4UNKA

Crystal structure of human triosephosphate isomerase (mutant n15d)
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
245
structure length
245
Chain Sequence
PSRKFFVGGNWKMDGRKQSLGELIGTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIAVAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Human Triosephosphate Isomerase (Mutant N15D)
rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 245
sequence length 245
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2014-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4unkA00
1LM1A 2PC4A 3PBUA 2QAPA 4NZJA 5CKSA 3LCLA 2D73A 3LCWA 5IM51 4LS2A 4LRSA 4JYFA 4UNLA 3SZ8A 5G1TA 3E96A 1QCWA 5DY3A 1WV2A 3KRUA 3LXBA 1ME8A 2GQ9A 3E12A 3W75A 3C8FA 4M7SA 5F2MA 1GWJA 2AQWA 2E6DA 4O16A 4P61A 2V82A 1SFLA 4OV4A 4U4MA 5AYZA 1Q3NA 4Z1CA 1GTEA 4LT9A 2TYSA 3HOJA 5AC6A 1TREA 1OABA 1XUUA 3NQ2A 3W1RA 4UFJA 1SSGA 1VYPX 4UUIA 1TPUA 5I3KA 4FEZA 4N9BA 4CCCA 1XI3A 5FI8A 1D3GA 4LVBA 3TSMA 1F2JA 2CZDA 2V81A 4KFNA 3W1MA 1DHPA 1WOBA 1JJKA 4CQAA 4CQ9A 1W3TA 3BO9A 4NQ1A 1KFKA 1Q45A 1UBSA 1YPFA 2YXGA 4Y90A 3M9YA 3MJYA 3GK0A 5A5WA 1VGAA 3UD6A 2NLIA 1W8SA 4GFSA 1KBJA 3GKAA 1SO6A 3UZ5A 4Z1AA 3QMRA 3LCHA 4XQ6A 2Y61A 4WXZA 3IV3A 3C2VA 4JTIA 3LRMA 5LKYA 1IIHA 4AAJA 4IMFA 4JTGA 5KTLA 3GDRA 4MVAA 3P80A 1ML1A 3OG3A 1VZWA 3Q37A 2EGZA 3CWOX 4UR7A 2GJLA 1JUBA 3HF3A 4X3ZA 3FFSA 3TXVA 3V1PA 2ZZ3A 2NV2A 3SSJA 4BR1A 4YXGA 4NNAA 3EX3A 1C29A 4QQ3A 3TMQA 1YTKA 2QAFA 3A5FA 3QMTA 1PCWA 4FXSA 1XUZA 1VYRA 3N19B 1X1ZA 3FKKA 2X2GA 3NPUA 3G8EA 3W7RA 1H1YA 2VFHA 2ABAA 3RF9A 4HSOA 1DORA 1KM1A 1N7KA 3BPWA 5LNWA 2QJIA 2A6LA 1OFQA 1W1ZA 2RDTA 1FDZA 3QJAA 2H3DA 2JKPA 1CI1A 2LLEA 5C5YA 2RDUA 3Q2DA 2OZ0A 2CU0A 1LRTA 2V9DA 1SSDA 1JCLA 1DBTA 3KRZA 4FO4A 2VFFA 4ZQMA 1OK4A 3LCGA 4EF9A 2WSQA 4X2RA 4IXHA 4QSHA 3W7NA 3NM1A 3HO8A 4NZFA 1EX5A 4S1FA 2QJHA 2EHHA 3QFEA 4FX7A 3BLEA 1TRDA 4N4PA 5BRBA 3ZR4A 3LBMA 4CCEA 3W7QA 1OG0A 1Z48A 5FESA 1V5XA 1KM0A 2BX7A 2ZA3A 3O16A 1KW1A 1WBHA 1S5TA 4RX0A 2ISSA 1SFJA 5DBUA 5H91A 2E77A 2DJLA 1JRBA 1ICSA 1KM3A 5LNUA 1V7YA 1L6SA 3CHVA 1ZY9A 3F4NA 5KZMA 3S0CA 2NUYA 4WZHA 3C2OA 4M6QA 4RR4A 4JX6A 4I7VA 3BVJA 4OGZA 3T40A 3W1UA 3GXTA 4LS0A 3TQ0A 1M7OA 3MMTA 7TIMA 1DJQA 4DQWA 5LHFA 1VHNA 1GVFA 5AHIA 2G97A 2EAWA 2A85A 4DBDA 5LNRA 1QNVA 1Q6RA 2GQAA 4NX5A 2QCDB 3NDOA 1THFD 1IGSA 1KFEA 1OFEA 2QUUA 3DHFA 3VE9A 4IMCA 4E38A 4UTIA 2ZZ6A 5FF4A 4NJJA 1PV8A 5LSMA 3MYPA 3QQ0A 1NF0A 1TV7A 2YGYA 3BW4A 2VC6A 1TQXA 5D2YA 4UFIA 5EKYA 3SY5A 5SWUA 1HFBA 4N9DA 2FPTA 3JR2A 4IJBA 2A7RA 2G96A 5BMWA 3W2KA 3LGEA 5D2VA 1L2UA 1OF6A 4O1AA 1K3UA 1RQHA 5EA9A 5MHBA 3TIMA 3NYZA 3UWWA 3PUDA 4X22A 3W9ZA 2CZFA 4JD4A 3GB6A 4UR8A 1GVOA 3GR8A 1EWEA 3WJSA 1J2WA 1YXYA 2YW3A 1WXJA 2XFWA 2BWGA 2CLEA 5AB3A 3DBPA 1MO0A 1Z44A 3C2FA 3SFKA 4AHOA 4PODA 5HMSA 5K9CA 3HG2A 3L5MA 1DQWA 3I7QA 4Y8FA 2ZYFA 1U5JA 2TSYA 3N73A 1S5WA 3C0JA 4JX5A 1QPNA 2FPVA 3W07A 4ADSA 1YTDA 3ATZA 2C0AA 1ZAJA 4IUOA 1ME7A 4LC8A 1YDNA 3BV4A 5F4XA 4UTTA 4YL2A 2H8ZA 3LCIA 4A2SA 1TPC1 3DFTA 2YFOA 3F4WA 3IRDA 3HMJG 3S42A 2PRLA 4BFAA 2ATMA 2BZNA 2FDSA 3A21A 1IXOA 1LBLA 5CSSA 3PUEA 1HG3A 2GPTA 3PAJA 5C54A 3CEPA 2Y70A 3LV6A 1PS9A 5TQLA 2ZFAA 2HS6A 1YTEA 3UWZA 5KZEA 3NOEA 3OVPA 1TPEA 1B3OA 2BLEA 3M5YA 3CPRA 4Q33A 1BTMA 1LCOA 3G0SA 3UWQA 1ZALA 2NWSA 3S9YA 3A22A 3RFAA 1OYCA 2OT0A 1CW2A 4QITA 2GQ8A 3GYEA 2ZA1A 3NPXA 1T96A 1G7UA 3V75A 2Y7EA 3NQEA 2GVGA 2CWNA 3C61A 3W7PA 3LCXA 3CLMA 4PEKA 3CT7A 5L6UA 1O94A 5HUPA 3LHUA 3VNDA 3STGA 4HSNA 1UB3A 5CZJA 3G8RA 3WK1A 3MP3A 1I2OA 4MY1A 3EWZA 4I9AA 4NT0A 3LLDA 3KX6A 2FB3A 5D32A 3LM7A 5D09A 3CEUA 1D3HA 4AB4A 5LGXA 3NL6A 3O06A 5D05A 4JTLA 3LBCA 3C2EA 1WX0A 3M5VA 4WY0F 1MEIA 2YFNA 4HNNA 2QCGA 1TTJA 2W0UA 5LZLA 3G1YA 3USBA 4O54A 3NQ6A 3A9IA 2RFGA 1SW3A 1W54A 1MEWA 2B7OA 2DZUA 4CNPA 2QCCA 4UMBA 1F5ZA 5EBUA 1G69A 2ZQ0A 1W37A 3ANYA 4LOCA 4E2BA 2E5BA 1SPQA 2G95A 3UWYA 1ZCOA 3HBLA 5DY2A 4NXSA 1H51A 3HG5A 3T55A 3E49A 2ZRUA 4JNMA 1OVDA 4POCA 3WK2A 3BLIA 3O63A 4N6EA 4MPQA 2FIQA 2W6RA 4O1DA 1ONRA 3O07A 5IBXC 1WQ5A 1K7FA 3P82A 3NEVA 3W71A 1O95A 1RR2A 4ZL1A 1NFBA 1QR7A 1A5CA 2Q3RA 3S6DA 4HHPA 3UZJA 2C15A 5FEPA 4Y6GA 1H1ZA 3NM3A 4TMBA 5G1YA 4IMDA 4AWTA 3KVKA 3KRSA 1JCYA 3D0CA 4UMAA 4WUIA 3W2NA 1XFBA 2WKJA 2FLIA 1N55A 1W5NA 1OJXA 4M6VA 4JS3A 3NNTA 2QDGA 4G1KA 1K8XA 3N34A 4MUZA 2JK2A 3O8AA 5HNRA 4OQVA 3W87A 1R30A 4JX4A 5DLCA 3DFQA 1IXQA 1VQTA 3TU9A 2DZWA 2I14A 2AGKA 2G5WA 2X16A 4JN6A 1KM6A 2YYTA 1TIMA 5F4WA 3TDFA 3W85A 3ABSA 4RZ6A 3FEMA 1U83A 4S2CA 5FF2A 3W7EA 3PBVA 1KFJA 2RKXA 4WX2A 2ALDA 2A2IA 3N2MA 1M6JA 3TKFA 4FNSA 2QCLA 1F74A 2X1SA 1H7OA 1W5MA 3OEXA 1D9EA 1XDLA 3MW7A 4MZYA 1KA9F 1TRIA 3B8DA 3EX2A 4RV8A 2QCEA 3BK0A 5BW6A 3M43A 3B03A 2OT1A 5DELA 1QPQA 3SI9A 5CG7A 2GOUA 4IWWA 3M44A 4HNTA 1TCDA 2EF9A 3GKFA 4ICNA 2V0TA 2E6YA 4J9JA 4WY0A 2WNZA 3IVTA 1AL7A 3UWVA 1A50A 3NQFA 4IGHA 4HPXA 3KXQA 3LI0A 5I3JA 1O5XA 1YADA 2FPYA 3I68A 4ONVA 2O7SA 2C19A 2Y7GA 3TQKA 3UQNA 1AW5A 1KV5A 4EVZA 3W76A 4OWGA 3C3NA 1TYGA 4UFHA 3L0GA 2B7NA 3TQVA 3LRLA 1VC4A 1R2TA 5AC7A 3C4UA 3RK8A 1SO5A 1FY6A 2HS8A 2X1UA 3W72A 1L6YA 3P8JA 4FNRA 2ISWA 3DFOA 5DCBA 3W2MA 3IIOA 2ZA2A 4N9CA 3P7YA 3C56A 4RZ5A 1LYXA 1VS1A 3OBKA 5F4SA 2X1TA 2QUTA 4OBTA 4Z1BA 4MYXA 1DQXA 5D04C 3WK0A 1Q6LA 2C6QA 3LTYA 1NAL1 3BLFA 2DP3A 1GTHA 2C16A 4C1LA 5DXXA 3P81A 3W7JA 2NXGA 3TC6A 2Z6JA 3L9CA 2H6RA 1FCVA 3B0UX 4LUJA 2B7PA 3W2LA 1CX9A 1GQNA 3W6YA 5LNSA 4XWUA 4X9SA 5HINA 1I8JA 3HIJA 4S2BA 4Y96A 3W2JA 4NJGA 2RH9A 1PIIA 4O52A 1KLZA 1FCQA 2VFIA 1F7BA 4UTJA 2E6AA 3HGRA 4DPQA 4O13A 2JBMA 3TCEA 3TROA 1GJPA 3S5NA 2H8XA 3GLCA 3SIZA 4O4VA 3QRHA 1X1OA 4FNTA 3HJZA 2DZVA 3G1XA 3MO7A 4MFEA 3CM4A 3B04A 4N4QA 3KHJA 4K6AA 4PL2A 4EOUA 3GX9A 3NQMA 3G1DA 2BSLA 2J24A 2CLKA 4DELA 4IPJA 2A0NA 3UYCA 1P0NA 4UC5A 3GAYA 3NQ8A 3FYOA 4UXDA 1H7PA 3RMJA 1LDCA 1PCKA 1XL9A 4ZVJA 3GNNA 4K37A 1RZMA 2BXVA 3TJXA 4FNPA 4UTWC 4DO6A 3BG5A 3W1XA 1GG1A 1JULA 1W3NA 3LERA 4GWEA 4PC8A 4W9TA 3KFTA 1J5TA 2YSWA 3LXAA 4R34A 2CFFA 1FWNA 3Q58A 2FQIA 5CPNA 4ZMGA 2C1HA 4I7UA 3P67A 3L21A 4HKPA 3Q94A 2YDAA 4ML9A 3NR0A 2VFGA 3PUOA 4QNWA 2E09A 1AG1O 1LLZA 1JVNA 4O53A 2DU2A 1O4UA 3PG9A 4EIVA 2X30A 1FWSA 4ADTA 1K8ZA 4WQ6A 3FIGA 3MYOA 3IVSA 3FOKA 5H2ZA 5CZSA 5D38A 2QJGA 3M7WA 3TFXA 4L4LA 3HG4A 2QF7A 5D33A 3NQDA 4QJ1A 1PHWA 1YYAA 3HQ1A 5E1QA 1OX4A 4PH6A 3L5AA 1H7XA 4JTHA 3INPA 2WO5A 1LRQA 3IGUA 4Z0SA 2CZ5A 2A6NA 4UCGA 4H3DA 1SW0A 3DH7A 3M0ZA 5U4NA 2NXHA 4H6KA 3WK3A 3AJXA 1W3IA 1JUKA 3ABOA 3BW2A 4QISA 3EWBX 2I9EA 4MYAA 3PB0A 3PULA 5HR6A 2E1DA 3M16A 2H3BA 1M7PA 3R5EA 4NJKA 1PL9A 2JGYA 1TPVA 4O12A 2TPSA 2Y7DA 3W2UA 4JTFA 5KMYA 4JDYA 3KVMA 4MIMA 2CLHA 4JIQA 1UUOA 1OYBA 1G4SA 3MBFA 2JKAA 3GAKA 3CIWA 3W1PA 3LHZA 4IQLA 5HWNA 4LS1A 1IXNA 1G4EA 4RJEA 1WOAA 4K36A 1XM3A 3EKZA 1H7RA 2KZHA 3TSBA 1TMHA 3W7IA 4XZ9A 4RLIA 1JRCA 3W7CA 4KFOA 2FTPA 3N9RA 4NVTA 4FB7A 1P4CA 1JQVA 3QSRA 2C14A 2NUXA 1TTQA 1HTIA 2IQTA 4A2RA 2A21A 4RCXA 1VHCA 4HN4A 4H4IA 4BI6A 2OJPA 2ZRZA 2ZRYA 1KTBA 4LRTA 5A8GA 5EL1A 1EWDA 1GVRA 1JUEA 3W7OA 1SZNA 3H54A 1W31A 5FF7A 1QMLA 3PR2A 1K7EA 2B0MA 3W7DA 1WA3A 2ISVA 1UCWA 5K2ZA 4O57A 3W1TA 2Y85A 2ZZ2A 3CU2A 1NF7A 1ICQA 1I2PA 3C2RA 1JCJA 6TIMA 3TJLA 1XDMA 3FJLA 4XBKA 4LWWA 3TAKA 3P60A 3WJXA 3R13A 1RPXA 5HWMA 3GDKA 1SU5A 3EX6A 3NO5A 3PC0A 3U8GA 1BKSA 4QM1A 5CSRA 3UNDA 4AVFA 1SR9A 1YXDA 2DZPA 3LV5A 2P10A 1BWLA 8TIMA 3HB9A 3U2OA 2P1FA 1GYNA 1NEYA 3ZWTA 3LHTA 3EX4A 1LOQA 1G7VA 4UNKA 4GBUA 1MZHA 6ALDA 3MI3A 1UUMA 1RV8A 3WJWA 5D02A 3B0PA 5D03A 5KSWA 1QO2A 4Z1DA 4JTSA 2WNNA 2ZZ4A 1P0KA 3PB2A 4O11A 1H60A 2XN0A 4IX0A 3W1AA 4AWSA 3ZS4A 2A7PA 5EY5A 1H61A 1W0MA 1PHQA 4I7WA 5J5RA 3HPXA 3P84A 2Q3OA 4P2VA 5E93A 2ATSA 2ZDRA 3G1SA 5AHLA 3OVRA 4K8HA 1O5KA 3NGJA 2QR6A 4DF2A 3HGJA 3KAOA 2C3ZA 3TAOA 1FX6A 1TTPA 2YYUA 2PCQA 1Q6OA 2ZBTA 1AK5A 1O60A 4O10A 5I3FA 3NZRA 4RZ4A 4NJHA 4BI5A 3W86A 3K30A 5G2HA 3UWUA 3OVQA 3A5VA 4AF0B 2V5BA 1I2RA 1ZAIA 3ZFHA 4LVDA 1DJNA 3GNDA 1I2NA 3G1VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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