5AHFA

Crystal structure of salmonella enterica hisa d7n with profar
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
244
structure length
229
Chain Sequence
MIIPALNLIDGTVVRLQRDYGNDPLPRLQDYAAQGAGVLHLVDLTGAKDPAKRQIPLIKTLVAGVNVPVQVGGGVRTEEDVAALLKAGVARVVIGSTAVKSPDVVKGWFERFGAQALVLALDVRIDEHGTKQVAVSGWQENSGVSLEQLVETYLPVGLKHVLCTDISNVSLYEEVCARYPQIAFQSSGGIGDIDDIAALRGTGVRGVIVGRALLEGKFTVKEAIQCWQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Two-Step Ligand Binding in a Beta/Alpha8 Barrel Enzyme -Substrate-Bound Structures Shed New Light on the Catalytic Cycle of Hisa
pubmed doi rcsb
molecule keywords [(2R,3S,4R,5R)-5-[4-aminocarbonyl-5-[(E)-[[(2R,3R,4S,5R)-3,4
molecule tags Isomerase
source organism Salmonella enterica
total genus 76
structure length 229
sequence length 244
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2015-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5ahfA00
3KFTA 3W75A 4ZQMA 2F7FA 4FO4A 4JYFA 1RVGA 1DVJA 4O18A 3B8DA 3UY7A 1W8SA 1THFD 2WKJA 1FWWA 4AF0A 1I2QA 2D73A 4O50A 3W7PA 3BLIA 4A22A 3EXTA 2ATSA 2RH9A 2VXNA 3C2OA 4FNTA 5DCBA 3WK0A 3LTSA 3W84A 5F1VA 3TC6A 1YDNA 1F76A 3GAYA 3P8IA 6ALDA 1P0KA 2OMAA 1ZHAA 1YXCA 3QPZA 3O1NA 2RDWA 3JR2A 2A5HA 3EWYA 2RHGA 5FF7A 1KM5A 3HGJA 3PUEA 2QCLA 3VCRA 3W07A 5C2XA 4JDYA 5FF0A 1F5ZA 4GUGA 3W7DA 3D0CA 4C1KA 3C2FA 3GNDA 1KM0A 2ISSA 1FCQA 2XN1A 3QYQA 4WQ6A 1LTDA 4OV4A 1W37A 2EAWA 4CCEA 2B7OA 4WOZA 3W83A 2E5CA 4DO6A 1ZAJA 2O7SA 1HUVA 3FFSA 4UTHA 4MZ8A 2QAFA 4JYEA 1PE1A 1K02A 3UWQA 2YSWA 1GVSA 3W7NA 1PCKA 4ALDA 3U2OA 3CEUA 3PG8A 4Q32A 1KA9F 4EF8A 3A22A 3NA8A 5U7SA 4QNEA 1MEHA 3WJZA 1UCWA 3DFPA 4N4QA 5K4ZA 2WNZA 1ZENA 4UTJA 5EYWA 1W5NA 5I3HA 5ABTA 1QPOA 3L65A 4FHAA 2E77A 3G0XA 3PULA 3M47A 1LORA 2FQIA 3NZRA 4QM1A 4N9CA 4M7TA 3LXBA 4CQ8A 1ZY9A 1WBHA 3QMSA 1VRDA 1OX6A 1H1ZA 1WOAA 1VHCA 2ZZ7A 1BWKA 2CZDA 3FKKA 1VR6A 3N2MA 4FF7A 1AW5A 2C19A 4YWIA 3TH6A 4CQ9A 2JK2A 3GR7A 1G4TA 2C3ZA 3MWAA 4LUIA 2QUUA 4E0CA 3VE9A 2GOUA 2WPBA 1TTQA 3LHTA 5AC6A 2NLIA 4A3UA 3PVFA 3LTYA 3DHDA 3BLEA 3EX6A 4NXSA 3C2EA 3LI1A 2RDUA 4UFHA 1P5BA 2NX1A 2Y7EA 4NNBA 1WA3A 4DBDA 4WX2A 1WAUA 1GVOA 3STEA 3WFAA 3F03K 3EB2A 4MZYA 4NQ1A 4FIRA 3E12A 4M6PA 3CTLA 1RQEA 3MHFA 4O1CA 2DZPA 3P81A 3C6CA 1QPRA 4DF2A 2NXIA 2YYTA 1T99A 1JUKA 5AOUA 3OBKA 4XTDA 5FESA 1JCJA 4QSHA 3W1TA 4K7YA 1V7YA 2ZFAA 3H55A 1ME9A 3PS7A 1KM3A 1JRCA 1QPQA 1A5BA 4JX4A 1YXDA 1Y0EA 1TV5A 3G22A 5F1UA 3FOKA 3GXNA 3HF3A 2DZXA 5AB3A 4FX8A 2DZTA 3HG2A 2HTMA 2A4AA 2A7NA 2W0UA 3LTPA 3IIPA 5AHIA 3TA6A 5A5WA 3LM7A 1OK4A 2ZTKA 5LGXA 3L9CA 1IXNA 1DL3A 1YPIA 2NV1A 2WSYA 1TREA 1Z42A 4MOZA 4A2RA 1FWSA 2FIQA 2CW6A 3HB9A 3AJXA 3GDRA 4HSNA 2ZYFA 2Y62A 3F4NA 1DOSA 1MZHA 2P0OA 1QOQA 3Q94A 5G2WA 5C5YA 4JTFA 3NQ2A 3EX2A 5D09A 4MZ1A 1AK5A 3C61A 3QZEA 3TJLA 5F2IA 2QCEA 1GVFA 3EX3A 4Z0SA 3TSDA 1SO5A 4UXDA 3H53A 4DBEA 4MVAA 1D9EA 3GR8A 3Q37A 4WY0F 1I8JA 1BWLA 4O57A 3G0UA 2X2GA 3M5ZA 3M16A 1B9BA 4TIMA 4UTTC 2HS8A 3RFAA 3WJSA 1HO4A 1W5QA 3TQVA 1C29A 4FX7A 3T4CA 2NX3A 4M7SA 3DBPA 3SECA 3TW7A 4QITA 4AWUA 3EWZA 1V5XA 3MHGA 1GG1A 1JRBA 3HGOA 1MXSA 3ABRA 3IGSA 4DO5A 2WSQA 1OABA 4NUWA 1G4EA 4QIUA 3UY8A 1R2RA 3FA5A 4O1BA 5D30A 2PE4A 2J9XA 3EWBX 5F4XA 5FI8A 1JJKA 1MEIA 2FPVA 1KBIA 4RV8A 4ZQOA 3G1HA 3OVQA 1U5JA 2B7QA 2H6RA 2E6AA 4IPJA 4EOUA 2RKXA 3CB8A 4I7UA 1R2SA 4Y90A 3BG9A 2DJXA 4DPPA 3DFOA 1OX4B 4FNPA 5EMUA 4NU7A 1EB3A 1ME8A 4UMCA 3S5ZA 2GQ8A 2CLLA 4FB7A 5D02A 1GVRA 4UTWA 3W1AA 2ALDA 4QNWA 2HMCA 1H60A 1VHNA 4FNUA 1JUEA 4NZFA 5C6MA 4JTTA 3EEGA 4RK8A 5AHFA 4AXKA 3RMJA 1X1OA 1F2JA 4BF9A 3IVSA 1KFCA 3P8JA 1YXYA 3P5YA 1KBJA 1SSGA 3BARA 2ABAA 3LLDA 1SR9A 3IEBA 4BFAA 1YADA 1DHPA 3C0JA 3DH7A 5DELA 1KV5A 3DFTA 3W7OA 2ZRXA 4HNTA 1OFAA 3W7KA 5J5RA 3ZWTA 3C2RA 2CZEA 3PUDA 3W85A 1QNVA 4NX0A 2VC6A 2G96A 5HMSA 2FFCA 3MP3A 4XKYB 5BMWA 2QJGA 2J9ZA 3EWXA 1FWRA 1SUXA 1TPFA 4AMAA 3DKJA 3S1WA 5EBUA 2YYUA 5BRBA 1TIMA 5LHFA 1LCOA 5LHEA 4UMAA 4RJEA 2PURA 3DI1A 1T8XA 3ZWSA 3LI0A 2V2HA 3NO5A 4QQ3A 3W73A 4IMCA 1K7EA 1CI1A 1UBSA 3C52A 1FCVA 4LS0A 2ZZ4A 4JX5A 3NQ6A 2NUWA 1C9DA 5MHBA 2A21A 2ZRWA 1Q6QA 3SIZA 3HIJA 3JRKA 3PUOA 5FEZA 3HQ1A 4MUZA 3MBFA 3W1LA 1MO0A 2X16A 4UUIA 5I3KA 3KVLA 3B0VC 2JKEA 1TPB1 1QO5A 4XTIA 1KFEA 1TMHA 3ABSA 1IXOA 3W9ZA 4Z1AA 4N9BA 1LOQA 1KM4A 4UFMA 3IGUA 4KWWA 5I3JA 5D2TA 3DXIA 3EKZA 3QRHA 3L0NA 3L5AA 4GUFA 5D2XA 3TR2A 1FXQA 2YZRA 1H7PA 4ZQNA 3NPXA 4LVGA 1IXQA 1IF2A 1I4NA 4TMBA 1K03A 2V2CA 4K39A 2DZUA 1YLVA 4WJEA 4K8EA 2J6XA 2P1FA 1JCXA 3MBDA 2R91A 1VPXA 3M44A 1YTDA 4EIVA 2DP3A 4UFJA 4DXVA 4MYAA 3N9SA 3P74A 1QWGA 1B3OA 1A5AA 1L9WA 3GB6A 3L21A 3MI3A 3O6CA 3CIXA 2JBMA 3SGUA 3P62A 1SO6A 1H1YA 1S5WA 3NQEA 2TPSA 1J5TA 3LV5A 4IXXA 4Z1BA 4OQVA 2KZHA 4RLIA 4WXZA 2YR1A 1WOBA 3GDKA 1GTEA 3B05A 2B0MA 1LRQA 1VCVA 2VELA 5TBOA 1RPXA 2Q3RA 1FWTA 4O54A 1DJNA 3IVUA 3NL5A 1BKSA 2TMDA 4NNCA 1W3IA 3P61A 1LDCA 3CQ0A 3NPUA 2GUUA 3HPSA 1AMKA 2ZRUA 3S8HA 1JQXA 4RR4A 3G1YA 4XBSA 3INPA 4JYDA 3TQ0A 3TSBA 1LZOA 3QW3A 4AB4A 5A8GA 2XN2A 3W2MA 4JY9A 3E96A 4R53A 3FJ6A 4ZVJA 3ZS4A 3TJXA 5C54A 1TRDA 2Z6JA 4GE8A 4JTJA 3DENA 1FX6A 4DQWA 3VNDA 3GNNA 1F6KA 3VKJA 4POCA 1SZFA 4MIMA 4FNRA 1K8ZA 5H91A 1DQXA 2QCDB 4Y6GA 3PWAA 3B03A 2WJZA 4LY8A 5DBTA 5CZSA 3T78A 3P80A 5EPDA 4GUJA 4PCFA 1ZAIA 3G8EA 5G5IA 1FDYA 1F74A 3OIXA 4LU0A 5KTLA 3DFNA 2VFDA 3LX9A 2CLOA 3V75A 1X7FA 1RQBA 1FXPA 2Y61A 2GPTA 3FJLA 2NV2A 4NJKA 2CLKA 5CPOA 3R89A 1ZFJA 1O5XA 3ELFA 5BNKA 4UTLA 4LVFA 3M41A 3O15A 4UIOA 1KV8A 3L0GA 2H8ZA 4CQAA 5I3GA 3CLMA 3S1VA 1I45A 3TUUA 5LNVA 5CSRA 2V30A 5DXYA 3OHIA 3LHYA 1D3HA 3FEMA 1VLIA 3LBCA 1KM1A 5D37A 3KRUA 1J4EA 1QO2A 5DN1A 3HMJG 4K36A 4PL2A 3SZ8A 3G1SA 2V82A 1XC4A 4LVAA 2BX7A 2PRLA 1VJIA 5F2MA 1KFJA 5K9DA 3TDFA 4PEKA 2JGYA 2NWSA 4HKPA 5FF4A 2QAPA 3NOEA 4DELA 3SJ3A 1OX5A 3LRMA 2QEZA 3MHUA 1Q6LA 4E38A 2TRSA 5K9XA 2H3DA 1TQJA 3QSTA 3IRDA 3W3OA 3KRSA 2QCGA 3LCGA 2E68A 3RU6A 3THQA 3UZJA 2E1DA 4MY8A 3NDOA 3G18A 1UUOA 2I14A 4OU1A 3E9AA 3FYPA 4IMGA 2I9EA 2QKFA 1S5TA 2R8WA 3UQNA 4I7WA 1JCNA 4UTUA 3O05A 4S2BA 2DZSA 1OJXA 2ZZ2A 3TV8A 1Z48A 1XBZA 3EX1A 4OT7A 4AHOA 1XKYA 3NPVA 3LHZA 5H2ZA 1F7BA 2BWGA 3QPYA 1TTJA 2FB3A 2GQ9A 2Y85A 3W7EA 2ZQ0A 3BVJA 1FDJA 2Z2UA 1ALDA 1G4PA 3GK0A 4JS3A 2Q3OA 1VGAA 3GYEA 1TB3A 1KLYA 5HUPA 4GC4A 3S6DA 2NUYA 3TMQA 3B04A 4RZ4A 1EX5A 2H8XA 2ZZ5A 3OVRA 3S9YA 1LP6A 3GXPA 3TU9A 2FPTA 1PIIA 3P7YA 1W5MA 5K3VA 4S2CA 4B5NA 3DAQA 4L4LA 3KRZA 3HG3A 3TSMA 4K37A 4O13A 1KFLA 4TMCA 2ZA1A 1GQNA 4JNMA 3UXAA 3O6DA 1OFDA 3NQCA 3RNDA 3HPZA 2YW3A 4ZQPA 1EP2A 1TSIA 4C1LA 4UFIA 4J9JA 2AAMA 3CT7A 3B4UA 3L5MA 2LLEA 4O52A 1EUNA 3KAOA 3C2VA 5AHEA 4GJ1A 5G1YA 3LB0A 1RD5A 1A53A 5D2WA 4IMFA 1Q45A 4IQLA 3STCA 3CC1A 3WK1A 3NXFA 1Q3NA 1TPH1 3T40A 3HG5A 3NQGA 4O14A 3LHVA 3E0IA 1RZMA 4UTMA 3R5EA 1QMLA 4UNKA 2X1SA 3S5YA 3SW6A 1ICSA 4LVBA 1LLZA 3QC3A 4LS2A 4WXYA 1M7OA 3PF3A 1O4UA 1K8YA 4CCDA 1SZEA 1AW1A 3TNOA 5IM51 4UMBA 1P4CA 4LC8A 1TPVA 4TO8A 4GWEA 4O17A 4WY0A 4K8HA 3RF9A 5AC7A 4XUGA 2Z6IA 3N73A 2C13A 4KFNA 4ML9A 4QISA 1GZGA 2QCNA 1OYCA 3LDVA 3W22A 5C55A 3T55A 3B0UX 1SW0A 2BTMA 1B4EA 2ZTJA 3NAVA 4K38A 3TX9A 4BWLA 5TIMA 2A85A 3V1PA 1QPNA 4JX6A 4KFOA 3PB2A 3KVMA 3A21A 3IIOA 3WK2A 2QDHA 1XDMA 1DJQA 3PC0A 2G97A 3BK0A 3UZ5A 4TX9A 1HO1A 3LRLA 4AVFA 3QEZA 4IX2A 4EF9A 2P10A 3LHWA 1XBYA 1DV7A 2QJHA 4OGZA 3MUXA 2VFFA 2YX0A 5HR6A 4JICA 3OVPA 2VFEA 3SGZA 4LT9A 2VENA 3BLFA 4LW7A 1ADOA 3CM4A 1L2UA 4M19A 3UYCA 5EKYA 1OFOA 5FF3A 1OX4A 1GOXA 4RCXA 3ANYA 4LTSA 4UNLA 1ZCOA 4UFLA 5D05A 1H51A 3PR2A 3JS3A 3NQMA 4HSOA 2ZCGA 3GIYA 4GFSA 1TPC1 3DGRA 3TXVA 2AGKA 5HINA 1H7XA 3NGJA 5G2HA 4JTLA 2A6LA 5LNUA 4E2BA 5KINA 3NQ7A 4R34A 1LBFA 1H50A 2WQPA 2ISWA 1H7RA 4O4WA 4XBKA 4OHQA 4K7VA 3NG3A 1OFPA 1GVQA 3EXRA 3W2KA 4GUIA 5DBUA 4BI5A 3EWUA 1R46A 3C56A 4NT0A 4AHPA 2CZ5A 1I2NA 4XKYA 5D2YA 5AHMA 2QJIA 1KM6A 4QJ1A 4UC5A 2DZWA 1N8FA 5F2GA 5TQLA 3TQKA 4MLRA 2J9YA 3L68A 1XM3A 3BPWA 1TPEA 5AHLA 3OG3A 5G4WA 4JY8A 3CWNA 3TCEA 1SU5A 2OX1A 5DCEA 4Z08A 1H62A 2G95A 3PSWA 3G1VA 1I2RA 3G1AA 3G24A 3W2NA 3BW3A 1JQVA 3NM1A 1TJPA 2ABBA 1WX0A 1SO4A 3STFA 5LGZA 3S42A 1OF6A 1VZWA 3CU2A 2IQTA 1LBMA 2C6QA 3PY2A 1PS9A 3S1UA 4JTEA 3N34A 5KZMA 3FIGA 3U8GA 5HNRA 4O8RA 1HFBA 1EWEA 2ZA3A 5KITA 3KVJA 1GG0A 4N6FA 3NPWA 2PCQA 3OA3A 2YPIA 1VYRA 5HULA 1H7WA 2VEIA 4MFEA 2V5LA 3KOFA 3HGRA 3L67A 2EHHA 3U6WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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