5CPSA

Disproportionating enzyme 1 from arabidopsis - maltotriose soak
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
517
structure length
517
Chain Sequence
SVGEDFPSEYEQWLPVPDPESRRRAGVLLHPTSFRGPHGIGDLGEEAFRFIDWLHSTGCSVWQVLPLVPPDEGGSPYAGQDANCGNTLLISLDELVKDGLLIKDELPQPIDADSVNYQTANKLKSPLITKAAKRLIDGNGELKSKLLDFRNDPSISCWLEDAAYFAAIDNTLNAYSWFEWPEPLKNRHLSALEAIYESQKEFIDLFIAKQFLFQRQWQKVREYARRQGVDIMGDMPIYVGYHSADVWANKKHFLLNKKGFPLLVSGVPPDLFSETGQLWGSPLYDWKAMESDQYSWWVNRIRRAQDLYDECRIDHFRGFAGFWAVPSEAKVAMVGRWKVGPGKSLFDAISKGVGKIKIIAEDLGVITKDVVELRKSIGAPGMAVLQFAFGGGADNPHLPHNHEVNQVVYSGTHDNDTIRGWWDTLDQEEKSKAMKYLSIAGEDDISWSVIQAAFSSTAQTAIIPMQDILGLGSSARMNTPATEVGNWGWRIPSSTSFDNLETESDRLRDLLSLYGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
publication title Structural Dissection of the Maltodextrin Disproportionation Cycle of the Arabidopsis Plastidial Disproportionating Enzyme 1 (DPE1).
pubmed doi rcsb
molecule keywords 4-alpha-glucanotransferase DPE1, chloroplastic/amyloplastic
total genus 185
structure length 517
sequence length 517
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.25: 4-alpha-glucanotransferase.
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02446 Glyco_hydro_77 4-alpha-glucanotransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5cpsA01
4HP5A 3AQUA 2OYKA 3PZUA 3SCOA 3L4ZA 3FHQA 2CCRA 3NSXA 2D3NA 4QCFA 3UG5A 3PTQA 5JIWA 1JI1A 1BTCA 3IJ7A 1HKIA 4HA1A 4URIA 1V6WA 4HZ8A 3VGFA 3PHAA 1OGBA 3AXIA 3VIKA 2QMJA 3MO4A 1V0LA 2XIBA 3ECQA 4ZXOA 1LWHA 1K6AA 3CHEA 3EDFA 2V3DA 2W91A 2A3CA 5FIPA 2WZEA 2VR5A 1HL9A 1UR9A 1GONA 1JDAA 1J01A 3K8LA 2MANA 4PMVA 3VIJA 3N1AA 2HVMA 1B3YA 4YHGA 3WH6A 2VR4A 5BXPA 4R5EA 2Z1KA 4D6IA 4H7VA 1JNDA 3BAJA 4BCEA 1W9UA 4ZFMA 3PZGA 3WH5A 3QHNA 1CNVA 2DIJA 2VCCA 2J7FA 3VGBA 1HJVA 3OGSA 1CXKA 3ZSSA 1FFQA 2W92A 3VPLA 1EDTA 3WFZA 3PBGA 1M7XA 4H8UA 1J0KA 1ISYA 4AD0A 1QBAA 1EQCA 2GSJA 2D1ZA 2OSWA 1WAWA 1E4IA 3SEPA 4MAVA 3O2LA 4QAWA 1E43A 1IZKA 4TX6A 4PMQA 2VZTA 4B9ZA 1W9VA 1WDSA 4GIAA 1BFNA 4AD2A 3W82A 2W61A 2JFEX 2F2HA 4DUVA 4W87A 4AZIA 2PBGA 3U7VA 1E56A 4R27A 1XSJA 4D72A 1KB3A 2J75A 1XSIA 4DUWA 1TFVA 1SFSA 4CD5A 2J74A 1FH9A 3W4RA 2GJPA 3N11A 3WL0A 3VDHA 1B3ZA 3DECA 3ZOAA 1QI5A 3OB8A 1UD8A 1EO7A 5FD0A 5M5DA 3O6AA 3DC0A 1C7SA 1J0ZA 2F61A 5IDIA 3MMUA 1UUQA 1UD5A 2JEPA 2QPUA 2PC8A 3IK2A 1VAHA 2TAAA 3QR3A 2WKGA 1JYXA 2WBKA 4B9YA 3W81A 3SCSA 4D6HA 4TXEA 4JL2A 4AD4A 1BQCA 3OLDA 2XUCA 4W88A 1EOKA 1OCQA 3DHUA 4KMQA 2WHMA 1HKKA 1D2KA 2UY2A 2WZHA 5LA1A 4UOZA 1K9EA 1KFWA 2XFFA 2VOTA 2G41A 3NDZA 4CD7A 4W5UA 1OBAA 1XHGA 3LPPA 1HJWA 2YBTA 5CG0A 1ZBWA 1AQ0A 3EYPA 2OYLA 3POHA 4B15A 3PTKA 2BVTA 1E5NA 3W24A 1FP9A 3VD5A 1UA7A 4D6FA 1MXGA 1UG6A 4IUGA 4AEFA 4A3YA 3AIUA 1DWHM 1EHAA 1WDQA 4U3AA 1UKTA 3ZT5A 3MV11 4DWSD 1JAKA 3VDBA 1DWGM 4D6GA 3A4XA 1GOWA 4OZOA 3W0KA 1JIBA 5CPQA 5A8PA 2VC9A 3AZTA 1IT0A 2ZWZA 4S3KA 3AYRA 2YBUA 4C7FA 3BC9A 3OG2A 1C90A 2WLZA 5I3DA 2QPSA 1KCKA 1XV8A 1Y7VA 2CKSA 2XHYA 1UHVA 1DP0A 1GOIA 2ZX8A 1GNXA 2DT2A 1Q6DA 5FCZA 3CHDA 2DT0A 5A8NA 1PIGA 4PCTA 1LG2A 2WHLA 3SURA 1MW2A 3VX0A 3CIVA 2BY2A 2DSKA 3G6MA 3WDHA 3CMJA 4PMRA 1W1TA 2DQXA 2O9TA 4M29A 4JCMA 4CCCA 1AQMA 1ISXA 4MTVA 1RP9A 5BXTA 1TE1A 3J7HA 3UETA 1UWTA 2J25A 2WCAA 2VZUA 4CD6A 4Z2IA 1UYQA 1J11A 4UFKA 1EO5A 3U7BA 5JIPA 2PWHA 1WP6A 2JEQA 5HBFA 1DWIM 3SCWA 2WHJA 2W66A 4JHOA 1V02E 4LXFA 2J7GA 4HZ6A 2GDVA 4PSRA 3AS0A 1E72M 1UH4A 3THCA 5E0FA 4GO8A 3VIHA 3CUIA 4X0NA 5AC4A 4P7OA 4H8HA 2A3HA 4XZWA 4QLKA 1H4PA 1UR4A 6CGTA 4X9YA 4JFVA 1PZ2A 1OD8A 4CN4A 3K4DA 2DGAA 2J62A 5CGMA 1VFMA 5GPRA 1UQZA 1UZ1A 4QCEA 4QLLA 1ESWA 5A6LA 1E71M 2YKKA 2EEXA 2CXGA 1QHPA 5DMYA 1VF8A 2VX5A 4PN2A 2WXDM 1KXTA 4OJYA 1FFRA 2CBVA 1UH3A 1RH9A 1HJUA 3M46A 4MAZA 4EK7A 2DIEA 4W5ZA 1TA3A 2G3JA 3WY1A 2D23A 1H49A 1C93A 3CZKA 3ZSTA 4J3WA 3MS8A 2WMKA 3GXDA 1WZAA 2C7FA 2J47A 2WB5A 5E6YA 3F4VA 3N12A 4S3JA 2CHNA 3K8MA 3AIBA 4ACZA 5C70A 1TG7A 4BZYA 3BAKA 4XB3A 1G1YA 1X6LA 4UQAA 4U31A 3ARSA 5A6MA 1J0IA 4K68A 1WE5A 3GM8A 3OZOA 5FL1A 2UY3A 1E6QM 1E6ZA 1UR8A 4GQRA 5HOSA 1CDGA 2IUZA 4E8DA 2WANA 1IZJA 5EFFA 3D3AA 4RE3A 4A4AA 4JKMA 1LG1A 4RL3A 4HU0A 1US2A 4HZ7A 1J0JA 2W63A 3RCNA 1E40A 3ARUA 1SMDA 2XM2A 1GOOA 3ARXA 1FOBA 2D0FA 1G01A 4WSKA 1XH1A 2CEQA 1J0HA 2XJ7A 5CXPA 2JIWA 4PMNA 7CGTA 1Q6EA 1CXFA 3WNNA 3T0AA 2VRQA 3WN6A 3KL3A 3WBAA 7TAAA 3CUGA 1NWRA 5CQ1A 1NP2A 5HPOA 4W93A 1HJSA 3M6DA 2CNCA 3BH4A 1UWQA 2E8ZA 4W89A 3VDAA 1E3ZA 2WMHA 4MJ4A 1QHZA 1FP8A 1A47A 1CGYA 1J12A 1V3KA 3MUY1 2WW5A 4YHEA 1EQPA 1R7OA 1UKQA 5BXSA 1QI2A 4BA0A 3ZT6A 1NWUA 1JZ2A 3WUEA 3WF1A 2BXYA 3ZJ6A 4QFUA 1V6VA 3TTSA 1G94A 1ISVA 2WVUA 4UFMA 1RD6A 3WF4A 4GZIA 3F5LA 5C8BB 3BSGA 3WEZA 4P8UA 3OIHA 5AC5A 3WQWA 3AMKA 2WBGA 2VURA 3AIVA 1MW3A 2G3NA 4ATWA 3SCUA 2ZIDA 1PJ9A 4XUYA 1CXLA 3IAPA 4AY1A 1UD4A 1Q6FA 3M07A 2FDMA 1E4LA 1JYWA 2W67A 3DYOA 1NARA 1UWRA 4N0RA 5IFTA 2VVSA 4H2CA 4WF7A 4NRSA 4UFIA 1B9ZA 3ALGA 3U5UA 2JF7A 4EKJA 1FH8A 4PCSA 5CLWA 3CZJA 2OWXA 1D7FA 1U2YA 1LLOA 3MMWA 3VINA 6TAAA 3T2QA 1PX3A 3IJ8A 3B9EA 2EBNA 1QNSA 3OLGA 1QNQA 2WC3A 1E15A 3WNKA 2G3IA 1WDPA 4Z2JA 1HX0A 3RDKA 2WMIB 1GQKA 1CTNA 1RPKA 1HIZA 4IPNB 3AIRA 4HOWA 2WCGA 3K1DA 4AZ6A 2YIHA 3FNDA 1E4NA 1R86A 5D4YA 1H09A 3WKZA 1XD1A 1E0WA 4Z2HA 4AC1X 2BHYA 1KQZA 2VMFA 4JAWA 5E9AA 3L2LA 2VVNA 2A3AA 1ZL1A 3LPOA 2PWEA 3W27A 4GZEA 1E6RA 3KEHA 1LJYA 2Z1SA 4OKDA 4LYRA 3VMPA 4CCEA 1EXPA 1HN1A 1ODUA 4AXNA 1UD6A 1ZJAA 3MU7A 1B3XA 3MMDA 1OT1A 4TVUA 5CPTA 2A3BA 3S6TA 1BHGA 3PTMA 2GUYA 5EBAA 1JZ4A 3NSNA 3KWXA 3WD4A 4P7NA 1LF1A 1XGZA 1UD2A 4U3CA 2VI0A 1B3WA 4GPNA 3ZT7A 2O9OA 2DT3A 4BQ4A 1H41A 3NUKA 3T0BA 3AIWA 1CYGA 1ZBKA 3AMDA 3RJYA 2BVDA 4H41A 1W91A 3NIYA 1KBKA 4AZBA 4ZE5A 1WKYA 4P7LA 1U33A 3W28A 2WMGA 4KH2A 1TCMA 1JXKA 4KWUA 1DWJM 3E1F1 2GJXB 3BAIA 1B1YA 1QNPA 4AZ7A 4PMXA 4PTWA 4YN5A 4PMOA 4HA3A 1PPIA 3DYPA 3L4WA 3ARWA 2B31A 1WZLA 3K8KA 4F79A 3WMBA 4UOQA 3ZR5A 5A6BD 1GHRA 4Q7NA 2BY1A 5DO8A 1UH2A 1I75A 1FH7A 3FHAA 5BRQA 2VRJA 4D6CA 2WC4A 4CVWA 3TTQA 5EB8A 1X1NA 1B31A 3WIJA 2VX4A 1HXJA 3ARTA 3SUUA 4CGTA 1ITXA 1GQJA 3UESA 2WZIA 2VQTA 1L0PA 4KRTA 2VTFA 4HMEA 1K9FA 1R85A 1HVXA 1O7AA 2YOCA 2ESCA 1VJSA 3RILA 1H3GA 1BYBA 3TP4A 1W1YA 3WNPA 2C0HA 5LYRA 3PZMA 2QV4A 6A3HA 4DUXA 4DWSB 1GJWA 5CGTA 5CSYA 1M03A 4YPJA 3UG3A 4AISA 2V3FA 4XX6A 2GK1B 4P8WA 2PBOA 5DEZA 3ARRA 3ZJKA 5D8ZA 2ZXQA 3WEMA 1JG9A 1H1NA 3WNMA 3W53A 4MNKA 2ZXAA 3VM5A 3A4AA 4IM4A 3AMGA 3SCPA 5I5RA 1DTUA 4HPGA 3W37A 4AZHA 3MUZ1 3OBAA 4EAMA 4V28A 2Y2WA 2YL9A 2OWCA 1C8QA 3CBWA 1OIMA 2E40A 1B90A 2WVTA 1E4MM 2WYSA 1JGIA 3WD3A 4CU6A 5I6SA 4U2YA 4Z2KA 5CJ5A 3T08A 1GOMA 3CUJA 3VMNA 3CUFA 3EDDA 5KEZA 1A3HA 2XFRA 1JFXA 3AIEA 5I23A 2PI6A 3WDRA 3D5HA 3IAQA 2D22A 1JF6A 2W5FA 3VX1A 4WKHA 5FOOA 5JUVA 4GKLA 3AXXA 4D6JA 1GQIA 1WPCA 4V2XA 3AHYA 3VOCA 3ARYA 4IISA 1QNOA 4JKLA 3VIOA 1CENA 1CXHA 3NCOA 4L4OA 4MNMA 2V38A 1CGXA 4PRWA 5D9PA 2QMKA 1C8YA 1QOXA 1E6SM 1JF5A 1NOUA 1GVIA 2BS9A 3THDA 3SUWA 4J3TA 4FK9A 4HOZA 2FH8A 1JDDA 3MUIA 1VBRA 4CD8A 1H5VA 1V6YA 5HDRA 3DHPA 3EDKA 4JIEA 1WB0A 5BCAA 2WVSA 5CPSA 1G0CA 3VNZA 2WSKA 3WH8A 1CXEA 4ATDA 2EJ1A 2WHKA 2X2YA 2J8GA 2FH6A 2WM0A 1SMAA 1ZBCA 3MANA 2OSYA 8CGTA 1OT2A 3GH5A 3EMQA 2E4TA 4WKAA 1FA2A 1E6PA 1C91A 2J7HA 3JUGA 3VGHA 3HU7A 4P7QA 3WD0A 1AQHA 2UY5A 1W1PA 2D2OA 1IV8A 1KXHA 1V3IA 3SUSA 4ATLA 2XIIA 1EHNA 1E0VA 4TTGA 1R7AA 3SCVA 2WVVB 4PUEA 4AWEA 2D0GA 4MB4A 4U5IA 3POCA 1UWSA 5ABHA 3OGVA 3WFLA 4E2OA 4TVCA 1W9BM 1GCYA 1BF2A 2D0HA 4Q22A 3MSDA 4MPKA 4H04A 3GXIA 1CIUA 1KBBA 3CH9A 1CGUA 3WDIA 3N9KA 2YDSA 1VENA 5IXEA 3KZSA 1HL8A 1UR0A 3G6LA 5GNXA 3FW6A 3A4WA 4C7GA 1C3FA 5BYWA 3ZM8A 3T0DA 1E73M 1BLIA 2QF8A 5JBFA 1VIWA 3VILA 4J3VA 3UR7A 4U2ZA 4CUCA 8A3HA 1HF6A 4C7DA 2YJQA 1ISZA 1GVYA 3FN9A 4WK9A 3CZEA 3AISA 4MNJA 3TONA 4E4PA 4D6DA 5A95A 2YLAA 5A2BA 1XYZA 1ITCA 2WWDA 2Y8VA 1C7TA 2VZVA 3CLWA 4W86A 5E6ZA 3VNYA 3AIQA 4FLRA 4OUEA 3AMLA 4OBRA 5EFDA 1ZS2A 5M03A 2ZUTA 1JYNA 4V27A 1W9XA 1F4HA 3ZQ9A 2VJXA 2CBUA 1MXDA 1C8XA 3CHCA 2XGBA 2BY3A 2VO5A 4ZEPA 4H8VA 4NI3A 1ZJBA 2WCSA 2AOSA 3WD1A 2X1IA 1XRVA 3EBVA 1W3KA 3RO8A 4J28A 2WLYA 1JZ7A 4BQ5A 2XG9A 4F8XA 4X0VA 4GO9A 1TZ7A 4BQ3A 3QGVA 2CPUA 3CGTA 5C71A 1K9TA 4PTMA 3ZR6A 1UKPA 1JL8A 2X0YA 1TMQA 1KR1A 2AAAA 3QHMA 2OYMA 3A3HA 3CMGA 3TTYA 5DFAA 7A3HA 3BAYA 1OB0A 1GJUA 1UKOA 3CPUA 1H11A 3ZJ8A 3WF0A 2J7EA 5JBDA 2NT0A 1B2YA 3FXYA 3VMOA 4PMYA 5CLTA 3ARQA 1TVPA 4EE9A 1XYFA 3EMCA 3VM7A 5I77A 1CEOA 3UEQA 1XH0A 4DM2A 3MUAA 3WUBA 5I24A 2Y8KA 1HKMA 3AJ7A 3WQ4A 2E9LA 2VX6A 1PAMA 3UERA 5M3WA 3WSUA 4GI9A 2JIEA 4ZXLA 2J79A 4OOUA 1JYVA 5D9NA 1VB9A 2EPOA 4NRRA 1BVZA 3BAXA 1E6XM 1BG4A 3ARZA 4LQ1A 4LX4A 2XSBA 1VEPA 1UD3A 1US3A 4CU8A 2BHUA 4RE2A 1OGSA 1KCLA 2Y4SA 3VGDA 3BAWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4HP5 A;  3AQU A;  2OYK A;  3PZU A;  3SCO A;  3L4Z A;  3FHQ A;  2CCR A;  3NSX A;  2D3N A;  4QCF A;  3UG5 A;  3PTQ A;  5JIW A;  1JI1 A;  1BTC A;  3IJ7 A;  1HKI A;  4HA1 A;  4URI A;  1V6W A;  4HZ8 A;  3VGF A;  3PHA A;  1OGB A;  3AXI A;  3VIK A;  2QMJ A;  3MO4 A;  1V0L A;  2XIB A;  3ECQ A;  4ZXO A;  1LWH A;  1K6A A;  3CHE A;  3EDF A;  2V3D A;  2W91 A;  2A3C A;  5FIP A;  2WZE A;  2VR5 A;  1HL9 A;  1UR9 A;  1GON A;  1JDA A;  1J01 A;  3K8L A;  2MAN A;  4PMV A;  3VIJ A;  3N1A A;  2HVM A;  1B3Y A;  4YHG A;  3WH6 A;  2VR4 A;  5BXP A;  4R5E A;  2Z1K A;  4D6I A;  4H7V A;  1JND A;  3BAJ A;  4BCE A;  1W9U A;  4ZFM A;  3PZG A;  3WH5 A;  3QHN A;  1CNV A;  2DIJ A;  2VCC A;  2J7F A;  3VGB A;  1HJV A;  3OGS A;  1CXK A;  3ZSS A;  1FFQ A;  2W92 A;  3VPL A;  1EDT A;  3WFZ A;  3PBG A;  1M7X A;  4H8U A;  1J0K A;  1ISY A;  4AD0 A;  1QBA A;  1EQC A;  2GSJ A;  2D1Z A;  2OSW A;  1WAW A;  1E4I A;  3SEP A;  4MAV A;  3O2L A;  4QAW A;  1E43 A;  1IZK A;  4TX6 A;  4PMQ A;  2VZT A;  4B9Z A;  1W9V A;  1WDS A;  4GIA A;  1BFN A; 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