5D8WA

Structrue of a lucidum protein
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
LQFAGVNIAGFDFGCGSDGTCNASGAWPPLTQYYGADGAGQMKHFVDDDGFNVFRLPVGWQFITDGVAGGDIDEDNWAEYDALVQACLDAGASCIVDVHNYARFNGEIIGQGGPTNQDFAALWSSIAAKYADNDKIIFGVMNEPHDVPDINLWADSVQAAVTAIRQAGATSQIILLPGNNWTSAETFVSNGSADALKKVTNPDGSVTNLIFDVHKYLDSDNSGTHEECTTNNIDNAWAPLAEWLRCNGRQAFNTETGGGNVASCETFMCQQVAYQNANSDVFLGYVGWAAGNFYQGYVLGEVPTDTNGVWTDTALVSACLAPNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Ganoderma lucidum
publication title Functional and structural analyses of a 1,4-beta-endoglucanase from Ganoderma lucidum.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase
total genus 112
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5d8wA00
3B9EA 2VZVA 3TTSA 2E40A 1CLVA 4EK7A 4J3TA 4F9DA 2GJXB 3AIWA 4MPKA 1K9FA 1WNOA 4LXFA 4UFHA 3SCSA 3IAPA 4UCFA 1EHNA 3WD3A 5I0DA 2NW0A 4BQ3A 5AC4A 3OG2A 1V6VA 3WQ4A 2G3JA 2CBVA 2PWEA 2EO7A 3VGBA 1UKQA 5BRPA 1UHVA 2AMGA 4TOQA 4UZUA 3TTOA 3GDBA 5AYIA 1X6LA 4NRRA 1UD5A 3CHFA 1F4AA 1QNRA 3VIOA 3AI0A 1GUVA 1JL8A 3MU7A 4WLCA 4HA1A 2VJXA 1GONA 3POCA 1KBKA 1NM9A 4WIWA 5CLTA 2WSPA 2Y5EA 4TX6A 1TCMA 2UY5A 2V5CA 1EQPA 5A6LA 5A6BD 1B1YA 2QMJA 3WQVA 6CGTA 3EDFA 1KXHA 1UD3A 5A6SA 1BVZA 2ZXQA 1GOKA 2Y8KA 3CHDA 1KCKA 4GKLA 4MNMA 1ZBVA 4MB5A 4ATWA 1SMAA 3W24A 1J10A 4CD6A 1B3VA 4HMEA 3ARVA 4KRTA 3OBAA 4K68A 4CCDA 1AQ0A 4M29A 3K8LA 4Z2GA 3AMGA 1LF1A 5AYBA 3SCVA 1SFSA 4AZ7A 1RD6A 2C8NA 2O9TA 1JYNA 1BF2A 4AZIA 4MAVA 4H8HA 4H8VA 4N42A 2VCCA 3PZ9A 4PTMA 3WNMA 1B9ZA 1WO2A 3ALGA 1J18A 1HP4A 1JD7A 3DYPA 4MJ4A 3CZLA 4E8DA 1E72M 2D22A 2J78A 3SUUA 3AMDA 2PWDA 4DM2A 1JI1A 4P7LA 2XG9A 3WNPA 1EDGA 5I3DA 4TVUA 1ZB5A 1H3GA 2VX6A 1M03A 2UY4A 1DWIM 3W0KA 1V3LA 1D3CA 5A2BA 1E6PA 2VNCA 2ZX5A 5BYWA 5JBDA 4Z2LA 3WUBA 1UH4A 4CCCA 4AXNA 1ESWA 1HKJA 4WJXA 3WBEA 1GW1A 2RGLA 2XVKA 2G41A 3CUHA 1CXHA 1UD6A 3GXMA 4QLKA 3FAXA 1W2VA 2D3NA 5ABHA 1JF6A 1LG1A 1BSIA 1A47A 1W9PA 2YLAA 1FOBA 4V27A 2WVVB 1MXDA 1KCLA 2ZUTA 5CJ5A 3N15A 3S6TA 4PSRA 3RILA 1QW8A 5IXEA 4AD1A 1ZJBA 2VZUA 1GVYA 3VOCA 4J27A 3WMCA 1EIBA 1MFVA 3GXIA 3W29A 3AJ7A 4AEEA 1QVBA 3ARQA 5DFAA 3I3DA 2WLYA 3RJYA 1BG9A 4UQ9A 1AQMA 3WQ6A 2DSWA 3WD4A 1NWRA 3CPUA 1C7TA 1KGWA 2J74A 3JUGA 3FNDA 1WE5A 5DEZA 4KRUA 1BYAA 1H1NA 3OIHA 3WUEA 3UERA 3VILA 3UETA 4D6FA 3VD5A 2DGAA 1LWJA 3WDQA 3BLPX 3VDCA 4ZE5A 4AD4A 4JFUA 4MAZA 1E4LA 2WHLA 1E70M 3AHZA 3AIVA 1R85A 4H41A 2XTKA 2V5DA 3MSGA 3CLWA 2EXOA 3OZOA 4OUEA 2GDVA 4ZXLA 4WSKA 4PCSA 1JDAA 2DSKA 3MMDA 4R5EA 3CUIA 2A3EA 2ZE0A 1V3HA 4CCEA 5I78A 1XGZA 1UWIA 5IFPA 2WVVA 4PMDA 2IXVA 1CECA 3CHEA 3AS0A 2VZTA 1QNPA 3DECA 1IV8A 1G1YA 1B3XA 3AHYA 4ATDA 1JZ5A 1XV8A 2ZUSA 1CGUA 3MO4A 2BVYA 3HJEA 3WMSA 2YBTA 1OGGA 1M01A 3EYPA 3SCTA 3WD2A 3FN9A 2WKLA 4J3SA 3WH5A 3B8SA 5A2CA 1FHLA 1VAHA 2UY2A 5A6MA 2BV9A 3VMOA 3SUTA 5EFFA 1VFFA 1ZBWA 3AYSA 1JFXA 2ESCA 3HMCA 1J9YA 4M56A 2YLLA 4BS0A 4ZFMA 4HU0A 1OIFA 1B2YA 1PZ2A 3ZJ7A 1TUXA 2VZOA 4GZJA 5ABEA 3AHTA 1CYGA 2V3DA 1CXFA 2EQDA 1WDPA 4HA3A 4TTGA 5CPSA 1XCWA 4X0VA 3AS3A 1OCQA 1WKYA 3OLEA 1B3YA 4GPNA 1GZJA 3NUKA 4W5ZA 1QBAA 1CPUA 1HP5A 3MKKA 2DSUA 1OB0A 4PMVA 4CU8A 3W6LA 1XD1A 2XPKA 4ZEPA 2W61A 1HKKA 5I24A 2VOTA 1E43A 1G01A 4AZHA 1KB3A 2DEPA 2RGMA 2DSVA 3CTTA 2Z1KA 3U57A 1FP9A 1HJVA 1R7AA 4J7RA 3E1F1 2QPSA 1UWTA 2WKGA 3NSNA 1WZMA 2ZWZA 4JKLA 2J8GA 4U31A 4HU8A 4W7VA 5CPTA 1Z32X 4AISA 3KL5A 1DEDA 1UKTA 1SYTA 2JEPA 4JCMA 4PBGA 2VRJA 2OYLA 3WF3A 2XVPA 1XH2A 1IZJA 1XRVA 1LQ0A 1PX4A 4IPNB 2J7GA 3VIMA 5I77A 1GJUA 1JYXA 3VTRA 2CNCA 2XVLA 3CMJA 3ZJ8A 4IM4A 2WCGA 3MV01 1V6XA 1LJYA 1OGBA 1UR0A 4W89A 5A69A 1OINA 4U2ZA 5CLWA 2ZX8A 1JAEA 1ITXA 4LX4A 3PZTA 3A47A 3A6OA 2EPOA 4X9YA 2ZICA 3KZSA 3TOPA 2O9OA 1E5JA 1ISXA 1GOQA 3VGGA 3CMGA 1LL4A 1PAMA 1I1WA 3VM7A 3CUGA 4XZBA 2QMKA 4HZ8A 2BHZA 1PX8A 5LYRA 3SCRA 5HNNA 1UQYA 1LLOA 4X0NA 5A8PA 1MW2A 1WDSA 1FH9A 1MW3A 1OD0A 3WF2A 2WMJA 5M5DA 4LYQA 2QHAA 3AIUA 1U2YA 1GQLA 5A8OA 4PSPA 2ZX9A 3OLGA 3WH8A 5FL0A 3WQ8A 3ARZA 4QLLA 3A3HA 6TAAA 1EXPA 3G6MA 2ZUNA 3CZJA 1E6QM 3MV11 3VDBA 2FGZA 1WDRA 2VX7A 1BHGA 3KWXA 3WF0A 1SMDA 5C70A 2J7CA 3QGVA 3WEZA 3IJ7A 3NYDA 3LMYA 1BAGA 3SIMA 1CXIA 1GOIA 3PZOA 4XX6A 1R86A 4P7RA 3WFLA 1BGAA 3W26A 4Z2HA 3BAYA 4GI8A 1BPLB 1E4MM 1VJZA 3L4TA 4BCEA 5D8WA 3IAQA 1EOKA 5ECUA 4HOWA 4PUDA 3VMPA 3K1DA 1GQJA 1KWGA 1XH1A 2E0PA 1YHTA 2VVSA 1W9UA 4QLJA 2J4GA 5CSYA 1EHAA 3GNRA 5E0FA 5CSUA 3QHNA 2ZUVA 1K6AA 1W9DM 4U3AA 3MS8A 1J0IA 2A3AA 4U5IA 1KXQA 4GO9A 2VMFA 5HDRA 4UQAA 6A3HA 4HA4A 2YA1A 3AISA 1HXJA 1VEMA 1CXLA 3WQWA 1X6NA 3N9KA 4N0RA 1OD8A 2XIBA 1FFRA 1KWKA 1M04A 4AEFA 2C7FA 3VD7A 5KEZA 1IT0A 1PPIA 1KQYA 3ZIZA 1KXTA 3WNOA 5I6SA 1PX3A 1V3IA 2WB5A 3SCOA 2ZXBA 3WH6A 2WBGA 4FLQA 1V0MA 3DYMA 1W1PA 2FGLA 2WWCA 1D7FA 3ARWA 3W37A 1UA3A 1GVIA 1MXGA 2Y8VA 3T0BA 3WY1A 1L0PA 1D2KA 1DP0A 1UWSA 3QOMA 4UTFA 4HMCA 3SCUA 3EDKA 1UYQA 4HTYA 4D6JA 1E15A 4OIFA 1VJSA 4AMCA 4Z2KA 2IXUA 3VIGA 3WDPP 4D1JA 4CU7A 3K46A 4J3XA 1B3ZA 1V08A 1CENA 1QHOA 4Q22A 4KH2A 1FP8A 3AFBA 3RM8A 3VD3A 1V6WA 4MDOA 3BCDA 2VX5A 5A1AA 3A4AA 1SR0A 1UKSA 4UNIA 5FD0A 3F5JA 1MWOA 3WNNA 1F4HA 5FCZA 4M1RA 3WDJA 3DHPA 5LA0A 2J7HA 3PZNA 1UWQA 2QPUA 3ARSA 2DH2A 1W9BM 1KR1A 1A3HA 2FHCA 2WVSA 4PEEA 1W3KA 3SEPA 5CGTA 3CZEA 1GNXA 2WW5A 3RM4A 3S2CA 1ISZA 2OYKA 4QDMA 4P8UA 5HPCA 2XGIA 4D72A 1ZS2A 3EMZA 5A6AA 2WC3A 2J62A 2JALA 4Q7NA 1XD0A 3ZR6A 2VX4A 1CIUA 2V3EA 3VIIA 1FHDA 2EBNA 3W6MA 2UY3A 1FH8A 4S3KA 3NIYA 4IISA 4D6EA 4F79A 2XJ7A 1JYWA 1HX0A 4DWSD 3BGAA 1W3JA 1JXJA 3TA9A 2IUZA 4J3UA 4B16A 2X05A 4CD7A 8CGTA 3I3BA 4C7GA 1HN1A 4MADA 3KL0A 1XC6A 2D1ZA 3OGVA 3AHVA 2CKRA 1UZ4A 4GI6A 5D8ZA 1NOWA 3WENA 1W1TA 3OLDA 5GNXA 1N82A 4AZ6A 1E6NA 4TX8A 1W1VA 4GINA 2CXGA 3IK2A 5A94A 1E0VA 2JIEA 3M07A 2BNJA 4W84A 1OM0A 2BVDA 3AIQA 4AZ5A 4OBRA 3PTQA 3L4XA 2WMHA 1Q4NX 1I1XA 4J28A 4QCEA 4AIUA 2C0HA 5TD4A 1JNDA 3A4XA 5A8MA 1GHRA 2ZUWA 4CGTA 2D20A 4M80A 2EPKX 4BA0A 2BXYA 3VMNA 4TVDA 3PZUA 1RP8A 3ZJKA 1MW1A 1BVNP 1HVQA 2EPLX 4IUGA 3CUJA 3POHA 3PTMA 4C7DA 4B9YA 1VENA 3ALFA 2WMGA 4HP5A 4U5KA 1QBBA 2BS9A 4JL2A 1VBRA 1L8NA 1MQPA 2JF6A 4TUFA 1R8LA 3EMCA 2CPUA 4UFIA 1GORA 3BAJA 3AZRA 4MB4A 2PWGA 4MDPA 3VIFA 4KGLA 5D9NA 3GXFA 3WDHA 1M7XA 3AIBA 1JZ6A 1NQ6A 4M81A 3GNOA 2YDSA 1AMYA 2YL6A 1J0HA 3OLIA 4PRWA 3DHUA 3UCQA 3WUFA 4JFVA 4LQ1A 3ZR5A 1H0GA 2XHYA 1CEOA 1UD4A 3N12A 4AW7A 3TTYA 4HPHA 1XYZA 2CBUA 3T2PA 3W25A 1C3FA 3M46A 4KMQA 3VX1A 4RE2A 3VDHA 1EO7A 1Y7VA 1RP9A 1B3WA 4BQ4A 2CYGA 4FLSA 2YJQA 3VPLA 2WMKA 3PZQA 4Y7EA 3EDEA 2CIPA 2J25A 1XSKA 3K4AA 4W7WA 3VKKA 3PZVA 4JIEA 1EDQA 4UQCA 2Q8XA 3WH7A 3FW6A 1KFWA 2TAAA 4JZ5A 1UWUA 2EEXA 3ARPA 4JFTA 4ML4A 3AYRA 5BRQA 4J3WA 3RMEA 2PWHA 2X0HA 1DWHM 3MMUA 3ARYA 4WKAA 4B15A 2WC4A 1DWJM 1E6RA 2VRQA 2QF8A 1GQIA 1LWHA 4JKMA 3ZOAA 1O7AA 1WZAA 1GJWA 1ZL1A 1UD8A 1PBGA 4W8LA 2FHFA 1VEOA 1EGZA 2D24A 1U33A 4QP0A 4L4PA 1ODUA 2WZHA 3NJ3A 4GQQA 1R7OA 2FDMA 4WKFA 5AY7A 2WHKA 3EDJA 2VQUA 4HMDA 3J7HA 1K9DA 1V0LA 2VZSA 2XFYA 3KEHA 2WBKA 1UWRA 3N17A 1GOWA 1HL9A 2XSAA 2WZEA 4R27A 4A3YA 4F66A 1J12A 2WMIA 1Q6GA 2XFRA 3WFZA 3NCOA 3WF1A 1JXKA 3A4WA 2YKKA 3T2OA 5FL1A 3MUZ1 3BH4A 4OOZA 4W87A 2DQXA 4UOJA 2A3BA 4F9JA 2W63A 3WEOA 3B9AA 3II1A 5A95A 3CGTA 4MB3A 5CZKA 3QOKA 2YIHA 2J77A 3L4WA 5E6ZA 1H2JA 4RE3A 3WMBA 1ECEA 2CBJA 5DT5A 4URIA 1G5AA 1GPFA 4YHGA 3ZQ9A 1CDGA 3T0AA 1JZ2A 2J79A 4FMVA 2VURA 2DT2A 4DUVA 5EB8A 2YL9A 1C8XA 3AOFA 3GTNA 5KZ6A 2VI0A 3BC9A 1UQZA 1J0YA 5DMYA 2HISA 2WNWA 2CKSA 3FHAA 2DT0A 5BXPA 1NOFA 5CGMA 1TVPA 2DIJA 3F5LA 1M53A 5A6KA 1XSJA 3VDAA 3AMLA 2J7EA 1E55A 2VL4A 4TXEA 3SCWA 1U30A 3GZAA 1HKMA 3AQUA 1V03A 4U2YA 2VRKA 2E8ZA 4MNJA 1DWGM 1PEZA 1KR0A 2ZWYA 3ZT5A 1QOXA 2VO5A 3LPGA 3K8KA 4W86A 1NWTA 2QV4A 5GPRA 4UQBA 4FK9A 5EFDA 1AQHA 1G9HA 5E6YA 4CU6A 1B31A 3RO8A 3F5KA 4GO8A 1J01A 4PMZA 5HBFA 4GXPA 2WYSA 4HOZA 1ISYA 1HKIA 4FF5A 3QHMA 1UR1A 4PMOA 1C91A 1BYCA 4JCLA 1B30A 1JI2A 4H04A 4Z2IA 2ZX6A 4YHEA 4D6DA 4YN5A 4KWUA 3AS2A 1B90A 1XSIA 2X1IA 1TMQA 3GM8A 4P8XA 3EBVA 4GQRA 2VQTA 4D6HA 2BVTA 2XGBA 1XH0A 3U5YA 1IZKA 3VIPA 3SCNA 2EPNA 4DUWA 1QPKA 1H0IA 3F4VA 1HJSA 1WAWA 2E9MA 3WEMA 4AY1A 3WUGA 1C7SA 4CVWA 3AMCA 3NDYA 3ECQA 4E4PA 3SUWA 3D3AA 4NRSA 1HJUA 3WH9A 4FLOA 4GI9A 4PTWA 1CXEA 2WHJA 3FAWA 5CPQA 3WDIA 2JIWA 1E56A 2VTFA 2WM0A 3W53A 1JF5A 2PF0A 2A3CA 4MJ2A 2WHMA 3ARXA 3I3EA 1UR4A 1E0WA 2JFEX 1CZ1A 2O9PA 2XFFA 5A8QA 7TAAA 1CLXA 3WNKA 5EMYA 3WSUA 3VNZA 3BLKA 5IDIA 2B31A 2DT1A 4F8XA 1QNSA 1GOMA 3BAXA 4EAMA 1E0XA 1OT1A 2XIIA 4UR9A 1QW9A 4PMRA 1JD9A 3CUFA 1US2A 1V02E 4AC1X 2PB1A 3MMWA 1WB0A 3L2MA 4PCTA 4EE9A 5FOOA 2D2OA 1VBUA 2Y24A 5BWFA 1EOMA 2J7BA 4PMNA 2ZX7A 1UR9A 1E3ZA 1DHKA 3VIJA 5E0CA 3MANA 1K9EA 1WP6A 2G3IA 2W62A 3WN6A 1MQQA 2BXZA 1NWUA 3UG4A 2CITA 1W91A 2J47A 1JAKA 1QI0A 1J0KA 1QNOA 1V0NA 3LPPA 3B9DA 5D9OA 1DTUA 2G3MA 4ATLA 2YA0A 1KXVA 2W92A 3M6DA 3WNLA 2O92A 1CXKA 1LL6A 3L4VA 1XYFA 1C92A 4LYRA 3U5UA 3VGEA 5BXTA 1TVNA 4QFUA 4CN6A 2FH6A 2EJ1A 3WF4A 3ZMRA 1KBBA 5M03A 4XV0A 2E8YA 1VFUA 5JBFA 4H7VA 2DDXA 3OA5A 3VUPA 1HF6A 1HIZA 2F2HA 4TVCA 1CTNA 3TTQA 2X09A 4EKJA 3BAKA 4PTXA 4AIEA 5ABFB 1CGXA 3N13A 3QHOA 5A6JA 3ZSSA 4HZ6A 1GCYA 1OIMA 3N1AA 3IANA 5DO8A 4CVUA 1NWSA 2FH8A 1UG6A 5I23A 4NZCA 3PTKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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