4ZZ9A

Crystal structure of t75s mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
246
structure length
243
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYSGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 91
structure length 243
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4zz9A00
4DF0A 3TROA 3FKKA 4MPQA 3V1PA 4FB7A 4YXGA 1H7PA 3S8HA 5I3GA 2VFGA 2CLHA 5U4NA 2I1OA 1F05A 1W3IA 3LM7A 5G4WA 5AHEA 4PFMA 4O0KA 2NWSA 1VQTA 1SFJA 3LLDA 4WUIA 2ABAA 4N2YA 1HUVA 4RKAA 3INPA 1I2RA 3LDVA 3F4NA 4NXKA 1EIXA 2VELA 4BWLC 1D9EA 5F2GA 3QM3A 3TAOA 1EPXA 1DKWA 3PB0A 3WJYA 1AK5A 2WNZA 3C6CA 2Y6ZA 3P67A 3FJ6A 4FNRA 4Z1DA 1TV7A 4JIPA 2OMAA 4PC8A 3NPXA 2ALDA 5DBTA 2QJGA 1LTDA 4AAJA 1YDOA 3HGRA 4NJHA 4JTHA 2Z1BA 3PC0A 4RZ6A 3LHTA 5BMWA 3GK0A 1QOQA 3NQFA 4XQ6A 1SSGA 3LRMA 4ADSA 1BKSA 2QUTA 3BO9A 1OJXA 3R5EA 1U5JA 3G22A 2G95A 3P82A 3L66A 1OYBA 2HMCA 2JKAA 3FIGA 3OVQA 3G18A 5DXYA 1L6YA 2QCFA 3TUUA 3Q94A 3U6WA 3B8DA 3BGJA 3M5VA 1ICPA 1PS9A 3IIZA 3PB2A 4UTMA 3MYOA 2TPSA 3L5MA 5CZSA 1A5AA 1OK6A 1WBJA 1H50A 3M5YA 3HG2A 3D0CA 5F4XA 1Y0EA 4N6EA 2FJKA 4BI5A 3MO7A 2AQWA 4K36A 3A22A 3SGZA 3LRLA 3QC3A 5FEXA 4RXGA 3TCEA 2PE4A 2V8ZA 3OG3A 3GLCA 5C55A 2ZZ3A 3PUEA 3R89A 5HUOA 3FS2A 1HTIA 4JTUA 4MZ8A 4EF9A 2YPIA 3EXTA 3GR8A 4O53A 2Z2UA 3RNDA 1DVJA 2H3BA 1X7FA 4AF0B 2R14A 1KFCA 4JR5A 3QPYA 4JY8A 3LCLA 1LRNA 3LOTA 1JCLA 2TRSA 5K2ZA 1FY6A 3CT7A 3EWYA 1FXQA 1LYXA 4MY1A 1GTEA 3HGSA 4JY9A 1P5BA 3FYPA 2FIQA 2Y70A 3ATYA 2C14A 3NQ8A 2DZSA 2ZRYA 5DBUA 4TMCA 3A5VA 3G1FA 4IX0A 2Q8LA 4A2SA 1YXCA 4LVDA 3TSMA 2QCMA 2F7FA 1TB3A 4JTFA 1YLVA 3MUXA 2VEPA 2NLIA 3UXAA 4WXZA 4CQ9A 3NQVA 1Z44A 3GIYA 4IX2A 2GQ9A 3NA8A 2RDWA 3LBCA 4Y6GA 5IM51 3L0KA 3TX9A 3O06A 4UMBA 1KM6A 3L2IA 4MOZA 2P0OA 2H8ZA 3CIWA 1SW0A 1H7OA 1MO0A 4RZ5A 4DO5A 1NF0A 5D09A 1Z42A 1FCQA 5E1QA 3S1VA 1TV5A 2X2GA 2QCHA 4UTTA 1FDJA 2A7PA 3B4UA 3W83A 2VXNA 2E68A 3NQDA 2Q8ZA 1TIMA 4GJ1A 2QEZA 4HT3A 2VEMA 3LXBA 3M5XA 2JK2A 3QH2A 4Q33A 2A4AA 1B9BA 1VR6A 4EIVA 5LNSA 5D05A 3LCXA 3UY7A 3C2VA 3UQNA 3DKLA 2CFFA 4HNNA 1W3NA 4BF9A 2FLIA 2C1HA 5CZTA 4JTGA 1ZNNA 1LBFA 3R2GA 4RXFA 4OBTA 4MJMA 4NJGA 4YCOA 5CSRA 3JRKA 5CSSA 3EX1A 1RQEA 4M5PA 1Q6LA 5KSWA 4NNAA 5LNUA 1D3GA 3R12A 1PIIA 1NSJA 2BX7A 3DI0A 3OEXA 1ZALA 4I9AA 1GVFA 3HG5A 3IRDA 3SJ3A 5CZ0A 1QCWA 1SZNA 4FX6M 5TQLA 2YFNA 2V5LA 4WQ6A 2LLEA 4LV9A 1FWWA 1I2OA 4U28A 4WY0A 3W2LA 1OFEA 2GQ8A 3THQA 1UB3A 3MHUA 3W1RA 4A2RA 1VHNA 4C1KA 3TFCA 4BR1A 3EEGA 2I9EA 3W23A 2CZEA 3UWUA 1OYAA 3N2MA 1OFOA 3UD6A 2YSWA 3G1AA 3THAA 1PHQA 1W0MA 1L9WA 3C3NA 4HHPA 3WK2A 1RR2A 1A5BA 3CWNA 1H7NA 3W7JA 3NYZA 4ZQPA 3IVSA 1OF8A 2B0MA 2ISWA 4LVFA 1NEYA 3HF3A 4GUGA 4FNQA 3S1XA 3IGXA 1C29A 3ABRA 3W74A 3DZ1A 2EF9A 4Y8FA 3HJZA 3G1YA 4O52A 1LRTA 3DH7A 3W7QA 1ZAJA 4RJEA 1SU5A 3R13A 5L6UA 3LXCA 3CEUA 3LCFA 4Z0JA 5DN1A 1VYRA 2CLIA 3A9IA 2J24A 1A50A 1HO1A 2ZZ7A 1EWEA 3QQ0A 3C4UA 1YADA 3L0NA 4UCGA 5LNWA 3W9ZA 3B0UX 4ZQOA 2A2IA 4UMCA 4FHAA 3UPBA 1RV8A 4N9BA 2Q3RA 1HL2A 4WXYA 3T40A 1AMKA 1SUXA 4GWEA 1TV8A 3C56A 1A5SA 2OZ0A 4Z08A 3GKAA 4UTWA 5LGXA 1T8XA 3IV3A 3EXRA 1IGSA 1YPFA 2CLEA 1G69A 3LI1A 4O1DA 1QOPA 3BG5A 5HUPA 1IXOA 1MEHA 1FCVA 3UZJA 2HS6A 1F5ZA 4AMAA 3GXNA 1WAUA 4N9CA 3QSRA 4PL2A 1QPOA 3W75A 2W6RA 2HSAA 3MI3A 5DCBA 1VCGA 3LBMA 4BWLA 1H7RA 1TCDA 3LB0A 4IXXA 2ZTJA 1R46A 4LOCA 4YL2A 4FNSA 3SFKA 5FF0A 1T0OA 1FUYA 3UPWA 4AWUA 2WSQA 3DI1A 3ZWSA 4NQ1A 1XDMA 1AW5A 2YW3A 2PCQA 4X22A 4HNTA 2VEKA 4WOQA 1GEQA 5KMYA 2OT1A 3W84A 6TIMA 3LCHA 3BW3A 2WSYA 1EUAA 2A21A 2BLEA 1R2TA 4UTTC 1H63A 1QNVA 4MKNA 3IEBA 3LHZA 2PC4A 2J9ZA 3IVTA 1GOXA 2GPTA 4CCCA 2EAWA 5D04C 1TQJA 3S1WA 1OG0A 3LRKA 3LHWA 1LDCA 5AC6A 5GVJA 1AG1O 1LLWA 3MBDA 2WSRA 2ZRWA 4L4MA 1C8VA 1V7YA 1ONRA 4HN4A 2E5DA 3KRUA 1XFBA 2NWRA 3NL6A 1DHPA 3G8EA 1M6JA 5DLCA 4NJKA 4LRTA 4K7YA 1GVSA 1TPEA 4XUGA 1FWRA 1VLIA 3N34A 3A21A 5K9XA 5BW6A 4AXKA 3TDFA 3ABOA 2QF7A 4XTIA 2NX9A 4TO8A 1CW2A 2ZZ5A 5LNVA 1DJNA 5CGQA 2J9XA 1B57A 5DXXA 3KVKA 3SR7A 3BLIA 5F1VA 3W73A 4UMAA 3I7QA 3NR0A 2A6LA 3NQGA 3NNTA 2Q3OA 3FA5A 2YR1A 1GT8A 4JYEA 5A8GA 4M7SA 2FTPA 4LVGA 3FKRA 3IIOA 3PS7A 1THFD 1SO5A 3OVRA 4MZ1A 1EB3A 3W2JA 1BWLA 3G3MA 3VI2A 3PY2A 3B04A 3KFTA 1QPNA 1X1OA 1LLZA 1MEIA 1JCYA 2GVGA 1RVGA 3N3MA 2H8XA 3E02A 3OVPA 2FPYA 3QMRA 1W5OA 2BXVA 4DO6A 4IMDA 3O6DA 1NVMA 4AHOA 5LGZA 3B03A 4DPPA 1TPVA 3CLMA 1DQXA 1OYCA 3PUOA 2QAPA 1WXJA 3FFSA 2BTMA 4N9DA 1FX6A 3HPXA 2C0AA 1WOAA 3B0PA 1I45A 3DFQA 1XXXA 2CZFA 2YFOA 3G1HA 2Y7GA 4H3DA 3C52A 3P60A 5F4SA 1FBAA 4FNUA 5D2YA 1TPDA 2VOMA 4JN6A 2JGYA 3CHVA 1P0KA 3Q37A 5CG7A 4O0ZA 2B7OA 2CLFA 3P74A 4NZFA 3NQAA 4GFSA 4ZQNA 3LHUA 3IIVA 5D32A 2NX3A 5F2LA 1V5XA 2GVJA 3DENA 3EXSA 4MUZA 1H1YA 3HMJG 1XL9A 5BMXA 1OFAA 2WQPA 3PR2A 5HQEA 2BZNA 3PBWA 2E6AA 4XBSA 4OV4A 5FI8A 3QMTA 2HS8A 1M5WA 5HINA 1GTHA 1XUUA 3EKZA 4QITA 4Z1AA 2A85A 4UTWC 1G4SA 3UWZA 3LGEA 1KFLA 2ZRZA 2QDHA 2FDSA 1BEUA 1N55A 3EWZA 2E5CA 4NT0A 2DP3A 1J4EA 2E6FA 3JS3A 5D2WA 3GDTA 1JRCA 4ICNA 1UASA 1GYNA 5FEZA 1LOQA 2X1RA 4UXDA 4GRSA 4Z1BA 1W56A 3U2OA 3NPVA 3NQ2A 3B05A 1GG0A 2QJIA 4U4MA 3P5YA 3SSJA 2P10A 3TJXA 3L67A 4UTHA 1MXSA 4B5NA 1YPIA 4A3UA 1OF6A 3EX6A 4GUIA 3EWXA 3LX9A 4S2CA 3FLUA 3I7SA 5CPNA 1T96A 1X8FA 3OHIA 3MP4A 5FESA 5AB3A 1K7FA 1XI3A 3STGA 3W7RA 3G1SA 2WKJA 3PM6A 3AO0A 4CNOA 3MWAA 1PL9A 4M6QA 4DPQA 3N9RA 1W5NA 3BG9A 3KHJA 4QSHA 1VC4A 2QR6A 3QW3A 2PRHA 2ZA3A 3GDKA 4EVZA 1BWKA 2Y88A 3W22A 2H90A 1SPQA 2ZRVA 4UTKA 3DFPA 4NU7A 1ZAIA 5HNRA 4D2JA 1KM1A 3W3OA 3C61A 1I2PA 1PCWA 2VFEA 1OFBA 1MZHA 4J9JA 1SW3A 1QPRA 2Y7EA 1YXYA 3C8FA 4O1CA 5SWUA 3YPIA 4YLWA 3N2XA 2X1UA 4S2BA 5CPMA 3TV8A 1H62A 2X30A 1NF7A 2CLOA 3WK0A 3NO5A 1LRQA 2A7NA 1EUNA 1JUBA 4GUFA 3NL5A 3KVMA 3WFAA 2VFFA 2V5BA 1YYAA 3QF0A 3HPZA 4ZZ9A 4PL1A 3O15A 3C2EA 1IXNA 4FNPA 3IGUA 1ME8A 3OBKA 3C2OA 3C2FA 3W2MA 2RDTA 3L21A 3GNNA 3BW4A 5D2XA 3W71A 3H53A 3STCA 2PURA 5AHFA 3FYOA 1SZEA 3G0XA 1DV7A 1J5TA 4O19A 1KTCA 5EL1A 4KFOA 2VC6A 5ABTA 4MY9A 5G2IA 4RCXA 5CPOA 5FEWA 2ABBA 2YDAA 1KFEA 2NV2A 3LLFA 3QEZA 4RR4A 3W7GA 3W2UA 2FFCA 2ATSA 1M7OA 3T7VA 1SSDA 3GX9A 4IJBA 1P1XA 2NUXA 4GBUA 1FWNA 5D03A 3GAYA 3PBUA 3BK0A 3MI6A 2CZDA 5AHIA 3E12A 5LHEA 1G4PA 2C3ZA 1AL7A 2Y7DA 4KWVA 4IQLA 1OFQA 5AHLA 5DY2A 3LHVA 3PWAA 1TPC1 2Y7FA 3EX4A 4MYXA 1KLZA 7TIMA 2XN0A 2YX0A 3TQVA 4WOZA 5J5DA 1OFPA 3DKJA 5U7SA 2NXIA 3W2NA 3BG3A 3VFLA 1GZGA 3TKFA 1O5XA 4FXRA 4FEZA 2YYUA 4N4QA 2DZWA 3TE9A 3RLVA 1KTNA 3EB2A 3VCRA 5IBXA 1KM2A 1R2RA 5D30A 2V81A 3SIZA 4JTIA 4XZ9A 4ZMGA 1Q6QA 2NZLA 3A23A 4GUHA 2AAMA 4ADUA 5I3IA 1K8ZA 3SECA 5LZLA 3I68A 3W7EA 3MP3A 3TAKA 1UCWA 1KV5A 2XN2A 3TMQA 3NZ1A 3QQ1A 4IMGA 3DXIA 4O12A 4ALDA 3MHFA 5AYZA 4KWWA 1JVNA 2QUVA 1LBMA 3W7CA 4DEFA 1EX5A 1K7EA 3G24A 2OCZA 1SO6A 3E49A 5FF3A 3TR2A 2QCDB 1X6UA 1VRDA 3EX2A 3WJZA 2FPVA 3GDLA 2ZTKA 2YYTA 3NVTA 4IMCA 1TSIA 2E6YA 4CCEA 1W8SA 4NX5A 1JCXA 2Y85A 5K9CA 1F76A 1ZJIA 4MFEA 3WJXA 1JULA 5I3JA 5G4EA 3RK8A 4Q4KA 4NJJA 5K4ZA 4ZQRA 5I3KA 1KM3A 3KVJA 3LXAA 4LNYA 3T78A 1HO4A 5HJLA 1QPQA 3Q2DA 3TFXA 4JTLA 1W5PA 5D02A 1L6SA 1TJRA 2JKEA 3NZRA 3TK7A 5K3VA 1G6CA 2VEIA 4UFKA 1QMLA 3W2KA 1E51A 3DFSA 1DJQA 3BARA 4H6KA 4DBDA 3NQ7A 2J88A 1IF2A 4FX8A 4WX2A 2E5BA 4NNBA 3NXFA 4NNCA 2R8WA 3ABSA 1IXQA 5KTLA 5HR6A 1HFBA 1R2SA 2TMDA 2OJPA 4RLIA 3HPSA 4BI6A 2ZFAA 3PBYA 2ZA2A 4MY8A 1TMHA 3TIMA 2VFIA 4NXSA 4O54A 4JTJA 4XBKA 1A5CA 4IXHA 1JQVA 1EP2A 4IMFA 4X9SA 3AJXA 3VNDA 3TSDA 4DF1A 4LU0A 1ME9A 4O16A 1K3UA 1WBHA 2B4GA 3PF3A 1LOLA 4IGHA 4DF2A 3BW2A 3LCWA 4LS2A 3I7RA 2NX1A 1I8JA 1XUZA 1KM4A 4BI7A 1DL3A 2C13A 5F2IA 5D33A 4OWGA 4AB4A 1P0NA 3O63A 1KBJA 2A6NA 1XKYA 2B7QA 4O13A 4NX0A 3UWYA 2E09A 4AH7A 3CPRA 4GE8A 2QDGA 4LTSA 4CQAA 3O6YX 2WNQA 3CIXA 1Q6RA 3P61A 4TMBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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