4UNLA

Crystal structure of a single mutant (n71d) of triosephosphate isomerase from human
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
SRKFFVGGNWKMNGRKQSLGELIGTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIAVAAQNCYKVTDGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
publication title Crystal Structure of a Single Mutant (N71D) of Triosephosphate Isomerase from Human
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2014-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4unlA00
4HT3A 1VJIA 2RFGA 4Q4KA 3ZR4A 3UWZA 3B0UX 2G95A 1I2QA 3NQGA 5E93A 3HGSA 1SW0A 4RX0A 4DF1A 4Y90A 4WZHA 2Y62A 3W3OA 2QJHA 4NQ1A 1VHCA 2BXVA 3O6CA 1SO3A 4BWLA 4JTFA 4TU1A 1KFKA 4LY8A 5K4XA 1EP2A 2EAWA 4CQ9A 3T7VA 2RHGA 4AH7A 4FB7A 3C2VA 4EF9A 3TXVA 4O14A 1YPFA 5H2ZA 1I2OA 3IGSA 4PODA 1YTEA 3DGRA 1IIHA 1QDSA 1XBZA 4FNTA 3PUEA 1TRIA 3PULA 4RZ5A 3HIJA 2YFOA 4UTTC 1HL2A 2JKAA 2NX3A 1P1XA 1QPRA 3GYEA 2PURA 3FKRA 4FX7A 5I3GA 1O5KA 3E49A 3ABSA 5F1UA 4XQ6A 1ZAHA 3BLFA 3CB8A 4Y9AA 4JTTA 4MYAA 3O05A 1ICQA 3B03A 3QQ0A 1AMKA 5KTLA 5AHLA 1KM5A 3NVTA 4LNYA 2PC4A 2E5CA 4LV4A 2E5DA 5DXYA 4TIMA 3DFOA 1YPIA 1YXYA 2V5BA 2ZRZA 4GUJA 1AL8A 3QSTA 3NYZA 3IVTA 2IQTA 4M6PA 1NF0A 3LHZA 3PUOA 4UTMA 1KM0A 3TUUA 1W5NA 2G96A 1JQVA 1K7FA 1VCFA 5G4WA 3STCA 4CCEA 1CI1A 1RQEA 3I68A 1XUZA 5HR6A 3T78A 3S1WA 3DH7A 1J2WA 2J6XA 2WNQA 1WV2A 3LBCA 3HJZA 1XDLA 2W0UA 3D0CA 3S42A 3CU2A 1XFBA 4LUIA 3NXFA 4UFIA 4XZ9A 1R2TA 4O8RA 2VXNA 1YDNA 2YR1A 1H7NA 2Q8LA 1OF8A 4WXYA 2VELA 2YYTA 1BWLA 1ZAJA 3LCXA 1IXNA 4R34A 3W1TA 5D37A 5F4XA 1HG3A 1IF2A 2B7QA 2OT0A 3TXZA 1GVSA 1LORA 3EWZA 1TPFA 1DL3A 2ZA1A 1G6CA 4R7JA 5EMUA 2C13A 4QNEA 2WQPA 3M5ZA 2I9EA 2E09A 3FS2A 3CTLA 2CLMA 3G3DA 4N9DA 4JTEA 1LCOA 2HMCA 4MY8A 3ATYA 4R53A 2Z0IA 1S5WA 3V1PA 4E0CA 4BI7A 5DY2A 3C61A 3GKAA 4NX0A 2GQAA 3EXSA 4QISA 2ABAA 2GQ8A 4IQLA 2DP3A 5FF7A 1U83A 3N14A 1I4NA 1QWGA 4XUGA 1KTCA 1K8ZA 3G0XA 3GDRA 4UR7A 3WK0A 4JTJA 3N2XA 3BK0A 5HUPA 3BW4A 1W5QA 3U2OA 3G1HA 1S5TA 3T44A 1NFBA 3SI9A 2OMAA 1VHNA 1NSJA 3NM1A 1OX6A 3ABOA 2C18A 3FA5A 3IGXA 2A2IA 4CNOA 2A6LA 4LC8A 1OF6A 2Y70A 3W1AA 5TIMA 5CGQA 3EX6A 3PSVA 4OWGA 4P61A 5AYXA 1Q6OA 2V5LA 1TV5A 4HNUA 1W5PA 2ZRUA 5FF2A 3H55A 3L67A 5D04C 3S1VA 5D2XA 3NQ6A 1FCVA 1WBJA 1D3HA 4CQAA 2NUXA 3DHFA 3LB0A 2GVJA 3LV5A 3I7SA 3LX9A 3LXAA 1ALDA 1WQ5A 2FFCA 4O57A 4JXCA 5HR7A 3TSDA 3EXRA 4L4MA 5G4EA 7TIMA 1G7VA 4IJBA 3G1DA 4DF2A 1GPWA 1TRDA 3B8DA 4UNKA 1TMHA 2WJZA 5K2ZA 4HNVA 6ALDA 3INPA 4X9SA 3W2MA 3TW7A 1QFEA 2E6DA 3UPWA 4O1DA 2NWRA 3C8FA 2UV8G 4MJZA 3SIZA 3WK3A 3FYPA 4EOUA 1H1YA 2YX0A 5G2HA 2QCNA 3W1MA 3A21A 2NV2A 3EWYA 5LZLA 3QQ1A 2Q8ZA 4ZQMA 4O19A 3WJSA 1P0NA 2JKPA 1SU5A 3W86A 3W7EA 4OQVA 1AW1A 3CWNA 4YWIA 3UWWA 1G4TA 4Y8FA 2B7NA 2KZHA 5CPNA 4AWSA 1V7YA 1JQXA 3QMSA 1P0KA 2VOMA 4XWUA 1L6YA 1SR9A 2ZFAA 4JEQA 3GKFA 2VEMA 3LTSA 3R89A 3TH6A 3VE7A 2ZQ0A 3NZ1A 4N9BA 3NQ7A 2NLIA 4N4PA 3BW2A 5AYYA 1EPXA 5LNWA 1TO3A 4OBTA 4O52A 4UUIA 3LCWA 5D2VA 4RKAA 1DOSA 2C19A 4KFOA 3FJLA 4OGZA 3MYPA 2NXHA 1B57A 3BW3A 3CHVA 3S5OA 3W2LA 4UTKA 1W3NA 3EXTA 4AHOA 4DELA 3LCGA 4CLMA 1VPXA 2PE4A 2R94A 5K9DA 4YCPA 1A53A 2NWSA 4GJ1A 2BTMA 4J9JA 1JCYA 2Y61A 3PC0A 2YW3A 2TMDA 4M7TA 1TPC1 4DEFA 5CSRA 5EPDA 3F1QA 4AAJA 1FBAA 3GXPA 3KVKA 4H6KA 3WFAA 3PG8A 1PE1A 3C2EA 4XBKA 2RKXA 1YDOA 1H5YA 3O15A 2VEPA 4ALDA 1DVJA 2QCGA 1VCVA 5C5YA 3U8GA 3G1FA 3HQ1A 2ZRVA 4LUJA 1SSDA 1PL9A 3MHUA 3W1UA 1T99A 2CZDA 1VGAA 4MJMA 2VFIA 1PIIA 3OA3A 5LSMA 1KV5A 2QCEA 3B0PA 4HN4A 4JY9A 1XC4A 1VYPX 4HKPA 4NUWA 2C3ZA 3IIPA 3LRKA 2TRSA 4NJKA 1ME8A 6TIMA 4GC4A 4JICA 2QAFA 4FIQA 1O5XA 1JCNA 3P61A 3NOEA 1OFAA 4O1AA 3NL3A 4JYFA 1ZY9A 3KHJA 2BWGA 1SO4A 3EKZA 3MW7A 5BMWA 3M16A 3MUXA 4LU0A 1G4EA 4R33A 2YSWA 1WXJA 3UWYA 4NZFA 3MP5A 3STEA 2WSRA 1D3GA 1KM2A 5HMSA 2Z2UA 3TK7A 3QMTA 3E0IA 3QJAA 5D2WA 3QEZA 3HGOA 3JS3A 4XKYB 1OYCA 2VFFA 3GDMA 4K8HA 1IXOA 1FCUA 4MFEA 3NQCA 1LOQA 4N4QA 1SZFA 1GT8A 3W85A 1TJPA 1C9DA 5LHFA 4LS2A 2Y88A 1OVDA 3GAYA 1OX4B 3PB2A 1P5BA 1SFLA 2FTPA 3PR2A 2ZTKA 4MZ1A 3S5NA 3CPRA 4ZQOA 4DXVA 3OIXA 2X30A 2ZZ6A 3E9AA 4DO6A 1K7EA 5I3IA 3ZWTA 3A23A 3W23A 1UUOA 2E1DA 4UMCA 4KWVA 1Z44A 3Q94A 3TFXA 1W54A 1W3TA 3MP3A 5K7JA 2VEIA 4X22A 5CPMA 1FXPA 1DV7A 3DKLA 3GDKA 3LHTA 5LHEA 4GUGA 3P74A 3JRKA 3TJLA 3FYOA 3IGUA 3DFNA 4WOQA 3P84A 5G2WA 3T4CA 2JGQA 3LI0A 2H6RA 2C16A 4GNJA 1R47A 2NXIA 5T26A 3P5YA 3NPWA 3PB0A 4QJ1A 5G5IA 5EY5A 1TV8A 1HUVA 1PCWA 3EX1A 2B0MA 2Y89A 3C6CA 5IBXA 1QPNA 2NUWA 1YXCA 3HGRA 3LCFA 1RPXA 3BARA 3W1PA 2F7FA 1BWKA 2C1HA 2QAPA 3NQAA 4RLIA 3PAJA 3N3MA 3W71A 3AO0A 1QR7A 3IVSA 1TB3A 3QPYA 1ZAIA 3HO8A 2AQWA 4LRSA 3LHYA 3GIYA 1SZGA 1UB3A 2I14A 3DFSA 1A5CA 4UTJA 3NPUA 3L0GA 3ZFHA 1JJKA 1T8XA 4NXSA 2E5BA 4MZ8A 3OVQA 2QCLA 3IIXA 2QF7A 3LV6A 1E51A 1QCWA 1EP3A 4UFMA 5TQLA 2TYSA 4WXZA 1JR1A 3GZ3A 5LNSA 3DI1A 1QO2A 4O13A 1KBJA 1EWDA 3BVJA 3P80A 4QAIA 5F1VA 3DAQA 1ICPA 2FPVA 2QDHA 3R2GA 4DO4A 1ZALA 4N6FA 3RNDA 4S2BA 2QUTA 1QMLA 4JN6A 3TV8A 4JX4A 4UTTA 4FF7A 4YCOA 3A5VA 4O11A 3DFPA 3QW3A 4LWWA 4ZMGA 3TW6A 1TTQA 3O63A 3QC3A 5DELA 3SR7A 1NVMA 3W7CA 3B05A 1GVOA 4M5PA 2DZTA 3UWVA 3LRMA 5F2GA 5AHNA 2ABBA 3BGGA 2FB2A 1Q45A 4FNSA 3W1NA 3W1LA 2YFNA 4UFHA 1F76A 4GE8A 3TX9A 1ZENA 3P60A 3LBMA 4IMDA 4O1CA 2PRMA 3KRSA 5DLCA 2C15A 1M7OA 1V5XA 2E6FA 5DXXA 1BTMA 2R14A 2GOUA 4DPPA 3G1SA 1TTPA 3O1NA 4UNLA 5AB3A 4Z1BA 2GQ9A 2H8ZA 2ATMA 3N34A 5FF3A 1Z41A 1KTBA 3NQFA 3P81A 3P5ZA 3O16A 2A4AA 1F5ZA 4AXKA 1JUEA 2QJGA 4FX6M 2J24A 5AHEA 3S5YA 2DZVA 1WOBA 4LW7A 1VS1A 2CFFA 3N2MA 5U7SA 3RF9A 3UYCA 1GYNA 3W1QA 4K39A 1J4EA 5KZDA 1TPUA 3G1AA 4ZZ9A 1EUAA 2XFWA 3DHDA 4MOZA 4NZJA 4LT9A 4JTSA 5HWJA 1ONRA 3C52A 3MYOA 4IPJA 2B7OA 1OFOA 1PHQA 4XBSA 1VCGA 3W70A 1FWRA 1TPVA 3NR0A 3NO5A 3M5XA 3NAVA 5K4ZA 1VZWA 4MUZA 3LCHA 4MIMA 3OVPA 2FJKA 4IMCA 4X3ZA 4LVGA 1PS9A 3TROA 5CSSA 2V82A 2PRHA 1LRNA 2P0OA 3W72A 4NJHA 3FLUA 1ADOA 1N7KA 4JIQA 4FNQA 3VCRA 5J5RA 1F6PA 1JUBA 1YTKA 3M0ZA 1SSGA 1N55A 2H90A 4AMAA 4Z1CA 3UWUA 5F2LA 2G5WA 4UMAA 5AHFA 3S8HA 1GVQA 2A85A 5KSWA 4RZ6A 3W7OA 3N19B 1XBYA 3C2OA 3KVLA 5KZEA 3SGZA 4KKXA 1X1ZA 1EIXA 4OV9A 2HSAA 2AAMA 4Y6GA 1G7UA 1J5TA 1H62A 4ORIA 1F73A 3BG9A 1EP1A 3WJZA 3G3MA 4LVBA 1B9BA 1LOLA 3S5ZA 2CLHA 1H7XA 5FF4A 5G2IA 4ICNA 3UXDA 4M6VA 4NJGA 4N9CA 1FY6A 3I6RA 4O10A 4D2JA 1JRBA 1RR2A 4Z1DA 3JR2A 3P67A 3EX3A 1Q3NA 3C0JA 2GJLA 5EL1A 4BFAA 1EX5A 4AVFA 4IMGA 1DORA 3FEMA 5D09A 3LHUA 3EWXA 4DBDA 3W2JA 1F7BA 1DQXA 5DBTA 3KVJA 3NG3A 1RV8A 3V75A 3SZ8A 2Z1BA 2CU0A 3S6DA 5J5DA 3UZJA 3LDVA 1QOPA 3GR8A 5D05A 3W6YA 4PH6A 2C6QA 3THQA 2DZPA 4YMZA 1LDCA 2R91A 3W22A 2CZFA 5I3JA 4S1FA 4HIBA 4LVDA 3ABRA 4HNNA 3NL5A 4UTLA 1XI3A 5DCDA 3QYQA 3N9RA 1DJNA 3NL2A 2Y7FA 4FHAA 2GUUA 4N2YA 3T55A 5F4WA 2X1TA 1IGSA 1EEPA 1ZNNA 4JDYA 2E68A 1KM3A 2PRLA 3IIZA 1FXQA 4IUOA 5G1TA 1MO0A 3S0CA 1TPB1 2CLOA 2BZNA 3MJYA 1KW1A 3W7LA 3WK1A 3N9SA 3AJXA 1GZGA 4FEZA 2A7RA 2Y7GA 3TSMA 1KFLA 2ZZ1A 1AL7A 1O60A 1OYAA 5FF0A 2QDGA 4YXGA 1FDJA 3GX9A 4K38A 1G4PA 1B3OA 1CX9A 3R5EA 1Y0EA 2Y63A 3LHWA 2J88A 1IXPA 5FESA 2ISSA 1LOSA 2VFDA 2X2GA 2YZRA 1TPDA 1O94A 3PUDA 2OT1A 4JTHA 3KFTA 4GUFA 4WOZA 1VYRA 4LVFA 4MLJA 1RD5A 1OFEA 4JNMA 4MYXA 4JIPA 1ZCOA 1I2NA 4JY8A 2ZDRA 1YTDA 4I9AA 2QCHA 1KM1A 4I7UA 1K3UA 3DKJA 5E0KA 3W84A 3B0VC 1F2JA 2CLEA 3Q2DA 4NVTA 1OK6A 2QUVA 3TAKA 1R30A 5D02A 2NXGA 2FPYA 2ZZ5A 3UQNA 1SZNA 1LLWA 3KX6A 1GVRA 4MPQA 3TIMA 1YXDA 3O8AA 2ZBTA 3TQ0A 3R12A 2O7QA 1FCBA 4MY9A 2DZXA 4IXXA 3CT7A 1G67A 2A7NA 2X1RA 3A24A 3LHVA 4P2VA 2BSLA 1OHLA 4IPIA 3W2KA 3O6YX 2CWNA 1Z42A 1K8XA 2VKZG 3T40A 3LLFA 3MMTA 3CIXA 4UTWC 1VYSX 2W79A 4AB4A 1OABA 5CZ0A 1TPH1 1ME7A 2TPSA 3OG3A 3MO7A 1XBVA 1OFPA 2JKEA 5MHBA 4PFMA 3W2NA 4QIUA 2CW6A 2A0NA 2G97A 3EX2A 2ZA3A 3EEGA 4K7YA 2DJLA 3L68A 3OEXA 4JD4A 4DBEA 2OCZA 3EWWA 2I1OA 3KVMA 3MI3A 2GPTA 5EBUA 5D33A 1SO5A 3Q37A 1K02A 3W83A 1SUXA 4PC8A 4NNAA 4WD0A 1W31A 4HSNA 4AF0A 3HG5A 1IXQA 4RK8A 4NJIA 3FOKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4R7O A;  4HT3 A;  1RJR A;  3GRI A;  4US5 A;  3UGV A;  1A0E A;  1BPL B;  2QPS A;  3NQG A;  3B9A A;  4BQ3 A;  1VPY A;  3EA2 A;  2ZC1 A;  1HL8 A;  1CGU A;  2BXV A;  2VR2 A;  3GBD A;  5C8B B;  4JTF A;  1KFK A;  3DHP A;  4QE1 A;  3AMC A;  2F61 A;  2EAW A;  2A3L A;  3M46 A;  2GSJ A;  4I5X A;  4D6H A;  5BXP A;  1UR4 A;  3T7V A;  1BGG A;  2ZUM A;  3L23 A;  1B0I A;  2VGI A;  3VIN A;  3CNY A;  4RNI A;  3GC2 A;  1XD1 A;  4FLR A;  3IGS A;  1CXL A;  1N2V A;  2HRW A;  1HL2 A;  3KP0 A;  3ZT6 A;  2WZT A;  1QWK A;  1HXJ A;  2INZ A;  2PU0 A;  3GYE A;  2PUR A;  3FKR A;  5I3G A;  1O5K A;  4M51 A;  3FHA A;  3MA8 A;  4PR4 A;  2EPO A;  3CB8 A;  1UJQ A;  2Q02 A;  4HZ8 A;  1B2Y A;  3ZJ8 A;  4H9M A;  3T81 A;  3B03 A;  1PYM A;  5CLW A;  2ZID A;  4Q7I A;  4DBW A;  1HVX A;  1KM5 A;  4LNY A;  3N6J A;  1HJX A;  4TIM A;  1UKT A;  1YPI A;  1ZB5 A;  4HU0 A;  3ITV A;  1YXY A;  2V5B A;  2ZWY A;  4GUJ A;  6PTD A;  2IQT A;  2R1P A;  3CB3 A;  4JTC A;  3BLD A;  4UTM A;  1KM0 A;  3TUU A;  4S3E A;  1K7F A;  3STC A;  2YLL A;  3I10 A; 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