5BNKA

Crystal structure of t75c mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
246
structure length
244
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGCGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 96
structure length 244
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5bnkA00
3GKFA 2CLEA 1NSJA 3QH2A 1O60A 2Y7DA 4N4QA 4UC5A 1KLZA 1KW1A 1KV8A 1DBTA 3H55A 1UUOA 4JTEA 3T7VA 1VYPX 6TIMA 4U4MA 3O16A 4FXRA 3UY8A 3G18A 1Z44A 1XKYA 3A22A 1I45A 3DU0A 3L68A 4FX6M 1K3UA 2AQWA 1G6CA 4WY0A 5HINA 4FX7A 5LNUA 2VEPA 5AYZA 4AHQA 4ZMGA 4RV8A 1LRQA 3DFTA 2G95A 3LHUA 2QJHA 2W6RA 4YLWA 3B03A 3INPA 3SY5A 5K3VA 4N4PA 3O1NA 1M6JA 3LHYA 2A7RA 3UWVA 1XBZA 3Q37A 5AN7A 2GVLA 3MP3A 2V2DA 2VFGA 4N9BA 4P61A 5GVJA 4ZQOA 3HGRA 2FDSA 3TMLA 2WNNA 2OCZA 1G7VA 1QR7A 3S0CA 1FX6A 3QEZA 3BGJA 3FS2A 4U28A 4RZ5A 1KM1A 3QMSA 4X2RA 4PA8A 3S1VA 1JUKA 3GYEA 5H91A 3EWWA 4O17A 5I3HA 3M5YA 3IIPA 4KFPA 1VR6A 4HPJA 3P62A 2ZRUA 1QNVA 4QSHA 1O5XA 1EP2A 2FPYA 4UMAA 2E5DA 4M7TA 5LNSA 1T8XA 1KM4A 3W7RA 4FF7A 3KRZA 1YPIA 3P82A 2J24A 4OU1A 4YCPA 2YYTA 2CZFA 5FF2A 3ZFHA 3O07A 4CQ8A 1TPWA 3UWUA 3OVRA 3MP4A 3FJLA 5D2TA 3G8EA 2NXHA 1OHLA 4UNKA 8TIMA 3LLDA 2NZLA 1G4SA 2H6RA 3ABQA 4AWTA 4JICA 3M7WA 2BZNA 4QIUA 1LRNA 3FYOA 2FB2A 4UR8A 5CPMA 5AB3A 1ALDA 4D2JA 3G1AA 1HG3A 4MY1A 3G3DA 1TV7A 4M5PA 3TNOA 3LRMA 4FNRA 3DGRA 4ADSA 4IOTA 1P0NA 3LI1A 4ZQPA 5KINA 2VC6A 1IIGA 1OABA 5IBXC 2BSLA 3GKAA 1W31A 3IGXA 1QMLA 4YMZA 1XCFA 4UMCA 1S5TA 3O06A 4UUIA 4WJEA 4LC6A 3B0PA 5TQLA 3NQEA 3FLUA 5E93A 4C1LA 1KFJA 2Y6ZA 4JX6A 1LOLA 3MW7A 3TE9A 3P80A 1OFPA 1SZNA 1I4NA 4YXGA 2ZQ0A 3PB2A 2QCHA 2E68A 1TB3A 1FDJA 1Z48A 3BK0A 3MBDA 4O50A 3GDKA 4LW7A 1O5KA 3UXAA 3UNDA 1F73A 3STEA 2CZEA 3DH7A 2P1FA 3C56A 3TJXA 3P60A 3W7JA 3ATYA 3G1SA 3A9IA 3NZ1A 2CFFA 2QKFA 2WSQA 1QOPA 1TJRA 2E6DA 4JY8A 4UFJA 2QJGA 3O15A 2DZPA 2QDGA 1KFEA 5FF4A 3KOFA 3UZJA 2ZZ3A 5D2WA 3GXTA 3TIMA 2NX3A 1X1OA 3W74A 1F7BA 5T26A 4PC8A 2EAWA 2ZZ2A 1I2RA 1GWJA 3SSJA 2WO5A 3NM1A 1R30A 1ZAJA 3SIZA 2FQIA 1FDZA 2W79A 3C4UA 4Z1BA 3PBYA 4G1KA 3N73A 5G2HA 5CSRA 5HNRA 2YGYA 3M6YA 4O19A 1OX4B 3NQAA 4O18A 4N2YA 4UFIA 4TO8A 2QUVA 1LROA 3GXNA 2GQ9A 2R91A 5DELA 1A53A 2VOMA 3AO0A 3L9CA 3CIWA 3IIZA 2NWSA 1OX5A 3BO9A 4JTJA 4N6EA 1SQ7A 4Q32A 3IGSA 4X9SA 3NQ7A 5SWUA 1VCGA 5LGXA 1LLZA 4NXKA 1ZJIA 4JDYA 1C8VA 1KM5A 4ADUA 1SU5A 5LNVA 4ML9A 1QCWA 1MEIA 1TJPA 5C6MA 2Z0IA 3P81A 3WJSA 3B0VC 4OHQA 4Z0JA 1DJQA 2EPHA 4HNVA 1RR2A 5EY5A 3QW3A 3V1PA 4WX2A 1EA0A 4TIMA 5F1VA 1F6PA 3UWYA 1R2SA 5FF0A 5I3IA 2ZZ5A 3W7CA 1DHPA 3C2EA 3M0ZA 1TCDA 2C1HA 3GAKA 3UD6A 1QPOA 3VCRA 4UTMA 1ICQA 3R12A 3LCWA 1W37A 4DPPA 1OJXA 2CZDA 5C5YA 3TW7A 3DFOA 1LBMA 1TQXA 4RKAA 3LLFA 3CWNA 3EXTA 4IMCA 4KWVA 3TQKA 2CLFA 2H90A 3TXVA 3NA8A 2WNZA 4O53A 1CX9A 2A5HA 3DFNA 2YCEA 1XFBA 4JTIA 4LTSA 5DY3A 3F4NA 1TPVA 1H63A 4AHOA 3W75A 3FJ6A 1C9DA 3HF3A 3HG3A 3W76A 3R5EA 1ZAHA 3W7DA 1O94A 2X1UA 6ALDA 4RXFA 1HL2A 2YW4A 1CW2A 4EF8A 2O7QA 3TQVA 4UTUA 3HG2A 2A4AA 1UB3A 1AW2A 4JN6A 2Q3RA 5D02A 1VQTA 3EKZA 3TDFA 1SZFA 1W56A 4ZQCA 1H7XA 1O4UA 3M5VA 1B4EA 4WUIA 3S5YA 3JRKA 3EEGA 5DY2A 1SO4A 1LZOA 1Q6RA 1YADA 3MHFA 3Q2DA 3U2OA 3LV5A 2V2HA 2TMDA 4RR4A 3EX6A 2QJIA 4FHAA 1VCVA 2BTMA 3EWBX 2GVGA 1H1YA 4MY8A 2ZRVA 3EWUA 1LDCA 4Z1DA 1LLWA 1D9EA 1IIHA 1XDLA 3IIXA 4AAJA 4OQVA 2NUXA 4JTHA 3DI1A 3EWYA 4DF2A 4NX0A 3EX3A 4EOUA 4FX8A 4DF0A 5D32A 1N7KA 1THFD 2WJZA 5HWMA 3ZR4A 3MHUA 5DCBA 4Q33A 1XUUA 4CCCA 1FQ0A 1W5QA 3UYCA 3GX9A 5J5RA 1D3GA 4HKPA 2G97A 5EBUA 3E0IA 1MEHA 3TKFA 3JR2A 2GUUA 3FFSA 1PHQA 3GZ3A 5HUPA 2BX7A 3W2UA 3UPWA 1P5BA 1EUAA 2Q8ZA 2ZRYA 4O1AA 1QDSA 4I7UA 2GQAA 4E38A 3QMRA 3L21A 4OE7A 4UNLA 3N9SA 4GUIA 3SW6A 3NQFA 4M6VA 3A23A 1OYBA 1VH7A 5D03A 3QQ1A 1SW3A 3QSRA 4WXYA 1EP1A 4ADTA 2BXVA 3PAJA 1YTKA 4XKYA 2V0TA 3EX1A 5C55A 3M16A 3TUUA 1S5VA 1ZCOA 1OYCA 1QAPA 3LOTA 5LNRA 1I2NA 3W86A 2C15A 1K8XA 3RNDA 5LKYA 3WJZA 3B4UA 3W1AA 3BG9A 1FWSA 2VKZG 4R7JA 1H62A 3P74A 2JBMA 2XN2A 1LORA 2EHHA 4LS2A 4MOZA 2TSYA 4M7SA 1I2PA 4I7WA 3LDVA 4HN4A 3B06A 2RDUA 3Q94A 5BMXA 2FFCA 4N02A 5G5IA 1LCOA 4O54A 1P4CA 4XTDA 4OV9A 3S5ZA 2E77A 1VRDA 1VHCA 1VGAA 4LC8A 5D2XA 1G4PA 3HOJA 1TV8A 2OT0A 4Y96A 1IGSA 5IM51 2BWGA 2XN1A 3EX2A 2C6QA 2Z6IA 3LV6A 4MLJA 4XTIA 1F5ZA 1BEUA 2NUYA 2DZUA 3O8AA 1H7NA 3W7LA 3CEUA 1NF7A 4RX0A 5F2LA 1QWGA 2C0AA 1SFJA 2PRLA 3AJXA 1JULA 3GR7A 2YW3A 5FEWA 1T0OA 3QZEA 1F6KA 4DPQA 5G4EA 1VZWA 2BLEA 2CLIA 3CLMA 4N9EA 4AXKA 3C2RA 1PVNA 3KVJA 2YZRA 4UFLA 3N34A 2H8ZA 2ZA2A 3RF9A 2I1OA 2FPTA 2E1DA 1F05A 3KHJA 1GPWA 3C2OA 3G1FA 5AOUA 5L9FA 4LY8A 3G8RA 2JKAA 3YPIA 5LHEA 2WKJA 4NU7A 3TW6A 3THQA 4HSNA 3FKKA 5DXYA 3L0KA 3B8DA 3E12A 1MO0A 3E49A 2Y7EA 3NQ6A 2Z2UA 4MYXA 3CTLA 5FEXA 2AAMA 5AC7A 1LOSA 4S1FA 5HJLA 1R2TA 2H3BA 4JTGA 4CNNA 3GIYA 1JRCA 1RV8A 5LHFA 2ISSA 3RLVA 3RK8A 3F03K 1OFDA 4TX9A 1FUYA 2QCMA 3L5LA 5G1YA 4A2RA 4JIPA 1AMKA 1W3NA 5FI8A 1TYGA 1FXQA 2C13A 1XC4A 4UMBA 3NVTA 3ZS4A 1XBYA 5D05A 4FNUA 5K9CA 3CIXA 1PE1A 3W73A 3MYOA 3OBKA 1GTHA 4XBKA 5DBTA 3W1TA 2B7OA 1OF8A 1FWRA 3KVLA 1SSGA 4CQ9A 3PM6A 2FB3A 4X22A 2QEZA 3ATZA 4YL2A 3D0CA 3W7NA 4UTLA 1XBVA 3BLFA 1JR1A 1QPQA 1OYAA 3W23A 1EEPA 3FEMA 4LUJA 3PS7A 2VFEA 3IVUA 3OA3A 1TPH1 1KV5A 4WOQA 3STGA 3DI0A 1VLWA 1I2OA 1SR9A 3M43A 1HUVA 2XFWA 1WQ5A 4JS3A 4O12A 3SGUA 4GFSA 1ZY9A 1A5AA 1X6UA 3H53A 4MZ8A 5AHEA 1KLYA 3CWOX 4PODA 1KM0A 1JQVA 1KTNA 1SO3A 5KITA 5F4WA 4XQ6A 4MPQA 1VS1A 2GQ8A 1BWKA 1GYNA 1Q6OA 3LCGA 3TA6A 4A3UA 3NPWA 4JNMA 1GJPA 2J9XA 2C16A 3W22A 3IIVA 5CZJA 3PF3A 4NJHA 1SFLA 3O05A 3PY2A 3N2XA 2QCEA 2LLEA 4DELA 1WOAA 3OHIA 3QQ0A 2ALDA 1JUEA 1YDVA 3EX4A 2J27A 2X1TA 3WK1A 4MZYA 4O8RA 4Q4KA 1Q6LA 2V30A 2YFOA 2ZRWA 1BKSA 3NG3A 2GVJA 2QAFA 2G96A 2J9ZA 4LOCA 2QR6A 1EPXA 4PL2A 4NJGA 2DZWA 1X7FA 3NGJA 2E09A 1SUXA 4IUOA 3UQNA 3DZ1A 5TBOA 4HNUA 1L6YA 1GVQA 1JRBA 3N14A 4GC4A 1L2UA 2ZTJA 4IMFA 4JGDA 5D30A 2V2CA 3MP5A 2ABAA 4DXVA 1ONRA 4Y6GA 3GDRA 2YX0A 2CLLA 1HFBA 1X8FA 5E1QA 4RXGA 4ONVA 3G0XA 3BVJA 1JVNA 3DHDA 5HR6A 4GXMA 3QFEA 1QPNA 1AL7A 3LTPA 2PURA 3NQ8A 1LM1A 1PCWA 2A21A 5DN1A 3G3MA 1H51A 1RQEA 3B05A 4JIQA 3HJZA 3PSWA 3BW4A 2ZDRA 1H50A 3R2GA 1MZHA 3F1QA 4H4IA 3DFQA 4AH7A 5D37A 4DEFA 1MEWA 1NEYA 2NV2A 5CG7A 3QPYA 4UR7A 4O0ZA 1VC4A 4GUGA 3IV3A 1SW7A 4HSOA 4LWWA 4NJIA 3TK7A 2E6AA 1OG0A 1YDOA 3A24A 1J4EA 1WBHA 2AGKA 4WD0A 3IIOA 3MI3A 3W7KA 4JTTA 1KTBA 2ZZ7A 2NXIA 4JTKA 3OIXA 4IJBA 3QRHA 5KZDA 4O28A 3UXDA 4E2BA 5C2XA 2FPVA 3W70A 1ZNNA 1KM3A 4C1KA 4P2VA 3U8GA 4LS0A 3PBVA 2CLHA 1CI1A 4MJZA 3TSMA 4PEKA 4MUZA 4QQ3A 1T99A 2NX1A 4IPJA 3M1ZA 4BWLC 2QF7A 3W2NA 3I7RA 5D2VA 3GAYA 3W85A 3WK0A 1K7FA 1NVMA 2FTPA 1Q3NA 1ZENA 5HMSA 3QM3A 1J5TA 1L6WA 2XN0A 4Y8FA 4IQLA 3HGSA 5CPOA 2C19A 4JTSA 1DJNA 1UUMA 5AHNA 3T40A 3NQVA 5G2WA 1E51A 2I14A 3LHTA 3DAQA 2Y62A 4OWGA 2CLKA 5EYWA 3G0SA 4HIBA 3E02A 2WSRA 3RFAA 2R94A 2C3ZA 5AHIA 5J5DA 1WOBA 1OX6A 3W7IA 4FO4A 2KZHA 3W1QA 4X3ZA 2RFGA 2V82A 3SJ3A 4XKYB 4JY9A 1IXPA 3HIJA 2WQPA 1AW5A 3MJYA 5AHFA 3W7PA 4GE8A 3M41A 3T4CA 2X16A 1FDYA 4EF9A 3TV8A 2Y63A 2Y7GA 5EKYA 3IVTA 4UXDA 3BW3A 5MHBA 1SZEA 3CC1A 3KX6A 4RCXA 1NAL1 2NX9A 1ICPA 1B57A 4QITA 1UASA 1XXXA 4UTTA 3L2IA 3NNTA 3PG9A 2B4GA 5LSMA 1PCKA 3LERA 2G5WA 5D04C 4PFMA 1SW0A 3WJYA 4R33A 3CT7A 3GNDA 4CNOA 4QNWA 3QPZA 4K36A 4L4MA 4PH6A 4RZ4A 4OBTA 3MWAA 2DU2A 1SZGA 2OZ0A 4IXHA 4CNPA 1N8FA 4CQAA 3TFXA 3TH6A 3S5OA 2B7PA 3LHZA 4MLRA 4UTIA 1YXYA 1W3IA 2YPIA 4LT9A 3LBMA 3VI2A 4IMDA 4WZHA 4MYAA 5H2ZA 3KVKA 1G4EA 2JGYA 1YXCA 4NVTA 1XM3A 1KFCA 3PWAA 1YTDA 1N55A 2NLIA 1G7UA 3QYQA 3V75A 3LX9A 4QAIA 2ZFAA 3G0UA 2TPSA 1B4KA 4Z08A 2YR1A 4UTHA 3DXIA 4ZL1A 2DP3A 3BG3A 2WNQA 1OF6A 4YCOA 3P84A 3SFKA 1ML1A 1OK6A 4IXXA 3TROA 3P8IA 2DORA 3TSDA 4K7VA 4DQWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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