5E0CA

Structural insight of a trimodular halophilic cellulase with a family 46 carbohydrate-binding module
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
531
structure length
531
Chain Sequence
QTDIQSYVADMQPGWNLGNTFDAVGDDETAWGNPRVTRELIKTIADEGYKSIRIPVTWENQMGNAPDYTINEDFFSRVEQVIDWALEEDLYVMLNLHHDSWLWIYNMEHNYDEVMAKYTALWEQLSERFQGHSHKLMFESVNEPRFTRDWGEIQENHHAFLEELNTAFYHIVRESGGSNTERPLVLPTLETATSQDLLNRLHQTMKDLNDPNLIATVHYYGFWPFSVNVAGYTRFEEETQQDIIDTFNRVHNTFTANGIPVVLGEFGLLGFDTSTDVIQQGEKLKFFEFLIHHLNERDVTHMLWDNGQHLNRETYSWYDQEFHNMLKASWEGRSATAESNLIHVRDGEPIRDQDIQLHLHGNELTGLQVDGDSLALGEDYELAGDVLTMKADALTALMTPGELGTNAVITAQFNSGADWHFQLQNVDEPTLENTEGSTSNFAIPAHFNGDSVATMEAVYANGEFAGPQNWTSFKEFGYTFSPVYDKGEIVITDAFFNEVRDDDIHLTFHFWSGEMVEYTLSKNGNHVQGRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insight of a Trimodular Halophilic Cellulase with a Family 46 Carbohydrate-Binding Module
rcsb
molecule keywords Cellulase
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. bg-cs10
total genus 183
structure length 531
sequence length 531
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
A PF03442 CBM_X2 Carbohydrate binding domain X2
A PF18448 CBM46 Carbohydrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5e0cA01
4XZWA 3PTMA 1LWJA 2O9TA 1PZ3A 3RMEA 2RGLA 3MUY1 2XGIA 3VD7A 1J0YA 3WQVA 2X2YA 1KR1A 3WNKA 2WMHA 4D6EA 1CWYA 2JF7A 1HIZA 1CXIA 1SR0A 4D6FA 3M07A 3TA9A 1ZU8A 3II1A 3TONA 1W9PA 3OG2A 3UR7A 2OYKA 5I6SA 1K9DA 1E4MM 4E8DA 1W2VA 4PUEA 5CSYA 4FLSA 3LMYA 4U5IA 3ARTA 4J28A 3OBAA 2XPKA 4JAWA 2W63A 1E9LA 1HNYA 3N18A 3WKZA 4OJYA 4WSJA 5AYIA 4WF7A 1L8NA 2ZUSA 3N04A 4X0NA 2XVPA 1UR0A 3ZSTA 2VR5A 1V3MA 2GVYA 4NRRA 2J7BA 5A6BA 1VJZA 2XVLA 1HP4A 3AXIA 3BAWA 1KGUA 1UD5A 3KWXA 4CD8A 1G94A 1MW3A 1W1YA 1MQQA 1A3HA 2J7GA 3IAQA 2XFRA 1DEDA 1VENA 3WUBA 3RJXA 1HN1A 3FN9A 4PMVA 5DT7A 5BXSA 2XJ7A 1XRVA 2CCRA 3PZUA 5KEZA 3CGTA 1LL4A 2XTKA 3ARYA 1WDSA 4ZXOA 4AEFA 3TTSA 4P8UA 2BXZA 2CESA 1E6PA 1V0MA 1NOFA 3T0BA 2AOSA 3BMVA 2D0GA 3EDFA 4CVWA 1PIGA 1UR9A 5A1AA 4J3WA 3ZIZA 1K6AA 2WWCA 2ZUTA 3ZO9A 1VFMA 1J0JA 1NWTA 1MW1A 1E6QM 2YLAA 3WH9A 3T09A 1JD9A 1WAWA 5A6SA 3KL0A 3S6TA 4JFSA 4LQ1A 6A3HA 1WO2A 3WL0A 4A3HA 2O9PA 3EDJA 3WQ4A 3CBWA 4AZ5A 1Y7VA 2DSZA 3VNYA 2A3BA 3EMQA 1B9ZA 1ISVA 1JNDA 1Q6EA 3W81A 4FLOA 1UR1A 3VMOA 3AYSA 1KB3A 1WDQA 1BGAA 2D20A 3WDQA 4HA1A 4DM2A 3G6LA 2UY5A 3I3BA 1QBAA 1KQYA 4EAMA 3E1F1 2XSAA 4W8LA 3PN8A 1V3IA 4H8UA 3TTQA 1R7OA 3GBDA 1E72M 3QOKA 4MNJA 3A6OA 2XFYA 1TVNA 3ALGA 4IUGA 3WH6A 3AS0A 1NP0A 2ZUWA 3T2PA 4CD7A 4B3KA 2W67A 1KR0A 4JL1A 4X9YA 3WF3A 4A4AA 4AXNA 3IANA 3IAPA 5IHSA 1EHNA 2A3AA 3EDKA 2XVGA 1EO5A 2WW5A 3GXMA 3WUFA 1W32A 4D6CA 4AW7A 4QFUA 4CN4A 1A47A 4RE2A 4HOXA 1UD3A 1OIFA 4HOWA 4PSPA 1XSJA 1UA3A 1DWJM 1DHKA 2WBGA 5FL0A 2CKRA 3VIJA 1R87A 3RM4A 4AC1X 2WCAA 5ABFB 2A3CA 1B90A 4U5KA 1E73M 2VVSA 4DWSB 4HU8A 3QR3A 2E9MA 1NWUA 5BXTA 1OB0A 4IPLA 5EFDA 3AQUA 4PMDA 2WLYA 5D9MA 5E70A 1GJUA 3ARSA 2ZE0A 5BXRA 1WZAA 3F4VA 3PHAA 5ECUA 3N15A 4K68A 2YL6A 5EMYA 1FOBA 2OYLA 5A8MA 4JFTA 5IFTA 3MV11 4PBGA 4B15A 1V6WA 2ESCA 1CXHA 5HPCA 4QAWA 4WSKA 1XSIA 1DWHM 3HU7A 3VD3A 3W29A 1C7SA 2A3HA 4W85A 2WMIA 5A2AA 1LG1A 1QNPA 4QCFA 3NIYA 1W9VA 1TE1A 2BVDA 4AMCA 1V02E 1E0WA 1UHVA 3WH7A 5LA2A 4V2XA 4AIEA 1IZJA 2D24A 2PWHA 1GUVA 3CHFA 5GNZA 3WUGA 1GHSA 2NW0A 2DT1A 1W3LA 3WUEA 4ATLA 3L4ZA 1KXTA 3WMBA 2BV9A 1HKJA 2VURA 4PMZA 3RM9A 5ABGA 1E6SM 2PI6A 3VD4A 3B9EA 2Y2WA 1KWGA 3AMDA 2WVSA 2OLHA 1HKKA 2ZX6A 4GQRA 1B30A 3WSUA 5C70A 3AZSA 1TZ7A 5AYBA 4UCFA 1E6ZA 4JCLA 5I24A 1HKIA 1OT2A 2WC4A 1J12A 3ZT5A 1VEOA 3PZOA 4AD5A 2ZX5A 3CZJA 5BYWA 2XSBA 3SCWA 3CZEA 2CYGA 4HU0A 2O9OA 1EH9A 1VJSA 1E4IA 3WQ8A 2V3FA 1E3XA 2DDXA 2D0HA 5BRQA 3B9DA 2D2OA 5E0FA 7A3HA 2WMFA 3WD3A 3DECA 2Y5EA 4UZSA 2E40A 1MYRA 2F8QA 1FHLA 4UR9A 1WDRA 2CKSA 1LQ0A 3AHXA 4HP5A 3WDJA 7TAAA 3VGDA 4W8AA 3I3EA 2CHOA 5CG0A 2YDRA 1GPFA 2CPUA 1UZ4A 2WANA 1OT1A 1OGGA 1JIBA 1LWHA 1E43A 2A3EA 3WEMA 1CECA 4JZ5A 1US3A 4W89A 2XFFA 3CZLA 3OB8A 2VQUA 3TOPA 5CJ5A 1PEZA 1VEPA 5A3HA 2YKKA 1CLXA 5JIPA 5BRPA 1U2YA 4TX6A 4HA3A 1CBGA 4HZ7A 3FHQA 5I77A 4XUYA 4R5EA 4WIWA 3GM8A 1IV8A 1HJUA 3F5JA 2Z1KA 2OSYA 2VT0A 3QGVA 4HMCA 1JYNA 3ARZA 4U3CA 1C7TA 4CD4A 1UQYA 2J7DA 3W38A 3ZM8A 1B2YA 1DWFM 1UOKA 3T0AA 2EPNA 1I1WA 1Q6FA 5CPQA 5A6KA 2XGBA 3VU2A 5ABEA 1D7FA 4F9DA 1ESWA 1GOKA 3OZPA 1MFUA 3AOFA 1NARA 3A47A 1CXFA 3GNOA 4U3AA 1WKYA 2GJPA 5FKYA 2WZIA 1CGTA 1J01A 1PX3A 1CXKA 1UKSA 1XD0A 1EO7A 3GZAA 3SCOA 5IFPA 4DUXA 1AQMA 5DF0A 2CETA 2ZX9A 4BQ4A 3VOCA 3K8LA 4FMVA 1TMQA 4ZXLA 2GJRA 1ISWA 2W62A 2YL5A 3OGVA 5E6YA 2DSVA 3MO4A 2FDMA 3GXFA 2DPEA 4P8WA 1W9XA 4Z2IA 4S3JA 3VDCA 1E5NA 2ZXAA 2FHCA 4CCDA 1QHOA 4CN6A 4Q22A 4IPNB 1E71M 4XX6A 1C3FA 2QHAA 3U5UA 1V6UA 2EJ1A 2VCCA 5CLTA 1KGXA 1WZKA 1VBRA 2JFEX 2PC8A 3VGBA 3DHPA 3KZSA 5A8OA 4PSRA 3PZIA 1QI4A 3WD1A 3AISA 1RH9A 1UWSA 1EXPA 4L4OA 2F2HA 3ZT6A 4ZENA 2VVNA 4UZUA 3WF0A 4AEEA 3MV01 3ARXA 1W9BM 1GVYA 5HDRA 1QNQA 2V3EA 1UKQA 4CUCA 2X0HA 2J7EA 4YHEA 1KCKA 4U2ZA 3WQ5A 3NSMA 4H8HA 1H2JA 3WNNA 3U5YA 3BGAA 4W5ZA 2DH2A 1XC6A 3WQWA 1W2PA 2XVNA 5I78A 2V5DA 2DIEA 5F7UA 5I3DA 1UZ1A 1GOQA 3SIMA 4AIOA 2BY2A 4F79A 3IJ8A 2D1ZA 1SYTA 1OCQA 1UD4A 1EQCA 3TTYA 1W9UA 5JBDA 3FW6A 4N0RA 1I1XA 2VO5A 4OBRA 4YN5A 3RM8A 3K8MA 4B9ZA 3BSHA 1ZBVA 1OINA 3AMCA 1U33A 2Y4SA 4C7FA 5HOSA 2E8ZA 3AYRA 1JZ7A 4XZBA 5M3WA 3WEOA 4PTMA 3QHNA 2FHFA 4JCMA 4ZEPA 3EDDA 1OM0A 2WVVB 1XCWA 3AIVA 1V3LA 4MB1A 3VIKA 4J3VA 3SCTA 4H7VA 4D72A 4PYSA 2CEQA 1JG9A 3AS1A 1VFOA 1V03A 2D23A 1CLVA 4AWEA 1JYWA 3WF2A 3UESA 1H0GA 4PMRA 1K9FA 2JEPA 1D3CA 1VRXA 4PRWA 5E6ZA 2VX4A 2VR4A 3CO4A 3L4TA 1W3HA 4FF5A 4PMXA 1UH4A 1UKPA 1ITXA 5IDIA 4P7OA 2PF0A 4UQAA 1JI2A 1KXHA 3VDHA 1TA3B 1E4LA 4J3SA 3CMJA 4D6DA 2VJXA 4MB3A 3VIGA 1J0HA 4H8VA 4J27A 2WC3A 3M7SA 4Z2HA 3WDPP 3UCQA 2YDSA 1MQPA 4CCCA 1QI5A 3N1AA 1QI3A 4M80A 3AZTA 3POHA 1UYQA 1B1YA 1KGWA 2XIIA 2E3ZA 3BCFA 2PWEA 1UR8A 5AC5A 3L4VA 2O9RA 5LYRA 2BS9A 4D6IA 1NP2A 5E09A 2ZWZA 1CGVA 1G0CA 4WKFA 4YPJA 1GVIA 3VVGA 2UWFA 2WVUA 2BNJA 5I5RA 4YHGA 2WNWA 3AIUA 3MUAA 3CHCA 4MNLA 2WYSA 5M17A 4TVUA 5A6MA 4E4PA 2UY2A 4GZIA 3FAXA 4M24A 5A8PA 4BQ3A 4PEEA 2VUYA 1BAGA 5AY7A 1QNSA 2GJXB 2XVKA 3VTRA 1GOWA 1J0IA 3HN3A 3BCDA 5A2BA 1UWIA 2WVTA 1JZ4A 3W26A 4GPNA 4TX8A 1ISXA 2VOTA 4UTFA 4LYRA 5C8BB 4OUEA 4AISA 1GONA 1K9EA 2JIWA 1JF5A 1UUQA 4CD6A 4WKHA 3THDA 1MW2A 3F5LA 1GQLA 3VIHA 3WBAA 2G3JA 4URIA 5A6AA 4JKMA 3W6MA 2DT3A 5HNNA 3CHDA 1JXJA 1XYZA 5CPTA 5KZ6A 1TFVA 4AD0A 3DYOA 3SURA 2VQTA 3QOMA 2VRQA 2J8FA 5EBAA 2VX7A 2X1IA 2D0FA 4WK9A 3VIMA 2VX6A 5CQ1A 2VCBA 1EHAA 3CHEA 4UFJA 4Y7EA 1X6NA 2ZXQA 3MU7A 3OA5A 4JKLA 4GINA 5DT5A 3RPMA 3VINA 3WMCA 5ABFA 3ARVA 3W37A 3PTQA 2VZOA 1PAMA 1V3KA 4MNKA 2DT2A 2GFTA 4W87A 3AIRA 3ZR6A 5I23A 1E3ZA 1GOMA 4FLQA 3VUPA 4CVUA 1JYXA 2VX5A 1IZKA 2W4XA 2ZIDA 1E6RA 1RPKA 4XV0A 3VIPA 1CTNA 1GZJA 1PBGA 3WFZA 2WMGA 3W4RA 3WFLA 3FXYA 5JBEA 3TTOA 2YA0A 1CPUA 1Q4NX 2DIJA 2E9LA 3FAWA 3THCA 2TAAA 2VTFA 3AIBA 3VDAA 3ZMRA 3PZTA 1UH2A 3AS2A 1UD8A 4MADA 3WH5A 1C8XA 3PZVA 5JIWA 2WWDA 4FK9A 3OLIA 3WH8A 2VZUA 1B3WA 5C71A 1Q6DA 2ZUVA 2D3NA 3WNPA 1RP9A 4MAZA 4UFKA 2NSXA 1VIWA 4QLKA 4AD3A 3CIVA 4M81A 3AMGA 3AJ7A 3WL1A 2ZUUA 2WK2A 1H1NA 2GUYA 2NT1A 1W1VA 3CZKA 1B3VA 3GBEA 1OWQA 2JF6A 1LL6A 4WJXA 4HOZA 4KH2A 1HVXA 1XV8A 3J7HA 1HXJA 5ABHA 2YDQA 2BHZA 2CBIA 5CLWA 3WN6A 2BY3A 3WNMA 1JD7A 1R8LA 3LPGA 3CUGA 3U57A 2VMFA 3T2OA 4LYPA 3M6DA 5HBFA 2EBNA 1E55A 4Q7NA 1NQ6A 4NSBA 2VL4A 4PMYA 2J7FA 1UA7A 2J25A 1DWGM 4TTGA 4Z2LA 1DWIM 2WXDM 3VD5A 4ATDA 2WKLA 3A4AA 2GDUA 3EBVA 3ARUA 3PZMA 2WC7A 2MANA 3AFBA 3GH5A 1H09A 3GDBA 1N82A 3L2MA 2YBTA 4JFUA 4EKJA 1MQRA 1CGUA 3MKKA 4W8BA 1UG6A 2J62A 3OGRA 1TUXA 2J74A 1H0IA 1WE5A 1B3YA 1CNVA 1JF6A 3ARPA 1HJVA 1IT0A 2W61A 3GXDA 4MJ4A 3MMWA 2VZTA 3AHYA 2J4GA 5E9AA 2G41A 4MJ2A 2EXOA 2GK1A 2V3GA 3ARWA 1BTCA 1ZS2A 4MB4A 4AZ7A 1JAEA 1UKTA 4D71A 1GOIA 3GNPA 1US2A 1X6LA 3BAYA 3MMDA 5DFAA 2OWWA 2G3NA 1PPIA 2YBUA 3AS3A 1QOXA 1JI1A 3U7BA 1M01A 3B8SA 1C93A 4B3LA 1FH8A 1BG9A 4M1RA 4EE9A 5A8QA 4DWSD 1QNOA 2G4FA 4TXEA 3QHMA 3WQ6A 1JDDA 1UWRA 3VM5A 3WDRA 3UR8A 1BYCA 1EDQA 4JIEA 3W24A 2O92A 4L4PA 5DO8A 1UWUA 3N9KA 3OIHA 2GDVA 1Q6CA 3WD4A 6TAAA 1ZBWA 1HX0A 1VAHA 2YJQA 4F9JA 2WMIB 3FY1A 4TVDA 1ZJAA 3CZGA 3S2CA 3VPLA 2XM2A 3VO0A 1V0NA 1CXEA 4PTXA 2OWXA 3BAKA 1TR1A 2VZVA 3QHOA 3RIKA 2CBUA 4ACZA 4GI6A 2E8YA 1HJWA 3AIQA 2J8GA 1JGIA 1FH9A 4DWSC 2BHYA 3VNZA 1ODUA 1WDPA 3UERA 1J0KA 3VMNA 2W66A 1TVPA 3SCRA 1OIMA 1E70M 3VKKA 1ISYA 2Z1SA 1C8YA 2CBJA 3ECQA 1C8QA 3MSDA 5A94A 2E9BA 4RE4A 1HJQA 4H04A 1M04A 4CGTA 1BVZA 3ARQA 2B31A 2CIPA 2XM1A 1PX8A 1BHGA 1V08A 4J3UA 4MDPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4XZW A;  3PTM A;  1LWJ A;  2O9T A;  1PZ3 A;  3RME A;  2RGL A;  3MUY 1;  2XGI A;  3VD7 A;  1J0Y A;  3WQV A;  2X2Y A;  1KR1 A;  3WNK A;  2WMH A;  4D6E A;  1CWY A;  2JF7 A;  1HIZ A;  1CXI A;  1SR0 A;  4D6F A;  3M07 A;  3TA9 A;  1ZU8 A;  3II1 A;  3TON A;  1W9P A;  3OG2 A;  3UR7 A;  2OYK A;  5I6S A;  1K9D A;  1E4M M;  4E8D A;  1W2V A;  4PUE A;  5CSY A;  4FLS A;  3LMY A;  4U5I A;  3ART A;  4J28 A;  3OBA A;  2XPK A;  4JAW A;  2W63 A;  1E9L A;  1HNY A;  3N18 A;  3WKZ A;  4OJY A;  4WSJ A;  5AYI A;  4WF7 A;  1L8N A;  2ZUS A;  3N04 A;  4X0N A;  2XVP A;  1UR0 A;  3ZST A;  2VR5 A;  1V3M A;  2GVY A;  4NRR A;  2J7B A;  5A6B A;  1VJZ A;  2XVL A;  1HP4 A;  3AXI A;  3BAW A;  1KGU A;  1UD5 A;  3KWX A;  4CD8 A;  1G94 A;  1MW3 A;  1W1Y A;  1MQQ A;  1A3H A;  2J7G A;  3IAQ A;  2XFR A;  1DED A;  1VEN A;  3WUB A;  3RJX A;  1HN1 A;  3FN9 A;  4PMV A;  5DT7 A;  5BXS A;  2XJ7 A;  1XRV A;  2CCR A;  3PZU A;  5KEZ A;  3CGT A;  1LL4 A;  2XTK A;  3ARY A;  1WDS A;  4ZXO A;  4AEF A;  3TTS A;  4P8U A;  2BXZ A;  2CES A;  1E6P A;  1V0M A;  1NOF A;  3T0B A;  2AOS A;  3BMV A;  2D0G A;  3EDF A;  4CVW A;  1PIG A;  1UR9 A;  5A1A A;  4J3W A;  3ZIZ A;  1K6A A;  2WWC A;  2ZUT A;  3ZO9 A;  1VFM A;  1J0J A;  1NWT A;  1MW1 A;  1E6Q M;  2YLA A;  3WH9 A;  3T09 A;  1JD9 A;  1WAW A;  5A6S A;  3KL0 A;  3S6T A;  4JFS A;  4LQ1 A;  6A3H A;  1WO2 A;  3WL0 A;  4A3H A;  2O9P A;  3EDJ A;  3WQ4 A;  3CBW A;  4AZ5 A;  1Y7V A;  2DSZ A;  3VNY A;  2A3B A;  3EMQ A;  1B9Z A;  1ISV A;  1JND A;  1Q6E A;  3W81 A;  4FLO A;  1UR1 A;  3VMO A;  3AYS A;  1KB3 A;  1WDQ A;  1BGA A;  2D20 A;  3WDQ A;  4HA1 A;  4DM2 A;  3G6L A;  2UY5 A;  3I3B A;  1QBA A;  1KQY A;  4EAM A;  3E1F 1;  2XSA A;  4W8L A;  3PN8 A;  1V3I A;  4H8U A;  3TTQ A;  1R7O A;  3GBD A;  1E72 M;  3QOK A;  4MNJ A;  3A6O A;  2XFY A;  1TVN A;  3ALG A;  4IUG A;  3WH6 A;  3AS0 A;  1NP0 A;  2ZUW A;  3T2P A;  4CD7 A;  4B3K A;  2W67 A;  1KR0 A;  4JL1 A;  4X9Y A;  3WF3 A;  4A4A A;  4AXN A;  3IAN A;  3IAP A;  5IHS A;  1EHN A;  2A3A A;  3EDK A;  2XVG A;  1EO5 A;  2WW5 A;  3GXM A;  3WUF A;  1W32 A;  4D6C A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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