5BMWA

Crystal structure of t75v mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYVGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 99
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5bmwA00
3O8AA 1SO5A 5I3JA 3S5YA 1V5XA 5EYWA 3TSDA 1OFRA 4NQ1A 3EWBX 2QUUA 2QCDB 1GG0A 1Y0EA 1X6UA 3LGEA 4WXZA 2NX3A 3VKJA 3NVTA 5F2MA 3B06A 3TE9A 2ZTKA 2NWSA 1P0KA 3N9RA 2A4AA 4AB4A 1YLVA 2YSWA 1MEIA 1WQ5A 4TMCA 4WD0A 2H8ZA 4Z1AA 3NL6A 4ADTA 4J9JA 5CPOA 4MIMA 4MZYA 2GQ8A 3PAJA 4NNAA 1I2NA 4QJ1A 3IVSA 1VCFA 1OK6A 2CU0A 5U4NA 1ZAJA 5HR7A 1AW2A 3W7OA 2Y7EA 1W8SA 4LW7A 4R34A 1TCDA 2E68A 2PRHA 4QIUA 3TK7A 2KZHA 3B0VC 4O1CA 1KM3A 5HR6A 4GRSA 1PCKA 3HGSA 3IGXA 4FHAA 4N9DA 1PE1A 1VYPX 4LUJA 2J27A 2H3BA 5IBXA 4WXYA 5BOOA 5D2VA 1KM4A 3CIWA 3WJXA 2R8WA 3GAKA 3NPUA 2C16A 2V2DA 4JR5A 4GXMA 4A2RA 5HQEA 5DBUA 2VOMA 1HFBA 5D09A 1FWSA 3BW2A 5FESA 4UTWA 2OMAA 2GUUA 4IXHA 2B7QA 4JDYA 3SECA 3EWUA 4FXRA 1D3HA 3HQ1A 3L68A 1P5BA 3P8IA 4G1KA 3C56A 4EIVA 2DJLA 3GR7A 3GIYA 1MEHA 5EKYA 5C55A 1LLZA 1KV5A 5F1UA 2JGYA 3W1PA 1SZGA 1SW7A 4AF0B 4IPIA 3STGA 1T99A 1ML1A 4O0ZA 2CLMA 4O0KA 1AL7A 1EWEA 3C0JA 4HNVA 4W9TA 3LCGA 1C9DA 1OX4B 1W37A 1W31A 4Y8FA 1XDLA 5FEWA 4MLRA 5DY2A 4QSHA 5AHEA 3TC6A 3A5FA 1VZWA 1KFJA 2AQWA 2NUXA 1EUAA 3GDKA 1KW1A 1AW5A 2QF7A 1XM3A 2B7PA 3AO0A 2E6DA 5I3IA 2YXGA 1VR6A 3LRMA 4UNKA 7TIMA 3N9SA 4S2BA 2F7FA 1KTNA 3KVLA 3NQCA 2ZZ5A 1OF6A 1UUOA 1DHPA 4MJZA 2YYUA 2Q3RA 2XN2A 1YDVA 3S1XA 3PS7A 5DN1A 1A5BA 3TR2A 1TB3A 1XKYA 1LDCA 1VYSX 4TR9A 3W88A 2H90A 3LV6A 3QJAA 5AHFA 3W7KA 3NM1A 3VCRA 4UUIA 4AMAA 5T26A 1T8XA 2ISVA 2OX1A 2ZZ2A 1TRIA 2Z6IA 1VYRA 5E93A 2ZFAA 4ZQNA 5KTLA 4CQ9A 1B57A 1FWTA 2A0NA 3S5OA 3EWWA 4MFEA 3C6CA 3EX6A 1VLIA 4OV9A 3BLFA 3GZ3A 3JS3A 1FCUA 2Y63A 3DBPA 3I68A 1KTCA 3MW7A 4JYEA 4Z0SA 4GUIA 3W76A 4XKYA 2QR6A 1WBHA 3G3DA 4M6VA 2YR1A 3HOJA 3A5VA 2CW6A 4QISA 3W7RA 1MZHA 5DCBA 2HSAA 5G2HA 4JTEA 3FJLA 2A7NA 1W5MA 3TROA 3NQGA 1HL2A 4E38A 3SJ3A 2ZRWA 4EF8A 3A23A 4JY9A 4O11A 4ZMGA 4DPQA 1ZCOA 1KBIA 2VENA 1GEQA 1TPFA 3USBA 4P2VA 1H1YA 4TX9A 4NZJA 3R8RA 2VFFA 5LGZA 3B0PA 5F4XA 3W7LA 4TO8A 2Y89A 4BWLA 1LROA 4AVFA 3IVTA 4P61A 5AB3A 1FCVA 2C18A 3M7WA 4DELA 1PHWA 2CLOA 4CNOA 4NJGA 1SSGA 4K8EA 4OBTA 3W2LA 4OV4A 3M16A 3NQDA 3FYOA 3W7IA 4FNTA 3W72A 1ICSA 4JTLA 1OFDA 5CZJA 1I2QA 3EWXA 3PVFA 3N14A 3G0UA 3LLDA 4AWTA 5HINA 2NX9A 3LDVA 1EX5A 4A3UA 1KTBA 1F73A 1XI3A 3LTSA 1WAUA 3S1WA 3I7SA 3LX9A 3FS2A 1B9BA 4RZ5A 1LBMA 4GJ1A 3G8EA 1SR9A 3NA8A 4UTMA 5EPDA 4A2SA 1OFQA 3BVJA 1BEUA 2A5HA 3QW4B 3LCHA 5K4ZA 3W7JA 3U6WA 2A1YA 3ANYA 3W9ZA 3NQFA 3UWUA 1W3IA 1A5CA 3U8GA 2A6NA 4PL1A 3W7EA 3LCIA 3LI1A 3NPXA 3G1VA 1NF7A 1RQEA 2W6RA 3C2EA 3Q37A 1W3TA 1G7UA 4GC4A 3M5YA 5K7JA 3G1XA 1W54A 4GUJA 3NDOA 3PB0A 2RDWA 3C2OA 3HMJG 5FF4A 2V0TA 4K39A 1OFOA 1Q6RA 4ALDA 4NJIA 1XDMA 1F76A 3P5ZA 2ZZ7A 3KRZA 3HGRA 2EKCA 1KM6A 4FO4A 4MKNA 2CFFA 2Q8LA 6TIMA 2D73A 3O6YX 1SSDA 1Q6QA 1V7YA 1H60A 3TFCA 1YDNA 1Q6LA 3IRDA 5KITA 2Y62A 4NNCA 3HG5A 3PB2A 2OZ0A 5FF2A 4JTGA 3W7HA 2NLIA 5I3KA 1A5SA 2DZUA 2DZPA 3KHJA 3LHUA 5BMXA 3W2MA 2E5DA 2PURA 5KZMA 3LCXA 4R7JA 3KRSA 5I3HA 2A7RA 3S9YA 3KVKA 5AOUA 4QM1A 3FKRA 2J9YA 1UUMA 3BGJA 2C19A 1OFEA 2PCQA 4HN4A 3O6DA 4FX6M 4H6KA 1HG3A 5AYZA 4UTKA 3MO7A 3QH2A 3NM3A 3MP3A 2H3DA 4S2CA 3ZS4A 3LLFA 5D2YA 4FXSA 3DFOA 1LZOA 3UYCA 3LTPA 2ZZ6A 5D2TA 3F03K 4UTTA 3EWZA 5C2XA 1PHQA 4OQVA 1H7RA 1ZY9A 3ABRA 4O1AA 3N2XA 2C6QA 2B4GA 4XBKA 1AG1O 3E9AA 5A8GA 4QNWA 2GJNA 4M7SA 1ZAHA 3P62A 3G24A 1YDOA 5SWUA 2WOQA 1YTEA 3P84A 4FNUA 4KKXA 3W87A 3THQA 4KFPA 4WJEA 5J5RA 1W5PA 4N02A 5AN7A 4LU0A 4NXKA 2BXVA 2Y88A 3B03A 4KWWA 1KM1A 1UASA 2C3ZA 1KLYA 5I3GA 2YFNA 3IEBA 4RV8A 3EX1A 1NF0A 4GWEA 4UTJA 5ABTA 2QAFA 1FWNA 2ATSA 4GNJA 1TPUA 1XBVA 3BG5A 4PH6A 1SU5A 2R14A 2IQTA 3LHWA 1WA3A 4ZVJA 3LCWA 1JQXA 3T40A 5D05A 3W7NA 3P60A 2TPSA 1JJKA 1RQHA 4ZQCA 3O07A 3IIOA 1OFAA 4A29A 2ZA1A 4YLWA 4B5NA 2EF9A 1GVRA 3L65A 4FIQA 2QJHA 3EKLA 3PUDA 4FNSA 1XC4A 3W70A 1DORA 2PC4A 3TV8A 4FEZA 5CPMA 4LT9A 4O4VA 3OHIA 1N55A 3O6CA 4R53A 3L0KA 4UFMA 1Z42A 3C2VA 2WO5A 2ZRYA 3PR2A 4FF7A 4UFHA 5EL1A 2Z6JA 2CZDA 3KOFA 2E6YA 5G1TA 1JCYA 4ADUA 3GK0A 4PEKA 5F2LA 2DP3A 3ABOA 4KWVA 4AAJA 1I2PA 2X30A 3M47A 4O15A 3HG4A 4WQ6A 3TJXA 1FY6A 1N8FA 4LVBA 1K03A 1LRTA 4JICA 5AYYA 4M7TA 1U83A 3G1YA 2ZTJA 1F7BA 2H6RA 3KFTA 1S5VA 1X8FA 1K7FA 3UWVA 3NQVA 3GYEA 3OEXA 4HNNA 3WK3A 3W2NA 4YXGA 1O95A 4DF2A 2JBMA 2J88A 2DZWA 1JVNA 3NAVA 4DXVA 3UQNA 1H7XA 3OVPA 2Z1BA 2Y7GA 3RNDA 5DXXA 4NX0A 5D37A 4XTIA 1TV7A 3LHYA 3LRLA 2VELA 1TQXA 4O1DA 1LTDA 3G1AA 3N34A 1G69A 5FI8A 3W7MA 1G6CA 3ELFA 4LVGA 1TPEA 2XN0A 3EB2A 3P74A 2ZCGA 3STCA 2ZZ3A 3GX9A 1I2RA 1JRBA 1ME9A 1TPH1 3LXAA 3UZJA 4FX7A 2Z2UA 4N9BA 1GTHA 4CNNA 4UMBA 1FWRA 2ZZ4A 2Y7DA 2BLEA 1EA0A 3GB6A 1AL8A 4Y6GA 3W3OA 3W23A 1QDSA 3EX4A 3D0CA 4RZ4A 1H1ZA 3BO9A 4YWIA 1OX5A 4E0CA 1YADA 4ZQPA 1JCXA 2FJKA 2ZRZA 2CLIA 2QCHA 1F5ZA 4DEFA 4UR7A 3Q58A 4L4MA 3HF3A 4PCFA 1S5TA 1ICQA 2B0MA 3CTLA 3EX3A 3TU9A 1G4EA 1OX6A 3TMLA 3WFAA 4AF0A 5L9FA 1SO4A 3NYZA 3CC1A 4QNEA 4I9AA 1TV8A 1XFBA 1LRNA 4NUWA 3W73A 2YGYA 4HNTA 1TJRA 3MI2A 1CI1A 1YYAA 3FFSA 4LS0A 5HULA 3BARA 4CCCA 2BSLA 3LXBA 3BLIA 4A22A 1BKSA 1W3NA 2DZTA 1LOSA 2YW3A 1PIIA 1QAPA 3IIXA 1SPQA 3QPZA 1DKWA 4HPJA 2YPIA 1F74A 5CSRA 4NJJA 4LUIA 1Q45A 5LNSA 1BWKA 3L66A 5HWNA 4GUGA 4PODA 3LHTA 2NUYA 3IIZA 3PG9A 4E2DA 1SZNA 3MMTA 3SZ8A 5DXYA 1KLZA 5CGQA 3OVQA 5AHIA 1TRDA 1DQWA 2ISSA 2Q8ZA 3GDTA 4O13A 2BTMA 2X2GA 4I7VA 2E5CA 5D30A 2P1FA 1X1ZA 3HPZA 2ALDA 2FTPA 5LSMA 1H5YA 1KFBA 3G0XA 1R46A 3VE9A 4IOTA 3QC3A 1FDYA 4IPJA 3UXAA 1H51A 3L2IA 2ZRUA 4YMZA 3FIGA 3BK0A 3PM6A 2FLIA 3DFTA 1LLWA 1IIGA 1SO6A 1W0MA 2H8XA 1UB3A 3PC0A 2VFIA 1K02A 1OK4A 1K8YA 4M5PA 2I1OA 5CKSA 4ADSA 1KM0A 3O05A 1VCVA 1L9WA 1EWDA 2B7OA 3MI6A 1PCWA 3VFLA 3PBYA 3SW6A 2CZFA 4Q4KA 3S8HA 3NZ1A 5CPNA 4IMFA 4POCA 3PY2A 1JULA 1AW1A 4UTLA 3EEGA 5DY3A 2CZEA 1O60A 1OFBA 1KFEA 1FQ0A 1SZEA 3G18A 2F84A 2RDUA 1XXXA 5F4WA 2QDGA 5HUOA 4IGHA 1I45A 1IXQA 4BF9A 3DH7A 2ISWA 3UWQA 3RU6A 3G22A 3TDFA 2QDHA 2OCZA 4CLMA 1VPXA 4L4LA 4HHPA 2J9ZA 4WUIA 4O18A 2QCLA 2E5BA 1W5QA 3NR0A 5K3VA 4UTHA 2E09A 1TO3A 1WOBA 1BTMA 3P67A 5D38A 3HIJA 3A9IA 1ZJIA 4UTIA 3C52A 4EWND 3OBKA 3NXFA 3EKZA 1TTPA 3GKAA 3MUXA 2A7PA 4O4WA 1ICPA 2E6FA 5K9CA 4NJKA 3PBVA 1THFD 1EEPA 3M0ZA 3QMRA 1K8ZA 4O14A 4AHQA 1JQVA 1GWJA 5TIMA 2GOUA 4JTSA 3M5VA 3G1HA 4WOQA 3RK8A 4RXGA 2VEMA 2WSYA 2TYSA 2AGKA 3TAKA 1LOLA 1J4EA 1W5NA 3O06A 2WNNA 4GFSA 1YXCA 4LS1A 4OU1A 3NG3A 4JIPA 3EXSA 4Y90A 1AK5A 3BV4A 2I9EA 1NFBA 5DELA 5EBUA 5G1YA 1TREA 3DU0A 3DFPA 3LCFA 2VXNA 1RR2A 4PA8A 4EVZA 2XFWA 1CW2A 2HMCA 1I4NA 1TYGA 1IXOA 3DZ1A 1GTEA 4O57A 3DI0A 5KINA 4JX4A 2QCCA 1ZAIA 2CLFA 3LTYA 2E6AA 3TQKA 3GLCA 1H7WA 1QCWA 4BI5A 2DU2A 3WK2A 5KSWA 4MLJA 2NXHA 5F1VA 1J2WA 3C2FA 1EP2A 1ME8A 1W1ZA 1DL3A 1PL9A 2PRLA 2VFHA 1DBTA 3L21A 2ABAA 2TMDA 3C3NA 2TRSA 3KAOA 2X1RA 4DBEA 2YCEA 1QOQA 2AAMA 1GJPA 5DCDA 4FIRA 3TA6A 4ML9A 1L6YA 1WOAA 3M5ZA 1YPFA 3GVGA 1RV8A 2GVJA 1SO3A 3GXPA 1SZFA 2QCGA 3SFKA 3V75A 3LHVA 4Z1DA 3A22A 3NQ6A 3GKFA 3UWWA 1VLWA 2DORA 4MPQA 5FF7A 1Z41A 4Z1CA 4EF9A 3WK1A 1TTJA 1JUEA 4XKYB 2ZDRA 5CZSA 3R89A 3W1MA 5LHEA 3ZWTA 1RVGA 3S0CA 2WNZA 1IF2A 3DFSA 1FBAA 2FDSA 3C8FA 3LRKA 4N2YA 2YX0A 3KXQA 3MHGA 2V5LA 1QOPA 4OE7A 3OVRA 1XCFA 3LHZA 4O8RA 4Y96A 4N6FA 3W1TA 3B0UX 1I2OA 3LOTA 2WPBA 3ZFHA 3LERA 1YXDA 1GVFA 1FXPA 4NVTA 1TJPA 3G1FA 1O5KA 3NNTA 1KFCA 4O1BA 3TMQA 2ZRXA 3HO8A 5CZTA 4DQWA 2J9XA 1VGAA 1MO0A 3NQAA 5D2XA 4BI6A 2HS6A 1L6SA 3MYOA 1MXSA 1TPWA 2EAWA 2GQ9A 3IGSA 1QMLA 2NX1A 1P1XA 3QZEA 3PF3A 2PE4A 1K7EA 1FCQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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