5D37A

Directed evolutionary changes in kemp eliminase ke07 - crystal 16 round 7
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
MLAKRIDAALILKDGRVVKGSNFENLRDSGDPVELGKFYSEIGIDELSFWDITASVEKRKTMLELVEKVAEQIDIPITVGGGIYDFETASELILRGADKVEINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVYIAAKRVDGEFMVFTYSGTKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEIVLGSIDRLGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIAHRGAGKTEHFLEAFLAGADAAKADSVFHSREIDVRELKEYLKKHGVNVRLEGLGSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags De novo protein, lyase
source organism Synthetic construct
publication title Directed evolutionary changes in Kemp Eliminase KE07 - Crystal 16 round 7
rcsb
molecule keywords De novo kemp eliminase KE07 round 7
total genus 91
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5d37A00
5D09A 4QISA 1UJPA 3B0PA 3DBPA 4OQVA 2VFFA 4O19A 1DORA 1WA3A 3FFSA 4JIPA 4Y90A 3S5NA 1KBJA 1ML1A 3NL2A 1I2OA 2YCEA 4CQ9A 4JTIA 5G1TA 3HOJA 4Z1CA 3EX3A 3USBA 5F1VA 3LM7A 3LHVA 4IX0A 3TFXA 3THQA 1K8XA 3V75A 3MMTA 3Q2DA 4TMBA 1VRDA 1I45A 1SQ7A 3O1NA 4ZQNA 2ZCGA 2CLKA 3P5YA 2E1DA 2VENA 5TIMA 1TRIA 3GLCA 4LS0A 3W7PA 2R8WA 3MWAA 4FXSA 4XKYB 4HIBA 4HHPA 4AHOA 3L5LA 1QWGA 5AYXA 3UXDA 2FIQA 2RDUA 1FWSA 2P10A 3VFLA 3GDKA 4YCPA 2QCLA 4Z1DA 3FYPA 4P2VA 3OVQA 3UD6A 4JIQA 5AC8A 5EBUA 5LNRA 4CNNA 3DGRA 5DELA 4AHPA 1YADA 3DH7A 3O6YX 1XBYA 4O12A 3INPA 1O4UA 2B0MA 1L6WA 3PG8A 4K8HA 4PL2A 5HWNA 2OMAA 4O50A 3QMTA 3TSBA 3GK0A 3QZEA 3S6DA 1TTQA 3DENA 4GUGA 1I8JA 1TCDA 1OVDA 4HPJA 1M6JA 1TPC1 3P8IA 1QOPA 4JX6A 2TRSA 4R53A 3P61A 1KTBA 1MEWA 3W1RA 2O7SA 4IXXA 2G95A 5AHIA 3PM6A 4JTEA 1G4PA 4AWUA 3QPZA 1GVRA 4ZQCA 3FOKA 3WK2A 2QCEA 3WFAA 4WZHA 2UV8G 3S0CA 3B04A 1T96A 1FUYA 2FPVA 5FEZA 5A5WA 3TW6A 3T44A 3NZRA 1RQBA 1GTEA 2J9ZA 3EX4A 3S9YA 2TSYA 2E5BA 1NSJA 4OE7A 4CNOA 1H7OA 3JS3A 1K02A 1VLIA 1FQ0A 1D9EA 2F84A 3W7LA 2QCGA 3PB0A 3PBUA 2HTMA 4KWWA 5K2ZA 2ATSA 2VEKA 2X1SA 3W74A 4MLRA 1FDYA 4XTDA 3TE9A 1XM3A 4RZ6A 1PE1A 2V2HA 3LCGA 2E6DA 4UMBA 3NQGA 4M6VA 1WBJA 3QMSA 1NVMA 3NPWA 1RQEA 4S2BA 4M19A 4NT0A 3TJLA 1EUNA 4NX0A 2ZFAA 1IIHA 5K4ZA 4OHQA 3WK3A 3L67A 3PWAA 4DXVA 2ZZ5A 3G24A 1JRCA 1VS1A 5CG7A 2ZTJA 5FF0A 1GG0A 4RLIA 5DY2A 2E77A 5D02A 4JYEA 4XWUA 4IUOA 1O5KA 2ABBA 3WJZA 5U4NA 2J88A 2QJIA 4FNPA 3ZFHA 1H7PA 4DPPA 3ABOA 3IV3A 4JYFA 3P74A 5TBOA 4ZQOA 5F2LA 2Z6IA 1XC4A 3LB0A 1VPXA 4JS3A 1VYPX 3W88A 3LCHA 4ZQPA 1VCVA 2PURA 3G0UA 1OK4A 3W2LA 3ZR4A 2C0AA 4MUZA 2V5LA 2Y7GA 3CWOX 3QYQA 2V5BA 4UFHA 3S1VA 4DF1A 2ZRVA 4XBKA 1FCVA 3EX6A 1KM5A 3W22A 4TMCA 3PBWA 4R33A 5D38A 1PHQA 1RVGA 3NQAA 2YYUA 4RCXA 3W7RA 4HNVA 3KVKA 1SO4A 5F4XA 4IMEA 1H1ZA 1YDVA 3BVJA 4KFOA 3NGJA 2R91A 3TJXA 1SFLA 4O1BA 4OBTA 1MO0A 1F73A 4FNSA 4IWWA 2I1OA 3R2GA 1EWDA 1X8FA 5CPNA 3N73A 4QITA 3LRMA 3LXAA 1WYIA 3M5ZA 2CZFA 1FXQA 3M1ZA 4M7SA 4WOZA 3SZ8A 4FXRA 3UZ5A 4ZVJA 4PH6A 1TQXA 5K9DA 5AHNA 5LNWA 1F76A 3U2OA 3LERA 4UC5A 2QCCA 3O63A 5LSMA 3W1NA 4RX0A 3TV8A 2NXGA 3W76A 7TIMA 1YYAA 4NJKA 1TPWA 3UWYA 4JR5A 1TJRA 1R2TA 2ALDA 4OWGA 3TQVA 3S1WA 2Z2UA 3BG3A 3C2VA 3W1PA 3STEA 2LLEA 3NG3A 3RFAA 1TRDA 3QRHA 1W3IA 2YW3A 1Q3NA 2ZYFA 3EWXA 4NJGA 2NXHA 1F5ZA 3S5YA 1P4CA 4CQ8A 4K36A 1UB3A 3KXQA 2O7QA 4D2JA 1OX4A 5HWJA 4JDBA 4XUGA 3YPIA 2CFFA 3E02A 1KFEA 1FWNA 3MP4A 3M9YA 3SECA 4MKNA 4UNLA 3FIGA 3F03K 4IQLA 1AL8A 2VC6A 4C1LA 1FDZA 3W07A 1O60A 5EA9A 2Y85A 3P5ZA 3TH6A 4JTKA 2KZHA 3M43A 4LT9A 2JK2A 4YLWA 3TNOA 1G69A 3PSWA 5EMUA 3KHJA 4BF9A 1KLYA 2DZPA 4Y8FA 4Z08A 4DO5A 8TIMA 1LROA 4HNNA 1TJPA 1SO6A 4ML9A 1SU5A 3W84A 4FNTA 4I7VA 2FDSA 3GIYA 4DEFA 1GG1A 4AF0A 1TO3A 1H7NA 3N14A 1OF8A 3W7MA 4NXKA 1KV5A 3O15A 3M16A 1A5SA 1XFBA 4KKXA 1JCXA 1JQVA 1OJXA 4NU7A 5G1YA 1KFBA 2DZSA 1W31A 5FI8A 2NUWA 3HBLA 2RHGA 3W7NA 2Y63A 4NZJA 3PAJA 3SGUA 3GKFA 1XBXA 3KOFA 4UTWC 3NAVA 1QPNA 1V7YA 1ZFJA 4O8RA 3HGRA 1X1ZA 2E6FA 1FDJA 3NL3A 4JDYA 4ADTA 4ADSA 5CZSA 1FWWA 1KM0A 1KFCA 3NQ2A 3I7QA 1VHNA 2CLFA 2B7NA 4O16A 2GPTA 3W7HA 3CLMA 3QQ1A 4GUFA 4GUJA 3TKFA 3TDFA 2A1YA 1SW7A 1QFEA 4FB7A 1TPH1 2PRHA 3E0IA 1NAL1 2Y7DA 1SZEA 3W2MA 3K30A 1OK6A 3LTPA 2H8ZA 1DJQA 4K7VA 5D30A 3CTLA 4PEKA 4LOCA 3HIJA 4ADUA 1U5JA 1XL9A 1QMLA 4JTGA 4LWWA 3DHFA 4GBUA 3TQ0A 3W7CA 1FCUA 2EPHA 4MY8A 3M47A 3P62A 4MYAA 3ZS4A 3TSMA 4HKPA 1WOAA 4Z1AA 1WX0A 4XKYA 5AHFA 5D32A 1KM4A 5HMSA 3NL6A 3B0VC 1L6YA 2NLIA 5FF4A 4IX2A 1KW1A 1W5MA 2VFIA 1OX5A 3IGSA 4K8EA 4NJJA 4K7YA 3GR7A 3PULA 3H54A 3MBFA 5KZDA 3GYEA 5LNUA 2NXIA 1J4EA 2CLLA 3EXRA 1VC4A 4DO6A 1DOSA 2DJXA 3NM1A 1S5WA 1DKWA 1W8SA 4LVDA 2C6QA 5A8GA 1XCFA 2JKAA 4XZ9A 1PL9A 3NL5A 3MJYA 4IMDA 3W23A 2WV8A 4Z1BA 1P5BA 2ZA1A 5AB3A 2ZZ3A 3TK7A 3O06A 3NNTA 2BWGA 1JJKA 3RF9A 1UUMA 3EX1A 5CSSA 4UFIA 4DQWA 5EL1A 1XUZA 4UTJA 1KTNA 2HS8A 4ALDA 1ZNNA 4UFMA 2H3DA 3GAYA 1CW2A 5HULA 3TX9A 2ISWA 2X1RA 1OFAA 2JGYA 5BW6A 1X7FA 5CZJA 3C8FA 3M7WA 4U28A 3CU2A 4IGHA 4JTTA 4O13A 4PA8A 3G0SA 4E2DA 1UCWA 1DVJA 3IVUA 1VGAA 4G1KA 4FF7A 3DZ1A 1GYLA 1GVFA 3FEMA 2GQ8A 4LY8A 3D0CA 2A4AA 3EWZA 1VYSX 3OBKA 2WSYA 3S1UA 3VKJA 3GX9A 2C19A 4N2YA 3DU0A 4AHQA 3Q94A 4LU0A 2YR1A 3A9IA 4CCCA 2W0UA 4ICNA 4MFEA 1R46A 3NXFA 5I3HA 3H53A 3RLUA 1LRTA 3NQVA 3C2OA 4N4QA 4AWSA 1AMKA 3M5VA 4JXCA 3C2EA 3C3NA 5G2WA 3ELFA 3O07A 5KSWA 3MHUA 1AW1A 4ORMA 2FQIA 2DZWA 3JRKA 2NV2A 3SGZA 2QUVA 2EAWA 4N9CA 3DXIA 4L4MA 1JULA 1SZNA 5BNKA 3UWZA 1VZWA 4LRTA 2WSQA 3FJLA 1EUAA 3BLIA 2QCHA 2GQ9A 3C56A 3LCLA 2IQTA 1JCLA 1F7BA 4JTFA 5H91A 3HF3A 1TPUA 4GE8A 3VE7A 1ME8A 3MP5A 3HPZA 2PE4A 3W7OA 1P0NA 2A21A 2EGZA 3MHFA 2YPIA 2J6XA 5AHLA 2B7PA 4PC8A 1HG3A 1TV7A 1S5VA 5L6UA 2QCFA 3RMJA 1WXJA 2VFGA 3QSRA 1WAUA 3NPVA 3DAQA 4BFAA 3QSTA 5F2MA 2G97A 4IMCA 3QPYA 2CLOA 3ATZA 2PC4A 3B06A 4LC6A 1TPVA 3JR2A 5I3GA 1I2NA 3PVFA 3TQKA 1L9WA 5C55A 3H55A 4OT7A 3IVSA 5DN1A 4BR1A 1F05A 1EPXA 4YXGA 1LM1A 5K3VA 5LNSA 2JGQA 4QNEA 1IXOA 3ABRA 4MY9A 1NF0A 4TR9A 2DZXA 2WJZA 1SSGA 4JN6A 1B9BA 2XFWA 3W7QA 1I2RA 3N9RA 3OIXA 4CLMA 2WKJA 3C2FA 1P0KA 1NFBA 1TV8A 4JYDA 2E6YA 4DBEA 3F4NA 1W5OA 3UNDA 5KZEA 1HL2A 1A50A 2WNQA 1LRNA 3EXTA 4FIQA 1IXPA 4M7TA 1ME7A 2VEIA 4QJ1A 2ZRXA 3NQEA 2FLIA 1H62A 4O1AA 3UWVA 3W85A 4JTHA 2NZLA 4MIMA 2DZVA 4TO8A 5I3IA 1FWRA 1LBFA 1O95A 2QDHA 3GB6A 4FX8A 1SW0A 3T40A 2AAMA 5GVJA 3G1VA 1SR9A 3P80A 3W1LA 4GJ1A 3LXCA 5FF3A 3QH2A 5D03A 3GXPA 1QDSA 2QF7A 4EF9A 1H7WA 3NM3A 3TXVA 3HGJA 1K7XA 1PIIA 1ZAHA 2CLEA 3CWNA 4CQAA 1QPQA 2Y89A 4N4PA 4LVGA 3SW6A 1JCMP 4A29A 2EHHA 1TREA 2C15A 4H3DA 1WBHA 1GJPA 3C61A 4IJBA 3PUOA 3DKLA 3CIXA 2V8ZA 5G4EA 1ICQA 2QCDB 3BW4A 5LGXA 1TB3A 1GVQA 4YCOA 2ZRWA 3RNDA 5CPLA 1M7OA 4NJIA 3DFSA 3BLEA 1LOSA 1FCQA 5C6MA 1MZHA 3NEVA 3PUDA 1AG1O 2J27A 5HNRA 3IIVA 3MP3A 3OA3A 2FTPA 2V82A 3N9SA 3Q37A 2HSAA 3E12A 3LHZA 1W0MA 4ZZ9A 3LCIA 1Y0EA 1TMHA 4JGDA 3TCEA 3KVLA 2P1FA 3NYZA 2WNNA 4NXSA 5BOOA 4NNBA 5I3JA 1QCWA 2ZZ7A 3EWUA 3LLFA 4O52A 5FF7A 5BMWA 4UTKA 3EX2A 3HGOA 4QNWA 3L0NA 1ZENA 2J24A 5IM51 3FKKA 5BRBA 3EB2A 1HFBA 1KTCA 3MI6A 2FJKA 4JY9A 1THFD 2TMDA 1F6PA 3NDOA 3R12A 4AEOA 3IRDA 4CCDA 3LI0A 1OYAA 1K8YA 4Z0SA 3DI0A 4IMFA 1RQHA 4MZ1A 1OFBA 5E1QA 3WK0A 4JTSA 2A85A 3B03A 2WSRA 3LHUA 4FO4A 2OT0A 2QDGA 2W6RA 3W7GA 4ONVA 1K7EA 1GTHA 2ZA2A 2H6RA 3PY2A 4M5PA 1I2QA 1JQXA 5HR7A 1QPOA 3HPXA 3VNDA 2X16A 4YL2A 3SSJA 3CEUA 3SI9A 5KINA 4ZL1A 1QOQA 4YMZA 2DJLA 3GDRA 1B3OA 4HNUA 1I4NA 1Q6OA 5CSRA 3OVRA 3LHWA 3MO7A 3BO9A 3WJXA 1VCGA 3W1AA 1A5CA 2Y70A 2BSLA 4KWVA 1ZJIA 3GDLA 2YGYA 3STFA 4M6QA 2G96A 3LRLA 5IBXA 3IVTA 5AYYA 3L0KA 4JNMA 1OYBA 3TMQA 4UMCA 3HO8A 3KRZA 1LBMA 2ZZ6A 4O4WA 1G7VA 2RFGA 5E93A 5D05A 3L5AA 3GAKA 1DHPA 1M5WA 1G4SA 4MJMA 5FESA 3RU6A 1DQXA 3C0JA 4GUIA 1H51A 3DKJA 1B57A 5LNVA 3S5OA 3NVTA 4LW7A 5D33A 3UQNA 4UCGA 5G2IA 3FYOA 3UWQA 3G1YA 3W1UA 3W1TA 3PB2A 5AHEA 3UXAA 1Z41A 3BGJA 4K38A 5CGQA 1S3HA 5CZ0A 3S5ZA 3W3OA 1JUBA 1BWKA 1RZMA 1C9DA 4O54A 3UZJA 2A5HA 2ZTKA 3GKAA 4MOZA 3MYOA 1TPEA 2VOMA 4EOUA 3FLUA 5DCDA 5HINA 2C14A 4GWEA 4ZQRA 2BX7A 3KVJA 1TTPA 1F2JA 3NQCA 1EIXA 4E2BA 3CB8A 4JTJA 1VLWA 2GVJA 5D2TA 3T55A 1GEQA 1H63A 2AGKA 2BZNA 3N3MA 5HJLA 4RK8A 2XN0A 5AHMA 2Y61A 5FF2A 1LCOA 2X2GA 3LRKA 2CU0A 4OU1A 3FS2A 3MHGA 1XI3A 3LGEA 4FHAA 1RPXA 4RV8A 4IPJA 2A6NA 5KZMA 1PS9A 3BK0A 1EEPA 1LTDA 4LS1A 2EF9A 2YW4A 3HJZA 4JTLA 1RD5A 3N34A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4QIS A;  3B0P A;  3DBP A;  4OQV A;  1HNY A;  4O19 A;  1EXP A;  2VTF A;  3NL2 A;  1ML1 A;  1I2O A;  4JTI A;  2CBJ A;  1Y5W A;  4KRT A;  5F1V A;  4B3Z A;  3POC A;  1K8X A;  2OQL A;  2QMJ A;  3Q2D A;  4R7W A;  3DG7 A;  4J2M A;  3NZP A;  2DV0 A;  3M0X A;  1BVW A;  2ZCG A;  1BGG A;  2ZX5 A;  4D6D A;  2ANU A;  2VEN A;  4Y2W A;  5TIM A;  1TRI A;  3GLC A;  3GC4 A;  2CHO A;  2X41 A;  2BXY A;  3WQE A;  3SSZ A;  1OCQ A;  3QV8 A;  9XIA A;  4OIF A;  1OEP A;  3L5L A;  5AYX A;  5CC6 A;  3APG A;  5A8O A;  1GHR A;  4LSB A;  1XYC A;  1ZBV A;  4W5U A;  2QCL A;  1YW1 A;  3FGC A;  4IMA A;  4XK2 A;  4AHP A;  3O6Y X;  1XBY A;  3SN1 A;  4JNY A;  2IMR A;  1EGZ A;  1O4U A;  4F9D A;  3PG8 A;  3SQL A;  1FP9 A;  1M04 A;  2F6K A;  1IWA A;  2XGZ A;  3OG2 A;  3R0K A;  2A79 A;  4HJW A;  4TXE A;  1WAW A;  4DJD A;  2GVE A;  4HPJ A;  3P8I A;  3P61 A;  1KTB A;  1XSJ A;  4HYV A;  1Q2R A;  5AHI A;  1G9H A;  4GX9 A;  4AWU A;  2PP1 A;  3GVW A;  1JPM A;  1GVR A;  4ZQC A;  2PDI A;  4S3J A;  5CJM A;  1Q7M A;  2HPM A;  3ZVH A;  1XLA A; 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