5E0CA

Structural insight of a trimodular halophilic cellulase with a family 46 carbohydrate-binding module
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
531
structure length
531
Chain Sequence
QTDIQSYVADMQPGWNLGNTFDAVGDDETAWGNPRVTRELIKTIADEGYKSIRIPVTWENQMGNAPDYTINEDFFSRVEQVIDWALEEDLYVMLNLHHDSWLWIYNMEHNYDEVMAKYTALWEQLSERFQGHSHKLMFESVNEPRFTRDWGEIQENHHAFLEELNTAFYHIVRESGGSNTERPLVLPTLETATSQDLLNRLHQTMKDLNDPNLIATVHYYGFWPFSVNVAGYTRFEEETQQDIIDTFNRVHNTFTANGIPVVLGEFGLLGFDTSTDVIQQGEKLKFFEFLIHHLNERDVTHMLWDNGQHLNRETYSWYDQEFHNMLKASWEGRSATAESNLIHVRDGEPIRDQDIQLHLHGNELTGLQVDGDSLALGEDYELAGDVLTMKADALTALMTPGELGTNAVITAQFNSGADWHFQLQNVDEPTLENTEGSTSNFAIPAHFNGDSVATMEAVYANGEFAGPQNWTSFKEFGYTFSPVYDKGEIVITDAFFNEVRDDDIHLTFHFWSGEMVEYTLSKNGNHVQGRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insight of a Trimodular Halophilic Cellulase with a Family 46 Carbohydrate-Binding Module
rcsb
molecule keywords Cellulase
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. bg-cs10
total genus 183
structure length 531
sequence length 531
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
A PF03442 CBM_X2 Carbohydrate binding domain X2
A PF18448 CBM46 Carbohydrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5e0cA01
1W3HA 1CGUA 1X6LA 2YL6A 1HKMA 3W27A 1E6PA 4YPJA 3AXXA 1VFOA 4HA1A 3TONA 1CBGA 1CXLA 4H04A 4U3AA 2J8GA 3FAWA 1GOKA 1UG6A 3KL5A 2YL5A 4PCSA 3VIJA 3AOFA 1OIFA 3GYCA 2D2OA 1CIUA 3RO8A 3VKKA 3CZEA 2WVSA 1CGXA 2YL9A 4AEEA 4QAWA 1QNSA 4KGLA 3WF2A 4Z2HA 1SFSA 4OUEA 1GJUA 5M03A 1GHRA 1W9DM 5F7UA 3BGAA 3B9DA 1ISXA 2VR5A 5A6LA 3ARWA 4HMDA 1OD0A 3HJEA 1RP8A 2UWFA 2WSPA 3W81A 3II1A 1GQLA 2CNCA 1V6YA 3FHQA 2CERA 1UH3A 5CPTA 4JIEA 1JYVA 3CUGA 3FW6A 3CZGA 4LYPA 1JAKA 1NWTA 4M80A 1VIWA 3UERA 4EANA 1PAMA 1JZ3A 3SCUA 3WNNA 3JUGA 3AIBA 2A3AA 1XH1A 1GVYA 2D23A 4HPHA 2VL4A 2HVMA 5I77A 2BXZA 1VEMA 4ML4A 2D0FA 1GCYA 5ABHA 1JL8A 4GPNA 4DUXA 2PBGA 1JZ7A 3LPGA 2FHBA 2WLYA 1MQPA 4E8CA 1FP8A 4WKHA 1MFUA 1J9YA 5BRQA 1WB0A 3UCQA 1MW3A 5E6ZA 2UY5A 1Q6FA 2WYSA 2ZUTA 2QV4A 1I1XA 5FL0A 4KRUA 4OOUA 1KB3A 3CUFA 3GTNA 2PWGA 5CZKA 2DH2A 3ZJ6A 5CJ5A 2WKGA 1SYTA 3VNZA 1LG2A 3GXFA 4W86A 3A3HA 1Y7VA 3AXHA 4HP5A 1UWUA 2VZTA 2ZUUA 1AMYA 1W2PA 5BXPA 1OT1A 1R7OA 5FL1A 3PZVA 1ISZA 1PIGA 2G4FA 4D6GA 2WZHA 2ZE0A 4W7VA 1DWIM 3QOKA 5CLTA 1R86A 1EXPA 1MWOA 1ZBWA 2Y2WA 3G6MA 4DWSC 3VDBA 4L4OA 2V38A 1NOWA 1WP6A 1TR1A 4U5KA 1BHGA 4B3LA 1C7SA 1GONA 1UUQA 2WZIA 5A8OA 1HJUA 3VUPA 5I0DA 1ZB5A 3VMPA 3UG4A 4AZ5A 1ZJBA 2X09A 1BVZA 3AHXA 3OZPA 2GJXB 2XWEA 4ZEPA 3IJ9A 1J0KA 1PX3A 1BQCA 1V0NA 2EPNA 1OGSA 1ZBVA 1LG1A 1HVXA 4CU6A 1E4NA 3S2CA 1V6VA 2IUZA 3U7BA 5HPCA 3MV01 3WQ5A 3SUVA 1H11A 4M24A 1WDPA 4RE4A 2PBOA 4P8XA 3VMOA 3ZQ9A 2CEQA 4UR9A 2CHOA 2NSXA 2XM2A 1EHNA 4CD4A 1D3CA 1KBKA 3WQ6A 3GBEA 1AVAA 2YBUA 3D5HA 1V6UA 2DT1A 5I79A 3QOMA 3VO0A 2A3BA 2WZEA 4KRTA 2J7EA 5HNNA 2EJ1A 1UH4A 1CXFA 1PBGA 2XUCA 1QHOA 1VFMA 1OINA 1OT2A 2V3GA 1MVYA 1GOOA 1BYBA 4MNMA 1CXHA 1JZ5A 3IAPA 5ABGA 2O9TA 4AD2A 3MMUA 4GQRA 5CGTA 5DEZA 4W89A 2VX6A 3CLWA 3PTMA 4A3YA 1PIFA 3WH7A 4UNIA 3RJXA 2VCAA 4CVUA 1X1NA 1DWJM 3B8SA 1W91A 1V6XA 1R7AA 3BSGA 2NW0A 1LF1A 5A8QA 3J7HA 4ZFMA 3DC0A 1V08A 1HF6A 1JD9A 3AZSA 3ZR6A 4CN1A 3WH6A 2EXOA 2CITA 2WVUA 4ZXLA 4UQ9A 2CHNA 2GK1A 4U31A 1OSEA 3SUSA 4DWSB 3CGTA 4CD6A 4FLOA 3VPLA 1CXKA 2MANA 1XD1A 3EMZA 2ZX7A 4W88A 3L4TA 3GDBA 1UD6A 4NI3A 4OBSA 5CG0A 3MV11 1MXDA 3SCRA 5GQBA 2DSKA 4U33A 4CCDA 3A6OA 4AD0A 4E2OA 1NOUA 2V3DA 3NIYA 1E6QM 4XX6A 5A2BA 3W25A 5HXMA 3L2MA 2CKSA 2ZXDA 3ZR5A 1R8LA 3VDAA 4D6DA 1NWSA 2WMHA 4H41A 3U5UA 2WMGA 4XV0A 4ATWA 3WUGA 1VEPA 4WIWA 1TA3B 2D0GA 1ZBCA 1KXVA 1QI5A 2AOSA 1YQ2A 2VCBA 2X1IA 1CGVA 4PYSA 2OWWA 1IV8A 2BV9A 1JZ4A 4LGXA 3AFBA 4U3CA 3GXMA 5E70A 4QLKA 1W2VA 1TFVA 1M53A 3ARQA 5IHRA 4F79A 1CPUA 5IXEA 3POCA 5BXTA 3VINA 2VX5A 4J28A 3W6MA 1B9ZA 1HXJA 5CSUA 3PZTA 4HZ8A 5JBEA 3A4AA 2JFEX 3LPOA 1HL9A 4UTFA 4HOWA 4CKQA 2Y8VA 1ISYA 1CLVA 2BHUA 5KZ6A 4JZ5A 1DEDA 1KCLA 2PWFA 3EMCA 3WH8A 1VF8A 4UOJA 5CQ1A 4ACZB 4MJ2A 1UWIA 2WAGA 3WQWA 1QNRA 1O6IA 4M1RA 1W3KA 4PEEA 3AIQA 3W6LA 5A6KA 4EKJA 3VILA 2PB1A 2WBKA 3WF3A 3ZMRA 4C7DA 4HA4A 3W53A 3SCTA 4PMUA 3LMYA 5DT5A 2VX4A 1TZ7A 4NSBA 2DSUA 1E73M 1HJXA 1JDAA 4GI9A 5AYBA 3FXYA 2VOTA 4HMCA 1XSJA 4H8UA 3CH9A 2G3NA 5A6SA 2VCCA 3AMDA 1VAHA 2Q8XA 2D22A 1GQKA 3A4WA 3WDQA 4AZ6A 3F5LA 3DYPA 1FH7A 2YA2A 1VENA 4P7RA 1CLXA 1NARA 4JCMA 4UOQA 1ISWA 2G3IA 1EDQA 1UOKA 1JDCA 3WNKA 5E09A 5IFTA 3W29A 2BHZA 2GVYA 3WMSA 3WNMA 1EO5A 4Q7NA 2W92A 1QW9A 1UR9A 1AQHA 4GZJA 4HOZA 1ODUA 2WWCA 1KXHA 4GI8A 1W1VA 1E3ZA 1WZMA 4E8DA 2WCSA 2OWCA 1Q4NX 9CGTA 3SUWA 4FLQA 4CCCA 4TX6A 1EO7A 4MADA 1Z32X 2WHKA 3NSMA 3LPFA 1MXGA 5ABFA 1E71M 2BHYA 3WL1A 3OLGA 2J78A 3WEZA 2CBVA 2E40A 3WF0A 1UWTA 2ZUMA 1QI4A 1B31A 1B3XA 2QPSA 3CMGA 2GJXA 3T2PA 3RJYA 1KQYA 2BNJA 4U2ZA 2WVTA 1QPKA 3AQUA 3I3BA 5BWFA 4WKAA 3WKZA 4IPLA 4PTWA 1HVQA 3MS8A 4AZCB 4UFJA 1JFHA 2W91A 1MW2A 1UWSA 1WDSA 1XRVA 1VRXA 3WUBA 1V03A 1JIBA 1CTNA 5EBAA 3KZSA 5DMYA 5JIWA 3CZKA 3SCVA 1E3XA 4GZIA 3EDKA 2WC3A 3VD3A 4FMVA 2EPOA 4CD5A 5IDIA 2UY3A 2JIEA 2Z1SA 5E6YA 1HJVA 1QW8A 3MSGA 1GOMA 4W8LA 1PJ9A 2BY2A 4P7QA 4KH2A 1US3A 3RIKA 2AMGA 2G3MA 3WBEA 1JZ8A 3D3AA 1C90A 2FHFA 3W24A 5CPSA 3BLKA 4AD5A 4ZE4A 2E8ZA 1NH6A 4PTVA 1R87A 3M7SA 1XSKA 2WK2A 2XGBA 3UG5A 3AS2A 2ZXAA 4P7OA 2BVTA 4D1IA 3QHOA 2A3EA 1G01A 1UYQA 1C8XA 5C8BB 1VJZA 7CGTA 1V02E 4FK9A 3NYDA 2JE8A 2V5CA 4PMQA 1UQYA 1BFNA 4GINA 4MAZA 3PZIA 3DYMA 4AMCA 1HP5A 1FP9A 4UZUA 2DDXA 1NOFA 1V0LA 2ZXBA 1I75A 3CUJA 3T0BA 3T2OA 4W5UA 2OWXA 2ZUWA 1PPIA 5D9MA 1OGBA 3AMCA 4AZHA 2Y4SA 4PSPA 1C7TA 2YDSA 3WQ8A 4F9DA 2Y24A 3PTKA 1JZ2A 2XTKA 1QNPA 4TUFA 3AISA 3VM7A 2O9PA 2WVVB 3G6LA 1RPKA 1GHSA 1KXQA 3N9KA 4UQCA 3T09A 2FH8A 3KE0A 2E4TA 1QVBA 3GNOA 1UZ4A 2Y5EA 3ALFA 4FLSA 5A6BA 1C8YA 4D6HA 1M01A 1DWAM 4H8HA 4IUGA 4PBGA 4Z2GA 1QOXA 1OB0A 2VC9A 3ARXA 2GJPA 1E56A 1KFWA 4JFWA 2XVKA 2RGMA 2D3LA 3VIMA 3WMBA 1W9BM 1CGYA 1UHVA 4BA0A 3EYPA 2J7DA 4AXNA 2VRKA 4JL2A 2OSWA 3VGGA 1J12A 3A4XA 4J3TA 4PMOA 1V3JA 2ZXQA 5AY7A 2V5DA 2E0PA 1FFRA 1WPCA 1YHTA 2W67A 4AWEA 2J7FA 2XSAA 3HMCA 3ZSTA 1GNXA 2WHMA 2YBTA 3LPPA 2NT0A 3TOPA 1KR0A 1EDTA 1W9VA 1JI2A 2ZX5A 3WUEA 3OB8A 1NWUA 1MQRA 2JF7A 3L4ZA 4ZXOA 3RMEA 2F8QA 3L4XA 1E70M 3WEMA 5CXPA 4CN4A 1M7XA 5A6JA 3QHMA 3CO4A 2ZUNA 4B16A 4JFUA 4DM1A 3ZOAA 4AIEA 5BYWA 1XSIA 1BTCA 1EIBA 4PMNA 4QLLA 3NDYA 4D6JA 3RPMA 2PI6A 2WC4A 3B9AA 4JAWA 4ACZA 2D1ZA 2VZSA 4N42A 3BAWA 1EGZA 3PTQA 1EHAA 4A3HA 1N82A 2V3FA 1V3LA 3IJ7A 4EK7A 4DUVA 4JHZA 1E5NA 2WMFA 3QGVA 3WH5A 2PF0A 1WE5A 1H3GA 2OSYA 4MPKA 4TVCA 1DTUA 3WUFA 1JAEA 1ODZA 2W63A 3OG2A 4QFUA 3A47A 3TTYA 4PMDA 2J7BA 4URIA 4KMQA 3T2QA 1RP9A 1EOKA 2JF6A 4X0NA 1CXIA 1H0GA 1FFQA 3MO4A 3L4VA 1B30A 4HA3A 4ACYA 2D3NA 3OBAA 5LYRA 3N11A 4MNKA 3BXWA 4J3XA 1LJYA 3ZJKA 1UA7A 1UKPA 3VIIA 2W66A 2YIHA 1BYAA 4C7GA 1PX4A 4MTVA 2XM1A 3L4UA 4FLRA 2XVNA 4IISA 1B1YA 8A3HA 4LPCA 3WDHA 3HU7A 3UETA 3SURA 1AQMA 1XHGA 1JI1A 2YKKA 4TOQA 3CHEA 4NF7A 1XH2A 3AZTA 4AZGA 2W5FA 4JFTA 3AHVA 4NRSA 5I6SA 4PMYA 5I3DA 4OZOA 3QR3A 2VRQA 1XCWA 4F66A 1UH2A 4MB1A 2AAAA 3VOCA 4RL3A 2XSBA 3VGEA 1QHPA 3GH7A 2TAAA 4XZBA 4HPGA 1BSIA 2VJXA 3BSHA 1LL4A 2VZUA 1JXKA 2WPGA 4AC1X 4JFVA 1WDQA 1J11A 1BPLB 2XIBA 3QHNA 3BH4A 3WQVA 1H2JA 2JALA 5D9NA 1E5JA 1BGGA 4XZWA 4A4AA 2ZWYA 3SCOA 4QLJA 5FD0A 1QI0A 3CZLA 3RM9A 1XCXA 5BCAA 1D2KA 1QNOA 4P7NA 3N15A 1E4MM 2OYKA 3VD4A 3K8KA 4W7WA 4ZENA 1ZU8A 1QBBA 4PCTA 1GVIA 4R5EA 3CMJA 2ZUVA 3S6TA 4EAMA 4OJYA 3W28A 4LQ1A 3NCOA 2FHCA 1XC6A 3VGDA 1LWJA 4OOZA 3POHA 3T0AA 2OLHA 2J4GA 1CGWA 1HIZA 3W37A 1WDRA 1GW1A 5LA1A 4JKKA 1ZS2A 1E55A 3L4YA 4M8UA 3WL0A 3ARUA 3PZ9A 1E40A 3AJ7A 2D0HA 5EFFA 4IM4A 5EMYA 1CGTA 3VIPA 1CZ1A 2DT3A 4UCFA 2EBNA 1KQZA 4J3WA 2CBUA 5DT7A 3CZ8A 4HU8A 3MUAA 1PZ3A 1U33A 3T08A 3N13A 4WKFA 1W9PA 1EQPA 1JYXA 1VEOA 3TP4A 3AS3A 4V2XA 3W38A 1JF6A 3GM8A 3SUUA 3WFLA 5IHSA 1EDGA 2FGZA 2C8NA 4NRRA 1WO2A 2O9OA 3NJ3A 1E1EA 3W4RA 1V3IA 2XG9A 3HN3A 2WLZA 2BVDA 4CU7A 1OBAA 5I78A 4BQ5A 1UKTA 3FAXA 3VD7A 1EA9C 3WNPA 1MFVA 3CHCA 1BYDA 5M17A 1DHKA 1H09A 1K9FA 3AMKA 2O9RA 2J7GA 3L2LA 2JEPA 3BCDA 2VR4A 2DH3A 2J75A 1E15A 5M5DA 3EDEA 2DSZA 2WVVA 2XWDA 1GOQA 2IXVA 1L0PA 3BCFA 1XD0A 2J74A 1H1NA 3CPUA 3UEQA 2E8YA 8CGTA 1JG9A 3OIHA 5D8ZA 4WJXA 2V3EA 3VDCA 1UKOA 4UOZA 2D24A 3FY1A 1UD4A 4PRWA 4U2YA 2J7CA 2VI0A 1DWHM 1E0VA 5A69A 3PZGA 5A6BD 2CESA 1E6RA 1GOWA 1KGXA 3GXDA 4JKMA 1JNDA 1VJSA 2WW5A 1TUXA 3UR7A 1UD3A 4CGTA 3ZT5A 3W0KA 1LLOA 4AZ7A 5FOOA 2W61A 3U57A 5KEZA 4XUYA 3TTOA 5M3WA 4TXEA 3ECQA 4D6CA 3PHAA 4BCEA 1GZJA 3AHTA 1V0MA 5D9PA 3W82A 3WENA 1H49A 1NP0A 4DM2A 5GPRA 1M03A 3FN9A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1W3H A;  1CGU A;  1X6L A;  2YL6 A;  1HKM A;  3W27 A;  1E6P A;  4YPJ A;  3AXX A;  1VFO A;  4HA1 A;  3TON A;  1CBG A;  1CXL A;  4H04 A;  4U3A A;  2J8G A;  3FAW A;  1GOK A;  1UG6 A;  3KL5 A;  2YL5 A;  4PCS A;  3VIJ A;  3AOF A;  1OIF A;  3GYC A;  2D2O A;  1CIU A;  3RO8 A;  3VKK A;  3CZE A;  2WVS A;  1CGX A;  2YL9 A;  4AEE A;  4QAW A;  1QNS A;  4KGL A;  3WF2 A;  4Z2H A;  1SFS A;  4OUE A;  1GJU A;  5M03 A;  1GHR A;  1W9D M;  5F7U A;  3BGA A;  3B9D A;  1ISX A;  2VR5 A;  5A6L A;  3ARW A;  4HMD A;  1OD0 A;  3HJE A;  1RP8 A;  2UWF A;  2WSP A;  3W81 A;  3II1 A;  1GQL A;  2CNC A;  1V6Y A;  3FHQ A;  2CER A;  1UH3 A;  5CPT A;  4JIE A;  1JYV A;  3CUG A;  3FW6 A;  3CZG A;  4LYP A;  1JAK A;  1NWT A;  4M80 A;  1VIW A;  3UER A;  4EAN A;  1PAM A;  1JZ3 A;  3SCU A;  3WNN A;  3JUG A;  3AIB A;  2A3A A;  1XH1 A;  1GVY A;  2D23 A;  4HPH A;  2VL4 A;  2HVM A;  5I77 A;  2BXZ A;  1VEM A;  4ML4 A;  2D0F A;  1GCY A;  5ABH A;  1JL8 A;  4GPN A;  4DUX A;  2PBG A;  1JZ7 A;  3LPG A;  2FHB A;  2WLY A;  1MQP A;  4E8C A;  1FP8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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