5AHFA

Crystal structure of salmonella enterica hisa d7n with profar
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
244
structure length
229
Chain Sequence
MIIPALNLIDGTVVRLQRDYGNDPLPRLQDYAAQGAGVLHLVDLTGAKDPAKRQIPLIKTLVAGVNVPVQVGGGVRTEEDVAALLKAGVARVVIGSTAVKSPDVVKGWFERFGAQALVLALDVRIDEHGTKQVAVSGWQENSGVSLEQLVETYLPVGLKHVLCTDISNVSLYEEVCARYPQIAFQSSGGIGDIDDIAALRGTGVRGVIVGRALLEGKFTVKEAIQCWQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Isomerase
source organism Salmonella enterica
publication title Two-Step Ligand Binding in a Beta/Alpha8 Barrel Enzyme -Substrate-Bound Structures Shed New Light on the Catalytic Cycle of Hisa
pubmed doi rcsb
molecule keywords [(2R,3S,4R,5R)-5-[4-aminocarbonyl-5-[(E)-[[(2R,3R,4S,5R)-3,4
total genus 76
structure length 229
sequence length 244
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2015-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5ahfA00
4WOQA 3DI0A 4O15A 1YTKA 5D30A 5D02A 1QPNA 3DGRA 4Q32A 4AHPA 4IPJA 1O4UA 1F7BA 4ZL1A 4NNAA 3O63A 1H7XA 2PE4A 2QF7A 3KOFA 4JYFA 1TCDA 4NJJA 1I4NA 3LHYA 2E5CA 1WDWA 3NQMA 3QM3A 3NQVA 3FYOA 3B0PA 4UTMA 1LM1A 3K30A 4BI6A 4D2JA 4HNNA 1NFBA 1G7UA 2HS6A 1FX6A 4CNPA 1QO2A 5TQLA 1ZENA 4FF7A 4O13A 5KZMA 4Y96A 3WFAA 5K9DA 1PS9A 3WK3A 3KHJA 3NQDA 3HGJA 2ZRVA 3NL6A 1VPXA 1SQ7A 3W71A 1A50A 3W83A 1E51A 3GAKA 3ZS4A 4LVBA 1WQ5A 1KM3A 3IVSA 4NQ1A 5F2GA 3OA3A 2WQPA 4JGDA 3LLDA 3O6YX 5G2IA 1VR6A 2A4AA 3ATZA 4JY8A 1XC4A 3CM4A 3LV5A 1GOXA 2V2HA 1SW0A 2GVJA 2VFFA 4LS0A 2OT0A 2GOUA 1G67A 3QSRA 1B4KA 4FB7A 3S42A 1I2NA 3W2JA 5FF4A 1QPRA 3OBKA 2E6AA 5C5YA 3TK7A 5I3JA 3C3NA 4HT3A 1DV7A 5F2MA 4I7VA 3N73A 4IMFA 4UMCA 3PVFA 3IVUA 1PE1A 1KA9F 1V5XA 4Y8FA 1DQXA 3UXAA 3FEMA 5CG7A 3OVPA 3ATYA 2E5BA 2ZZ5A 1U83A 1OFRA 5FEPA 1LBLA 3GDTA 1SPQA 4JTJA 4A2RA 3SGZA 4FX7A 2VEPA 1UASA 1S5WA 5K4ZA 2W6RA 3LTSA 3NQFA 4HIBA 2HS8A 3KVLA 2DZSA 3L2IA 3I7RA 5LKYA 3TW6A 1L2UA 5CPNA 1FCUA 3CIXA 5G2HA 1XBYA 3L66A 2VEMA 3GIYA 2X1UA 3IVTA 4N9DA 3W7CA 4MVAA 3G8RA 1HO4A 1DBTA 2F7FA 3KRUA 3KVJA 2Q8ZA 1K03A 4XKYA 3W23A 1RQHA 1QNVA 4A29A 3EWXA 1G7VA 4O12A 1QPOA 1ZJIA 2C14A 3NL2A 1F05A 1OFOA 2IQTA 1IXQA 1VCGA 4A22A 3G8EA 3NQGA 1O94A 3LTYA 3A22A 3OVRA 4MJMA 1HTIA 3BVJA 4HN4A 5EA9A 3C52A 3NG3A 4K8HA 2R91A 4WUIA 2Q3OA 5L6UA 1KTNA 3W74A 1RVGA 1SR9A 3GYEA 1P0NA 4O17A 5LGZA 1H60A 5AHNA 2V2DA 5DBUA 4IMDA 1JCXA 3NL3A 4NX0A 1R47A 4LWWA 3TX9A 5H2ZA 2WOQA 2EF9A 4UFIA 4I9AA 3B06A 4BWLC 3W3OA 4UFKA 5HNRA 4O18A 1S3HA 4NJIA 2QJGA 4MUZA 1BTMA 1Z44A 3M6YA 1F6PA 1GYNA 3HG3A 4BR1A 5IBXA 1ICPA 3CQ0A 4E2BA 3W70A 2PC4A 2C16A 1R2TA 2B7OA 3G1DA 4RV8A 2TPSA 3PSVA 3BG3A 4JTIA 5T26A 1WOBA 4K37A 3S8HA 4IX0A 4PC8A 4LC6A 1VH7A 4O4VA 4Z1BA 1T99A 3GXTA 2CZDA 4RK8A 1F5ZA 1J5TA 3NPXA 4UTKA 4PA8A 2QAPA 1F2JA 1ML1A 3O8AA 4LVFA 5L9FA 5E0KA 1OFAA 1B4EA 4QQ3A 3TDFA 3WK2A 4UTTA 3LI1A 4GFSA 4UTWA 2VEKA 4YL2A 2EHHA 2FQIA 5K2ZA 3HPXA 3QC3A 1CI1A 3LTPA 4JIQA 1DKWA 4ICNA 1AW1A 3S9YA 1L6YA 3L68A 1OX5A 1YPFA 3O07A 3FLUA 3HQ1A 2JGQA 2X30A 2NX3A 4PEKA 3DFQA 1GJPA 5DCDA 5FEXA 3USBA 1JCJA 5AHEA 1W5NA 1FDZA 4OV9A 4Y90A 1EWDA 3M5YA 1WA3A 5BRBA 1W5PA 1LP6A 1ZFJA 3W2MA 4O11A 5H91A 1D9EA 2ABAA 3HIJA 5E1QA 1JUKA 2C3ZA 5I3IA 4UNKA 3MBDA 1KLYA 3F03K 4UR7A 3P8JA 4LV9A 4AF0A 1OYCA 2FPTA 4JD4A 4O4WA 4O1AA 2TYSA 3LCHA 3MHGA 2YFNA 3T55A 1IXPA 2VKZG 4WY0F 1Q3NA 1JVNA 5CPLA 3TIMA 1CW2A 2OZ0A 3GXPA 4UFJA 3W1NA 4A3UA 1LRNA 2ZDRA 4M6PA 2ZA3A 4HSOA 5AC7A 2TRSA 4RXGA 3B8DA 2B7QA 1OFQA 3FJ6A 3LHUA 4X2RA 3G22A 2FPYA 4XWUA 3EX2A 5D04C 2AAMA 3L0KA 2NZLA 3M41A 1FDYA 3L21A 5CPOA 3W7LA 3H54A 1SSGA 1SFLA 3LOTA 3UWVA 3DAQA 3KXQA 1XDMA 2QCCA 3UZJA 3W87A 3SJ3A 5LSMA 2QCLA 3A24A 2Z6JA 4EWND 2I9EA 1KTCA 1X1ZA 4KFPA 4IMCA 3IGXA 4LTSA 1LOQA 3DFOA 1WBJA 4X22A 3MP5A 3RLVA 1AK5A 1TRIA 4PH6A 1LTDA 3S1UA 3CT7A 2XFWA 2JKEA 2CW6A 2Q8LA 3NNTA 4O0ZA 3W6YA 3P74A 5AN7A 2ZA2A 4EF9A 3RU6A 2QAFA 2QKFA 1OF6A 4Z0JA 3P67A 1MEHA 2QCDA 3DHDA 1EP2A 4FXRA 1OYAA 4JTLA 5K4XA 1XDLA 1W5QA 2R8WA 1O5XA 3TMLA 4FIRA 4OWGA 5CPMA 3R89A 3ABOA 3GXNA 1VGAA 3CEPA 2AQWA 4LC8A 3HGOA 5IM51 3C2EA 4HPJA 5A8GA 5LHEA 4KWWA 3NQCA 3IIPA 1PCKA 3W2LA 3C61A 3EWUA 5DXYA 1G69A 3EX6A 3F4NA 3SFKA 5FF3A 2RDWA 3G0XA 4CQ9A 1DORA 4DXVA 3MWAA 4IUOA 2BWGA 3PSWA 2Y89A 2E5DA 1XXXA 3ELFA 1JCNA 1KTBA 3GKFA 3W2KA 5I3KA 2WO5A 5CSRA 2C18A 1GWJA 1OFPA 2QUTA 4ZQNA 3S0CA 4ORMA 2W0UA 5KTLA 4EIVA 1WX0A 1P0KA 1W0MA 4O50A 1JJKA 1T8XA 1I45A 3SIZA 4ADUA 4ZQRA 2NV1A 3LHWA 4HSNA 4K36A 4GRSA 2QJIA 3BG9A 1WXJA 3O1NA 3S5YA 2V81A 1I8JA 2Y7DA 4MLJA 3GX9A 5G1YA 4JTHA 8TIMA 2ZQ0A 3DXIA 3STEA 3WJXA 3R8RA 5AB3A 1YDNA 3TA6A 1WAUA 1RD5A 2E6DA 4JXCA 1EUAA 5A5WA 2NX9A 3B0UX 5D2WA 2ZTJA 3QYQA 2NUYA 1FWTA 2ZRYA 4RZ6A 2P0OA 5EL1A 3SW6A 3G3MA 4CCEA 1GTEA 4S2BA 5D38A 1IF2A 5FEWA 5TBOA 1KFLA 4OE7A 1OF8A 2Y85A 1MXSA 1R2SA 2RH9A 5G2WA 3UPBA 3NAVA 2Y61A 1H7OA 2LLEA 4ADSA 4OQVA 1OFEA 2QCDB 1EP1A 3V75A 3ZFHA 4JYDA 3E96A 4UTLA 5K3VA 3QJAA 4JX4A 4MFEA 4FX6M 3E12A 2HTMA 3PULA 3GNDA 3ABRA 4XBKA 3GZ3A 3GB6A 4TO8A 5AC8A 3GLCA 1ZALA 2J6XA 1W5MA 3W2UA 1U5JA 4OT7A 4JS3A 4AWTA 3UPWA 5C54A 6TIMA 1GVRA 4NJKA 3C2VA 2FLIA 4Q4KA 3T44A 3W2NA 3PR2A 3UWWA 3A5FA 5FEZA 5LGXA 4LY8A 3SI9A 3FKKA 4AB4A 4LOCA 1IGSA 3QQ1A 4M7SA 3E49A 3CWNA 3LRMA 1TTPA 4YLWA 1EP3A 3TFCA 3UWQA 1HFBA 4ALDA 1LLWA 1VYPX 1HUVA 4C1KA 1X1OA 3W7DA 4MZ1A 1VCVA 3G1HA 3M16A 1ALDA 1V7YA 3QH2A 5G1TA 2X2GA 2E77A 2E6YA 2OT1A 4JX5A 2NWSA 3M47A 1WOAA 1YTEA 3G0SA 3NVTA 4XQ6A 4LW7A 2ATSA 5FI8A 2VXNA 1UJPA 2OX1A 3V1PA 4NX5A 1TQXA 5C55A 5CGQA 3W7IA 3RK8A 1TJRA 3W22A 5HQEA 4MJZA 1H7RA 2Q3RA 4M19A 1OYBA 4BWLA 3G24A 1VZWA 1AW5A 3M44A 2DZWA 4KKXA 5AOUA 2BZNA 4WZHA 2Y7FA 1UBSA 3HG5A 5LHFA 3L67A 4H6KA 4O53A 3QSTA 4O16A 5CSSA 4RR4A 1BWKA 3B0VC 2YFOA 2X1RA 4RCXA 1RV8A 3UY7A 1TTQA 2YZRA 2RDUA 1VJIA 4UIOA 1PIIA 4UUIA 3L5MA 2YGYA 1N55A 4K8EA 1KM5A 2ZTKA 4JYEA 4LRTA 3PG9A 1M7PA 3FS2A 3O05A 3AJXA 4UTJA 2A85A 3TNOA 3NDOA 3RMJA 2ZZ1A 4RZ4A 4K6AA 1A5BA 2B7NA 4YCPA 3NL5A 5KZDA 2CLKA 4QISA 1ZY9A 2CU0A 4CCDA 3QW3A 2A5HA 4XZ9A 3T40A 4MKNA 3W7OA 3TSMA 3UWYA 4NU7A 4KWVA 4B5NA 1JULA 1EA0A 2J9YA 1TMHA 3W73A 2CLHA 1DL3A 1NF0A 3PUDA 5F4XA 3L65A 1XL9A 3OVQA 4O19A 3VE7A 3LXBA 3LCWA 5AYZA 3HF3A 1ZAHA 3T78A 4AWSA 1FXQA 2OCZA 2YYTA 3KAOA 4O57A 3A23A 2DZUA 3S5ZA 3B05A 4JN6A 3SSJA 4Y6GA 2WSRA 4NJHA 3W7QA 3MHUA 2DJXA 4XTDA 3MO7A 2GJNA 3F4WA 1B57A 3IIVA 1LRTA 3KVKA 2C19A 4NNBA 5F2IA 2Y7GA 1Y0EA 5U7SA 5AC6A 2JGYA 3IGSA 3IIZA 1OG0A 1K02A 2YDAA 2ZZ3A 4JEQA 4CLMA 4PTNA 5DLCA 2VELA 1SZNA 1QOPA 1JR1A 4NZJA 2QCGA 2JKPA 2V0TA 1TPFA 2ISWA 1R30A 3W1RA 1FCVA 2V2CA 2VC6A 5C6MA 1O95A 1LRQA 4CQAA 3IIXA 3UXDA 1ZAJA 3RLUA 1KLZA 4IWWA 4AXKA 5CKSA 4DBDA 2WNQA 4PL1A 2WJZA 3O16A 4CQ8A 4MYAA 2C6QA 3W7NA 3GKAA 4MIMA 3TC7A 2VENA 1R2RA 2ZZ7A 5HWJA 4GJ1A 3M9YA 3DH7A 3LXAA 2ZFAA 1XUZA 1VS1A 2PRLA 1YXDA 1VYRA 3LBCA 5FF2A 4QITA 1JCYA 4QM1A 3LCGA 3Q2DA 4AVFA 2ZRUA 3DFNA 1M7OA 4GUIA 5J5RA 3QQ0A 3SGUA 4Z1DA 5LNUA 5F4WA 4GUHA 4ADTA 5D2TA 4RJEA 4BI7A 3PBVA 1QCWA 5I3FA 4LV4A 3HMJG 1GVFA 1OVDA 4ZVJA 1VC4A 3EWWA 5KSWA 3TE9A 1H1YA 4WJEA 1KBIA 1G4SA 4Z08A 4LU0A 3FIGA 1GYLA 3C6CA 4DPPA 5K9XA 3DHFA 3E9AA 4H3DA 3E0IA 1AMKA 3JR2A 1VRDA 3C2OA 3C4UA 3C8FA 4O14A 4RLIA 4PFMA 4N4PA 4K7YA 4IPIA 3PG8A 2B7PA 2CLOA 1KBJA 2VFIA 2AGKA 3YPIA 1KFBA 1YXCA 4FIQA 1RQBA 1FWWA 3LCXA 4N9BA 1QOQA 4GUJA 4WD0A 4FEZA 1UUMA 1N7KA 2QCHA 1VLWA 3TCEA 1N8FA 3QMSA 2J9XA 3SECA 2PCQA 3BO9A 1QWGA 1WBHA 3W72A 1QPQA 4JTEA 3CLMA 3W1UA 3M1ZA 1F76A 1W54A 3ZWTA 2DP3A 2YCEA 1Z42A 1C8VA 1IIGA 5AHIA 4NVTA 4ORIA 1LOLA 3W1LA 3PS7A 1AL7A 4ZZ9A 1M6JA 3GAYA 3NPWA 4JTTA 1UB3A 2A6NA 3IEBA 5DY3A 3DFTA 1FXPA 4IXHA 1JRCA 1OX4B 3KVMA 3LHTA 3LGEA 3W1MA 2Z2UA 3W76A 4JDYA 2DZXA 2VOMA 4JR5A 3NZ1A 1XBZA 4ZQCA 4XTIA 3W7HA 2Y63A 3PBUA 3S6DA 4QAIA 2QDGA 2V5BA 3THQA 1DHPA 2BSLA 3OG3A 1LOSA 4AHQA 2A6LA 3EWBX 1GZGA 2CLLA 4HNUA 2EGZA 3L0GA 1SO3A 2O7QA 2E68A 3P62A 2QUUA 1C9DA 3W7GA 3L0NA 1JQVA 4MFDA 1KFJA 1L6WA 3F1QA 3W7KA 5DCBA 1ZHAA 1QMLA 1IIHA 1H62A 3EX1A 4IX2A 4M5PA 3Q58A 1ICQA 2ABBA 4LVGA 1KM0A 3NQ8A 1JCLA 2CLEA 2FB3A 1H7PA 5EY5A 3P81A 5HJLA 3E02A 3QPZA 2YPIA 3TW7A 3TAOA 1LLZA 3PWAA 1TV5A 1GTHA 4LS2A 3LCFA 1SO4A 3W9ZA 5K9CA 3NYZA 3W88A 1YDVA 4DO6A 4E0CA 3EB2A 4JDBA 4ONVA 5FESA 3TSBA 4O28A 2GQAA 1TPUA 3ANYA 3MI6A 4BFAA 1ZAIA 2A7RA 3O6CA 4PL2A 2B0MA 1X8FA 3B04A 3EX3A 3DKJA 3M5ZA 5HUPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4XVE A;  1X38 A;  1FHL A;  4XG1 A;  1YTK A;  3WUB A;  3WQV A;  4X63 A;  3DGR A;  2D22 A;  4H9Y A;  1QOX A;  4NNA A;  3ZJ6 A;  1H7X A;  2PE4 A;  4JYF A;  1ISZ A;  1TZ7 A;  3B0Y A;  4XB3 A;  4NJJ A;  2E5C A;  3AIU A;  3QM3 A;  3FYO A;  3CK5 A;  3B0P A;  3BQ6 A;  1G7U A;  5D9M A;  4S3B A;  1XYC A;  2VL4 A;  4D6G A;  1OC6 A;  4UQB A;  2DGA A;  4O13 A;  4X0N A;  3WFA A;  1O1Z A;  4Q4M A;  1SM9 A;  3WK3 A;  2EEX A;  1XHG A;  3NL6 A;  2VDI A;  1SQ7 A;  3DYM A;  3DG6 A;  5JVL A;  1D2K A;  4MWA A;  2BVY A;  1WQ5 A;  1JDC A;  2PDX A;  3IVS A;  4NQ1 A;  3GZA A;  4Z42 C;  3B97 A;  3O6Y X;  2WM0 A;  3DER A;  4QDM A;  2YKK A;  1VR6 A;  3HM7 A;  4JY8 A;  4XZN X;  1GOX A;  1SW0 A;  2VFF A;  2OT0 A;  1G67 A;  4PBG A;  4B15 A;  1B4K A;  1QNO A;  3S42 A;  1UZ1 A;  5FF4 A;  4HK5 A;  8CGT A;  2E6A A;  5I3J A;  4ZXL A;  2QMK A;  5BRO A;  3C3N A;  1DV7 A;  4I7V A;  1RK5 A;  3RXZ A;  3PVF A;  4TVC A;  3AXM A;  1FWJ C;  4A8I A;  4HMC A;  4Y8F A;  4V28 A;  1TJ0 A;  4W7V A;  1SFS A;  1YE6 A;  2PP1 A;  3ATY A;  4MAD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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