5F4XA

Fructose-1,6-bisphosphate aldolase k229m mutant from rabbit muscle
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLMPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title DECYCLIZATION DETERMINES DIASTEREOISOMERIC SUBSTRATE SPECIFICITY OF MAMMALIAN CLASS I FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 138
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2015-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5f4xA00
1VQTA 1XBZA 2Z6IA 5F1VA 2QCFA 4JTTA 3ABSA 2V81A 3OA3A 3WFAA 4GUGA 4MLRA 3W2JA 2CLIA 3TQVA 3S5YA 1TPWA 3INPA 1LCOA 2EHHA 2X1UA 3UZ5A 1JUBA 1LLZA 3MWAA 1GPWA 3W1XA 2Y62A 3NL6A 3WK0A 1J2WA 4AWTA 3C2FA 3IVSA 4TMCA 4CCDA 4LVGA 4GRSA 3G1YA 2ISWA 3T55A 1XFBA 5AHLA 3C2VA 3MHFA 2B7QA 3MMTA 3W7LA 1KLYA 1AL8A 4O8RA 3HPXA 3DKLA 4AWSA 5FEWA 3FYPA 3STGA 5CG7A 4CLMA 1TQXA 3W3OA 3TW6A 3CM4A 3G1FA 1LOSA 2ZZ7A 4DO4A 1A50A 3TE9A 1Q6OA 1YTEA 2GQ8A 3NOEA 1WA3A 3W7CA 2O7SA 3IIXA 2GJNA 3R2GA 3TH6A 4RZ5A 4JD4A 4DO6A 4FNRA 1SZGA 1WOAA 3GAKA 1I8JA 1OVDA 1PHQA 1OYAA 1L6WA 4WXZA 3LTPA 1IXOA 4HN4A 2V2CA 3N2MA 3GXNA 4TR9A 2J6XA 1LYXA 3NL3A 3NPUA 1IXQA 3VFLA 4JDYA 1NVMA 4QISA 2C3ZA 5D05A 1AW5A 3LM7A 4BK9A 2WO5A 4RX0A 5LNUA 4EF9A 3FLUA 2GOUA 3P67A 1A5SA 1FXQA 3PR2A 4RR4A 3RFAA 3W84A 1JUKA 1ZAIA 1QOQA 4I7VA 3AO0A 1SU5A 1KM2A 3LCXA 4RKAA 2R14A 4LRSA 3W1AA 3EX2A 4GUFA 3W1RA 3CIWA 3NPVA 4UMCA 3W85A 3N3MA 1EP3A 1IGSA 5LNVA 2C6QA 3JS3A 5D02A 3UYCA 3LI1A 3M6YA 2XN2A 1A5CA 2R8WA 4JTEA 3ATYA 3O8AA 5KINA 3A21A 2ZRUA 3P80A 3W73A 2CZEA 5FEXA 3MYOA 1B4EA 2Q8LA 3EWWA 2DZWA 2XFWA 2QJHA 1GVRA 3HG5A 3S1VA 3SECA 4C1KA 3PUDA 3NQVA 3KXQA 2EAWA 4QITA 3O6DA 2ZRWA 1OHLA 2ZBTA 4O28A 1F7BA 4O10A 2BWGA 2WOQA 3HPZA 1BEUA 4RJEA 3FS2A 2EGZA 3TFXA 4ALDA 1GVSA 3DGRA 3VCRA 3IIPA 1H62A 2ZRXA 1F6PA 1VGAA 3A5VA 1EEPA 4K8HA 2WSYA 3NPXA 2NV1A 1JRCA 3T7VA 3UWQA 1WBJA 3GXPA 4XBKA 5AHIA 2FQIA 4XTDA 2WNQA 1OG0A 1ML1A 3N14A 1OFPA 3LHVA 2JBMA 3W1PA 5LNSA 1H63A 2EF9A 1KM6A 2TYSA 2NZLA 2ZZ3A 5AC8A 1XBXA 3G1HA 5EA9A 3GX9A 1WOBA 3W7NA 1VR6A 2VEIA 2D73A 4HIBA 5F4SA 1UBSA 2CU0A 5FEZA 4Z1CA 1ALDA 2KZHA 1F76A 3K30A 3MP3A 4YMZA 5FF3A 3STFA 1QWGA 1H7OA 3HO8A 2WPBA 1H7XA 3G0SA 3GKFA 2YX0A 4MLJA 4NJJA 4GJ1A 2NLIA 1KTBA 3CTLA 3THAA 1ZAHA 5CSSA 4NNBA 3V1PA 4OV9A 1OX6A 4X2RA 4Z0JA 3M5VA 3N9SA 3BO9A 2AAMA 3TJXA 3NQMA 1S5VA 1XCFA 3QW4B 2VEMA 1EB3A 4DPPA 3L65A 2QAFA 4Z0SA 3HOJA 1H50A 4BR1A 2W6RA 4LVBA 3P74A 1E51A 3M7WA 3SGZA 4LS2A 1F05A 3BW4A 4XUGA 1QNVA 2G97A 2AGKA 2GQ9A 4IXHA 4K7YA 2WKJA 4E38A 3GYEA 3W1UA 2PC4A 2HMCA 3UPBA 2CLOA 1AL7A 4JR5A 2Q3RA 4CNNA 4O52A 3M5YA 4O57A 4R33A 2DJXA 1T8XA 1QOPA 2VFFA 4WXYA 3TFCA 3LGEA 2QEZA 3EX6A 5EBUA 2J9XA 2YCEA 1QCWA 1ZNNA 4MUZA 2Y7GA 1O5XA 3G8EA 1ONRA 2QF7A 3JR2A 1I2NA 4JNMA 3N73A 4JTIA 2DZUA 3A23A 1THFD 4A21A 3W83A 1AK5A 1DOSA 4MJZA 2A7RA 5D32A 4EIVA 1Z42A 3S1XA 5G5IA 5F4WA 3WJSA 1T0OA 2H3DA 2CLMA 3LTYA 3M0ZA 4U4MA 3S1WA 3EXRA 3GDRA 4O14A 5IM51 3UWZA 1LDCA 1TMHA 1G7VA 2QR6A 1IXNA 2ZCGA 4RZ4A 4DF1A 1H7NA 1W8SA 3W2KA 5I3IA 1TV5A 3GDMA 4MIMA 2NWSA 2E6DA 4H6KA 4LWWA 5F4XA 2PURA 1I2OA 4ZVJA 2Y7FA 1X8FA 2V0TA 3O1NA 4AXKA 3G1DA 3M43A 4JX5A 1QPQA 5KMYA 3B0UX 3QQ1A 2A1YA 1O94A 1YPIA 2CWNA 1MSSA 6ALDA 4IMFA 3PVFA 5FF0A 2ISVA 4JY9A 2CZ5A 1OFAA 4QSHA 4CQ8A 4JS3A 3GVGA 5LGXA 4O15A 5EL1A 1GWJA 3DFOA 4AHOA 4PL2A 5K2ZA 5LKYA 4M5PA 3PBYA 2XN0A 1SZNA 4PA8A 1CW2A 5C6MA 2V30A 3F03K 4K37A 3W71A 3G0UA 3B06A 2HTMA 4YXGA 1Q6QA 1H5YA 2DZSA 3O05A 1FWWA 4RV8A 1TPDA 1K8YA 2Y6ZA 3W1LA 1GQNA 1TJRA 2P10A 1ME7A 4L4MA 3KAOA 5AN7A 4I9AA 2V2HA 3WK1A 1TPFA 3IV3A 4FIRA 4UFHA 4O1DA 1MEHA 2RDUA 1SSGA 1WX0A 2C1HA 2P1FA 1H7PA 1KM3A 3P61A 4MY1A 4DF0A 1YLVA 3C3NA 1SO6A 1UB3A 4M7SA 3QMSA 1VJIA 3EXSA 3RF9A 1R30A 4WJEA 4LY8A 3EWUA 2ZA3A 4PH6A 4JIPA 3LRMA 5HUOA 3SFKA 3W1QA 2QCNA 1KM0A 1SW0A 4OV4A 4DXVA 4CNOA 3PF3A 1KTCA 3FKKA 4UFIA 3EB2A 4Y96A 4NZFA 1TYGA 3HBLA 3RK8A 4NJIA 1H1ZA 3DKJA 3I7RA 1TPH1 4IQLA 5D33A 4HSNA 1M5WA 3BLFA 3PSWA 1WXJA 2NXGA 5CKSA 1C9DA 1W5QA 3LCIA 1UJPA 3SGUA 4JTUA 1DQWA 5KITA 3HQ1A 3B03A 3LB0A 1ICSA 4XTIA 5DN1A 4UTTC 5CPNA 3RLVA 2YDAA 1GYLA 4UMAA 3W7KA 5I3HA 2FDSA 4NX0A 3SZ8A 3UQNA 2QCEA 1B4KA 2JK2A 4S2CA 3NNTA 4WY0F 4O54A 3IVTA 5F1UA 3L2IA 3EWZA 2VFEA 2A7PA 4YL2A 3ABQA 4IOTA 1OX4A 3C0JA 4BI5A 2YSWA 2DZXA 2ZTKA 2C15A 3E9AA 3P5YA 1LBMA 5LNWA 4ADTA 3NQCA 1XBVA 3E02A 1L6YA 4HPJA 2H3BA 4IUOA 3NA8A 1LBFA 1Q3NA 3BARA 2J88A 4AF0A 4UR8A 5GVJA 3LHYA 5AOUA 3MP4A 1F2JA 2GVGA 4RXFA 1L9WA 6TIMA 1Z41A 3QW3A 3UY8A 3QMRA 3F4NA 1A5BA 3A24A 1X7FA 2OCZA 4LV4A 1X6UA 4RLIA 5G2HA 5DELA 2CZDA 1OFQA 1KBIA 4TMBA 4MYXA 1Q6RA 2GVJA 5K4ZA 4AVFA 4KFNA 4M6VA 4O53A 2ZA1A 3G18A 2ZZ4A 4UTMA 1W54A 1KBJA 3TKFA 2QCMA 3PG8A 1SW3A 4ZQOA 1FDYA 1KM5A 1W3TA 1P0KA 4JTLA 3NQGA 2JKAA 1TO3A 2Y7EA 4D2JA 3KHJA 4NQ1A 4PTNA 5DCEA 5F2MA 1L2UA 3IIVA 4O13A 1G4PA 4J9JA 4JTJA 1TPB1 1WYIA 4JY8A 2ZZ5A 4UTTA 3P82A 3U2OA 1XUZA 3HG4A 5K9XA 5AYXA 2CLKA 3B0PA 5BNKA 1SFLA 3ZWSA 1N7KA 3LDVA 3HGSA 1GYNA 7TIMA 4M7TA 1YYAA 1ZFJA 5AC6A 2FPVA 1SR9A 3W22A 3B05A 1N55A 2VENA 3NL2A 3W7HA 3P62A 3M5XA 4K39A 1L6SA 3CEUA 1V5XA 2NX9A 3W70A 2QDHA 1LZOA 3G3DA 3O16A 4IMGA 1G6CA 5G2IA 1I2PA 2B0MA 1PCKA 3TCEA 3GAYA 3SY5A 1TJPA 3NPWA 3W2MA 3BG3A 2V2DA 1OYBA 4CQ9A 1XC4A 3CPRA 4UTLA 2JKEA 3CT7A 1DQXA 4NZJA 3TK7A 1C29A 1JVNA 3DI0A 1NSJA 2EPHA 3PG9A 4AEOA 1FCVA 5D2TA 1TV8A 4O0KA 5D09A 1WAUA 4QM1A 1SO5A 4DEFA 3GKAA 2NX3A 3LXAA 4IPIA 1R2TA 1WQ5A 3DBPA 1RV8A 2QUVA 4JXCA 5HNRA 3KX6A 3KVLA 4U28A 3DI1A 2QJGA 1LRNA 3NXFA 2Q3OA 4GFSA 3DFNA 1VYRA 1W3IA 3HGOA 3TQ0A 5L6UA 4RXGA 5FF7A 5HINA 4GUIA 2X16A 4UFLA 3U8GA 4EF8A 1GT8A 1V7YA 1KFKA 3NQFA 4O1CA 2AQWA 4ICNA 2OX1A 3C6CA 3W7IA 2Y89A 1ICQA 5AHNA 4N6FA 3QF0A 1TTIA 3LCWA 3HG2A 1H60A 3L5LA 4TU1A 3SJ3A 3W2UA 3GNDA 4L4LA 4XKYA 3LBMA 4OU1A 3L0GA 5DBUA 1Y0EA 2F7FA 1JCLA 1QPNA 1HO1A 2QCDA 3MW7A 4O16A 4GUHA 2QUTA 1XM3A 1WDWA 2V5LA 2G5WA 4CCCA 2WNZA 1NFBA 1XUUA 4FX7A 3H55A 5LGZA 3DXIA 3WJYA 3D0CA 3TMQA 3W6YA 3W2LA 1QDSA 3G1AA 3TC7A 3C8FA 3TW7A 2YFNA 5CSRA 5TIMA 4DBDA 4M19A 1SPQA 3UXDA 4GNJA 2EKCA 1YADA 1KFLA 5J5RA 2A2IA 4BWLC 4NVTA 3C52A 5IBXC 1OFBA 3LHWA 4R53A 2QCCA 4A2RA 2GPTA 2Y85A 1KV8A 5BMWA 2FB3A 3UZJA 3FJ6A 1CI1A 2VFGA 4X22A 2B7OA 5HMSA 2YFOA 4P2VA 2CLFA 1A5AA 3I7QA 3TSMA 1K03A 1DHPA 1YDVA 4FIQA 3DFSA 5C55A 1ZY9A 5AHEA 4FX8A 4IMDA 3LXBA 3PAJA 1VS1A 3W1MA 1W5PA 2RFGA 5HR6A 3W7JA 1ZAJA 3QM3A 1FWRA 1ZALA 3W72A 5I3GA 2HS8A 3G0XA 4PFMA 1DV7A 2DORA 1OJXA 4JYEA 3MYPA 3O6YX 3W2NA 1F73A 1T99A 1GTEA 1VYPX 1QO2A 4XZ9A 3N2XA 4O0ZA 2CLEA 3QH2A 3TUUA 2A4AA 2FFCA 4N9EA 2ZZ1A 4P61A 3W74A 2WV8A 1EIXA 3B8DA 3IEBA 3GLCA 4LUIA 3VE9A 5F2GA 3TU9A 4LW7A 1YXYA 2C13A 2H8ZA 4Z08A 5D2YA 4ZQMA 1SO3A 3SI9A 1N8FA 2CLLA 4ZL1A 2PRHA 3G3MA 1VCGA 3NAVA 5SWUA 3DZ1A 2VELA 1BWLA 5U7SA 1LOQA 3L67A 1W5NA 1IIHA 4JTSA 4XQ6A 1SUXA 3JRKA 4BWLA 5IBXA 2NUWA 3O06A 3SIZA 2CFFA 2BX7A 3MBDA 5BOOA 5ABTA 3EKZA 3PM6A 5D37A 4QNWA 4BF9A 1FWSA 1FDZA 2B7NA 3NM3A 2RKXA 4LOCA 3T44A 1U83A 3M41A 4GC4A 3W75A 4O19A 4ADSA 4HKPA 1WBHA 2YXGA 3W7QA 1S5WA 4FB7A 3QFEA 3W7GA 2HS6A 1XDLA 3BGJA 4EVZA 2F84A 2YYUA 4WOZA 4Q32A 1PVNA 2I14A 1Z48A 2A5HA 1DL3A 4N9BA 1HG3A 4PC8A 5CZ0A 5FF2A 3ATZA 1Q45A 3HIJA 4C1LA 1VHCA 5I3KA 3DENA 1SW7A 1S5TA 5KSWA 1X1ZA 1KFCA 3MBFA 5HWJA 4JX6A 4OWGA 4TO8A 3LCGA 2H8XA 4JTKA 3GIYA 3W7PA 4YLWA 1KLZA 2ATMA 2G95A 2GJLA 5K9DA 4EWND 1FUYA 2UV8G 4UMBA 4LVFA 3HGJA 1KFBA 3IIZA 2CZFA 5FESA 4Y9AA 3TIMA 2Y63A 3W07A 2FB2A 5TBOA 2WNNA 4DQWA 3PY2A 5HJLA 3YPIA 3LERA 1G7UA 3FFSA 4Y8FA 2ZFAA 2E6FA 5FEPA 1OX4B 3HF3A 1IF2A 3TR2A 1FX6A 4O1AA 3W7RA 1VC4A 3NQAA 4HNNA 5DY2A 3GR8A 5D38A 3PBVA 1W3NA 4I7WA 3BVJA 3UY7A 3UWVA 1FWNA 3HPSA 1QPRA 4CCEA 1ME9A 3CWNA 2QCHA 4LVAA 2ZA2A 2ABBA 3T78A 1HTIA 4A2SA 2V82A 3LV6A 3KRSA 3LOTA 1JCJA 4Z1BA 1W37A 1MXSA 4GE8A 4WD0A 4UTKA 1G4SA 2NUYA 4KWWA 4Q4KA 2NWRA 4LS0A 4JTHA 2R94A 3VE7A 3L9CA 3I65A 2BTMA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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