5AB3A

S.enterica hisa mutant d7n, d10g, dup13-15, q24l, g102a
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
247
structure length
241
Chain Sequence
MIIPALNLIGGTVVRVVRLHQGDYARLRDYGNDPLPRLQDYAAQGAGVLHLVDLTGAKDPAKRQIPLIKTLVAGVNVPVQVGGGVRTEEDVAALLKAGVARVVIASTAVKSPDVVKGWFERFGAQALVLALDVRIDEHGTKQVAVSGVSLEQLVETYLPVGLKHVLCTDISRDGTLAGSNVSLYEEVCARYPQIAFQSSGGIGDIDDIAALRGTGVRGVIVGRALLEGKFTVKEAIQCWQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional innovations in the real-time evolution of new ( beta alpha )8 barrel enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneam
molecule tags Isomerase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar cubana str. 76814
total genus 78
structure length 241
sequence length 247
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2015-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5ab3A00
3D0CA 4X3ZA 2HS8A 3BPWA 1FWNA 3W2LA 5DCDA 2ZA1A 3C2VA 3LXCA 2YYUA 4RV8A 2DORA 4MIMA 3GAKA 2GQ9A 1QPNA 2QCLA 2DZWA 1LBLA 4O19A 2OT1A 3M7WA 1KA9F 1SUXA 4KKXA 2HS6A 3C0JA 3O1NA 3NPWA 2YZRA 4BF9A 1XBYA 2ZZ4A 2CZ5A 1I2QA 1KFJA 4M5PA 1Q6OA 3EX2A 4A29A 4DBDA 3W7LA 4RK8A 4AF0A 3TC7A 2CZFA 1GG1A 1RV8A 1LLZA 2PRHA 3DFQA 4LC8A 3TSBA 2J9XA 4JTSA 5BRBA 3VI2A 3TQVA 4DBEA 2CLFA 3STCA 3S8HA 3NPUA 1EB3A 1XBXA 5G1YA 4JTEA 4AMAA 5FEWA 3Q2DA 3LCXA 4BI5A 4JX6A 2NUYA 4N9BA 1JCLA 1Z44A 3LRMA 1YDNA 4BI7A 1X6UA 5LGZA 2TPSA 2NUXA 5D2YA 5K7JA 4MOZA 2A85A 3O07A 3NQ6A 4LVDA 4MJZA 3BO9A 3W87A 2ZQ0A 3TV8A 1M7OA 4FNQA 3BG3A 5BNKA 4ZMGA 3SR7A 3MBDA 2E6YA 3O06A 4IUOA 1TCDA 1D3GA 3T7VA 1G4PA 1S5WA 2ISWA 3HQ1A 3P82A 5HR7A 1IIGA 1EUNA 2Z6IA 3E96A 3KRUA 4NJGA 2Y7EA 5CZTA 4NUWA 4UFJA 4WOQA 3G1DA 3M47A 1HFBA 2X1UA 1W5MA 3W7MA 3I7SA 3UD6A 1KM5A 5EMUA 2X1RA 3S5OA 3E9AA 3DFTA 3FJ6A 3LHVA 4IXXA 3TAKA 4EF8A 4X22A 4AHOA 1Y0EA 3G0XA 4R53A 2YGYA 4H3DA 2QCFA 3NAVA 3N14A 1ME7A 2VFIA 4CLMA 2BTMA 4RX0A 5J5DA 5K3VA 1TTQA 1AG1O 1XUUA 2CLLA 3C2OA 4GNJA 3G1SA 2Z1BA 1BEUA 2YSWA 3UPBA 3G1YA 5DXXA 2NWSA 1KM0A 4JDBA 3NQGA 4Q32A 4FNSA 1FBAA 4ORIA 1TPVA 1J2WA 1SR9A 1L6YA 1P0KA 4RKAA 3SFKA 2PRLA 4TO8A 1SO4A 3PG8A 2EPHA 1A50A 1KM6A 3KVJA 3W7PA 3TUUA 2B0MA 3RLVA 3V1PA 4TMBA 4LNYA 2XN1A 3WK1A 2BXVA 1KBJA 3QPZA 3LHUA 4GUHA 3CU2A 1JUEA 5TBOA 1X1OA 2JKPA 3GNNA 1NF7A 1QFEA 3GYEA 5IBXA 1N55A 4LW7A 3TA6A 3FOKA 4U4MA 4K6AA 3A22A 4WUIA 1GVQA 1QWGA 2DJXA 4YL2A 3RF9A 5I3KA 3TU9A 2C6QA 2R94A 3W7KA 3FA5A 1MZHA 3ZWSA 1OABA 1JVNA 3B8DA 3EWBX 5KZMA 1TYGA 1ZJIA 2NV2A 5CZJA 5KITA 4MJMA 4LVBA 3HF3A 4O12A 3DKJA 1A5SA 2E6FA 3CTLA 3GX9A 3MWAA 1OFAA 3PG9A 3M5YA 3MYPA 4O4WA 3W22A 3G3DA 4N6FA 3IIPA 1WOBA 3B0VC 2QAFA 4ICNA 3VNDA 1XFBA 5GVJA 2QKFA 4FNPA 5K9CA 4O53A 2TRSA 4QAIA 1G4EA 3UWUA 1F2JA 5DCEA 3CEUA 4BK9A 3P62A 3CC1A 4XQ6A 6TIMA 2CZEA 5EKYA 4AH7A 2DZVA 3IGSA 1ML1A 3TK7A 4PH6A 2I14A 3C2RA 4KWVA 3QYQA 1AK5A 3C56A 1C29A 4FB7A 2WV8A 5BMWA 3FLUA 3F1QA 8TIMA 4GUIA 3QSTA 2GUUA 2A5HA 2CW6A 1K8ZA 1JUBA 4O57A 1LORA 2A21A 4IX0A 3T44A 5D33A 1KFEA 4DO4A 4LY8A 3RLUA 2VKZG 1ME9A 3ATYA 4K38A 1YXDA 1A53A 1JRCA 2G5WA 3KVMA 3SI9A 2JGYA 5FEPA 1OF8A 4ML9A 4S2CA 4WY0B 1OK6A 1DJNA 1QAPA 5FI8A 4NNAA 3TXVA 4KWWA 4FXSA 1PCWA 3L0KA 4Y90A 1P5BA 3QQ0A 5T26A 3EX6A 4EWND 2ALDA 3NGJA 2ZRUA 1GQNA 2Y63A 2Y88A 2A7NA 1NEYA 5K9XA 3G22A 4WD0A 2E1DA 3MHGA 3UPWA 3LCFA 3NQDA 4JTLA 4O0KA 5CG7A 3MP5A 2VFFA 4JTHA 4S2BA 3A5VA 5D2XA 4O50A 5D2TA 1T99A 4NJHA 2I1OA 4HPJA 2WNZA 4LS1A 1J5TA 3CIXA 2QDHA 4IX2A 5EL1A 1GVSA 4O4VA 1KV8A 1GJPA 5EPDA 4QQ3A 3R89A 3NM3A 3W7RA 4LVFA 4LC6A 4AWSA 2FPTA 4UTIA 5J5RA 3C2FA 3TSDA 1QR7A 2R14A 3NA8A 2WSYA 3DFPA 2A4AA 3GDRA 4GWEA 2GQAA 4GUGA 1W0MA 1TMHA 2H3BA 2ZA2A 1IIHA 1H51A 4XKYB 2QUTA 2QJGA 2JKEA 4AAJA 4NX5A 2DJLA 2FLIA 4O1AA 4RLIA 4M19A 5D2VA 1DORA 3M5XA 3LHTA 2FB3A 4WY0F 4JS3A 2WNNA 3L0GA 5HUPA 1W56A 1TRDA 4LUJA 3W7CA 3QRHA 1OF6A 3LHYA 1H1ZA 3P84A 1JRBA 3L5MA 3OIXA 1AW2A 1WAUA 4DQWA 1LRQA 4PTNA 1YADA 4A2SA 4O16A 3UZJA 3W6YA 3DKLA 4Y9AA 1KM2A 2W6RA 4Q33A 5FF0A 3NDOA 3GR7A 3LV6A 1KBIA 4IMDA 1JCMP 3SIZA 4AEOA 1F73A 2BX7A 1WQ5A 1CX9A 3IV3A 5HJLA 4JTGA 4DO6A 2Q8ZA 6ALDA 3W1LA 4YLWA 3W7NA 4PODA 2ISSA 1O95A 5DN1A 2C3ZA 3VE7A 3WJZA 1AL7A 3A23A 5EY5A 3NPVA 2QEZA 5DLCA 1JCJA 1TRIA 3IIZA 2QF7A 1PCKA 2YW3A 4ORMA 1VYPX 2Z0IA 3ELFA 1ONRA 3S5NA 3RNDA 4B5NA 3LLDA 4PA8A 1WYIA 5DY2A 2YCEA 1KFCA 1EP1A 1WXJA 1R47A 1H62A 3GLCA 3T78A 3DH7A 3W70A 5IBXC 5K9DA 3GKFA 3NXFA 3TX9A 1LOLA 4K8HA 3DFNA 3GAYA 1L2UA 3TH6A 3LB0A 1FWSA 3BGJA 3MBFA 5E0KA 1K8YA 1NAL1 1VCVA 3W7IA 3W86A 1FWTA 3W73A 2C16A 2NX1A 1ZAHA 3R2GA 4UCGA 1LRNA 3EWUA 4WY0A 3NQAA 4KFPA 3W83A 4UR7A 3UWYA 3DHDA 2W0UA 4IWWA 1WV2A 5D02A 3THAA 4LOCA 3HGSA 2QUUA 3TMQA 2X30A 4AB4A 3TSMA 4DO5A 4LRTA 3JS3A 3P8IA 4EIVA 1K03A 3B4UA 2QJHA 2CLKA 1KM1A 3IIOA 2Q3OA 2YW4A 4CNPA 4XBKA 3KX6A 4O17A 3LX9A 3QW3A 4LS2A 4UTTA 2G97A 3MYOA 5LNSA 2V8ZA 2ZRWA 4JXCA 2A1YA 1FDJA 3E02A 3PVFA 1B57A 3QJAA 1RVGA 1T8XA 3PBWA 1F6PA 3G0SA 1VR6A 3T4CA 1ZALA 3JR2A 4JDYA 4QNWA 3CLMA 3PY2A 5AB3A 4YCOA 5HQEA 5CZ0A 2RH9A 3ABQA 3BV4A 3SY5A 2YFNA 3SECA 4NJIA 3C61A 3GR8A 5AC6A 1N8FA 4ONVA 1FX6A 4NT0A 3EWXA 3CB8A 1BWKA 1TB3A 1YDOA 3GKAA 1KV5A 1THFD 4O15A 4R34A 2GVGA 1KLYA 5G5IA 1RD5A 3LXBA 5AHIA 2H8XA 4A22A 4FNRA 2GVJA 3BK0A 1QPOA 3CWNA 1GVRA 5G2HA 1H1YA 3CHVA 1R2TA 3LBMA 3N19B 5AYYA 3G3MA 1EWDA 3R8RA 1T96A 4XKYA 1U83A 1G4SA 1SW0A 1ZFJA 3S0CA 2F7FA 5MHBA 4LU0A 4WZHA 4AHPA 1LRTA 3VE9A 4Z0JA 2X1TA 4ZZ9A 4S1FA 2E5DA 2E68A 1D9EA 4JYFA 1GVFA 3VKJA 3SGZA 4NJJA 2YX0A 4QSHA 2CLIA 1TPWA 3DHFA 4O10A 1TQXA 4WXYA 5AFDA 4HNNA 4UFHA 2VENA 3NL3A 1PS9A 1BWLA 4EF9A 3TIMA 5LZLA 1TJRA 3W1NA 3S9YA 3IVSA 3IGUA 4UFIA 5HNRA 4AWUA 4XTDA 4XWUA 1VYRA 4DEFA 1VC4A 3S5YA 2PC4A 1OX6A 3W9ZA 1RQEA 4IMGA 2E6AA 1LOSA 5G1TA 3NL6A 4YMZA 1H61A 4M6QA 3P60A 1XKYA 1GVOA 2XN0A 5G2WA 4UIOA 2HTMA 2Y89A 3RK8A 2LLEA 5D38A 4EVZA 3QC3A 4OBTA 4IPIA 2YFOA 4GXMA 3T55A 4UTKA 4ZQOA 1R30A 5F4XA 3KRZA 2GVLA 4JTKA 3B03A 2F84A 2Y70A 2WPBA 2X2GA 3LRLA 3TAOA 4A2RA 2ZFAA 3NQMA 4HNTA 3KOFA 1YTKA 4MVAA 5DCBA 1RQHA 1D3HA 3ABOA 3NL5A 3DXIA 1SZGA 1W5OA 4JY8A 1ZHAA 1H60A 4K8EA 1TIMA 2H90A 4HSNA 4M7SA 4MZYA 4A21A 3NQFA 4UR8A 2WKJA 3W7OA 3M0ZA 1TV5A 3L2IA 5I3GA 2NZLA 1PVNA 1U5JA 4IXHA 1Z48A 4JTJA 4FX8A 2ZZ7A 1FCVA 1I45A 5FEXA 1GWJA 3W1UA 3W7EA 3L21A 4N2YA 3HG2A 1UCWA 5KZDA 1OYBA 4MY8A 1RPXA 3C52A 1G69A 4OT7A 2J24A 2ZCGA 4WQ6A 3PWAA 1TJPA 2R8WA 2DZTA 4IMCA 1OFPA 3P7YA 1TV8A 4I9AA 1SSDA 5LNWA 2AGKA 1C8VA 1YTDA 5C55A 3DAQA 3EXRA 3UNDA 1JCXA 1OFRA 3TKFA 4MLRA 3L5AA 3G8EA 3TQ0A 5BW6A 4R33A 4O18A 2JGQA 2GPTA 3M5ZA 1PE1A 2ZTJA 4RZ5A 3MI2A 2QUVA 3FIGA 1KM3A 1YPFA 5LNRA 4O1CA 4Z08A 1MEWA 3TE9A 3N9SA 3N2MA 4UMCA 2JK2A 4NVTA 3OEXA 2A6LA 1FDZA 2B7QA 4PL2A 1MEHA 3HGRA 3O63A 3LGEA 2JBMA 4BWLA 1W3NA 3G1AA 1DL3A 4UTUA 3PB0A 2FB2A 2VOMA 1B4EA 4TR9A 1SO6A 5HWNA 3P61A 1S5TA 2A0NA 1F74A 1DBTA 3EKLA 3P8JA 3FS2A 1QO5A 1VS1A 1LM1A 4HT3A 3BG9A 2PCQA 1SZNA 3P5ZA 3S1VA 3L68A 1K7XA 4MY9A 4O28A 2NXHA 4NJKA 1Q6QA 2V2CA 3M5VA 2C1HA 3GVGA 4PL1A 4JX5A 3CM4A 3C6CA 1K8XA 4ADUA 4N9CA 2CLOA 4TMCA 4Y8FA 1S5VA 5HUOA 1SZFA 2ATMA 3WJYA 2GJLA 5AYZA 5BOOA 5LGXA 4UTLA 7TIMA 3TW7A 1F05A 1SFJA 1OJXA 3W7DA 3HIJA 3CQ0A 3W88A 4E38A 3M6YA 3W75A 2YDAA 4ZQNA 4X9SA 3NL2A 1DHPA 3E0IA 3B0UX 1IXQA 3PM6A 3F4NA 4IQLA 3LM7A 5LNVA 3PBUA 4UTTC 1DV7A 2VFGA 1N7KA 1LP6A 4UTWA 1WBHA 2B7PA 4O54A 5I3JA 1DQWA 1PL9A 3EX4A 3O15A 2P1FA 5D03A 2WOQA 4N6EA 4L4LA 2Y85A 3W3OA 1SPQA 4LV9A 4M7TA 4O11A 4LV4A 1LLWA 1KM4A 2DZSA 5HINA 2Y7FA 1TPC1 4MYAA 3GB6A 2ATSA 2CWNA 4BFAA 1YYAA 3LHZA 4JGDA 4O0ZA 4LUIA 2GJNA 4I7WA 1JCYA 3STEA 2B7NA 3GZ3A 4E0CA 1B9BA 3NQ7A 3QH2A 3IVTA 5G4WA 3UXDA 1A5CA 5AYXA 3LBCA 4OE7A 3LTPA 1IXNA 2NXGA 5FESA 1DKWA 3W1TA 4ZQRA 4DF1A 3S1WA 1H7WA 3NQCA 2ZBTA 3PBVA 5C2XA 1FWRA 3LHWA 4FIQA 2O7SA 4FX6M 3WJXA 3R5EA 1SO3A 4FHAA 2RKXA 5L6UA 2Q3RA 3O05A 3ZWTA 5F2GA 5EYWA 2DZXA 1B4KA 2Y61A 3R13A 4CQAA 1KFLA 1F5ZA 1OVDA 2WSRA 3PR2A 4R7JA 5C54A 3TDFA 3SW6A 2BZNA 4C1KA 1HUVA 4QM1A 2J9ZA 3EKZA 2Z2UA 3UZ5A 3WJSA 3HOJA 1K7FA 4ADSA 2OMAA 1LTDA 4Y6GA 1F76A 4RJEA 3NM1A 4AVFA 4JTIA 3NO5A 3N3MA 2ZDRA 4LTSA 4QISA 4XUGA 4M6PA 2JKAA 1HG3A 1ZENA 2FDSA 3GIYA 2FQIA 4GBUA 4DF2A 3MP3A 3THQA 2ABBA 3L9CA 2V30A 3ZFHA 3A9IA 1JJKA 3RU6A 3EXSA 3LI0A 4ZVJA 1H50A 3M16A 1H63A 4PEKA 3DFOA 4FF7A 3KAOA 3P74A 2I9EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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