5BMXA

Crystal structure of t75n mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
ARKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYNGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 98
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5bmxA00
3C52A 4EWND 2AQWA 3P74A 4DXVA 2GVJA 1W3NA 3KVKA 1G7VA 2VXNA 4Z0SA 4UTMA 4TU1A 5KZEA 4JDYA 1LZOA 3OVRA 2X30A 1IXPA 1ONRA 3GDKA 2ZCGA 5G4EA 5E93A 3HIJA 2YYTA 5C54A 2VOMA 3MI3A 2RDUA 3I6RA 2ZZ1A 2DZWA 5G4WA 3I7QA 2Q8ZA 1PE1A 2QAFA 1WYIA 5CGQA 5U4NA 3NL6A 2V30A 5KZDA 4TMBA 3M7WA 4CQ9A 3LCGA 4LRSA 1OJXA 3NPWA 4TR9A 1BWKA 3GKFA 3PB0A 1LOQA 2R8WA 1TMHA 4ZVJA 1L6SA 1XBVA 2ATSA 5SWUA 3W3OA 4LS0A 2BLEA 1R46A 3W2KA 3IGSA 4MY9A 3C8FA 1M7OA 3HB9A 4IWWA 4X9SA 5I3HA 1QDSA 3HJZA 5TBOA 4MIMA 4O19A 2DZSA 3NDOA 3BG9A 2VEIA 4NVTA 3PUEA 4N02A 2ZZ3A 2PRMA 3BGGA 3CWNA 2NXGA 2FJKA 4RXGA 1U83A 2CZ5A 1LM1A 1R30A 2VELA 2ABBA 3EX2A 3INPA 2ZRYA 3GZ3A 5EBUA 3W1TA 2H90A 1UASA 4FNPA 4JTIA 3M5YA 3PG8A 3LHTA 1SZGA 3FEMA 1AL7A 1ICPA 1FCQA 3TQKA 3EB2A 1SO4A 3EWYA 4JGDA 3TAOA 5LKYA 1PCKA 3HPXA 1UB3A 2JBMA 4H4IA 5G1YA 3STEA 3F4WA 3ATYA 1OF6A 2FTPA 2V9DA 2J24A 4O10A 3DFOA 1T99A 3GAYA 4WUIA 4JICA 4UTTC 3JS3A 3B0PA 4O1AA 3HQ1A 2C14A 4JX4A 4ZL1A 3A9IA 1YXYA 3W88A 3NQVA 3W85A 4TX9A 1XUUA 3IVTA 2VKZG 3ZS4A 3LLDA 1RV8A 5C5YA 5D2YA 3G1DA 3NL5A 4N6FA 3BK0A 3U6WA 1YTDA 1XCFA 2ABAA 3PULA 4GUGA 5F4SA 2A2IA 3TX9A 4NNAA 1JUBA 3E12A 3LM7A 3W7NA 3NQEA 4ONVA 1PHWA 1FWRA 2DZUA 1JRCA 2VFIA 2BX7A 2VFDA 4WX2A 2VFHA 2RH9A 5LNSA 3EX3A 4WY0A 3TH6A 5CPLA 4DQWA 2GJNA 3W74A 2HMCA 3C2FA 2HS8A 1TSIA 4CCEA 1LBFA 1Q3NA 1XBXA 2YSWA 1S5TA 2WSQA 3FYPA 5HULA 2B7QA 3QZEA 3IIZA 4O1CA 4LVBA 3A24A 5AC7A 1FQ0A 1TPUA 4ADUA 1WX0A 1XBYA 3STCA 2OT0A 3W86A 2PURA 3W1NA 1NVMA 3UQNA 3NAVA 4KFPA 2BZNA 5LNUA 2Y7EA 3LRMA 1VC4A 3I7RA 3SY5A 5F2IA 4U4MA 4MJZA 1IXOA 2GQ9A 2WV8A 2QKFA 3FKRA 2W79A 5BMWA 4FF7A 4O0KA 2NXIA 4ZQMA 5FF4A 1F6PA 3S0CA 3E9AA 4UFJA 3NO5A 4QISA 4K8EA 5D04C 3HF3A 3BLEA 3BG3A 3C2RA 1KM3A 1UUOA 1JCNA 3EX6A 1K8YA 4O16A 1IIHA 1W8SA 4LV9A 2ZA2A 4OGZA 4WY0B 2Q3OA 2X1TA 3GIYA 1GVQA 2YW4A 2H8XA 3P82A 3WK0A 4JY9A 4LUIA 5HR6A 2NUYA 4AHQA 3UWZA 2ZZ2A 3GNDA 3B03A 4HPJA 3HGRA 5D02A 5LZLA 5F2MA 4WQ6A 3LRLA 5AB3A 1OYBA 1D9EA 5EKYA 3CIXA 3TW7A 2YX0A 4E2DA 3LV5A 1HO4A 1GG0A 2E68A 1DJNA 1A5BA 3GDRA 4MZ1A 3UWWA 3LERA 1T0OA 4RV8A 5DXXA 2V2HA 3LXCA 2Y7DA 4I7WA 2A21A 1Q6QA 2V81A 2AAMA 1LOSA 2FB2A 1OG0A 3S8HA 3P5YA 3W7KA 4YCPA 2JKAA 4O14A 3MHFA 2ZYFA 2EHHA 2EGZA 4CCDA 1TPFA 4DF0A 5KMYA 4AVFA 3EEGA 3C6CA 4BF9A 3L68A 1FBAA 4S2CA 1L2UA 3M43A 3G18A 1GQNA 4PL2A 1KLZA 3W07A 4XUGA 3W7QA 3SSJA 3NM1A 3PBWA 4EOUA 3NQFA 3ABSA 2R94A 3O6DA 5CPOA 1QR7A 2GPTA 2FQIA 3KVLA 4AWSA 3W7JA 3B4UA 3EWBX 5IBXC 2FFCA 1AW5A 2QJHA 3NPUA 3EX4A 1OYAA 2RDWA 4OWGA 5LGXA 3GDTA 3Q94A 3W7RA 4JYEA 1FDJA 3N3MA 5H2ZA 1E51A 4BFAA 1PCWA 1BEUA 4JIQA 4M6QA 3W72A 5LNRA 4QITA 5KZMA 4PCFA 4LC6A 2J9ZA 1MSSA 3BVJA 2X1SA 2A85A 5F4XA 4I7UA 3TW6A 3A22A 2A6NA 4IMCA 1XDLA 3UWQA 4E0CA 1YPFA 1EUAA 4RJEA 1OK4A 3W7PA 3DFNA 4O1DA 3LI1A 1OFQA 3S5NA 2F84A 2GVGA 3KOFA 2WSRA 3UWVA 2O7QA 2QUUA 3GR7A 1CW2A 1QPNA 3O1NA 5HR7A 3ANYA 3JRKA 1NSJA 3GVGA 4FX7A 5KTLA 4GUFA 4NJIA 1A5CA 3E49A 3TFXA 3KRUA 4FO4A 1UUMA 3IGXA 3UNDA 3QYQA 1XKYA 3BPWA 1KFLA 3W1LA 4R7JA 2CU0A 3NQ6A 2E6YA 3C2EA 4FNUA 1G4SA 3HBLA 2I9EA 2G96A 5IM51 5GVJA 1O60A 3LRKA 4ZQOA 1HFBA 5CKSA 4Y96A 1SO3A 4AH7A 2P1FA 1TPEA 2NX1A 1H63A 5LNVA 3IIOA 3NQAA 3KVMA 1DJQA 4BWLC 5EPDA 1LBLA 3ABOA 3BG5A 1WOAA 5HUOA 4JY8A 4KFNA 1VH7A 1JCXA 3WJWA 5U7SA 3HGOA 4ZMGA 4O57A 1VYSX 1L9WA 1FDZA 3LXBA 4UMBA 3STGA 1KBIA 1H62A 1PHQA 3TA6A 4FB7A 4FX8A 3OBKA 3T4CA 2CLIA 4DBDA 4UTUA 2A4AA 2QCFA 2YDAA 4GRSA 5DY2A 1QOQA 1VHNA 2NX3A 2RKXA 4NUWA 2OZ0A 3L9CA 3GK0A 1IXNA 1T96A 3HG5A 3QSTA 3PB2A 3W6YA 4WXYA 1DKWA 1AG1O 4JXCA 3CIWA 5AC6A 3M0ZA 5D33A 3Q37A 1DVJA 5D2WA 4JYFA 2ZTKA 2X1RA 1ZJIA 3P7YA 2R91A 3LCIA 1KV5A 5D38A 3UWUA 4POCA 1VJIA 3W1UA 1KW1A 3S6DA 3CC1A 4KFOA 4GJ1A 4LU0A 4K36A 2ZRUA 3D0CA 1K3UA 1LLWA 4DO4A 1BKSA 1XUZA 4JX5A 5DN1A 1Q6OA 2KZHA 4PA8A 4UNKA 4NQ1A 1F2JA 3DENA 3S5OA 3TMQA 4ZZ9A 4ZQNA 2VFFA 2ZTJA 1KFBA 3GNNA 4NXSA 3QMSA 3WK1A 4IGHA 5D32A 4NX0A 3SECA 4PFMA 1AL8A 2V2DA 4JTTA 5A5WA 5E0KA 1TRIA 1ZAIA 2B7NA 1H1YA 3LTSA 1J2WA 1TQXA 4K38A 3W1MA 1SFLA 4JR5A 5KITA 2CWNA 3MO7A 2ISSA 3L66A 4CLMA 3MUXA 3C0JA 5G1TA 4JTFA 3CEPA 2Y7GA 3KRSA 5G5IA 1GJPA 1WQ5A 3LDVA 4YCOA 3KRZA 3CT7A 5KSWA 1OFBA 2QCEA 1JUKA 2JKEA 3M5XA 1TJPA 1H60A 1RR2A 3PUOA 4CCCA 4ZQRA 5D09A 1THFD 3I68A 4I9AA 1TPC1 3MBDA 2OCZA 4UNLA 5EA9A 4RCXA 1KM1A 1MO0A 2I14A 5CSRA 3LXAA 1K8ZA 1VR6A 5A8GA 3NQCA 3W1QA 4PH6A 2QF7A 2WOQA 3TXZA 1PVNA 1ZNNA 3L0GA 3Q58A 5FF3A 1UCWA 5HNRA 4RKAA 5BW6A 5C6MA 3IV3A 1A50A 3RMJA 1P0KA 4L4MA 2FPYA 2G97A 5K7JA 1VYRA 1XDMA 3G24A 3IIXA 2ZQ0A 2YFNA 1TJRA 1QAPA 4KWVA 3TIMA 5EL1A 1YDOA 3R5EA 4EVZA 1XM3A 3W7LA 5DCDA 3IEBA 3V1PA 3OEXA 4RX0A 3QF0A 5LSMA 5F1UA 2ZA3A 4R34A 4Z08A 4RLIA 3P62A 3V75A 1TPVA 3QMTA 4M6PA 4ALDA 4Z1CA 1EPXA 3TMLA 4HNUA 4FNQA 3TR2A 3LGEA 3NEVA 6ALDA 3E02A 1I2OA 2V5BA 2QCDA 4O17A 5K4ZA 4NNCA 5LHEA 1X8FA 4AF0A 3W9ZA 2V8ZA 1JULA 4AEOA 3VE9A 5F2GA 1B9BA 1I2PA 3NG3A 5AYZA 2QCLA 2G95A 4OV9A 2Q8LA 2TPSA 5AOUA 4UXDA 4ADTA 5HQEA 4K7YA 3FIGA 3CLMA 4O12A 3TSBA 3P61A 2OMAA 2NV1A 4GNJA 4IMDA 1O4UA 2TMDA 3TNOA 3PM6A 4RZ5A 2E5CA 4NXKA 1H7NA 4FNRA 1GVFA 4PODA 1F76A 3WK3A 4WJEA 2ATMA 1VZWA 1OK6A 3A23A 3PBUA 3QPZA 3W7HA 5K4XA 5EY5A 2BSLA 1QCWA 2FLIA 2XN1A 4JEQA 1OVDA 3UPWA 3PWAA 5D05A 5I3IA 3N73A 1KTBA 1JCMP 1O5XA 3MYPA 3QW4B 1OFOA 3THAA 4K6AA 3DKJA 2V5LA 8TIMA 1H7WA 1W1ZA 2TYSA 3L67A 1EX5A 4O52A 4IXHA 4IX2A 3DFSA 1V5XA 1ZENA 2DZTA 4RXFA 4WD0A 2QCDB 5AFDA 4KKXA 1KFJA 2B7OA 2AGKA 4AF0B 5AC8A 3I65A 4HT3A 1UJPA 2GJLA 3L0KA 4Y9AA 1Q6RA 4JTKA 3LV6A 1SZFA 4JTSA 3N34A 1F5ZA 3FA5A 1VLWA 1W5PA 3Q2DA 4IMGA 1OX6A 4NT0A 3SJ3A 3BGJA 2NLIA 3PSVA 4LY8A 3TV8A 3TXVA 3G1VA 1OHLA 1KLYA 4MVAA 3R13A 3SIZA 2V2CA 1OX5A 1EUNA 1S5VA 5F1VA 2A5HA 3YPIA 4MYAA 6TIMA 2BXVA 3UY8A 4IOTA 5K3VA 3LHUA 2YFOA 3DI1A 1K7XA 3BLIA 3EWXA 4IX0A 4JNMA 1RQBA 3G8EA 4O4WA 4QM1A 3ZWTA 2CLEA 4K7VA 2RDTA 1KFKA 1MXSA 5G2WA 4YMZA 1O94A 3QSRA 3T55A 1FCUA 1SQ7A 4GFSA 1GVOA 1YXDA 5K9DA 1OYCA 3WJSA 1ZCOA 1FUYA 1B4KA 2WJZA 2X1UA 3H53A 5D2TA 3BW3A 3W84A 3G3DA 5FI8A 3W23A 3W2LA 2EAWA 4TMCA 1N7KA 4QNEA 4H6KA 5C2XA 5AN7A 4OU1A 1QNVA 4Z1BA 4AAJA 2CZEA 4LS1A 3TQVA 2YCEA 1OFEA 1FWNA 1NF0A 1FWSA 2E6AA 4K8HA 3RNDA 4D2JA 3EWWA 4N9DA 4Z1AA 3I7SA 1LRQA 2FPTA 1NF7A 4MFEA 4N9CA 3LHYA 1LBMA 4HSOA 3CHVA 3L21A 4AWTA 1J4EA 1IIGA 1GTEA 1KTCA 2CLOA 2WNZA 3T44A 3TJXA 5BMXA 3W83A 1GYNA 2QDHA 3UWYA 3HOJA 2ZBTA 3NNTA 3EKZA 1YYAA 1X1ZA 2E5BA 1OFPA 4JDBA 4TO8A 3G1XA 3RLVA 1HL2A 3TDFA 3VNDA 1K03A 3LHWA 4UTLA 3LCHA 1TV8A 2DZVA 1W3IA 4YLWA 1Z48A 4Z1DA 1LORA 1SW0A 3P84A 1AK5A 4X22A 1M5WA 1JCYA 4JIPA 3VI2A 3QC3A 4UTWA 4ORIA 3LOTA 3W22A 3DFTA 3F1QA 1TPWA 1OFRA 4QSHA 4IMEA 4HHPA 2E77A 1FWTA 1SSGA 1VQTA 2ZRWA 3NQ2A 4MLRA 4XWUA 5D30A 4UFHA 4XBKA 5I3JA 2BWGA 4I7VA 3O06A 1GOXA 5CZSA 3OVQA 1R2RA 1K8XA 2YZRA 3DFQA 2EF9A 2C13A 1W5OA 3CU2A 3G0UA 1ICSA 1Z41A 4OQVA 4ADSA 5EYWA 1W37A 1LDCA 2ZDRA 1JCLA 5L9FA 3UY7A 1SUXA 1QOPA 2QEZA 3THQA 1KM5A 1LP6A 4WXZA 4O1BA 2J88A 2OT1A 3R8RA 2A7NA 3GDMA 2E6FA 1W5NA 2CLMA 1TRDA 3LB0A 2QCMA 3W7CA 1LCOA 3N9SA 3TROA 3FJ6A 2J9XA 1ADOA 3B0VC 3HPZA 4LS2A 1GTHA 1F05A 3W7GA 1CX9A 3PG9A 3IGUA 3LTYA 3GXNA 4GWEA 3W2JA 1P5BA 1ME8A 4BK9A 5HMSA 5AHIA 1S5WA 2Y88A 3NQGA 3MWAA 1PV8A 1G7UA 2CZDA 4IPIA 2CLHA 3IVSA 4YXGA 3HG3A 3WFAA 4J9JA 3DFPA 1QWGA 1FCVA 1P0NA 3QPYA 3RLUA 3BARA 2OX1A 3NXFA 2ALDA 4O15A 4LT9A 2W6RA 4ZQPA 4PL1A 3T78A 3S1UA 4HIBA 4FEZA 4MUZA 1SSDA 4R53A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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