5E93A

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with neq0071
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Exploring Trypanosoma cruzi Dihydroorotate Dehydrogenase Active Site Plasticity for the Discovery of Potent and Selective Inhibitors with Trypanocidal Activity
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi strain cl brener
total genus 110
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2015-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 5e93A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5e93A01
2X2GA 3C61A 4O0ZA 3UY8A 3W2UA 3TCEA 1EEPA 4HHPA 3C52A 1C8VA 1SSGA 4MY8A 1F73A 5AB3A 3A22A 3BW2A 4IPJA 1H61A 3DXIA 3LTPA 4LOCA 1V5XA 4Z1DA 4M6QA 1G4TA 4R34A 5D09A 3W84A 1XFBA 5FF2A 1DBTA 1FWWA 4EF8A 3P5ZA 4LS0A 2QCHA 3G24A 1GPWA 4EVZA 1TMHA 2CLEA 3W3OA 1RVGA 3N3MA 4EF9A 5J5RA 1GWJA 5KMYA 1TRIA 3TQVA 3RU6A 3RMJA 4NXSA 5G4EA 4O50A 1K02A 2V0TA 1EP2A 3QMRA 4OGZA 3NQFA 3CB8A 3IVUA 1G4EA 3SFKA 3NQMA 1TPB1 2NUWA 3CQ0A 1K8YA 1RZMA 3KRSA 5DBTA 2RDTA 2ZRVA 4H6KA 1T96A 3FKRA 3C0JA 3O63A 5D05A 2A2IA 1FXQA 3P62A 3W9ZA 3UD6A 3RK8A 1Y0EA 2EAWA 5EYWA 3G1YA 4Z1AA 3R13A 3EWUA 5IBXA 2X1SA 2YW3A 4LVGA 1QO2A 1PVNA 2ZZ4A 4JX6A 2A85A 4O13A 4MIMA 4Y96A 3TDFA 4NX0A 1JCJA 4E2BA 2HTMA 4N9DA 3G1HA 2C0AA 1FCVA 1MEWA 3GB6A 1GVOA 4MY1A 5LGXA 5K2ZA 3STGA 3VFLA 3GKFA 1ZJIA 1QO5A 1KA9F 1J2WA 3M5YA 5LHFA 1I2PA 1AMKA 1PL9A 5I3HA 3TIMA 1YTKA 1LRNA 4OV9A 3HG2A 5HWMA 1EPXA 1QNVA 3UNDA 3LCHA 3QM3A 4CQ9A 3MI6A 1SUXA 1XBVA 1G4SA 3TX9A 2C19A 3VE9A 4CNNA 4BI6A 4K38A 3C6CA 1O94A 2CLHA 3U2OA 3L5MA 3Q94A 4POCA 3W22A 1S3HA 1DORA 3F4NA 1UUOA 1H50A 4JTHA 3CT7A 3A5VA 4MJZA 1DHPA 2Y88A 4UTTA 1NVMA 4J9JA 3DFTA 3FA5A 4GUJA 4LUJA 1W3IA 4RKAA 1ICSA 1DQXA 3W71A 2B7PA 2VKZG 4CLMA 2WNQA 5LNUA 1SO3A 3IIPA 3OHIA 5I3GA 4L4LA 2H8XA 3DGRA 3PB0A 3P8JA 5TBOA 1VLIA 2A7PA 1WOBA 4JICA 1WX0A 1SO5A 5EMUA 1K03A 3G1XA 4FNTA 3RLUA 3YPIA 4UTJA 1MEIA 4DO6A 2YYTA 4GRSA 3FJLA 3B4UA 3UWVA 2A6NA 3BG3A 3EXRA 4BFAA 5C2XA 3VNDA 2FIQA 1VR6A 2Y7GA 4X22A 4AHPA 4RXGA 3PUEA 1SZEA 3L5AA 4L4MA 5CZTA 1GEQA 1ZNNA 5KTLA 4BF9A 4O10A 3ZR4A 3LERA 1RPXA 3NQ8A 4AF0A 1K8ZA 5KZEA 4FXSA 1GVFA 3WFAA 5KSWA 1RR2A 4LY8A 1PIIA 4WXZA 2WO5A 2NXGA 1YXYA 3PBUA 1TJRA 5MHBA 1NAL1 5F4WA 3ANYA 3DBPA 3T7VA 1QFEA 1WV2A 4OE7A 2NLIA 1FQ0A 3S42A 3EWBX 5G1TA 4HNVA 3IIZA 5C55A 3SR7A 3LXBA 3NQGA 2Y7FA 3N2XA 5KITA 4LS1A 1GYLA 1OFOA 4C1LA 3DI1A 1OFRA 1HG3A 1W1ZA 1KM2A 2XN2A 3W1UA 1K3UA 4UTMA 1KFCA 3VE7A 1S5TA 1ZHAA 5I3KA 3KRUA 4XKYB 3QSRA 4I7VA 3B04A 3LCLA 5CGQA 4GUFA 1KBJA 3UXAA 2B7OA 1RV8A 2WNNA 3DU0A 1CW2A 5A5WA 3LHZA 1KFKA 4S2CA 1P0KA 1O95A 3DFQA 3VCRA 1F05A 3WK2A 4KFPA 3FIGA 3E02A 4K7YA 3QYQA 3S1XA 4XBKA 1IF2A 2Y70A 3PUDA 4N9EA 4RV8A 3EWYA 5CZSA 2ZTJA 5LKYA 3OVQA 3EWXA 4LC6A 3A24A 3UWQA 3LRLA 3G1AA 3NGJA 4KKXA 2JGQA 2DJXA 2Z6JA 2QCFA 4WY0B 3ABQA 5AC8A 3M7WA 4I7UA 3DZ1A 3BG5A 3P82A 3W85A 3HG4A 3W1PA 1R47A 4DPQA 3W23A 1V7YA 3STFA 1B57A 3RF9A 3W7KA 1XUZA 4JTKA 1YTDA 4FHAA 2DU2A 5AYZA 2VEMA 4IOTA 3W1MA 4NJGA 4EIVA 2WQPA 3N19B 2YR1A 3W2NA 4DF2A 4WY0F 4ALDA 3D0CA 3GIYA 3LDVA 4UR7A 2ZZ1A 2ZBTA 2GJNA 4IXXA 1XI3A 3G0UA 1ZFJA 3VI2A 3S0CA 4GNJA 4Z1CA 1TJPA 1M7PA 1FWSA 1I8JA 2NUXA 3NXFA 3BGGA 3GAKA 5GVJA 4N4QA 3CU2A 1EA0A 2EF9A 4Y90A 3E49A 4KWWA 2WSYA 3LM7A 2HS8A 2EHHA 2ZQ0A 3DFSA 3GDTA 4C1KA 3LTSA 3EWWA 4LRSA 1EP3A 5D30A 3S1UA 4Z1BA 1SPQA 1A50A 2BSLA 3WK0A 4BI7A 4MYAA 2QJGA 4RZ6A 3W7DA 3NQCA 4BK9A 1RD5A 1S5VA 3BPWA 3GKAA 1J4EA 1WA3A 3N9RA 1K8XA 1LDCA 1VJIA 3I68A 3NPXA 1PCKA 4Y8FA 2WPBA 4FX8A 2V81A 3LI1A 2E6YA 1EX5A 1QOQA 3CPRA 3KVLA 3NAVA 2CLIA 2P0OA 3L68A 5G2IA 3I7QA 4E38A 2Q8ZA 3M44A 3Q37A 3SI9A 3CIXA 2TSYA 3JR2A 3NDOA 3NR0A 2GJLA 4GE8A 3FEMA 4RR4A 4PEKA 3R8RA 2J9ZA 1B4EA 3L67A 3PBWA 4G1KA 1JJKA 2VELA 4GBUA 3IV3A 3L0KA 3GK0A 2WV8A 2E5DA 3BK0A 3O6DA 3PULA 4IMDA 3DFPA 2V2HA 4AEOA 3MW7A 5IM51 1Q6QA 1D9EA 1VYSX 3I7RA 2R8WA 1TO3A 3KVJA 4OQVA 2FPYA 3TMQA 3TXZA 1K7EA 4FNRA 4D2JA 3G22A 3CTLA 3WJWA 2G5WA 2YYUA 4O54A 3NL5A 4UTWC 5FF7A 2FPTA 5KINA 3KRZA 2PRHA 2CU0A 2V9DA 1A5SA 4UNKA 3HOJA 1MSSA 3ABOA 2YW4A 3NL2A 1VYPX 1BWLA 5KZDA 3W7MA 2WJZA 5BOOA 1OF6A 2ZZ6A 1W56A 1QCWA 4NX5A 3DH7A 4UFKA 1BEUA 3NOEA 3W88A 2QJHA 2FB3A 3TFXA 3OBKA 1ZAHA 3L9CA 4LNYA 2VEPA 2J24A 3W1QA 1F7BA 2Y7DA 5CZJA 5HJLA 2Y6ZA 3BLFA 1JUEA 1KTCA 1IXPA 3LTYA 2ALDA 1AL7A 4UNLA 4A2RA 2A21A 4E2DA 1JCNA 3GZ3A 4FB7A 1JCMP 4MPQA 2X16A 2ZA2A 3KVKA 4UCGA 3NPUA 3HG5A 3W1XA 1MEHA 1OG0A 3DHDA 3HO8A 4NNAA 4NNCA 1W3NA 1H62A 1VZWA 3E12A 1LM1A 4YMZA 4ZQRA 2QCLA 2Y7EA 2QCCA 5DCDA 2Q3OA 3TE9A 1SU5A 4ZQCA 4WY0A 3SGZA 5LSMA 1HO1A 2OT0A 2E68A 1G69A 2E6FA 3TW6A 1Q45A 2H8ZA 1EWDA 1WAUA 2OZ0A 3GXPA 1PHQA 3NPVA 3W7CA 2C15A 4PL1A 4JTEA 3LHUA 1QAPA 2PCQA 2A5HA 2JKEA 3NNTA 4RK8A 1DQWA 4JX4A 3F4WA 1C9DA 1OK6A 2CZEA 3EEGA 3O1NA 4JDBA 3KX6A 5D2VA 5D03A 3UWUA 4FX6M 1XXXA 3NQDA 1FX6A 3HPXA 2TRSA 3LRMA 4UC5A 2QUVA 1ME9A 3CC1A 4Q32A 4PA8A 4GUGA 1G6CA 1LCOA 2ZRZA 5LGZA 4O17A 4E0CA 1XDMA 2J27A 3G1FA 3IVSA 5FF3A 3O06A 4IX2A 3PG8A 4H4IA 2QUUA 2EPHA 3WK3A 3TQKA 3IRDA 3P7YA 2X1TA 3W1LA 3S5NA 1VCVA 4OU1A 1P1XA 4YL2A 3DFNA 4GWEA 1TTJA 5L9FA 2ATSA 3N73A 4CNOA 1OFQA 3G1VA 1H7PA 4XQ6A 5HINA 3L65A 2VFFA 3CEPA 2E1DA 2PURA 1CI1A 1H60A 2XN0A 3MI3A 3R12A 4N9BA 4O19A 4RJEA 4A21A 1YLVA 2C3ZA 1OF8A 4Q33A 5E0KA 1MXSA 3STCA 3MWAA 3TXVA 4N6EA 3C2OA 4O18A 4JIQA 4YXGA 1LP6A 2QCGA 3PF3A 3KVMA 4UTWA 1YDOA 4JTGA 1N55A 4DQWA 2ZA3A 3GNNA 1GZGA 3IIOA 3LBCA 5HUPA 2NX3A 3W7EA 3N14A 3KAOA 5DCEA 3EKLA 4UTLA 5BMWA 3A9IA 1R2TA 1R30A 3PY2A 3BV4A 3IGSA 1GQNA 1TREA 3NYZA 4Y9AA 5K4ZA 2RDUA 5AHLA 4FNPA 3W72A 3W7PA 1TPEA 4U4MA 5LNRA 1K7XA 5CSRA 2WNZA 4IX0A 1GT8A 3HQ1A 1DKWA 3DENA 4DO5A 1A53A 2C6QA 3ZS4A 4O1CA 3M5ZA 2ZRYA 1LBLA 2CWNA 5G4WA 3W7RA 4Z0SA 4YLWA 3I6RA 5EL1A 4CCEA 3GDMA 3W7HA 1VCGA 1OYCA 3W1AA 3A5FA 3AO0A 4N9CA 2A4AA 2ZRUA 2YXGA 1G7UA 5K9DA 4OHQA 1W37A 4DBEA 3AJXA 4NXKA 3A23A 4AH7A 2A7RA 2Z2UA 1RQHA 2A0NA 3DKJA 3PUOA 4M19A 1E51A 4H3DA 3GXNA 4LWWA 2I14A 1T8XA 4LW7A 3SZ8A 2JK2A 3W7LA 3DHFA 1H7OA 2ZRWA 5CPOA 1AW2A 2QKFA 1VPXA 3MP3A 4JTLA 1ONRA 1KFBA 1KM6A 2VEKA 1AK5A 2V8ZA 2C14A 1H7NA 3QPZA 3ABSA 4QAIA 3CWOX 4TMCA 4JR5A 4QSHA 4M7SA 5LHEA 3HJZA 2B0MA 3V1PA 3LHVA 3SW6A 3G8EA 2QCMA 3UXDA 3DAQA 1DOSA 3S8HA 4RZ5A 1YDNA 3C2EA 1GVQA 4DXVA 1G67A 4RZ4A 3F1QA 3EB2A 3VKJA 3QZEA 4JTUA 3C56A 2V5BA 3EXTA 2Y89A 4AHQA 4LT9A 4MFDA 1TPC1 7TIMA 1OABA 3EX6A 2FDSA 5C5YA 4OT7A 4BR1A 4FNSA 1JULA 2CFFA 2VFIA 1HFBA 3CIWA 2UV8G 1QWGA 2AGKA 2FTPA 4LVDA 5D33A 5HR6A 3LOTA 3OA3A 1Q6RA 4MZ8A 3T44A 3C8FA 3M47A 4NJIA 4WQ6A 3PBVA 3LLFA 2G95A 3M5XA 1LORA 3FKKA 1KTBA 5K9CA 3GX9A 3IVTA 2CW6A 1ML1A 3TAOA 2DZUA 5SWUA 1K7FA 4UFLA 1ZENA 1M6JA 1JRCA 1P4CA 3L0GA 4LVAA 1NSJA 4ZL1A 1QOPA 3W6YA 3M9YA 3S5ZA 1W5OA 4O14A 5ABTA 2VFEA 5HWJA 1JUBA 2LLEA 3K30A 5J5DA 4PTNA 4FX7A 1EIXA 3QPYA 5FEXA 1TTQA 1WXJA 3P61A 3TA6A 4WOQA 3W86A 4MFEA 1X1ZA 3QMSA 4LUIA 3UWYA 3WJSA 3LCGA 1SFLA 4JX5A 2W6RA 4PL2A 4UMBA 4ADUA 1THFD 5CSSA 4U28A 2V30A 3R2GA 5D2TA 1JCLA 1N8FA 2ZZ2A 2FQIA 1TPFA 4QM1A 1M7OA 1XDLA 4IMFA 2NV1A 4JEQA 3W2MA 2BZNA 3H53A 3LHYA 2A6LA 3W70A 6ALDA 5CPNA 5FEPA 4NNBA 4QNWA 3NL3A 4FXRA 4IQLA 2CLKA 1I2RA 2GUUA 1LLZA 3O07A 2YFNA 1I4NA 2ISWA 1LLWA 4JY9A 3TQ0A 2C13A 5LNWA 1ICPA 1W5MA 2AQWA 2FJKA 5LZLA 1WBHA 3IEBA 1UB3A 1SSDA 1F5ZA 4Z0JA 2YX0A 2CZDA 4IMEA 4MZYA 1YADA 5G1YA 5EY5A 1WYIA 2C16A 3W2KA 4K7VA 4HNNA 3P84A 1YXDA 3PVFA 4MVAA 4ADTA 1H7WA 3SJ3A 4IXHA 3S1VA 3QSTA 3LCWA 1F6PA 1DVJA 1W0MA 3B0VC 3DI0A 4K8HA 1I2NA 3BW3A 4AXKA 1W54A 2O7SA 3Q58A 5D02A 1W31A 3WJZA 3SECA 1P5BA 3UWWA 2ISVA 1FWTA 1SZNA 2VFDA 4JTJA 3T4CA 1BTMA 1KFLA 3UYCA 1EUAA 1JVNA 1XUUA 1RQBA 4LV9A 2PRLA 3PM6A 2Y62A 3LI0A 4Q4KA 3TH6A 5C6MA 3W87A 1KBIA 4JXCA 2QCDB 3UWZA 5T26A 3W2JA 2H3BA 3MP4A 1YPIA 3DFOA 4DF1A 4R7JA 1FCBA 1EWEA 3CHVA 3OEXA 4JYDA 2TPSA 3THQA 4PH6A 3QEZA 2D73A 1PCWA 3PSWA 4O8RA 1TPUA 1FWNA 2Y85A 3FLUA 1HUVA 1GG0A 3O05A 4AWUA 5DCBA 3BG9A 1KM0A 4K37A 5HR7A 1Q6LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M1B A;  3HQO A;  3TCE A;  1EEP A;  4OKD A;  4FK9 A;  3VKD A;  1V0M A;  1MXG A;  4S3J A;  3RR1 A;  2WC4 A;  5PTD A;  3QKZ A;  4LH8 A;  4IPJ A;  2Y5S A;  1XYB A;  3Q65 A;  1YBQ B;  3V36 A;  1MRA A;  4M6Q A;  2PDU A;  4L6D A;  1FWW A;  4EF8 A;  1J0K A;  3G24 A;  1GPW A;  1TMH A;  1T41 A;  3WEZ A;  2J77 A;  4HZM A;  3GRI A;  4EF9 A;  4DYE A;  1CB7 B;  4NXS A;  5G4E A;  1W1T A;  3QMR A;  3GNO A;  4OGZ A;  1J6O A;  3SFK A;  2WNW A;  2QYG A;  2XSA A;  1CDG A;  2VX4 A;  3H12 A;  1RZM A;  2Z7K A;  4YN5 A;  1V3H A;  2XUC A;  4S3A A;  1AOD A;  2BHZ A;  3W9Z A;  2A2I A;  1FXQ A;  4PMO A;  3RK8 A;  5CSU A;  5EYW A;  3G1Y A;  4GA8 A;  4LBS A;  3R13 A;  3EWU A;  3PZG A;  1QO2 A;  1VPQ A;  5BU9 A;  2XH7 A;  1PVN A;  2ZZ4 A;  3BOL A;  4C6K A;  3HU7 A;  3TDF A;  2YCI X;  4NX0 A;  4E2B A;  5I0D A;  1MEW A;  4REQ B;  4JNZ A;  3TLQ A;  2ZDS A;  3STG A;  1XIF A;  3VFL A;  4PB5 A;  5REQ A;  3R43 A;  3GKF A;  3RHG A;  1ZJI A;  3GZA A;  2WHM A;  2FHC A;  1QO5 A;  1CGX A;  3W29 A;  1I2P A;  4W8L A;  4JHO A;  1AMK A; 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