4Y6GA

Crystal structure of tryptophan synthase from salmonella typhimurium in complex with n-(4'-trifluoromethoxybenzoyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f6f) inhibitor in the alpha-site and beta-site.
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
268
structure length
257
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Visualizing the tunnel in tryptophan synthase with crystallography: Insights into a selective filter for accommodating indole and rejecting water.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 96
structure length 257
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2015-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4y6gA00
2C0AA 5U4NA 1LP6A 5LGZA 3DZ1A 1AL8A 4A3UA 1GVSA 1T0OA 3CU2A 3NQVA 4BR1A 2LLEA 1KFEA 4JX5A 1JVNA 1H60A 5BMWA 2Y85A 1N7KA 5F4WA 1VHNA 2CWNA 4LVFA 3PUEA 2H3DA 4JTUA 2ZA3A 4AWSA 3FKKA 3HF3A 4O18A 4S1FA 4GUIA 1EWDA 5G2IA 1W5PA 1ICSA 2WO5A 2YSWA 1D9EA 4ML9A 3UWUA 3GIYA 3W7KA 2PRMA 3CEUA 1MEHA 1TV5A 4EF8A 1TQJA 2ISWA 4K36A 5DY2A 1OFRA 4ADTA 3OEXA 3TFXA 6ALDA 3R89A 3EWWA 2X16A 5CPLA 4QAIA 3TQ0A 3C6CA 4MLJA 4BK9A 2ZZ4A 2J9XA 2QCEA 1X8FA 1XBVA 3NPUA 4Z1AA 5FEPA 1W0MA 3V1PA 1GVFA 4ADUA 4LNYA 3BGJA 4K7VA 3EB2A 3MI6A 1MEWA 4RKAA 2FTPA 2Z1BA 5G4EA 5KZDA 2OJPA 4X2RA 3FLUA 1TQXA 2QCNA 2VFEA 3HPSA 1Z48A 3TFCA 5BRBA 3PWAA 5LNWA 1XCFA 1D3HA 1X6UA 2ZA2A 4HSOA 3QH2A 1XUUA 4L4LA 1KW1A 3IIZA 1TPDA 3NDOA 4CQAA 1AG1O 4IMEA 1M6JA 5C54A 4NXKA 4LS0A 1YLVA 2NV2A 2QF7A 4DPQA 3MP3A 5AHNA 3LDVA 3SGZA 3W1LA 4X22A 1LROA 4DQWA 4HNTA 3USBA 4KFPA 1GOXA 3R2GA 3C56A 5DN1A 5F2GA 1YDOA 1RZMA 3G1AA 1WBJA 2E6FA 3L67A 3NQDA 4EWND 3NO5A 3I7RA 5J5DA 4ZMGA 4TMCA 1C8VA 1R2TA 2I9EA 3R13A 4UFJA 4N9CA 3D0CA 3SJ3A 2CLHA 4NNBA 2CFFA 4H4IA 2GOUA 3CQ0A 3H53A 3GDRA 4B5NA 1H7NA 3ABQA 4JY8A 3LTSA 4UTTC 3SY5A 1AW5A 1KM1A 5G1TA 1MEIA 1EUAA 3S5NA 3WJSA 1TMHA 4HSNA 3KAOA 3P8JA 4O0KA 4X3ZA 3FA5A 3MJYA 3P5ZA 4LC8A 1IIHA 2Y63A 4UIOA 1B57A 3KOFA 1H61A 4PEKA 3STEA 4A29A 3M5ZA 1PCWA 1TV8A 1OVDA 4O8RA 4H3DA 4LRTA 2A85A 3S5YA 2DJLA 1FWTA 3F1QA 1L6YA 4LS2A 3HGSA 1AW1A 5LKYA 1HG3A 4K6AA 4PH6A 1NF0A 2UV8G 3S1WA 1ZFJA 4RZ5A 4HHPA 3MBDA 4JIPA 1P1XA 1H63A 1LOLA 4O14A 3EXSA 3EWYA 5KZEA 1WYIA 4NJJA 2GVGA 1SZNA 3R12A 5EY5A 4IOTA 5K9CA 3PBYA 3NQCA 2E77A 1W5NA 1HO4A 4K7YA 3S1UA 3BVJA 5AHFA 5D33A 4LV9A 1H51A 4D2JA 1WXJA 2HS6A 5C5YA 3LM7A 5F2IA 2CLEA 3BW2A 1UUOA 3DU0A 3KVJA 4WXYA 4YWIA 2Y62A 3Q94A 1VPXA 4FX7A 1DQXA 1GVQA 5D32A 1TPWA 1OF6A 3DAQA 3W6YA 1W3IA 3G1SA 1T99A 3GDTA 1I8JA 5HWJA 2V2DA 2TPSA 3NZ1A 2A7PA 3DBPA 5KITA 3B06A 3HOJA 3KFTA 2NUWA 3PF3A 3YPIA 4TU1A 3RLVA 2ZZ7A 3BV4A 4A22A 1LORA 3N2XA 2ZRYA 4JYFA 4NNAA 2E6AA 3FYPA 3NR0A 3K30A 4WQ6A 1FQ0A 1JR1A 1TRIA 2XN2A 1KFLA 1THFD 1SSDA 4JN6A 1XDLA 4LWWA 1W8SA 2A2IA 3ZWTA 4I7WA 1H7OA 1PVNA 2GVLA 3KVLA 3W23A 3T55A 4DELA 4LUIA 3C2VA 2E6YA 1OK4A 3NEVA 5AN7A 4GNJA 2BSLA 2V0TA 3B4UA 4JDYA 4CQ9A 5FEWA 3LCHA 3MHGA 1TTJA 3AJXA 1L6WA 2FPYA 3NOEA 1JUEA 3LCFA 2VKZG 3LBMA 1H7RA 4GUFA 5G2HA 4LUJA 2Z2UA 2RKXA 3GDLA 5LHFA 3BLFA 1VRDA 1YTEA 2QAPA 3VE9A 4ICNA 3NZRA 2V82A 1MZHA 4Y96A 4DF2A 1HUVA 4WY0A 2IQTA 3QPZA 5EA9A 3W1UA 4N6EA 2NX1A 3HGOA 4O52A 2X1RA 4JIQA 1GT8A 3GYEA 5DXXA 3LLDA 1G6CA 1FCVA 1LBLA 2Y7GA 4O13A 4JX4A 4JD4A 1BEUA 1KFCA 2DZPA 2FB2A 1DKWA 2DZUA 4Z1BA 1G7VA 3W73A 4UC5A 4LV4A 1H50A 4O57A 1PCKA 4Z1DA 4WXZA 1SO6A 3T4CA 4N6FA 2WSYA 1X7FA 5AHEA 4Y6GA 2QJGA 2GVJA 1BWKA 3FKRA 3GXNA 5HR7A 1C29A 2VELA 1L9WA 1WX0A 4AF0B 1F6PA 4DO5A 3LTPA 1XBZA 3W7GA 3DENA 1JJKA 4FB7A 2V5LA 1A53A 3G8RA 3O07A 2V5BA 3IIXA 3G1XA 3G1HA 4M6PA 3U6WA 3QW4B 2ALDA 1VJIA 2QCHA 5D03A 2QCMA 3PY2A 4XUGA 2EF9A 3QMSA 4JTIA 4UMCA 1J2WA 4NUWA 4FF7A 1ZNNA 1PE1A 4O12A 3TU9A 1O94A 5AFDA 3QSTA 3TW6A 3I7SA 1QAPA 4GJ1A 3HMJG 3UXDA 3FJLA 1CX9A 2DZVA 5D2VA 1VR6A 2Q3RA 1Q3NA 4M7TA 3BW4A 1OFPA 1QWGA 4ZQMA 1OG0A 5HUOA 1KM2A 4A21A 3LCGA 1UCWA 4HPJA 4Z08A 5F4SA 3MBFA 3IIPA 3T44A 1JRCA 3STFA 3G1FA 3NL6A 3FOKA 4MOZA 4RZ6A 3P7YA 1GTEA 3W7LA 3B03A 1OFAA 1TPVA 3CB8A 1WBHA 2PRHA 1Z42A 1LBMA 3SFKA 4AWUA 5AOUA 3ATZA 4DPPA 1SO5A 3FS2A 1WDWA 1R46A 5CZSA 5HINA 3NPVA 1XDMA 4GWEA 1SO3A 3QQ0A 5LNUA 1ADOA 4IGHA 4FNSA 3B8DA 4HNUA 2DORA 5HWNA 2G97A 4R53A 1OFBA 5I3HA 1K7EA 3P84A 3UY7A 3QPYA 3ABRA 2GQAA 3QEZA 2R14A 4XKYB 3O6CA 3LHWA 3STCA 3IIOA 3RFAA 4AF0A 1Z41A 4NVTA 4M19A 4C1LA 3W07A 4LW7A 1KLZA 1QOQA 3QF0A 5KSWA 2FJKA 1QDSA 2WJZA 3WK3A 1CW2A 4LOCA 3W84A 2QKFA 2CZEA 4FXSA 4CNOA 1HTIA 3UXAA 1KTCA 1SZFA 4O1CA 1EP1A 3GR7A 2ZZ1A 1GVOA 1BKSA 3W7DA 3UWZA 1KTNA 4IMGA 5D2TA 2ZBTA 3L68A 4LT9A 1EX5A 1EWEA 2VXNA 3N9SA 3W7OA 4P61A 1S3HA 3G3DA 5K9DA 3MYPA 3GNNA 1R2RA 4PC8A 3OA3A 5AB3A 1O4UA 2NV1A 5EPDA 1LZOA 1QFEA 3QFEA 1JQXA 2V81A 3CTLA 3KRSA 1VS1A 2JKEA 1W56A 1FBAA 3LHZA 4GFSA 3ELFA 1K8ZA 4OV9A 4O4WA 4M6VA 3EX6A 1TREA 4JYDA 3WK0A 3C8FA 3HQ1A 4LC6A 6TIMA 1IGSA 2W6RA 3N19B 3TJXA 4E2DA 5CZJA 1OYBA 4NU7A 1TYGA 1XFBA 5LNRA 2RDUA 2RFGA 1F76A 3TJLA 4NNCA 5FF0A 4JS3A 4YCPA 3HPZA 4FNPA 4BI5A 1XL9A 3M1ZA 3MP5A 3UD6A 4O16A 1Y0EA 4YCOA 5E93A 1SFJA 1TPFA 1VCVA 3G1YA 1GG1A 3ATYA 1KM4A 4E38A 4XKYA 3W70A 2HMCA 4DF0A 4IWWA 1EUNA 1EIXA 1F7BA 8TIMA 3HGRA 4I7VA 1IXOA 1O60A 2EHHA 1OX6A 3LERA 4N9DA 4CCDA 1OJXA 3A5FA 3BK0A 3GDMA 1OK6A 3CT7A 1VYPX 7TIMA 3E0IA 4ZQOA 3UYCA 4UR7A 4N4QA 4ORIA 1VCFA 3C2RA 1LTDA 4QM1A 4NZJA 5K4XA 2P10A 3A21A 2EGZA 4DO6A 2CLMA 1GQNA 3TC7A 1HO1A 4RK8A 3NL3A 3ZFHA 5K4ZA 1P5BA 2QCCA 4UTLA 5EKYA 3QZEA 4W9TA 1XKYA 2E09A 4O28A 2A0NA 4MUZA 3V75A 1WV2A 5CZTA 3S0CA 4XBKA 4H6KA 2W0UA 1YTDA 5HQEA 1GEQA 3WJXA 4KWVA 4MY8A 3UWVA 1ZAJA 1ZY9A 1SW3A 1FDYA 1EA0A 4RZ4A 3LOTA 3OG3A 1WQ5A 1FUYA 1H7WA 2XFWA 2BLEA 2X1UA 3DFNA 2WNNA 3FEMA 5HUPA 4IX2A 4PL1A 5C55A 1F74A 4A2SA 4IX0A 2FLIA 2I14A 3EWXA 2QDHA 3SW6A 4FNTA 1G4SA 5LSMA 3LCIA 4HN4A 3BPWA 4CCCA 4OHQA 2ZDRA 3G1VA 4TR9A 4HNNA 1QCWA 1ME7A 5AYZA 4CNPA 3WJZA 3EKZA 5A5WA 4PCFA 1TPC1 3GDKA 3VI2A 1LOQA 3W7MA 2WNQA 3L0NA 3L66A 4WOQA 4FX6M 2KZHA 4UTHA 3W74A 4JTKA 2CZ5A 4DBDA 4JR5A 2V8ZA 4IMCA 2ZRVA 4FX8A 2Z6JA 1JCXA 4MKNA 3E49A 4Q33A 2CZDA 5D04C 3W1NA 4IPJA 1K02A 2TRSA 4IQLA 3GNDA 1FWNA 4UTIA 3S1XA 2ZTKA 3BG9A 3W1AA 2ZRZA 4QSHA 5LHEA 2AAMA 3MO7A 5AC6A 4A2RA 4M6QA 1TPH1 3TROA 1ONRA 4NQ1A 1JCJA 3M5XA 5FF7A 2PRLA 5FF2A 3TSBA 3B0PA 2JKPA 2CW6A 5D2YA 1WAUA 1YDNA 5AHIA 1QNVA 3QYQA 1KFBA 1H5YA 3LGEA 2VEKA 3LXAA 1GTHA 1K03A 2E6DA 5DCDA 4JDBA 2WNZA 2QEZA 4JTGA 3GR8A 1R30A 1PHWA 4DBEA 3L65A 1GWJA 1F73A 3MYOA 4RV8A 3DKJA 3TKFA 1TB3A 1QO2A 2VFFA 4O1AA 3RNDA 3EXRA 2RH9A 4E0CA 3FIGA 3RF9A 1KTBA 3T40A 3F4NA 3P82A 1P0KA 1NEYA 5K9XA 1JCMP 3JRKA 3A24A 1FWRA 1E51A 1LRNA 2A7RA 4Y8FA 5I3KA 1ALDA 1RQBA 4UTJA 4GE8A 3O6DA 3DFSA 3L5MA 2YFNA 2NUXA 1G7UA 1K8XA 5FESA 4O54A 3KVKA 1SO4A 1X1ZA 1IXNA 1LBFA 3PR2A 3TH6A 5MHBA 1UBSA 4RCXA 3W85A 4JTJA 1TJPA 1RQHA 3NQMA 4WY0B 4NJKA 1PL9A 2PCQA 1FY6A 2NX3A 1FX6A 2C13A 3M44A 4R34A 3IVUA 4QJ1A 5ABTA 2I1OA 2FFCA 3HJZA 1SQ7A 3PC0A 1YPFA 1DJQA 5CGQA 3CC1A 3CWOX 1JUBA 3CWNA 4QISA 1OF8A 3E9AA 1QR7A 5D30A 4O10A 3HB9A 4FNRA 4N02A 3NM1A 1HFBA 4OGZA 1A50A 1Q45A 3MHFA 3PG8A 5CPOA 3MMTA 4UFLA 1GVRA 1KFKA 2QCGA 2Z6IA 5TQLA 3TAKA 1S5WA 1TPEA 2EPHA 3PBVA 2HSAA 4OWGA 1RVGA 1YDVA 3M41A 1U5JA 3CHVA 1TPUA 4JGDA 4PODA 4TO8A 1XC4A 4JTLA 3GXTA 4XTDA 1EEPA 2VFDA 3DFTA 1WOBA 2ZA1A 1MO0A 2C3ZA 3E96A 3GVGA 5EL1A 1UUMA 3EX2A 1RR2A 4UFHA 3TCEA 1VYRA 2TSYA 4Q32A 1JUKA 1OYAA 3NXFA 4O1BA 4OQVA 3VE7A 4AWTA 5CPNA 3L2IA 2ZZ6A 2ZRXA 4TX9A 3LCLA 3EWBX 3MHUA 4O50A 4CLMA 3PSVA 2CLOA 3H54A 4EIVA 5I3IA 3ZWSA 3MW7A 4UTUA 1GYLA 3PVFA 4K39A 2FQIA 3R8RA 2ZYFA 4AH7A 4DO4A 3PG9A 4POCA 3B05A 3PAJA 4Y9AA 1BTMA 2C1HA 2YW3A 1Q6RA 3KX6A 2B7NA 4OU1A 5AYXA 4BF9A 3NPXA 3TR2A 4U28A 2H8ZA 4R7JA 5G5IA 3SZ8A 3NPWA 1YADA 3SR7A 1QPNA 4YXGA 4ALDA 1QMLA 1W54A 3W7EA 1K7FA 3HG5A 4X9SA 3O05A 3UZ5A 3S5ZA 3L0KA 4K37A 3G22A 3TMLA 1Q6LA 1IXPA 2J9ZA 3RMJA 2X2GA 2Y6ZA 2ATSA 2ZZ3A 3L5LA 4UNLA 5TBOA 2VOMA 3O06A 2X1SA 3PB2A 1F05A 4FIRA 2WKJA 2QCDB 1A5AA 2FB3A 3G0XA 2VEIA 3LCWA 5FI8A 4UTWA 1GPWA 1BWLA 2ZTJA 3JR2A 5EYWA 3SGUA 2A6NA 2C19A 2VFGA 2J27A 4MY1A 3TXZA 3I68A 1SZGA 3T78A 2G95A 2V2CA 1JRBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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