4UNLA

Crystal structure of a single mutant (n71d) of triosephosphate isomerase from human
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
SRKFFVGGNWKMNGRKQSLGELIGTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIAVAAQNCYKVTDGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Single Mutant (N71D) of Triosephosphate Isomerase from Human
rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
total genus 89
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2014-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4unlA00
3DBPA 3QF0A 1RD5A 5D30A 1RPXA 2R14A 3UXAA 4BK9A 4JDYA 1SUXA 1TPVA 4S2CA 5G4WA 1Z48A 1JJKA 5G2WA 1OX4A 1K03A 3G1VA 3L66A 5T26A 3OEXA 3D0CA 5KMYA 4ZQOA 5HNRA 3B4UA 5D2XA 4JXCA 5LSMA 3CQ0A 1EP2A 3GDMA 3FJLA 5C54A 1AL8A 2H90A 1D3GA 1XKYA 3MUXA 3TKFA 3E49A 1I2PA 3C6CA 4EF8A 3TA6A 1KFKA 3OIXA 1GYLA 4AHOA 4Q4KA 2YW3A 1VGAA 1H60A 3E02A 3IIOA 4LC6A 1GG1A 2GQAA 3LTYA 2CW6A 2BZNA 4I7UA 4N9CA 1BEUA 5BOOA 3CTLA 3LRKA 1LOSA 3S9YA 4FNQA 4DF0A 3C0JA 2PURA 2ZRZA 4MJZA 5G2IA 3O6YX 4O1AA 2B7NA 1B4EA 1D9EA 2DZVA 4UNLA 1F2JA 5IM51 3CIWA 4PL1A 1OYBA 1K7FA 4EVZA 1KV5A 3L0KA 2QCNA 4M5PA 3W7GA 3I65A 3SSJA 4ZMGA 3BGJA 2Z6IA 3A23A 4UR7A 1M7OA 3KVMA 1KTNA 2A85A 1E51A 2FJKA 2FDSA 4X2RA 3GR8A 3QQ0A 5LGZA 1BWLA 1QO2A 3T44A 1JQXA 1P4CA 3F4NA 4FIQA 1MSSA 4O54A 3GAYA 1G4PA 1GYNA 2QR6A 1FWRA 1XM3A 3PG8A 3TK7A 7TIMA 1FWWA 2Z1BA 1JR1A 3T40A 2QCEA 3DAQA 5D02A 3QJAA 1JRBA 3W76A 2C6QA 2QEZA 4ML9A 1WOAA 3ZFHA 4NXSA 3EX1A 3A22A 1ZAJA 1R46A 1DV7A 2NZLA 1KM4A 1XBXA 3W70A 5CG7A 3NGJA 1K8YA 4CCEA 5LNVA 1OFBA 2EHHA 5BMWA 1NSJA 5D09A 3IIPA 2RFGA 2ZZ6A 2V2DA 1BTMA 4ZQPA 5FEWA 4BFAA 3U2OA 2E77A 4YLWA 4K6AA 2A7NA 3NQMA 1FBAA 4YCPA 1W1ZA 3M7WA 2H3DA 1HFBA 3S5YA 1KFJA 3C52A 3I7SA 3CIXA 4GUJA 1RZMA 4JYFA 2V5LA 2F84A 3KRZA 3L21A 1ZALA 4FO4A 4Y6GA 2ZFAA 5EPDA 2ZZ3A 1W3NA 2Y88A 4P2VA 5D2WA 5F2IA 1TTJA 1Q6OA 1PVNA 2JBMA 3LRMA 4AHQA 1JCLA 3NG3A 3DU0A 5K9CA 4FF7A 3MHUA 4ORMA 3UYCA 2B7PA 4OBTA 5GVJA 3TJXA 4L4LA 2A5HA 2FIQA 3L67A 1OJXA 3LB0A 1GVOA 1NF0A 4A29A 3S6DA 3S1UA 4GRSA 1MO0A 5AHLA 5A5WA 4ADUA 1GVQA 4UR8A 1OFQA 1SO5A 1T99A 4UFIA 1HTIA 3BW3A 3QPZA 4WQ6A 3USBA 1YPFA 3E9AA 3RK8A 3VE7A 2E6FA 4AXKA 1P1XA 2C15A 3DFTA 3FKRA 4IWWA 3PY2A 3UWWA 1VLWA 1LZOA 2D73A 1FUYA 1YTEA 2ZBTA 3NQAA 3W87A 1B57A 3GDKA 1AW5A 3F1QA 3W83A 4JTGA 1XL9A 3P7YA 5L9FA 1H62A 3KHJA 1SW7A 2OT1A 4O57A 3BW4A 3W7JA 1H5YA 1G7VA 3VNDA 1I8JA 2NUXA 2RHGA 1LLWA 4O1CA 1M6JA 1VC4A 3B0UX 3IIVA 3TH6A 3B04A 4NVTA 1I2OA 1DVJA 3IIXA 4CCDA 1JCXA 3W75A 2E09A 3S1WA 1YADA 3PS7A 3INPA 1OK6A 1EWDA 2CLMA 3QH2A 4PODA 3H53A 1IIHA 1Q3NA 1OX6A 4ZQRA 2NX9A 5H91A 1TPUA 3R5EA 1HL2A 3G1SA 2V81A 3CHVA 3L65A 4YL2A 3ABQA 4NZJA 1A5CA 4L4MA 4NJIA 1H50A 1L2UA 3G1HA 3HO8A 2JGYA 4HSNA 2HTMA 2V2CA 3UPBA 4DELA 5K3VA 1PHQA 2VEPA 1XBZA 3N14A 1LRQA 3O63A 1OF6A 4N02A 5TQLA 2YPIA 4HNTA 2EPHA 3W7OA 2ABAA 3Q2DA 1I2NA 4M6PA 4AEOA 2Y7EA 1VHNA 4QJ1A 3CT7A 5K4ZA 3LHUA 1KBJA 3OVQA 1WXJA 1ZAIA 3CC1A 1CX9A 3EKZA 3W1AA 2GVGA 2NUYA 4MZ1A 1TPEA 2ZZ7A 2G95A 4RZ6A 3HG4A 4DF1A 5F1UA 3W73A 1WOBA 2OMAA 3M47A 4O52A 2CLHA 5C55A 2ZZ4A 4LUJA 1WBJA 4K38A 3CB8A 3QSTA 2HS8A 1AG1O 3BLEA 1L6YA 1UUMA 3LHTA 4DBEA 3LBMA 3W85A 3HGJA 2H8ZA 4M7TA 1FWTA 3STCA 1A53A 1GVSA 5BRBA 1RV8A 4UTWC 3BVJA 2RDTA 5FF7A 1R2RA 3HBLA 3EX2A 4MLRA 5F2GA 1QOPA 3MI3A 2B7QA 3NPUA 3PB2A 3I6RA 3ELFA 4IMDA 2NWRA 3LV5A 3BPWA 4IX2A 4MUZA 4O14A 4E0CA 4PEKA 5K2ZA 5CZ0A 2J9ZA 4ONVA 1YXCA 1TMHA 1GVFA 2ZRUA 1KM1A 3M6YA 2CU0A 3RNDA 3MJYA 1AL7A 2QDHA 1OHLA 3BARA 4QM1A 3EXSA 5D2YA 2EF9A 5HJLA 1PE1A 2WPBA 1LYXA 2YXGA 5D37A 3DGRA 1I4NA 3GK0A 2OJPA 5C5YA 1W5MA 1XBVA 1ZENA 3EWXA 3MBDA 5I3JA 3O07A 2BX7A 1PHWA 3WJSA 3HMJG 2VC6A 1KM5A 1OX4B 3TXZA 5U4NA 3KFTA 3LXCA 1ZJIA 3PUDA 2V5BA 3NZRA 5FEXA 3G1YA 4GXMA 3G24A 4WD0A 2X16A 3TU9A 4HNNA 2ATMA 1EWEA 3CEUA 2OCZA 3TX9A 1Q6LA 2CWNA 3UZJA 1S5TA 1YDNA 3M5XA 2RDWA 3WJYA 2BWGA 4JD4A 4MZ8A 4LUIA 1H63A 1U5JA 4GUIA 4YWIA 1S3HA 1IXQA 4TIMA 3E12A 2I9EA 1XDLA 3EXTA 3DHDA 5FF2A 5D05A 4UTTC 1KBIA 3LI0A 2CLLA 4JTEA 3TIMA 3IRDA 4JYDA 4YCOA 1QWGA 3MO7A 1YXDA 2A4AA 2ZRWA 3RU6A 3OHIA 5CSSA 4WXZA 5AFDA 1YYAA 1TO3A 3MP5A 1H7WA 5I3KA 5LKYA 2G5WA 1EB3A 5C6MA 1OFOA 2PCQA 4O53A 1JRCA 4FHAA 3TCEA 3NDOA 1QCWA 3M44A 4JX5A 4JIQA 1PIIA 1K8XA 3KOFA 1DJNA 3UD6A 1YTDA 4UTWA 4ICNA 3FIGA 1EPXA 2QJIA 3PG9A 3EX6A 2AQWA 1BKSA 3GZ3A 1RQHA 3RLVA 5HWMA 3PAJA 1OYAA 1O94A 2NX3A 3L0NA 4CQAA 1FWNA 1F6PA 3FLUA 4X22A 4GJ1A 2PC4A 3QW4B 1KFEA 1R2TA 3P74A 3EWUA 4LC8A 3W2LA 2CLIA 4XQ6A 3W7PA 1TJRA 1R30A 3N3MA 4GBUA 2TRSA 1DHPA 3OVPA 3DKJA 2R91A 1FXQA 4IMEA 5CPOA 1J5TA 1KTCA 4JTJA 1SZEA 3EKLA 3TE9A 2V0TA 1VHCA 4OE7A 3SY5A 4Y96A 1OK4A 4LS2A 3HGRA 4NZFA 5HUPA 4MIMA 3YPIA 5CPLA 2BXVA 1OG0A 2Y7DA 3W07A 1NAL1 4IOTA 3KVLA 6ALDA 1TQJA 3MMTA 1WQ5A 4GC4A 3NPVA 4B5NA 1SZNA 1RR2A 1SZFA 3LBCA 2ZQ0A 1FCQA 3VKJA 5LNRA 2YR1A 3WK3A 4NNAA 1W8SA 4HIBA 3GLCA 2ZRXA 3TAOA 4NNBA 1H7NA 1TQXA 4O10A 3BG5A 3T78A 4JICA 1VYSX 4FXSA 2X1UA 1G6CA 1GTEA 1QPRA 4XBKA 3HOJA 4QNEA 5G1YA 3UWYA 4OU1A 5DCEA 4UTTA 4IXHA 2FPYA 3S42A 3LM7A 3BK0A 1TREA 4IUOA 5AHMA 5CZSA 5BW6A 2E68A 3LCLA 4AWSA 3M5ZA 4HNUA 5CPNA 1KLZA 3UZ5A 5AHNA 2QAFA 4HN4A 3C2VA 2QJHA 5DY3A 4A2SA 3CPRA 3MI2A 3ATYA 4O13A 1QPQA 2Y7FA 1QFEA 3M1ZA 4TU1A 3TV8A 3WK0A 3JS3A 2ZZ2A 4N9EA 1VPXA 3HF3A 2V2HA 3NPXA 5AHFA 2ISSA 1H7RA 3WJZA 2QCMA 3SFKA 5G5IA 3WJXA 1MZHA 1OABA 1IXNA 1XUZA 1JUEA 4OT7A 4WUIA 4O4VA 4ALDA 3NZ1A 1MEHA 1ZAHA 3IV3A 3P80A 2QDGA 3O8AA 3IVTA 4UMAA 4NU7A 4JTFA 3SIZA 4U28A 4GWEA 1EA0A 3BG9A 4ZVJA 4XTIA 3STEA 3RF9A 1J4EA 3FYPA 1VH7A 4FX7A 2X30A 1LP6A 1FDZA 2WNQA 3LERA 2J27A 4ZQMA 4S2BA 4MFEA 4TMCA 4DF2A 1J2WA 5CGQA 1BWKA 1FX6A 2HMCA 4GNJA 2DJLA 4H6KA 5HINA 4BWLC 5E0KA 5HMSA 3W7NA 5HQEA 3W7EA 4O18A 5KINA 3TSDA 3CWNA 3W2KA 1W5NA 4KFNA 2Z2UA 3R12A 1LOLA 2GPTA 4GUHA 3G1XA 3UWUA 4Z1DA 4JDBA 3QM3A 4N9DA 3TW6A 4AF0B 5CKSA 1Q6QA 1N7KA 2EKCA 1JVNA 4WY0F 1N8FA 2H3BA 3NEVA 4HKPA 1AK5A 3MYPA 4PL2A 3W2NA 4MPQA 1ML1A 1H1YA 2XN1A 3G0SA 2CZEA 3HG5A 3N9SA 4PFMA 4TR9A 3DFNA 5G4EA 1QO5A 4LVBA 4UC5A 5BNKA 3PC0A 5EMUA 4HHPA 4JYEA 3LXBA 4MFDA 1F5ZA 2YYUA 3W1LA 1SW0A 3QRHA 2VELA 1AMKA 3Q37A 1GJPA 5IBXC 1JCJA 1MEIA 1I2RA 2DZUA 2ZA2A 3NO5A 3NM1A 2R94A 1TIMA 2GVLA 2W0UA 4JTIA 2QUVA 3TJLA 3GXNA 3UNDA 4FNTA 3W3OA 4JR5A 2RH9A 4KWWA 3K30A 3VI2A 3N19B 1SFJA 3QQ1A 1WAUA 2CLEA 4NJJA 3TSBA 4NQ1A 1G67A 3ATZA 3UWQA 2C19A 3TFCA 1TPFA 4WX2A 4GUGA 4LRSA 4WOZA 3EX3A 3PSWA 1HG3A 4C1KA 5D03A 4UFMA 2VOMA 2GJNA 3CLMA 2ZRYA 3IVSA 2E5CA 3HGSA 1SQ7A 3W72A 1O95A 4D2JA 4NJGA 5A8GA 3TC6A 3TXVA 1HO4A 1NEYA 1M7PA 1NF7A 4IGHA 4LVGA 2ZYFA 3GDLA 3ABSA 3QEZA 4OGZA 1SSGA 5FF0A 1EX5A 4A2RA 1UCWA 1EP3A 4UMCA 4QITA 3PWAA 1ME7A 4ZL1A 3RLUA 2WNNA 3G1DA 5DBTA 3NPWA 3I68A 3F4WA 1LLZA 3V75A 1GWJA 1ALDA 1LOQA 1IXPA 5F2MA 3DFSA 2AAMA 2NXIA 1S5WA 3MP3A 1HUVA 2P0OA 3W1PA 1VJIA 3NM3A 3IGUA 3TMLA 3ABRA 4BI5A 3G0XA 3ZWTA 1UBSA 4UFKA 3MI6A 3OG3A 3B0VC 1C8VA 1VR6A 3TAKA 4A22A 3NQEA 3S0CA 2KZHA 3I7RA 1OX5A 4A3UA 1DJQA 4LV9A 4RKAA 2FFCA 3M5YA 3W1RA 1ICQA 1PV8A 4N4PA 4O1BA 1QR7A 3BGGA 5FEZA 2WQPA 4UTJA 3P60A 4IMCA 4OHQA 1LBLA 4M6QA 1F7BA 1SO3A 1THFD 3CU2A 3R13A 4XWUA 2P10A 4QSHA 2YDAA 3C2OA 2RDUA 3PULA 3KVJA 1K02A 4RCXA 1RQEA 3DFOA 3LCWA 3GAKA 3ZR4A 3W1UA 1X1OA 3TSMA 2VEMA 2FQIA 3P67A 3H54A 3NA8A 3V1PA 4AH7A 5LNSA 1DQXA 3LRLA 4AF0A 2JGQA 1N55A 4O16A 2WSYA 4M7SA 4JIPA 1LTDA 4O1DA 1V7YA 3G8EA 3MYOA 1A5AA 4UTHA 1K7EA 2JKPA 1SFLA 2QCDA 1UJPA 4CCCA 3L5MA 1TRIA 2CFFA 4KFPA 5BMXA 2O7QA 4XZ9A 3GKAA 4R53A 2WSRA 1KW1A 1T8XA 5D2TA 4RZ4A 2W6RA 2Y6ZA 4DO5A 3STFA 1TJPA 5K4XA 4FIRA 1JCYA 3S5NA 2X1RA 4X9SA 1DORA 4AAJA 4AHPA 2E1DA 4E2BA 2TSYA 2RKXA 1D3HA 2GOUA 5DCBA 5E1QA 3WK2A 3NXFA 4CNOA 4EF9A 1KM3A 3PBYA 4LWWA 3E96A 1Q6RA 1XUUA 3THQA 3M43A 4HPJA 3NYZA 4UTUA 3GNNA 1GTHA 3LCFA 1ONRA 1W3IA 2LLEA 3QMTA 3LCGA 1IGSA 3C4UA 3W1TA 3P82A 4KFOA 4UTIA 3SR7A 4QNWA 4ADTA 1K7XA 1QNVA 3L5LA 2WO5A 1DBTA 3LV6A 1LROA 3EX4A 3C56A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3UJE A;  3OP2 A;  2XDF A;  2P3E A;  3ZZ1 A;  1RD5 A;  5D30 A;  2VOT A;  2R1K A;  2R14 A;  1XYB A;  4BK9 A;  1SUX A;  3F2C A;  4S2C A;  5G2W A;  4AIO A;  4PMR A;  3SCT A;  2QDE A;  3B4U A;  2EPK X;  4D6I A;  3T81 A;  1K77 A;  4XZH A;  3GO2 A;  4LAM A;  1XKY A;  3AIV A;  1V0L A;  2EKG A;  3FJN A;  3AAL A;  1J12 A;  1GYL A;  3OIX A;  3W26 A;  4FPS A;  1VGA A;  1H60 A;  1HIZ A;  5FL0 A;  3IIO A;  2WC3 A;  3A3W A;  4LC6 A;  4KWU A;  2GQA A;  3VYL A;  2P8B A;  1EOM A;  1AZ1 A;  3S9Y A;  4DF0 A;  2CPU A;  2ZRZ A;  3JZE A;  7XIM A;  4C6F A;  1BYD A;  2CIP A;  3BLL A;  2B7N A;  3N2C A;  1OYB A;  4EVZ A;  4LEF A;  1D8C A;  1J96 A;  2YLL A;  3UW6 A;  2VRK A;  3I65 A;  2Z6I A;  4UR7 A;  1UD2 A;  1BSL A;  2Z7G A;  4HZM A;  1D2K A;  3AS0 A;  3GR8 A;  1B0I A;  1XII A;  5LGZ A;  3CZG A;  1BWL A;  2NQ5 A;  2FYM A;  3T44 A;  1MXD A;  3F4N A;  2E40 A;  4FIQ A;  2WLZ A;  4GA8 A;  4PRW A;  4DNM A;  5C9X A;  4GIS A;  3TLQ A;  3PJX A;  1XM3 A;  5T9B G;  4BF5 A;  1FWW A;  4WR3 A;  5D02 A;  3DAQ A;  2PDB A;  4A3R A; 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 2BOD X;  3KHJ A;  4C5Y A;  4O57 A;  3BW4 A;  4GME A;  5FJU A;  5A94 A;  1EH9 A;  4EAC A;  4HHH A;  3VND A;  1CXF A;  1Q2S A;  3FV9 A;  3UR8 A;  3QTP A;  3VIL A;  1ODU A;  1XH1 A;  5I23 A;  1DVJ A;  5IFP A;  2FGZ A;  3W75 A;  2W61 A;  2HCV A;  1M1B A;  2HXT A;  1WKY A;  4POD A;  2CLM A;  3WQ6 A;  4ZST A;  3AOF A;  1IIH A;  3UG5 A;  5H91 A;  2FHB A;  1OWQ A;  1HL2 A;  1QI2 A;  3CHV A;  1LUC A;  3L65 A;  4YL2 A;  2GK1 A;  2OWW A;  5BCA A;  1GOK A;  4FP1 A;  1WXY A;  5K3V A;  4ZXL A;  2DSW A;  4ZFC A;  3FND A;  1LRQ A;  4NZ5 A;  2BAS A;  4HNT A;  2EPH A;  3FDG A;  3R94 A;  2Y7E A;  1NDV A;  1VHN A;  3DC8 A;  4LCQ A;  4A8I A;  1UWS A;  3W28 A;  1QW8 A;  4REQ B;  3LHU A;  4PUK A;  3OVQ A;  4TX8 A;  1C3F A;  3QV7 A;  5ABE A;  1TJ0 A;  1Y5X A;  4V27 A;  4RZ6 A;  3W24 A;  5F1U A;  3LPO A;  3RJY A;  1UZ1 A;  1RCO B;  1WOB A;  2PZ0 A;  3M47 A;  5H1W A;  2CLH A;  2ZZ4 A;  6REQ A;  4K38 A;  3QST A;  2HS8 A;  3BLE A;  4QLK A;  5HJY A;  1BXN A;  3HGJ A;  5A8O A;  4M7T A;  4GO8 A;  5EFD A;  1GNX A;  1M9H A; 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