5AB3A

S.enterica hisa mutant d7n, d10g, dup13-15, q24l, g102a
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
247
structure length
241
Chain Sequence
MIIPALNLIGGTVVRVVRLHQGDYARLRDYGNDPLPRLQDYAAQGAGVLHLVDLTGAKDPAKRQIPLIKTLVAGVNVPVQVGGGVRTEEDVAALLKAGVARVVIASTAVKSPDVVKGWFERFGAQALVLALDVRIDEHGTKQVAVSGVSLEQLVETYLPVGLKHVLCTDISRDGTLAGSNVSLYEEVCARYPQIAFQSSGGIGDIDDIAALRGTGVRGVIVGRALLEGKFTVKEAIQCWQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional innovations in the real-time evolution of new ( beta alpha )8 barrel enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneam
molecule tags Isomerase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar cubana str. 76814
total genus 78
structure length 241
sequence length 247
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2015-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5ab3A00
4Z08A 5DBTA 4UFHA 3PBWA 2ZA2A 1C29A 2Y61A 5F4SA 3N9RA 3PB2A 3NPXA 1W31A 4UMCA 1W3IA 1FUYA 3B06A 5HQEA 3TQVA 4TMCA 2CLKA 4A2SA 5C6MA 4NJJA 1Q3NA 4L4MA 3U6WA 4ZL1A 4GUJA 3NQEA 1EB3A 2GPTA 2OX1A 3C2FA 3GXPA 3DFTA 1XFBA 4QAIA 2GJLA 3IRDA 4JTUA 1TQXA 3R12A 1TTQA 3LHUA 4IJBA 4GFSA 5K9DA 3W72A 2HS6A 2HTMA 3EX1A 3SGZA 1KFEA 4DBDA 1SFLA 5DLCA 3KX6A 4QJ1A 1FBAA 2ZRZA 3UZ5A 2NV1A 1ML1A 1VHCA 1BKSA 3FA5A 4N6EA 3R89A 4UMAA 3ABQA 4WX2A 1OYCA 1OX6A 1Z41A 2NLIA 1UUOA 3GK0A 3TV8A 3PUDA 1QAPA 1G69A 3HPXA 1HFBA 4H6KA 3W7OA 2YYUA 5F4XA 3O6YX 1Q45A 3DI1A 1BEUA 4BF9A 2A1YA 4UTIA 2J24A 3WK3A 1EUAA 1QNVA 2KZHA 4O15A 1H60A 1TV8A 1DQWA 2QF7A 1LRNA 4WY0B 1O4UA 3S6DA 1EUNA 3A22A 1NFBA 4H4IA 5KSWA 4WD0A 2YXGA 2C13A 1G4TA 3ZFHA 3DHDA 1XDMA 3GR7A 2YW3A 3O06A 3M43A 4KFNA 3MWAA 4XBSA 3DFOA 2GOUA 3NQ8A 4MFDA 3RK8A 1VC4A 1KBIA 1KM1A 3B05A 4LV4A 5D38A 1OABA 2E5DA 4O57A 3LGEA 3TFCA 2ZZ2A 3O6DA 2ZBTA 3TAKA 4ADSA 3S8HA 3W7GA 3P84A 2QCCA 3RNDA 3W7JA 3LI1A 3E9AA 4CQ9A 5L9FA 4A3UA 2A6NA 4RCXA 5AN7A 1H62A 1A50A 1F74A 1OFRA 3OHIA 1QDSA 3SR7A 1FWTA 3EXSA 1VCFA 1OJXA 2Q3RA 1GVQA 4HNTA 3LCGA 4UTWA 4FX7A 3BW2A 5J5RA 1GTEA 3G22A 3L5AA 1PHWA 2WNZA 1GYNA 3PM6A 5CSRA 3A24A 4WOZA 1AW5A 2YSWA 3PAJA 3O63A 5AYYA 2EPHA 3W86A 1RQEA 2C16A 4OBTA 1SZNA 5DCDA 1WQ5A 5HNRA 1QPOA 1GT8A 1LP6A 3A5FA 5MHBA 5BW6A 4LVDA 3W7DA 1ZHAA 2E09A 1FWWA 1I2NA 2YW4A 1TPFA 1BWKA 1B57A 4O11A 1GEQA 2E6AA 2Z6JA 4PEKA 4QQ3A 2Z6IA 1SO3A 1DL3A 1LBLA 4OGZA 2G95A 4NNBA 1W5NA 2CZDA 5LGZA 4BI6A 1VLWA 5AYXA 3QMRA 2V9DA 3F1QA 3TC6A 5DCBA 1F73A 3F03K 2RHGA 3TKFA 4AVFA 2A21A 3W84A 2TRSA 1L2UA 4NZFA 4POCA 1SFJA 2QEZA 1XBVA 3LERA 1YDVA 3W73A 3DFPA 3B8DA 2F84A 3KVMA 5EL1A 1LBFA 5D2VA 5GVJA 3QSTA 2WKJA 1DVJA 1A5BA 3E49A 3EX4A 2JBMA 3THQA 1U83A 3P8JA 4RKAA 3W2MA 2C3ZA 3EXTA 4ZMGA 1WXJA 4AF0B 2G5WA 2DZTA 3NPVA 3LBCA 1H1ZA 4Q33A 1RPXA 1UUMA 4RX0A 3T78A 4Y9AA 3W7IA 1XUZA 3M1ZA 1TIMA 3B04A 1FCUA 5IM51 5AC6A 3B03A 3OVPA 5HWNA 1KV8A 3G8EA 3LTPA 4UC5A 1GVSA 3SIZA 1RZMA 5HINA 1F5ZA 3UWVA 4A22A 5BMXA 3RFAA 4U4MA 5F2GA 4I7WA 1EP3A 5CSSA 3E12A 3NQCA 1D3HA 2QUTA 1RQHA 2WNQA 3N14A 3GVGA 1O95A 1P0KA 3KRUA 4LTSA 1X6UA 1VCGA 3M0ZA 5AB3A 1XBXA 1XBYA 3UWUA 1K8ZA 1JJKA 5C5YA 1DKWA 3KAOA 3PSVA 1MEHA 4IMEA 4WY0F 3C61A 1SZGA 4Z0SA 2AQWA 1AMKA 1JCJA 3CM4A 2YYTA 4IMCA 3OIXA 5EYWA 5HMSA 5G2WA 4JIQA 4DO5A 1D3GA 3L5MA 3NO5A 1LRTA 3IEBA 2VFHA 1OX4A 5FESA 5FF3A 2WQPA 1DQXA 3GDMA 2GQ9A 3O07A 3LHVA 2QAPA 2QCLA 3QEZA 2OMAA 3C52A 3PB0A 4M6VA 3M5ZA 3TAOA 4Z0JA 1E51A 1YXDA 3TCEA 1LORA 2H8ZA 3GAKA 3SI9A 3N9SA 1Q6QA 2NWSA 1R47A 4O4VA 3QF0A 5AC8A 3LXBA 4ZQMA 1KFKA 4Z1BA 2GVLA 3WJXA 3B0UX 3L67A 1XL9A 1M7PA 1NEYA 3MP5A 1KFLA 1ZENA 3BW4A 1ZY9A 3GXTA 3UWYA 2ZTJA 1VQTA 3E0IA 1WBJA 3OVRA 4G1KA 2ISVA 1PV8A 1MO0A 3L2IA 3ZS4A 3RF9A 3W2LA 2BSLA 4TR9A 2OCZA 1AL7A 5LKYA 1KLZA 3EX3A 1DJNA 3FS2A 2VFEA 4DXVA 3W7EA 3C0JA 1O94A 2ABAA 3NNTA 2D73A 4JTJA 3UQNA 1A5SA 5LHEA 3HGRA 1Q6LA 1O60A 1PHQA 1X1ZA 5AHEA 4UCGA 4UFIA 1OFDA 1TTIA 3I68A 4FXRA 4GNJA 3EKLA 4HT3A 5G4EA 1T96A 2PRHA 5F1UA 1MSSA 2FJKA 3E96A 3TNOA 2ATSA 2RDTA 4WXYA 2ZQ0A 1WA3A 4MZ8A 5D2XA 1X7FA 4CNNA 5FF7A 4BI5A 3L5LA 2YCEA 1ME9A 1ADOA 1BWLA 4IMFA 4Z1AA 3TXZA 2A85A 3LRLA 3SGUA 3EWZA 4GE8A 5LNWA 4IOTA 4LS2A 3W3OA 4C1LA 3UY8A 1R30A 1KTBA 4S2BA 4KFOA 2H90A 3O8AA 2QCDA 2Y7FA 1K7XA 1MEIA 1KFBA 2J27A 5LHFA 3LM7A 5K4XA 3C3NA 1ALDA 4AB4A 2QJIA 1Z48A 1L9WA 3LTSA 4JTSA 2ISSA 3WJSA 1W56A 4AHQA 3LHTA 2DZVA 2Y89A 2WSRA 4ORMA 1JUKA 3PBYA 3W07A 2ZFAA 4UR7A 3Q94A 1G4EA 4YL2A 4YWIA 4JX6A 2GVGA 4LS0A 2NUXA 4IX2A 4YMZA 1OX4B 1TJRA 1K7EA 1HO1A 3CIWA 3DKLA 4M6PA 3VE9A 5D02A 3BVJA 2H8XA 5E1QA 4WZHA 1D9EA 3P62A 4BWLC 1IXQA 3A5VA 4ALDA 3ABSA 3W1XA 4ML9A 3L65A 3FYOA 3G24A 4TMBA 2FPVA 4O10A 3KVKA 4CCCA 5DCEA 3G3MA 4N9DA 1T0OA 5T26A 4PL2A 2ISWA 2V81A 2ZZ4A 2TMDA 3DXIA 3QZEA 4OQVA 2VEKA 4ZVJA 4ZQRA 2CZ5A 1GG1A 3NEVA 4UFLA 1FWSA 3LCLA 3CHVA 3LXCA 4MOZA 4A29A 1YPFA 2A7NA 2A5HA 1H61A 4LOCA 3NDOA 4PL1A 3N73A 1R2RA 1KTNA 3FLUA 2XN0A 4YXGA 4ADTA 2DZXA 3V1PA 3WK1A 4NVTA 1VHNA 3BG9A 5SWUA 1JUBA 4NNCA 1W37A 3LOTA 3LHWA 1UB3A 2GUUA 2ZZ3A 2YPIA 4K37A 2CU0A 2BTMA 5EMUA 1UCWA 4FNQA 4WUIA 4M5PA 3UXAA 5KZMA 4NX5A 3FEMA 2TYSA 3NA8A 2ZTKA 1LRQA 4AWSA 3TA6A 4FEZA 3HIJA 3GZ3A 3M5YA 5C2XA 3PR2A 1HO4A 1VRDA 3HG3A 1XCFA 1RV8A 3IGSA 1ZNNA 5BOOA 3P7YA 5E0KA 3R5EA 2ZYFA 3P81A 1H7XA 1EWDA 1HUVA 4JD4A 2Y85A 3PG8A 1AL8A 4GJ1A 4X22A 3EWUA 5I3GA 4GXMA 4GUGA 3M44A 2I14A 3O16A 2QCDB 3QC3A 3W7CA 4O12A 3GKFA 4Z1CA 2BLEA 1SZFA 4FX6M 3UWZA 1Z44A 3USBA 4MY9A 1VS1A 5D04C 1TPH1 1WAUA 3I6RA 3QH2A 5FEPA 3UD6A 1XDLA 1PVNA 2DZPA 3ABRA 4RXGA 1WOAA 4M7TA 2CWNA 2HMCA 3W1PA 3S9YA 2FDSA 1XBZA 1S5WA 3I7SA 3VCRA 2QCMA 3LV5A 1GVOA 4MJZA 5CZTA 1G6CA 3L0KA 5HR6A 1J4EA 5ABTA 3STGA 2DJLA 1J2WA 1TCDA 1EP2A 1DHPA 4LT9A 4JX5A 4LV9A 3EWYA 4BK9A 2ZCGA 3GLCA 3EWXA 3CEPA 1JVNA 4CLMA 1TRDA 3HF3A 1QR7A 5LNSA 2Q8LA 2ZRWA 1VCVA 3MMTA 2E6FA 3QW3A 2PCQA 4YCOA 1G4SA 1W5MA 3W83A 2ALDA 4ORIA 3LX9A 3MHGA 2DU2A 3TU9A 2DORA 4IMDA 2ZA1A 2HS8A 1O5KA 4QIUA 2I9EA 2QDHA 2ZRVA 3BLIA 3BG3A 2A7PA 3EX6A 1YTKA 1VYSX 2GVJA 4BFAA 4DEFA 1C8VA 3DGRA 3G0SA 1SO4A 3KVJA 5I3JA 3P60A 3G3DA 4FIRA 3T44A 1ZAJA 1LYXA 1H7RA 3NQVA 2NUYA 3C56A 3C2RA 4MVAA 4XTDA 1UJPA 3NL2A 4IXXA 2Z0IA 3ATYA 1L6YA 3NYZA 1FWRA 1I2RA 2QCGA 4MY8A 3SY5A 2X16A 1LOSA 1OFBA 4WOQA 3I7QA 3C6CA 4DPQA 3GNDA 4PH6A 1DV7A 1SO5A 3QPYA 2QDGA 1F05A 4JICA 3AJXA 5K2ZA 2VEIA 1Q6RA 3LCIA 4AEOA 4IWWA 3SW6A 3HJZA 4U28A 2XFWA 4PFMA 1DBTA 3PG9A 2X30A 1H7OA 4O52A 2LLEA 2Q8ZA 3W1QA 4AWUA 2WOQA 2CZEA 3CC1A 4LUIA 3W1TA 3C2EA 3PSWA 4RJEA 4O4WA 3QJAA 4QNEA 3STCA 5DN1A 2C19A 4HNNA 3UWWA 1I2OA 2YFOA 1R2TA 4K8EA 4X9SA 1I4NA 3HPSA 3DHFA 4CCDA 5G4WA 2E77A 3G1VA 4UIOA 4UTJA 5LNRA 1OFPA 1TJPA 2Y62A 5KZEA 1H7WA 4FNUA 5D33A 2H3BA 4DF0A 1RD5A 1JCYA 4NQ1A 4S1FA 1NAL1 5EPDA 3DZ1A 1RQBA 2Y7GA 4FB7A 1H7NA 3B0VC 3W2JA 4O13A 4UFJA 4HKPA 1ME7A 1SO6A 1GYLA 2BZNA 3U8GA 1C9DA 1ICSA 4ZQCA 2YGYA 1XC4A 2Z2UA 5TBOA 4UTMA 4RLIA 3GYEA 3KOFA 1PL9A 4CNPA 2P1FA 3BK0A 4M6QA 4UTTC 1WV2A 2QR6A 3B4UA 3TJXA 5BMWA 4A2RA 1G67A 1X8FA 3W76A 1TREA 4NUWA 1YADA 3S5NA 4EIVA 3DFQA 1SUXA 2X1SA 3CQ0A 4UMBA 1H63A 3NPWA 5K4ZA 1TPC1 3SECA 2XN2A 1GQNA 5AHMA 2C6QA 3EX2A 4JIPA 1UASA 3O6CA 4FO4A 1YXYA 4PCFA 3DENA 1KM5A 4NT0A 5A8GA 1XKYA 1EX5A 4AAJA 2Y7DA 1A53A 1W3TA 5BNKA 1AK5A 1U5JA 3DBPA 2DZWA 3DFSA 2W6RA 3G1SA 4DBEA 1K8YA 1SSDA 2NXHA 4NJHA 3W23A 3YPIA 3P67A 3NL3A 4EF8A 2JK2A 3U2OA 1W5QA 2CLLA 3BO9A 4CNOA 3TDFA 4YCPA 3TSBA 4N9EA 4UFMA 1TPWA 4UR8A 8TIMA 5C55A 1QOQA 1HL2A 1G7VA 5TIMA 4ZQPA 2NXGA 3NG3A 3S5ZA 3W7RA 5LZLA 3TUUA 1IXNA 3W7LA 2QUVA 3W85A 4OV9A 1TV7A 4NU7A 3IIZA 3LLFA 2RFGA 1R46A 1RR2A 1YDNA 1B3OA 1VYPX 4JTEA 3Q37A 4IPIA 2VOMA 1TYGA 1LLZA 5E93A 2WJZA 1ME8A 1FY6A 1OF6A 4LNYA 2E6YA 1JRCA 3QQ1A 1FDJA 3OVQA 3QMSA 3ABOA 1H1YA 2ZZ6A 1PCWA 1Q6OA 3DFNA 3N2XA 4JR5A 5CZ0A 1OX5A 2CLEA 2QUUA 5G1TA 3G1AA 3L21A 5KZDA 2E5CA 3IIXA 3QMTA 3W7QA 3CLMA 3S5OA 4HSOA 3HMJG 1GG0A 2NV2A 1SW0A 4JYFA 4LS1A 5KINA 3M16A 4GBUA 3I7RA 1LOQA 3SZ8A 3TROA 4QNWA 2ZRYA 1QMLA 3O15A 4JTTA 5AC7A 4NXSA 1ZAIA 3EEGA 4N9CA 2ZRXA 4NJGA 2W0UA 1RVGA 3NVTA 5D30A 4UTKA 4OU1A 4XZ9A 2C14A 3G1FA 3Q58A 2BXVA 4IGHA 4E2BA 1JUEA 1PE1A 3LHZA 1XM3A 3NQMA 3W1NA 5IBXA 2NZLA 4O53A 4LY8A 1F6KA 1TO3A 3CWOX 5HWJA 2CFFA 2QCFA 3PBVA 1WOBA 4FHAA 2WSYA 3IVUA 4XQ6A 2A0NA 1QCWA 4DPPA 3TMQA 1EA0A 1W0MA 3UWQA 5H2ZA 4LUJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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