5F4WA

Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from streptococcus pyogenes in complex with tbp
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
ITLTENKRKSMEKLSVDGVISALAFDQRGALKRMMAQHQTKEPTVEQIEELKSLVSEELTPFASSILLDPEYGLPASRVRSEEAGLLLAYEKTGYDATTTSRLPDCLDVWSAKRIKEAGAEAVKFLLYYDIDGDQDVNEQKKAYIERIGSECRAEDIPFYLEILTYDEKIADNASPEFAKVKAHKVNEAMKVFSKERFGVDVLKVEVPVNMKFVEGFADGEVLFTKEEAAQAFRDQEASTDLPYIYLSAGVSAKLFQDTLVFAAESGAKFNGVLCGRATWAGSVKVYIEEGPQAAREWLRTEGFKNIDELNKVLDKTASPWTEKM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Streptococcus pyogenes serotype m1
publication title NON-STEREOSPECIFIC SUBSTRATE CLEAVAGE BY TAGATOSE-BISPHOSPHATE CLASS I ALDOLASE
rcsb
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2
total genus 128
structure length 325
sequence length 325
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2015-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5f4wA00
1KLYA 3W1XA 1AW2A 1WXJA 1ZFJA 5HULA 3IGSA 2DORA 4MY8A 3KRZA 3QSRA 4CCCA 2E09A 3UWQA 1JUEA 2AQWA 3T7VA 3V1PA 4UFIA 2FTPA 4P61A 2HSAA 3RLUA 4UFLA 3LCHA 5TBOA 1DQWA 4ZQNA 1VYPX 3AO0A 4QM1A 1A50A 4UMBA 3EXRA 3W83A 1OFPA 1BWKA 4JEQA 3UWZA 3BLIA 4WXZA 3G1XA 3A5VA 2TYSA 2X1RA 2E77A 4MFDA 3T40A 3S1UA 4ONVA 2YYTA 3DFOA 3RK8A 1VRDA 1AL7A 5LNRA 4RZ5A 3ZWSA 1KFKA 2NX1A 3DHDA 1GQNA 1ZCOA 2Q3RA 4GNJA 1OG0A 2BX7A 4PODA 5A8GA 1YPFA 1FDZA 4WJEA 4FNTA 3KAOA 3O07A 4EF8A 2NZLA 3HGOA 1W56A 4ZL1A 4LS2A 2DZSA 3MI3A 2Q8LA 3FYPA 1NF0A 1YLVA 2Z2UA 4GBUA 2V2CA 4Z1AA 5LKYA 5HWJA 1RVGA 5KINA 4ADSA 4K37A 2Z6IA 4LRTA 3IIOA 4LVBA 2ZTJA 3A22A 4IX0A 2OT0A 1L6SA 1QWGA 1L6WA 3LXAA 1THFD 2H3DA 4LRSA 3TC6A 2R94A 1QOPA 4ML9A 1TPB1 2A7RA 5D2YA 4E2DA 1TV8A 1PCKA 1Z41A 1SPQA 1FCQA 2NUYA 1G7UA 5K7JA 1TJPA 3A24A 5E93A 3B0PA 3OVRA 3RLVA 3W7MA 3ELFA 4MZYA 1SZNA 4PFMA 4AF0B 4XTIA 4KFPA 2FB2A 3WFAA 5C54A 1JRBA 2VENA 3IIZA 3W6YA 2NXIA 3QW4B 4JTUA 2V5LA 2H90A 4JDBA 2WOQA 2FJKA 3HF3A 3BGJA 3W76A 2CFFA 2VKZG 3W1MA 3S0CA 2GUUA 3EX2A 5EL1A 3TDFA 4DO6A 4C1LA 2YZRA 3VI2A 3NAVA 1FWSA 3W7CA 3PB2A 1VLIA 1OFOA 3LDVA 3HB9A 3N73A 3PM6A 1TTPA 1QDSA 2EAWA 3NM3A 3E0IA 1G67A 3KVKA 1EA0A 5D03A 3R8RA 4UFHA 3YPIA 3GLCA 3MYOA 1EP3A 4N9DA 3G1SA 3H53A 1VS1A 1YTDA 3EWZA 4O4VA 4O28A 4LVAA 2Q3OA 4WOQA 3G1VA 3L5MA 4GE8A 3NYZA 2ZZ4A 4BI7A 3LTSA 3OA3A 1D3GA 1FUYA 1W1ZA 4DO4A 1XDMA 4CQ9A 5DLCA 1F6KA 1AW1A 2EGZA 1B4KA 3O63A 1LOQA 1L6YA 1MEWA 4DF2A 2WKJA 1GT8A 3W1QA 2G96A 2BWGA 4IGHA 1IXNA 1N8FA 1SUXA 2QUVA 3TE9A 3RF9A 4LS1A 2DZVA 3CWNA 5F2LA 3W87A 1LBLA 4M6PA 3HBLA 2DZUA 3NL6A 5KITA 2X1TA 2Y7DA 1MXSA 4YCPA 1LZOA 2G95A 1LBFA 3B06A 4IMEA 3TJLA 1JCYA 4M5PA 3PSWA 4UTUA 1TMHA 4M6VA 3PB0A 1SZEA 4ZQCA 1J4EA 3UWUA 4UMAA 4N9BA 3STGA 2ATMA 4ZQMA 3PF3A 4POCA 4QNEA 2J9XA 2CU0A 2F84A 1FWWA 4B5NA 4JY8A 5K4ZA 3KOFA 1VYRA 5BRBA 3MP4A 3NQVA 1A5SA 1JCLA 5EA9A 5FF2A 4UNLA 4O10A 1KLZA 2ZZ7A 3NNTA 1P1XA 2ZQ0A 3EKLA 3VFLA 2O7SA 3QQ1A 1K7XA 3WJXA 1TRDA 3QPYA 1EP2A 3W2NA 3ZR4A 3EB2A 4JGDA 1ZJIA 1MO0A 3GAYA 3BLFA 1UJPA 2GVLA 3C6CA 4RX0A 1LOSA 3W70A 4O1BA 1HUVA 1D9EA 1BKSA 3NQ7A 1UB3A 3EXTA 1DVJA 5AC8A 3QRHA 3DGRA 4EF9A 4A29A 4AH7A 1GVQA 5F1UA 2GVJA 1EPXA 3LXCA 1H62A 3C2VA 3NM1A 1XCFA 3GKFA 5G2IA 3GB6A 2V81A 3SW6A 5G4EA 1T99A 3TQ0A 3W73A 1FWRA 3PG9A 4WZHA 4MYXA 4MUZA 3A9IA 4NU7A 1ZALA 1LTDA 6TIMA 3E9AA 2C14A 5C5YA 1ZAJA 3F4NA 4LU0A 1H7PA 1FDYA 1VZWA 1XL9A 2CZEA 5DBUA 2H8ZA 3IVSA 4FXRA 3LCXA 3LRMA 3GX9A 1TJRA 3GDMA 3W1PA 4AWSA 2JKAA 5HWNA 3UY8A 3KHJA 3VE7A 5AB3A 1D3HA 1SU5A 3UPWA 1RV8A 4FX7A 4NXSA 5CPOA 3GAKA 1X1OA 1H50A 1DJQA 4BWLC 3U8GA 3SFKA 3G18A 4UCGA 3PWAA 2GJLA 5F4WA 4NVTA 1L9WA 3STEA 4JTSA 3HG5A 3NQ8A 5DELA 4O50A 1OJXA 4JTTA 4AHOA 4K39A 2OX1A 2CLHA 1QMLA 2C15A 4A2RA 2X16A 4JD4A 1JCJA 4LW7A 5SWUA 4BR1A 3G24A 4ALDA 2VEPA 3W88A 1A5AA 5KMYA 3G1HA 4JDYA 1FQ0A 4MIMA 1DOSA 3M9YA 2J6XA 3B4UA 2GPTA 1O94A 5BMWA 1S5WA 3NEVA 4BK9A 1KM3A 3N2XA 3MHUA 4RKAA 1VLWA 3P8IA 2X2GA 3NQ2A 3W7KA 1S5TA 4UFJA 1VCGA 3M1ZA 5BNKA 3W7JA 5BOOA 5EY5A 4O0ZA 1OX5A 3NQGA 2YGYA 3TMQA 4LY8A 1YYAA 3BG9A 3QFEA 2VEMA 3MHFA 4OU1A 5D30A 1H7OA 3I7RA 3PUDA 3W22A 3GXTA 2NXGA 3K30A 1I4NA 3PBVA 5D2TA 3AJXA 4CCDA 1WOBA 1IXPA 4NXKA 1DQXA 4BF9A 1VQTA 4S2CA 1PS9A 1B4EA 3LLDA 3TSMA 3QC3A 3BW2A 3S9YA 1IGSA 3NQCA 5FF3A 2ZBTA 3C0JA 3GNNA 1GTHA 3N3MA 4K36A 4QJ1A 1EIXA 4NJJA 3TAOA 2C3ZA 4QITA 1W5OA 3CLMA 2YDAA 2RHGA 4IWWA 3KVLA 3SR7A 3B04A 1AK5A 4QAIA 3P8JA 3QF0A 3TIMA 1LM1A 3NDOA 3WJZA 1GWJA 3HIJA 1YXYA 3KRUA 3TW6A 3HGSA 1H63A 1TPH1 4JTJA 1SO6A 3LHWA 4N6FA 2GQ8A 3BK0A 3IRDA 4DEFA 4EIVA 3U2OA 4XKYB 3S1VA 3IGXA 2VFFA 5IBXA 2BSLA 4JN6A 5CZ0A 4FNUA 1UCWA 2ISVA 3SSJA 3LCIA 4OQVA 3ABOA 2NWSA 4HPJA 1G7VA 3W2JA 2I9EA 1Z44A 2QCDA 5AHIA 4BI6A 2QF7A 1G4PA 3JR2A 3CIWA 4NJKA 2ZA1A 3VKJA 3JS3A 3PAJA 3PVFA 3UWVA 3O16A 2C6QA 3A23A 4DF0A 2QCHA 4IXXA 4GC4A 1SZFA 3UWYA 4MPQA 3CEPA 2GOUA 1JUKA 3NZ1A 1TV7A 1TPWA 3Q58A 1F76A 4M19A 1L2UA 4MVAA 1EWEA 5K9DA 1WDWA 3QPZA 4Q33A 1TPEA 2CZDA 4N2YA 3P62A 4O1AA 1H7WA 4O8RA 4MY9A 3FOKA 5E0KA 1A5CA 3PY2A 5D37A 4HIBA 3W84A 1NAL1 1V5XA 1RD5A 4P2VA 3LCFA 1H60A 3DFQA 5CSRA 5AYXA 3OHIA 4JTIA 2W79A 1F7BA 1FWTA 3W7IA 4WD0A 4RZ4A 2UV8G 1P4CA 1F5ZA 5TIMA 3TV8A 1SW3A 1H61A 3M41A 5GVJA 4E2BA 4ZQOA 4FO4A 3DI1A 4MJZA 4ADUA 5KZMA 4UTKA 3PUEA 2ATSA 4ZMGA 4ZQRA 2DZXA 1CX9A 5AOUA 5I3GA 2VEKA 3BV4A 1RR2A 5DY3A 4KWWA 2E5DA 2A21A 1F73A 4Z0SA 1KFCA 3QQ0A 4CQ8A 4UTWA 3CB8A 3L21A 5AHFA 5IBXC 1XFBA 3LHYA 4QISA 1X7FA 3W72A 3BO9A 1ZAIA 4AF0A 3GK0A 3L5AA 3NQ6A 3NQAA 2RKXA 3TNOA 1EX5A 1DV7A 3LOTA 3S5NA 1OX4A 4K38A 1MEHA 2A7PA 4IPIA 1ALDA 3O6DA 2QCLA 4UTTA 1OYAA 4IUOA 4JX6A 1F2JA 4MY1A 2D73A 5CG7A 2CZ5A 3W2UA 3NGJA 5D2VA 5CKSA 5HINA 4GUGA 1FDJA 1OFRA 3A21A 3M47A 1R2TA 4IPJA 1GG0A 2YW4A 2V30A 1P0KA 1W5PA 3EKZA 2E1DA 3L67A 4CQAA 4OBTA 2XFWA 5L6UA 3N34A 5LHEA 3T55A 4Q4KA 4RZ6A 3UQNA 3GDTA 3CM4A 3SIZA 4YWIA 2Z6JA 2E6FA 1ICQA 4HPXA 1C29A 3GR8A 4Y96A 3DFSA 1EWDA 3CEUA 2G97A 5G2HA 4HNTA 3CU2A 3W75A 2PURA 2JBMA 3L5LA 4O11A 3HMJG 3P74A 2VC6A 1TREA 3DU0A 1SR9A 3G1YA 3VCRA 3W2MA 7TIMA 3N19B 3W1UA 4QQ3A 2E6AA 1GJPA 1LRTA 5EBUA 5FI8A 2F7FA 5T26A 3OG3A 2ZDRA 1GYLA 4LVDA 4GUIA 1H7XA 1WQ5A 1I2QA 1I8JA 3HG3A 1TPFA 2RDUA 3E96A 1TPDA 5AYZA 3DFNA 5KZEA 4FHAA 1K03A 3TAKA 2W0UA 4OWGA 1DJNA 3NZRA 1VR6A 3R89A 1TTIA 1LOLA 2NX9A 2VOMA 4H3DA 1XM3A 1O5KA 1OYBA 3MP3A 3I68A 3MHGA 1RZMA 1XBXA 4L4MA 3ATZA 1JULA 3EX6A 3TK7A 1TQXA 4XTDA 3G1DA 1M5WA 5F4SA 1EP1A 4Y90A 2R14A 1LCOA 2NV1A 2J27A 3NG3A 4LTSA 4Z1BA 3NL2A 4FEZA 2CWNA 3M6YA 3DKJA 2QCEA 1M6JA 2VFDA 3M5YA 3MJYA 5CPLA 1VH7A 1PHWA 3TX9A 5HNRA 4CNPA 1JVNA 1GVFA 4JTKA 1LP6A 4LV4A 1KV8A 1NEYA 3CQ0A 3C2EA 4LNYA 3PULA 2QCNA 4N4QA 1UUMA 2ALDA 2HS6A 3UZ5A 5BW6A 1F74A 2Y61A 3M16A 3QMSA 1EEPA 4K6AA 1G69A 2QAFA 4A3UA 4N9EA 3M43A 4YCOA 3THAA 3QH2A 1LROA 3O6YX 3TUUA 3R5EA 4RCXA 4TR9A 1FY6A 1VYSX 4RV8A 3BPWA 3DENA 2V2HA 4ORIA 2DJXA 5TQLA 3E49A 4JIQA 3NQFA 2A6NA 5E1QA 4RK8A 3WK1A 5I3FA 4JY9A 2NWRA 2Y6ZA 4GJ1A 2J24A 3LHUA 3GKAA 2H8XA 1K02A 3W71A 4O57A 4WY0F 1JR1A 3G22A 3NPWA 1JJKA 4HNNA 2ZFAA 3L9CA 1OFDA 2YFNA 1JCXA 4HT3A 3C2FA 5G1TA 1TV5A 2GJNA 3S5YA 1TIMA 2RH9A 5AHLA 3IIVA 1FBAA 2WJZA 4RR4A 3O1NA 5G4WA 4GUHA 2I14A 4TIMA 3NO5A 3IIXA 5DXYA 2ZZ6A 3S1XA 5LHFA 4O13A 4XQ6A 4AXKA 4NJIA 3RNDA 3WJYA 3PSVA 4MZ8A 1W8SA 1FCUA 1YXDA 1DHPA 3G1AA 3LM7A 3LI1A 4J9JA 1SW0A 2C16A 4KWVA 2BTMA 4I9AA 3CPRA 1GEQA 1R2RA 5FEWA 3IEBA 1W0MA 3EX3A 5FEZA 4N02A 1PIIA 3ABRA 4FXSA 5D02A 4DPPA 4KFOA 2Y70A 4AWTA 1YDOA 3PBWA 3CT7A 4UXDA 2JGQA 2QJHA 4IMGA 2VXNA 2Z1BA 4IX2A 1RQBA 2ZA3A 3EXSA 4YXGA 4WOZA 4FF7A 3MWAA 4RXGA 2NLIA 2QUTA 4R34A 2V82A 5D04C 1LLZA 3CTLA 1OFQA 4AHQA 4UIOA 4CNOA 3C2RA 1X6UA 2A4AA 3NQEA 4HSNA 3E02A 3EWBX 1KTBA 3DAQA 2NUWA 4M7TA 3CHVA 3LV6A 1ML1A 1E51A 4NNCA 4NX5A 3UXDA 3FLUA 4O12A 4ORMA 5BMXA 5FEXA 2X1SA 5F2IA 1KW1A 2A6LA 4K8HA 3PUOA 1WX0A 2QUUA 4IMCA 4RJEA 2XN2A 3FIGA 2DJLA 5LGZA 3SJ3A 3L65A 1SO5A 3P81A 1ZENA 4OHQA 1O5XA 1SFJA 1B57A 3DXIA 1KV5A 3W1AA 2DZTA 1KFJA 3O8AA 3H54A 1DL3A 4EOUA 2EKCA 2PC4A 5AC7A 3W1RA 4HNUA 4PH6A 3NL3A 1J5TA 2VELA 3G8RA 1OK6A 3KVMA 1I45A 3N14A 3JRKA 5LSMA 2ZZ3A 4FX8A 4U28A 2FLIA 3HGRA 3HG4A 4UFMA 4LT9A 1QO2A 3KXQA 1H51A 5MHBA 1H1ZA 1VHNA 2NX3A 3SI9A 1Y0EA 4WQ6A 2WPBA 5U4NA 4JX5A 1T96A 4PL2A 3TA6A 1Q3NA 2EPHA 3M44A 3G3DA 2E6DA 3P67A 4JX4A 1DBTA 3ATYA 2YYUA 1ZHAA 4ADTA 3MBFA 5DBTA 2A5HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3W1X A;  3IJ7 A;  1V93 A;  1W2V A;  1ZFJ A;  5HUL A;  3AIQ A;  1XIB A;  3AMG A;  4MY8 A;  5LXX A;  4MPK A;  1UJQ A;  3UWQ A;  1XF0 A;  4AZH A;  1M01 A;  2PLK A;  4FAM A;  4FP1 A;  4AEE A;  1CIU A;  3RLU A;  4UFL A;  3LCH A;  2DIK A;  5TBO A;  1DQW A;  3AO0 A;  3OZY A;  2DZA A;  4UMB A;  4GGH A;  2Z00 A;  1UD4 A;  2X0S A;  3URQ A;  3UWZ A;  3D3F A;  4WXZ A;  3G1X A;  3A5V A;  3N18 A;  2OGY A;  4MFD A;  1IEX A;  4M6U A;  3DFO A;  3NYD A;  1UW9 A;  1OCQ A;  3TJ4 A;  2R1N A;  4WHB A;  2AL2 A;  2NX1 A;  2XFY A;  3DHD A;  5FA5 A;  4ZB5 A;  1GQN A;  2Q3R A;  1OG0 A;  5A8G A;  1FDZ A;  3BAN A;  4XSM A;  2J7C A;  4FNT A;  4PMO A;  1EYW A;  1SMD A;  3O07 A;  1SJA A;  3HGO A;  4R88 A;  2DZS A;  3MI3 A;  3GBE A;  3WL1 A;  4G1N A;  1ZL1 A;  2VWT A;  1Z8A A;  5CJM A;  3UPM A;  4KES A;  3TP4 A;  1W2P A;  2ZC8 A;  4S3J A;  2QMK A;  3IIO A;  2XDF A;  3A22 A;  2EPO A;  1QWG A;  1BD0 A;  1L6W A;  3LXA A;  1XV8 A;  4AZG A;  1TPB 1;  3OW1 A;  1P7T A;  3K8L A;  1BWV A;  4OOU A;  1JEZ A;  5TAO A;  3A24 A;  4C7G A; 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