5E0CA

Structural insight of a trimodular halophilic cellulase with a family 46 carbohydrate-binding module
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
531
structure length
531
Chain Sequence
QTDIQSYVADMQPGWNLGNTFDAVGDDETAWGNPRVTRELIKTIADEGYKSIRIPVTWENQMGNAPDYTINEDFFSRVEQVIDWALEEDLYVMLNLHHDSWLWIYNMEHNYDEVMAKYTALWEQLSERFQGHSHKLMFESVNEPRFTRDWGEIQENHHAFLEELNTAFYHIVRESGGSNTERPLVLPTLETATSQDLLNRLHQTMKDLNDPNLIATVHYYGFWPFSVNVAGYTRFEEETQQDIIDTFNRVHNTFTANGIPVVLGEFGLLGFDTSTDVIQQGEKLKFFEFLIHHLNERDVTHMLWDNGQHLNRETYSWYDQEFHNMLKASWEGRSATAESNLIHVRDGEPIRDQDIQLHLHGNELTGLQVDGDSLALGEDYELAGDVLTMKADALTALMTPGELGTNAVITAQFNSGADWHFQLQNVDEPTLENTEGSTSNFAIPAHFNGDSVATMEAVYANGEFAGPQNWTSFKEFGYTFSPVYDKGEIVITDAFFNEVRDDDIHLTFHFWSGEMVEYTLSKNGNHVQGRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insight of a Trimodular Halophilic Cellulase with a Family 46 Carbohydrate-Binding Module
rcsb
molecule keywords Cellulase
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. bg-cs10
total genus 183
structure length 531
sequence length 531
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
A PF03442 CBM_X2 Carbohydrate binding domain X2
A PF18448 CBM46 Carbohydrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5e0cA01
3I3DA 1DEDA 2D2OA 1WE5A 1M53A 2VI0A 5BCAA 4ACZB 2NT0A 1B90A 5IFPA 1B9ZA 1BVZA 4NRRA 2WW5A 3GH5A 4XZBA 4H8HA 3ZOAA 1UYQA 2W92A 2VR5A 2XPKA 3QOMA 4MTVA 2ZXAA 2OSWA 2EPKX 5HBFA 1ZBKA 3AMLA 1E0XA 1Q6EA 5D9PA 3PZUA 3VD7A 2WCAA 1W1YA 3OG2A 4LQ1A 2ZX7A 1LG1A 1CGYA 1V02A 1JDCA 1QI2A 1U33A 3WDPP 1JI1A 1QBAA 1C93A 1L8NA 3BH4A 4ZFMA 3L4TA 5FCZA 3D5HA 4W85A 2WANA 4CVWA 4U33A 4PMVA 4C7GA 1CWYA 2Q8XA 1E72M 4V2XA 4AZIA 2WC7A 5JBEA 1LWHA 1G0CA 1Q6GA 3AIEA 4W89A 3WDJA 2DGAA 3ZMRA 4KWUA 4TX6A 1XCXA 4HMEA 2VX6A 2XSBA 2WKGA 3NIYA 4J3VA 2WCGA 3WF3A 4HZ8A 3QHNA 2QMJA 1UR8A 2CIPA 1BYBA 3ARYA 4GIAA 1ITCA 1CNVA 1RH9A 4PMOA 1CLXA 2VT0A 1OIMA 3AIQA 2TAAA 5BWFA 3GYCA 1C90A 3K46A 4QLKA 4BZYA 1V6VA 4AY1A 3VIMA 4UFMA 4GPNA 3RO8A 1FHDA 1TA3A 2YL6A 1HNYA 1JZ8A 3L2MA 5D9OA 4CU6A 3BLPX 4CUCA 5AC5A 1UD2A 4U2ZA 3WFLA 2BXZA 1KQYA 5JBDA 2BVYA 3CMGA 1W9DM 1PX4A 2ZXDA 6A3HA 1W9UA 1MWOA 3SUUA 4DWSD 4UQBA 1M7XA 1D7FA 1LG2A 4IISA 4FLOA 1WP6A 4UFLA 3DHUA 1W2PA 3EBVA 1KBKA 4YHEA 1J0HA 3W6LA 4CN4A 1TR1A 2EPMX 3WD0A 1CGWA 2XG9A 3VO0A 1CPUA 4H8VA 4D6HA 3M7SA 1JYWA 4QLJA 1WDQA 4ATLA 1BYCA 4P7LA 4J7RA 4B16A 2D0GA 4OJYA 3MUIA 1W3HA 3FHAA 1C3FA 3VD4A 3CIVA 3BSGA 1KWKA 4AZBA 5EB8A 3PTKA 1EXPA 2W91A 3WKZA 1C7SA 5E9AA 1KCKA 4MAZA 1EOMA 3N04A 3VIPA 1OD0A 1XH2A 4GO8A 3CZLA 1E9LA 1UD5A 3AYSA 5DFAA 1MYRA 5E70A 1MFVA 2C0HA 1UOKA 3W26A 4JCMA 3KEHA 3PTMA 2OLHA 2EPNA 2DEPA 3MSDA 3VIJA 1M01A 4CGTA 2XHYA 3RMEA 1GORA 3AIRA 4UQAA 4AXNA 3W4RA 3SUSA 1XHGA 4CD5A 2Y2WA 1VIWA 1BQCA 1E40A 4U3CA 3WUFA 2IXUA 4M56A 2PWEA 4HU0A 2WSKA 2E8ZA 4WF7A 3UEQA 1E71M 4FK9A 4BA0A 3GXDA 4FMVA 4QFUA 4DM2A 1CEOA 2J47A 1ZU8A 1B3XA 2V5CA 5CXPA 1HL8A 1OB0A 2RGMA 1D2KA 3AZSA 1HKKA 4DWSB 1E6ZA 1ZJBA 1OCQA 1QNQA 3CHEA 2VC9A 2WHJA 5A6KA 1CBGA 3VMOA 5BXSA 3VIGA 3L4UA 2PF0A 1XYFA 2X0YA 1NOWA 1ISYA 4W8AA 3WEZA 1HF6A 4Z2KA 4JKMA 2ZUUA 2NW0A 2HISA 3SCVA 5EFDA 3GM8A 3WUEA 3AOFA 1JNDA 1QBBA 3AFBA 3IJ7A 4MB5A 1W9PA 1UWSA 3K4AA 1WZKA 1H4PA 1XH0A 4PN2A 5E6YA 4ZE4A 4M24A 4NRSA 3W81A 3TOPA 3BGAA 2NT1A 1IZKA 4B9ZA 3FAWA 3IK2A 3BAJA 4OOZA 5A2CA 1VF8A 1FHLA 4W7UA 2ZUNA 1BHGA 5GPRA 1ITXA 2XGIA 2VRKA 1VFOA 3CHFA 4GZIA 3ZJKA 4HPHA 3QOKA 2YBUA 4XB3A 5D8WA 3T0BA 4PCTA 1E4IA 4J28A 1ISXA 4JL2A 3L4WA 3OGSA 3PZGA 4NI3A 1C8YA 2Y8VA 1ODUA 1ZB5A 1VEPA 4ZE5A 1JYVA 3WH5A 4PTWA 2WMIA 5A94A 4P8UA 2OWXA 3AXXA 1E6NA 3WMSA 5A69A 4U3AA 1EQCA 3DYPA 3N18A 5CPTA 2FHFA 4AZCB 1DWFM 1E4MM 1UR0A 4TOQA 5A6MA 2CBVA 3MKKA 3ARSA 4QDMA 4KGJA 3RM9A 2BHYA 1PAMA 1E6QM 2BY1A 3MUY1 2GDVA 1ZL1A 3BLKA 3FHQA 4D6GA 2G4FA 3FN9A 1MFUA 5A6AA 2E3ZA 2WC4A 5A6BA 3THDA 3WSUA 2F8QA 4TXEA 3VDBA 2E9LA 2VX4A 4W87A 1FH8A 3UCQA 1PX8A 3S6TA 1Q4NX 1ZBVA 2DQXA 3WIJA 1EO7A 4BQ3A 1WO2A 5DMYA 1V03A 2BHUA 1UH4A 3WL0A 2O9PA 1OINA 2CKRA 1E6RA 5DO8A 1VBRA 2G3IA 1CXKA 2XVGA 3ALFA 2DT1A 1UWUA 2WPGA 1GONA 3PZTA 3HMCA 5EFFA 2PB1A 2ZXQA 3CPUA 1JZ6A 5I6SA 3WQWA 3M6DA 1WZMA 1B2YA 3WNOA 5I0DA 1AMYA 2J25A 2WMJA 1UA3A 4D6DA 4Z2HA 1GJUA 3WQ8A 2PC8A 3F5LA 1H5VA 5DT5A 3UR8A 1QNSA 5FL0A 4FLSA 4GQQA 1CDGA 2ZIDA 3A4XA 5CZKA 1JDAA 1AQHA 1TUXA 1JF6A 3TTQA 2YLLA 3WMBA 5A2AA 3W27A 3RDKA 1CECA 1M04A 2D1ZA 3AIVA 3WD4A 1R8LA 4HOXA 3VM7A 1A3HA 2YL9A 3NJ3A 1W9VA 1VENA 3ZM8A 1UQZA 2V38A 1KXHA 2VZUA 2XTKA 1NOUA 1I75A 3EDFA 5CPQA 3DYMA 2QV4A 5C71A 2WC3A 5A8PA 4NF7A 3W82A 2YOCA 1GOKA 4YHGA 3VD3A 3W37A 4ATWA 4J3SA 1QHPA 1TG7A 3EMZA 5CSYA 4OKDA 1J0KA 3PHAA 3PZOA 4HTYA 2GK1A 2QF8A 3BAWA 3EMQA 2BY3A 1C7TA 1BG4A 1LWJA 4UNIA 4F9DA 1VFUA 3SCRA 5BROA 2XVPA 3B9AA 1HJWA 2WMFA 1KQZA 4JCLA 3TTSA 3AXHA 2WAGA 3K8MA 5CGMA 1W32A 1E6XM 3IJ9A 4BS0A 1JI2A 3MANA 1W91A 4WSJA 2BV9A 2WVVB 2GVYA 4P8WA 3ARZA 4PCSA 4W86A 3SEPA 3VKKA 3VD5A 3GNRA 5D4YA 4AD2A 4TVDA 1LQ0A 3FAXA 5E0FA 1KGUA 3ALGA 3VGBA 1IT0A 5FIPA 4NSBA 2EJ1A 4UFHA 4A3HA 1J18A 4CU7A 4Z2LA 1WKYA 4Z2IA 4XX6A 2JF7A 3HN3A 5I24A 3RCNA 4QCEA 3W0KA 3KL0A 2XIIA 4M82A 4XV0A 1CENA 1HP4A 2D24A 3WNMA 3AMDA 2V3FA 4W5UA 5IHRA 5DF0A 1GQKA 1XYZA 1PX3A 3U5YA 3F4VA 5HNNA 4WKHA 1NM9A 3EYPA 1KR1A 3AS0A 1E73M 2VX7A 3ARXA 1TMQA 1UZ4A 1V3IA 3AQUA 1QW9A 3RIKA 1WDSA 6TAAA 2VZSA 2XJ7A 2J79A 1ODZA 4UQDA 3WH6A 3WDIA 4PTVA 2VTFA 1B3WA 1G1YA 1GHRA 4QCFA 2RGLA 2VNCA 5ABEA 1RP8A 3AHTA 4JFWA 1FH7A 5JBFA 2V3DA 3OBAA 2WHKA 1EHNA 1TVNA 4AZGA 2W62A 1V0LA 5KZ6A 1C8XA 4J3UA 3RM4A 4A3YA 3LPPA 2DSUA 3VNZA 2ZX8A 3WNNA 2VO5A 3BAIA 1E4NA 2WB5A 3T09A 1G94A 1B30A 4HOZA 4H2CA 3T2QA 4HZ6A 2WWDA 4UOQA 5HPCA 4D72A 1JZ5A 2QPSA 1B3VA 2Z1SA 1GQIA 2C8NA 3BCDA 1F4AA 1JD9A 3HU7A 4URIA 3ZR6A 1HL9A 4B3KA 3ZSSA 2J7DA 2D22A 3QHMA 2WNWA 1R86A 2X2YA 1LF1A 4P8VA 1BYAA 4B9YA 2DSWA 4EANA 3WDHA 1VFMA 1ZJAA 1OM0A 4MJ4A 2CHNA 2VZTA 3GZAA 2WBGA 3S2CA 1W3KA 2YLAA 1C8QA 5AYBA 4CD6A 4P7NA 1E5NA 1EDGA 1TA3B 2D0HA 1E15A 3ECQA 5E09A 4AYSA 1NARA 4AIOA 1VFFA 2OWCA 2OSXA 2CHOA 4PMYA 4J3XA 2O92A 1H2JA 3N11A 4P7RA 4E4PA 1PIFA 1VEOA 1BYDA 4TVUA 5A8NA 3VUPA 8CGTA 4UQ9A 1UG6A 1J0ZA 3NSNA 3AROA 3IJ8A 2YDSA 3AISA 1CXLA 3KWXA 3ARWA 1HXJA 1HKMA 1SFSA 3U57A 1C91A 2FH6A 4W93A 3OZOA 1E5JA 3T08A 1JFXA 3FY1A 1E6SM 3MMDA 4D1JA 1QI0A 3WUGA 4S3KA 4AZ6A 1JGIA 1JG9A 4BCEA 4Y7EA 1LLOA 1UKQA 4MNLA 3BMVA 1ECEA 4OZOA 1UZ1A 1JDDA 3T2PA 5A8QA 4PMQA 4BF7A 1MQPA 1OWQA 1R87A 1K6AA 1BSIA 1HIZA 4W5ZA 1E0VA 2OYLA 3VX0A 4HU8A 4H04A 4D6FA 1EA9C 3CUIA 3KL3A 2A3EA 2ZWZA 2WHMA 2DSVA 3WD2A 3VM5A 1MW1A 1QNPA 3F5JA 3A47A 2EEXA 3OGRA 3IAPA 3MMUA 3ZT5A 3VMNA 1SMDA 4UFIA 2DSKA 2VCAA 1RP9A 2ZOXA 3AS3A 3POCA 3NUKA 1JFHA 1U2YA 2YA2A 4QP0A 4AD3A 4A4AA 1XSJA 1B1YA 3EDDA 1UR4A 2G3JA 3BMWA 2XUCA 1V6WA 3TA9A 2WXDM 3BAKA 4AD1A 2XWEA 1DWJM 2J7GA 2WK2A 5D9NA 3TTYA 1WDRA 2VRJA 8A3HA 1JAEA 1UR9A 2CXGA 3BCFA 2G8ZA 1AVAA 1FH9A 3SCOA 1E3XA 2GJXA 4M80A 2VUYA 1UH2A 2GFTA 1H1NA 4MNMA 2G3NA 4CN1A 5A6BD 5GNYA 4H8UA 3I3EA 3OZPA 4LX4A 2WYSA 2J8FA 4P7QA 2D20A 1E1EA 4UZUA 4WK9A 5A6SA 2EBNA 2ZUTA 3WF1A 5BXTA 2ZXBA 1V3LA 4AIUA 1Q6FA 1E1FA 3CZKA 4UFKA 1BGAA 3AMGA 5HOSA 2J8GA 3U7VA 2CITA 2WZIA 3O6AA 5E0CA 4UQEA 3NDYA 3T0DA 4AD0A 3PZVA 1NH6A 1IV8A 2GJPA 4KRTA 1DHKA 3AIBA 3T2OA 1CYGA 3OA5A 2DH2A 1J10A 2BVDA 2WLZA 1AQ0A 1V6YA 1UD3A 2PI6A 2XSAA 3KZSA 1GPFA 3M46A 1XV8A 1GCYA 2BY2A 1BTCA 1GJWA 3KE0A 4HA1A 1H0IA 2W61A 4PUDA 1UUQA 1DWIM 4DM1A 3PZMA 3DECA 4UCFA 2UY4A 4U2YA 1W1VA 1FOBA 3SCTA 5I5RA 4PMDA 2CBUA 3UESA 2XVKA 4GZJA 1TZ7A 4CD7A 5ABFA 2WMIB 1Z32X 3J7HA 1WB0A 1EO5A 3UG3A 3CLWA 3A4AA 2E4TA 1YQ2A 2W67A 1K9EA 3CGTA 3A4WA 5I23A 1MQRA 3ZR5A 4PMZA 3BC9A 1CXIA 2DT3A 3SCNA 4HMCA 3QR3A 4ZEPA 2X0HA 2WZEA 2XVLA 4JFUA 3PZIA 3G6MA 5BYWA 2JALA 3PZQA 1OT2A 3ZT6A 3NSXA 2J7EA 3VU2A 2G3MA 2YL8A 1ZS2A 4D6JA 1HJQA 1GVYA 1F4HA 5CSUA 4WKFA 4PBGA 1DP0A 3WEOA 5FD0A 2O9RA 2FHBA 2WVTA 1UHVA 1GOOA 1NP2A 1EH9A 1KR0A 4W7WA 1X1NA 2VCBA 2G41A 5AYIA 1XH1A 4HPGA 4GINA 4F66A 3PZ9A 1GUVA 3A6OA 1EDQA 3L4XA 3VD9A 2ZICA 5M3WA 1PZ3A 3CBWA 4ZXOA 4IPLA 2XYLA 3GNOA 1OT1A 4LGXA 4C7DA 3EMCA 1CXEA 2YL5A 4PMNA 2FHCA 1OIFA 2E9BA 4AMCA 5A1AA 1HVQA 1OGBA 4OUEA 4M8UA 3WH9A 1QOXA 3N9KA 1HJVA 3VIKA 3AMCA 3VGDA 3OB8A 2XFRA 1OSEA 1FA2A 2W5FA 3SUTA 2VZVA 4L4PA 4PEEA 3N1AA 1G9HA 1E6PA 4MNJA 1E70M 3NSMA 4S3JA 3SCPA 2VL4A 5LYRA 3II1A 1LL7A 3BAXA 2A3BA 3VIHA 5GNZA 1B31A 5JUVA 1CLVA 2VX5A 1PPIA 1CXHA 3BSHA 1P6WA 1EOKA 2QHAA 2XM1A 3WF2A 3K4DA 2JIWA 2GK1B 4HMDA 2WMKA 3IAQA 3WD1A 2WM0A 3ARPA 2YBTA 4Z2GA 1J0YA 1NOFA 1NQ6A 4P8XA 2D3LA 4ZXLA 4M1RA 5CJ5A 4PYSA 1LJYA 1G5AA 2VOTA 1QI5A 3VOCA 3W53A 3WMCA 1BG9A 2JIEA 4E8DA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3I3D A;  1DED A;  2D2O A;  1WE5 A;  1M53 A;  2VI0 A;  5BCA A;  4ACZ B;  2NT0 A;  1B90 A;  5IFP A;  1B9Z A;  1BVZ A;  4NRR A;  2WW5 A;  3GH5 A;  4XZB A;  4H8H A;  3ZOA A;  1UYQ A;  2W92 A;  2VR5 A;  2XPK A;  3QOM A;  4MTV A;  2ZXA A;  2OSW A;  2EPK X;  5HBF A;  1ZBK A;  3AML A;  1E0X A;  1Q6E A;  5D9P A;  3PZU A;  3VD7 A;  2WCA A;  1W1Y A;  3OG2 A;  4LQ1 A;  2ZX7 A;  1LG1 A;  1CGY A;  1V02 A;  1JDC A;  1QI2 A;  1U33 A;  3WDP P;  1JI1 A;  1QBA A;  1C93 A;  1L8N A;  3BH4 A;  4ZFM A;  3L4T A;  5FCZ A;  3D5H A;  4W85 A;  2WAN A;  4CVW A;  4U33 A;  4PMV A;  4C7G A;  1CWY A;  2Q8X A;  1E72 M;  4V2X A;  4AZI A;  2WC7 A;  5JBE A;  1LWH A;  1G0C A;  1Q6G A;  3AIE A;  4W89 A;  3WDJ A;  2DGA A;  3ZMR A;  4KWU A;  4TX6 A;  1XCX A;  4HME A;  2VX6 A;  2XSB A;  2WKG A;  3NIY A;  4J3V A;  2WCG A;  3WF3 A;  4HZ8 A;  3QHN A;  2QMJ A;  1UR8 A;  2CIP A;  1BYB A;  3ARY A;  4GIA A;  1ITC A;  1CNV A;  1RH9 A;  4PMO A;  1CLX A;  2VT0 A;  1OIM A;  3AIQ A;  2TAA A;  5BWF A;  3GYC A;  1C90 A;  3K46 A;  4QLK A;  4BZY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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