5E0CA

Structural insight of a trimodular halophilic cellulase with a family 46 carbohydrate-binding module
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
531
structure length
531
Chain Sequence
QTDIQSYVADMQPGWNLGNTFDAVGDDETAWGNPRVTRELIKTIADEGYKSIRIPVTWENQMGNAPDYTINEDFFSRVEQVIDWALEEDLYVMLNLHHDSWLWIYNMEHNYDEVMAKYTALWEQLSERFQGHSHKLMFESVNEPRFTRDWGEIQENHHAFLEELNTAFYHIVRESGGSNTERPLVLPTLETATSQDLLNRLHQTMKDLNDPNLIATVHYYGFWPFSVNVAGYTRFEEETQQDIIDTFNRVHNTFTANGIPVVLGEFGLLGFDTSTDVIQQGEKLKFFEFLIHHLNERDVTHMLWDNGQHLNRETYSWYDQEFHNMLKASWEGRSATAESNLIHVRDGEPIRDQDIQLHLHGNELTGLQVDGDSLALGEDYELAGDVLTMKADALTALMTPGELGTNAVITAQFNSGADWHFQLQNVDEPTLENTEGSTSNFAIPAHFNGDSVATMEAVYANGEFAGPQNWTSFKEFGYTFSPVYDKGEIVITDAFFNEVRDDDIHLTFHFWSGEMVEYTLSKNGNHVQGRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insight of a Trimodular Halophilic Cellulase with a Family 46 Carbohydrate-Binding Module
rcsb
molecule keywords Cellulase
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. bg-cs10
total genus 183
structure length 531
sequence length 531
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
A PF03442 CBM_X2 Carbohydrate binding domain X2
A PF18448 CBM46 Carbohydrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5e0cA01
2C0HA 2VOTA 4H2CA 4FLQA 5I77A 1UWRA 2PBOA 2QPUA 1OCQA 3MKKA 4P7OA 1V3MA 4DUVA 2WM0A 5BWFA 1V0MA 1XD0A 2Y5EA 2PF0A 2PBGA 3WQWA 1QI4A 3WNNA 2ESCA 2YL6A 4UOJA 4P8UA 1E0VA 1E40A 1CECA 3KL0A 1UD3A 5C8BB 3BC9A 1JZ7A 2C7FA 5A69A 4HOZA 1MW2A 1E4LA 5E09A 4D1JA 1B90A 1CNVA 2GVYA 4AZGA 1W1PA 3N13A 3NIYA 2FHCA 3W38A 3M07A 1DEDA 1CXKA 1JYVA 2X05A 2DSZA 4W8LA 3AHVA 2CHOA 3ZJKA 1UWIA 1WAWA 1L0PA 3L4YA 4U3CA 4KGJA 1NQ6A 2A3AA 4GZEA 2WHLA 1NWRA 4UFLA 2J7BA 2GJRA 3ZMRA 1V3LA 2PWHA 2E8YA 2EBNA 3VIGA 4UQ9A 1DHKA 1KGXA 1FFRA 3AZRA 1D7FA 3ZJ8A 4U2ZA 4H8HA 3A3HA 1VEMA 4KWUA 2J62A 3AMCA 4TXEA 1IT0A 1C92A 1JAEA 4X0VA 3G6LA 2DGAA 3LPGA 5CLWA 2D0FA 2PWEA 3AIQA 4ZEPA 2FH6A 3PBGA 2ZX9A 3AS0A 3AJ7A 1IV8A 5DO8A 5IFTA 1H1NA 4H7VA 4AEEA 4L4OA 1UQZA 2X0YA 3BLKA 3PZMA 1WE5A 4AIUA 1K9TA 1E0XA 2BVYA 1HP4A 4P7NA 3MV11 2J78A 1B2YA 1XH2A 4PUEA 2BHYA 3PHAA 8CGTA 3VDCA 3WQVA 4UFIA 4IISA 1E6PA 5CGTA 4M24A 4J3SA 1SFSA 4JFTA 3FAWA 1VB9A 2OSYA 2WBGA 3CBWA 5A8PA 5D9PA 1AMYA 3VNZA 1OT2A 1FHDA 2W91A 4LYRA 4UTFA 1JNEA 4HPGA 2O9TA 2X8RA 4UFMA 4UQCA 1E6SM 2Y8VA 1TVPA 2GJPA 1VIWA 1B1YA 2CHNA 3VPLA 1WB0A 3IJ9A 5C70A 3WMCA 2XWEA 2WB5A 3DYOA 1EDTA 1C8QA 4DM1A 3AZTA 5BROA 3WKZA 2XUCA 2J7CA 3LPOA 1E5JA 4MJ2A 5ABEA 1K6AA 4QLJA 3ZSSA 4LX4A 3VMPA 4UOQA 1V02E 4CUCA 5JIPA 3QOMA 1J18A 1FA2A 5A6JA 3FW6A 3TA9A 2X0HA 3WELA 4TOQA 5I79A 1UHVA 1X6NA 4HMDA 3AS1A 1WCGA 4RE3A 3ARVA 5LA1A 3MUY1 3ARTA 3ZOAA 2YKKA 4N0RA 1EH9A 2CXGA 5E6YA 2GDUA 1LL7A 2A3EA 3AICA 4CGTA 1E56A 2CCRA 2DT3A 5LYRA 1JIBA 2WC7A 1I75A 2ZX8A 3NSXA 1H0GA 3FY1A 2V3FA 3BSHA 5D9NA 1GZJA 4FF5A 3EDKA 5AY7A 1HJUA 2CYGA 1JAKA 3GDBA 1UG6A 4NRRA 1Z32X 2ZX6A 3VVGA 2YL9A 3POHA 5AC5A 2WYSA 3GH4A 4U2YA 1GQKA 5CZKA 2CEQA 1UWSA 1B0IA 3S2CA 4W84A 2VVSA 4F8XA 4AMCA 1HVXA 3WNLA 4D6JA 2CBVA 2F61A 4UQEA 1V6YA 1B3YA 2EO7A 2YJQA 3WD4A 1BYAA 4W7UA 2XVLA 4GZJA 4U5IA 1NH6A 2WW5A 4XV0A 1XSJA 3MANA 2WMIB 2NW0A 1JYNA 2VZUA 3ZO9A 2J7DA 4J3VA 3CZKA 1BTCA 2WHJA 1JGIA 2XYLA 2ZXQA 1RP8A 2FGZA 3O6AA 4MNMA 3UETA 2CIPA 4HMCA 4H8VA 4NF7A 3O9NA 3KL3A 3MMDA 5FL0A 1QI2A 3W25A 1EA9C 4GI6A 4AEFA 1QHOA 3VD3A 1WPCA 3VGFA 5GNYA 3PZIA 3VILA 3BCFA 1UR9A 4Q7NA 3AIBA 1UD2A 3GH5A 3WENA 3WUBA 3M6DA 4MPKA 1VBRA 1JNDA 4DWSB 4AD4A 4W93A 3U5UA 5CLTA 3RDKA 4ZXLA 1WZLA 1V6UA 2JE8A 4D71A 3AFBA 4ACZB 3BAXA 1US2A 3U5YA 4MTVA 1XRVA 3RIKA 4PMNA 1CZ1A 1CGUA 2VC9A 1W1VA 1LG2A 5A2CA 2W92A 1EXPA 2W67A 5AC4A 2VX6A 1QNOA 3SCSA 3KE0A 1E1FA 1R85A 3N12A 1TUXA 2XIBA 2E9BA 1K9FA 3VMOA 3AIVA 3VMNA 5I6SA 3RO8A 4JKLA 1NOWA 3WEZA 1S46A 4EKJA 4TVCA 5FL1A 4ATDA 2D20A 2J4GA 1RH9A 2OSXA 1LQ0A 4PTMA 5IFPA 3GBDA 1M03A 1JFXA 1PX3A 1EGZA 4HOXA 3CH9A 3JUGA 1L8NA 2QHAA 3ARSA 4CN4A 3CTTA 3GTNA 3EMZA 1TZ7A 1EO7A 5BXTA 5CXPA 3PTQA 4JHZA 1OGBA 1W9BM 2D23A 5JBFA 1ZBWA 3N04A 3PZNA 4E8CA 4CN1A 2BVDA 2VL4A 1CXLA 3W29A 1G94A 3AHXA 3VOCA 5CJ5A 3AMKA 1W9VA 2EJ1A 3ZQ9A 8A3HA 1W3JA 4HA3A 1HL8A 2XG9A 1PBGA 3MSGA 2D1ZA 4AW7A 1MXGA 1KWKA 2G3JA 2E9LA 3T2PA 3WBAA 3W53A 3PZTA 1H2JA 4ZE4A 4D6DA 4BQ5A 3LPFA 1CTNA 4W87A 1HKJA 2PB1A 4HU0A 2CKRA 2ZX7A 4J3WA 3G6MA 1LF1A 4GINA 1NOUA 1W2PA 1W9PA 1JD7A 1CXFA 1PIFA 3W27A 4GKLA 1LL4A 5DT5A 3WUFA 5JBDA 2WANA 3MUAA 1D2KA 4W86A 3ZR5A 1BYBA 1TA3A 4KGLA 4XZWA 3B9DA 2VJXA 2CERA 1V6XA 3TOPA 3T0BA 1GPFA 1W32A 1ISZA 1UD8A 1OIFA 2V38A 2BY0A 3W82A 1VFFA 1LWHA 4KMQA 4YHGA 3PZQA 1CLXA 3VIJA 3W26A 2QPSA 1AQ0A 3MUZ1 1YHTA 2WMGA 2XHYA 1BSIA 2UY3A 6CGTA 3SCNA 4CU6A 2VQTA 3ARWA 2BY1A 2ZUWA 3PZ9A 5M17A 3K4AA 1UR4A 1J0ZA 1PJ9A 1JXKA 4Z2LA 2EPLX 4QLLA 3W24A 2F8QA 3UR8A 2FGLA 2ZUMA 4M29A 2ZOXA 3SUTA 1HKMA 2ZICA 4NZCA 4AZBA 4RL3A 3U7VA 1M7XA 2JIWA 4FLRA 1UH4A 4PMRA 4NI3A 3CPUA 3ARQA 4UFJA 3OLGA 1VFUA 2VZOA 4WF7A 1GORA 1JZ3A 3W0KA 3PTKA 2VX7A 1Q6EA 5CPQA 1OWQA 3NDYA 7CGTA 3WDHA 1V08A 1CGVA 5A8NA 3LPPA 1Q6DA 2D0HA 1WDSA 3UG4A 3WEOA 4Z2KA 3IANA 5BCAA 5JUVA 4GI9A 5ECUA 5I24A 4CD7A 3SCOA 1ISVA 2X1IA 4M8UA 1ZJBA 3FAXA 2W63A 5A6BD 4C7DA 2DDXA 3UG3A 1UKQA 4F79A 2DIEA 2FDMA 3BMVA 2OLHA 4D1IA 2WK2A 1E3ZA 1MQPA 1UD4A 3A4WA 2VVNA 1RD6A 3AROA 2J7FA 3MSDA 4IPNB 4AZ5A 4CVUA 3OLIA 1VRXA 1MQRA 3II1A 3WQ4A 1G5AA 1US3A 1PEZA 4HPHA 4Z2HA 1KGWA 4CCEA 1NWUA 2YL8A 1B30A 3A6OA 3SCVA 2WSKA 3SCWA 3CHEA 1C91A 2YOCA 2MANA 1I1WA 2G4FA 2J25A 1E71M 2VRQA 3ZT5A 1J12A 1OGSA 1X6LA 1GOMA 3GZAA 3VINA 4HZ7A 2XTKA 3UG5A 2V3EA 2OWCA 2GDVA 2RGMA 4R27A 5ABFB 1XGZA 4AZCB 2WSPA 3AOFA 5CPSA 3WL1A 4QLKA 1SYTA 4PMXA 4D6EA 3M7SA 4BZYA 4S3KA 3WNPA 5FIPA 3CGTA 1KXHA 2O9RA 3WMSA 1BLIA 1ZL1A 1BF2A 5A2AA 2YLAA 3FXYA 4AWEA 2Y8KA 1EQCA 3W6MA 1YQ2A 4MNJA 4ZFMA 3PZGA 3VD5A 4Z2IA 4MDOA 5DT7A 1N82A 3ALGA 1UR1A 1ZBVA 3AHYA 5FD0A 2DSUA 1XSIA 4TVDA 4R5EA 5KZ6A 4M82A 4A3HA 1KR0A 2BV9A 4FK9A 3SUUA 5DMYA 2D3NA 3VGEA 1E5NA 3UEQA 2XVGA 3W4RA 4B9YA 1KWGA 3VUPA 2A3BA 5A6BA 2AAAA 3ZIZA 2E4TA 2XVNA 2CNCA 4MNKA 4PMZA 4HTYA 3OBAA 4H04A 3CUHA 2XSBA 5EFFA 3AHTA 2WWDA 3ZR6A 2WMHA 1DWAM 1BFNA 1ZS2A 2JFEX 1O7AA 3VGGA 1GONA 2ZUUA 1TMQA 3VIMA 1UUQA 1UWUA 2WZEA 2WBKA 1J9YA 4WK9A 3WDIA 4B16A 2YDSA 4DUXA 3T2OA 2WC4A 3EDFA 2VCCA 3MV01 5M03A 1B3WA 3DECA 2WMFA 3CMJA 3SUVA 4E2OA 4JCLA 1ZBKA 2J74A 1FH8A 1JD9A 2FH8A 2D24A 2DT2A 1WDQA 3PZOA 3TTQA 1GVYA 3WF3A 4TTGA 4CU7A 4W5ZA 3VD7A 5I0DA 3GXIA 1ODUA 2Y24A 1GOQA 4PCSA 1DWJM 4CD8A 1HJSA 1UD6A 1VEOA 3ECQA 3SUSA 1G1YA 5FKYA 4QCEA 2IXUA 4UQDA 6A3HA 1FP8A 2Y2WA 1CGYA 4AIEA 1JZ8A 1KXQA 2BXYA 1Q6GA 3WDRA 2VZSA 3E1F1 1NP0A 4BF7A 3SIMA 4U5KA 5I78A 1MXDA 3ZSTA 4P8WA 3WNOA 4BQ2A 3L4TA 3DHPA 4UZUA 1KQZA 4GO8A 2Q8XA 3AS3A 3SCPA 3GYCA 1HKKA 4KH2A 1XYFA 6TAAA 1KXVA 1XCXA 1V6WA 1OBAA 5ABGA 1A47A 4HA4A 3VDBA 1H4PA 2ZUNA 1MFVA 4P7LA 3EDDA 1CYGA 3WDPP 2TAAA 1OIMA 4HZ8A 5FOOA 1R87A 4PSRA 1VJSA 3VM7A 3BAYA 2VT0A 1UA7A 3AXIA 3VIKA 4OBSA 2XIIA 1MW1A 3FHAA 2QF8A 1JXJA 3AZSA 3N9KA 4UCFA 1EO5A 2YA2A 2W4XA 1HT6A 3OG2A 1JYXA 1AQMA 4DWSD 5E9AA 2ZXBA 4MB4A 4Y7EA 3VTRA 1R7AA 5AYIA 1UZ1A 1ITXA 3TONA 4XB3A 1OB0A 1QOXA 3VGHA 3THDA 4Z2JA 2GK1B 3N18A 3OZPA 1MVYA 4WSKA 1GOWA 3F5JA 1ESWA 1UKPA 3NJ3A 4GI8A 1WZMA 1KQYA 3WD1A 4UFKA 3CUIA 3GM8A 4AYSA 1QPKA 5A3HA 3WF4A 1DWGM 2J7GA 4D6CA 3K46A 4W5UA 5C71A 3K8MA 1PZ3A 1XC6A 1V3JA 1BG9A 1W3LA 2WVTA 4U33A 1DWFM 1OD8A 1CGWA 2XSAA 1E15A 2HISA 2WHKA 2BHZA 3MU7A 2VI0A 5IHRA 5E0FA 1H49A 4QDMA 2GFTA 3AYRA 2WCGA 2AOSA 4WKAA 4V27A 5A6AA 2XM1A 2O9PA 1HP5A 2ZUSA 2E3ZA 4AISA 1FH9A 2V5DA 2WMIA 5GPRA 3PN8A 1CLVA 3WDJA 3HN3A 3SEPA 1WDPA 2WXDM 4BQ4A 3W6LA 1W1TA 4DUWA 3PZVA 3RJXA 4YN5A 2CETA 1JFHA 5CGMA 4CD6A 2WLYA 4FLOA 3ZM8A 2PWFA 5A8MA 1KCLA 1V03A 2J75A 2W66A 4TVUA 3CHCA 1VENA 3VO0A 1H0IA 4JKKA 5E0CA 3WQ6A 1PX4A 3CZJA 4UZSA 1GOKA 4XZBA 4DWSA 1E6QM 2G3NA 2VO5A 4GXPA 4MB5A 2VR4A 2VZVA 4MAVA 2W61A 4AZIA 4ACZA 1J0JA 1PAMA 2VCBA 4W8AA 1UR2A 2BVTA 3CIVA 2OYLA 5CG0A 1FOBA 1W3KA 1Q6CA 2EQDA 3PTMA 4ATWA 1XCWA 2V5CA 4HOWA 4OOZA 3T0DA 3WD0A 2WCSA 2VRKA 1PPIA 3RM4A 1Y7VA 1DWIM 1WZKA 4PCTA 4OIFA 3BAKA 1E4NA 4IUGA 1H09A 3BH4A 3EMCA 4TX8A 4M80A 2WKLA 4GQQA 1HL9A 1NM9A 2VRJA 4PTXA 1E73M 1HNYA 2CPUA 4JFUA 4MJ4A 1C7TA 4D6IA 4NSBA 5HDRA 1JZ2A 1B31A 1GVIA 4OKDA 3MO4A 1R7OA 3BLPX 2BXZA 4N42A 1UKOA 1WO2A 3F5LA 3UERA 3N17A 4CCDA 3ALFA 3WH9A 2VMFA 1ZB5A 5ABHA 4UNIA 5CSYA 4J7RA 4MADA 4GIAA 3VNYA 2UY4A 3WD3A 4JFVA 2VCAA 1I1XA 3RJYA 2VX4A 5IDIA 4PTVA 3CUFA 1QVBA 4GO9A 1E4IA 1E6XM 2YL5A 3F5KA 3GXMA 2IUZA 3QOKA 5E70A 1GOIA 1CDGA 1V0LA 3CO4A 3AS2A 3VIFA 2Z1SA 1TCMA 1H41A 5HPOA 4M56A 3ARZA 3WL0A 4A4AA 4OZOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2C0H A;  2VOT A;  4H2C A;  4FLQ A;  5I77 A;  1UWR A;  2PBO A;  2QPU A;  1OCQ A;  3MKK A;  4P7O A;  1V3M A;  4DUV A;  2WM0 A;  5BWF A;  1V0M A;  1XD0 A;  2Y5E A;  2PF0 A;  2PBG A;  3WQW A;  1QI4 A;  3WNN A;  2ESC A;  2YL6 A;  4UOJ A;  4P8U A;  1E0V A;  1E40 A;  1CEC A;  3KL0 A;  1UD3 A;  5C8B B;  3BC9 A;  1JZ7 A;  2C7F A;  5A69 A;  4HOZ A;  1MW2 A;  1E4L A;  5E09 A;  4D1J A;  1B90 A;  1CNV A;  2GVY A;  4AZG A;  1W1P A;  3N13 A;  3NIY A;  2FHC A;  3W38 A;  3M07 A;  1DED A;  1CXK A;  1JYV A;  2X05 A;  2DSZ A;  4W8L A;  3AHV A;  2CHO A;  3ZJK A;  1UWI A;  1WAW A;  1L0P A;  3L4Y A;  4U3C A;  4KGJ A;  1NQ6 A;  2A3A A;  4GZE A;  2WHL A;  1NWR A;  4UFL A;  2J7B A;  2GJR A;  3ZMR A;  1V3L A;  2PWH A;  2E8Y A;  2EBN A;  3VIG A;  4UQ9 A;  1DHK A;  1KGX A;  1FFR A;  3AZR A;  1D7F A;  3ZJ8 A;  4U2Z A;  4H8H A;  3A3H A;  1VEM A;  4KWU A;  2J62 A;  3AMC A;  4TXE A;  1IT0 A;  1C92 A;  1JAE A;  4X0V A;  3G6L A;  2DGA A;  3LPG A;  5CLW A;  2D0F A;  2PWE A;  3AIQ A;  4ZEP A;  2FH6 A;  3PBG A;  2ZX9 A;  3AS0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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