5EBAA

Crystal structure of aromatic mutant (y343a) of an alkali thermostable gh10 xylanase from bacillus sp. ng-27
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
354
structure length
354
Chain Sequence
VQPFAWQVASLADRYEESFDIGAAVEPHQLNGRQGKVLKHHYNSIVAENAMKPISLQPEEGVFTWDGADAIVEFARKNNMNLRFHTLVWHNQVPDWFFLDEEGNPMVEETNEAKRQANKELLLERLETHIKTVVERYKDDVTAWDVVNEVVDDGTPNERGLRESVWYQITGDEYIRVAFETARKYAGEDAKLFINDYNTEVTPKRDHLYNLVQDLLADGVPIDGVGHQAHIQIDWPTIDEIRTSMEMFAGLGLDNQVTELDVSLYGWPPRPAFPTYDAIPQERFQAQADRYNQLFELYEELDADLSSVTFWGIADNHTWLDDRAREYNDGVGKDAPFVFDPNARVKPAFWRIID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of aromatic mutant (Y343A) of an alkali thermostable GH10 xylanase from Bacillus sp. NG-27
rcsb
molecule keywords Beta-xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. ng-27
total genus 139
structure length 354
sequence length 354
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2015-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5ebaA00
3EDDA 2J7DA 1JZ2A 5DEZA 2BHZA 4P8VA 4QCEA 3VNZA 5E09A 1GW1A 1EDQA 1WO2A 2WBGA 4M80A 1KFWA 4AZHA 4C7GA 4V2XA 5I24A 3T2QA 1CGXA 1VF8A 2EJ1A 2PB1A 1VBUA 1ZBCA 1BG4A 3BAWA 3K4AA 3QHMA 1DWJM 4AIEA 3VGFA 3RDKA 4YN5A 2WBKA 3L4UA 2G8ZA 4ZXOA 4B3LA 4GINA 4Z2LA 4AIOA 5GNXA 2PWDA 2XM1A 1ZS2A 4CU7A 5BXTA 1UR4A 1KXTA 3VD9A 3VKKA 2W62A 3W27A 4Z2GA 4J3TA 3VMPA 1X6NA 1H4PA 2QMKA 3CUIA 3WF3A 3DYOA 4MNMA 1AQMA 2VZVA 1HJUA 5A6KA 1EXPA 2E9MA 1EDGA 5ABFB 1XYFA 5D4YA 3T0BA 3AMGA 1L0PA 1FH9A 4WF7A 4MB1A 5FD0A 1FH8A 1CXHA 2A3AA 2OSXA 2WZEA 1KBBA 1E6NA 2BY3A 2RGMA 5A8QA 1WDQA 2VZSA 1BFNA 2VQUA 1GOWA 1NWRA 1HNYA 2J7CA 1QNPA 3BAYA 5IHSA 2VURA 4HU8A 1V03A 2J79A 3HN3A 1JYXA 2VZTA 1WZMA 1VFMA 1MXGA 2VO5A 1H11A 3QOKA 1W9BM 1PX3A 5I2UA 3RIKA 1DWFM 5F7UA 1E4NA 2VZOA 3WH8A 2J25A 1UG6A 3UR7A 3VDAA 4TUFA 5BYWA 5A6BD 3ZJ8A 4J28A 3CTTA 1NQ6A 5M17A 1M01A 4UQ9A 1RPKA 2BS9A 2WANA 4MTVA 3MANA 1ZBVA 2Y2WA 2J8GA 2ZIDA 3FW6A 2VX7A 3MMUA 2YA1A 1IT0A 3WFLA 1GORA 2VI0A 4CCDA 1Q6GA 3CH9A 4UFIA 4AZIA 1CXEA 4J3SA 4IUGA 3VVGA 4HMDA 3G6LA 4H8UA 3T08A 1E6XM 2OYLA 1MW3A 4TTGA 2VVSA 3N18A 5IFTA 1CLVA 4D1JA 1KQYA 4E2OA 3W6MA 2JF6A 1LQ0A 4W88A 1F4HA 3AQUA 4ML4A 4B9ZA 3T0DA 1ISXA 1TUXA 1US2A 3IJ8A 4W7UA 2VRKA 1FFRA 2WW5A 3A6OA 4PTXA 1L8NA 2J7HA 1XH1A 4PMNA 1FHDA 2CXGA 2PI6A 1QNQA 3N12A 1JZ4A 4OOZA 5HNNA 4MADA 3SCRA 2VCBA 1HN1A 1HT6A 1LL7A 5ABGA 4DWSA 2XIIA 3KWXA 1E15A 3K46A 3UR8A 3RM4A 3PBGA 1PPIA 1U33A 1TMQA 4WSJA 3AS2A 5EBAA 1BVNP 3NYDA 2WVSA 2E40A 3PZQA 5BCAA 5I5RA 5GNYA 1KR0A 4C7DA 3SCOA 5FOOA 1CIUA 1E0VA 3WY1A 4HPGA 1US3A 2A3BA 1CYGA 4DWSC 3F5KA 4CU8A 3GXIA 3FNDA 4DM1A 3IAQA 3KEHA 4QCFA 2WXDM 3OZPA 1EHNA 2JALA 1VEOA 4D72A 5DFAA 1CZ1A 3GH7A 1EA9C 4KRUA 2VRJA 3RJYA 3W53A 2J7GA 1A47A 1MVYA 2VC9A 2XG9A 3U5YA 3AMLA 1CDGA 3HU7A 3AHVA 5HDRA 1VFFA 3SUTA 3L4ZA 2CEQA 2C8NA 3VGBA 4FLSA 4XZWA 1DWGM 2PWFA 2VT0A 5E70A 4GI8A 1JDDA 3NDYA 2Y4SA 4W7WA 1XSIA 3T0AA 4J3VA 1H3GA 1NM9A 3W28A 1IZKA 2X05A 4ATWA 2IXUA 1VRXA 1JD9A 4KMQA 3TTOA 4UTFA 3CUJA 3VM5A 2DDXA 3SIMA 3NIYA 3WBAA 1CTNA 1MQRA 2JE8A 4UFLA 4W8BA 4FLOA 3W81A 3UCQA 3WNMA 3SCTA 3U7BA 4ATLA 3EMCA 1UKSA 3WDHA 3FY1A 3IK2A 3DYMA 2FGLA 1GQLA 3CZ8A 4UFKA 3CLWA 3PZUA 3WQVA 3FHQA 6A3HA 3CUHA 1V0LA 3NCOA 4H8HA 1WAWA 1UKQA 2CBJA 5BRPA 1HIZA 5BXRA 1OT2A 2VJXA 1UR1A 3SCPA 2BY1A 1E1EA 1TCMA 1KGXA 1MW1A 1BLIA 1W1TA 1OB0A 1QNSA 3AHYA 2XHYA 3ARSA 1GVYA 1XD0A 2DSKA 4FLRA 4OIFA 4W8LA 2O9RA 4PMOA 2TAAA 3ARWA 1W3JA 2WLZA 5A2AA 3DHPA 2GDUA 2D22A 3ARUA 3MV01 4UQAA 3WUBA 3GZAA 4X0NA 3VIKA 3VIMA 1JDAA 2GJXB 1C91A 4P8XA 2G3MA 2W61A 3ARXA 1B3YA 3WL0A 3MO4A 3N1AA 3I3BA 4MB3A 4V27A 1MFUA 4UZUA 2QF8A 1ISVA 3NUKA 2HISA 3UG3A 4DM2A 1UKPA 3CZGA 4RL3A 4IM4A 5DO8A 6CGTA 1DWHM 2V3EA 1KXHA 5BRQA 4NZCA 1Z32X 4AZ5A 1WDPA 2WMGA 1R8LA 4J3WA 2JEQA 2WKGA 1LWJA 3PZ9A 3BLKA 1OIFA 1VBRA 5D9PA 1FP8A 1JD7A 1P6WA 1JF6A 4TX8A 3WFZA 1JNEA 1RH9A 4DUWA 1D2KA 1BSIA 3VNYA 2J62A 3ZIZA 2XIBA 1MQPA 1W3HA 3VIOA 5CXPA 4LQ1A 4BQ5A 2YLAA 4LXFA 1ZBKA 4PEEA 5E0CA 4Q22A 4Z2KA 1GQIA 3CZJA 1LJYA 4NRRA 2WMJA 5A6BA 1E6RA 1HJVA 1QOXA 3VIJA 2CYGA 1RP9A 5CQ1A 3VINA 5KEZA 4R27A 3WQWA 1UKTA 2XSBA 2D3LA 4UFMA 4PCSA 3M7SA 4DWSD 3CUGA 3MUAA 3PZGA 3M6DA 1UWRA 3K8MA 3ZT6A 3OGRA 4MB4A 2BXYA 3BMWA 3EDJA 3TTYA 1UWSA 3L2LA 1KB3A 1GHRA 5D8ZA 1K6AA 3EMQA 2WNWA 1BAGA 1B3VA 3APGA 5LA2A 2D24A 4YHEA 3WF1A 4A4AA 2CCRA 2DQXA 2VX5A 3N04A 1W32A 3THCA 1JYVA 1KCKA 2J75A 4YPJA 3VD7A 5CSYA 5A6AA 4ACZB 3W29A 2F8QA 2RGLA 5C70A 5ABEA 4ZEPA 4U3AA 4AMCA 1XH2A 3VMOA 1GPFA 5JBEA 4N0RA 2X8RA 1PAMA 5C71A 5AYIA 3AIEA 1HL8A 1E71M 4TVUA 1XC6A 1XD1A 4B3KA 1G01A 1W2VA 3WD0A 4TVCA 2BXZA 1DHKA 3FAWA 1K9DA 4JFTA 2XGIA 3U5UA 3CHDA 1EOMA 1UUQA 3RCNA 3BLPX 3BGAA 1EGZA 1EIBA 3N13A 3GM8A 5AC5A 4KGLA 3PZOA 1OBAA 4M81A 4AXNA 3QOMA 3WQ6A 3AMCA 2ZX7A 4FMVA 2YL9A 1E0XA 3AIVA 4A3HA 3L4XA 4CD4A 4AWEA 1QW8A 4PCTA 3IJ9A 5E0FA 4JHZA 3ZM8A 1E4LA 2BY0A 3LPGA 1Q6CA 4AZBA 4OUEA 4MJ4A 1UWUA 5JUVA 3TTSA 2WVUA 4KH2A 2GSJA 3VDHA 2FH6A 1E6ZA 4HA4A 1UWQA 3WQ5A 1GHSA 2XPKA 3MUY1 4NF7A 1OM0A 1QHPA 4D6IA 1RD6A 2DEPA 2Z1KA 1W9VA 3RMEA 1O7AA 2EPKX 4ACYA 3WQ4A 1DTUA 2WMKA 1E5JA 2BNJA 1DP0A 3W82A 3TOPA 4MDOA 3AJ7A 1CLXA 4N42A 2W66A 1FP9A 1BYDA 4XZBA 3WMSA 1E6SM 1NH6A 1W2PA 4PMDA 3GTNA 5JIPA 4BA0A 4AZCB 4W86A 1V02E 3I3DA 3AI0A 5A2CA 2WZIA 2WMIA 2VVNA 2G3IA 4OBRA 1JXKA 3ZT5A 3VUPA 2O9TA 1B3ZA 3PZIA 3CZKA 2J77A 1UZ1A 1J0JA 2Y5EA 4P8UA 4JKKA 2GK1B 5D8WA 1JFHA 3AIBA 1QVBA 1I1WA 3BMVA 4TXEA 4CD5A 4U2YA 1ECEA 5LYRA 5IXEA 4W8AA 4MJ2A 4EAMA 3QGVA 4HZ8A 1UZ4A 3AS3A 3ZO9A 1X6LA 2WC4A 2WVTA 2BVYA 1QI5A 4FF5A 3K8LA 2WVVA 2G41A 4Q7NA 4JFUA 4QFUA 3K1DA 3OLEA 4W89A 2DIJA 1J0IA 2DSVA 1PEZA 5FKYA 1KWGA 2VR4A 2PWGA 4AYSA 3WN6A 3VD4A 4W7VA 1CEOA 1JZ5A 1WKYA 3PZNA 1B9ZA 4QDMA 3VILA 2WKLA 1WZAA 1UH2A 1PX4A 3II1A 4PUEA 1EOKA 1PZ2A 5AY7A 4EE9A 4HU0A 1UH4A 2ZUSA 2YJQA 1J18A 1BYBA 1AQHA 2OLHA 2E9BA 1UR8A 5I0DA 2WM0A 4UOQA 2YA0A 1SMAA 3PZTA 2QMJA 2E9LA 4AW7A 3EBVA 3KZSA 1QHZA 4WIWA 1F4AA 4D6CA 4H7VA 5M3WA 3HJEA 4JL2A 4W5ZA 3MU7A 4GIAA 3VPLA 1GCYA 3B8SA 4U33A 3WEOA 3U57A 1D7FA 3CHCA 2ZX6A 1I75A 2W5FA 3OA5A 2W63A 2JEPA 3AHTA 3SCQA 5I79A 5CSUA 2WCGA 3AROA 5D9NA 2YLLA 4LGXA 1E5NA 2VL4A 1IV8A 1CBGA 1AQ0A 1UR9A 1EQPA 3FAXA 3OIHA 2CITA 5EMYA 1UA3A 1QI4A 3LPPA 3MV11 1GNXA 2XWDA 1CXFA 1UD8A 4M8UA 2EPNA 2XGBA 4H41A 1OD0A 2DSUA 4D6DA 2OWCA 4UR9A 3WEMA 1C7TA 2OWXA 4IPNB 3N9KA 3AXIA 1WDSA 2D2OA 2WSPA 4BCEA 3A3HA 1GOMA 4D6HA 4M24A 1VAHA 3EYPA 3WSUA 1EQCA 2Z1SA 5CPSA 3SCUA 2V3FA 1OGSA 3WNOA 8A3HA 2BHYA 5LA0A 3D5HA 2ZOXA 1HVXA 1ZJAA 1C8QA 2W4XA 3SUUA 1UD5A 1HKKA 3TA9A 4BF7A 2WB5A 3OGVA 1U30A 3LPFA 1JAKA 1NWUA 2CESA 1UWIA 5FL1A 4W85A 2X0HA 2XVGA 1PZ3A 3WUFA 1ITCA 1E1FA 4PSPA 4W87A 2OSYA 3VGDA 3AISA 1B30A 4JCLA 2UY5A 1HVQA 3WEZA 1OT1A 4BQ3A 3PTQA 1UYQA 1W9UA 1U2YA 3WMCA 3T09A 4AC1X 2GFTA 3WUEA 1JDCA 1PIGA 1J0YA 5AYBA 2J47A 3WD1A 1B3WA 1LLOA 1WNOA 1WE5A 2YL8A 1DWIM 1ZJBA 1ISYA 5EFFA 3ARYA 1XGZA 3QHNA 3S6TA 5BXSA 1HXJA 2V5DA 2DH2A 2VZUA 1TR1A 3CIVA 1H2JA 5DMYA 1JL8A 2PBOA 1W3LA 3WKZA 3FHAA 4AD3A 4GI9A 3WH5A 1VFOA 8CGTA 5LA1A 1CWYA 4XX6A 3VGGA 5A6LA 1KBKA 4MAZA 4NI3A 4X0VA 1Y7VA 1DWAM 1R87A 3WELA 2YOCA 2D23A 3K4DA 3KL5A 3AS1A 4ZENA 1KQZA 1UWTA 4HOZA 1WZKA 1V6XA 3ARRA 1E56A 3EMZA 1NP0A 5CPTA 1J12A 4P8WA 1FH7A 2XWEA 2FDMA 2DSZA 4CD8A 1ODZA 2BV9A 1JI2A 1E9LA 3THDA 3AZTA 3VGEA 3RILA 4PMZA 4HZ7A 1HJSA 1VIWA 1M04A 4BZYA 1WP6A 1E73M 1UQYA 2Q8XA 4DUVA 2YIHA 4PBGA 1NOUA 1B0IA 4EANA 4CN4A 3EDEA 3ZR5A 2D1ZA 4PMXA 1Q6FA 5A94A 4GZJA 4JKLA 4AD1A 3CUFA 1Q4NX 3VX0A 4B16A 4DWSB 2DT2A 3OBAA 3KL3A 4HOWA 2WC7A 2JFEX 2WCAA 3NSXA 4XUYA 1LL6A 2QPUA 2J7BA 1H0IA 3L4TA 4MNLA 1JF5A 4KGJA 2EQDA 3KL0A 3AXHA 1UHVA 4JL1A 1G9HA 3AMDA 3VOCA 5IDIA 1HKJA 3VDCA 5CPQA 1HF6A 4EK7A 5BXPA 4XV0A 1EHAA 3CGTA 3F5LA 4J27A 4UZSA 2FHCA 2PC8A 4XB3A 5A2BA 1KXVA 1PBGA 3BSGA 5A69A 2WYSA 2VCCA 1FHLA 1B3XA 1UKOA 3LMYA 2A3CA 4OBSA 3VM7A 5I77A 4P7RA 4UOZA 1TE1A 3T2PA 3ZJ7A 1V6VA 2Y8KA 2XJ7A 5CGTA 5CG0A 1GOKA 3AS0A 2ZE0A 3ZR6A 5A6SA 1E3ZA 1QW9A 4H04A 1CENA 2ZX8A 4QLLA 1LL4A 1G0CA 2EBNA 4AD5A 4M82A 2DT3A 2NT1A 1YQ2A 3E1F1 4U2ZA 4CGTA 4PTMA 3SCVA 1W1YA 1AVAA 1MW2A 1UH3A 4M1RA 1GOOA 1GQJA 4UCFA 3MMDA 1QBBA 5DT5A 2GDVA 1OGGA 3BH4A 2WPGA 1ZL1A 2NW0A 5A6JA 4F66A 1BPLB 2WCSA 4HP5A 3WNNA 4CCCA 1B90A 4PN2A 2UY3A 4H8VA 3PHAA 4BQ4A 1VB9A 1TVPA 4D6FA 1OGBA 1SFSA 5CJ5A 1E40A 1CXLA 4FLQA 3SUVA 3ZT7A 2WHJA 1CXIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3EDD A;  2J7D A;  1JZ2 A;  5DEZ A;  2BHZ A;  4P8V A;  4QCE A;  3VNZ A;  5E09 A;  1GW1 A;  1EDQ A;  1WO2 A;  2WBG A;  4M80 A;  1KFW A;  4AZH A;  4C7G A;  4V2X A;  5I24 A;  3T2Q A;  1CGX A;  1VF8 A;  2EJ1 A;  2PB1 A;  1VBU A;  1ZBC A;  1BG4 A;  3BAW A;  3K4A A;  3QHM A;  1DWJ M;  4AIE A;  3VGF A;  3RDK A;  4YN5 A;  2WBK A;  3L4U A;  2G8Z A;  4ZXO A;  4B3L A;  4GIN A;  4Z2L A;  4AIO A;  5GNX A;  2PWD A;  2XM1 A;  1ZS2 A;  4CU7 A;  5BXT A;  1UR4 A;  1KXT A;  3VD9 A;  3VKK A;  2W62 A;  3W27 A;  4Z2G A;  4J3T A;  3VMP A;  1X6N A;  1H4P A;  2QMK A;  3CUI A;  3WF3 A;  3DYO A;  4MNM A;  1AQM A;  2VZV A;  1HJU A;  5A6K A;  1EXP A;  2E9M A;  1EDG A;  5ABF B;  1XYF A;  5D4Y A;  3T0B A;  3AMG A;  1L0P A;  1FH9 A;  4WF7 A;  4MB1 A;  5FD0 A;  1FH8 A;  1CXH A;  2A3A A;  2OSX A;  2WZE A;  1KBB A;  1E6N A;  2BY3 A;  2RGM A;  5A8Q A;  1WDQ A;  2VZS A;  1BFN A;  2VQU A;  1GOW A;  1NWR A;  1HNY A;  2J7C A;  1QNP A;  3BAY A;  5IHS A;  2VUR A;  4HU8 A;  1V03 A;  2J79 A;  3HN3 A;  1JYX A;  2VZT A;  1WZM A;  1VFM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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