5AHN | Genus

Total Genus 102

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	102
sequence length	467
structure length	297
Chain Sequence	MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHTYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITGA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystallographic Studies of Two Variants of Pseudomonas Aeruginosa Impdh with Impaired Allosteric Regulation pubmed doi rcsb
molecule keywords	INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas aeruginosa pao1
total genus	102
structure length	297
sequence length	467
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2015-02-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5ahnA00

4UFMA 3LHYA 1O95A 1U5JA 2TYSA 4E2BA 5C6MA 1JJKA 3B0PA 4UR8A 3NM1A 4WUIA 2VFIA 1LYXA 4AWUA 1G4SA 2ZRWA 3TC6A 3Q37A 4RZ6A 5HR7A 3L5MA 5I3HA 1GVFA 2YFNA 1OFBA 4M7SA 3V1PA 1JUBA 4RK8A 2J88A 3W7MA 4LTSA 2WNZA 4JICA 2ZDRA 2UV8G 4HN4A 2RDWA 1KV5A 1PCKA 3DFNA 1QAPA 3HG3A 3DH7A 4P61A 3MWAA 1GEQA 2YXGA 2Y61A 2ZZ7A 1DORA 5H91A 3LHVA 1OFQA 1QO2A 3LCIA 1XL9A 4FX8A 1GYLA 1Z44A 3STCA 3TAOA 4ZQCA 3OA3A 3W76A 1VCFA 1C9DA 3TV8A 3S1UA 3TROA 1QR7A 1QWGA 4RJEA 1EA0A 2JKEA 2ZBTA 4OHQA 1FDJA 1RQBA 3S5ZA 3HJZA 4ADTA 4UC5A 2J24A 3GNNA 3QC3A 5DBTA 2HS8A 3LV6A 3TJLA 3KVJA 1X8FA 3UWQA 1SW0A 3C4UA 1FWRA 1PE1A 4AF0B 1SQ7A 8TIMA 4AWSA 4QNWA 1WDWA 2F7FA 4GUHA 2QUUA 4JDYA 1ZJIA 1KM6A 1G67A 1BKSA 2QDHA 1JCYA 3LRMA 5FEPA 4Z0SA 3EXRA 1VH7A 3T44A 3IIZA 3PUDA 4WX2A 2H8XA 3M6YA 1IIHA 2B7OA 5AC6A 3W22A 4WY0B 2A1YA 3BLIA 4H4IA 1I2QA 4PODA 3MI3A 3W6YA 3QW3A 3IIXA 1OFPA 4GE8A 3BG9A 4O52A 3W2MA 1HO1A 4GNJA 1DJQA 2WO5A 4K6AA 1JCXA 3TKFA 1A5SA 3GAYA 3UYCA 4O14A 2VC6A 4IMEA 1YXDA 4MZYA 1QMLA 1O94A 4C1KA 2EF9A 1OJXA 5C55A 1DVJA 4RXGA 1MSSA 1AW5A 4UTMA 1GYNA 1OFAA 2CZDA 1A5CA 1K8XA 3UZ5A 2A85A 3C61A 2QAFA 3FJLA 4H3DA 1FDZA 2V2HA 3F4NA 3DAQA 4WD0A 4O18A 3MHFA 3ATZA 3PVFA 3G1AA 2E5BA 4K37A 2ZZ1A 5K2ZA 5HWNA 5HQEA 4YXGA 4FEZA 4NXSA 1YTKA 2VEIA 2DZUA 5D04C 3HOJA 4IOTA 2QR6A 4QNEA 3PBUA 1VS1A 3W7DA 4WY0F 4MPQA 4WQ6A 4DBDA 2RH9A 3TK7A 3W23A 3PSWA 1SW3A 3CIWA 5LSMA 1Q45A 3OVQA 1SO5A 4CCCA 2JGYA 2YPIA 1K8YA 3HF3A 4FB7A 4UTHA 3FFSA 2WSRA 3E12A 3NPVA 2ZA1A 1E51A 1OFOA 4FIRA 1RD5A 4FHAA 1SFLA 3W1NA 3GNDA 5G4EA 5F2IA 3MI6A 3O05A 3LHTA 2GOUA 3UZJA 1JRCA 3W9ZA 1L6SA 3M43A 3RNDA 2DORA 3LCXA 3HPZA 2X2GA 1K7XA 3N14A 5FF3A 4O4WA 4O53A 3MI2A 2X1UA 1VYSX 4IX0A 3DFQA 1T0OA 5I3GA 3L66A 3M44A 1AL7A 3ZWTA 1KTBA 1TPC1 1VCVA 1YDOA 1GVRA 2QAPA 4UCGA 3HGRA 5KITA 2AQWA 3ZS4A 1W3IA 4ZMGA 4A29A 1MEHA 1R47A 3ELFA 1KM3A 4K36A 2BXVA 4O1CA 2FFCA 2C18A 3NVTA 3N9SA 4J9JA 1A5AA 5FEXA 4FF7A 3ZR4A 1P0KA 3EX3A 3N9RA 3TW6A 3O6YX 2VEMA 4IPJA 1TSIA 1K8ZA 3HPXA 3W1UA 1UUMA 3RLUA 2D73A 4LS0A 6ALDA 4BWLC 2I1OA 1RVGA 5FF4A 3LRKA 4MOZA 5GVJA 1ONRA 2Y6ZA 3FLUA 4LC6A 1IF2A 1KV8A 5E1QA 1RPXA 1JQVA 1EX5A 2X16A 3W83A 1YYAA 4TIMA 1YTEA 4GWEA 4N9DA 4BF9A 5FF2A 1WXJA 2CLLA 3GAKA 1ME7A 2V2CA 2QCCA 1OFRA 3N3MA 3MYOA 5FESA 1TTIA 2ATMA 2X1SA 1OK4A 3HB9A 3W7OA 2YZRA 1XKYA 3EB2A 4LV9A 4NU7A 2FPTA 2E1DA 2G5WA 4MYAA 1YDNA 1QDSA 1UBSA 3H53A 4IPIA 1L2UA 2V5LA 5D2XA 2ZZ6A 2YYUA 4OV4A 2ABAA 4Q33A 1G4PA 5DLCA 3LCFA 4HKPA 3IIOA 4ORIA 3B0UX 2Z6IA 3DBPA 3HGSA 4O28A 2DZVA 3C2FA 1F6KA 5HWMA 3UWVA 3EX4A 2DZPA 3T7VA 3L21A 1TV8A 1JCMP 4O50A 4EF8A 2ABBA 1UASA 5K9CA 1K7EA 4JTIA 1GQNA 1OX4B 3E49A 1QPOA 3F1QA 2ZRVA 4ADUA 4CCDA 1G4EA 1OABA 2V30A 4Z1CA 3W7RA 2B7PA 2H8ZA 3TXZA 3ZWSA 3W2JA 1I2RA 1QNVA 1KM1A 3C2RA 3L0KA 1AG1O 3W7GA 3BW3A 2JBMA 3AJXA 1SSDA 4PC8A 4WZHA 5KMYA 1H7RA 3KXQA 4GUFA 3LCWA 4DPQA 1IGSA 5F2LA 5AYXA 4Y96A 4TU1A 1KFEA 1TCDA 1W54A 3NO5A 4AHPA 3PBYA 3SIZA 3NAVA 3W3OA 4JDBA 3CWNA 3EWBX 3TC7A 4L4LA 5AHFA 2ISVA 2QCDB 1L9WA 4E0CA 1LTDA 1WOAA 1ZFJA 3IEBA 1SZEA 3A22A 4MJZA 5J5DA 2NUWA 1OF6A 2VFHA 2Y85A 4FNPA 3QPYA 5E0KA 4X22A 3EXSA 3QSTA 2NV2A 1GOXA 4EWND 1JULA 1BWKA 1PCWA 3DI0A 1K02A 2EAWA 4NZFA 2WJZA 1F73A 4UFLA 2CLMA 1GG0A 3PB2A 4MFDA 4ZL1A 3DFSA 1GVSA 4ML9A 3RK8A 2EGZA 5I3IA 3LTSA 4JR5A 1ZALA 2QUVA 5FEWA 1HTIA 3WJXA 2DP3A 1FWWA 3NEVA 3UWYA 3DENA 5LNRA 3ANYA 4LVGA 2VEPA 3KAOA 3L65A 3TJXA 3GIYA 1X7FA 3MP3A 2GVGA 4O19A 1F5ZA 2J9ZA 3P7YA 4JN6A 4LT9A 4XBSA 3LXAA 5BMWA 4LUJA 5IBXC 2R91A 3WFAA 4UTUA 3DFTA 2B0MA 4FNSA 2A5HA 5DCDA 3TE9A 2R14A 4XKYB 4NX0A 4AH7A 4CCEA 3TFCA 4NJKA 3BO9A 1G6CA 4UNLA 1W0MA 4LY8A 1GVOA 4JEQA 2QKFA 3W1MA 1XBVA 2TSYA 3NG3A 1TREA 2QUTA 3LBMA 4FXSA 4K39A 4RCXA 5EYWA 4JD4A 2Y63A 1A5BA 2TRSA 4DELA 4UTWA 4ZZ9A 4NNAA 3T55A 3M5VA 3PY2A 2DJLA 3FYOA 2LLEA 1SW7A 4GFSA 3NQEA 4IX2A 3S5NA 2A6LA 3DGRA 1LBMA 4EIVA 3G8EA 4MKNA 4O12A 3PWAA 3WK3A 1EUAA 3DKLA 4H6KA 3STGA 4AVFA 2QCMA 3NGJA 1WOBA 2PRHA 2E09A 4UTKA 2Q8ZA 4AF0A 1TPUA 2RKXA 4NVTA 1VRDA 2E6YA 2XN2A 3LX9A 3LOTA 1VGAA 3ATYA 1NSJA 2WSQA 5CPMA 2DZXA 3UWUA 5DY2A 1FCBA 1MZHA 3WK0A 3O15A 4PA8A 1KFLA 5LNUA 3W7KA 4ORMA 1AK5A 3FKRA 3WJYA 1ICQA 1WA3A 2TMDA 4WY0A 3W86A 4IGHA 2FQIA 3W7CA 4U28A 3QYQA 3GDMA 2P10A 3VE7A 3UQNA 3ABQA 1CW2A 4O17A 4OE7A 4ZQNA 1O5XA 1TRIA 3TMQA 5F4XA 5D38A 4PFMA 4K7VA 4PH6A 1R46A 5D30A 1XI3A 5I3FA 3PULA 4LV4A 3M16A 5HWJA 4FNQA 3SFKA 4JXCA 3STEA 1J2WA 2G95A 3P82A 1F2JA 1SU5A 5F2MA 1YXCA 1B57A 3W7EA 5LKYA 2V9DA 2B7NA 3G0SA 3VI2A 4BK9A 2VFFA 2ZA2A 4UTTC 2RDUA 3W1LA 1PHQA 5DN1A 3OBKA 5I3JA 4DF2A 1M7PA 3HQ1A 1KM4A 3A5VA 3Q58A 2E6DA 1H61A 4DEFA 1FX6A 2YW3A 2XN0A 3M41A 1EPXA 3F03K 3SGZA 3GLCA 4O54A 1ZAIA 3LHUA 3TCEA 3BW4A 4QISA 4Z1BA 3TU9A 3A9IA 5G2WA 4LVAA 3L67A 2NXHA 1QFEA 5KZEA 3KHJA 4UFHA 2HTMA 3WK2A 3MJYA 4HHPA 1LBFA 2Y7EA 1LOLA 3R2GA 3W71A 3PUOA 4YCOA 2QCNA 2AGKA 3C2OA 3QQ0A 4FO4A 1H7WA 3TQ0A 5AOUA 3CU2A 1Y0EA 3M7WA 4O16A 3BW2A 1ZY9A 3E9AA 2QCHA 4IXXA 5D02A 5K9DA 1XBYA 2QCFA 3OVPA 3MUXA 4NNBA 5H2ZA 3INPA 3C56A 2C0AA 4UMAA 1KA9F 1LRNA 3GXNA 1VCGA 2ZYFA 1GWJA 3QM3A 1VLWA 4XZ9A 1XUZA 4O4VA 3GDLA 1I4NA 3B03A 4DXVA 1TPWA 1F74A 4PL2A 4UXDA 4OT7A 4DF0A 5C5YA 4JTTA 5T26A 3EXTA 2C3ZA 4LS1A 1VYPX 4Q32A 4UTLA 4OGZA 1C29A 5CZSA 2A21A 3UXDA 1KM5A 3W88A 1EWEA 2Y7DA 4NNCA 4ZQMA 1LZOA 4DBEA 1R2TA 3LXBA 4TX9A 4EOUA 3CWOX 1FQ0A 3S0CA 5FEZA 3G3DA 2BLEA 2V81A 5AN7A 3CHVA 1FWSA 3OHIA 2ZZ5A 1OVDA 3LCHA 4GXMA 5AHIA 2OT1A 5CZ0A 4N9EA 1AW2A 4W9TA 3TX9A 4ADSA 1ZCOA 2VFEA 1PVNA 1QPQA 1H7OA 3G1YA 1F05A 1YTDA 1XM3A 3NPXA 3NDOA 3EWYA 3S42A 3L0NA 3FYPA 5TBOA 2FPYA 3P80A 5D32A 1PIIA 3LBCA 1D3HA 2E77A 4HNVA 3SJ3A 1HG3A 3GDTA 3LDVA 1TTJA 1IXPA 3ABSA 3PG9A 1H7XA 4IJBA 1HL2A 4GJ1A 4NUWA 4GUGA 1W5MA 1KFCA 2QCGA 2PRLA 4IXHA 3LHZA 4JX6A 3KVMA 1TB3A 3THAA 1L6WA 4O11A 5CZTA 4JX4A 2I9EA 4AWTA 1H1YA 4O57A 1NAL1 1OX5A 2GJLA 2I14A 2AAMA 5LZLA 3P62A 5EKYA 2O7QA 3ABOA 5G1YA 1WQ5A 3THQA 1HFBA 3NA8A 3C2VA 2V0TA 4N4QA 4IMGA 1YDVA 3TXVA 3ABRA 3NQGA 1F7BA 2E5CA 1TQXA 1XDMA 4Y6GA 3O16A 1N7KA 3DXIA 3R13A 3GX9A 1OX4A 1DHPA 1O5KA 3LGEA 5KTLA 1P5BA 3KVKA 4RX0A 1YLVA 1XFBA 2NLIA 4LOCA 2GQ8A 2J27A 1KLZA 1W3NA 2H90A 2PCQA 4DO4A 3GK0A 3PR2A 1N8FA 3FKKA 4M6VA 1IIGA 2C14A 3TNOA 3NQMA 2RDTA 1G7VA 4Z08A 3EEGA 5ABTA 1D9EA 4EF9A 3G1DA 2NWRA 1XCFA 3UPWA 2PC4A 2A7PA 3MP5A 4O0ZA 2JKAA 1MXSA 1FXQA 2C16A 3PS7A 2GUUA 3U8GA 1NFBA 3TSBA 2QJIA 2QCDA 4HNNA 5F4WA 1FWNA 2KZHA 3W7HA 3NQ8A 3EWXA 3SZ8A 1Q6LA 3HPSA 3C52A 3W7LA 4OWGA 2FIQA 3LXCA 1DQXA 1XBZA 3W75A 3LI0A 1ICSA 3UNDA 1FUYA 5L9FA 2PRMA 4KWWA 3R12A 3DFPA 4K38A 4ICNA 4MYXA 1H5YA 3IGXA 5D2VA 2PURA 3M5ZA 3T4CA 5K4XA 4ALDA 1BEUA 3CEPA 4JTLA 1VPXA 5A5WA 2E6FA 1ADOA 1IXQA 1U83A 3LI1A 3HG5A 4L4MA 1ZAHA 2OX1A 2Z6JA 5EA9A 3WJZA 2FTPA 1YXYA 1GTEA 3ZFHA 2CZFA 5AYYA 3UWZA 4P2VA 3GVGA 3MMTA 1QCWA 4BWLA 2C15A 1G69A 3WJSA 4BI5A 1WX0A 2ZRXA 2JK2A 5D05A 1LDCA 1K03A 3QMTA 1LLWA 3C0JA 3I6RA 3C8FA 4JYEA 3RU6A 4JTKA 4QSHA 1SZFA 2CW6A 3P84A 3B06A 5CPNA 2A4AA 3C6CA 1TRDA 4XKYA 3TSMA 2CLHA 4HPJA 3WK1A 2Q3RA 4ZQPA 1D3GA 4M5PA 2NUXA 4OBTA 3BV4A 5HR6A 3P5YA 3A21A 3G8RA 1THFD 5DELA 1P4CA 1Z41A 2BX7A 3UWWA 5TIMA 3NQVA 2A7NA 4NXKA 4ZVJA 2V2DA 1KBJA 1JUKA 3S5OA 3LHWA 3PSVA 3N2XA 4M6QA 4N6EA 4PCFA 2YGYA 1I45A 1SFJA 5L6UA 5FF0A 1JCJA 1KBIA 2C1HA 1UCWA 3EX1A 3KOFA 4UFIA 3TA6A 4C1LA 5SWUA 3TDFA 1PHWA 3DHDA 4KFOA 1Q6OA 3HIJA 1YPFA 3BVJA 4JTFA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5AHNA

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