5CPSA

Disproportionating enzyme 1 from arabidopsis - maltotriose soak
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
517
structure length
517
Chain Sequence
SVGEDFPSEYEQWLPVPDPESRRRAGVLLHPTSFRGPHGIGDLGEEAFRFIDWLHSTGCSVWQVLPLVPPDEGGSPYAGQDANCGNTLLISLDELVKDGLLIKDELPQPIDADSVNYQTANKLKSPLITKAAKRLIDGNGELKSKLLDFRNDPSISCWLEDAAYFAAIDNTLNAYSWFEWPEPLKNRHLSALEAIYESQKEFIDLFIAKQFLFQRQWQKVREYARRQGVDIMGDMPIYVGYHSADVWANKKHFLLNKKGFPLLVSGVPPDLFSETGQLWGSPLYDWKAMESDQYSWWVNRIRRAQDLYDECRIDHFRGFAGFWAVPSEAKVAMVGRWKVGPGKSLFDAISKGVGKIKIIAEDLGVITKDVVELRKSIGAPGMAVLQFAFGGGADNPHLPHNHEVNQVVYSGTHDNDTIRGWWDTLDQEEKSKAMKYLSIAGEDDISWSVIQAAFSSTAQTAIIPMQDILGLGSSARMNTPATEVGNWGWRIPSSTSFDNLETESDRLRDLLSLYGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
publication title Structural Dissection of the Maltodextrin Disproportionation Cycle of the Arabidopsis Plastidial Disproportionating Enzyme 1 (DPE1).
pubmed doi rcsb
molecule keywords 4-alpha-glucanotransferase DPE1, chloroplastic/amyloplastic
total genus 185
structure length 517
sequence length 517
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.25: 4-alpha-glucanotransferase.
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02446 Glyco_hydro_77 4-alpha-glucanotransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5cpsA01
1V03A 3WUBA 3D5HA 2CHOA 2ZUSA 3ARYA 4D71A 2WPGA 3MUZ1 3N17A 1J0HA 5A6KA 1LG2A 3BAKA 5BROA 3KL3A 1PBGA 5IXEA 3GXFA 2J79A 2WVSA 3WY1A 1DWFM 4Z2JA 4DM1A 3VIIA 3VILA 4YPJA 2E0PA 4UFJA 5CGMA 4R5EA 3N18A 1LJYA 3PTQA 1UZ1A 3PTKA 2YA1A 1BPLB 1H41A 3CZGA 1KCKA 1H11A 1VF8A 1MQPA 1OD8A 1BG9A 1UD3A 2BFGA 3SUWA 5IHSA 4XZBA 2VC9A 2VMFA 3TTQA 2GFTA 3CUJA 2YBTA 2WBGA 2J7DA 4WKHA 1W9PA 5CSYA 4IUGA 5ABFA 4AD0A 4KWUA 3S6TA 1OD0A 1E4MM 2XTKA 4J27A 8CGTA 3PZQA 4PCSA 3OLIA 3CPUA 3O9NA 1XYFA 5KEZA 4S3JA 4LQ1A 5HDRA 1U33A 3ARSA 1WP6A 3CHDA 2XVKA 3W82A 1NOFA 1WDRA 2V3EA 3VIOA 3U5YA 2GJXA 5I24A 1J9YA 5HNNA 3E1F1 1TE1A 1UR2A 2CBIA 5E6YA 2ZE0A 5AC4A 3PHAA 1IZKA 2WHJA 4GZIA 1JNDA 2XG9A 1CIUA 3CUHA 4FLQA 1UD2A 1V6VA 1UZ4A 3SCTA 4E8CA 4TVCA 2OYKA 4TXEA 1HX0A 3RPMA 1OINA 3AHYA 2VX4A 3WD2A 2XPKA 4J28A 1HJUA 3ZJ6A 3OIHA 2Q8XA 4A3YA 3CMJA 3QHOA 1PZ2A 3PZNA 3WEMA 4UFMA 1S46A 5D9NA 4W5ZA 1GNXA 3FXYA 2XVNA 3TONA 1H4PA 3FHAA 1FP9A 1QHZA 1V6WA 1TUXA 4QLLA 3I3DA 4ZENA 1C8XA 3SCPA 3VIKA 1VFMA 3VD5A 2GJPA 4NRSA 3MUY1 3AI0A 1KGXA 1HKKA 2WC3A 2XWDA 1C8QA 2XIBA 3WQ6A 2J7CA 4PTMA 3BLKA 4AIEA 1WKYA 5E0CA 5ECUA 3CIVA 1E56A 2VOTA 4AZCB 4CD6A 1XD1A 1BVZA 3UR7A 2CKRA 1R85A 1G1YA 4TVDA 2OLHA 1V02A 2WMJA 2X8RA 4J3TA 1OT1A 1EQCA 3RDKA 3TA9A 1KR1A 1JZ5A 1O7AA 3VKKA 4N0RA 3W26A 3GXMA 1UR0A 2WMKA 5DT5A 3N11A 3WNPA 1CBGA 3KZSA 3N15A 1XH1A 1UYQA 2VI0A 1DWHM 3IJ8A 2BY2A 1V3IA 2VCAA 2XSBA 1E5NA 3GBEA 2DSVA 4JAWA 2E40A 1E1FA 4XZWA 1KWGA 2X05A 1HJQA 3WDPP 2XVGA 5BWFA 3WNNA 2WVVB 2G3NA 4H8HA 3WEOA 2VJXA 5E9AA 2Y5EA 1QNOA 1NOWA 4UOJA 2QPSA 3IJ7A 4AD5A 1HP5A 1CXEA 5I77A 4U33A 3AHXA 4AXNA 3VGFA 1CDGA 2IXVA 2E4TA 2E8ZA 3WD4A 2B31A 3CZEA 1HVXA 1HJWA 2VQUA 2ZX7A 4HU8A 1MW3A 1JZ4A 3SEPA 1VEOA 4JKMA 4OOZA 3T08A 5D9OA 5JBDA 3OLDA 3BAYA 3AISA 1H3GA 2XHYA 3UETA 1UKTA 2WANA 3ARQA 1NARA 1UQYA 2ZUVA 1DWGM 2XWEA 3WF3A 2DT0A 4PMYA 1CECA 3T2OA 3LPPA 3WL0A 1E4LA 3BAXA 3GYCA 1HJXA 1VEPA 2NW0A 2VZSA 3THCA 1OGBA 3WBEA 1CWYA 5A2CA 5IFTA 3L4WA 3M7SA 3ZT6A 2VRQA 2XJ7A 2WC4A 3UERA 2WWCA 1MFVA 1ODZA 1W9XA 1R7OA 2DDXA 3L4ZA 4ACYA 3CZLA 2WK2A 2EPNA 4PN2A 4CVWA 1JXJA 5CGTA 4WKAA 1J18A 3AYRA 3WH6A 3CGTA 1EDQA 4UFKA 3WDQA 2BHZA 2WNWA 4WLCA 1E43A 1NP2A 4ZXOA 3IJ9A 2PWGA 1KCLA 2WB5A 5GNYA 2WZIA 2VQTA 5LA0A 1C90A 1R87A 3OZOA 2PB1A 2JFEX 3OA5A 4PMQA 4RE3A 3GNRA 4X0VA 1HL8A 3UG4A 3KEHA 3GTNA 3VIPA 1KXTA 2BY3A 3BH4A 2VUYA 5LYRA 3TP4A 1PAMA 3SCUA 2DT2A 1C8YA 1IZJA 3EBVA 4JFWA 2OYLA 2WC7A 1XSJA 3WL1A 1MW1A 1Q6CA 3LMYA 2JF6A 1Y7VA 2CETA 3OGRA 5I2UA 2EEXA 1VFOA 2HISA 1PPIA 1QPKA 3N9KA 2YIHA 4HOWA 1UD6A 2PWEA 3ARWA 1QW8A 1UD5A 3G6LA 4C7GA 1BVNP 5AYBA 2VVSA 2W4XA 3L4UA 2VURA 4DUVA 1ZS2A 2CNCA 1WDQA 3A3HA 1JZ6A 4XUYA 1RPKA 1QI3A 3RJYA 4FLRA 4MTVA 1JZ3A 2BY1A 3K8LA 2W67A 1CGUA 1JDDA 4U2ZA 3MUAA 3RMEA 3L2LA 1E1EA 3PBGA 4TVUA 3L4VA 5CG0A 1GJWA 3PTMA 1MYRA 2GUYA 5A6SA 3OZPA 5A8QA 1MW0A 3ARXA 4UR9A 4RE4A 4M29A 1QI0A 3THDA 2YKKA 3ARUA 3ARVA 2PWDA 2WVUA 3W25A 3WQ8A 2JE8A 3SCQA 3ZMRA 1FFQA 1W3HA 3ZO9A 4D6IA 1H5VA 2CCRA 4KRTA 4OKDA 3VO0A 1B3VA 1B3WA 4AY1A 3VIGA 5CQ1A 5ABGA 2W63A 4D6HA 2O9RA 3UESA 2QMJA 4S3KA 1V3HA 4MPKA 3WIJA 3VGEA 1EIBA 2V3GA 4BQ5A 3FHQA 4AZCA 1QW9A 1ODUA 1V3JA 3AS1A 2AAAA 5CJ5A 3ALFA 3AZSA 1AMYA 2D3NA 3GXDA 3VGGA 4WKFA 5BXTA 1V6YA 4PUDA 1JAEA 2QF8A 2FDMA 1JDCA 2XFRA 2BVDA 3BLPX 4P7LA 1U30A 1X6LA 3SCRA 4W8AA 4WSKA 1ZBWA 2J7HA 3RM4A 2BVTA 5A6MA 1UH4A 1H0GA 1CGTA 2VZTA 2J25A 4EANA 2WHKA 4U2YA 3IK2A 1X1NA 2J4GA 2ZIDA 4KGLA 4PMZA 4JCMA 1CXLA 4PCTA 5M5DA 1YQ2A 3MUIA 4IPLA 4GXPA 4F9JA 3WMSA 4AZIA 3AFBA 1J0IA 4MAVA 1E3XA 4UZSA 2O92A 4IPNB 3G6MA 1ITCA 1LG1A 2J7EA 4JFVA 5AY7A 3VDBA 4OBRA 3VIFA 4IM4A 4LPCA 4AIUA 1BSIA 4JFSA 4PMDA 3RILA 1GZJA 4CGTA 2YOCA 3EYPA 2YLLA 1JZ7A 3AQUA 3WNOA 2YBUA 1CTNA 3WNLA 2BY0A 4QP0A 3WDHA 2AMGA 4CKQA 2EPKX 1KBBA 2ZUUA 1J01A 3WFLA 1E4IA 4UCFA 4H8VA 1M7XA 3FAXA 2YL8A 5I78A 4HZ6A 1UWQA 2BVYA 5M03A 1E9LA 1I75A 1WZKA 1XCWA 4BA0A 4CD8A 1V3KA 1HXJA 1C3FA 2ZXQA 4W93A 4EAMA 4UQ9A 4JL2A 2WCAA 1KR0A 2Y24A 1QNRA 4MDOA 4V28A 2WWDA 1XD0A 1IV8A 5C70A 2G4FA 1MQQA 4B16A 5F7UA 3VDCA 3PZIA 2VX5A 4KH2A 3AJ7A 4A4AA 5HXMA 4MJ2A 1QBBA 4U31A 5KZ6A 1BTCA 1J10A 3VM7A 1UWRA 5D4YA 1C91A 4PTVA 4TOQA 2WLYA 1GJUA 1XGZA 1JZ2A 1OT2A 1UWIA 3MO4A 2YDRA 2XM1A 4AZGA 1OIMA 4CU7A 1CZ1A 2VZUA 2UY3A 1HKMA 3U7VA 1XYZA 4YN5A 1VJZA 1W91A 3GH7A 1BYAA 3VIJA 2OWXA 2ZOXA 2CPUA 3NJ3A 1DWIM 4U3CA 1LQ0A 5JBEA 2UWFA 1H1NA 1UA3A 1TA3B 2C8NA 4PRWA 4D6CA 2V38A 3BAIA 4GQRA 2G41A 1HKIA 5EFDA 3SCNA 4K68A 4P8XA 3BGAA 3CZ8A 5EFFA 2DSWA 2DIJA 2IXUA 3EMCA 2YA0A 1JYWA 4HU0A 4LX4A 4LXFA 4JCLA 3NDYA 4Q7NA 1GORA 2EO7A 1US3A 1V3MA 4D6FA 3MMUA 4JZ5A 4M24A 2G3JA 4H41A 1E6XM 2V3FA 2A3CA 1A47A 2A3EA 4W85A 1F4HA 1CXFA 1G5AA 4AZHA 2FHBA 1M53A 3NUKA 4NI3A 4WF7A 4HZ8A 4AZ7A 3WMBA 1CGVA 4AZ5A 5FKYA 3VMNA 1JYXA 2DIEA 2BXZA 3WUGA 1XRVA 1UWUA 3IAPA 4LYQA 4L4OA 2VX7A 4F9DA 1CNVA 1EDTA 4P7OA 1AQ0A 4MB3A 3AXXA 2AOSA 1JFXA 1Q6EA 1GQIA 2CEQA 5I6SA 2YA2A 1B30A 3WD0A 3CHFA 3FY1A 1ITXA 4OJYA 4KGJA 1HP4A 1XCXA 1JDAA 1CLXA 4WSJA 3TTYA 3L4XA 1N82A 4UQAA 4WK9A 2PWHA 4MDPA 3LPOA 1A3HA 5CZKA 1F4AA 2YL9A 1OWQA 4PMUA 5DFAA 4KRUA 4AYSA 5DMYA 2VCCA 2ESCA 1WE5A 2WMFA 4JFTA 4H8UA 3W24A 1V0MA 3DYPA 1UR4A 2WW5A 4AEFA 3EDKA 1MXGA 5E6ZA 1HJSA 3PZMA 1QOXA 4CN1A 3LPFA 4DUXA 1JGIA 8A3HA 1JZ8A 2XM2A 1G0CA 2ZWZA 4AWEA 3ALGA 3UG5A 3HN3A 1VBRA 1QHOA 3I3BA 7CGTA 4M1RA 4PTXA 5A8NA 1RP8A 1LWHA 2A3HA 3WEZA 3WQWA 2J7FA 1WDPA 3SCOA 3WNKA 1VFFA 5EBAA 4TTGA 3VMOA 2O9OA 1NP0A 3HU7A 2PI6A 1K9FA 3W0KA 1CGWA 1XSIA 1HL9A 3I3EA 5CSUA 4QAWA 3OG2A 3K4DA 1ISYA 5JIPA 5CXPA 1RP9A 1TMQA 3J7HA 3W28A 1UKQA 2WYSA 1E55A 5A6BD 1UR1A 1JF6A 2Y8VA 2Y2WA 1W9UA 1GHRA 1FA2A 3W53A 3EDFA 2Z1SA 1GQLA 4B3KA 4NF7A 3IAQA 2FHCA 2VR5A 4P7QA 3SIMA 1W9VA 3ZSSA 4GO9A 4MB5A 5GQBA 4A3HA 2OSYA 4W84A 2W66A 1I1XA 1LL6A 4H7VA 4HPHA 4CD7A 4GQQA 5HBFA 2CYGA 1WZLA 3BAWA 3WKZA 3CUFA 3AS0A 1X6NA 4W87A 3AMGA 2OSWA 2D20A 4QCEA 4CUCA 2G8ZA 1FH7A 1QI2A 5A6BA 3LPGA 2ZXBA 4B9YA 1W2VA 1LLOA 3SCVA 2WHMA 1E6SM 2CESA 1UWTA 5D8ZA 1JNEA 3WQVA 3EDDA 3OB8A 3K46A 1D3CA 2GDVA 2XYLA 1G9HA 2YLAA 2ZX6A 5A6JA 1J0JA 4BCEA 2XSAA 1R86A 4M8UA 3SUTA 4UOZA 1W2PA 1DHKA 3WH5A 2D23A 4CVUA 3QGVA 3RJXA 1CXIA 1Q6FA 3VUPA 1M04A 3WUEA 1NWUA 3UR8A 3WQ5A 4UTFA 4NZCA 4PEEA 5A6LA 4GKLA 3WN6A 1FP8A 4U5IA 2WCGA 1TVPA 2QV4A 1ZL1A 2DPEA 1TA3A 1KQZA 1EHNA 2XFYA 1SYTA 1GONA 4RL3A 3AIWA 1V02E 2WMIB 4NRRA 3MS8A 1OGGA 4UZUA 4NSBA 3MU7A 5HOSA 4ACZB 1TCMA 2V5DA 5E09A 4ML4A 1QVBA 3VD7A 3MMDA 1UKSA 4PMRA 1BG4A 3KL0A 3DYMA 1DEDA 2XGIA 3WBAA 3OLEA 4CN4A 4D6EA 1B9ZA 4QDMA 5A95A 1FH8A 4GIAA 3VMPA 4U5KA 4UQBA 1B31A 1DWJM 1UH2A 4FK9A 1MW2A 2VZVA 5A6AA 2QLYA 3GNPA 1SMDA 3BSHA 4EE9A 3BC9A 3ZQ9A 7TAAA 4BZYA 4KMQA 4HOZA 3AZRA 5A8OA 1DWAM 5ABHA 6CGTA 2J8FA 3SURA 1BGGA 5A1AA 1NWTA 4W8LA 4JL1A 4LGXA 4UFIA 1XV8A 3OLGA 1AQMA 4FLOA 3DC0A 4CN6A 1OCQA 1HIZA 2PWFA 1UHVA 1PJ9A 1Q6DA 2UY2A 4GZJA 3VD4A 5BXSA 4MB4A 2YDSA 1BYDA 3FNDA 4J3VA 1C7TA 2EPOA 3VINA 4Z2HA 2ZXAA 5E0FA 5TD4A 3AS2A 4D6GA 1W1TA 4AD4A 4GINA 2F61A 1UKPA 4H04A 1SMAA 1CEOA 1M01A 1RD6A 3QOKA 2XIIA 1H0IA 2E9MA 4Z2KA 2PF0A 3BAJA 4WJXA 1KBKA 5A8MA 5BYWA 1WB0A 2O9TA 4Z2GA 4ZEPA 2J7BA 4Q22A 2J62A 1E0WA 3MSGA 3VIHA 1JI1A 4ZFMA 2ZWYA 1TFVA 1R8LA 2ZUTA 3CO4A 3VGHA 2ZUNA 1G01A 3WD1A 1VFUA 1KXQA 2WBKA 4HP5A 3D3AA 4LYRA 1CXKA 2WLZA 1W9DM 1WZMA 3QHNA 4FF5A 3GM8A 3AIVA 3M07A 3WH7A 3OGVA 2DQXA 3TTOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1V03 A;  3WUB A;  3D5H A;  2CHO A;  2ZUS A;  3ARY A;  4D71 A;  2WPG A;  3MUZ 1;  3N17 A;  1J0H A;  5A6K A;  1LG2 A;  3BAK A;  5BRO A;  3KL3 A;  1PBG A;  5IXE A;  3GXF A;  2J79 A;  2WVS A;  3WY1 A;  1DWF M;  4Z2J A;  4DM1 A;  3VII A;  3VIL A;  4YPJ A;  2E0P A;  4UFJ A;  5CGM A;  4R5E A;  3N18 A;  1LJY A;  3PTQ A;  1UZ1 A;  3PTK A;  2YA1 A;  1BPL B;  1H41 A;  3CZG A;  1KCK A;  1H11 A;  1VF8 A;  1MQP A;  1OD8 A;  1BG9 A;  1UD3 A;  2BFG A;  3SUW A;  5IHS A;  4XZB A;  2VC9 A;  2VMF A;  3TTQ A;  2GFT A;  3CUJ A;  2YBT A;  2WBG A;  2J7D A;  4WKH A;  1W9P A;  5CSY A;  4IUG A;  5ABF A;  4AD0 A;  4KWU A;  3S6T A;  1OD0 A;  1E4M M;  2XTK A;  4J27 A;  8CGT A;  3PZQ A;  4PCS A;  3OLI A;  3CPU A;  3O9N A;  1XYF A;  5KEZ A;  4S3J A;  4LQ1 A;  5HDR A;  1U33 A;  3ARS A;  1WP6 A;  3CHD A;  2XVK A;  3W82 A;  1NOF A;  1WDR A;  2V3E A;  3VIO A;  3U5Y A;  2GJX A;  5I24 A;  1J9Y A;  5HNN A;  3E1F 1;  1TE1 A;  1UR2 A;  2CBI A;  5E6Y A;  2ZE0 A;  5AC4 A;  3PHA A;  1IZK A;  2WHJ A;  4GZI A;  1JND A;  2XG9 A;  1CIU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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