5AOU | Genus

Total Genus 95

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	95
sequence length	247
structure length	240
Chain Sequence	PRYLKGWLEDVVQLSLRRPSVHASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAYYLRKSPRDPIEYAKYMEPYAVGLSIKTEEKYFDGSYEMLRKIASSVSIPILMNDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVEILTERELESLLEYARGYGMEPLILINDENDLDIALRIGARFITIYSMNFETGEINKENQRKLISMIPSNVVKVPLLDFFEPNEIEELRKLGVNAFMISSSLRNPEKIKELIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Emergence of a catalytic tetrad during evolution of a highly active artificial aldolase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE
molecule tags	Lyase
source organism	Sulfolobus solfataricus
total genus	95
structure length	240
sequence length	247
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2015-09-11

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5aouA00

4FNQA 5AHNA 5IM51 3FOKA 3B0VC 3BLFA 4MVAA 3DGRA 1NAL1 1P5BA 2HTMA 2Y62A 3KX6A 3W73A 4BWLA 3QPYA 3CTLA 4O28A 3LRMA 2ISWA 1L9WA 1VH7A 5D33A 1TMHA 5BMWA 1UUMA 1GZGA 1M7OA 4ONVA 1OG0A 3QC3A 3STGA 1DQWA 1I2PA 3ZS4A 2BZNA 3TFXA 2VEKA 3LTYA 2FPTA 1ALDA 1VYPX 4K8EA 4MZ8A 3W7PA 1VLIA 3TNOA 4YWIA 4QQ3A 2V2HA 1OYCA 2XN1A 1XI3A 1CX9A 2BLEA 2OCZA 3C2FA 3B05A 4RX0A 3W86A 1E51A 2CLFA 4QAIA 4MPQA 1P0NA 4MY1A 3TMQA 4RV8A 2FTPA 3NYZA 3QPZA 4DPQA 6TIMA 1H60A 2ZZ4A 1KFBA 4DO5A 2CZDA 1TPFA 3LHWA 3NVTA 2YFOA 1JQXA 3RFAA 4JDYA 3RK8A 4CNPA 3WJSA 2CZ5A 3W88A 2CLLA 4CQAA 3W71A 1HG3A 2NXHA 3IVTA 4QISA 1CI1A 3U6WA 1LCOA 3HF3A 2Y89A 1EUNA 4NVTA 1R2SA 3NQEA 3IVSA 3JRKA 1U83A 2C1HA 4IX2A 5DN1A 1MZHA 2CLHA 1T96A 5LHFA 3YPIA 4OV9A 1AK5A 3N9SA 3RLVA 3ABOA 2VXNA 4NJGA 5D02A 4AVFA 3L0NA 4ZQPA 3L0KA 1J5TA 4HNUA 3W2JA 2VKZG 2QCGA 3GDKA 1XL9A 1G7VA 2ZRYA 4P61A 2V30A 3PWAA 3PY2A 2A5HA 3CU2A 3G1SA 4AHQA 3MBFA 3O6YX 4U28A 3Q2DA 4UFLA 4RXFA 1AW2A 4FF7A 5LNWA 3FIGA 3W2MA 4JYFA 1TV7A 4LU0A 1OFQA 1OX4A 2G96A 3CQ0A 5CZSA 1VC4A 1UJPA 2V5BA 5HQEA 1ME8A 5AB3A 5D38A 3C2VA 4JY9A 3VI2A 1VS1A 2DZTA 5HJLA 3UPWA 5LNVA 2NXGA 4E2DA 2H8ZA 2F84A 4IXHA 2QCFA 2HS6A 4AH7A 3W84A 5F1VA 1SPQA 4UC5A 2TYSA 1QDSA 3N19B 1FX6A 1GWJA 4KWWA 5HR6A 3IGUA 3AO0A 3MJYA 3GXPA 3M7WA 1N55A 4XTIA 4M6VA 4IWWA 5K4ZA 2ZRUA 4FB7A 5DLCA 3HO8A 3B0PA 2OX1A 2ZA3A 3LTSA 2A4AA 3UNDA 1VPXA 5D09A 4FX7A 1JCNA 4LRSA 5K3VA 1TYGA 5FEPA 1WAUA 3A21A 2YDAA 3B04A 1TPH1 3QJAA 3L0GA 3L21A 5J5DA 3DBPA 4BI5A 3LV6A 3LI0A 3P74A 2J88A 2XN0A 3THQA 4N2YA 5FEXA 2NZLA 2YR1A 1W56A 1OFBA 4UTWC 3R13A 3PG8A 2XN2A 1B4EA 3LBMA 2VELA 1NSJA 4PL1A 4HPJA 3G1DA 2FB2A 3PM6A 1TTIA 1KM6A 1WBHA 1QR7A 3FKRA 4YLWA 3FYOA 4O12A 5DBUA 1UBSA 4ICNA 3TJLA 4GFSA 4OHQA 4DO6A 5CSRA 3L65A 5KITA 2Y6ZA 1KFKA 2ZRVA 3HOJA 5AHFA 3EWUA 2JKAA 4K39A 4O14A 1FDJA 1YDVA 3I7SA 4UTMA 1JQVA 4NZJA 3FS2A 4N9EA 3TW6A 5DELA 1VLWA 3LDVA 3N2XA 4QIUA 5G1YA 1LRTA 1SR9A 2A1YA 3SI9A 1LROA 4ZVJA 3LXBA 3A9IA 2GOUA 3LXCA 4ZMGA 3W7GA 4Z08A 3IIZA 3MP3A 2FFCA 5G1TA 1HTIA 3GXNA 1QO5A 3QMRA 3QRHA 2NWRA 5BRBA 1OFDA 3W1PA 4LOCA 1KM3A 3MI3A 3S6DA 4EWND 3B4UA 3EX2A 3PBUA 4DELA 1M6JA 3ABRA 3SECA 2QCLA 3F4NA 4AHPA 4NNBA 4UTIA 1BWKA 2TRSA 7TIMA 3N14A 3M43A 3Q94A 1ZJIA 5AFDA 4LVBA 3IIPA 1WOBA 1RQEA 3H54A 4XUGA 3DFSA 5AHEA 2YPIA 4JY8A 5D05A 1VYSX 4MZYA 3UWZA 3C6CA 1YTDA 1G4TA 3OA3A 1ICSA 3C61A 4XZ9A 5CPMA 3HG5A 4UIOA 5HMSA 1ME9A 1KTCA 1GVRA 3B06A 2X16A 3M0ZA 4N4PA 4NXKA 2V9DA 1TREA 5BOOA 3MBDA 4HKPA 3P61A 4WOZA 4UTHA 4JYEA 4GUIA 3Q37A 1QPNA 4RK8A 2BX7A 3S1VA 1EX5A 3NNTA 8TIMA 3R5EA 3U2OA 4OGZA 2DZXA 5CPOA 4A29A 3WJXA 3P81A 3W7NA 2H6RA 4IPJA 2NWSA 2A6NA 5J5RA 4OWGA 5CZTA 2ATMA 2R8WA 4FX8A 5G4WA 3O1NA 4KFOA 2C6QA 3S5ZA 5HNRA 4K6AA 3OIXA 2WV8A 5KTLA 1H61A 3W22A 2E1DA 4LT9A 4XQ6A 1I4NA 4GBUA 3SFKA 4PL2A 3L5LA 1XM3A 1QMLA 3UPBA 2ZRXA 1XKYA 5K2ZA 5HR7A 5AHMA 2C18A 5D32A 5I3KA 2V5LA 3BG9A 3PG9A 4NJJA 2QCHA 3TW7A 4DF2A 3NL6A 4O4WA 2E5BA 4JX4A 3I7QA 2C14A 3KVMA 1H7RA 2OT1A 3W7RA 2Z2UA 1JUKA 2B7NA 3W7IA 3O63A 1N7KA 3BG3A 3DH7A 1KM4A 1TV8A 3LXAA 4Z1BA 3NPXA 3DFOA 3DXIA 1LM1A 3W74A 5KZEA 3SIZA 3SY5A 1B3OA 2FQIA 2E6AA 1R2RA 4JDBA 3QW3A 5CZ0A 1PE1A 3GXTA 4IXXA 5HWMA 5FEZA 3C56A 5CGQA 2ISVA 2GJNA 5LHEA 3QMTA 2FPYA 1FXQA 4YMZA 3SR7A 1B57A 4UMCA 1EUAA 3EKZA 2ZCGA 1FQ0A 1O4UA 2CZEA 5BMXA 3N73A 2B7OA 3GIYA 3O05A 2V2CA 4HIBA 1JCMP 1EB3A 1RVGA 5E0KA 3NQVA 5I3JA 3NO5A 4N02A 1XBYA 5KINA 1LDCA 4RLIA 5AOUA 1DJNA 4UMAA 2ZRZA 1AL8A 1GOXA 3O16A 2X1TA 1KFCA 1BEUA 3DI1A 4O0KA 1VCVA 1D3GA 3TSMA 4K8HA 4O57A 1Z48A 3G24A 1YPIA 3BW3A 2GVJA 1TPB1 3BPWA 6ALDA 5D04C 1W5QA 1FWTA 2OMAA 4Z0SA 1EP2A 4RCXA 3QQ0A 1WOAA 1XBZA 1YTKA 3VE7A 4AWTA 1GVSA 4JTTA 2BTMA 2YYUA 1K8ZA 1OHLA 5SWUA 2DZVA 3M41A 4MZ1A 4M6QA 2YYTA 3M6YA 3GNNA 3PR2A 3VE9A 3W7OA 4J9JA 3B0UX 2Q8ZA 1KLZA 1LOQA 3BG5A 2GJLA 5CZJA 2J9XA 1FWSA 3BARA 4H3DA 2HS8A 1W5OA 4YCPA 1TPVA 1VRDA 2R14A 3NL5A 2E6FA 5EYWA 2TMDA 3ATZA 3BGJA 2Z0IA 3A23A 5HULA 3WK3A 4Y6GA 4HSOA 2GQAA 1S5VA 4O0ZA 3P8JA 2QCNA 3PVFA 3DI0A 2EAWA 4UTUA 1Q6OA 3STCA 3TA6A 5E1QA 3G3MA 2NLIA 3PS7A 1Z44A 4Z1DA 5FEWA 4AF0A 3TC6A 2B7QA 3C0JA 4IMDA 1GPWA 2WNQA 3H55A 5FI8A 3MWAA 4HT3A 2QUVA 3NM1A 1GVOA 1L2UA 4MOZA 3W23A 1F76A 4Y8FA 5LKYA 3GDTA 2QKFA 1SU5A 3CC1A 2FIQA 4G1KA 4X9SA 3GK0A 3CWNA 1ME7A 3I7RA 3TROA 2TPSA 1XC4A 3TUUA 2ALDA 4NJIA 1QOQA 3GVGA 4QITA 4I7WA 4LS0A 1SO3A 3TIMA 2C13A 4RZ6A 2NXIA 1P0KA 4JS3A 3TMLA 4P2VA 2GQ8A 5G5IA 1QOPA 3NPUA 1JCXA 4CQ8A 3HGSA 3LCXA 4NX0A 1DV7A 1A5AA 5DBTA 3P62A 2V8ZA 3W7EA 5TBOA 1EPXA 1K3UA 4GWEA 3TV8A 2JGYA 1QCWA 3PUOA 2QJGA 1PIIA 3CIXA 4IPIA 2QCDA 4Y90A 5EKYA 1OX4B 4UTTC 3TH6A 2QUUA 4IUOA 4HNNA 2V82A 3M5VA 1D9EA 3TE9A 2E6DA 4FIQA 2ZBTA 4ADUA 4N9DA 2Y7GA 1TTPA 1OFEA 2HSAA 5EMUA 4WOQA 3PF3A 3NR0A 4LUIA 5DY3A 1XDLA 2DZSA 1F74A 1LRQA 1VYRA 3STFA 2YCEA 5D37A 1H7WA 3MHGA 3DU0A 1AMKA 1KV8A 4NJHA 3UZ5A 3W7QA 3LM7A 1SO4A 1YPFA 3TAKA 2C19A 4UFMA 1OFRA 1H7OA 2PURA 1ZFJA 1J2WA 3LHYA 2A7RA 2O7SA 1XUZA 4PCFA 4CNNA 3GAYA 3QMSA 3Q58A 3NG3A 4XBSA 2YW3A 2QEZA 2E6YA 2ABBA 1Q6LA 1GJPA 3GKFA 1OX5A 1MEHA 3TJXA 4IGHA 4JTUA 1TPC1 4Q32A 4TO8A 4LRTA 4EF8A 1Z42A 3L9CA 1JRBA 1SZFA 3BVJA 3BGGA 3EWYA 5TQLA 1VGAA 5KSWA 3SGZA 5FF0A 3KXQA 4WD0A 1X7FA 5C54A 3V1PA 2Y70A 3GB6A 5EBUA 1DBTA 4O17A 2J6XA 3LV5A 3QSTA 1NF0A 2WQPA 4FNTA 3QQ1A 4CCCA 2Q8LA 3S1UA 3IIXA 4S2CA 3HG2A 2ZDRA 3CT7A 2W6RA 3L5MA 1W8SA 1GG0A 5IBXA 1W3NA 4DBDA 2FPVA 4MUZA 1LBLA 3MUXA 1W37A 1R47A 5H91A 3EWZA 3NQCA 5L6UA 5H2ZA 3ZWTA 1LBFA 3GDRA 1NVMA 1Q3NA 3NZRA 3NQMA 3NQDA 1S5TA 1KV5A 4YXGA 2DJLA 3TC7A 5EY5A 1K7FA 4RXGA 3STEA 3EX3A 1T0OA 3PBYA 3CEPA 1TJRA 3D0CA 3LBCA 4M19A 2YSWA 4KWVA 4RZ4A 2BXVA 2P1FA 1KLYA 3NA8A 3TFCA 4TIMA 1WYIA 1TTQA 4GJ1A 1LZOA 4UUIA 4JTSA 3IEBA 3EWXA 1SW7A 3EWBX 3GR8A 1SQ7A 4IMFA 1ZHAA 1F7BA 1S5WA 2VEPA 2DU2A 4WUIA 2AGKA 3DKJA 3GR7A 5AHIA 1H7XA 3HBLA 1TTJA 1IXPA 1LTDA 3G22A 4TU1A 4ZQNA 3T7VA 4R33A 2IQTA 4LVFA 1TIMA 3IVUA 4TX9A 3W1RA 1P4CA 4O1AA 3G1XA 2R94A 3G1YA 3MI6A 4AWSA 4JD4A 4UXDA 3KVLA 4O53A 2QJHA 3VFLA 4EVZA 3QFEA 3M47A 2RDTA 1YXYA 3P84A 2A21A 2H90A 3KRSA 1Y0EA 5LGXA 4Q4KA 1H7PA 2PC4A 2QF7A 1RD5A 1TRIA 3LLFA 3HB9A 5KMYA 4QM1A 3QF0A 3W72A 3SW6A 4UR8A 3S0CA 1G6CA 4MFEA 4WJEA 3JS3A 1SZNA 1HUVA 1FCBA 3W2KA 3GKAA 3DFTA 4CLMA 1JUBA 2RDUA 3S5NA 1SSGA 4JX6A 4H6KA 5D2WA 2EF9A 2RH9A 3KVKA 4MY8A 1X6UA 4NJKA 3IV3A 4OQVA 3G8RA 5G2IA 2WJZA 4DF1A 1KM0A 1TQJA 1J4EA 1TV5A 4O8RA 2FLIA 1WV2A 3PB0A 3AJXA 1K7EA 4GRSA 2RDWA 3NAVA 2J9YA 5EL1A 1WBJA 4EF9A 3HG4A 4WY0B 4BWLC 2FDSA 3PC0A 3M16A 3W85A 3E0IA 2DJXA 3O07A 4JTLA 3T55A 3UZJA 4LS1A 4PODA 1HFBA 2QAFA 2X1UA 1VQTA 4JIQA 2YXGA 3UWYA 3O15A 2XFWA 4PEKA 5F4SA 2I9EA 1NF7A 4R34A 5I3FA 1AL7A 4D2JA 4AWUA 5MHBA 2WSRA 1SSDA 2CLIA 4TR9A 3KFTA 2Z1BA 3G0UA 5BW6A 1YADA 5BNKA 5AYZA 3A24A 4DF0A 1SO5A 3P60A 1KW1A 1YTEA 1L6YA 2KZHA 2QCCA 5D2YA 1WDWA 2DORA 1UASA 2NX1A 1A50A 4Z1AA 4K37A 5C5YA 1SW0A 3CPRA 3W2NA 1EP1A 2NUXA 3S9YA 3S1XA 3R12A 1RZMA 2VC6A 1KA9F 3LHVA 1ZENA 3RLUA 3EXSA 4ZQOA 1VHCA 1KFJA 1WX0A 2QCEA 3IRDA 3W76A 3NQAA 3CWOX 3C3NA 2A7PA 3NGJA 3EX4A 4ORMA 5DY2A 4O10A 4QJ1A 2ZZ5A 2Z6JA 3S8HA 1FWRA 3W1XA 4FNPA 1VHNA 4W9TA 3P67A 2QJIA 4N6EA 3GYEA 4XKYA 4FXSA 2WO5A 2CFFA 1G67A 1IIHA 1DJQA 5I3IA 1QAPA 1UCWA 3M44A 5HINA 1HL2A 3DZ1A 4LVDA 4N6FA 4OT7A 2WPBA 4PTNA 4BR1A 3W1MA 1QWGA 1W3IA 4KKXA 3N34A 2FB3A 4M7SA 3CLMA 2RKXA 5F2GA 4HNTA 1U5JA 3GNDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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