5CSRA

Crystal structure of triosephosphate isomerase from thermoplasma acidophilium
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
MYTAIVNLKTYREATGANFTRFMEKFEPVQGKFELIFSPSLLDLEKAAKCGKFRFFAQHVDAEPYGAYTGHVPMDMMIDLGITGSILNHSERRLPRDTIINTLKKASKLDFTIVLCVENAEEAKYFREYEPDFIAYEPRDLIGGDVSVSTAKPEIIEDIVKIYEGTGTSVLVGAGIKTGEDVRRSIGLGARGILVASGVVKSADPTKSLNSLIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Isomerase
source organism Thermoplasma acidophilum (strain atcc 25905 / dsm 1728 / jcm 9062 / nbrc 15155 /
publication title Structure and Stability of the Dimeric Triosephosphate Isomerase from the Thermophilic Archaeon Thermoplasma acidophilum.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 74
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5csrA00
1ZAJA 2YYUA 3KXQA 2B4GA 5LZLA 3ZWTA 5DLCA 2NX9A 3KRUA 3WJZA 3TW7A 4HKPA 4O17A 2Q8ZA 2VFEA 4XBKA 3WK2A 1S5WA 3VCRA 5LNWA 2YFNA 4MY1A 1MO0A 1PCKA 2FIQA 2J24A 2Y63A 3S1UA 3T78A 3PUDA 2QJGA 3HGOA 4HN4A 1B57A 5IM51 3LHWA 1F5ZA 3O16A 3PWAA 2ZRYA 3NDOA 4GFSA 4DEFA 1H7XA 4O1BA 4E2DA 1GTEA 4LWWA 5HUOA 4BI7A 2NUYA 3TQKA 1SO6A 5G1YA 3TROA 2V2CA 4MYAA 3TMQA 3MI6A 3GAKA 2JGYA 1YYAA 1WBJA 4MKNA 1IXQA 2YXGA 3NQFA 3MBDA 4K37A 1JCMP 3S0CA 1OYAA 1OYBA 1ZY9A 4E0CA 4AHQA 1BTMA 4DO4A 1OYCA 4WOQA 1ZENA 4TU1A 3GIYA 4IMFA 3LCXA 2H90A 3P61A 3UWZA 1JQVA 3W75A 1EPXA 3EWXA 3QSTA 2YCEA 1P0KA 4GE8A 1G4PA 5KITA 2HTMA 4FNSA 2VFIA 4O1CA 4HPXA 4AXKA 4KWWA 4UTMA 1QWGA 1L6YA 2X1UA 3STFA 1I45A 4OV4A 4UR8A 2BX7A 3I6RA 4N6FA 4ICNA 2ZCGA 2Y7FA 3CEUA 4FX7A 3B0UX 5HR7A 4IWWA 2V81A 1IGSA 3C2RA 1H60A 2E5CA 4MPQA 1SPQA 3DZ1A 1G69A 1H7WA 1ZFJA 3W2MA 1SW7A 1AL8A 3EX3A 1FUYA 2DORA 1LBLA 3BW4A 4UMCA 4OE7A 4TR9A 4O52A 3MMTA 1DOSA 2ZA3A 4Y6GA 4JTGA 2I1OA 1FDZA 1YLVA 3HF3A 3RK8A 4XZ9A 1O5XA 3ELFA 4AAJA 2HMCA 4DXVA 2CLFA 1YTDA 3TNOA 4FIQA 1K8XA 2PE4A 1EEPA 3NO5A 4NU7A 4UMBA 1I2PA 1UBSA 2FB3A 2FQIA 3ANYA 2V2DA 1M6JA 4FXSA 2WPBA 1H5YA 5DBUA 1TV7A 4HNTA 3DENA 1F74A 5D30A 3PY2A 2C15A 1G7VA 3M1ZA 5EBUA 3GB6A 4NNBA 1Q6QA 5CSRA 4C1LA 2XN1A 4LV4A 4GWEA 3TXVA 4P2VA 3SY5A 5K9CA 3HG4A 4WZHA 2Z6IA 3P81A 4IJBA 1I8JA 4E2BA 3UNDA 1JUBA 2GOUA 3W87A 1RV8A 1EWEA 3LLFA 1JUEA 4GXMA 3G1YA 1YPFA 1M7OA 1SZGA 1A50A 3TH6A 4QM1A 1K7EA 1W37A 3IIXA 3TDFA 1QPRA 2NX1A 3LCWA 5AHFA 3S1VA 3UQNA 4XBSA 1H1ZA 2CZDA 3KOFA 3W7LA 3C2EA 3C2VA 1JCYA 3IIOA 4TX9A 2YX0A 4EF8A 3U6WA 2B0MA 2QDHA 4BWLC 3UWQA 1WDWA 3CU2A 1VCVA 3Q94A 1P1XA 1QPNA 4AWSA 1Z48A 3EX1A 2AGKA 3FFSA 3EKLA 1Q6OA 4FNRA 3E02A 3S5YA 1HG3A 4Z1BA 3W7KA 3PBUA 1K7XA 1W5MA 2NLIA 1QDSA 3W7CA 1G7UA 3C4UA 1XDLA 2TPSA 3W7DA 1W31A 1M5WA 2ABAA 3OVPA 1SO4A 3Q2DA 1QCWA 3P74A 1PL9A 3OBKA 2QCHA 3W2NA 1FX6A 2E5DA 2G97A 3HG3A 5HMSA 4ZVJA 5F4WA 1H62A 2C1HA 1TPB1 2C13A 2CLLA 6TIMA 1SSDA 2WSQA 3R2GA 1WYIA 1UB3A 2CLHA 1G67A 3LXCA 4LU0A 4JTEA 1I2NA 2R14A 3DI0A 2CLEA 1T8XA 4HSNA 1VRDA 3NL2A 1QPQA 2OMAA 4JX5A 1EP1A 3W7GA 3LBMA 5LGZA 4E38A 5HWMA 3THQA 1H63A 3NL6A 4O28A 4HIBA 1N7KA 3W73A 1FY6A 1D9EA 1OK4A 3SECA 4UTHA 1GG1A 3CWNA 3G0UA 4JDBA 3PBYA 2X30A 1I2QA 2GQ8A 3P62A 1KTNA 3W7RA 1XI3A 3SGUA 5DXXA 3R8RA 1U83A 1ICSA 4N9CA 2B7NA 4C1KA 5DCDA 4Z1AA 2Y89A 2TYSA 3BG3A 1W5QA 1J2WA 2TMDA 1P4CA 4AF0B 2E6AA 1LBFA 3LV6A 3M41A 3C3NA 1B4EA 4XTIA 2WO5A 3N34A 4Y8FA 3NQ2A 4NX5A 4Y96A 2X1RA 4JTIA 4CCDA 5DCEA 1R2TA 5CGQA 2E68A 1R30A 2QCFA 3M6YA 4RLIA 1KV8A 4PH6A 5D2VA 4XTDA 2G95A 1LRQA 1FDYA 1E51A 3QW4B 3T7VA 2OZ0A 4RKAA 4LV9A 2YDAA 2JKEA 4YXGA 5G4WA 2CWNA 4MY9A 3UD6A 5D02A 3W86A 3NQAA 5H2ZA 1RZMA 3NR0A 2BWGA 2NXHA 3VNDA 1WQ5A 2DJLA 4EVZA 3LOTA 5E93A 5U4NA 3FKKA 1YPIA 2NWRA 3I65A 3QM3A 3BW2A 3Q58A 4LW7A 4UMAA 5FF0A 3MBFA 4O1DA 3N14A 1L6SA 1BWLA 3PSVA 3NA8A 3QF0A 3W7IA 3ATYA 3O6YX 5HULA 3B04A 4O19A 3BGJA 3N9RA 1SW0A 3HMJG 3W07A 4S2CA 2Z0IA 3OHIA 1QR7A 1VPXA 3IVSA 1IIGA 4LUJA 3IGUA 3KHJA 2WOQA 3FEMA 2DJXA 1F2JA 3L68A 4LVBA 4IMGA 5K2ZA 1TQXA 4D2JA 2C19A 3NQDA 3PB0A 5CZSA 2YGYA 5AYYA 3M5YA 4AVFA 4CQ9A 3TW6A 4UFMA 3V75A 4H6KA 2DZTA 1NF0A 2Y7EA 1OJXA 1PV8A 3HOJA 3STCA 1PCWA 1GVRA 1KFKA 1PHQA 3PF3A 3G1HA 3AJXA 4O50A 5EA9A 3GDTA 1YADA 1RQEA 4LOCA 4UFIA 3PR2A 1NSJA 1XC4A 4PFMA 4O54A 1LM1A 1MEIA 5AYZA 3BO9A 1WV2A 3IVTA 1OG0A 2A5HA 5AB3A 1A5SA 1SZNA 2G5WA 4GC4A 4UIOA 3NEVA 4ZQCA 1KFJA 4ZQMA 3S8HA 5J5DA 3O8AA 3C6CA 5KINA 1O95A 3FJ6A 1TPEA 3NPVA 3ATZA 2Q3RA 1H7OA 5KZDA 2FDSA 4JICA 3DFOA 1OX4B 3L5AA 4ML9A 1TQJA 1KM3A 4GUGA 4BI6A 3G3MA 3TKFA 2QEZA 3IVUA 6ALDA 3TA6A 2B7PA 1SFJA 3MJYA 1VQTA 3DFSA 1Z44A 5J5RA 1G4SA 3FS2A 4A21A 3GXTA 2AAMA 1W3TA 5E1QA 1LOQA 5D2XA 4O4VA 3NM1A 2DU2A 4UTUA 1LOLA 1H61A 5AHMA 4UFJA 1TSIA 4AB4A 4N9EA 1TJRA 1FXQA 1OX6A 3EWWA 3LHUA 3G8RA 3M47A 5G2HA 3EWUA 3HGJA 4IMCA 1VYPX 3DFPA 3WJWA 5BNKA 1I2OA 1X1OA 4WY0A 2VENA 3F4WA 2A6LA 1TIMA 3ZR4A 1XUZA 3NPUA 1KM0A 2R91A 2IQTA 3GAYA 1FWWA 1W3IA 2NWSA 3CT7A 2YPIA 4NX0A 1PE1A 1VHCA 3M44A 3QPZA 1BEUA 1PS9A 2CLKA 5FI8A 4O57A 1AG1O 1VH7A 4XKYA 3GXPA 3LHTA 4Z1DA 5IBXC 1AL7A 2V2HA 5LNVA 2EAWA 1Q6RA 5FEXA 3PUEA 1SZEA 2VOMA 4M7SA 1B4KA 2ZZ5A 3G8EA 2FPTA 1OFDA 2EPHA 3OG3A 4A2RA 3KAOA 1X6UA 3KVMA 3O6CA 3IIPA 4UTWA 4YCOA 1TV8A 3CEPA 3LTSA 4UTTC 1FWRA 3W7HA 1JRBA 3GR7A 1DQWA 4CCEA 3B8DA 4QISA 4Q32A 4N02A 4RV8A 3NL5A 1LRTA 4JX6A 1TO3A 3BPWA 5DBTA 1Z41A 3GK0A 3I7SA 4LS2A 1W8SA 4HT3A 1RR2A 3GR8A 5LKYA 1WAUA 3MI2A 1TB3A 2ZZ6A 3F4NA 3DKJA 5D2YA 5KZEA 1LRNA 5CPMA 4NJGA 4MUZA 5HQEA 1GWJA 2ISSA 1X7FA 2EHHA 3I7RA 2GPTA 1TPDA 1SR9A 4ORIA 3SJ3A 1WOBA 5G1TA 1FQ0A 2GVJA 3NL3A 2VFGA 1TREA 1VYSX 2C6QA 3QYQA 4CLMA 5D32A 3HG5A 2GQ9A 3P7YA 3W1QA 1W1ZA 5KMYA 1XBYA 1G4EA 4ZQPA 3PC0A 3AO0A 4HSOA 4POCA 1KM4A 1RQHA 3DGRA 2QCDA 3TSBA 4I7UA 1FWTA 3N2MA 2I14A 5DXYA 3H53A 1JCJA 4OT7A 5K4ZA 3GLCA 4PODA 1S3HA 1YDOA 2CU0A 3LRMA 3A21A 3TAOA 4K36A 2A21A 4BWLA 4LS1A 3SR7A 5U7SA 2J6XA 3M9YA 2ZTJA 3W84A 1ZNNA 3QMRA 4NXKA 3GZ3A 3UZ5A 3VFLA 1KM6A 3C56A 3GNNA 1B9BA 4Z08A 1QNVA 3EWZA 3F03K 3C2FA 2X16A 2QKFA 1TV5A 4OU1A 4M6PA 2ZRVA 1T99A 3W7EA 4KKXA 1N8FA 4NUWA 1J5TA 3GDLA 1EA0A 1F6KA 4XUGA 2RDUA 4UC5A 3BK0A 1N55A 3UWWA 3LCLA 1SFLA 1WOAA 4OWGA 3TCEA 2DZWA 1KTCA 2RHGA 2Y62A 3MP4A 3W9ZA 3L5MA 1FWNA 1IIHA 2A7PA 5DELA 2H3DA 4UTIA 4ZL1A 1HL2A 1EWDA 5TBOA 3TJXA 1H7PA 3M5ZA 1I2RA 3TR2A 1GEQA 3T40A 4MZ8A 3L67A 2A7RA 1JJKA 5D03A 3W1MA 1Q6LA 3O07A 3SW6A 3GKFA 1TPWA 5MHBA 3T55A 1KLZA 1LP6A 3S42A 4JTJA 4I7VA 2DP3A 5D05A 4IUOA 2RFGA 2VFDA 1CX9A 4DQWA 1O60A 3R12A 2R8WA 3LB0A 5TIMA 2ALDA 4K7VA 4B5NA 1TTIA 5AFDA 4PTNA 1F05A 3P80A 2RH9A 2QF7A 1GQNA 3QZEA 1CW2A 2DZUA 2A4AA 2DZXA 1LORA 1KV5A 2NXGA 1VZWA 2GQAA 2OT1A 1K02A 2J88A 2HS6A 1W3NA 1RD5A 4RK8A 3P60A 2ISVA 1FCVA 2Y85A 4FEZA 2H6RA 4JTUA 5FEZA 4PCFA 3DH7A 4WJEA 3S5NA 1JULA 3IEBA 4M19A 4HHPA 4AHOA 4N4QA 3CM4A 3PS7A 3A9IA 3TUUA 2F7FA 3QEZA 3DKLA 3NXFA 3OEXA 1SQ7A 1LYXA 4A2SA 3NZRA 3HPZA 1OVDA 1X8FA 3VKJA 1FCQA 1SUXA 1EUNA 3B06A 1DJQA 2Y70A 1TPC1 2QUUA 2YW4A 4N9BA 2GVGA 4S1FA 4JTHA 5EY5A 3FKRA 2PRLA 4PL1A 1KM5A 3FJLA 2JGQA 3ABQA 4LY8A 4O12A 1VCFA 4NVTA 1TRDA 3KVJA 5CKSA 4MZ1A 3TX9A 1OF6A 1G6CA 2ZFAA 2PRHA 3QRHA 3CHVA 1AMKA 4QQ3A 1TPFA 3S1XA 3P8IA 1XXXA 3FYOA 1ZALA 4X22A 5BOOA 1DQXA 3O05A 5F2MA 5K3VA 3WJXA 1S5TA 3FLUA 1L6WA 4MVAA 2TRSA 4O8RA 1OFBA 3MP3A 4JGDA 1YDNA 4LVAA 4U28A 1LBMA 3PG8A 2H8XA 4DO6A 3QH2A 2QCEA 3MW7A 1RQBA 4JS3A 4O14A 1BKSA 3MYPA 3NPWA 2BXVA 5SWUA 3B0VC 4PC8A 1L9WA 4K6AA 5KZMA 3MHFA 5ABTA 5LNRA 2PURA 1KFEA 3YPIA 2P0OA 4LVFA 4JIQA 4R53A 1QAPA 4FX8A 4NT0A 4UCGA 5F4XA 4UNKA 3P67A 2E5BA 1TPVA 4UTJA 3TC7A 3WFAA 3UZJA 3IIVA 1OFPA 3JRKA 2ZZ4A 3W7JA 2JK2A 1P5BA 3E9AA 3FYPA 4NJKA 2YZRA 4DELA 1FWSA 1IXOA 5A8GA 4WUIA 5G4EA 4QNEA 3PAJA 1GG0A 3G1AA 3F1QA 1ONRA 4O10A 1K3UA 3TIMA 2QUTA 5CPLA 1LTDA 4WXZA 3TXZA 1SSGA 3BG9A 3DI1A 5C55A 3LCGA 1V7YA 2DZVA 3DFQA 4K7YA 4NZFA 1O4UA 5DCBA 3W1RA 4IX2A 2YFOA 2GVLA 5CZJA 5EMUA 1H7NA 1QO2A 3G18A 4CNNA 1TTJA 1GPWA 3L5LA 1K8ZA 1DJNA 1NF7A 1UUMA 3LLDA 4O18A 2C3ZA 4O13A 1G4TA 5KSWA 4KFOA 2XN0A 1QFEA 4H3DA 2JBMA 3G1DA 2ZZ2A 3OIXA 5CSSA 2AQWA 4DF0A 3LHZA 4NJIA 5CZTA 3LGEA 4O1AA 4UR7A 1WBHA 5LNUA 2WSRA 3E49A 4Z0JA 2ATMA 5HJLA 2Y6ZA 1XCFA 2QAFA 3W2JA 2J9ZA 2QCLA 1VC4A 3CIWA 3O6DA 3NZ1A 2WNZA 2G96A 4QAIA 4I7WA 3TJLA 1HUVA 3LRKA 4FXRA 4BR1A 1VGAA 1C29A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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