4XUG | Genus

Total Genus 101

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	101
sequence length	267
structure length	267
Chain Sequence	MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of Tryptophan Synthase from Salmonella typhimurium in complex with 2-({[4-(Trifluoromethoxy)Phenyl]Sulfonyl}Amino)Ethyl Dihydrogen Phosphate (F9F) inhibitor in the alpha site and ammonium ion in the metal coordination site. rcsb
molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule keywords	Tryptophan synthase alpha chain
total genus	101
structure length	267
sequence length	267
ec nomenclature	ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date	2015-01-25

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00290	Trp_syntA	Tryptophan synthase alpha chain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4xugA00

1YDNA 4DF2A 4UR8A 2EPHA 4WXYA 2W6RA 1FDZA 1J2WA 4O18A 3C56A 2G97A 1ZAIA 3C3NA 3W84A 1LP6A 3UPBA 1TJPA 3W1LA 1SZFA 2JBMA 2TPSA 1FY6A 4GUIA 4WUIA 5CKSA 3BV4A 2X2GA 3N73A 2QDGA 4QAIA 1KM5A 4H3DA 4JICA 3O16A 3S1WA 2YR1A 3L9CA 5LNWA 1Q3NA 1JR1A 3NQ7A 1TPVA 4IX2A 2I9EA 1EUNA 1V5XA 4MYXA 1HL2A 2O7QA 3TH6A 1SQ7A 4IMCA 1UBSA 3W73A 3NQVA 3L68A 1LZOA 3CWNA 3TXVA 3WFAA 4O4WA 3W76A 1W3TA 1FUYA 2ISVA 2V2CA 3BO9A 5AYZA 2EHHA 5AHFA 3G1VA 4RK8A 5LKYA 3C0JA 5I3HA 1F5ZA 3R12A 3I68A 1G4TA 1Z41A 4MOZA 3HPSA 1WYIA 4X9SA 4FX7A 3BG3A 3PB2A 3W7NA 4JTEA 1EEPA 2RFGA 2QF7A 4UXDA 4MY1A 1PCWA 3LV6A 1QCWA 1XFBA 4AWUA 2GJLA 1DVJA 1FDYA 1EIXA 3GXTA 5K7JA 3CIXA 3KOFA 5GVJA 1FWSA 1BKSA 1GOXA 5A5WA 1NEYA 1LOSA 4K7VA 3JRKA 2ZA1A 2QDHA 5CZJA 3EWBX 4K7YA 3DKJA 5G1TA 3QW4B 1OF8A 3UY7A 1KFJA 4Q33A 3B0UX 2RKXA 3NVTA 4GC4A 1FCVA 2BLEA 1IXQA 3C2RA 3DHFA 3P8IA 4O1DA 4WQ6A 4OHQA 1MEIA 4ADTA 1X7FA 4B5NA 3W83A 2E09A 4MLRA 1BWKA 1VCGA 1JRCA 3G0XA 5CGQA 1JRBA 4S1FA 3NOEA 3A5FA 4QM1A 5D33A 3S1VA 5L6UA 4PA8A 4JY8A 2NLIA 2IQTA 1TYGA 2HSAA 5TBOA 1TPEA 1H1YA 1LLZA 4GUGA 4I7UA 5LHEA 3QPYA 3W75A 3ABRA 4O0ZA 5E1QA 4M6QA 1IXOA 1GPWA 2YX0A 4UFLA 3PB0A 1OK6A 1GG0A 4JTUA 5AHIA 6TIMA 2GOUA 2VFEA 2Y85A 4UR7A 4Y9AA 1D9EA 2CZEA 4QSHA 4HNVA 1SSDA 3S5ZA 4KWVA 4ADSA 1C9DA 5HUPA 3B8DA 4CNNA 4NNCA 4KFPA 4E0CA 4JIQA 2X30A 4O1AA 1Q6QA 3LI1A 1B57A 4LS2A 1TPC1 1O4UA 2CU0A 4XQ6A 3W1AA 2DP3A 4NZJA 4DO5A 2NXIA 1SW3A 3PWAA 4GWEA 4Z0SA 3Q37A 2FPTA 4UIOA 4JX5A 1QOPA 5D37A 4JN6A 4GUJA 3BW3A 4HSNA 4NJIA 5LNRA 4TMBA 2GQ8A 3FYOA 3U8GA 4XBKA 2RH9A 5LGXA 1TRIA 1ME8A 2NX1A 3MI2A 1KTNA 2B0MA 3ANYA 1Z42A 4I7WA 2ABBA 5G5IA 4RR4A 4CCEA 3P67A 2ZCGA 3FA5A 2V2DA 3TMQA 4RXFA 4RV8A 1H62A 4R7JA 4O53A 4ONVA 2LLEA 4MFDA 4K37A 3CB8A 3MMTA 5DLCA 3CQ0A 4IJBA 2CZDA 3KXQA 1ZY9A 2W79A 1ML1A 4ZQRA 5EPDA 5AHLA 3DFNA 3W1MA 3IVTA 4LC6A 1SZNA 2Z0IA 4DBEA 3OBKA 3SR7A 1TB3A 3LTSA 1GTEA 4FNPA 4LU0A 3LCLA 3M9YA 3WJSA 5D30A 2EF9A 4LV4A 4O54A 4UTJA 4WZHA 5FF3A 4LS1A 4EF9A 1HO4A 4O52A 1R47A 2VENA 5U7SA 5K4XA 2Z1BA 2ZA2A 2AQWA 4A2RA 4E38A 4NX5A 3PC0A 4ZQNA 3TU9A 2OZ0A 2ZZ7A 3EKZA 1ALDA 2V0TA 1GVQA 2EKCA 2YDAA 3BGJA 3T4CA 4PTNA 1QPOA 3AJXA 3CT7A 1KW1A 3HGRA 5BW6A 1W5MA 2A21A 2E68A 1VLIA 3IIZA 1YLVA 3DAQA 1LBLA 3G3DA 1QR7A 1T96A 1K8XA 4H6KA 4M6PA 3UNDA 3PBWA 2AAMA 3INPA 4WOZA 5KITA 1QWGA 2H8XA 4EWND 4HT3A 4ICNA 1TPFA 2YXGA 1SFJA 1JQVA 4GXMA 4LWWA 3SIZA 3PY2A 5FEZA 3A5VA 1P5BA 2JKEA 1I2RA 2BXVA 2J6XA 2WNZA 2QCDB 1O95A 1FQ0A 3O07A 3TE9A 4QNEA 3A24A 1GVOA 3G18A 4ZQPA 3P5YA 1F6KA 3LXAA 3RLUA 5U4NA 2QCDA 3THQA 3W2MA 5C55A 1XL9A 5AHEA 1I2NA 1IGSA 3P80A 3TMLA 2XN2A 4DPQA 2YW3A 1FWRA 2C19A 1VYSX 4JTGA 3DENA 3G1FA 4Z08A 4JTLA 4NXSA 3USBA 3W1TA 4ZL1A 3MJYA 4N9BA 1H7RA 5D32A 4HNUA 3IVSA 3L0GA 1XXXA 3MO7A 5TIMA 4UFKA 1VHCA 3NO5A 1VYRA 4ORIA 4O10A 1JCNA 3STCA 3STEA 3HGSA 1VZWA 4JEQA 3FIGA 2XFWA 3ZWSA 2V8ZA 4OV9A 4AAJA 1OFEA 1PS9A 3SW6A 4JTKA 3NQ8A 4TMCA 2YCEA 3MI6A 3S42A 1K7XA 4AWTA 1AW2A 2ALDA 4K38A 3H54A 5KZEA 4OU1A 4EF8A 1MO0A 1VCVA 5BOOA 4UTHA 2JKPA 1OFAA 4P2VA 1SW7A 1GJPA 2E6YA 1TMHA 5AHMA 1A5SA 3EX4A 2HMCA 3C2VA 4XUGA 1BTMA 3LCGA 1CX9A 1K02A 2WPBA 4FF7A 4TO8A 4UFIA 3W7GA 1PHQA 1THFD 1VS1A 3G8RA 2GVLA 3UZ5A 3GDKA 1TQJA 4IXHA 3OVQA 1QPQA 4YXGA 3UWVA 4UC5A 4UTWC 3TDFA 1GQNA 1A5CA 4KKXA 3L65A 5DXYA 3LB0A 1LM1A 4IMFA 4IMEA 3QJAA 4TIMA 1I4NA 5D03A 1XBYA 1LYXA 1SFLA 4MUZA 2GQAA 4WD0A 3PSWA 3M47A 1PL9A 5F2LA 2QJHA 1ADOA 3F03K 1JUEA 3W7RA 3VI2A 1YXCA 3TCEA 1J5TA 3KVMA 3LHYA 2P0OA 3KHJA 2GVJA 3M0ZA 3MHUA 1IF2A 1W3NA 2CLKA 3QSRA 4R34A 2A0NA 3BLIA 3E9AA 1UCWA 3PSVA 1I2QA 4BWLA 4N2YA 1XUZA 5I3GA 3DI0A 1DHPA 4N02A 3NEVA 3STFA 5LNSA 1OFDA 3EX6A 1PCKA 2I14A 3LCIA 3KRZA 5D09A 2BTMA 3LXBA 2X1TA 1TTPA 3LI0A 3CEUA 5DBUA 4FXSA 3NYZA 2DJXA 1OYBA 3L2IA 1EWEA 5I3JA 2A4AA 1SSGA 2FFCA 5D2VA 3W7PA 1RD5A 3QC3A 4NXKA 1AW5A 5EKYA 1QO5A 4I7VA 3TQ0A 3STGA 2PRMA 3L5LA 1Q45A 3QSTA 1XBVA 1TPWA 5I3IA 3SFKA 4MJZA 3TR2A 3GR7A 3LCHA 5C6MA 4JGDA 2ATMA 2ZRWA 4FNSA 1FXQA 4LVFA 3MYOA 2FJKA 3FJ6A 3OHIA 3NQGA 2XN1A 1MZHA 4PODA 2Z6JA 5EY5A 1KM1A 2QEZA 2VFDA 4ZZ9A 4NQ1A 1K8YA 1YPIA 5G2IA 4JXCA 2RDUA 4FXRA 1S5VA 1W5QA 2J9YA 3JR2A 5AFDA 2NWSA 3HMJG 4JYEA 4NU7A 3S0CA 3BVJA 2A85A 1OHLA 2NWRA 4D2JA 1W5PA 5HWJA 3HGOA 1UUOA 4E2DA 2RDTA 2WNNA 5BRBA 1WAUA 1OJXA 1FBAA 4M7SA 4FNUA 1KM0A 1H7NA 2V2HA 1XM3A 3TKFA 2VC6A 3G1AA 3E02A 1JUBA 2GQ9A 2QUTA 3MYPA 4LY8A 5F2IA 4EOUA 5MHBA 4BK9A 4O11A 3FOKA 5FESA 4N6FA 4NZFA 2X1RA 4RJEA 3DKLA 3NQ2A 2ATSA 3HO8A 1A50A 4XTIA 1JCJA 2VXNA 4HNNA 4Y6GA 1NVMA 4IWWA 2V5BA 3ATZA 2X1SA 1B4KA 3A9IA 1G67A 2WOQA 3T40A 2TYSA 3BW2A 2J9XA 1RZMA 1LBMA 3LDVA 3UWYA 4O28A 5EA9A 3U6WA 1WXJA 3NAVA 1KM3A 4HKPA 3PUEA 3WJYA 4JTTA 2J24A 4X2RA 3W22A 1WA3A 1TTQA 3O6YX 1MSSA 4WJEA 4BWLC 2DZWA 3MWAA 1NAL1 5BMXA 3W9ZA 3GDTA 5D04C 2C3ZA 3T78A 4JD4A 4LV9A 3LX9A 4CQAA 3RNDA 5CSSA 4QISA 3LHWA 1VR6A 1GTHA 4M19A 4OT7A 1XBZA 2ZZ2A 2FB3A 5F2GA 4NT0A 3W2KA 5F4XA 2Y6ZA 2BSLA 2JGQA 4MZYA 3RLVA 1WOAA 3BG5A 3EX2A 3W7MA 1QPNA 4ML9A 4X22A 2ZDRA 3G8EA 4LRTA 3O05A 3W6YA 2YGYA 1W5OA 4JYFA 4OWGA 2VFFA 4GBUA 1FWWA 1OX6A 3LV5A 3W7HA 3LLFA 1SO3A 1LRTA 3CLMA 3C52A 2RDWA 3SJ3A 5F4SA 3QH2A 4LUJA 1CI1A 2FLIA 4U28A 4XTDA 3HBLA 3IEBA 5HJLA 1K8ZA 2CLLA 4HPXA 3DBPA 2WSRA 3D0CA 4KFNA 2E1DA 2FPVA 3LCXA 1EP1A 2Z6IA 3S9YA 3M5YA 1JCMP 1L6SA 1K3UA 5IBXA 1GVRA 4UFJA 4Q4KA 1T0OA 2UV8G 5DCEA 4EIVA 1X8FA 4LVAA 4MKNA 3W87A 3BPWA 1VC4A 1TQXA 4JDYA 3C6CA 3PR2A 1YXDA 5J5RA 4JY9A 4JTJA 4JR5A 4UTUA 1ZAHA 4AHOA 1FWNA 2TRSA 1XBXA 1S5WA 3T44A 2PRLA 3VE9A 1GVFA 3NR0A 2CLIA 5I3KA 5H91A 2QKFA 4ZQMA 4BI5A 4NNBA 3HG4A 1SUXA 3N2MA 2W0UA 4HN4A 3W2JA 2QCNA 3NQEA 4BF9A 5J5DA 3UQNA 1DJQA 1VGAA 3C2OA 3MW7A 5CPNA 3L21A 2Y63A 1EA0A 3TIMA 1FDJA 3MP5A 2H3DA 4FNRA 1AG1O 5DY3A 3N9RA 4OQVA 3HF3A 2ZBTA 5AC8A 3M5VA 3N34A 4PL1A 4BFAA 2V9DA 3M5ZA 1AL7A 1LCOA 1KM4A 1S3HA 1LDCA 4O4VA 3C8FA 4GNJA 1JJKA 1XKYA 1ZENA 3M16A 3B0VC 2J27A 2YZRA 3EXRA 4UFMA 4LVGA 3EX1A 5D2TA 4HNTA 1KFKA 4JX6A 1P4CA 3GDLA 2FQIA 1XDMA 5FF2A 2GVGA 2Y7GA 5DBTA 1ZALA 3LOTA 3TFCA 1EWDA 4BI7A 1OG0A 2B4GA 3M43A 1GWJA 3UPWA 2A1YA 4N4QA 3PG9A 4ORMA 4UTKA 1WBHA 4QNWA 3M7WA 2H3BA 4XBSA 3BK0A 4ADUA 4DXVA 1M6JA 4O1CA 1WOBA 2I1OA 2Q8LA 3T55A 2CLMA 5F1UA 5CPMA 3W3OA 4YCPA 1QO2A 3SECA 3UWUA 1GEQA 3W71A 3DZ1A 3N2XA 4PEKA 3UWWA 3NL3A 5C54A 4M5PA 1KM2A 3PAJA 1VLWA 3OIXA 2C16A 4O50A 5D2XA 3EWWA 2QCHA 2VFIA 1HUVA 4XWUA 4YLWA 1L6WA 5IBXC 3TSMA 2C15A 1XC4A 2A6NA 2GJNA 1QPRA 3MI3A 1SO5A 1Q6OA 3F1QA 2DZTA 4AF0B 4CNPA 4Y96A 1TPH1 4TX9A 1EUAA 2H6RA 2H90A 2ISWA 1P0NA 2YFOA 4AF0A 2NUWA 3I6RA 4POCA 2V5LA 3K30A 3IVUA 2ZRYA 3CM4A 2WJZA 3QYQA 3O8AA 1DQXA 1KBIA 4UTWA 4FIRA 5AHNA 6ALDA 4U4MA 2DZSA 1GT8A 1MXSA 1GZGA 2ISSA 4DQWA 3NG3A 3EX3A 4QJ1A 4R33A 1F74A 3GNDA 3H53A 4WY0B 5EBUA 1RQEA 1C8VA 3EEGA 5DN1A 3G1XA 3C4UA 3M6YA 4IPIA 4WY0A 2FB2A 3MBDA 2P1FA 3MHGA 3UWQA 5D2YA 3W7IA 4HSOA 2ZQ0A 1TIMA 1PHWA 1W3IA 3S6DA 5HR7A 2ZRVA 3YPIA 1SO4A 3WK3A 3C2EA 4DF1A 2CFFA 4TU1A 3TAOA 2E6DA 4EVZA 4TR9A 3TNOA 3W88A 1LTDA 5HINA 3W72A 3WK0A 1SR9A 4RLIA 1OK4A 3NQ6A 1LOQA 5E0KA 3W23A 5D38A 5K9CA 1ZFJA 3LCWA 3I7SA 3MP4A 4ZQCA 3BLEA 3FKRA 4WX2A 3T7VA 1OF6A 4HIBA 4UTIA 3W74A 1M7OA 3W70A 3LRMA 5KTLA 4UMBA 1H51A 3IIPA 3VCRA 2CZFA 2Y89A 3W7JA 2WSQA 3NPXA 3W7OA 1XUUA 1A53A 1DL3A 3TC7A 3Q94A 3ZFHA 3PUDA 3P84A 1WV2A 3EKLA 1MEWA 3W86A 2G5WA 2KZHA 5CZ0A 3L67A 3NQFA 1H63A 4Y90A 5DY2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4XUGA

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