5CPMA

Xena from pseudomonas putida in complex with nadph4.
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
359
structure length
359
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGLINDWHQVHYASMARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIGADDARGWETIAPSAIAFGAHLPNVPRAMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPETNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Better than Nature: Nicotinamide Biomimetics That Outperform Natural Coenzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xenobiotic reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
total genus 133
structure length 359
sequence length 359
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5cpmA00
4KWVA 5IBXA 1CI1A 4MLRA 4PEKA 2ABBA 2PRMA 1EB3A 4OV9A 4WQ6A 1EUNA 3LHZA 1O60A 2ATSA 1H1YA 4NXSA 1F05A 3MUXA 5D03A 2VEPA 4CNOA 2EHHA 2BWGA 4RJEA 3G18A 3SY5A 4CQAA 3MO7A 2EAWA 4BR1A 3W1LA 3IEBA 4PL2A 3P67A 1B57A 2CLEA 3LTPA 2QAFA 3W1PA 5AC6A 1LBLA 1SW3A 3P62A 4UTTA 3EWZA 3MW7A 3O05A 2V81A 1U83A 3FS2A 3STCA 4YWIA 4FNUA 3DH7A 1T99A 4YMZA 3HIJA 4BI6A 1TPVA 3R12A 3INPA 1GWJA 4UIOA 2C3ZA 5BOOA 2E5CA 3O07A 1IXQA 2LLEA 3M44A 3PB2A 3G1XA 5C5YA 4WXYA 3QSTA 1FWSA 4LRTA 3P8IA 3LHWA 3IRDA 5CPMA 2E1DA 1ML1A 3NQDA 4Y9AA 5T26A 2A0NA 1OJXA 3JR2A 3EX2A 1RPXA 5CPNA 2PRHA 5E0KA 5G5IA 4C1KA 2QKFA 3ABRA 1QCWA 4KFPA 4W9TA 4CLMA 4UFIA 2ZRVA 2YR1A 3O6CA 4N2YA 4XKYB 4A2RA 4Z1BA 5MHBA 2NWSA 2Y70A 3LRKA 3MJYA 1QO2A 2E77A 2G5WA 1T8XA 4IQLA 1TCDA 4O57A 5HQEA 1ICPA 4MJZA 4TX9A 2Y61A 3UWWA 2DJLA 1VCGA 3BW4A 4N6EA 3W7KA 4O1AA 3A21A 2X1TA 4S1FA 4LOCA 1I2OA 3NQVA 1G4PA 5KZDA 3QH2A 5G2HA 3MI2A 4WOZA 1D9EA 3KRUA 3LBMA 4UFJA 1OK4A 1P5BA 2NXGA 1GQNA 4M6PA 4O0KA 1YTDA 4RR4A 4UTUA 2CZFA 4M7TA 1KBIA 1SZGA 3PG9A 4Z08A 5HWMA 2IQTA 3NL6A 1PS9A 4QSHA 3BGJA 5E1QA 3W2MA 4JY8A 2RDUA 3R5EA 2QUTA 3L67A 5D33A 2G97A 4HIBA 5A8GA 1XI3A 3BARA 3MWAA 2GVJA 3PF3A 4GC4A 4JIQA 1KFEA 4HPJA 5DN1A 1FDYA 4Z0JA 3WK0A 2HMCA 1FWWA 4CQ9A 3TJXA 4N6FA 3G1VA 4KWWA 2PRLA 1SFJA 3TMQA 4JTLA 1P0KA 5I3GA 2FTPA 3PB0A 1KLZA 3MP3A 2YSWA 2EGZA 3H54A 3W71A 4NNBA 4LVGA 4PFMA 5FEPA 1L6YA 1JCNA 3PR2A 2Z6IA 1AW5A 4JDYA 3QM3A 5EKYA 2CFFA 3I6RA 3LHYA 5D30A 3UWZA 1WV2A 4FEZA 3RMJA 3NNTA 5C54A 1UUOA 3LRMA 2VFHA 2ZRYA 2NXHA 3E02A 2PCQA 2ZCGA 1TV5A 4JTJA 2FPYA 2ZA2A 1YXYA 1O95A 3KFTA 3NDOA 1FWNA 4XKYA 5F2LA 3DFNA 1VLWA 2YFOA 2CWNA 4R33A 1UCWA 4JR5A 5LNRA 1G4SA 4IUOA 4EIVA 1UBSA 3P8JA 3I65A 5BRBA 3UY8A 5BNKA 3LB0A 1QOPA 2P0OA 1TYGA 4MZYA 3BLEA 4CNNA 2NZLA 3M1ZA 3PM6A 2J24A 4FX6M 1SU5A 3UYCA 1R30A 3M7WA 1ZFJA 4A3UA 5FF4A 3UZ5A 4S2BA 4ZMGA 3P7YA 5DBUA 2FJKA 3GAYA 3SZ8A 3W9ZA 1FQ0A 4B5NA 3A9IA 1IIGA 3EWXA 1GG0A 3S5NA 2BXVA 1EX5A 1NAL1 3CLMA 2JGYA 1F5ZA 1OYAA 4GRSA 2PE4A 3VNDA 5F1VA 2CZEA 3N19B 1R2RA 3EXSA 4QNWA 1JUEA 4L4LA 3KHJA 3DI1A 3C0JA 2ZZ2A 4FNTA 4O8RA 2QUUA 3W3OA 4ZVJA 3F4NA 1K8YA 3L66A 4M6VA 4JD4A 3AO0A 3W88A 3PBVA 4JTEA 1ZAHA 3B04A 3ZR4A 1DHPA 1TRIA 4NNAA 2H8XA 4OU1A 2GQ9A 3GR8A 4QQ3A 2E68A 2VXNA 3QW4B 1OFQA 4FHAA 4ZQPA 4RZ4A 4JEQA 3W2KA 2H8ZA 3TC6A 2Z6JA 1Q6RA 2CLMA 2W6RA 2Q8LA 3NM3A 1KTNA 4O19A 2QF7A 2YDAA 3FJLA 4LVAA 3BVJA 4ADTA 2GJLA 3DAQA 3PWAA 3BLFA 2TSYA 1YDVA 2I1OA 3RLVA 3CWOX 5FEXA 3LXCA 5AHEA 1C9DA 3W7QA 1SZNA 1YYAA 4HNUA 1HG3A 3GZ3A 2QJGA 3QPYA 1VCVA 3NPXA 3DXIA 1KV8A 1JRCA 1JCJA 3SW6A 4X22A 3SSJA 1VYSX 3TC7A 4D2JA 4M19A 4UTKA 3N2XA 4A22A 3QYQA 1K03A 1VJIA 2R94A 3C6CA 5I3JA 1ONRA 1YLVA 1C29A 4WXZA 1H50A 4E38A 4O12A 3GDMA 4MY9A 3O8AA 1W3IA 1LOSA 4TMBA 3BO9A 5G1YA 1WAUA 1XBXA 3TAKA 2C14A 3M16A 1RV8A 2TMDA 3I7QA 1OX5A 2BLEA 2NV1A 2X1SA 3GXPA 3DBPA 3GDKA 2Y63A 4N4PA 1NF7A 3S5OA 1H7PA 1OHLA 1TJPA 3HBLA 2C16A 1VR6A 3QMRA 4IPJA 1T96A 4PH6A 2YGYA 4UTLA 1L9WA 4E2DA 1G4EA 2ZDRA 1YTKA 2EKCA 2ZTKA 5CKSA 4AAJA 1JUKA 4MY8A 1EP1A 1TPH1 1M7OA 2TPSA 3FEMA 1H7NA 3G1HA 3W7GA 3FFSA 3FA5A 3UWUA 3NPUA 5AFDA 3GKFA 3HO8A 1ICQA 1PE1A 4RXFA 1TTIA 1X8FA 3IGSA 1O5KA 3W2UA 3S6DA 1LROA 4K6AA 5J5RA 2JK2A 3W1MA 1EA0A 2XFWA 4O54A 4U28A 2UV8G 1QR7A 4NU7A 3R8RA 4LVBA 3UWYA 4UTJA 4OT7A 3NZRA 3TV8A 1L2UA 2C6QA 1L6SA 1JCYA 1GOXA 1GYLA 3QQ1A 3GLCA 2RFGA 1H51A 3DENA 3PG8A 4A21A 1KFBA 3OVQA 1TPB1 5D02A 1HO1A 3C8FA 1LRNA 2X30A 3NQAA 2V2DA 2DJXA 3N9SA 4OV4A 5H91A 4O4WA 2G96A 2P10A 4I7WA 1K8XA 3LV5A 4ALDA 2QAPA 5AHIA 1MEWA 3F1QA 2WNQA 2B7QA 3W7DA 4GJ1A 1R2TA 1SW0A 2FFCA 2Y85A 1SFLA 2NX3A 1OYBA 3QQ0A 3O6DA 3PS7A 4UTWC 1FY6A 4L4MA 4FNQA 1A5CA 4OWGA 3W84A 1VGAA 2CLIA 1PCKA 3MHGA 1J4EA 2OT1A 2VELA 1MZHA 1DOSA 2VFDA 3VCRA 3G1YA 4JYEA 3BW3A 3LDVA 5KZMA 2AQWA 1NSJA 1OFOA 3OBKA 1XFBA 4O1BA 3T7VA 1TTJA 5KZEA 2OMAA 2NV2A 2VFGA 3L5AA 4IX0A 5AYZA 1WOBA 2WO5A 3P80A 3KVJA 3ATZA 4QITA 2A7PA 1M7PA 2E5BA 2WQPA 3HB9A 4OBTA 4R34A 5EY5A 3CIXA 1O94A 1A5SA 4KFOA 4N02A 1X7FA 1TRDA 2TYSA 3HOJA 1K02A 4AH7A 2DP3A 3B0VC 1V5XA 4O16A 3NQMA 4NJGA 5D2XA 2DZSA 3EXRA 1FWRA 1EP2A 4XUGA 4NX5A 3OHIA 3IIXA 1I8JA 5U4NA 3USBA 3W1QA 4NT0A 3KVLA 1UJPA 2B7NA 3L21A 3QEZA 3DHFA 3NYZA 4UTIA 3THAA 3TCEA 4NUWA 1CX9A 3NG3A 5KITA 4YXGA 3RFAA 4ORMA 3HG3A 4AHPA 5H2ZA 2V2HA 3LHTA 1H60A 5F1UA 3A23A 2X1UA 3MMTA 4NZJA 1X1ZA 3MI3A 3TK7A 1H1ZA 2ZZ6A 3W7HA 3STFA 4H4IA 1KFJA 3ZWSA 1O5XA 1K8ZA 5D2TA 2ISVA 4FXRA 3VFLA 4AWSA 4LVFA 5D32A 3JRKA 4UNLA 3ABOA 1GVOA 3LRLA 4O4VA 4UFLA 3NQ2A 1HL2A 3CT7A 1YXCA 3WK1A 1QDSA 1IIHA 3WJWA 1LLZA 2WNZA 1JCXA 1FCVA 3EB2A 3W7LA 4UFHA 3BW2A 1IXPA 1SO6A 1Q45A 3WK2A 4UR7A 3B06A 2Z0IA 1AK5A 2ZZ3A 4GNJA 5HWJA 2Y7FA 1TV7A 1ADOA 4QNEA 3C61A 3QPZA 3SIZA 3M0ZA 1NEYA 3P84A 4I7UA 1AL7A 1C8VA 4H6KA 3I7SA 1F2JA 3GK0A 5AYXA 5CGQA 4LRSA 2CLOA 1AMKA 1QPNA 1QO5A 2DORA 2NUWA 2Y7EA 1VYPX 4NJHA 5EA9A 4LTSA 5K9CA 2V82A 1B3OA 1OFRA 3W7RA 1B4EA 1LRTA 1Q6QA 3PSVA 2V0TA 1PIIA 3KRZA 3R89A 4AEOA 4JS3A 4EOUA 2GOUA 3CEUA 3W7NA 3SJ3A 3W7MA 3PVFA 3MYOA 2J88A 4K38A 4IXXA 4O1CA 2FPVA 1RQBA 3RU6A 5F2GA 2C18A 3N14A 4DEFA 3M43A 3OVRA 3HGOA 1WX0A 3FJ6A 2AGKA 4LVDA 2WSYA 3O6YX 3YPIA 4CCEA 1BKSA 3NXFA 3ABQA 4UFMA 1HO4A 5FF0A 4UTWA 3V75A 3R13A 1F6KA 2P1FA 3G0UA 1FDZA 2GVGA 2J9YA 5BMXA 3NA8A 3WJYA 3M5VA 4HN4A 3B0UX 4Q4KA 3IIPA 5E93A 1EEPA 5K9XA 1ZCOA 3LXBA 3NQEA 3S5YA 3NGJA 3P61A 4MYAA 4O52A 1DJNA 3G0SA 2E5DA 3TXVA 3PY2A 1W3NA 4G1KA 3TROA 3QF0A 4N9CA 2ZYFA 5FF3A 3EWBX 5L9FA 4UMAA 3QMTA 3W1RA 1X6UA 3LBCA 4O14A 1R2SA 5HUPA 3C2EA 4KFNA 1GYNA 4MIMA 2X2GA 3HJZA 5AC8A 4ZQMA 3TW7A 3FKKA 4BI5A 4WZHA 2ZRXA 2OT0A 4RX0A 5SWUA 1VRDA 4WY0F 3EWUA 4TU1A 2ZRUA 3C3NA 1QPRA 3E0IA 1TTPA 3SR7A 3W76A 4JTGA 2Y7DA 4O28A 1DBTA 3M5ZA 2GVLA 1FCQA 3W07A 5LNUA 3NVTA 4UUIA 5LGZA 4XTDA 4EF9A 5FF7A 2Q8ZA 3LCXA 4IWWA 4O18A 2QDHA 4DO4A 1PL9A 4UNKA 1KA9F 4FF7A 3TNOA 1DORA 3GXNA 2OJPA 4YCPA 1WDWA 3U6WA 1GVRA 2WSRA 5I3KA 3S1WA 4YCOA 1EWDA 1F6PA 3C2FA 4NQ1A 2FB2A 4NX0A 5GVJA 3DGRA 3KOFA 3G1AA 5CG7A 2VEIA 1HFBA 4XQ6A 1R47A 2J9ZA 4HHPA 1SUXA 2X1RA 1JUBA 3W2NA 4X9SA 1QPQA 3LCFA 1R46A 3TE9A 3UXAA 4RK8A 1FX6A 3W6YA 1WBHA 1GVSA 5TQLA 3LLFA 4NNCA 1VS1A 4MFDA 1SSGA 1A5AA 3Q58A 2VFFA 5HR6A 2E09A 2WPBA 1SSDA 3BG9A 1XBYA 3W7EA 1OK6A 1FDJA 2FIQA 4DO6A 5LZLA 3UZJA 3TFCA 1EPXA 2B0MA 3PULA 4QM1A 3W87A 2KZHA 3W86A 2GQAA 3MI6A 3DKJA 1LYXA 3EX6A 1QFEA 1W54A 3GAKA 1VHCA 3NEVA 4MY1A 2X16A 3H55A 4JNMA 4QISA 5LNWA 5EPDA 1G67A 1WA3A 3G1SA 2H90A 1H63A 4FNPA 4MZ8A 3FLUA 3DFSA 4JDBA 3NPWA 1G69A 3LHUA 1WXJA 1YTEA 1LRQA 1RQHA 5I3FA 5LGXA 4IOTA 1YPIA 3DKLA 1TQXA 3TJLA 1G7VA 3HG4A 3PBWA 3DFPA 3FYOA 3W2JA 1KM4A 3W7OA 3W70A 1NF0A 2VC6A 3W7IA 3G8EA 3L5LA 4IPIA 2Y89A 4JTUA 4IMCA 2GJNA 1FCUA 1H5YA 2VENA 3S5ZA 3TFXA 5G2WA 2E6DA 3HPSA 1X1OA 2YYTA 3CC1A 4UC5A 3L68A 5D09A 1I45A 1XUUA 2WOQA 3KXQA 2GUUA 3HGSA 5C55A 3ATYA 1I4NA 3G1FA 2NUXA 5KINA 1UUMA 3DHDA 4Q33A 3E9AA 4GUGA 1MO0A 2YX0A 3GYEA 5CZSA 1KW1A 2YPIA 2CLKA 3DZ1A 1XC4A 2FLIA 1VLIA 2I9EA 3LOTA 3UQNA 3P5YA 3LM7A 4GUHA 1LDCA 4BF9A 1A53A 3KRSA 3LHVA 3M41A 3GR7A 2QCGA 3Q2DA 6ALDA 3NO5A 4ZZ9A 4BWLC 3H53A 5D2VA 2YZRA 3QRHA 4BK9A 4GUIA 1FXQA 3L0KA 4NJIA 2QCFA 4DBEA 2B7OA 2FDSA 3TKFA 3NM1A 2H3DA 3P5ZA 1VH7A 1ZAIA 2B7PA 3NQGA 2A7RA 1Q3NA 2PURA 3N9RA 3ZS4A 5HJLA 2VEMA 1S5TA 2BTMA 3E96A 3GNNA 4DELA 3UWQA 1MXSA 3HG5A 4M7SA 4O50A 4ADUA 3IIOA 3M9YA 2QCNA 3BGGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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