5D8WA

Structrue of a lucidum protein
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
LQFAGVNIAGFDFGCGSDGTCNASGAWPPLTQYYGADGAGQMKHFVDDDGFNVFRLPVGWQFITDGVAGGDIDEDNWAEYDALVQACLDAGASCIVDVHNYARFNGEIIGQGGPTNQDFAALWSSIAAKYADNDKIIFGVMNEPHDVPDINLWADSVQAAVTAIRQAGATSQIILLPGNNWTSAETFVSNGSADALKKVTNPDGSVTNLIFDVHKYLDSDNSGTHEECTTNNIDNAWAPLAEWLRCNGRQAFNTETGGGNVASCETFMCQQVAYQNANSDVFLGYVGWAAGNFYQGYVLGEVPTDTNGVWTDTALVSACLAPNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Ganoderma lucidum
publication title Functional and structural analyses of a 1,4-beta-endoglucanase from Ganoderma lucidum.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase
total genus 112
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5d8wA00
4S3JA 3GH7A 1WAWA 1UA3A 2VRKA 1TUXA 3O9NA 2WZIA 2UY3A 2VX7A 2TAAA 1KXTA 4UR9A 3FHQA 4ML4A 5A6SA 1H11A 2CXGA 4CCEA 2G8ZA 3TTYA 3W82A 2JALA 3N18A 2VZUA 1KFWA 1GHRA 1QNPA 4NF7A 2ZUUA 4H8UA 3WH8A 1DP0A 5E9AA 3WQWA 4KGJA 5AYBA 2PB1A 4CU7A 1VRXA 3BMVA 2J25A 2ZUMA 3AIRA 1W9PA 2X0YA 2XIIA 5A8PA 4P7NA 5M17A 1J11A 1X6NA 3ARXA 4CD5A 3SURA 2FH6A 1XH2A 2ZX9A 1GJUA 3NSXA 3OA5A 3VNZA 2YA1A 1JZ3A 5DFAA 3T09A 3CZ8A 2C0HA 1H49A 1OD8A 1GOWA 1WB0A 5FL1A 3FNDA 3VGGA 4RE4A 2J78A 4AZHA 5HXMA 3NIYA 1J10A 4W88A 1OIMA 2J74A 4AZIA 4AD0A 4U3CA 1E0XA 4HOWA 5HDRA 1HIZA 1UHVA 4W8LA 1V6XA 3VOCA 1CLXA 1E55A 1JDAA 3OLIA 4MB4A 1PEZA 2D0FA 4WK9A 1H41A 2CHNA 2WWCA 4MDPA 5CGTA 2NSXA 3WN6A 1OT2A 1CENA 3RM9A 4W93A 4NRSA 4W84A 4U3AA 5C70A 2Y5EA 3ZJ7A 1ZB5A 1B30A 3QOMA 1KB3A 4U5KA 2VZOA 4CCCA 4HP5A 2EPLX 2CERA 5DF0A 4WKAA 3EDKA 3VU2A 2PC8A 1VFOA 4W86A 1J0YA 2FGZA 2O92A 1V0NA 2EPKX 1GUVA 1JIBA 1RH9A 2JIWA 1EDTA 1HKIA 2UY5A 3BC9A 1QNQA 1E56A 3RIKA 1FH7A 3VMNA 3GNRA 1UKQA 1UOKA 2RGLA 2XVKA 3AXXA 1DWHM 1MXDA 2PI6A 1QW9A 3N1AA 4P7OA 3KL3A 2WVSA 3M6DA 1JAKA 1ESWA 3PTKA 2PWHA 2D2OA 2ZX8A 2VO5A 5BYWA 1VEPA 2VZVA 3EMQA 3WL0A 3CUFA 4P7RA 3AS1A 4CN6A 4CGTA 1RP8A 4H41A 5CPQA 4D71A 2ZE0A 1E71M 4MJ4A 2VR4A 5BXRA 1DWIM 2XM1A 3FAWA 3GH5A 1CZ1A 4KMQA 2WMJA 1LWJA 2J75A 3CIVA 2CHOA 1B9ZA 1XD1A 1TA3B 1XH1A 4AZ7A 4PMRA 1C7SA 3WEOA 3U7BA 5GNYA 2EJ1A 4R27A 2GJXA 3ARQA 1VBRA 1UR0A 1CYGA 2QMKA 5A3HA 4GI8A 3WH5A 2WMGA 3CUHA 1EQCA 1UZ1A 1W1PA 2VRQA 1WZAA 4JKKA 5CJ5A 2FHFA 3O2LA 5C8BB 2BHUA 1E5JA 3NJ3A 1NH6A 1IV8A 3WUFA 1HX0A 2OWWA 2V3FA 3DECA 3K8LA 1EO5A 4CD6A 3SUTA 4BQ4A 5CZKA 5M03A 5BCAA 5FIPA 1B3WA 3MMDA 1BG9A 4PSPA 1LWHA 1MFUA 1SFSA 2ZX7A 2XG9A 3IK2A 4B16A 2J4GA 2E40A 3VGEA 3BXWA 4NZCA 1CGUA 1CXIA 1ISXA 1JG9A 3WMCA 1C91A 1V6YA 3AXIA 1GQJA 4D6FA 1W3JA 5D9OA 2EPMX 1XV8A 3EMZA 3EDDA 1V3MA 3AHZA 5IHSA 1R7OA 1ISVA 3CO4A 3RM4A 5KEZA 3THCA 4W85A 3WF1A 2J8FA 1DWGM 1QI5A 5GPRA 4L4PA 1KXVA 4WIWA 4J3UA 3W6MA 4J3XA 2CITA 1J01A 3N13A 4ACYA 1GJWA 3CMJA 4QLLA 1E15A 2DQXA 3AOFA 3EDJA 3VIKA 1B3XA 4CCDA 3WNNA 1JZ8A 1JFHA 4ATWA 1Q6GA 3A4XA 4ATDA 2V3DA 5HBFA 2A3EA 2GK1B 1GPFA 2JFEX 1JDCA 4KH2A 1IT0A 5GQBA 1CWYA 2D22A 1E4LA 3G6MA 4W89A 2VX6A 4OIFA 1W1TA 1QHZA 1HT6A 2X0HA 3CHEA 4E8DA 3LPGA 1K9FA 1Y7VA 4HMEA 1FFRA 2E3ZA 1MQPA 1BTCA 3GNPA 2CBJA 5E70A 3VD3A 5DT5A 1MW1A 1UH4A 3VGFA 3WBEA 2CKSA 5A8MA 1GONA 1U33A 2YBTA 4P7LA 3SCNA 1BG4A 5C71A 1EOKA 1QBBA 2V5DA 4DM1A 1GORA 2AOSA 4HOZA 1UKTA 1HL8A 3HJEA 1E70M 1QBAA 3WF3A 3GTNA 2WMIA 1M53A 2W67A 4MADA 4Q7NA 1JYVA 4QLJA 4UFHA 5LA2A 1BGGA 4UQDA 4XZWA 5A8OA 3WH9A 3AIUA 3WDQA 5LA1A 1FH9A 3S2CA 5TD4A 1HVQA 3VMPA 5AC4A 1WZLA 5I0DA 3PTQA 1TCMA 5LYRA 3LPOA 3L2MA 4H7VA 4OOZA 4GZEA 4HZ6A 3L4WA 1HJWA 2XFRA 5CGMA 4GI9A 1PIGA 2F2HA 4QCFA 1C93A 5A8NA 2CPUA 1PJ9A 3CZEA 4PCSA 3BH4A 1ITXA 2B31A 5EMYA 1BQCA 1E0WA 6TAAA 2O9PA 2V38A 4E2OA 2GDVA 3MMUA 1E6QM 1ZL1A 3CBWA 4CD4A 2DGAA 3RCNA 4J27A 5BXPA 4PMYA 3ALGA 3SCUA 5IFTA 4CVUA 4LQ1A 4B3KA 1V0LA 2Y8KA 1CXKA 1UG6A 3VD7A 2VC9A 4PBGA 5I79A 3A6OA 5DEZA 1UR1A 3VMOA 3CUIA 1XCXA 1CGWA 4PMZA 4M8UA 4WKHA 1H0GA 3AXHA 3SEPA 1E9LA 3SUWA 4IM4A 4FLOA 5CPSA 2D3LA 2D0HA 2ZICA 2GJPA 3PZIA 3MSGA 1EHAA 2C8NA 1BVZA 1K9EA 6A3HA 1I75A 1ECEA 1HL9A 4UZUA 3N04A 3NYDA 1NWTA 1KCKA 3WY1A 8CGTA 1EHNA 3BAIA 1E1EA 1AQ0A 3VIJA 3GXIA 3ZR5A 1OB0A 2J79A 3IJ8A 4TX8A 4YHGA 2W61A 3DYMA 5AY7A 1JD9A 4A3YA 3ARRA 3A4AA 1UQZA 5I77A 3WNMA 1V6VA 5I6SA 4TUFA 3VTRA 2GFTA 1PAMA 5CSUA 6CGTA 4JCMA 3N11A 3L4UA 1CXHA 1J0KA 1G0CA 1UD5A 2WM0A 2PWGA 2UY2A 1XYFA 3SCPA 3BAXA 2WKGA 2VT0A 3ARSA 2WZEA 4ACZA 1V3LA 2WBGA 3AFBA 2FHCA 4TVUA 1ZBWA 3AROA 2G3JA 3RJYA 3WFZA 1HJQA 4OBSA 3TTQA 1DHKA 3ARYA 5LA0A 4S3KA 2DPEA 2DSWA 1OSEA 1TR1A 1JZ7A 2A3HA 4JL2A 3S6TA 4AIEA 2VL4A 4PMVA 4OUEA 4V28A 2IXVA 1UUQA 4AEEA 3DHUA 4PSRA 1WDSA 3CHFA 3ARUA 1FA2A 1K9TA 1JZ5A 4GI6A 1V3HA 5FCZA 4HU0A 1UWUA 1XHGA 3AHVA 1E6ZA 3ZOAA 4AZCA 1W2PA 1EDGA 3AYSA 4GINA 3GBDA 3ZT7A 1QI4A 3WDIA 3K46A 1OGBA 5HPCA 2CBIA 3FY1A 4FMVA 3BAKA 1VFFA 3AISA 4D6GA 2WVVB 5A6LA 5D8ZA 1ITCA 1GCYA 1VEMA 4JKLA 4DUWA 2J62A 2PWFA 3VIPA 1W2VA 4GO9A 3A47A 4PCTA 3B9AA 4H8HA 3BCDA 3U5YA 3VM5A 1TZ7A 5ABHA 1HJUA 1PIFA 2G3NA 1O7AA 3RJXA 3PBGA 2QPUA 3AMGA 4Z2HA 4RE3A 4MDOA 5E0CA 1NP0A 4GXPA 1GVIA 3I3DA 1C3FA 3CZJA 2W5FA 4X0NA 3PZ9A 4UQBA 4FLRA 5D9MA 2YBUA 2YL5A 3WEZA 5JBDA 4J3TA 3O6AA 5A6BA 4UQAA 4DM2A 1E6NA 1NWUA 1RP9A 5CSYA 5ABEA 5F7UA 4UZSA 3RDKA 1MVYA 2VJXA 3KL5A 2WKLA 1H4PA 4AZ6A 3WDRA 2PF0A 2WXDM 4P7QA 3F4VA 3A3HA 4NSBA 3U57A 3MO4A 2BVYA 1CPUA 1PX4A 7A3HA 5E09A 1F4AA 3BGAA 3K8KA 3L4ZA 4TX6A 1LL6A 2ZOXA 3L4YA 5FL0A 4QCEA 3WF0A 3AIWA 3VIFA 4Z2IA 4UTFA 2WB5A 4CKQA 2J7BA 2G3IA 2E8ZA 3POCA 4Z2GA 1CTNA 4XB3A 5A69A 1H2JA 2D24A 2J7EA 2XVNA 2WHKA 3PHAA 1V08A 4J3VA 1GQIA 4C7DA 3FXYA 5A2AA 1FFQA 5CLTA 2WZHA 4UQEA 1ISWA 1KWKA 3WD1A 2D0GA 5I2UA 4PEEA 2WMFA 4LYPA 2VRJA 1UWIA 1GHSA 3T2QA 1WZKA 4PYSA 2BY0A 5A6JA 1KWGA 3BLPX 3HN3A 4F9DA 1UWQA 3ZSSA 5I78A 2J8GA 5GNZA 1WZMA 3WUEA 7TAAA 1WE5A 2A3BA 3SCQA 1G94A 5JUVA 1C90A 2XWDA 3VX1A 3ZJKA 3ZJ6A 3UG5A 1K9DA 3VD9A 4ZFMA 2FH8A 1OINA 2EPOA 1OD0A 1G1YA 2GVYA 3KWXA 1NARA 4EK7A 1Q6EA 1MW3A 2V3GA 1EO7A 1B90A 1TE1A 2OSYA 1BYCA 1NWRA 1WDRA 1C8QA 1B0IA 1EIBA 1E43A 1PBGA 3AHXA 1GVYA 2XFYA 3W29A 3WD4A 4UQ9A 4TTGA 3IJ9A 1B1YA 2DEPA 3AS2A 1CGTA 1RD6A 4BS0A 3DC0A 3AIQA 1VEOA 3EDFA 5E0FA 2JF7A 2DT3A 3OLDA 4W7WA 4ZE5A 1E5NA 4JZ5A 4HTYA 2WNWA 3QHNA 4AZGA 4JHZA 4BQ3A 4OKDA 2QF8A 4XZBA 3L2LA 1H09A 3UR8A 3ZSTA 3LPPA 1WKYA 2ZUWA 3SCWA 5M3WA 2CIPA 4OJYA 1E4MM 4CN4A 2W63A 2Z1SA 2VURA 1LL7A 4WLCA 3MUY1 2NT1A 1BF2A 2WHMA 4U2YA 1L0PA 3W6LA 4PMUA 3W26A 3WMBA 4JHOA 3F5LA 5EFDA 4QP0A 3N9KA 1G5AA 4PTMA 3KEHA 2NW0A 4YHEA 1BLIA 1JGIA 3VILA 1HP5A 3QHMA 5AC5A 1HJVA 3WFLA 2WWDA 1E4NA 3WUBA 1F4HA 2BY1A 1W9DM 3CLWA 3NDYA 2CNCA 3BSGA 1V3KA 4AISA 4D6DA 2XWEA 3W28A 4J3WA 5BROA 1CLVA 4JL1A 4F8XA 1W91A 4HA1A 3W0KA 4BQ5A 1BHGA 4TTUA 2WSPA 3VIGA 2Y2WA 3B8SA 4B15A 3GZAA 3VO0A 4FLSA 1GQKA 2YA0A 1CXEA 4D6JA 4PMNA 1ISZA 5DO8A 4LYQA 3CZKA 4PRWA 3T2PA 4UOZA 3MSDA 3OZPA 3M07A 2QHAA 1Q4NX 1BPLB 3N12A 4MTVA 1CNVA 4F9JA 3K4DA 1JZ4A 3CGTA 4LGXA 3T08A 3GXDA 1R7AA 5JIWA 3AMLA 4MNLA 1WDPA 1AQMA 4WJXA 4W5UA 1WDQA 1MWOA 3HU7A 3OB8A 1UQYA 4AXNA 2VR5A 2ZUSA 2XGBA 1UD4A 1OWQA 3VDAA 3DYPA 3CPUA 4D6EA 5I23A 3GDBA 3EYPA 2EQDA 1MQQA 2Z1KA 4WSJA 4HA3A 1V02E 1J18A 1JI1A 3PZQA 3NDZA 1E6SM 4J28A 1E3ZA 2YL9A 1WPCA 2ZIDA 1L8NA 3I3EA 4TVDA 4BQ2A 3KZSA 2E8YA 1UR2A 4KRUA 4HZ7A 2OSXA 2XSBA 3WQ4A 4EAMA 1OBAA 2BHYA 3IANA 3CZGA 3WL1A 1XYZA 2MANA 4WSKA 1HF6A 2F8QA 2BY2A 3IAPA 4MJ2A 4PN2A 3AJ7A 4YN5A 3BAJA 1QI0A 5KZ6A 1G9HA 4UNIA 4UFJA 3WF4A 1V3IA 1W9VA 2J7CA 3SCTA 4AIOA 4GO8A 4AW7A 1R87A 3PZTA 1US3A 1QW8A 4BZYA 5FKYA 4C7FA 3AIEA 3AHYA 3NUKA 2PBGA 3OBAA 4Y7EA 4QAWA 3IAQA 4D6CA 3MV11 1FOBA 4H8VA 1MW2A 2W4XA 3WNKA 1PPIA 1HKJA 4UFIA 3CZLA 3LMYA 2W66A 2Y8VA 1QHPA 3T0BA 5D9NA 5EFFA 1XSJA 1J0ZA 2QMJA 2XVGA 2VOTA 4AY1A 5A8QA 4JKMA 4QFUA 3WH6A 2CYGA 1A47A 1BVNP 5IFPA 2DSVA 1ISYA 4WF7A 1E72M 4FF5A 1Q6CA 3MUIA 2CBVA 4PTWA 3LPFA 4R5EA 4MNKA 1EH9A 4DWSA 2VQUA 3OLEA 3TONA 5IDIA 2ZUNA 3TP4A 4W8AA 1JXKA 1E0VA 2Y4SA 1YHTA 1M01A 3UEQA 1UKOA 1Z32X 2XHYA 1I1XA 2YOCA 4IUGA 4AMCA 2CKRA 1NQ6A 1PZ3A 2WVUA 1X6LA 3M46A 1JFXA 4MNJA 4FK9A 2DH3A 2DIEA 4M29A 4W7VA 3W24A 3GM8A 2V5CA 1GOKA 3IJ7A 3UR7A 4F79A 1SR0A 1TVPA 1QI2A 3SCOA 4JFTA 2OLHA 2A3AA 1ZBCA 1D7FA 5A2CA 1W1YA 1CGVA 2WPGA 1E6XM 4PUEA 3T0DA 3WSUA 3BAYA 1V6WA 1AMYA 4H2CA 2XUCA 3GXFA 3ARZA 5A95A 4B3LA 1C8XA 2GJXB 4AZBA 1LF1A 3EBVA 2WANA 1EXPA 2X1IA 1TA3A 2DSKA 1XD0A 2DT2A 1KGXA 1NOFA 2ZXQA 4UFMA 1JYXA 4F66A 2YL6A 1G01A 1J12A 3L4TA 4CD7A 4WKFA 3UERA 3VKKA 2BNJA 1BYBA 1W3HA 3AMDA 2XPKA 1EOMA 1FP8A 3ZMRA 5BXSA 5ABGA 3K8MA 3KE0A 1ZBVA 1NWSA 2VQTA 4OOUA 1N82A 4ZEPA 1J9YA 4P8WA 2E9BA 3WMSA 2QPSA 1J0IA 1KXQA 4LXFA 4HOXA 1BSIA 3QHOA 5I5RA 2G4FA 3PZGA 3CH9A 2WHJA 2VCAA 4P8VA 4GZIA 3WD2A 1MQRA 3FN9A 2CETA 3MV01 2WMKA 1E6PA 5A6MA 3AS3A 2O9OA 4HMDA 1XGZA 3RMEA 4DUXA 2XJ7A 2WC7A 1H1NA 1H5VA 2CESA 2YLAA 1UH2A 1WNOA 3QR3A 3TTSA 2GJRA 1HKKA 2ZX5A 3OGSA 4D6HA 4W8BA 3U5UA 2WAGA 1QNRA 5D8WA 1LG2A 5JBFA 3CUGA 4CN1A 1NP2A 1CIUA 2UWFA 3W53A 5DT7A 2JEQA 5E6YA 2ESCA 2VI0A 4IPLA 3VD5A 1BYAA 2E4TA 2NT0A 3WUGA 2CBUA 1TMQA 1B2YA 3T2OA 2QV4A 3CTTA 4PMDA 2VZTA 3TA9A 3CUJA 3EMCA 2XSAA 2WVTA 2EEXA 1W32A 3FHAA 2WW5A 1QNOA 3T0AA 1JDDA 2X8RA 3BAWA 3QGVA 1QHOA 4OZOA 1PX3A 4NRRA 3VIMA 3N17A 1XC6A 3K1DA 4HPHA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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