4Z0SA

F96a mutant of plasmodium falciparum triosephosphate isomerase
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
ARKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHAERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Connecting Active-Site Loop Conformations and Catalysis in Triosephosphate Isomerase: Insights from a Rare Variation at Residue 96 in the Plasmodial Enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 87
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4z0sA00
3O63A 4NJIA 4AF0B 1G6CA 5F4WA 4ZQRA 4O54A 1SPQA 2E09A 2NZLA 3G1DA 4LVFA 5KZMA 4TO8A 3BW2A 1EP1A 3R13A 1VLIA 4ORIA 3NQ6A 5DY2A 5AOUA 4N6EA 3M6YA 3P67A 2B7QA 3QF0A 3LV6A 3HJZA 1JCYA 3E49A 1K3UA 3SZ8A 1OFPA 5U7SA 3TDFA 1S5TA 3NQCA 5FF4A 4RV8A 3EWYA 5C54A 5F4SA 4O1DA 1ICPA 4O13A 4K38A 3HPSA 2ZRUA 1YXYA 4DO4A 1Q3NA 2A7NA 4NNCA 3OA3A 3OVRA 2VC6A 4EVZA 1WX0A 4FNTA 3LLDA 3EX3A 1F6KA 1MXSA 4LVDA 3W9ZA 2DORA 1FCVA 1C8VA 3HF3A 4OU1A 4XUGA 2DZTA 3NEVA 3W2MA 2WV8A 3G8EA 1OFAA 3C0JA 1I2QA 1ZALA 4E2BA 3L0NA 3WJWA 1TSIA 3QPZA 5G1TA 4A21A 1GT8A 1TQXA 4NJHA 2R94A 3PB0A 4MFEA 2JKEA 1PL9A 3QH2A 4YCPA 3W1AA 4UR8A 4FEZA 1F2JA 3NM3A 4DF0A 1W5MA 3VKJA 4Z1DA 3B4UA 1ZAJA 4C1KA 4GRSA 4O17A 3LRLA 1VCVA 4JTHA 1YTEA 1VCFA 3LXCA 4TMBA 5HR7A 2FJKA 4LS0A 1PV8A 1TPWA 4JY8A 5EPDA 1QPNA 4FNRA 3O16A 3S1UA 1L6SA 1QNVA 1VH7A 3MI2A 5AHLA 2YGYA 2V5BA 1FDJA 1OK6A 4IX0A 1I2OA 3GR7A 3E9AA 3W1QA 5LGXA 3ABSA 4NX0A 3FJLA 3OVPA 3SSJA 3FKKA 5D04C 3W07A 2YR1A 2B7NA 3SIZA 3Q58A 1LBMA 2Q3OA 3EKLA 5AHMA 2Y85A 1XDLA 3N14A 5AC8A 3EWWA 1P1XA 4YCOA 3LGEA 1K02A 2A6NA 3IGUA 2A0NA 3UWUA 3W7HA 2YDAA 1MEHA 1MZHA 1O4UA 4O14A 4BF9A 2TMDA 4JTSA 2RDWA 5FI8A 1VCGA 1XL9A 1R47A 1THFD 4QNWA 4P61A 3W7MA 3HGOA 7TIMA 3B0UX 3QMRA 2F7FA 3LOTA 2IQTA 5IBXA 1EA0A 3DKJA 3PF3A 4K6AA 3FIGA 3CWOX 3UXDA 3BVJA 3ELFA 4FF7A 3L66A 3O6CA 1L2UA 3W72A 1GYNA 1W0MA 1OX6A 1W5PA 5G2IA 4RXFA 1RQBA 4XZ9A 1VHCA 5LSMA 5CSSA 1TV8A 3GDRA 2QR6A 1GYLA 4IJBA 2Y6ZA 1LBLA 2G5WA 3LHZA 4HIBA 1VYPX 4E38A 1PIIA 2EKCA 3KXQA 4TR9A 2C14A 3LTPA 4PL1A 2A21A 3OEXA 4M5PA 3G1FA 3G1YA 2HS6A 3P84A 2PRLA 5E93A 4LS2A 1TREA 1OF6A 3TW7A 3L68A 4MVAA 1BWLA 3G24A 2CLHA 1FWTA 3LCHA 4LY8A 4OE7A 4QAIA 1H1ZA 3TE9A 3TJLA 5G4WA 3I68A 3VCRA 1CX9A 1TRDA 1OYCA 1DJQA 3DFQA 4CLMA 3L5LA 3EWUA 4EF8A 1Q6QA 2A2IA 2O7QA 1I2NA 4QNEA 4WOZA 1HUVA 3C61A 3GXTA 3W1TA 3HG5A 1DQWA 1NEYA 3BLIA 3P5ZA 1EIXA 3BO9A 4HT3A 4OWGA 1R2RA 1S5WA 4O1CA 4OQVA 5I3FA 1OX4A 2C13A 1JCJA 1WOAA 4PODA 5K9DA 2ABAA 4JX5A 4RZ6A 4NXSA 3W86A 1BKSA 4UMBA 3IIXA 2X1UA 4XKYB 2WQPA 3GXPA 4A22A 2V2DA 1TPC1 3HG3A 3NQ2A 2ZTKA 3S5OA 3PUEA 1ZAIA 1HG3A 5BRBA 3RF9A 3P61A 2X1RA 3W85A 3DFPA 5HNRA 3HG4A 4Y9AA 4MUZA 5AN7A 3P80A 1LTDA 3F1QA 3TNOA 1X1OA 4NU7A 4M19A 5CZTA 5AHIA 5T26A 2RH9A 5D37A 2ZDRA 3LDVA 3HGJA 4JTLA 5TBOA 4BR1A 1FCQA 3N9RA 3TROA 2W0UA 4JS3A 2C6QA 3MMTA 3JS3A 2Q8ZA 1QDSA 5MHBA 2ZBTA 3PM6A 4HNNA 3AO0A 2QF7A 3EXRA 1HL2A 2KZHA 3C56A 4IGHA 1K8ZA 1JCLA 1P0NA 3QJAA 4S2CA 3SI9A 2CLKA 3UZ5A 2B7OA 4BK9A 2ZZ3A 5F4XA 4Z1BA 3W83A 1K7FA 4LTSA 3W1LA 3QW3A 1FY6A 3W1NA 5A5WA 1RZMA 4LRTA 4N2YA 3PWAA 3MP4A 4DF1A 1H7PA 1MO0A 3TK7A 3KOFA 1AK5A 4ZQMA 3G1SA 2ZQ0A 5HULA 3QW4B 1A53A 2E5CA 2PURA 3M5YA 4N6FA 5KMYA 1EB3A 4HN4A 4PH6A 5DY3A 1TYGA 3W2KA 3B03A 3S1WA 3PG9A 4JYFA 5DLCA 5BMXA 5G1YA 2V5LA 1LRTA 2CLOA 4FIRA 1I2RA 1K7XA 3FA5A 3N2XA 5I3IA 3UWQA 3R2GA 2NX3A 1CI1A 4KFNA 1XBVA 4MJZA 3M41A 3H53A 3KRUA 2WKJA 4GUIA 1FXQA 3IVUA 5H91A 1U83A 4O1BA 5LZLA 4XTDA 4CCCA 2I9EA 2CFFA 2WOQA 3THAA 4AVFA 4C1LA 1VS1A 4OHQA 1OF8A 3QPYA 2CLLA 3ZWTA 1LORA 1ICQA 4O0KA 2X2GA 1VZWA 3O15A 5C5YA 2YPIA 2WNZA 2GJLA 2X1TA 3C6CA 5ABTA 1LDCA 3L5MA 3GDTA 1OFDA 1SW7A 2DP3A 3QMSA 2QDGA 4A29A 1DV7A 4KWVA 1SO5A 1XFBA 3MBDA 1Q6LA 4QQ3A 2WNQA 3TC7A 4GFSA 3O07A 1SW0A 3B8DA 3R89A 1JULA 4O52A 1TJRA 2DJXA 3H55A 3L2IA 2Z1BA 2TPSA 2FB3A 1OG0A 4RZ5A 3KX6A 3ZS4A 3KAOA 3L67A 3QMTA 2GQ8A 2DZXA 2H6RA 1TO3A 1BEUA 1G7VA 2J24A 4UNLA 3RLUA 1EUAA 2XN2A 1VHNA 4UFMA 4OBTA 2TSYA 1HO1A 4ZVJA 3CB8A 4MPQA 4O15A 4Y8FA 2JGYA 2BX7A 1P0KA 4FNUA 3TR2A 3UZJA 4O50A 1LOLA 3NPUA 3T55A 5D2VA 3IIVA 1SSDA 3QZEA 1NF0A 4NZJA 4WOQA 1X7FA 4O11A 4UTKA 2VEIA 1F74A 3W2LA 3WJYA 2QUTA 1FCBA 3GDLA 1LRNA 5U4NA 2R8WA 1TIMA 1HTIA 3I65A 4NJGA 2J9ZA 3NL3A 2YW3A 4JIQA 3ABOA 4LV4A 4ZZ9A 1L9WA 3NPXA 4ONVA 1QPQA 3RFAA 4GUGA 1FWSA 1PS9A 2AQWA 1YYAA 3FLUA 3L5AA 2OJPA 1JQXA 2QEZA 4O0ZA 5CZSA 3MHGA 1TPUA 3T78A 3UD6A 3DHFA 2QJIA 3QSRA 1EP3A 5LHFA 1GWJA 4D2JA 1OYAA 5IM51 1LCOA 3MI6A 4K39A 4YXGA 3VNDA 2Y7EA 4JXCA 4Z08A 3Q37A 3GR8A 3BG3A 1FWNA 2QUVA 4M7TA 4UMAA 4KKXA 3W76A 2OT1A 2QCMA 4LNYA 3W7OA 4JTTA 2ZRYA 4JTGA 4JY9A 4MFDA 4AB4A 4N9EA 3DH7A 3W7GA 3NNTA 4HHPA 4LU0A 3TH6A 5D38A 3S42A 5EY5A 3CEPA 3HO8A 3H54A 1OFOA 4UFJA 1SZGA 4IUOA 4UMCA 3GB6A 1ZNNA 1U5JA 1GG1A 2J6XA 3NO5A 3HMJG 2BWGA 3KFTA 4FB7A 1SSGA 5F2LA 1FWRA 4N9CA 2I1OA 4MY1A 3S1VA 3GKFA 1H61A 4I7VA 2DZSA 5HUOA 4IMCA 1RR2A 1H1YA 1A5BA 1DVJA 4WY0A 3ATZA 3B06A 4H6KA 1TTIA 3OBKA 3TX9A 5D33A 3F4WA 4IOTA 4JTEA 4K7YA 3HQ1A 2A6LA 1JJKA 4O18A 4AWUA 5TQLA 1KBJA 4IX2A 2FFCA 3C52A 4MLJA 2Y7GA 1GQNA 3NQMA 4AF0A 1FXPA 2GQAA 2QKFA 1W5OA 3NQVA 3GLCA 5FF0A 4DEFA 4UR7A 1IXPA 2VFIA 4R7JA 3TQVA 2ATSA 2V9DA 1R2TA 4QJ1A 4CQAA 4O57A 3PUOA 4RX0A 3W7LA 3F4NA 3S1XA 5DN1A 1LROA 1QAPA 5D2WA 4JX4A 2CU0A 2CZDA 1OFQA 4GJ1A 5CGQA 5L6UA 1OFRA 3LHTA 2H3DA 3QSTA 1ZCOA 4RZ4A 2C3ZA 1CW2A 4LRSA 4H4IA 3G3MA 3EXTA 1E51A 4LW7A 3FYPA 2OX1A 3G0XA 1QOPA 4P2VA 5HUPA 4AAJA 5CG7A 1NSJA 3DFSA 2Y62A 4ZQCA 1AL7A 2E6DA 3D0CA 1ZJIA 3TXZA 2ZZ6A 3GZ3A 4MKNA 5FEZA 1W56A 4Q4KA 3GAKA 5H2ZA 5C55A 3W7QA 4HSOA 3EX1A 2H3BA 4FHAA 3LXBA 1KV5A 4QIUA 1ALDA 5D02A 5AHNA 3W3OA 1SO4A 2AAMA 2V2HA 1EPXA 5G5IA 1TQJA 2ZTJA 4O1AA 5HINA 4AWSA 3DXIA 1X6UA 5LKYA 4UNKA 2VFGA 2X16A 3SR7A 1ML1A 1KV8A 4DQWA 3NQGA 2CLMA 3LM7A 4Y6GA 3CQ0A 2WSYA 1SU5A 3CTLA 1YDVA 2YW4A 4K8HA 1KFLA 2FIQA 1A5CA 1IXQA 3A21A 5GVJA 2FB2A 4UFHA 1TJPA 4Q32A 1H7RA 1J4EA 4J9JA 4BI5A 3EX6A 1TCDA 5C2XA 6TIMA 1WBJA 4MZ8A 2E77A 2QCCA 2B4GA 2JBMA 2JGQA 3TSDA 2VFHA 3TKFA 3ZR4A 1IGSA 1QO5A 3PBUA 5KITA 3ZFHA 2Z2UA 4R34A 2V8ZA 1VJIA 3MI3A 3N3MA 4O53A 2HTMA 3BGGA 4HPXA 5EKYA 2ABBA 4Q33A 3SGUA 5TIMA 5I3JA 1JVNA 3SECA 3YPIA 3LHYA 3N9SA 3IRDA 1TTQA 2D73A 4K7VA 4HSNA 2HMCA 3MBFA 1G4PA 3O06A 1KFCA 3DI1A 4XBSA 2Y70A 2G95A 1W31A 3R8RA 3GDMA 2WSQA 3L65A 4IMGA 2R91A 4O4VA 4QM1A 1P5BA 2VEMA 3W7PA 4GUHA 1NF7A 1DBTA 4UTMA 1D3GA 2JKAA 1QFEA 1SW3A 2E5DA 5EL1A 4JTJA 3PG8A 3I7QA 5FEWA 3NXFA 1DKWA 1XI3A 3TAKA 1OYBA 4JTUA 1R2SA 4O16A 2RDUA 4LOCA 4O8RA 5F2MA 3U8GA 5BMWA 4ADSA 1B9BA 3BG5A 3W7JA 3OHIA 2ISVA 1T0OA 4M6VA 4N9BA 3WK0A 1FDYA 1AW5A 3PUDA 3IV3A 4FXSA 3IGXA 3VFLA 4CNPA 4UTTC 4IWWA 5HWJA 2P1FA 2C0AA 4DPQA 1JCNA 4XBKA 3TQ0A 4O28A 4FIQA 3FOKA 5E0KA 4BI6A 4HNUA 3S8HA 4IMDA 2WSRA 3M1ZA 1KTCA 3KVLA 3BK0A 3PULA 3C3NA 1GTEA 3N73A 5DXXA 4ZMGA 3UWVA 4FO4A 4AHOA 3FS2A 3GX9A 1SZNA 3RK8A 5DCBA 1MEWA 4EF9A 3K30A 3TFXA 4QITA 4UC5A 4Z0SA 1F76A 3ATYA 2CWNA 3KVMA 3W2NA 4XKYA 3KVKA 4K37A 3LCWA 1GVFA 3HPZA 4OGZA 2HS8A 3FJ6A 1RVGA 1WBHA 3TA6A 3IIPA 2CZFA 4LUJA 1TV5A 2QJGA 1EP2A 1EX5A 2DJLA 4FNQA 5CZJA 4FX6M 2VOMA 4JIPA 1WOBA 4I7UA 5D05A 2ZFAA 1KTBA 5AC7A 1W37A 1W1ZA 3NQAA 1I45A 3TU9A 5KZDA 1FQ0A 3ABRA 4AHPA 2UV8G 2Z0IA 1RQEA 2ZZ7A 5HWNA 2H8ZA 4WD0A 3NPWA 4PCFA 3QEZA 5I3HA 3IEBA 1F73A 5AYZA 3BLEA 3STEA 1PVNA 1S5VA 3EX4A 3NZ1A 4TIMA 2YZRA 1RPXA 3A22A 4M6QA 5K2ZA 1C9DA 4NNAA 3MP5A 3G1HA 4AWTA 2YXGA 1XBXA 2OMAA 4PA8A 1M7OA 4LVAA 4JD4A 1WYIA 2ZA1A 4MY9A 3TCEA 3FEMA 2B7PA 3UWWA 1B4KA 5DBUA 2ZCGA 5D03A 4WZHA 1Z41A 3PY2A 3RMJA 5G2HA 3W1XA 2WNNA 1W3NA 1LLZA 4GUFA 3W74A 1DJNA 2QCGA 4LVBA 4AXKA 4JICA 3M5ZA 4HKPA 3V75A 4NJJA 4HNTA 2Y89A 3PR2A 3A23A 2DZUA 3NL6A 3W7KA 1IF2A 2VFEA 3M9YA 4ZQNA 1GJPA 4JR5A 3TSBA 3EKZA 5D2XA 2DZVA 3FYOA 2BSLA 4OV4A 3S6DA 1GG0A 4O4WA 2FTPA 1JRCA 3G0UA 1IIHA 3O8AA 1KFKA 2W6RA 3PAJA 2J88A 3B05A 1UCWA 3CPRA 5DELA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O63 A;  4HHM A;  4K68 A;  1E1C A;  2P0I A;  2VP8 A;  4LVF A;  3G1D A;  5KZM A;  3BW2 A;  4Z2K A;  2NV9 A;  2QV5 A;  5M3W A;  1E6R A;  1V93 A;  3S46 A;  4MNM A;  3ZYZ A;  4EE9 A;  3P67 A;  4TQT A;  5HNU A;  4W7U A;  2OXN A;  1QW8 A;  3GBE A;  3PN8 A;  3TDF A;  2OEJ A;  4TTU A;  4AZG A;  5F4S A;  4O1D A;  1UBP C;  2V63 A;  5CBJ A;  4WJX A;  2ZRU A;  3RPT A;  4Q4M A;  3VMO A;  1QBA A;  4PBF A;  3N12 A;  3QPE A;  1PO9 A;  3WNM A;  1F6K A;  5AY7 A;  3W9Z A;  5CBB A;  1TUX A;  5IXE A;  4OU1 A;  2YL9 A;  3NEV A;  3W2M A;  1KGW A;  1TV2 A;  2Z7G A;  5IHS A;  3NZP A;  1I2Q A;  1TSI A;  5H6H A;  3CQJ A;  4MFE A;  1A5U A;  1GZ1 A;  3FGC B;  4RDV A;  3VKJ A;  4Z1D A;  3E6E A;  4C1K A;  4GRS A;  2L5H A;  2TAA A;  4ILS A;  3AIU A;  3VOJ A;  4PMY A;  3PPF A;  4LS0 A;  1TPW A;  4G7E A;  1UWS A;  1S2V A;  1QPN A;  3LD5 A;  5CPQ A;  1RP9 A;  1Q6G A;  1QNV A;  1E0U A;  3K5X A;  5AHL A;  2OU4 A;  3NCO A;  2ON3 A;  1FDJ A;  4IX0 A;  3APG A;  2O4Q A;  4H2C A;  4C6B A;  3N2O A;  3OVP A;  3FKK A;  4OOZ A;  2YR1 A; 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