5AHLA

Apo-form of the deltacbs mutant of impdh from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
358
structure length
321
Chain Sequence
MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHETAKAKTYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGEIELFQGRSYKSYRVPYKGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa pao1
publication title Crystallographic Studies of Two Variants of Pseudomonas Aeruginosa Impdh with Impaired Allosteric Regulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
total genus 104
structure length 321
sequence length 358
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2015-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5ahlA00
3P5YA 3NQ2A 2VKZG 2CLOA 5D05A 1K8XA 1OFBA 1GYNA 1TPH1 3EWZA 4MKNA 2H8XA 2Z0IA 4QQ3A 2P1FA 2F84A 3TQKA 1O5XA 3W7IA 4MLJA 2ZZ4A 3UPBA 3IIPA 4I7WA 1KBIA 4AF0A 1HG3A 1X8FA 4BR1A 4P61A 3O07A 1PHQA 1W8SA 3L0GA 2P0OA 4MOZA 2V2CA 3MI3A 5BRBA 2JKAA 4AWSA 3B0UX 3JR2A 1LP6A 3QC3A 4JIPA 1Z44A 3DFSA 1VYRA 4MUZA 4LS1A 2NUWA 3W73A 1JR1A 3NQFA 2Y7EA 4FHAA 4WOZA 3IRDA 3TC6A 4JTHA 3M9YA 1LORA 2E5CA 2VEIA 2YX0A 3P8JA 4TR9A 3W1PA 1W3NA 3E96A 3IIZA 1HO1A 4WZHA 1RPXA 2NX1A 4HNVA 1YTDA 1H50A 2DZXA 1QO2A 5LNRA 4PA8A 3P74A 8TIMA 4AB4A 1LBLA 3MHGA 4IUOA 2AQWA 1VZWA 4M6VA 3L0NA 3PY2A 1FWNA 3HMJG 4O11A 5G2HA 1KFJA 4OHQA 2BZNA 1XC4A 3W7CA 1HTIA 3E0IA 4UMBA 4OV4A 3QM3A 2EAWA 1L9WA 3TQ0A 4N4QA 4Y9AA 3BO9A 3N2XA 1PV8A 4MY8A 2Y7DA 2ZZ5A 5FEZA 3SY5A 1GG1A 1Q3NA 4MFEA 1EEPA 5A5WA 3TX9A 4Q4KA 1SZGA 1K7FA 2Q3RA 5ABTA 2H6RA 1TQJA 3UWYA 3CEPA 3W1XA 1LTDA 3INPA 3Q94A 5DELA 1LBFA 3WJWA 3IGXA 4MIMA 2V9DA 3PBWA 3FKKA 1QNVA 4QIUA 1VYSX 3EXTA 4JYFA 1W3IA 3F03K 3FKRA 2BSLA 4IX2A 4MLRA 5BOOA 1P5BA 5G5IA 3L68A 1T8XA 1R2TA 1CI1A 1OFRA 3QFEA 4MY1A 1HO4A 2V8ZA 1FX6A 2YW3A 4CNPA 1Z48A 1VQTA 4KKXA 3MP3A 3NPWA 3LCIA 1KM3A 2NWSA 5K4XA 3EWUA 5HULA 2YFNA 3UY7A 3NQCA 3I7RA 3B03A 4YMZA 2QR6A 5CZTA 4XZ9A 4I7UA 4RZ5A 4ZMGA 3AO0A 4OBTA 1FY6A 1VCFA 4RR4A 1B4EA 1OF6A 3NL5A 1EB3A 5BW6A 1KFCA 2E6DA 3W86A 5D2YA 3SI9A 5LHEA 2OMAA 3T40A 3IVSA 1FWSA 5EKYA 2C1HA 4RZ4A 2GVGA 3GNDA 5FF2A 3TMQA 1GZGA 1S5WA 2VEMA 2WO5A 1H7NA 1K8ZA 5D32A 3I7SA 3WJXA 1TPC1 4AAJA 2Z2UA 5DY3A 2C14A 1GEQA 3BGGA 3EWWA 4LRTA 3A5VA 2ZRYA 5L6UA 1SZEA 3G18A 1XBXA 3PM6A 3IIXA 3G3MA 3LHZA 1JQVA 2A21A 1TV8A 1LCOA 1VCVA 4NNBA 4FX7A 3W83A 5CZJA 3GLCA 1YDVA 4JTTA 3UNDA 4PC8A 2QCEA 3BLIA 2OJPA 1XBZA 3C52A 3IEBA 1OHLA 5F1VA 3TAOA 3W1AA 4ICNA 3GAYA 1GPWA 4DXVA 2RDWA 3OIXA 2YR1A 1YDNA 1H7OA 1JCNA 3W6YA 3W70A 3NQAA 5DY2A 3CT7A 1H1YA 4IPJA 2JKPA 5F2GA 3LV6A 5SWUA 2H3DA 1H5YA 3FFSA 5AFDA 1G69A 5LNUA 4FX6M 3SECA 2ZTJA 3N73A 5LKYA 4OE7A 3F4WA 1ZAIA 3LI0A 2J27A 4WQ6A 1S5TA 2RDTA 5I3GA 1DORA 3P84A 1TPFA 1TMHA 1H62A 3KX6A 1SR9A 1SZFA 1O95A 5F2LA 1B9BA 2EGZA 1W3TA 4O4VA 3RLUA 3BLFA 3ABRA 1G6CA 3YPIA 1EPXA 5IM51 5D30A 3G0SA 5HWNA 2B4GA 1BWLA 4TX9A 5KZMA 1KM1A 3W7PA 3LHVA 3M7WA 5EA9A 2PRMA 1EWDA 3T55A 3P82A 4WOQA 1U83A 4ZQRA 3C61A 3NL6A 1TCDA 3P8IA 4NXSA 3P61A 3UWZA 2C19A 2WQPA 3BG9A 2ISSA 3DFNA 1GVQA 3C6CA 1R2RA 3GXNA 4UR8A 4JYDA 4UFIA 1H7WA 1JRBA 3G1YA 4ZVJA 2O7QA 4MZYA 2A6LA 4FB7A 1YLVA 3W2NA 1B57A 3W75A 4WXYA 1PL9A 2CLKA 4CLMA 3PB2A 5E1QA 1RV8A 4DQWA 4TMBA 2LLEA 3QMSA 5HUOA 1GQNA 3LLDA 1A5SA 2PRHA 1SPQA 4M7TA 5C55A 3A23A 4RJEA 3HOJA 1GOXA 2VFDA 2WNZA 1KW1A 1IXNA 4NX0A 3W7DA 4JD4A 3FYPA 1ZJIA 3EB2A 3NA8A 3TSMA 1X1ZA 3EX2A 2NX9A 1FDYA 1JJKA 1IXQA 4POCA 6TIMA 1QMLA 2Y7GA 2Y85A 2A85A 1DBTA 3Q37A 4HN4A 1L2UA 3BLEA 5HWJA 3FEMA 3LCLA 3M43A 1A53A 4S1FA 5K3VA 2G96A 4O10A 3HGJA 2Q3OA 5G2IA 1AG1O 2FB2A 1WBJA 2CW6A 5D2VA 1SQ7A 1BKSA 4DF1A 3C8FA 4IMCA 5DBTA 4RXFA 2AAMA 4UTKA 3HF3A 1GWJA 3TNOA 4AVFA 3SJ3A 3G0XA 4O1BA 4AXKA 4KFNA 2FDSA 1PCKA 2CZ5A 3G1SA 5K9CA 1UUOA 2NXIA 2D73A 3O8AA 2I14A 5D33A 5KINA 1W5PA 2VFEA 4L4LA 3G1HA 4GXMA 3TROA 3TR2A 1MXSA 4O15A 3G0UA 4Z1AA 4MYXA 3S1UA 4CCEA 1V5XA 1OF8A 1F6PA 1S5VA 4QNEA 4O8RA 2H90A 3NGJA 1AW2A 3BV4A 3QPYA 2ATMA 1KM6A 3TFXA 1P4CA 1XDMA 3LCGA 3LDVA 1PVNA 3L0KA 3TSDA 5D03A 3G8RA 2DZWA 3QPZA 2A0NA 3H53A 3DI0A 2GPTA 3V1PA 2B7QA 1ZNNA 4IWWA 1H61A 3TKFA 1FXPA 1ME9A 1RVGA 3TW7A 1DQXA 4K7VA 5CKSA 1WOBA 3KAOA 5LHFA 4WY0F 4O12A 3OHIA 4JTIA 3P80A 2FB3A 4N9CA 2DZPA 1W54A 4JTGA 3LHYA 3W85A 1VC4A 3A5FA 2QUVA 1OYAA 2QEZA 1H7PA 2GOUA 1L6YA 4LC6A 2Q8ZA 2YXGA 1W5MA 7TIMA 2BTMA 2V5LA 1OFAA 3PC0A 1WQ5A 1F2JA 3BVJA 2VFFA 3HB9A 4LVDA 2CLIA 3GX9A 4M5PA 2RH9A 2PRLA 1AK5A 5HWMA 1C9DA 3KVJA 1VS1A 3CIXA 4X2RA 2O7SA 3WK0A 4UFHA 4N6EA 2QCDA 3MHUA 1DJNA 4LU0A 1GYLA 1G4EA 4OQVA 2FIQA 2ABBA 3CIWA 5CPNA 1AW5A 5FEWA 5DCEA 2VFGA 4Q33A 2C6QA 3GNNA 4GUGA 3W76A 3W7QA 1IIHA 4JTSA 5AYZA 2B7OA 3W7RA 4CNNA 2H3BA 3RNDA 1ICQA 3HPXA 3L5AA 3R13A 1TPEA 3TE9A 3LOTA 4UFLA 4Z08A 2YYTA 1YYAA 3DZ1A 3PBYA 4IXHA 4LRSA 4A2RA 1XI3A 5D2TA 1XDLA 3SGUA 4JNMA 1RQBA 5EPDA 3QSTA 1DVJA 5G1TA 5AHFA 4QJ1A 1K02A 1C29A 3N2MA 1I2QA 3EX4A 4JTLA 1AL8A 3SFKA 3P5ZA 3KHJA 2FTPA 2Y6ZA 4S2BA 3TA6A 3TJLA 3PG8A 5AHIA 3NR0A 1XXXA 5L9FA 3L9CA 3ATYA 1LBMA 2ATSA 3QH2A 1PCWA 3UYCA 4C1LA 4FEZA 2VC6A 4K7YA 5FEPA 4KWVA 1LRTA 4LY8A 1FWRA 2GQAA 4O1AA 4NVTA 4BWLC 4LNYA 3VCRA 1QWGA 2NZLA 3STCA 2FQIA 5I3HA 1T96A 4KFOA 3PBVA 4X9SA 2NWRA 3LCFA 3SSJA 3PG9A 1Q6RA 5LNWA 2QCLA 2V0TA 1YADA 3W9ZA 2PC4A 1EA0A 4K6AA 3NG3A 4Z0SA 1KFKA 2OT0A 3HG3A 3PBUA 2Y63A 1RD5A 2ZRUA 3FJLA 4JR5A 2QDHA 4JTKA 3HGSA 1ICSA 5DBUA 3GKFA 3RU6A 4R33A 1SO4A 1EP2A 3HQ1A 3KVLA 3W7MA 1JQXA 2FPVA 4DEFA 4BFAA 4RK8A 4JDBA 3P67A 4PODA 3G24A 4E38A 3UD6A 3DFTA 5LNVA 3PSVA 4GFSA 4UTTA 1B3OA 5I3KA 3LLFA 3NYZA 3UWQA 4A3UA 3R8RA 2HS6A 3A24A 3RMJA 1DQWA 3PAJA 5DXYA 1FBAA 1KBJA 1A5BA 2V30A 1KM5A 3TDFA 4Y8FA 3A9IA 4NJKA 2NLIA 3W1UA 4N9EA 3LRMA 4LT9A 2Z6IA 4FNQA 3OA3A 1OX4B 4WD0A 3V75A 3ZS4A 3N19B 5CSRA 1MEWA 2ZZ7A 2QJGA 3NAVA 4LOCA 3NQMA 3M5XA 4CCDA 4NJGA 1KFLA 3BPWA 2J9XA 4OGZA 4PL1A 1MO0A 3VE7A 3LXAA 1JCJA 2BXVA 2HSAA 4O18A 5CZSA 1XKYA 5FEXA 5H91A 3UWWA 1L6WA 1HUVA 1RR2A 5AYXA 3NQEA 2CU0A 3SIZA 2GJLA 4ZQMA 2W6RA 2FPTA 4ZQOA 3UY8A 4NT0A 1K7XA 5BNKA 3IGUA 5HR6A 2V5BA 1P0KA 2E77A 2DP3A 4D2JA 4WX2A 1JCMP 1PE1A 5HINA 4BWLA 1GVFA 2X1SA 1K7EA 5HQEA 1UBSA 1ZAJA 4K38A 2ZZ6A 3USBA 1YTKA 2EHHA 3CB8A 5D04C 3E02A 1PS9A 3QSRA 3C2EA 2V2HA 3P60A 3UZ5A 1G7UA 2BWGA 1O5KA 3L66A 3THQA 3NQ8A 1PHWA 1J4EA 3P81A 4RZ6A 1R30A 5KSWA 1TTQA 5K9XA 1SO3A 2B0MA 3DKJA 4FNUA 1TYGA 1TTIA 4NXKA 1KA9F 1GVOA 3L67A 3KRSA 4WXZA 3MUXA 5I3FA 1YXYA 2QAFA 3PWAA 3HIJA 4HSOA 5DXXA 3WK2A 4WY0B 1VR6A 3W7NA 5CSSA 3GKAA 2FFCA 4JX4A 5D38A 1IIGA 1H7XA 4JYEA 1VRDA 3ZWSA 2C0AA 3NPXA 4O4WA 2DORA 4CCCA 1JUKA 3VE9A 4DF0A 3TJXA 3E9AA 3GB6A 1QAPA 3M44A 1TV5A 4BI7A 1OJXA 2NXGA 3I68A 3ZFHA 4HNTA 1XUUA 4AHPA 1IGSA 1VJIA 3MYPA 5CGQA 1CW2A 4IJBA 1JULA 2XN2A 5TQLA 1I2OA 2EF9A 4M6QA 1SSDA 3O63A 1O60A 3GDMA 1EIXA 1QPOA 3LB0A 3STEA 4UTWC 3HJZA 1VHCA 4WJEA 1HFBA 2QCHA 4B5NA 4EF8A 1NAL1 2HMCA 1DL3A 1ALDA 3C2RA 4FNPA 2QAPA 3NL3A 4LS2A 1KFEA 3PUDA 1SO6A 1FWWA 2I1OA 5AC7A 3TXZA 4NUWA 2ZZ1A 3MW7A 4R53A 2YZRA 3BARA 3QW4B 1R2SA 4IMFA 1G4PA 4AWUA 1P0NA 3TSBA 4FO4A 1UB3A 2X1UA 1SFLA 3N9RA 3S5OA 5HUPA 3SW6A 2C13A 3C2VA 1ZHAA 4N02A 2P10A 4C1KA 2G5WA 3ELFA 4UTLA 5TIMA 3IIVA 1KV8A 2A1YA 5FESA 4R7JA 3IV3A 1I2NA 1VYPX 3S9YA 1OYBA 1E51A 4BK9A 4LS0A 4ORMA 5IBXC 1Z42A 2VENA 1EP3A 1TIMA 4IMEA 4H6KA 1WDWA 3CPRA 1OG0A 2DZSA 4P2VA 1VPXA 4UC5A 5FI8A 4GE8A 4ZL1A 4L4MA 4K8EA 5HMSA 4EOUA 4A21A 3LTSA 2ZBTA 3N14A 3BGJA 3KVKA 3W23A 2JGYA 3W3OA 4UIOA 5CPLA 3W7EA 1LOSA 2E6AA 3UWUA 1UASA 1M7OA 1RQHA 4HNNA 1YDOA 3W7KA 4AHQA 4ZQNA 3R2GA 4GNJA 1SO5A 2EKCA 1AW1A 2VEPA 3EWXA 1EUAA 2X2GA 4JS3A 1ZALA 3G1FA 3WJSA 3LCXA 4E2BA 2KZHA 1YXDA 3KRUA 3NVTA 1F7BA 3WK1A 4XBSA 5FF0A 4Z1BA 2NUXA 2TYSA 1OX5A 3G1VA 3Q2DA 5K2ZA 3M16A 2A7NA 4UTWA 1ZENA 3PSWA 4MYAA 1QO5A 1W1ZA 1G4TA 2HS8A 4O13A 1TSIA 1XBVA 2YPIA 4ORIA 1M5WA 3S6DA 4KWWA 4X3ZA 1A50A 4O52A 2WOQA 4NQ1A 4YXGA 2GVJA 4Q32A 4GJ1A 4XBKA 3B06A 3W2UA 4JTFA 3HG5A 4AHOA 4M6PA 5EY5A 4JX5A 2J88A 4JY9A 1FCQA 3W7OA 1TO3A 4MZ8A 3BG5A 6ALDA 3PVFA 2DJXA 1KTCA 3ZWTA 1WXJA 1XUZA 2ZCGA 5F2IA 4Z1CA 2OX1A 1SW7A 4IXXA 4Y96A 4O50A 3TU9A 3H55A 3NDOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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