5AHLA

Apo-form of the deltacbs mutant of impdh from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
358
structure length
321
Chain Sequence
MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHETAKAKTYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGEIELFQGRSYKSYRVPYKGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystallographic Studies of Two Variants of Pseudomonas Aeruginosa Impdh with Impaired Allosteric Regulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa pao1
total genus 104
structure length 321
sequence length 358
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2015-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5ahlA00
1LDCA 3S5ZA 3W7NA 5KMYA 3W1MA 2B0MA 3UPBA 1OYAA 5F4WA 2Y85A 3TFXA 4FO4A 3M5VA 1QOPA 5CSSA 3LCFA 3N19B 1AL7A 4LOCA 3VKJA 2Y7GA 3DKLA 5FEPA 4JTTA 1VYSX 4HNVA 1KBJA 4HPXA 3LTYA 2GVLA 3TE9A 4ZQOA 1TPFA 1W3TA 1ZJIA 4GWEA 2A85A 2RHGA 1IXPA 2A5HA 4N9BA 3LV5A 3TU9A 4UMBA 2C0AA 3R5EA 2JK2A 2JGYA 3HG2A 3G3MA 2ZRVA 1P0NA 1TTIA 3S5YA 5DCBA 1ZAJA 5EKYA 1FWSA 2TMDA 4BWLA 4JICA 2YW4A 1WBHA 1KM3A 4FHAA 3NGJA 1SZEA 4WY0B 4U28A 3NZRA 3HQ1A 4Z0JA 3WJSA 3BPWA 2NV2A 3CEPA 2RDUA 4ICNA 5FF0A 4NJKA 3CWNA 1KTCA 4MFEA 1NVMA 2PE4A 3NEVA 4A21A 3LHTA 1CX9A 4GNJA 2Y7DA 3W2NA 2DZXA 1OYCA 3NQGA 2QCGA 5DELA 2VEMA 1WXJA 4DO6A 4O12A 2E6AA 5D30A 5L9FA 4ADUA 4TX9A 3M5XA 3L67A 4L4LA 3HB9A 1KTBA 4UUIA 4MUZA 3Q2DA 5F1VA 5A8GA 3PULA 3KVMA 5J5DA 1GEQA 3M0ZA 3L65A 1C9DA 2W0UA 5F2GA 4ORMA 4W9TA 3W7DA 4UR8A 1R2TA 3LGEA 2H3DA 2HS6A 3TH6A 1I8JA 1ML1A 3QH2A 3SECA 1VZWA 3P82A 4RX0A 1W0MA 3QMTA 4HHPA 1JQXA 2ZFAA 3SZ8A 2Y89A 4EOUA 2ISVA 3QSTA 3IV3A 3KVLA 3PM6A 3UYCA 3IIZA 3P60A 1F7BA 4UMAA 1LOQA 1TMHA 3EX1A 3B06A 3HF3A 3WJYA 4JR5A 5L6UA 1S5VA 3W72A 3W2MA 4CQ9A 2X1RA 1HUVA 4ZQMA 3DGRA 4QJ1A 3S5OA 3U2OA 3O6CA 1GG0A 1QFEA 1QAPA 4N4PA 4TO8A 1O94A 2C18A 4IX2A 4HKPA 3UXDA 1LYXA 3CPRA 3BW3A 2YW3A 2ZZ7A 3Q94A 3G24A 4UTJA 3I6RA 2ZZ5A 3H53A 1KM0A 3L0GA 4UTWA 5LSMA 3A5VA 2FB2A 2ZA2A 1KTNA 3W87A 3MWAA 3CTLA 1H63A 3WJWA 1VQTA 4PCFA 4CCCA 1HTIA 1SZFA 5FF2A 3O1NA 3I7SA 4O0ZA 2E6FA 5HUOA 2DP3A 3F03K 1N55A 3GKAA 2NX1A 3L5LA 3TCEA 5DN1A 3TIMA 1T96A 4OE7A 1VYPX 4DBDA 2CLOA 3LOTA 1AW5A 5MHBA 2ABAA 4LC6A 1IXQA 3NA8A 4N6EA 3FYPA 3DFNA 5K2ZA 4MJMA 2QDGA 5F2LA 5EA9A 5HQEA 2Y7EA 3SGUA 1PIIA 3M43A 3QW4B 4JX6A 1B57A 3FEMA 5CGQA 1K8XA 1XFBA 3H55A 4UTHA 2O7QA 1BWLA 4AAJA 1KLZA 3NR0A 4AXKA 1L6WA 2EAWA 3DAQA 4XQ6A 1JCMP 1UUOA 5G1TA 1XM3A 4KKXA 1K7EA 2LLEA 4NX5A 2CLKA 4QNWA 2QJIA 3BO9A 1SW3A 3W1RA 1GVFA 1T8XA 4GFSA 4LVDA 4IXXA 3BGGA 4JN6A 1SSGA 3WK1A 5CPLA 2Y70A 3LRKA 2H90A 5D04C 4MKNA 4AVFA 5H91A 2GVGA 3DHFA 1HG3A 3T4CA 3I7QA 1QO2A 2FIQA 4NJIA 4IUOA 1JCNA 3G1VA 4JY8A 5LNWA 4O0KA 1WDWA 3OBKA 1GVQA 3RF9A 1VGAA 1ME9A 5CZJA 2NUYA 3JS3A 2FTPA 2QR6A 3UQNA 5GVJA 1H62A 4JTLA 3W7JA 3PBUA 2A2IA 1OFPA 3KRUA 4MJZA 3UZJA 3M41A 4JYFA 3W1XA 3F4NA 4TIMA 5U7SA 2WNQA 3PG9A 1GT8A 2DZTA 2A1YA 1TPWA 1C8VA 3MBFA 1MEIA 4GUGA 1OK6A 3W75A 3W1PA 1GOXA 5A5WA 3MP4A 3MI6A 2R94A 3ZWTA 5DXYA 1X1ZA 1OJXA 3UWUA 4XTDA 1VCFA 3M5ZA 4LRTA 4JX4A 4WY0A 3BW2A 1LOSA 1TPEA 4FF7A 5BW6A 4RLIA 3W2UA 2VKZG 4YCOA 5KZMA 5D03A 2CZFA 4S2CA 3T44A 3LHZA 1TPVA 3B0UX 2VFHA 2Y62A 3G1DA 1KW1A 1OHLA 3NQEA 3WK0A 3WK3A 3A9IA 3DI0A 2YSWA 1SR9A 3EXRA 2G95A 3HPSA 1KV8A 5AHIA 1YXYA 5D02A 2V8ZA 4ADTA 3LTSA 3BGJA 2EGZA 3ATZA 3RLVA 1KFBA 4IJBA 1OVDA 3C52A 5E93A 2ZZ3A 1W3IA 2V81A 3R89A 2ATMA 2PRLA 1IGSA 3E12A 1ZNNA 4MZYA 2ZRYA 4IQLA 1FUYA 2GPTA 2ZRXA 3W1AA 3W70A 3FKRA 1GYLA 5F4XA 3L68A 4O13A 4PH6A 3R13A 4NNCA 2Q8LA 3EWWA 3PBYA 1VLIA 4K38A 3C8FA 1HL2A 2Q3OA 4EF8A 1PV8A 3BW4A 1H51A 1RQBA 3QMRA 1SFJA 1D3HA 4GRSA 2GQ9A 2C13A 1EP3A 3MP5A 4I7UA 1QPRA 1TTQA 4DF0A 3W76A 4QIUA 1C29A 4I7WA 1I2OA 4PFMA 4LNYA 3THQA 5TQLA 1J5TA 3LLFA 3GIYA 5G1YA 1EP1A 1O5XA 3VCRA 1KV5A 4HNNA 1KFCA 3LBCA 2KZHA 1F6KA 1WOAA 1EEPA 3STEA 3LV6A 1LP6A 1ICPA 4N9DA 4GJ1A 4GC4A 4O52A 4N02A 1IIGA 5BMXA 1UBSA 3UPWA 1THFD 1W3NA 3E9AA 3G3DA 4JGDA 1H7NA 3CEUA 4LRSA 4K7VA 1QNVA 1TREA 3GXTA 3I68A 4AEOA 2Q3RA 2ZRUA 1WV2A 4PTNA 1FWNA 1BWKA 4C1LA 4GBUA 4OHQA 3THAA 3DFTA 3GDTA 3EWXA 4GXMA 3RNDA 3WFAA 1UCWA 3KFTA 4IPIA 3W73A 4DEFA 3P80A 4WOZA 1FCUA 5DLCA 1EP2A 4X22A 4IXHA 2EF9A 1A5BA 4FX6M 4LVBA 2YPIA 4O57A 3S1UA 5AYZA 2ZYFA 4YMZA 3UNDA 5CZ0A 1JUBA 3N73A 3IVTA 1A53A 1FXPA 2E77A 3T7VA 4O54A 1ADOA 3LXBA 2NUXA 3HOJA 5G2WA 1XCFA 1H7RA 4UMCA 3QPZA 3PG8A 2D73A 3C0JA 3W2LA 1J2WA 2CZ5A 1Q6OA 3LI1A 3GX9A 4M7SA 6TIMA 1K7XA 3QJAA 1SSDA 1OFQA 3UWVA 1Q45A 1FDYA 5FF7A 3UY7A 1GQNA 3UWYA 1QPOA 1MO0A 3VNDA 4PODA 1J4EA 4JTIA 1W5OA 1PVNA 2ZTKA 4JTUA 4L4MA 4GUFA 1FCBA 3Q58A 1LORA 3NPVA 1YXDA 4JYEA 3DBPA 4NQ1A 3SFKA 4K37A 2EKCA 3IVUA 1U83A 2ISSA 2XN0A 1DQXA 4LWWA 3QEZA 4IX0A 3BARA 3GB6A 1QPQA 3W7OA 4BK9A 2QAFA 2VEIA 4UTIA 4O10A 3PSWA 1EIXA 1VYRA 2HMCA 1N7KA 1IXOA 3LCHA 3NL3A 4LU0A 4QAIA 2OCZA 3L2IA 4MOZA 4Z1DA 1ICSA 3GDRA 3TJLA 3GK0A 3ABSA 2ISWA 1QR7A 2ZCGA 1XL9A 1JR1A 2WPBA 1OX4B 3UZ5A 3T55A 4JTEA 4FXSA 3A22A 4Q33A 2DZPA 3G1HA 3NDOA 4TMCA 2E5CA 3CT7A 4O17A 1N8FA 3W1QA 1SO5A 3PF3A 1X7FA 3P84A 3N9RA 3KHJA 4N4QA 2J24A 2YYTA 3BLEA 3G22A 4FX7A 3W7QA 1S3HA 3KAOA 1G4PA 3LDVA 3PUOA 4I9AA 4X9SA 2E68A 4UTKA 1I45A 4O1DA 1H60A 3TW6A 1W5QA 4NZFA 4BI5A 1HFBA 2QCDB 2E1DA 1H7PA 3G18A 5FEZA 1ZAHA 1ZHAA 3PSVA 2PRMA 3W2KA 3W84A 4HIBA 4HT3A 3GKFA 3QSRA 1XBVA 2YXGA 4PA8A 1FWTA 3C2VA 3FFSA 5AN7A 3L9CA 2GQAA 1BTMA 3SY5A 2WQPA 5LNVA 3MP3A 3N14A 3HGSA 5K9XA 2BX7A 3NQVA 3EWZA 1L2UA 1ICQA 3QFEA 3PBVA 5EBUA 3U6WA 5BRBA 1D9EA 3VE9A 3O07A 3OG3A 2QAPA 1Q6LA 4O14A 1NF0A 4WZHA 3T78A 4JIQA 3P67A 2ZZ1A 3R12A 1MEHA 3M1ZA 4FNRA 1DQWA 3JRKA 4MLJA 4LT9A 1WBJA 1SPQA 3CIXA 4POCA 2V5LA 5EMUA 4EIVA 3LX9A 1QPNA 4RR4A 2PURA 1RVGA 3NOEA 4JXCA 4ZQNA 3PC0A 4WXYA 5HINA 1P5BA 2XFWA 1T0OA 4JTFA 2A4AA 5AHMA 4RJEA 2EHHA 5DCEA 3TR2A 5HR6A 3TQVA 4AMAA 4EVZA 4H6KA 2VFGA 1VH7A 4IWWA 3TQKA 3NG3A 1XKYA 2VFIA 3EX6A 4A3UA 4IMFA 2QUUA 3NNTA 3ABRA 1TO3A 1PHWA 3C2EA 2Y88A 2ZZ2A 3BG3A 1H5YA 4WD0A 5AHFA 4Z1BA 1G7VA 5CZTA 1XBYA 3OEXA 4DO5A 1EWDA 1AK5A 4O11A 2UV8G 1JCJA 4OQVA 4UFMA 3CM4A 3NQAA 4CNPA 3S0CA 1YADA 3BK0A 1KM6A 2JGQA 4MPQA 2P0OA 3W9ZA 1AL8A 2GOUA 1YPIA 4LS0A 3GR7A 4Q4KA 1OFAA 3OVRA 2QUTA 1SFLA 4Z0SA 1D3GA 3H54A 1AW1A 3EEGA 1LM1A 3DFQA 3RU6A 4CQ8A 3LBMA 5AC7A 1YTEA 3G8EA 4Z1CA 1YDNA 1ZY9A 1TTJA 5I3KA 1B3OA 5G2HA 5K4XA 2Y63A 2XN2A 4UNLA 4XBKA 5FF4A 2FFCA 5D05A 4NUWA 3C2FA 3L5MA 5D09A 3W1UA 5LHFA 1F5ZA 1GZGA 3PS7A 3HO8A 4P61A 1VR6A 1JQVA 5D2XA 3OHIA 1P4CA 1B4KA 1FDJA 3GR8A 1T99A 3W7EA 3GAKA 3V1PA 3MHFA 1JVNA 2BTMA 4IMEA 2OX1A 3EWBX 3FS2A 2QDHA 4S1FA 1KFKA 4JTKA 2I9EA 1XDLA 3AJXA 1U5JA 2H8ZA 3E0IA 4YXGA 8TIMA 1PL9A 5AHLA 1G4TA 4FNPA 3LTPA 2CU0A 3T40A 1F2JA 4B5NA 3PBWA 1G7UA 1OG0A 2WSRA 1TIMA 1SW7A 3IIXA 2NX9A 5G2IA 3W7MA 3O6DA 4O28A 2CZDA 3STCA 1K3UA 4ZQPA 3NPXA 1I4NA 3TDFA 4DF2A 3KRZA 1A50A 1Z48A 2DZSA 3CLMA 2YX0A 2QF7A 4UC5A 2FPVA 3LM7A 4JTSA 1WAUA 3YPIA 2BLEA 3M7WA 3N9SA 4AWSA 2E09A 1YDOA 1FDZA 3NQ2A 2WOQA 1PCKA 3M5YA 1W54A 4PC8A 3UWQA 5CPNA 2C15A 2G97A 3DENA 3KXQA 1W56A 5CPMA 5CZSA 3FIGA 1OX4A 3TSDA 4M19A 3GXNA 1S5WA 1XBZA 3C6CA 1VC4A 3HPZA 3I65A 4XTIA 3STFA 1P1XA 3E96A 5FEXA 1L9WA 1OF6A 3C3NA 3G0UA 5C54A 3QPYA 4DQWA 4ZMGA 4LY8A 1X1OA 5KINA 1KFEA 1QDSA 1NF7A 1O4UA 3O16A 4Y9AA 1SO6A 1LCOA 3SW6A 3W3OA 4MY1A 3GNNA 2H6RA 5C2XA 2PRHA 1YTDA 4LUIA 1H1YA 1KBIA 3TXVA 2QCDA 3OA3A 4A22A 4P2VA 5LGZA 3DKJA 1AW2A 2OT1A 3F4WA 2O7SA 2B7QA 4G1KA 3NVTA 3TW7A 2CLIA 4N9CA 2HS8A 3E49A 4J9JA 3NL5A 4NXKA 4LV9A 3L0KA 5CSRA 3O63A 2B7PA 2OZ0A 5HULA 4OT7A 1H7OA 1K7FA 3W2JA 1FBAA 1LRTA 3W85A 3W7LA 3D0CA 4ZL1A 5LNUA 2ZTJA 4LVFA 2VFEA 3KX6A 5AOUA 1TPUA 4RZ6A 4WOQA 3UY8A 3TX9A 5LZLA 1G6CA 1TPC1 3W7IA 1W37A 3LI0A 2YGYA 5AB3A 5IBXC 1A5SA 2OMAA 1GG1A 4R34A 4UTTA 1IIHA 4JDYA 4O8RA 1DORA 2Y7FA 5IM51 3BG9A 5EL1A 3CIWA 1TPDA 3W86A 4X3ZA 3G0SA 1H1ZA 1Q6RA 4DPQA 3GDLA 4U4MA 2QCLA 3QF0A 3W07A 3STGA 2Z6IA 1VHNA 4ZZ9A 1W5NA 1W31A 5F2MA 1DJQA 2J9ZA 3S1WA 1RPXA 4JTHA 2ZZ6A 4YWIA 4CNOA 2W6RA 3TA6A 3C4UA 3GAYA 2CWNA 3NM3A 5FESA 4IGHA 4AWTA 4O1BA 4OU1A 3G0XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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