5BNKA

Crystal structure of t75c mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
246
structure length
244
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGCGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 96
structure length 244
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5bnkA00
1VLWA 1EWDA 2JKPA 2VFHA 3HF3A 5CPLA 2H3DA 2QCCA 3LXBA 4LUJA 1VYRA 1PE1A 2R8WA 2J9ZA 1D3GA 2QCLA 1VCFA 3QFEA 3G1FA 1J5TA 2NZLA 1FXPA 3B05A 1IF2A 2BLEA 1JUEA 3M43A 5LSMA 3VCRA 2ZRYA 1DL3A 4LVDA 1TV7A 3FIGA 1YTEA 1XI3A 4U4MA 4BR1A 2BWGA 1SUXA 1LLWA 2R91A 2V9DA 1AG1O 3NZ1A 4ZMGA 3ELFA 3FKKA 2ZZ1A 4UFHA 3W75A 1G7VA 4UTKA 3NDOA 1DVJA 4OT7A 4LRSA 5KSWA 5HNRA 3DKJA 4JYEA 3DAQA 3L5LA 4CQAA 4N6EA 3TMQA 2B7OA 3G1AA 4HSOA 5F2IA 4OWGA 4CCDA 4KFNA 4M5PA 3QEZA 3UZJA 2D73A 4JIPA 3Q58A 4ZQOA 3NVTA 3ABQA 2OT1A 2YYUA 3NYZA 3TXVA 2QAPA 3NQ8A 1EX5A 5KITA 3EKZA 1P0NA 1SW0A 4NX0A 2P1FA 4H6KA 3G3MA 4OV9A 1KM4A 2WKJA 3FJLA 1PS9A 3FKRA 3IRDA 4GBUA 3G3DA 4N2YA 1H7WA 4I7WA 3S1XA 1LOLA 3R8RA 2WSRA 3LERA 3G1SA 1UB3A 1KBIA 4JTTA 1KM2A 3RF9A 1TTQA 4ADTA 4QITA 2C19A 3P5ZA 1H62A 4DO5A 3HPSA 3LHWA 3S5OA 1GYNA 4FHAA 4DEFA 5K4ZA 1DOSA 3INPA 1UCWA 5HWMA 1THFD 2R94A 3LBMA 4FIQA 1F5ZA 3N73A 2TMDA 3MI2A 3PG8A 3ATZA 1W8SA 3F4NA 2GJNA 4N4QA 3EWYA 3OBKA 3P80A 3S8HA 1G4SA 1O4UA 1W1ZA 1ZALA 4UNKA 1DORA 2NUYA 3TV8A 4CQ8A 1PVNA 3N9SA 3GYEA 2VEMA 5FESA 3EX4A 3GXNA 3AJXA 1Z41A 3LHZA 1W3NA 4O28A 1M5WA 4LVFA 4NJKA 4MY8A 3NPXA 2X1TA 1EUNA 2NLIA 4ADUA 3W7CA 2VEKA 1WOAA 3GX9A 5EA9A 3GZ3A 1GPWA 5IBXA 3DFSA 5D37A 3TC6A 4FNQA 3UD6A 5KZEA 5I3KA 3C3NA 2DZXA 4O10A 3TQ0A 2VFGA 3LCLA 4NU7A 5K9CA 5KZDA 1JUBA 3TAKA 3FYOA 4O53A 4WD0A 3QQ1A 1TTPA 2JBMA 3LI0A 3MUXA 1K3UA 5GVJA 4UXDA 2PURA 2Y70A 2NXHA 3P8JA 1A5BA 1YYAA 2WSQA 1ICQA 4O14A 3OEXA 4K8HA 3GB6A 3LHUA 3Q94A 4CLMA 1XBVA 3S1VA 3I7QA 1OX4B 3E0IA 2QKFA 3M6YA 4RXFA 3HB9A 4RZ6A 3TC7A 3W07A 1OYBA 3CIWA 4ZQPA 2NUWA 1OYAA 2Y61A 1TPC1 3QW3A 3P8IA 1SSGA 4AH7A 2ZRXA 4M19A 2WOQA 2Y7EA 4AHOA 1RQBA 1TQJA 4MOZA 3LRKA 5LHEA 4UUIA 3NQDA 3FS2A 4Y96A 4O50A 1TCDA 1TTIA 4CNNA 3O1NA 1KLZA 1SZEA 5DELA 1AW5A 4YCOA 1SFLA 1OFOA 3OIXA 5I3IA 3NPUA 1QCWA 4LY8A 4R7JA 2B4GA 1SZGA 4XWUA 5LNVA 3PB2A 4HKPA 1AK5A 4BI7A 3E12A 4LS0A 2TSYA 2DZUA 3STEA 5C2XA 3CTLA 1GVOA 2AQWA 3N2XA 5I3JA 1L6YA 1WV2A 4J9JA 3CIXA 3KHJA 4QSHA 3G8RA 3A5VA 2ISSA 3W2JA 2GQAA 2PRMA 3MWAA 1YDVA 2FQIA 4O0ZA 3CLMA 3NL5A 1N8FA 2PRLA 3C52A 3VE7A 1DBTA 3LCHA 4LUIA 4MZYA 3I68A 1X6UA 4JTHA 3HPXA 1VH7A 2ZYFA 4A2RA 1XBZA 4KFOA 1H61A 3NO5A 4MPQA 4ZQRA 1ZFJA 5J5DA 1KM5A 3WJZA 5LKYA 2W6RA 4PL1A 3S0CA 5HWJA 1ML1A 3QPYA 2ZCGA 3NNTA 2ISVA 3W1AA 1LROA 2RDTA 5IM51 1G6CA 5TBOA 3SECA 3MHUA 1OK6A 2A4AA 3JR2A 3PBUA 2F84A 3I7SA 4UTIA 3BVJA 4JTLA 3PC0A 1OX6A 3GDLA 2G5WA 2CWNA 1IXNA 1HO4A 3P62A 3UXDA 1GG1A 3PBYA 4MIMA 2Z6IA 1TRIA 4FB7A 4IX0A 4DF1A 2E09A 3E9AA 4HN4A 1I45A 2YYTA 3EX1A 5DBUA 1JCXA 3QJAA 4UCGA 3MI3A 1D3HA 1OG0A 4A3UA 2QCNA 4HPJA 4WZHA 3GIYA 5AB3A 5D38A 2QUVA 2YPIA 2HMCA 3NPVA 5FF2A 1VLIA 1JULA 4UNLA 2JKEA 1DKWA 2Q8LA 4JYDA 3DI1A 4O12A 3T40A 2ALDA 4LV4A 4AHPA 2J9YA 3KRSA 3NQVA 5FEZA 4X2RA 1CX9A 3LTYA 3DBPA 3W1NA 4P61A 2UV8G 3NQAA 1NEYA 3NZRA 3IIPA 1QPQA 4Y90A 1VPXA 1KV5A 4UTTA 3W7EA 1OFDA 4ZVJA 2V30A 2BXVA 3NM1A 3F1QA 1XL9A 3LV5A 5HWNA 4A21A 1DHPA 5D04C 3GDKA 4O1CA 4S2BA 1RR2A 1K8ZA 3FFSA 3LB0A 2ZRZA 1QDSA 4UMAA 1SFJA 3NAVA 2ZQ0A 3YPIA 3M5VA 4QM1A 4OBTA 3O6CA 3L68A 4NNAA 1F7BA 3HG2A 2ZTKA 3NL6A 4I7UA 4JIQA 1C9DA 3TQVA 2ISWA 1W5NA 2CU0A 1KFEA 2Z6JA 3PB0A 1KM6A 4HIBA 1GQNA 1QPNA 4PL2A 2ATSA 3HGOA 1LRTA 2DZPA 3OVQA 4K7YA 3LM7A 4AF0A 4WY0B 1GZGA 1GJPA 1LOQA 1UJPA 1EIXA 3EWXA 4K6AA 3W1UA 1SO3A 1LYXA 2Y7GA 4U28A 3W7KA 3PULA 4Z08A 4JTGA 4WJEA 1JR1A 3C8FA 1ONRA 4KWWA 3PUEA 2QF7A 2ZRVA 1TSIA 2H8XA 2WPBA 1QFEA 4Z0JA 1BWKA 2WV8A 3NL2A 5AHIA 3PUDA 1OFAA 2Z1BA 5BMXA 3EWWA 3IVUA 3NQEA 2J88A 2VEPA 3TW6A 3T55A 3WK3A 4JX5A 1SU5A 4N9CA 5A5WA 3UWQA 4PCFA 2V2HA 1L6WA 2YW4A 1R30A 3TSBA 2B7PA 4DBEA 3LI1A 3MMTA 3CPRA 4Z1DA 3W7MA 3O6DA 2FJKA 3ZFHA 2VC6A 3CQ0A 4JDBA 1F6KA 4JX4A 3SGUA 1YXCA 1DV7A 3FOKA 1W0MA 1W31A 5G4WA 1TRDA 1CI1A 1JUKA 2GVJA 1FXQA 1Q6QA 4GNJA 5AYXA 4IQLA 4NJGA 3O16A 1FCBA 3LHTA 1XDMA 3M1ZA 4YWIA 5G2IA 3GAKA 3P5YA 5DCBA 2A6LA 3EWZA 3DU0A 4HT3A 3IVTA 3RLVA 3S5YA 3WFAA 3E49A 2YCEA 4GC4A 5AHMA 2GOUA 3G0SA 4M6PA 3MP4A 2YW3A 7TIMA 1DJQA 2NV1A 3W7LA 2ZZ3A 2DZVA 2RKXA 3NQGA 5H91A 4XUGA 2ZA1A 3F4WA 3W1TA 3RK8A 1ZAHA 3LTPA 1Z44A 2YX0A 2YFNA 1W3TA 1LCOA 3TE9A 3KVKA 1ADOA 2ZZ2A 5BW6A 1H50A 2ZZ5A 2E5BA 2CLMA 3H54A 5CPMA 3EX2A 3VE9A 3PG9A 4OE7A 1W56A 4XBKA 5DBTA 3PF3A 1GOXA 3NQFA 4XKYA 1MSSA 3P81A 4MY9A 4A29A 3P74A 1Q6OA 5LGXA 1RVGA 4W9TA 1K8YA 4ICNA 4OHQA 3EX6A 2X1UA 4UTLA 3PWAA 4MUZA 3PSWA 1YTKA 1GVRA 3G1XA 3HIJA 2ZZ6A 4JS3A 1EEPA 3LCGA 2A0NA 3SZ8A 5HUPA 5DXXA 1VYPX 1H51A 3BGGA 5G4EA 1PIIA 1HUVA 4S2CA 3NXFA 3W7NA 5AHFA 3LTSA 2GPTA 3EWUA 5CSSA 2A5HA 2ZFAA 4QNWA 3VNDA 1RPXA 4JEQA 3BK0A 2F7FA 4S1FA 1F2JA 1OFEA 2VFDA 1O5KA 3W1RA 2HSAA 4LOCA 3UPBA 4MYXA 3O63A 4LS1A 4OU1A 1SO6A 2QUUA 4MYAA 5G1TA 2CZ5A 3EWBX 4E0CA 4O18A 4R33A 2HTMA 2A2IA 4Y8FA 3EX3A 4TO8A 4EVZA 1Q3NA 3GK0A 1SR9A 4ALDA 3MBDA 1YXYA 4M6QA 3CC1A 1UUOA 2Z2UA 2QCDA 2WQPA 1Z42A 1AL7A 2EAWA 3MW7A 3RU6A 3W7HA 1PHQA 1HL2A 1MXSA 2FPVA 3K30A 2B0MA 1ZAJA 2GUUA 2ABAA 2Q3OA 3TH6A 3O6YX 3B0VC 3DFQA 3OVPA 1O95A 2W79A 4HPXA 5EKYA 2ABBA 1R46A 4IMGA 2ZBTA 3W3OA 4EWND 3QH2A 3C0JA 5FI8A 2YFOA 3L67A 5FF3A 4LVBA 2LLEA 1I2RA 3TIMA 5CZSA 2BSLA 1GVFA 1H5YA 1C8VA 4WUIA 1JRBA 1OFRA 4GRSA 5KMYA 3DZ1A 5AYYA 2CFFA 3UWYA 2CZEA 3W22A 3STFA 3PSVA 2QJHA 4QQ3A 1FDJA 4IMCA 5D2VA 1JQVA 4IJBA 3TNOA 1H7OA 4ORIA 2BZNA 4NNCA 4Q4KA 5TIMA 3IGXA 2Y6ZA 4FNPA 3M5XA 1W5QA 4JTJA 2FPYA 5G5IA 1VHNA 4JYFA 5CZ0A 5LNRA 2GQ8A 4FNUA 3B04A 4MLJA 5EL1A 3NQ6A 3TR2A 2JGQA 4IXXA 1BKSA 1GTEA 4IWWA 4JTEA 5EY5A 4O13A 3STGA 2WSYA 1YDOA 3TA6A 1SO5A 3LLDA 3TJXA 5EPDA 4GUFA 3W7DA 2O7QA 2Y85A 2YDAA 3T4CA 1IGSA 2ZA3A 4AB4A 1JRCA 4X9SA 2GVGA 3DFPA 5CGQA 3WK2A 4NJIA 1KFKA 1XCFA 1YTDA 1LRNA 3BG9A 4MZ1A 2C14A 1VRDA 1OFBA 3LCIA 1XBXA 3LDVA 4UFMA 2V2DA 2ZDRA 1B4KA 1R2SA 3G22A 5D03A 1K8XA 3W1LA 3C2VA 1N7KA 1CW2A 1RZMA 2Y89A 4XBSA 1OJXA 3B0PA 3S1WA 3C61A 4IUOA 5F2GA 1HO1A 2B7QA 5F2MA 3W72A 4NQ1A 1T96A 1TB3A 1F76A 3N3MA 1QO5A 1TPVA 3MHFA 4NJHA 5T26A 5HINA 1QR7A 1PHWA 1F05A 3GNDA 4QNEA 1XM3A 1AW1A 4JTUA 5D2XA 4ZQMA 1D9EA 2I9EA 4UR7A 4QAIA 3BLFA 2OT0A 5AFDA 4BI6A 1DJNA 4ADSA 3H55A 2Q3RA 2XN1A 3BLIA 3PVFA 5HJLA 2QCEA 5CG7A 2C0AA 1H1ZA 4MFDA 2QEZA 1KTNA 5AC8A 3BG5A 1H7NA 4PTNA 4M6VA 5LNUA 4NJJA 2EGZA 4CNOA 3MHGA 5BOOA 3FEMA 1KFCA 4IMFA 3PBVA 1ZCOA 3TFXA 1H60A 4NX5A 3BW3A 4UTMA 5G1YA 1SQ7A 3TX9A 3BLEA 4L4LA 1JCLA 3DKLA 1T0OA 3LCXA 5FEXA 4HNNA 4YL2A 3QRHA 4RLIA 2VENA 2HS6A 3S42A 2VXNA 1K7XA 3JS3A 2Y7FA 3GXTA 3QMSA 1A5CA 3CM4A 3HMJG 4C1LA 3B4UA 2EHHA 3PR2A 2BTMA 2H6RA 4FIRA 3LXAA 1OFQA 2TRSA 3TDFA 2CW6A 4X22A 4FO4A 4MVAA 5C55A 4K8EA 1S5TA 1Q6LA 3UNDA 3S6DA 2NV2A 2Y62A 1SW3A 4GUJA 3B06A 2C15A 3S9YA 1TJRA 2DZSA 3U8GA 4LWWA 4AHQA 4IOTA 1VHCA 4ONVA 3W2UA 1C29A 3OA3A 1NSJA 4N6FA 2V5LA 4YLWA 3LOTA 4CQ9A 4JGDA 2TPSA 2VFIA 1AL8A 4O54A 3L0GA 3CT7A 3RNDA 2VFFA 1LBFA 3RFAA 1KFLA 4EF8A 5K3VA 4N9DA 1IIGA 1YXDA 3MYPA 3DFNA 1R2TA 3JRKA 4JDYA 4Y6GA 5BMWA 1QPRA 4PC8A 5IBXC 2J24A 4JR5A 3KVLA 2CLOA 1YLVA 1K03A 5BRBA 1W37A 3W88A 2DJLA 4LTSA 3P61A 1UASA 1W54A 3C56A 1L2UA 1XDLA 2IQTA 2NXIA 5EYWA 1X8FA 1IXQA 2E5DA 1JCYA 1TO3A 2WO5A 2Y63A 3QSTA 1JQXA 2WNZA 2G96A 2QR6A 3G0UA 3HJZA 1MEWA 4JXCA 3DFTA 4BWLA 3NQ2A 1LRQA 4O4VA 4NVTA 3W74A 2JKAA 1LM1A 3LCWA 5KINA 2X2GA 5AHNA 1Z48A 4C1KA 4UFIA 3HGRA 4HNTA 2B7NA 2QDGA 4FEZA 2OX1A 1H63A 3LV6A 5K9XA 3NQ7A 3SGZA 3TSMA 3W73A 2CLFA 4E38A 1M6JA 3GXPA 4MKNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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