5CPSA

Disproportionating enzyme 1 from arabidopsis - maltotriose soak
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
517
structure length
517
Chain Sequence
SVGEDFPSEYEQWLPVPDPESRRRAGVLLHPTSFRGPHGIGDLGEEAFRFIDWLHSTGCSVWQVLPLVPPDEGGSPYAGQDANCGNTLLISLDELVKDGLLIKDELPQPIDADSVNYQTANKLKSPLITKAAKRLIDGNGELKSKLLDFRNDPSISCWLEDAAYFAAIDNTLNAYSWFEWPEPLKNRHLSALEAIYESQKEFIDLFIAKQFLFQRQWQKVREYARRQGVDIMGDMPIYVGYHSADVWANKKHFLLNKKGFPLLVSGVPPDLFSETGQLWGSPLYDWKAMESDQYSWWVNRIRRAQDLYDECRIDHFRGFAGFWAVPSEAKVAMVGRWKVGPGKSLFDAISKGVGKIKIIAEDLGVITKDVVELRKSIGAPGMAVLQFAFGGGADNPHLPHNHEVNQVVYSGTHDNDTIRGWWDTLDQEEKSKAMKYLSIAGEDDISWSVIQAAFSSTAQTAIIPMQDILGLGSSARMNTPATEVGNWGWRIPSSTSFDNLETESDRLRDLLSLYGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
publication title Structural Dissection of the Maltodextrin Disproportionation Cycle of the Arabidopsis Plastidial Disproportionating Enzyme 1 (DPE1).
pubmed doi rcsb
molecule keywords 4-alpha-glucanotransferase DPE1, chloroplastic/amyloplastic
total genus 185
structure length 517
sequence length 517
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.25: 4-alpha-glucanotransferase.
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02446 Glyco_hydro_77 4-alpha-glucanotransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5cpsA01
3WDQA 4Z2IA 4WIWA 4EAMA 4CKQA 5BRQA 5CPSA 4GI6A 1PZ2A 3T2PA 3WDJA 2GUYA 4PMDA 1UR9A 3SCOA 2VCAA 1C7SA 1J11A 1PJ9A 3VNYA 2XHYA 2YBTA 1NARA 4V27A 4UFHA 1VBUA 1JZ3A 4CCDA 4E8DA 2OSXA 2ZWZA 3GTNA 4BQ3A 1QNQA 4CVWA 3AHTA 3MANA 1RH9A 1UKPA 2VTFA 1E6RA 3L4XA 1CENA 2E8ZA 2QMKA 2WBGA 3WNKA 1ISWA 5A8OA 1Y7VA 1OGGA 1KGUA 5E09A 1CDGA 3DYOA 5I79A 4AXNA 2O9TA 1QNRA 2J74A 3ALFA 3VGBA 3W81A 3L4VA 3VGGA 4MNKA 5AYBA 4BQ4A 3WQWA 1EQCA 2E40A 2EPLX 3BCFA 2J77A 3I3EA 3VMPA 1OINA 1EHNA 3EDKA 1JDDA 4MJ2A 7CGTA 4ATLA 4H7VA 4P7OA 3K1DA 1ODUA 1H41A 4PTWA 2XTKA 4C7FA 1C93A 1QW8A 5FL0A 5C8BB 3MMDA 2WVTA 2PWGA 3FHQA 1JZ7A 4JKLA 4U2ZA 2WMHA 4GKLA 3TP4A 1HJUA 1E71M 1HN1A 2JEPA 4RL3A 3NDYA 5D8WA 3BAXA 3CMJA 4UQEA 3TA9A 3OBAA 4V2XA 2ZUVA 2DT1A 4ZXLA 2ZUUA 2UY4A 4J3XA 2GDUA 1EA9C 4W85A 1C8XA 2O9RA 5D8ZA 4F9DA 4WKFA 4L4PA 4BF7A 2YDQA 4MPKA 2D2OA 3SCSA 3PN8A 4CD4A 4PMZA 4ATDA 2X0HA 1ISZA 3WNOA 1IT0A 3I3BA 1JDCA 5F7UA 1NP2A 3AROA 5DO8A 2DDXA 4OZOA 2VUYA 2W4XA 4M81A 2WWDA 5CPTA 3B8SA 5IDIA 5CQ1A 3MUZ1 3W6MA 3EDJA 4PN2A 1JAKA 1U2YA 3OLEA 3UESA 3NSNA 1V3IA 3ARRA 4MAZA 1V0KA 2ZXBA 3UETA 2J7BA 1MQQA 1QNOA 3KWXA 1GOMA 2AMGA 2YA2A 5I5RA 1R7OA 5EFFA 1KGXA 4FLSA 3MUIA 1E4LA 2EPNA 1E6SM 1W3KA 1UOKA 3VPLA 3VIPA 2YL8A 2CBIA 4Z2KA 2WCGA 4PMYA 1SR0A 4PSRA 5D9PA 1HJXA 4CD7A 5JBEA 3A6OA 3NJ3A 5JBDA 1HF6A 4NI3A 4P8WA 5AY7A 2NSXA 4AEEA 4AIUA 3AIQA 1MW1A 3MUY1 3WBAA 3FN9A 3F5JA 1JL8A 3WF1A 4Q7NA 2G4FA 2VR5A 3MMUA 1DEDA 4M29A 2DSVA 1B0IA 5FL1A 3RO8A 1D2KA 1EXPA 3BLKA 3BSGA 5GNZA 1DP0A 2YDRA 1V3JA 5IHRA 3VMNA 3VOCA 2OYKA 1E0VA 3SCRA 3K4AA 1UD5A 1BSIA 1C7TA 4MB1A 1V3MA 3BGAA 4AIEA 1E70M 1H11A 1V0NA 1KCLA 2UWFA 4P7NA 4UTFA 2WW5A 2WXDM 1MFVA 1BVNP 2GJPA 3WNMA 4N42A 1DWIM 4AZCB 4A4AA 4CD6A 2ZXAA 5DEZA 3MS8A 4D1IA 4JFSA 4HU0A 1GCYA 1GQLA 3EDFA 8A3HA 3G6MA 3E1F1 1W91A 4W8AA 2J7CA 1JF6A 4IM4A 3WUBA 1Q6CA 5A6SA 3MU7A 3PZUA 1XCWA 5LA2A 2D0FA 2VZUA 4F8XA 3QHMA 1HJSA 3A3HA 5A6KA 5CGTA 4WLCA 3WMSA 4U2YA 4ZE5A 1GQJA 3SUWA 1QVBA 3ARYA 2CEQA 4P7RA 4DUXA 3AIWA 1CYGA 1JZ6A 2WSPA 4WKHA 1V6YA 1WE5A 1CECA 1E3ZA 2D22A 2X0YA 4CN1A 2V3EA 5A2CA 5M5DA 1UH3A 2ZX8A 5FOOA 4NSBA 1W9BM 1QI4A 1B3WA 3VGDA 3GH5A 2W61A 1AQMA 3L2LA 1KGWA 1CXFA 1MYRA 3BLPX 4YN5A 4D6GA 4AZHA 3SCTA 4QLLA 3OG2A 1H09A 4FK9A 2W66A 3DC0A 2ZUWA 3K8KA 3MSGA 5HPCA 1GNXA 1LL4A 4HMCA 4B15A 5I2UA 2TAAA 4W8LA 4PUEA 1D7FA 3M6DA 1B1YA 2EPOA 2W67A 1ZJBA 2XG9A 1EDTA 3EDDA 4LPCA 4M1RA 4HU8A 1I1WA 1ZBWA 4GI9A 1J9YA 4AISA 1CXIA 5HNNA 1NOFA 3NIYA 3UCQA 1M7XA 2WLZA 4HZ8A 2MANA 1B2YA 2ZIDA 2ZUSA 3U57A 3PHAA 1H49A 2DH3A 3N17A 5DFAA 3SUVA 3B9EA 3PZOA 1FFQA 3W6LA 4EE9A 3IAQA 1JYXA 2DEPA 3QOMA 5GQBA 4HA3A 1G1YA 4UOJA 2J75A 4HA1A 1AMYA 4NF7A 1E72M 3M7SA 4ML4A 3B9DA 3RM4A 1FHLA 4B16A 2WANA 4R27A 1GHRA 2DIEA 1V0MA 4JHZA 4MB3A 1ZS2A 4AMCA 5I0DA 3ZJ6A 6TAAA 2XPKA 1GZJA 2QLYA 2ZWYA 5E6ZA 2XGIA 3N12A 1KXHA 3TTSA 5A8MA 2VQTA 2RGLA 4KRUA 3WD4A 4PRWA 1TA3B 4ZENA 1PPIA 1WDSA 5A8NA 3W38A 1ITCA 2DH2A 4RE3A 3WFLA 2AOSA 3VIFA 1MQRA 1J12A 1E6QM 2WYSA 3AIEA 5CSYA 3VIMA 1VFOA 3WBEA 4XUYA 4AEFA 1U33A 1TR1A 1BG4A 2VCCA 4UFIA 1FH8A 3THCA 1E43A 1CXLA 2JEQA 2FH6A 1GW1A 4AD1A 4J3WA 2A3CA 1CBGA 4GIAA 5A6LA 4AZCA 4Z2GA 2F8QA 2J8GA 2YBUA 4DWSB 1UWRA 3KL0A 1EO7A 2E3ZA 4X9YA 2J62A 3AHYA 5I6SA 3N9KA 4QP0A 2WCSA 1DWAM 3QGVA 1G9HA 2VX6A 1W9PA 4LQ1A 1V3HA 4PMRA 1UR0A 1GVIA 1H3GA 1EOKA 5IFTA 5JIPA 1JZ8A 2JIWA 1E6ZA 3PZ9A 1J0IA 1VBRA 1FH9A 1V6UA 2OWCA 2OYLA 3A4WA 3SCPA 4ACZB 3VGFA 5AYIA 2UY3A 4OBSA 1XC6A 3J7HA 1UKOA 4YHEA 1A47A 2WHKA 4ZXOA 3VIKA 5E6YA 5JIWA 3AXXA 4CD8A 4UQCA 3WH8A 3WF0A 1SYTA 4P8XA 3VMOA 1OIMA 3VVGA 1IZKA 4PTMA 1X1NA 4PEEA 3VD5A 3D3AA 3WEOA 3S6TA 2PWEA 4UQAA 4EK7A 2PWFA 2A3HA 1ECEA 1GOOA 1UR2A 3BCDA 3II1A 4HZ7A 1VEOA 5GPRA 5IHSA 4AIOA 4PUDA 3AMKA 4H2CA 2DSUA 2YL5A 5BXRA 1TUXA 3GNRA 1M03A 1E6PA 1WZKA 4QDMA 4JHOA 3VD7A 5LA0A 4XX6A 4GO8A 2VZVA 4DWSD 1UKQA 1KBBA 4UZSA 5A94A 1E73M 1V6WA 4UFMA 4BCEA 4EKJA 3K8MA 2Z1SA 1PX8A 2V3GA 3BXWA 3VIHA 2WM0A 3WDIA 1CGWA 5A6BD 3WQ6A 1QNPA 1NOWA 3ZR5A 2CESA 4MDPA 2Y5EA 3VGEA 3W24A 1E1FA 2YL6A 3CLWA 1R7AA 4AD0A 1HJWA 1BGAA 4JL2A 2CERA 1W1YA 4WJXA 3N15A 2AAAA 1LWHA 3LPOA 4UOQA 3WH9A 3UEQA 3ZM8A 2OYMA 1W9UA 2XSBA 3PZVA 2YL9A 3WDPP 4NRRA 4KMQA 2VX4A 2VRJA 4MADA 2WPGA 1A3HA 4LYRA 4FLRA 1IZJA 1TA3A 1H1NA 4AZ7A 3CH9A 4HOWA 1V02A 2O92A 4GQQA 3RM8A 1ZL1A 2ZOXA 1MQPA 4UQDA 3BC9A 1V08A 1V6XA 4JAWA 1FP9A 4MAVA 3M07A 3TTQA 1UH2A 3UR8A 3AHVA 3RCNA 2E0PA 2Y8KA 4MB5A 1UWIA 5DMYA 3TOPA 1B90A 3F4VA 1HP5A 4HP5A 3EMZA 3WDRA 1KBKA 3RPMA 3WEZA 3GH4A 3AZTA 3N11A 1BTCA 2BVYA 4CCEA 1R8LA 4J3UA 4AWEA 3UERA 5A6AA 3NUKA 5TD4A 5CG0A 2PB1A 2B31A 4DWSA 1UQZA 1PIFA 2J7EA 3K4DA 4N0RA 1PIGA 3PZIA 1TVNA 3ARQA 3CO4A 1V6VA 3DHUA 3FY1A 1B3ZA 1C8QA 3MO4A 2ZUTA 4ZE4A 1EDQA 1B3YA 5D9OA 2GJXB 3MSDA 3SCWA 3AMDA 1E56A 1MWOA 5A6BA 3TTOA 2BXYA 4K68A 5I23A 2EPMX 1JYWA 2IXUA 4CVUA 5HPOA 3AMGA 3RMEA 3AMCA 4D6HA 2W92A 2ZUMA 3NSMA 3RIKA 4ACZA 1G01A 3L4YA 3QR3A 4W84A 1OM0A 3UG5A 4H04A 3ARWA 4D6JA 4GO9A 3HN3A 1JYNA 2VZOA 1QI5A 1YQ2A 3SIMA 4KH2A 1J01A 3CHCA 4HMEA 4XV0A 3D5HA 2BS9A 2DQXA 5E0CA 4BS0A 3GXIA 3ZT6A 4Z2LA 3WNNA 3SURA 5EB8A 1XYZA 3VINA 3RJXA 3MUAA 3VKKA 1TG7A 3DHPA 4TVCA 4TVDA 2UY2A 4QLJA 1R85A 3AHXA 2QPSA 1S46A 1OSEA 1TMQA 1JGIA 5CJ5A 1G94A 1ZJAA 2WHLA 1HKMA 4C7GA 2EXOA 1FH7A 4TOQA 3S2CA 2CNCA 1ISVA 4PTXA 4IPNB 3W53A 1E4IA 3WNPA 3WH6A 1GPFA 3GM8A 5A6JA 3PZGA 1W2PA 1DTUA 3WY1A 1WAWA 4U3AA 1MFUA 5I3DA 1E3XA 3CIVA 3F5LA 3ECQA 3TTYA 5I77A 3WUGA 1QHOA 4HPGA 3GNPA 2D1ZA 1KWKA 4W87A 3CMGA 4P7LA 1UKTA 1ODZA 1HKKA 1XD0A 2OSYA 2CHOA 1BYCA 1HVXA 1VENA 1AQ0A 1BFNA 4HMDA 1CZ1A 3WF2A 2CETA 1FFRA 2E8YA 2FHCA 3W28A 5D4YA 5M17A 4GINA 3T0DA 2WVUA 4U3CA 3PTKA 3SCQA 4GZJA 2WC7A 4ATWA 1VJSA 1C91A 4FLQA 4CGTA 2Y24A 2WMJA 1W3LA 1OGSA 3IK2A 5BXPA 1UKSA 5DT7A 4WSJA 4J28A 1DHKA 1N82A 4OBRA 2WB5A 3VILA 3BAYA 3N1AA 5E9AA 1KXVA 4KGLA 3ARTA 3UR7A 3DYPA 5JBFA 3WH7A 3AXIA 1BAGA 2BV9A 1GUVA 3ZO9A 1GHSA 1XH2A 1ZU8A 3EMCA 1NWRA 3SUTA 3AZRA 4JFTA 4W8BA 2BVTA 2BY0A 5E70A 3VD4A 2EPKX 1WKYA 3VD9A 2QV4A 2WK2A 3GH7A 2EBNA 1OIFA 1TE1A 2V38A 1H2JA 3W27A 2X05A 2OWXA 4AZ6A 1UR1A 1UA7A 4J3SA 4GZIA 5ABHA 2XM1A 4CN6A 2FGZA 3AHZA 2JIEA 1OWQA 3BMWA 1B3XA 2CCRA 3VIOA 4AW7A 5A1AA 3ARSA 4P8UA 1VAHA 3CHDA 2GJXA 4FLOA 3WF4A 4GZEA 1EDGA 3UG3A 2VNCA 4TX6A 1WPCA 3QHOA 2VMFA 4HA4A 1Z32X 1LWJA 2F61A 4LGXA 2XVGA 3ZJ7A 2IUZA 4YHGA 2CKSA 1ZBKA 3CTTA 3NDZA 2XVKA 2VQUA 3GDBA 4PMUA 3AMLA 1GJUA 2VL4A 1BQCA 1VEPA 1XRVA 1M53A 4M24A 3ZMRA 2ZX5A 3SEPA 1Q6GA 3UG4A 3WKZA 4D71A 1QI2A 3WD0A 3OIHA 1SMAA 3W37A 1E4NA 4JCMA 4L4OA 3WIJA 4F9JA 3KL3A 3GYCA 2YLAA 2YIHA 4S3KA 2FDMA 2O9PA 4BA0A 3VDAA 1DWHM 2G3NA 3WD3A 3G6LA 2J7DA 1BG9A 1QBAA 1UUQA 4CUCA 2NT0A 2V3FA 2PF0A 1UWQA 4LXFA 1J0YA 2EJ1A 4WF7A 3LPGA 5A8QA 1US2A 1JYVA 1W9XA 2YLLA 1WDQA 3TONA 1WZLA 2PWDA 4W93A 3VDCA 1Q6EA 5KEZA 3L4TA 4IUGA 3WUEA 3EYPA 3L4WA 4UFLA 3AYRA 3AZSA 1K9FA 4NZCA 3W25A 4ZEPA 4JCLA 1JNDA 4KGJA 4AZGA 1ZB5A 3VD3A 1XSKA 1NWSA 5ECUA 2V5CA 3OLGA 2ZX9A 3PZNA 3T2QA 3IANA 2E9LA 4TTUA 1NWUA 1QNSA 4D6IA 2D24A 1HJQA 2C7FA 1W9VA 1OB0A 1QBBA 2J7FA 3VGHA 1UWUA 2XFFA 5FKYA 4AY1A 5BCAA 4NRSA 4EANA 1XV8A 2VRKA 1CXHA 4CU8A 3POHA 2X8RA 2OLHA 2ZX6A 2BHYA 4W7UA 3FXYA 1UZ4A 3ZR6A 5A8PA 4PSPA 5EBAA 5BRPA 1E5NA 4JL1A 2A3AA 2VI0A 1K6AA 3THDA 4B3KA 5BYWA 1K9DA 5BXSA 1W1VA 1GQKA 3VIIA 1NWTA 1WNOA 3NYDA 1GOIA 1JFHA 3VIGA 3BMVA 3CUFA 3BAKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WDQ A;  4Z2I A;  4WIW A;  4EAM A;  4CKQ A;  5BRQ A;  5CPS A;  4GI6 A;  1PZ2 A;  3T2P A;  3WDJ A;  2GUY A;  4PMD A;  1UR9 A;  3SCO A;  2VCA A;  1C7S A;  1J11 A;  1PJ9 A;  3VNY A;  2XHY A;  2YBT A;  1NAR A;  4V27 A;  4UFH A;  1VBU A;  1JZ3 A;  4CCD A;  4E8D A;  2OSX A;  2ZWZ A;  3GTN A;  4BQ3 A;  1QNQ A;  4CVW A;  3AHT A;  3MAN A;  1RH9 A;  1UKP A;  2VTF A;  1E6R A;  3L4X A;  1CEN A;  2E8Z A;  2QMK A;  2WBG A;  3WNK A;  1ISW A;  5A8O A;  1Y7V A;  1OGG A;  1KGU A;  5E09 A;  1CDG A;  3DYO A;  5I79 A;  4AXN A;  2O9T A;  1QNR A;  2J74 A;  3ALF A;  3VGB A;  3W81 A;  3L4V A;  3VGG A;  4MNK A;  5AYB A;  4BQ4 A;  3WQW A;  1EQC A;  2E40 A;  2EPL X;  3BCF A;  2J77 A;  3I3E A;  3VMP A;  1OIN A;  1EHN A;  3EDK A;  1JDD A;  4MJ2 A;  7CGT A;  4ATL A;  4H7V A;  4P7O A;  3K1D A;  1ODU A;  1H41 A;  4PTW A;  2XTK A;  4C7F A;  1C93 A;  1QW8 A;  5FL0 A;  5C8B B;  3MMD A;  2WVT A;  2PWG A;  3FHQ A;  1JZ7 A;  4JKL A;  4U2Z A;  2WMH A;  4GKL A;  3TP4 A;  1HJU A;  1E71 M;  1HN1 A;  2JEP A;  4RL3 A;  3NDY A;  5D8W A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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