5CPLA

The crystal structure of xenobiotic reductase a (xena) from pseudomonas putida in complex with a nicotinamide mimic (mnh2)
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
359
structure length
359
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGLINDWHQVHYASMARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIGADDARGWETIAPSAIAFGAHLPNVPRAMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPETNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Better than Nature: Nicotinamide Biomimetics That Outperform Natural Coenzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xenobiotic reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
total genus 130
structure length 359
sequence length 359
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5cplA00
5LGZA 4C1KA 3G1HA 5CPOA 2DJXA 3PUOA 1TPB1 2VC6A 4OV9A 3HB9A 2ZA3A 3C61A 2Z6JA 4HNNA 2X16A 3CU2A 1AMKA 3PG9A 3W22A 3LRKA 4LS0A 3W1AA 3O6YX 2YFOA 2A7RA 4FEZA 2E6YA 4AWUA 4QNEA 4WXYA 4MKNA 3ZFHA 3SR7A 1J2WA 4HSOA 3R89A 1L6YA 1K8XA 3G22A 3TFXA 2VENA 1VLWA 5I3GA 2RKXA 2DU2A 3MI3A 4LU0A 4AHPA 3C3NA 3HG5A 3NL6A 1MEWA 2ISSA 3TE9A 1XFBA 1O60A 2BZNA 1Q6LA 3PBWA 4LV4A 3MHFA 4WX2A 4JYFA 2VELA 1OABA 4ZQPA 3O6DA 1OX6A 1TRDA 1TREA 3IRDA 1LCOA 4OHQA 1IXPA 1X1ZA 3W74A 3QRHA 4P61A 5AHLA 1ADOA 3G1XA 4E0CA 4D2JA 1EWDA 2V5LA 3E96A 4IX2A 2HSAA 3G0XA 2ZZ6A 1P1XA 1SW0A 1I2RA 3DU0A 1LLZA 3DFNA 1OX5A 4K8EA 4TX9A 3A24A 4H6KA 1WX0A 3R2GA 5KZDA 3MWAA 3S1XA 4RK8A 3GNDA 3B03A 4Y6GA 3DXIA 3BPWA 3TMQA 3LV5A 1LRQA 4HT3A 2YCEA 3L65A 1FWWA 3M0ZA 3KAOA 4DPPA 1FWNA 1GJPA 3MP4A 3W75A 2XN0A 3FLUA 3C52A 3UWUA 1FCQA 2ISWA 2A4AA 4GUHA 3CWNA 1KM5A 4AHOA 2NWRA 3L66A 3MP3A 3G1AA 3L5MA 2V2DA 3GDKA 5CPLA 4H4IA 4XKYB 4DBEA 1Z41A 2DZSA 1V7YA 3E9AA 1F05A 2FPVA 2J6XA 1KM4A 3E49A 4FB7A 3FIGA 3CT7A 1M5WA 1HG3A 1MXSA 4O53A 4ZQOA 4K7VA 3QFEA 3K30A 3BG9A 3EWZA 2C6QA 4FNRA 2YYUA 1HO1A 1AW1A 3STCA 4RXFA 5FF3A 1HTIA 4FX8A 3UNDA 4JEQA 3CIXA 1FXQA 1TB3A 4YWIA 3STFA 3WK0A 1ZAJA 4UTTC 2OMAA 4WZHA 3QQ0A 2ZZ2A 4ZQNA 1GYNA 3SECA 2RH9A 4ADSA 2YZRA 4IUOA 3W7JA 2TSYA 4GE8A 1G7UA 1KA9F 3PY2A 2O7QA 1QPOA 2QAFA 1GWJA 2HMCA 5KSWA 2KZHA 4UCGA 4NJIA 1T96A 1UBSA 1JCMP 2DZPA 1ZENA 2RDWA 4N6EA 1KTBA 2QCFA 4UC5A 1JCJA 3W83A 5LHEA 2WJZA 4ONVA 3M7WA 2CU0A 3W7PA 1H7XA 1C9DA 3DHDA 4YL2A 1FCBA 3HMJG 1T8XA 3B0UX 1FUYA 4O28A 3TV8A 4DO5A 3GYEA 4E38A 1WXJA 1YTKA 3FJ6A 1MEHA 4LNYA 3G1DA 3S5YA 1JRCA 2QKFA 3BGGA 2P10A 4MZYA 4BF9A 4X9SA 1GTEA 4UFLA 5C6MA 3VFLA 5CSRA 2X1TA 3TDFA 1KFJA 4QAIA 5FEZA 3FFSA 1H50A 3TA6A 3S9YA 3NDOA 2UV8G 4XBSA 3L21A 3EXRA 3MW7A 3NO5A 2GPTA 1OFQA 3FKKA 3S6DA 3HF3A 4UMCA 5DY2A 2ZZ1A 2ZTKA 3W84A 3CTLA 4PCFA 1M6JA 3QPZA 4JNMA 5FESA 1U5JA 1OHLA 3KX6A 3R5EA 3W73A 4N02A 3NQEA 1RV8A 4XTDA 1W8SA 2NV2A 2AGKA 4TR9A 4ORIA 2XN1A 1NF7A 3ATYA 3H53A 1BEUA 4UR8A 4O54A 3GR8A 5K7JA 1QR7A 3C4UA 3LHYA 5KTLA 1UCWA 4X2RA 5EKYA 4AMAA 4ADTA 1DORA 5EYWA 2QUTA 4MY1A 1DJQA 4M7TA 3WJSA 3LTSA 3NQ2A 2ZRWA 2Z1BA 1EP1A 2E68A 4Z0SA 3T55A 3RLVA 2J27A 5DCEA 4M6VA 5TIMA 1W1ZA 3PSWA 1CX9A 5HULA 2J9ZA 3I7RA 1JULA 3EWXA 4K36A 2V30A 1C8VA 1W5OA 3GB6A 3FOKA 1TPDA 4X3ZA 4JTIA 2QCNA 4CQ9A 1OFDA 2X30A 2YPIA 1F5ZA 5DBUA 3P7YA 3LM7A 3RNDA 5CGQA 3UY7A 2NX3A 5G5IA 3L2IA 3HGRA 4NNBA 2P1FA 2ZQ0A 4I7VA 4JDYA 1PCKA 2ZRYA 4RX0A 4UTTA 3LOTA 1YLVA 3CPRA 1OF6A 1SFLA 3NQ6A 3P82A 1SZNA 4ORMA 4AVFA 1W5PA 4IX0A 3O6CA 4I7UA 3CEPA 2QJHA 3LBCA 2H8XA 5DXXA 5DELA 1RQHA 1AL8A 3CLMA 3MI6A 1M7PA 2A21A 3MBDA 1G4PA 3PB2A 1BWLA 1F73A 3P8IA 1E51A 4HKPA 2DORA 1N7KA 5KITA 3GK0A 3QW4B 5FF7A 1TV5A 4JY8A 5F4WA 3UZJA 2NLIA 1YXCA 2YW4A 2VFDA 2YXGA 1AK5A 2Q8ZA 5CZTA 3RF9A 4GNJA 1A5SA 3W1PA 3HGOA 1IGSA 1LOQA 3N2XA 1EWEA 1TJRA 5FEXA 3S5ZA 4O52A 1ZHAA 1DHPA 3GAKA 3W7OA 3MHUA 1TPUA 4O19A 3QYQA 5FEPA 3I68A 3RK8A 3W7QA 3R13A 1TQJA 4A29A 2H3DA 3W1UA 4NZFA 3P61A 3T78A 5EA9A 2QUVA 2Y7EA 2TMDA 4JIQA 2A2IA 3UWWA 3W7CA 3LLFA 4AF0B 5FEWA 3TFCA 3HG4A 2CLFA 1F74A 1KLYA 3FKRA 3WK1A 3PC0A 3NNTA 3E12A 1Q6QA 3A9IA 1TMHA 4MLJA 1JCXA 5F1UA 1KFKA 4FO4A 3UZ5A 2QEZA 4UTWA 4AWTA 2WNZA 2Y62A 3LBMA 1FBAA 3A21A 1VCVA 2R94A 3UXAA 3I7SA 2E5CA 1BKSA 4FNQA 3TNOA 3UQNA 1J5TA 3LCLA 5CPMA 5I3KA 3NVTA 4NNCA 2YDAA 3TQVA 1OJXA 1KTCA 4BI5A 4EF9A 5MHBA 1LRNA 1L6WA 5DBTA 3A5FA 4CNOA 1WQ5A 6ALDA 4OGZA 2QCEA 1ML1A 5G1YA 3M1ZA 2ZRVA 3LCGA 1VC4A 4UTJA 3Q58A 1OX4A 4K39A 2I1OA 3ZWTA 4O18A 3UD6A 4TMBA 5C55A 1OYBA 3G1VA 5BW6A 4MY8A 2B0MA 2CZFA 3DFOA 3TSBA 1AL7A 1M7OA 4K37A 4O0KA 1XC4A 3VKJA 1Q3NA 1EP2A 4ML9A 3W1TA 2Y63A 3UYCA 2C15A 3FA5A 1FWSA 1SO6A 2NXHA 1QO2A 4B5NA 3W7KA 3KVLA 4DF0A 4UXDA 3M5XA 1IXOA 1GVFA 3LHZA 3FS2A 2CW6A 3W7LA 3G8EA 4HIBA 4OV4A 4UNKA 5CZ0A 5AC8A 5HWJA 3EXTA 5AC6A 1DBTA 2FJKA 5HNRA 2EGZA 1TPFA 4Y9AA 4JR5A 1XBXA 1A5CA 4R34A 5AYXA 1LM1A 1WDWA 5G2HA 1EIXA 4JD4A 5AHEA 3S5OA 3ZS4A 4LC6A 4M6PA 2E6DA 2NX1A 2FFCA 2RDUA 3W9ZA 2BX7A 1ZAHA 2B7OA 4WY0B 2CFFA 1Z48A 3IGUA 4ZQRA 1F6PA 2JKPA 3PG8A 4IGHA 4EVZA 2ZYFA 2NV1A 3MHGA 1JCNA 1SSDA 3WK2A 2AQWA 1XXXA 1QDSA 4OQVA 1TTQA 5D03A 3E0IA 3QC3A 1G7VA 1VYPX 5IM51 3Q94A 3KRSA 2XFWA 3PBYA 5IBXA 3LHTA 1H1ZA 4BR1A 3KRUA 2QR6A 4LVGA 2Y6ZA 2YR1A 2Q8LA 2HS8A 1OFOA 1XI3A 2C3ZA 4FNTA 3BLFA 3OG3A 1WYIA 3SZ8A 1I2PA 1I8JA 4YCOA 3C2FA 3AJXA 3G3MA 1QAPA 3L5LA 4MZ8A 2VEMA 3A22A 1EPXA 1P4CA 2NXIA 1OFAA 2H8ZA 3KXQA 3GZ3A 3GKAA 3PS7A 4QITA 3W88A 3UWVA 4M5PA 5EBUA 3KOFA 2ZFAA 4Y90A 2CLMA 1XBZA 3F03K 3HJZA 4KFOA 1R2RA 3MP5A 2YFNA 3IIXA 3M47A 3SJ3A 5LNSA 5D2TA 2CLIA 3O15A 3DENA 4FF7A 1TPH1 3NPXA 4BFAA 5TBOA 4ZMGA 3NA8A 4FNPA 3UPWA 3IEBA 1XM3A 3E02A 3TU9A 1H61A 2ZBTA 2PCQA 2DZXA 4XTIA 3W7EA 4JTLA 4JX4A 3WJXA 2Z0IA 4JXCA 1P5BA 1PE1A 2G95A 4S2CA 1UB3A 4IPIA 3L67A 4A21A 4DO4A 2ISVA 3TROA 3W76A 1W31A 4JX5A 4JICA 3TR2A 1NFBA 4N9EA 3G24A 1DL3A 1XKYA 2LLEA 1P0NA 3M41A 2A85A 2DZVA 3NQCA 3S1WA 3W07A 4NZJA 2DP3A 4JTUA 1A5AA 2ATMA 4LW7A 4JTHA 2R91A 3KVJA 4BK9A 1FCVA 2V2CA 4Z1BA 3TX9A 4HSNA 1QPQA 1QFEA 1I45A 2NXGA 3LERA 4MZ1A 1YPIA 4Z1CA 2C14A 2Y88A 3GXPA 4FNSA 3NAVA 2E6FA 4E2DA 1TYGA 1TTJA 3IVUA 1V5XA 4S1FA 3CQ0A 3W70A 2CZEA 3V75A 3NPWA 4RXGA 5G4EA 2C19A 2VFGA 2A7PA 4FNUA 3H54A 4CCEA 3W2LA 3PVFA 1D9EA 1H1YA 1IXNA 4QM1A 4N9BA 5F2IA 1PS9A 3TXVA 1K03A 2QAPA 3A5VA 3O07A 1QOPA 3IGXA 4NX0A 3P74A 4PTNA 4RZ4A 2WO5A 4JTEA 4PH6A 1UUMA 4M19A 1L2UA 7TIMA 1JCLA 1ME9A 2YYTA 1VZWA 1ZALA 4DO6A 3QSRA 3O06A 4YMZA 3OIXA 1FY6A 1QNVA 1TTIA 3THAA 3U8GA 4LWWA 8TIMA 4ZZ9A 3S5NA 4O12A 3TMLA 1MSSA 3TSMA 4PL2A 2WSYA 5KMYA 3STGA 3LCXA 5G2IA 2NX9A 4HPXA 4HPJA 3GXTA 4UTHA 4NX5A 1TV8A 4Y8FA 1KM6A 4A2SA 4A3UA 2WNNA 1GEQA 1JUEA 3DZ1A 2V2HA 1WV2A 2B7PA 3NR0A 5K2ZA 3WK3A 4BI7A 3NG3A 4IMDA 3HGJA 3LXAA 4LRTA 4DBDA 1RPXA 1VR6A 2FB3A 1TSIA 3PR2A 3W7RA 4LC8A 4LY8A 1H51A 3EX2A 3EB2A 3LHWA 3I7QA 4POCA 1ZAIA 4UR7A 1LOSA 1NVMA 2VFFA 3WJYA 1YDOA 3TCEA 1O5KA 3NOEA 1ZY9A 1KFBA 2QCDA 2GJLA 2ZRXA 3BW3A 4O17A 5CZJA 3QM3A 3LCFA 1JCYA 3DFTA 4MJMA 1YADA 4XUGA 4O57A 3LLDA 5FF4A 4NU7A 3IIOA 3L0NA 3LTYA 1VQTA 1ICPA 1EUNA 2NWSA 5FI8A 3S42A 1GG1A 3IIPA 3LXBA 3Q37A 2GQ8A 2OT0A 2VEIA 1TPC1 1GOXA 4MLRA 5K3VA 3UWYA 5FF2A 3ATZA 2Y61A 2Y70A 2WNQA 2Q3RA 2AAMA 3F4NA 5D30A 3GX9A 2FDSA 4JTFA 1VLIA 3LB0A 3CEUA 5DCBA 2RDTA 5EPDA 3W2JA 3W1QA 2Y7FA 1WAUA 3N19B 4IMFA 5LKYA 4EOUA 5D04C 3W2MA 4IOTA 2QJIA 4UTWC 2JKAA 5J5DA 3ANYA 1VHCA 1R2SA 1LBLA 1FDJA 1U83A 4QJ1A 4GXMA 1R47A 1ZFJA 1O5XA 2FPTA 4LUIA 1JQXA 3W2UA 1LP6A 3SI9A 3W7DA 3HPZA 5HUPA 5F2LA 4LRSA 1H62A 1LROA 1XDMA 4HN4A 4CCCA 1YDVA 3UWQA 3B06A 3CM4A 2GJNA 4ZVJA 4DQWA 5BOOA 3RFAA 4UFKA 2A5HA 5H2ZA 3TSDA 2YGYA 3EXSA 4JYEA 4N6FA 1KM0A 1RD5A 1VGAA 3N2MA 4LS1A 2CLKA 1DQXA 3NXFA 3GR7A 3UY8A 5AHNA 2A6LA 1JR1A 1IF2A 3ELFA 1VJIA 3P5YA 5U4NA 3FEMA 2O7SA 5LSMA 2VFIA 3OA3A 4WXZA 2Y7GA 2GQAA 4UFHA 4KWWA 1K8YA 2JK2A 1JVNA 1ME7A 5BMXA 3KVKA 4RV8A 4NJGA 1N55A 3CC1A 3FYOA 3R12A 3C2EA 1GVRA 4XKYA 1XBVA 1H60A 5DY3A 5A5WA 1NF0A 1FDZA 1GTHA 3NQMA 3WJZA 2CLEA 3T7VA 3C6CA 1XDLA 4XQ6A 2Z2UA 2WV8A 1X6UA 4LVDA 3O05A 2X1RA 4NJHA 1EA0A 1SW3A 3JS3A 1PHQA 1JQVA 4RZ6A 5HUOA 3QQ1A 1I2NA 4IMGA 3TUUA 4IWWA 4MY9A 5D32A 3BW4A 3RU6A 5D2WA 1W5MA 2P0OA 4LUJA 3G0SA 4NNAA 3VE9A 4UTKA 2ATSA 2YX0A 4PA8A 1B57A 5A8GA 2NUWA 4QQ3A 3N3MA 2ABBA 5TQLA 2HS6A 2JBMA 3QH2A 1L6SA 4JYDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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