5A3HA

2-deoxy-2-fluro-b-d-cellobiosyl/enzyme intermediate complex of the endoglucanase cel5a from bacillus agaradhearans at 1.8 angstroms resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Snapshots along an enzymatic reaction coordinate: analysis of a retaining beta-glycoside hydrolase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 116
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1998-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5a3hA00
3NIYA 4D6CA 4QLLA 2WKLA 1UH4A 2YL6A 1EOMA 1H4PA 4UFMA 1HJSA 1UQZA 1E3ZA 2G4FA 3VINA 2OSYA 5GPRA 3PZUA 5HDRA 3VIFA 3A47A 1P6WA 1PJ9A 1YHTA 3NYDA 3N1AA 3II1A 3CZEA 4PMYA 3VILA 1NWSA 5HNNA 1NWUA 2EXOA 4B9ZA 1RH9A 3N12A 1JDDA 1OGGA 4FK9A 3S6TA 1OB0A 4OIFA 5A8OA 3A4AA 2WMIB 2W92A 1CXLA 4TTGA 4AEFA 3AIEA 3O2LA 4M24A 3AS0A 2WLYA 3WEOA 1V3KA 1C92A 2F8QA 3W6LA 1JAKA 1QI5A 4D6FA 4RE3A 1BGAA 2G41A 2EBNA 1E70M 1KGWA 3EDFA 3WUEA 1OGBA 1WKYA 3EDDA 1VFOA 2YLLA 2QLYA 2XIBA 4EAMA 2YA0A 4WIWA 4A4AA 1GQLA 4EK7A 1JYNA 4QCFA 1HVXA 5C71A 1EDGA 2EO7A 2J62A 2VUYA 2WSKA 2ZX8A 4H04A 4GXPA 1LWHA 2NT1A 5LA2A 2MANA 3RMEA 4WSKA 1NOWA 4AZCA 4UNIA 3ALGA 1TA3B 1OWQA 4UZUA 3ZT7A 1UKQA 3VIJA 1V3HA 1KXQA 4HA3A 2VURA 1OSEA 3VM5A 4W5ZA 2VX5A 5BRQA 1E4LA 2ZUVA 3T2QA 3T0DA 4ZE5A 3ARRA 1VJSA 1R86A 2CETA 7CGTA 2WC4A 2FGLA 3CPUA 1LLOA 3VGDA 3CHCA 4TX8A 1U30A 5I0DA 4LX4A 3RDKA 1K9FA 4IISA 3A4WA 1BGGA 3AHZA 3ZR5A 4AZHA 1HP4A 3OGRA 1XD0A 2WWCA 4HPGA 1V02A 3G6LA 3SCPA 3WNMA 4J3VA 4PMQA 1E5JA 3W0KA 4JKKA 5AYBA 1BHGA 1XC6A 1EQCA 3AYSA 4D1IA 1NP0A 1QNPA 1GVIA 1XCWA 4CN4A 4WKHA 4P8WA 4J7RA 3THDA 4UFJA 2A3EA 2WWDA 3CZJA 1UA7A 1KBKA 1K9EA 2J7FA 4CVUA 1GOOA 2W66A 2JEPA 4J28A 4MNLA 3VNZA 1F4HA 1EQPA 5KEZA 1SR0A 1US3A 4B15A 4M80A 1B3XA 3VD3A 2DT0A 4P8VA 4MAZA 3OBAA 4W7UA 3ZMRA 2EPNA 2ZUTA 2E8YA 1NWTA 2DSKA 3W27A 3BAWA 2BHUA 1JDCA 1JGIA 1GQJA 4B9YA 3L4WA 2GFTA 3LPPA 3QHOA 5GNYA 4ML4A 2WMFA 2XM2A 1UD5A 4P7QA 3FW6A 4F79A 1UR9A 3ZT5A 1BQCA 2VL4A 3BAKA 1H1NA 4DWSC 3AIWA 3CZLA 2O9TA 3EDJA 2D0HA 1KWKA 4FLSA 3VOCA 2C8NA 3RJYA 3I3EA 5CZKA 1XSIA 1XH1A 4A3YA 3EDEA 5BCAA 3IK2A 3BMWA 3PZGA 1JZ2A 1Q6GA 5I79A 3TONA 4W93A 3WDHA 3BAJA 3LMYA 4PMVA 2VRQA 1RP9A 1DWIM 2W61A 4PTMA 5TD4A 4AZGA 3DHUA 2Q8XA 4Z2KA 3S2CA 3A4XA 1NARA 2J7DA 1OM0A 1ZB5A 4ZXOA 1G0CA 3DC0A 3RM4A 4PMOA 4PSPA 2YL5A 1W1YA 1BPLB 2XTKA 3AHVA 4PCTA 2VVSA 3B9DA 2Y4SA 2XSAA 4GQQA 4R27A 1GOKA 4JKMA 5FCZA 3AXHA 4HMCA 3ZSSA 4E4PA 2WVUA 3M7SA 1M7XA 4KMQA 1UH3A 1JL8A 1QNSA 1H0GA 3KL5A 3WNNA 1PZ2A 1WE5A 2VVNA 4HMEA 1BYAA 1VBRA 5JBEA 4JZ5A 2PF0A 4ZEPA 3ARQA 3N04A 1HJVA 1V6XA 3ARYA 1QW8A 1XGZA 1GUVA 2G3JA 3VD4A 5LA0A 1DWGM 1E0VA 3O9NA 4D6IA 1UWIA 4J3XA 4C7DA 3TTYA 2DT1A 5FKYA 3OIHA 1CBGA 2UWFA 1OIMA 3PHAA 3IJ8A 1JNEA 3GBDA 1FH7A 4JFTA 3CUFA 4HMDA 4OUEA 4ATWA 1OIFA 3JUGA 2PWFA 3D3AA 3WEMA 1GOMA 1O6IA 3VDAA 5JBDA 4K68A 1H3GA 3N9KA 4F8XA 2DEPA 4HU0A 1TVNA 2WVVA 3NSNA 3MMDA 3THCA 3AHYA 1SMDA 2E3ZA 2QPSA 2HVMA 1ZL1A 2RGLA 4KGJA 2WCAA 3GDBA 2X1IA 2YL9A 4Z2HA 7TAAA 4AZCB 3TA9A 4AD0A 1B30A 4W86A 5FD0A 1GOWA 1BYCA 1E6PA 1JZ3A 1QPKA 4U5KA 1DWJM 1UD8A 3MS8A 1VF8A 3GXDA 4BQ2A 2WHLA 1TG7A 4HTYA 3AS2A 2D24A 3CLWA 4M81A 2Z1KA 5HXMA 3WF2A 1C3FA 3OGVA 3T2PA 4BCEA 4HA1A 1HNYA 1JFXA 2D1ZA 5C8BB 3TOPA 4M82A 1V02E 1G9HA 4Q7NA 3VMOA 1FP8A 4BS0A 1R7AA 2A3BA 2VRKA 2RGMA 1VEPA 1GQIA 1US2A 3L2LA 1HJQA 2OYLA 3WENA 4PSRA 3AISA 5KZ6A 4TUFA 2CHOA 2CESA 2F2HA 1WDQA 4HZ8A 3NDZA 3RPMA 5A69A 5AC4A 2WPGA 2DT2A 1F4AA 1ZBWA 1LL4A 1G94A 3WQ4A 2VX7A 3CO4A 3GZAA 1VB9A 4UQDA 4LYQA 1M04A 3FAXA 3AROA 1FP9A 3BXWA 5D4YA 3EMCA 2WZHA 2VZVA 1MFVA 3QR3A 4P8UA 4AD1A 3M46A 5ABFA 3ZJKA 4ZXLA 1NH6A 1QVBA 2FH6A 2XGBA 2DH3A 4ZE4A 1W32A 4M29A 4H8VA 4PEEA 4CD5A 3VIPA 1MQPA 8A3HA 4D6JA 3QOMA 5EBAA 1UHVA 2J78A 2JE8A 3WDJA 4AXNA 4M8UA 1J0JA 4HZ7A 2W4XA 2G3MA 2XHYA 4IPNB 3SIMA 1V6VA 4UZSA 3ARSA 2GDUA 1EA9C 4V27A 1TR1A 4MB1A 3RIKA 1CYGA 1E0XA 3VIHA 1MQRA 3RJXA 4DUWA 1BF2A 1E4NA 1UWUA 2ZIDA 3RM8A 3L4XA 2J77A 6TAAA 2VX6A 5GNXA 3RCNA 2WVTA 1JNDA 1NM9A 1SMAA 1XH0A 4FF5A 4B3KA 3GNRA 1XYFA 3F4VA 1AQMA 1WDSA 3KL3A 2G8ZA 3ZIZA 3AIVA 2D20A 5CSYA 1WNOA 3CZ8A 2BHYA 2TAAA 4NSBA 1W1TA 4CGTA 4IUGA 3WQVA 4KWUA 2CXGA 2BS9A 4J3WA 4TX6A 1FFRA 9CGTA 1TUXA 1PX4A 1JD7A 3W82A 4CN1A 1VFUA 1B3WA 2BY3A 4Q22A 3U7BA 1UH2A 5BXPA 4UFLA 4AW7A 1BFNA 2CPUA 3WD3A 3W29A 3AI0A 2ZXDA 3OLGA 3PZVA 1GOQA 2DQXA 1CXKA 4PYSA 2D2OA 1JF5A 1B2YA 2XVPA 4UFHA 5E0FA 4DWSA 1KGXA 1MW1A 3WELA 3SUUA 4OZOA 1XH2A 3U57A 1DWFM 4TVDA 1OBAA 3WDQA 5A2BA 2YDRA 2CNCA 1LG2A 3ARPA 1H09A 4WLCA 4AD2A 3VKKA 5ECUA 1W3JA 4U5IA 2DGAA 1MFUA 1ZJAA 1WZAA 1V3LA 2WK2A 2O9RA 2WVVB 3VPLA 4AWEA 2VCCA 2XVKA 1VENA 5DFAA 2YDSA 1DP0A 1XV8A 1WAWA 4TOQA 1QBAA 4D6DA 1Q6EA 5A1AA 4AYSA 2VCBA 1UR1A 1H0IA 3AIQA 3UESA 3KWXA 3AXXA 2IXUA 5C70A 3WL0A 2JIEA 3WH9A 4UR9A 3WUFA 1B90A 4OOZA 5BRPA 4J3TA 1E40A 2XVLA 3DYMA 5LYRA 1E9LA 5BWFA 3WD2A 3UERA 2ZX7A 3K4AA 1UWQA 1UA3A 1H2JA 1V6UA 4P8XA 3IANA 1CPUA 4HOZA 3K8MA 4BF7A 1BYBA 2GJPA 1EDTA 2QV4A 2X0YA 4UOJA 2WHKA 1WDPA 2J8FA 3VNYA 4JCLA 4M56A 4JFSA 3BAYA 2D0FA 3U5YA 4U3AA 2AOSA 3SEPA 3ZJ6A 1KR0A 3FHAA 3WD1A 2CBJA 2J25A 1HXJA 1WP6A 2ZUMA 2YOCA 1ITXA 1CLVA 5AYIA 1UWRA 4QLJA 1HKIA 3PZQA 3VD5A 1B3VA 4AZ5A 3WMSA 4F9JA 1MVYA 4HPHA 1VEMA 2CIPA 3DYPA 3CTTA 5CPQA 2WZEA 4FLOA 2QPUA 5A2CA 1OD0A 2OYMA 4Z2GA 5CLWA 1CZ1A 4JL1A 1KCLA 5D9NA 2FHBA 1V6YA 3VD7A 1EO5A 2E4TA 3I3DA 2Y24A 3ARUA 4ACZA 4ZENA 5ABFB 3WMCA 1JF6A 3HN3A 3UG5A 1HL8A 1OGSA 1VEOA 3GTNA 1WB0A 4AEEA 3N18A 5FIPA 4PBGA 2QMJA 1C8XA 2ZXQA 1C93A 4PN2A 5D9MA 3MUIA 5A6AA 3LPFA 4J3UA 1QI3A 1PX8A 3WD4A 1CNVA 1V08A 2J75A 3CHEA 2A3HA 1QI0A 3SUVA 3VMNA 3FNDA 4AD4A 2VT0A 2WMGA 1CENA 4CD7A 4IPLA 1UR2A 1ISYA 3EBVA 3W38A 4PTXA 4E2OA 4W7WA 1V03A 3OB8A 1GW1A 2J79A 2JALA 3PZ9A 1MW3A 1J10A 2C0HA 2VQUA 3W53A 1R7OA 3AIBA 2XWDA 3VIOA 3GXMA 1JZ8A 1MWOA 2O92A 4U31A 1DTUA 5BYWA 4QLKA 3MU7A 4CVWA 1D3CA 3K4DA 3RM9A 4W84A 1JIBA 1QNRA 1E6ZA 1V0KA 4PMZA 8CGTA 1UYQA 2W62A 1W2PA 3N11A 2EPMX 2F61A 3POHA 2A3CA 3AMLA 1I1XA 5A6KA 4V28A 4W5UA 3VGGA 4YN5A 1AMYA 1H11A 5JIWA 4XX6A 1S46A 3CHDA 2OWXA 5F7UA 5E6YA 2VZOA 1OT1A 4CCCA 4DWSB 3CZGA 5JUVA 3ARZA 5D8WA 1QOXA 2D22A 5M17A 1B0IA 2WMJA 4OOUA 1W1PA 1OT2A 2ZUWA 2CBVA 2XVNA 4WJXA 3WN6A 1ISZA 1JI2A 5IHRA 4HA4A 1KQYA 1VRXA 3VX0A 4MDOA 3APGA 1XHGA 1E4IA 3IJ7A 3AMDA 3WUBA 4AZBA 4GKLA 2AMGA 1NOFA 3AS1A 1J0KA 2DSUA 3WFZA 3WQ6A 2C7FA 3ZJ7A 4H2CA 4S3JA 1W9XA 3PZNA 1E6QM 4AD5A 4ATLA 1QNOA 2WB5A 2XIIA 1MQQA 1VIWA 1EH9A 1E6SM 1UOKA 1WZMA 3E1F1 4GIAA 3WKZA 1ESWA 1V3JA 2VOTA 1W3KA 4PTWA 1C7TA 4KRUA 1GJUA 2CHNA 4MB4A 4PUEA 4NRSA 3ECQA 1PEZA 2WLZA 2AAAA 5E9AA 2CYGA 3WBAA 3VGHA 1BVZA 3CGTA 2J7EA 3W6MA 2YIHA 3UETA 3OA5A 2EPOA 5ABHA 1CGUA 4NZCA 3SCOA 1K6AA 1B9ZA 2J7GA 1KB3A 1QHOA 3MMUA 2D23A 2GJXA 1C8YA 4XUYA 3L4UA 3WF1A 1BSIA 1EXPA 1UR4A 4UQBA 2NW0A 1UD2A 1UWSA 3MUAA 1GQKA 1W3HA 1XSKA 2V5DA 4W89A 5IXEA 1GJWA 1X6NA 1HF6A 1J01A 2VZUA 3AZRA 4B16A 1XSJA 1JDAA 4UQ9A 2WXDM 4ACZB 3NJ3A 1SYTA 3QGVA 1LJYA 3EMQA 2UY5A 1SFSA 1XYZA 3CMGA 1LQ0A 1UKOA 3MMWA 5CXPA 4CCEA 1UD3A 1TCMA 2E9BA 1W9PA 4IM4A 2DH2A 4GI6A 5JBFA 3F5LA 2V5CA 3WH6A 4J27A 3BAIA 2CBIA 1JI1A 2VQTA 3N13A 1M03A 3WBEA 5DT5A 1E55A 5BXRA 2FDMA 4MNMA 3HU7A 5D9PA 1LL7A 3ZSTA 3T08A 3UG4A 3WUGA 1WDRA 4ACYA 3K8LA 4AD3A 1E72M 1E1EA 1HKMA 5BROA 1BG9A 3ZT6A 1C8QA 2VNCA 2IXVA 2BXYA 4W87A 1KXVA 4W8AA 1J18A 2YKKA 3CZKA 1EDQA 1J9YA 2VZSA 5FOOA 1QBBA 1RPKA 1NOUA 1M53A 5CPTA 1VBUA 3OZPA 2HISA 5IHSA 1QI4A 2G3NA 4UCFA 1Q6CA 1E43A 3J7HA 2B31A 4PRWA 4MNJA 1ISWA 3F5KA 4HP5A 4HOXA 2V3FA 3ZR6A 1V6WA 1E15A 1ISXA 3WH5A 4QP0A 3CHFA 1W2VA 1HVQA 1QI2A 5A8MA 3BGAA 1CGWA 2J7BA 5HPCA 2Y2WA 5M5DA 3AZSA 1KXTA 5A6BD 1HJWA 3KZSA 2XGIA 1OCQA 1PBGA 4X0NA 1EHAA 4TVCA 2O9PA 5A95A 1WZKA 3UG3A 1M01A 2DSVA 4CU8A 5CSUA 1ODZA 4MTVA 4KGLA 3T2OA 4CKQA 1UR0A 3WMBA 3WNKA 5EB8A 3I3BA 1CLXA 5EMYA 3VIGA 2WW5A 1GPFA 1KCKA 4V2XA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NIY A;  4D6C A;  4QLL A;  2WKL A;  1UH4 A;  2YL6 A;  1EOM A;  1H4P A;  4UFM A;  1HJS A;  1UQZ A;  1E3Z A;  2G4F A;  3VIN A;  2OSY A;  5GPR A;  3PZU A;  5HDR A;  3VIF A;  3A47 A;  1P6W A;  1PJ9 A;  1YHT A;  3NYD A;  3N1A A;  3II1 A;  3CZE A;  4PMY A;  3VIL A;  1NWS A;  5HNN A;  1NWU A;  2EXO A;  4B9Z A;  1RH9 A;  3N12 A;  1JDD A;  1OGG A;  4FK9 A;  3S6T A;  1OB0 A;  4OIF A;  5A8O A;  3A4A A;  2WMI B;  2W92 A;  1CXL A;  4TTG A;  4AEF A;  3AIE A;  3O2L A;  4M24 A;  3AS0 A;  2WLY A;  3WEO A;  1V3K A;  1C92 A;  2F8Q A;  3W6L A;  1JAK A;  1QI5 A;  4D6F A;  4RE3 A;  1BGA A;  2G41 A;  2EBN A;  1E70 M;  1KGW A;  3EDF A;  3WUE A;  1OGB A;  1WKY A;  3EDD A;  1VFO A;  2YLL A;  2QLY A;  2XIB A;  4EAM A;  2YA0 A;  4WIW A;  4A4A A;  1GQL A;  4EK7 A;  1JYN A;  4QCF A;  1HVX A;  5C71 A;  1EDG A;  2EO7 A;  2J62 A;  2VUY A;  2WSK A;  2ZX8 A;  4H04 A;  4GXP A;  1LWH A;  2NT1 A;  5LA2 A;  2MAN A;  3RME A;  4WSK A;  1NOW A;  4AZC A;  4UNI A;  3ALG A;  1TA3 B;  1OWQ A;  4UZU A;  3ZT7 A;  1UKQ A;  3VIJ A;  1V3H A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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