5EBAA

Crystal structure of aromatic mutant (y343a) of an alkali thermostable gh10 xylanase from bacillus sp. ng-27
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
354
structure length
354
Chain Sequence
VQPFAWQVASLADRYEESFDIGAAVEPHQLNGRQGKVLKHHYNSIVAENAMKPISLQPEEGVFTWDGADAIVEFARKNNMNLRFHTLVWHNQVPDWFFLDEEGNPMVEETNEAKRQANKELLLERLETHIKTVVERYKDDVTAWDVVNEVVDDGTPNERGLRESVWYQITGDEYIRVAFETARKYAGEDAKLFINDYNTEVTPKRDHLYNLVQDLLADGVPIDGVGHQAHIQIDWPTIDEIRTSMEMFAGLGLDNQVTELDVSLYGWPPRPAFPTYDAIPQERFQAQADRYNQLFELYEELDADLSSVTFWGIADNHTWLDDRAREYNDGVGKDAPFVFDPNARVKPAFWRIID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of aromatic mutant (Y343A) of an alkali thermostable GH10 xylanase from Bacillus sp. NG-27
rcsb
molecule keywords Beta-xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. ng-27
total genus 139
structure length 354
sequence length 354
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2015-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5ebaA00
2ESCA 5IHRA 1EGZA 1E3XA 1QI5A 1LQ0A 2CCRA 3VGDA 4A3HA 4TXEA 1JF5A 2V3GA 3A4AA 4F9JA 4E8CA 5EFDA 2XVNA 2DDXA 1CIUA 1W3KA 2JEQA 3NIYA 1GVYA 4BQ4A 3WF1A 4MTVA 4QCEA 1FA2A 3VGFA 3ZSTA 1H1NA 1GOOA 3NDYA 1E5NA 1UKQA 2WZIA 3ARPA 3IJ9A 4CD4A 4F8XA 5I6SA 4Z2IA 2YJQA 4DWSB 1N82A 5A2CA 4NI3A 1OSEA 1HIZA 2DQXA 2EQDA 3QOMA 4PMOA 1KBKA 1ZBCA 3K1DA 3QHNA 4EANA 1UR0A 2QMJA 4PMQA 3T2OA 1OD8A 3ARVA 3L4XA 3WY1A 1PIGA 4CU6A 1QNOA 1FFRA 4JZ5A 1H4PA 1WNOA 3L4YA 1JF6A 2VCCA 4TOQA 2YDRA 1RH9A 2VC9A 2WVVA 4TTGA 1CECA 3BC9A 4GIAA 3W29A 3VDBA 1UOKA 3T2QA 1WDSA 3W4RA 5CQ1A 1GJUA 5E09A 1FH9A 3K46A 1EHAA 1AQHA 3QHMA 1HJVA 3WH6A 2G3IA 3WDJA 2D0FA 3M46A 4FLOA 3WNMA 1RP8A 3ZT6A 4P7OA 1CXKA 3IANA 5D8ZA 3SUTA 1CGVA 2D0HA 5LA1A 3PHAA 4W87A 3N18A 2XPKA 3IAPA 3PZOA 4TVCA 1MW3A 1NOUA 3BAXA 4MAZA 4UFMA 3WF2A 4BQ2A 3BH4A 4D6JA 1JNEA 1QHOA 4LYQA 2VMFA 4OUEA 4JFWA 5DO8A 5I0DA 1E73M 1W9XA 1HKIA 4YN5A 3PZGA 2YDSA 4TX6A 2VOTA 2J74A 2XYLA 2XHYA 1PJ9A 1UD4A 2X05A 4AIOA 1C7SA 4N0RA 3KE0A 1VBRA 4HZ7A 3WBAA 2J4GA 3WD1A 3DYMA 2DSZA 3WNKA 4GINA 3BSGA 5A2AA 4UQCA 4FMVA 4WKHA 1EXPA 4GI9A 3BGAA 2V5DA 1C7TA 3AMCA 3WEOA 1E4NA 1WDPA 3THDA 3EBVA 3W25A 4Q7NA 4D1JA 3CZEA 2BY0A 3CIVA 3TOPA 4M81A 1K9TA 1UWSA 5E6ZA 3NSMA 3VGEA 3L4TA 1AVAA 2ZX8A 1WE5A 2OWXA 3CZLA 1JAEA 5M17A 4UZUA 1NARA 1HX0A 1JNDA 2VQTA 1VEMA 1JG9A 1J0ZA 3AQUA 4CVUA 5FL1A 4AEFA 3WQ5A 5CZKA 2F8QA 2D1ZA 3J7HA 1NH6A 1A47A 4D6CA 2WB5A 3WIJA 2CERA 4D6GA 2PF0A 5HNNA 3AFBA 3UR8A 2UWFA 2HISA 2EXOA 2FHCA 3NUKA 4P8XA 2VR4A 3OGRA 3WD0A 3S6TA 3CO4A 1VEOA 1JZ4A 1GHRA 4ML4A 2ZUUA 2GDVA 2BS9A 4B9ZA 4V2XA 1ISYA 1HN1A 4PMVA 1EH9A 2ZUTA 5EMYA 1UKPA 1E6PA 7A3HA 1H5VA 4D1IA 1ZL1A 5F7UA 3RMEA 2JF7A 4KGLA 4ACZB 5I3DA 2G41A 1NWRA 3ARTA 4X0VA 3EDJA 1G01A 4M82A 1YQ2A 2G3MA 2QPUA 3CHDA 4PUDA 1MQPA 3EYPA 2J79A 4OBRA 5IFPA 1ISXA 4J3XA 3ZJ7A 3WH7A 1UR9A 3CUFA 3M6DA 3AS3A 3AIBA 4JCMA 3SCVA 2QF8A 5DFAA 3OLDA 1VIWA 4PN2A 1PAMA 2X09A 1VEPA 1Z32X 3VPLA 2DSVA 3W0KA 4PUEA 3AICA 3MV01 2XVPA 1UWQA 2BHZA 4OIFA 3AIRA 1BHGA 3EMQA 2XM1A 2VQUA 2UY2A 3FAWA 3WUEA 5GNXA 4FLRA 2YL5A 4QFUA 2Y2WA 1MYRA 3SUVA 2J7HA 4HA1A 4ZE4A 3WEMA 4UZSA 2VURA 3WQ8A 2XVGA 4WK9A 3NCOA 3WNOA 2ZXAA 5HOSA 1E6XM 1XCXA 3CHEA 3RM8A 1E71M 2VR5A 4PMZA 3GM8A 5D4YA 2EO7A 2A3AA 3VM5A 4XV0A 4U31A 1ZBWA 3AHYA 2OWCA 4AIEA 2WBKA 4UFLA 3WDPP 2GK1A 2WSPA 1WB0A 4D71A 2DT2A 3NDZA 1LWHA 3AZTA 1CDGA 1PPIA 3GNPA 1UD6A 5CLWA 1J9YA 4MB5A 1V0LA 4QLJA 2VRQA 1BF2A 1UH4A 1PEZA 3SUSA 3ZJ6A 4B9YA 1KXHA 1V6UA 1OGGA 2GDUA 2G3NA 1U30A 5I78A 1TE1A 3N13A 3KL5A 1W1YA 1CXEA 4W93A 3FHAA 2VX7A 1HJQA 3II1A 2D24A 5HDRA 4KRTA 3ALFA 4ZEPA 2UY5A 4GZIA 1E6NA 1J0HA 4AD1A 3K8LA 2J7EA 3ALGA 2ZOXA 1BVZA 1GOMA 3AYSA 4C7FA 3WMBA 1JXJA 3WL1A 5CGTA 1XGZA 4HZ6A 3AOFA 1DWHM 2OSWA 2YOCA 3VD3A 1HJWA 2JFEX 4PMYA 4JHZA 5IXEA 3MANA 4PSRA 2CBIA 2O92A 1HP5A 1MWOA 4Z2LA 3HN3A 7CGTA 3IAQA 4R5EA 2WMIB 1X6LA 1KWKA 3PZUA 3WQ4A 1C91A 3O6AA 2WPGA 8CGTA 3VMNA 2XIBA 3SURA 2J7DA 3PZ9A 3PZVA 4HZ8A 1QI2A 1JFXA 3QHOA 5I23A 1VB9A 4LQ1A 1J0YA 5AYBA 1DP0A 1KXTA 3OZOA 3PZNA 1MQQA 1OT2A 3KWXA 1GJWA 3OZPA 2D3NA 1D2KA 4UTFA 2OSXA 4AY1A 3DYPA 1EHNA 2BV9A 1UD5A 1LWJA 1UWIA 1WDRA 3AS0A 2YL8A 2X1IA 3RIKA 4LGXA 1FHDA 1GQIA 4WSKA 4W8LA 3TP4A 1CXLA 2E40A 4BA0A 1J11A 1V0KA 1J18A 5JBFA 1LG2A 4ATDA 3MV11 4A3YA 3B8SA 3AMKA 3VIFA 1KXVA 1TCMA 3D3AA 1ODUA 5LYRA 4GO9A 2CIPA 3ARXA 1QBBA 2X2YA 2W61A 2W92A 4J3TA 2B31A 3SEPA 1CEOA 4GQQA 5M3WA 4CU8A 1MQRA 3SCTA 1YHTA 5DT5A 5ABFA 1RP9A 2WVVB 3OGSA 5CPSA 3WD4A 4M1RA 2CBJA 1JZ6A 1CXIA 3KL0A 1VRXA 2JALA 1U33A 3WFZA 2J25A 1GVIA 5M5DA 4HA3A 3SCSA 1UHVA 3FN9A 1Q6EA 3WMCA 4MNLA 4URIA 4PTMA 2PWHA 4BQ5A 3GBDA 1M01A 1ZU8A 1E6SM 4JL1A 5A6KA 3HMCA 3VNYA 1KFWA 4AZ6A 4EK7A 2OYKA 5CPQA 2DSKA 2O9OA 4PEEA 1HJXA 1F4AA 4Z2GA 3KZSA 3WH5A 1Q4NX 3AS2A 3FW6A 3MMUA 2ZXBA 3VX1A 1W3LA 1XHGA 2CYGA 1KGUA 3WH9A 3QGVA 1WZKA 1LJYA 1QNPA 4QCFA 5I2UA 2EPOA 4JIEA 3ZQ9A 2J7CA 2VZTA 1RD6A 1TA3A 1GOIA 1DWAM 3DHUA 4UQ9A 3WUBA 4UCFA 4UR9A 4C7DA 1KCKA 2ZXDA 3VUPA 2V5CA 1CTNA 2YLAA 3VO0A 3AZSA 4CVWA 1FH8A 4PCSA 5A6AA 4BZYA 1R8LA 5BXTA 4UFIA 1WDQA 2CEQA 1KGWA 4AZCA 4P8WA 3VNZA 3T08A 1G94A 1BAGA 4F9DA 4TUFA 2V3EA 1CYGA 3PTKA 2ZX7A 1QHPA 3WH8A 1CXFA 4NRSA 3NSNA 4PYSA 4CGTA 1EDQA 4ZENA 4CKQA 3E1F1 2CESA 3ZO9A 5ABGA 2CXGA 1AQMA 4J3WA 1B3WA 3BMWA 4JHOA 5E70A 2NW0A 1JYXA 1WO2A 1V0MA 2XVKA 2GJXB 1DHKA 1W1TA 1G1YA 4XZBA 3AMLA 2WXDM 3EDKA 3N9KA 2G8ZA 3T0AA 4D6DA 1ESWA 3W26A 5CSUA 2VL4A 4Z2HA 3BAKA 2CETA 4UQEA 5A2BA 3RM9A 4P7QA 2FGLA 2J7FA 3BCFA 3WMSA 5A8PA 2ZX6A 1V0NA 1KR0A 1DWIM 3I3DA 5BYWA 4JCLA 2JIEA 2DIJA 3SUWA 3WENA 3WNNA 1GOKA 1ZBVA 2ZUMA 4TTUA 5LA0A 1GNXA 2RGLA 1X1NA 5IFTA 4MB1A 1OT1A 2WVTA 2CPUA 3U5YA 4MNKA 3K4AA 1JL8A 2BFGA 2W66A 2C8NA 1GZJA 3FY1A 2Y8VA 4BCEA 5DEZA 1VFUA 1VF8A 1O6IA 1UG6A 5A8NA 5FD0A 4HU8A 3OIHA 3AXHA 3UEQA 1V3KA 3TTQA 3VIJA 1B30A 1HJSA 1GORA 3K8KA 5BXRA 2EBNA 1CGYA 2BHYA 2J7BA 4QLLA 1V02E 2DT3A 2YBUA 4V28A 3W82A 4UNIA 1QI0A 5A6MA 1W9VA 4KMQA 1Q6DA 4J28A 1WKYA 1H0IA 1JZ8A 4UQBA 1FOBA 2W5FA 1E15A 1FFQA 1NQ6A 3I3EA 4JFTA 3AIQA 5EFFA 3APGA 4DUWA 1UWRA 1BYDA 3GNRA 4AD2A 1JD7A 2ZXQA 5D9OA 1NP2A 2RGMA 2VRKA 3GXMA 4W8AA 4H04A 1E9LA 1GOWA 3GYCA 1QNQA 4JKLA 2VUYA 1PIFA 4LYPA 2WKGA 2WLZA 4IISA 2XIIA 2J47A 5HPOA 1US3A 4UOQA 4UFKA 2XFRA 2Z1KA 3WKZA 4U3CA 1LL6A 5A8QA 1JZ5A 1JZ7A 1IZJA 3BAYA 4IUGA 3ZT7A 3GBEA 2MANA 3GZAA 1A3HA 2WYSA 3BAIA 3DECA 3FXYA 3CMJA 3N1AA 2XM2A 3ARZA 2YA0A 2J77A 3F5LA 2GK1B 3O2LA 1M03A 1JIBA 3ZT5A 1BYCA 3AIUA 2WMKA 2WZHA 1B1YA 5KZ6A 3VIGA 1XH1A 3RDKA 1UR8A 1E0VA 4J3SA 2VO5A 3WDIA 3CZ8A 1V08A 4DWSA 2J62A 1DWJM 2DPEA 1C93A 1OIFA 3IJ7A 2VX6A 4W85A 3MUAA 3PZTA 5ECUA 3MSDA 1E1FA 5IHSA 2VRJA 4F66A 1XSKA 2XGIA 3ZIZA 2QHAA 2O9TA 3VGBA 3WSUA 3CGTA 5FKYA 4MNJA 4YPJA 1E40A 2BY1A 1J0IA 4H2CA 5GQBA 1I75A 1G0CA 4IPNB 4F79A 1BG4A 3ZSSA 2E4TA 1W3JA 5A69A 3CZJA 1J10A 1VFFA 1CGWA 3ZJKA 3PTMA 4KRUA 3MSGA 1QOXA 4W84A 2WCGA 1QI4A 4S3JA 3GDBA 2IXUA 4LYRA 4MB3A 1EA9C 3VIPA 1V3LA 1EOKA 2VZSA 4QP0A 4B16A 2VNCA 2O9PA 3POCA 4E4PA 5HBFA 3OLIA 4PSPA 2PI6A 1OM0A 5C8BB 1JFHA 5GNYA 3A4WA 6TAAA 5DMYA 3L2MA 2XUCA 2XWDA 3VDCA 3WF0A 2ZX9A 3LPFA 5A94A 3VIIA 5I5RA 1Y7VA 3GTNA 4RE3A 1B3XA 4P7LA 5AY7A 1B0IA 1WAWA 4P7NA 1SMDA 1P6WA 2E8ZA 4CU7A 4HPGA 4W5UA 3ARUA 4PMDA 2WW5A 5JIWA 1NM9A 1B3YA 4AZHA 2XGBA 1QI3A 3S2CA 4PRWA 4W88A 1R87A 1TFVA 2A3EA 1W1PA 1QVBA 3OG2A 3TONA 3AHVA 3BAJA 3RO8A 1HJUA 3PZMA 1V3MA 3NYDA 4BS0A 9CGTA 1JDAA 2E8YA 1OINA 1VFOA 3SCWA 3SUUA 4W86A 5A3HA 1BLIA 3VD5A 1UA7A 5CGMA 3VIKA 3CUJA 4AD5A 2PWGA 4PCTA 3WNPA 4AEEA 4PMXA 1GHSA 1XCWA 5A95A 1UYQA 1AQ0A 4AW7A 5FOOA 4OKDA 3N15A 3VD4A 4Z2KA 1H09A 4GI8A 3A3HA 1UKSA 3VILA 2WC7A 3RILA 3VIHA 4AIUA 3WFLA 3VMOA 5BXPA 2CHNA 1PZ2A 1VJSA 3ZM8A 5AC4A 2YA2A 4HA4A 3VIOA 4YHGA 3WUFA 4CN6A 1E5JA 1MFUA 1D7FA 3UETA 1KBBA 4AWEA 2XG9A 1JI1A 3AHXA 1K9FA 2VZVA 3AZRA 2WAGA 2Y24A 4WF7A 2ZUNA 4Z2JA 2IXVA 5BROA 1C90A 2CHOA 4H8HA 4HOZA 2F2HA 1EIBA 1J12A 4M24A 4HMDA 4P8VA 2GVYA 3W6MA 3CPUA 4L4OA 2VVSA 2XFYA 3W37A 4U2YA 1UD8A 1E43A 2FHBA 3B9AA 3GH4A 2DH2A 1TG7A 1IT0A 5CXPA 2WZEA 4RL3A 1V3JA 1VJZA 3BSHA 1EQPA 3RJYA 4KH2A 4A4AA 2QV4A 1J0JA 3HU7A 1BFNA 3AHTA 2J78A 4JFSA 1E6QM 4NRRA 3VX0A 3CTTA 5I24A 2HVMA 1HL8A 1O7AA 1FH7A 2E0PA 3TTOA 5E0CA 1H41A 2J8FA 5ABHA 1TUXA 3BLKA 3WELA 3VOCA 3OLGA 5A6BA 4BQ3A 2YDQA 1LLOA 2EEXA 3ARSA 1UA3A 4ATLA 3RCNA 2PWEA 1GQLA 4GZEA 1C8YA 4W7UA 3W24A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ESC A;  5IHR A;  1EGZ A;  1E3X A;  1QI5 A;  1LQ0 A;  2CCR A;  3VGD A;  4A3H A;  4TXE A;  1JF5 A;  2V3G A;  3A4A A;  4F9J A;  4E8C A;  5EFD A;  2XVN A;  2DDX A;  1CIU A;  1W3K A;  2JEQ A;  3NIY A;  1GVY A;  4BQ4 A;  3WF1 A;  4MTV A;  4QCE A;  1FA2 A;  3VGF A;  3ZST A;  1H1N A;  1GOO A;  3NDY A;  1E5N A;  1UKQ A;  2WZI A;  3ARP A;  3IJ9 A;  4CD4 A;  4F8X A;  5I6S A;  4Z2I A;  2YJQ A;  4DWS B;  1N82 A;  5A2C A;  4NI3 A;  1OSE A;  1HIZ A;  2DQX A;  2EQD A;  3QOM A;  4PMO A;  1KBK A;  1ZBC A;  3K1D A;  3QHN A;  4EAN A;  1UR0 A;  2QMJ A;  4PMQ A;  3T2O A;  1OD8 A;  3ARV A;  3L4X A;  3WY1 A;  1PIG A;  4CU6 A;  1QNO A;  1FFR A;  4JZ5 A;  1H4P A;  1WNO A;  3L4Y A;  1JF6 A;  2VCC A;  4TOQ A;  2YDR A;  1RH9 A;  2VC9 A;  2WVV A;  4TTG A;  1CEC A;  3BC9 A;  4GIA A;  3W29 A;  3VDB A;  1UOK A;  3T2Q A;  1WDS A;  3W4R A;  5CQ1 A;  1GJU A;  5E09 A;  1FH9 A;  3K46 A;  1EHA A;  1AQH A;  3QHM A;  1HJV A;  3WH6 A;  2G3I A;  3WDJ A;  2D0F A;  3M46 A;  4FLO A;  3WNM A;  1RP8 A;  3ZT6 A;  4P7O A;  1CXK A;  3IAN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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