 1UWSA 3PN8A 4KH2A 1LJYA 3RIKA 2E40A 1E70M 1GHRA 5DT7A 4UQAA 1WZMA 4YPJA 8CGTA 1E4LA 1MFUA 2A3CA 3N15A 1UWQA 4EANA 3CTTA 1XCWA 5A6BD 4W86A 3WH6A 4UQ9A 1ZJBA 2G3NA 1MYRA 1RP9A 1KWKA 4AIOA 4M56A 1JGIA 3CMGA 1M7XA 3U5UA 3WQ5A 3W82A 3ZR6A 1VBRA 3L4VA 2DIJA 1UUQA 4LPCA 3A47A 1BAGA 4RL3A 2F61A 2V3DA 3OZOA 2XWEA 2YL6A 3TTQA 4HPHA 4PTWA 3QR3A 2WVSA 5EFDA 2A3AA 2V3GA 1HJSA 1TVPA 4XUYA 1OT1A 3S6TA 4PTXA 3W37A 4P7QA 4X0NA 3VGDA 1QOXA 1IZKA 1E55A 3WEZA 2E4TA 2QPSA 3DHUA 4WF7A 5ECUA 1DWGM 4TX8A 5IHSA 3AIBA 3IJ7A 1SMDA 4JFTA 4TVUA 5BXSA 4ZXLA 1JI2A 1D7FA 4XZWA 5D9OA 1OIMA 3BAIA 4AZHA 4E8DA 1TUXA 2EPOA 4AD2A 4HMCA 3L4ZA 3L4WA 1ISWA 4LYPA 3HJEA 4HU0A 5IDIA 1US3A 2X0HA 1LWJA 1CZ1A 5E9AA 3WDIA 5CSUA 1QVBA 1B2YA 3BLKA 1DWJM 4J28A 5BXRA 1C91A 3SCPA 1PZ3A 3CZJA 4LYRA 3OIHA 4EK7A 3VIKA 1HNYA 1UHVA 4Z2KA 1TA3A 4MB5A 2EPMX 5BXTA 4JHZA 1RP8A 4MTVA 1UWRA 2OSYA 4UTFA 4XB3A 2XUCA 4UZSA 1ISYA 4URIA 4AZCB 1UQYA 1V3JA 4AZBA 4KWUA 3NDZA 3MMUA 2WMGA 3RPMA 3TP4A 3M07A 5A2CA 1G94A 4PMZA 4D1IA 1MW3A 4PMQA 2WCAA 3RDKA 1CXEA 3ARWA 1OT2A 1HL9A 2VJXA 1Q6FA 2DH2A 2VRJA 1LL6A 4JFUA 1HF6A 2YA2A 4F66A 1L8NA 2JALA 1H0IA 2VQTA 2CITA 1OWQA 1MW1A 3VILA 1J12A 1JXKA 4UQEA 3M46A 3OZPA 3SCTA 1VEPA 3VD5A 4H8HA 2WKLA 1ZBWA 3AHTA 5I2UA 2QMJA 2EPKX 2WPGA 3O9NA 4HPGA 3VD7A 1NOFA 1EO5A 1WZAA 2XVKA 3OLGA 4M80A 1KGWA 1RH9A 3TA9A 1Q4NX 1EH9A 3N18A 4OKDA 2JE8A 4BQ4A 1CYGA 1BHGA 3FXYA 1DWFM 5E09A 1B31A 1GOMA 3LPGA 3WH5A 2PI6A 2QHAA 5I3DA 2D2OA 6CGTA 4Z2HA 1ZS2A 4L4PA 2J78A 5BWFA 2D1ZA 1BTCA 4DM2A 5HDRA 1J0IA 2VR4A 1MQPA 4GZEA 4Z2LA 1I1WA 1V02A 2ZUWA 1E15A 4JCLA 3L4TA 3AYSA 4DUWA 1C8YA 2VX5A 1NOWA 1JNEA 2V5CA 1NWSA 2YL9A 4GZIA 5I0DA 1MVYA 1H1NA 4IUGA 3L4UA 5LA1A 3WQ4A 1EGZA 1Q6EA 4KMQA 4AC1X 1XD0A 3GXFA 1HKMA 3ARPA 2YA0A 1EOKA 5BRPA 1FP9A 2GK1A 4DWSC 1VFMA 3VKKA 4MNKA 4CVUA 4UQDA 4PMYA 1NH6A 4W7UA 3KWXA 3AICA 1BYBA 1GZJA 1H49A 3E1F1 3W27A 4DUXA 3WNOA 1J18A 3B9AA 3ARVA 5C70A 2J74A 2WVVB 3KE0A 3W0KA 1W9XA 2ZXQA 1W3HA 1WDSA 1VJSA 5FIPA 1B3YA 1QNSA 1BSIA 3ARTA 4UR9A 1PX8A 4AD4A 4S3KA 1V3MA 4H41A 1MQQA 4CU7A 4GI6A 2WCSA 1W3KA 3WNPA 4MADA 2WW5A 3T2QA 5D9MA 1DP0A 4HMDA 2YLAA 3WF4A 1AQMA 4MDPA 2EEXA 2D23A 2AOSA 1JZ3A 1KQYA 1CGWA 3THDA 4A4AA 3W53A 2JIEA 2WMIB 4M8UA 1V6UA 4M24A 1CGTA 1JZ6A 4GPNA 3CUHA 4OOZA 4CKQA 3WD0A 1OGBA 3VMPA 1UG6A 1VEMA 2D0HA 4GI8A 2A3HA 1HN1A 2YBUA 4W8BA 5AY7A 5A6SA 2YDSA 3MMDA 2DPEA 4P7NA 1HKKA 2CCRA 2UY5A 1WDPA 3W24A 2ESCA 3CMJA 3L2LA 2C7FA 3AOFA 2J8GA 1IT0A 3AIUA 4JFSA 3N9KA 1JZ8A 3A4AA 3SUTA 1CECA 1OINA 3VGFA 3DYPA 3AYRA 1BF2A 2EPLX 3UG4A 1JZ7A 4GXPA 4PCTA 1E40A 6A3HA 1JYVA 1CEOA 3EDEA 4ATWA 4CVWA 4JFWA 3AI0A 1E6ZA 4DWSA 1E6QM 3NCOA 3MKKA 1B0IA 1DWIM 1E4IA 3WMSA 1KXTA 4PMVA 3W28A 1CGYA 4KRUA 1C93A 3AMCA 2WYSA 3GNOA 1UD5A 1KXQA 1XCXA 1FH9A 3AMDA 3K8LA 3NSXA 1WZKA 3UERA 1WZLA 4JFVA 3MV11 3WY1A 1C8QA 4LXFA 4GO8A 3OBAA 2FHCA 2CBJA 1K9TA 4MB1A 1UKSA 5GPRA 2E9LA 3VMNA 2JEPA 3ARSA 1OCQA 3WF2A 1SYTA 2ZUNA 1TFVA 4CD5A 1J11A 1W2PA 1CXIA 3OLDA 2AAAA 5AC5A 2VNCA 1KB3A 1M04A 5A2BA 1TR1A 4BQ2A 5IFPA 2W92A 1JDAA 2BS9A 3I3EA 3TONA 1OSEA 1XV8A 2WLYA 1XYFA 4MPKA 4PMXA 3U7VA 1JDCA 2VR5A 1GUVA 1CIUA 1Q6GA 2AMGA 2ZWZA 3RM9A 3AIQA 4WKFA 1KR0A 2XGIA 4P8WA 1R8LA 1V6XA 1BG4A 3WF0A 1DEDA 5D9PA 4D6JA 2VZOA 1YQ2A 1QBAA 3S2CA 1XH2A 1GHSA 1S46A 4NRRA 3BGAA 3GTNA 1EQPA 4MNJA 2OWCA 1J9YA 5HBFA 1B3WA 4CU8A 2XSAA 1TMQA 3UR8A 1RD6A 1BFNA 4W84A 3ZT6A 1BVZA 3VD4A 5C71A 5CGMA 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2UY3A 2DDXA 3ZJ7A 4AZ7A 4P8VA 2VCAA 2NW0A 4WIWA 2BFGA 3EMZA 2PWHA 1KGUA 1JYXA 3NIYA 1KCLA 3N13A 1V3HA 2J7HA 2EO7A 3U5YA 2VO5A 3VPLA 4H2CA 4LX4A 5CPTA 2OYKA 2VCCA 2XFYA 5CPSA 5FL1A 5E0FA 2GJPA 2YDQA 2G3IA 1GW1A 5A8QA 2XWDA 2WVVA 3CUFA 3VUPA 4AW7A 1AQHA 1US2A 3FAWA 2WC3A 2Q8XA 3BMVA 3WQ6A 2VCBA 4AY1A 4ACZB 2DEPA 2QV4A 3CUJA 1E0XA 1H0GA 1QHPA 4D6GA 3VX0A 2O92A 5DEZA 1CGUA 3GH5A 2BHZA 5JIWA 1H41A 1M01A 2BY2A 4ZXOA 3K4AA 4H7VA 1JNDA 2BXYA 2E0PA 4ATLA 2WMIA 1GQLA 1VRXA 3PTQA 2D3NA 3II1A 4PTVA 1QNQA 5I77A 3SUUA 3IANA 3SCUA 5JUVA 1HXJA 2WVUA 2J79A 4JCMA 1E6SM 3WFZA 3EBVA 1KGXA 2ZUVA 1FHDA 5CGTA 3PZTA 4BS0A 5LA2A 4GQQA 1U30A 1N82A 2BV9A 1H5VA 3SCWA 2YBTA 2ZX6A 3M7SA 1JAEA 3CH9A 3U57A 5E6YA 4WJXA 1JG9A 3FW6A 1GQJA 4JL1A 3SIMA 3UEQA 5HXMA 3QOKA 1PBGA 3W26A 4QFUA 5BRQA 3GNRA 1HJUA 2G4FA 3ZSSA 1G9HA 4W89A 4WSKA 3GXDA 2FGLA 3WF3A 2D24A 1HIZA 1M03A 1EDTA 4UOJA 3QGVA 1V3IA 2DGAA 3KL5A 1J0HA 3WH9A 7TAAA 1CLXA 4UOQA 3HMCA 2O9OA 2D0FA 1SFSA 1KQZA 1QI5A 2BHUA 1R85A 1V6WA 3EMCA 4A3YA 1ISXA 4YHEA 4R27A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4JTS A;  1VFS A;  4M1B A;  4NAF A;  3URB A;  4EF8 A;  4WDX A;  3HQP A;  4M6V A;  3F2B A;  3NQ6 A;  1JYW A;  4W8A A;  4LC8 A;  3F4W A;  6TAA A;  3P61 A;  3LY0 A;  5FJR A;  4MJ2 A;  3ISI X;  4UMA A;  3GU1 A;  2IQD A;  4XO7 A;  1W3I A;  3GUG A;  2QDG A;  3BJF A;  1W9P A;  1DJQ A;  4Q8N A;  3ES7 A;  2X09 A;  4RK8 A;  3FVD A;  2J7D A;  1KKO A;  3ARY A;  3NL3 A;  1EUA A;  3ZJ8 A;  2PWE A;  4PCP A;  4DB7 A;  1H5Y A;  1R9X A;  3VIG A;  3DOP A;  1X6U A;  5IRP A;  3AXH A;  5IFT A;  4ORM A;  3TR2 A;  2XH0 A;  3QBU A;  4NNC A;  4CD7 A;  3POH A;  3OVQ A;  2JQX A;  4HQV A;  1OFE A;  4BFA A;  4Q7I A;  1M53 A;  5G1M A;  4XWU A;  4D6C A;  3HZ3 A;  1EWE A;  4S3J A;  4RCX A;  2QXW A;  3PBV A;  1WCG A;  3BXW A;  5FD0 A;  4AU0 A;  5FAC A;  4HSN A;  3EWZ A;  4IIB A;  1UUM A;  3EA3 A;  3WH7 A;  3LCG A;  3DIP A;  4F79 A;  4AD3 A;  1W1Y A;  2DQX A;  1LP6 A;  4NAS A;  4D2J A;  3AQU A;  2GUY A;  4G7E A;  3LOT A;  2GJN A;  5BCA A;  4AZ6 A;  1JFH A;  3RO8 A;  4DJD D;  5D05 A;  4PMO A;  2FDS A;  3U48 A;  3P67 A;  3LQL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4U5KA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations