5FCZA

Streptomyces plicatus n-acetyl-beta-hexosaminidase in complex with thio-naglucal (tnx)
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
DRKAPVRPTPLDRVIPAPASVDPGGAPYRITRGTHIRVDDSREARRVGDYLADLLRPATGYRLPVTAHGHGGIRLRLAGGPYGDEGYRLDSGPAGVTITARKAAGLFHGVQTLRQLLPPAVEKDSAQPGPWLVAGGTIEDTPRYAWRSAMLDVSRHFFGVDEVKRYIDRVARYKYNKLHLHLSDDQGWRIAIDSWPRLATYGGSTEVGGGPGGYYTKAEYKEIVRYAASRHLEVVPEIDMPGHTNAALASYAELNCDGVAPPLYTGTKVGFSSLCVDKDVTYDFVDDVIGELAALTPGRYLHIGGDEAHSTPKADFVAFMKRVQPIVAKYGKTVVGWHQLAGAEPVEGALVQYWGLDRTGDAEKAEVAEAARNGTGLILSPADRTYLDMKYTKDTPLGLSWAGYVEVQRSYDWDPAGYLPGAPADAVRGVEAPLWTETLSDPDQLDYMAFPRLPGVAELGWSPASTHDWDTYKVRLAAQAPYWEAAGIDFYRSPQVPWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces plicatus
publication title N-Acetyl glycals are tight-binding and environmentally insensitive inhibitors of hexosaminidases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords B-N-acetylhexosaminidase
total genus 182
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fczA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 5fczA01
2XVPA 3K4DA 1XHGA 3BSHA 3FNDA 2G41A 2DEPA 3ZR6A 1JFHA 2PWHA 5M17A 2OWCA 1GONA 2WHKA 2YJQA 1SFSA 1GVIA 1PZ2A 4MB5A 3GNRA 3PZVA 2ZUTA 1V6YA 4H8HA 2BXYA 5TD4A 1E6RA 4Z2GA 5JBEA 2E9MA 1E6SM 3BH4A 3WH9A 4FLRA 2XM1A 3W6LA 3WH6A 3L2LA 4D6GA 1KGWA 1EO7A 5A6BA 3OG2A 1PEZA 1JZ6A 3AS2A 4NRRA 1Y7VA 1E56A 2O9TA 4ATDA 1NQ6A 5F7UA 1E1EA 1HKKA 3AMKA 4AISA 3WFLA 1OT1A 3J7HA 4AZ7A 3A4WA 1VRXA 5CLTA 2CHNA 2G3JA 2YLLA 3MUZ1 3SUTA 2W4XA 4HP5A 3VIKA 1EH9A 2VZSA 3OLIA 5E9AA 3THCA 2ZXQA 2O9PA 1JAKA 2WMFA 1UZ1A 1CIUA 3EDJA 2EBNA 3CZEA 4B16A 4DUWA 5A6LA 3QGVA 1PX4A 3KL0A 3PN8A 2WBGA 1ZJAA 3APGA 4P8XA 3DECA 4H2CA 5A2AA 1OGBA 4HA4A 2A3HA 4WK9A 4TX8A 2BY1A 3VIIA 4D1JA 3RIKA 1BYDA 1CXEA 3T08A 1XCXA 2OYMA 3SCVA 3WY1A 3AHTA 5C8BB 1D7FA 4J27A 4QLKA 2Z1KA 9CGTA 4C91A 3T0DA 1JZ7A 1VAHA 4W87A 1LWJA 1OCQA 2JALA 2VX5A 1B3WA 2G4FA 3CGTA 1XGZA 1ITCA 1WKYA 2VVNA 4JIEA 3UR8A 2D22A 2X05A 3U57A 3B8SA 1DP0A 4TOQA 5E6YA 3IAPA 1FP9A 2CXGA 2E8ZA 2WSPA 1ODUA 4FF5A 1U2YA 2UY4A 2V3DA 4LX4A 2ZICA 2WMJA 3VGBA 2MANA 3FAWA 4R5EA 4P7OA 5D9PA 1GOIA 1NP2A 4ACYA 1DWFM 1UWSA 2BHYA 5HDRA 3W24A 1BSIA 3ARYA 3CHCA 4A3HA 1W9DM 2BY0A 1CGWA 2YDSA 1VBUA 4NRSA 4URIA 2JIEA 1DWGM 2YDQA 1JI1A 4GI8A 2NT1A 1OM0A 2XWDA 2RGLA 3WQ4A 2DDXA 3VGHA 4YHGA 3CHDA 4J3VA 1JYVA 1GJWA 4CD4A 1S46A 1VEMA 1V6WA 3A4XA 1MXGA 5DT5A 3WNPA 3KWXA 4PUEA 4W85A 1R7OA 3A47A 3AIWA 2J78A 1JAEA 2VRKA 3MV11 1YQ2A 1FH7A 2J8FA 1K6AA 5A1AA 2VJXA 2DT0A 4XB3A 3POCA 1QBBA 2D2OA 1XSIA 3PZOA 4WJXA 3WQ6A 5JBFA 1ZBVA 3RO8A 1W91A 2XGBA 2XM2A 3AICA 2XHYA 1C90A 1V6VA 4BQ4A 3EMCA 4PCTA 5IHRA 3WF0A 3WNKA 1ECEA 1V3HA 1QBAA 4R27A 1CEOA 2A3AA 5BYWA 3VMOA 3OZPA 2GDUA 4W84A 3VMPA 5I2UA 2EEXA 2VRJA 4MDPA 3ZM8A 4W5ZA 3AHVA 1EDGA 3QHNA 3OGSA 1KWGA 3FHQA 4PMDA 2BV9A 1W3KA 4LYPA 3K4AA 2CCRA 3L4XA 1WCGA 1JL8A 1CXIA 2GJXA 1JD9A 2WMHA 5D9OA 1UD8A 1OWQA 5A6MA 5I79A 3F5JA 3WFZA 4A3YA 1UG6A 4F66A 4L4OA 5GQBA 4WKFA 4W7WA 4M56A 4M1RA 3D3AA 4W8LA 5A95A 1OINA 2VZUA 2JEQA 2PWFA 4B3LA 2OSWA 2WVVB 5I23A 1ZS2A 2WCSA 2WCGA 3U7BA 3G6LA 3VGFA 1A3HA 1W2VA 4WF7A 4NSBA 1Q4NX 2J77A 5FCZA 3PZGA 1HT6A 3K8KA 2GUYA 1XCWA 4E2OA 1M01A 4JHOA 1UYQA 4DWSA 4BQ3A 4F9JA 1PZ3A 1JYNA 3RM8A 3LMYA 5EMYA 2WAGA 3IAQA 2YL6A 1QNSA 4AZGA 4PMRA 4Q7NA 3SCRA 2WMIB 3OIHA 1E9LA 4W86A 2ZUMA 4WSKA 3ARXA 2E40A 3VUPA 2DH2A 1WDSA 1E6QM 3WMBA 3ZO9A 2PWDA 5A3HA 1ZJBA 2YL8A 1R7AA 3F5LA 2O9OA 2WVTA 1H0GA 4PTVA 1GOWA 1QI0A 3KE0A 4ZE5A 1G1YA 2WW5A 4AZHA 1E15A 2OSYA 4QFUA 5A6JA 1OSEA 2J7DA 5D4YA 3MV01 2VR5A 4A4AA 1UD6A 2GSJA 2QPUA 4P7RA 4BCEA 1M7XA 1C92A 3SCNA 3WKZA 1KCKA 3ZJ6A 2WKGA 3CZLA 1BGAA 3SUVA 1ZL1A 5D8WA 2JE8A 3B9AA 1MW2A 3VNZA 1B9ZA 1PPIA 4EANA 4OJYA 1Q6DA 1C7SA 2GDVA 2X1IA 3RDKA 1IZKA 1QI2A 3SCSA 1W2PA 2WB5A 4Z2JA 2YA0A 1UD2A 2Y5EA 3ARVA 4UOQA 2VZTA 1QVBA 5EFDA 2EPKX 5BROA 1DWAM 1UWQA 1SMAA 1W1PA 1R8LA 1WZAA 2WC4A 3WH5A 1JXKA 1BAGA 2CBIA 3SCUA 1HJXA 2FGLA 4AZ6A 4W88A 5BRPA 8A3HA 1N82A 4D6IA 8CGTA 2PWGA 1HP5A 2EPOA 4HTYA 1J0YA 5A2BA 5BWFA 3CZGA 4ZXLA 3W4RA 2PBOA 4F79A 4J3XA 4IUGA 4W8AA 2WWDA 2WMGA 1VIWA 3I3BA 3AYSA 2VZVA 3SURA 2J7HA 1B3XA 2HVMA 2UY3A 2FHBA 4UFHA 2VTFA 2WVUA 2V5DA 2GJPA 3VGGA 2V3EA 1JDDA 3NYDA 4IISA 3EYPA 4PMZA 2FGZA 2BHZA 3CUJA 1BYBA 3SCPA 1WZKA 4CCCA 1E72M 3GYCA 4UR9A 2WVVA 2XWEA 1J11A 2DT2A 3WL1A 4TVDA 3VVGA 1QW9A 1MWOA 4MB3A 3SCTA 5GNXA 2J7EA 3ARQA 4H41A 3WELA 4AY1A 2DIJA 2VR4A 3WQVA 4D1IA 4CVUA 2WZIA 1E70M 3VD7A 2D3NA 5IHSA 1OBAA 3NUKA 2W62A 2J75A 5FL1A 3BAXA 3THDA 3AZRA 1GJUA 3AIUA 1J18A 1PX8A 4UFKA 5CSYA 4ZE4A 4ZEPA 3VGEA 2CESA 1SR0A 3GDBA 2WLYA 4QAWA 1C93A 3W81A 1UA3A 3PZMA 4UQDA 1BLIA 4MADA 4BQ5A 4HMDA 4OBRA 4HU8A 1KR0A 3A4AA 1TMQA 4N42A 1J9YA 1PAMA 3W82A 1GOQA 3IJ8A 3WMCA 1EGZA 3W6MA 2YKKA 1QPKA 1Q6FA 3T2PA 1KBBA 3AYRA 2G3NA 3OGVA 3PTKA 2X0YA 1XH0A 5DFAA 2W61A 4EE9A 1V6XA 3ALFA 2W92A 4RE4A 1X6NA 3ALGA 2X09A 3LPGA 2F8QA 4TXEA 1ZBCA 1B31A 2V3FA 5CPSA 3BGAA 4P7NA 4PTMA 1E73M 4D6JA 3VU2A 4UQAA 1ODZA 2PF0A 5CJ5A 5A94A 5I78A 3CUIA 5IFTA 6A3HA 1K9DA 1TA3B 1VFFA 3M7SA 1RD6A 4J3WA 4QP0A 1EDTA 3ARSA 1B90A 4FLSA 1OGGA 3IJ7A 3AIBA 4XZWA 3W0KA 1QNQA 2WVSA 4BS0A 3L4YA 2ZUWA 3RJYA 2XVGA 3HJEA 3QOMA 3WNMA 2BY2A 4NI3A 3II1A 4DUXA 1FA2A 2OSXA 1BGGA 1I75A 2W63A 5BCAA 4AD4A 3DYMA 4MNLA 2VL4A 5IXEA 3AHXA 4K68A 2ZX8A 3BAWA 4KGLA 4TVCA 3T2QA 3OA5A 1G9HA 4U2ZA 3WF1A 3MKKA 4UQEA 3ZQ9A 5JIWA 1UKPA 2WXDM 3AZSA 4PEEA 1KWKA 3FAXA 3A6OA 5CG0A 5CLWA 1JNEA 1UQZA 3K8LA 2JF6A 3CMGA 1VJZA 1KFWA 1MFUA 2W91A 2DPEA 2QHAA 2VUYA 3L4TA 3NIYA 2CERA 2EXOA 4RE2A 1H49A 4GZEA 3DHUA 3WIJA 4UFMA 4HOWA 3GNOA 5A2CA 4GZJA 1X1NA 2ZX9A 2QMKA 4V28A 3MS8A 2J74A 2CETA 1KBKA 2DH3A 2RGMA 2WM0A 5AYBA 1W9XA 3UESA 4PMQA 3VOCA 3W27A 1BG9A 3EMZA 1V3IA 2XFRA 2PWEA 2JFEX 4AZIA 1E1FA 4UZUA 5FIPA 4QDMA 4CN6A 2WCAA 4AXNA 3IK2A 3N11A 4U5KA 5C70A 1RP9A 4J3TA 3VM7A 4S3KA 3GXMA 5AC4A 5E0CA 1LG2A 2YDRA 3VINA 2JIWA 3AS3A 2WZEA 5A6BD 3ARZA 1VENA 1B1YA 1UKQA 4HZ6A 4UOJA 2G3MA 1JDAA 3WD0A 4DM1A 3BAIA 4KGJA 4HPHA 1J01A 2Y4SA 1EXPA 3GNPA 5AY7A 4LYQA 3GH7A 1OT2A 1E4MM 1E6PA 2EQDA 1HVXA 4Z2HA 3CBWA 3HN3A 3VDAA 1NOUA 2XSAA 5E6ZA 3L4UA 4JKKA 5A6AA 1Q6CA 3WD1A 4B15A 1CLVA 1ISVA 2GVYA 4JL1A 1E3ZA 4UTFA 5I5RA 1UKOA 4H04A 1DWHM 4HPGA 3BMVA 5FL0A 4KH2A 4B9YA 3AQUA 2VURA 1UR4A 1UWIA 2CIPA 1WZMA 1XC6A 2W67A 4RL3A 3VO0A 3NDYA 3N18A 4W5UA 1HJVA 1UHVA 5EFFA 1UQYA 3N15A 1V0MA 5HOSA 1EA9C 2VMFA 4FMVA 4UCFA 4UZSA 3UERA 4CGTA 4UFLA 4X0VA 3WMSA 4TVUA 1GQJA 1UD3A 1W32A 1ISYA 2D1ZA 3DC0A 4YPJA 1C8XA 1GOMA 1JZ3A 4PSPA 4KWUA 4JZ5A 1GORA 4MJ4A 1UA7A 1JZ4A 2XFFA 1JYXA 1GZJA 2Y2WA 3EDEA 1E6NA 2A3EA 1E0WA 2QLYA 3BAKA 3NDZA 2UY2A 3CTTA 1HJSA 3AISA 3W38A 1QI5A 1GVYA 3AJ7A 3GXDA 3F5KA 5CZKA 4FK9A 1WP6A 2W5FA 3W37A 1A47A 2QMJA 3AXIA 5BXPA 4M81A 3VIFA 5HXMA 1H09A 4JKMA 3EMQA 4E8CA 2VX7A 4JKLA 1X6LA 3T0AA 1JXJA 3ZIZA 1PIGA 1YHTA 3N1AA 3NSXA 2WYSA 2OWWA 3PZNA 4PMNA 3VIGA 1JD7A 2CBVA 3CMJA 3AHYA 4JCMA 1V0LA 2ZUVA 2BXZA 1HXJA 2ZWYA 1LF1A 2ZX7A 3IJ9A 2DT3A 3PZQA 3TTSA 1XV8A 2WBKA 1BF2A 5D8ZA 2DT1A 3FW6A 4J3UA 2TAAA 3MANA 1V3LA 1FHDA 5BRQA 1AQMA 1E40A 1F4AA 3WBEA 1PIFA 3ARUA 5A8MA 3SCWA 1DTUA 2DGAA 1ISZA 1GQKA 3S2CA 2ZIDA 4P7LA 1R87A 3S6TA 1CYGA 2G3IA 1TFVA 1C91A 2GK1B 2FH8A 1WAWA 4OKDA 1LQ0A 1BVNP 4W7UA 3OGRA 4PMUA 3KL3A 1FOBA 1CXFA 1E55A 5A6SA 4AZ5A 4QLJA 2D0HA 3W26A 2V5CA 5AYIA 1G94A 3WDIA 3ARPA 2V3GA 3VIMA 3WQWA 5EBAA 3D5HA 2ZUUA 3AI0A 3VMNA 1E4IA 2EPLX 4H8VA 3VX1A 4NZCA 4MB1A 3G6MA 4IPLA 5ABFB 2CYGA 2YBUA 2D0FA 4U5IA 5CPTA 1W1TA 1HP4A 3BLKA 3UEQA 1BG4A 4AIEA 4MAZA 1J0HA 5GNYA 2ZWZA 7TAAA 1NWRA 1CNVA 3HMCA 4CCEA 1V02A 3OBAA 4JFVA 1PBGA 5DMYA 3OLGA 4C7GA 1DWJM 5BXTA 4U3CA 1F4HA 2DQXA 1CDGA 1HN1A 4DWSD 7A3HA 3KZSA 3WH8A 4U3AA 1MW3A 3MUIA 1IZJA 4JL2A 2E3ZA 4AZBA 7CGTA 2AAAA 1CGUA 2QV4A 2WZHA 3N13A 4D6EA 1B30A 1XRVA 1JGIA 3ZJ8A 4DUVA 3WF2A 3PZIA 2OLHA 3WENA 3CH9A 1MYRA 5HPCA 3W29A 3ZT7A 2WHJA 3U5UA 2XG9A 2VZOA 4WLCA 4UFIA 2J79A 1WO2A 3AFBA 2ZOXA 5A6KA 1CBGA 1QHOA 1BTCA 3T2OA 4PRWA 3WUGA 1HL9A 4AWEA 3BCDA 3BXWA 1OD8A 2PB1A 1CGVA 2WWCA 3TA9A 5IDIA 4Q22A 1LJYA 1KXQA 2YA1A 4YHEA 1CENA 2ZUSA 4OOUA 1HX0A 1Q6EA 3ZJKA 3VPLA 2ZXAA 4AIUA 3WBAA 3WF4A 1TVNA 1EO5A 1M04A 1C8QA 1TG7A 1WDQA 1HJQA 1G0CA 2XGIA 2Y24A 4ATWA 2VT0A 2OWXA 4M82A 5I3DA 1SYTA 4GQQA 2CITA 5GPRA 3GH5A 2WC7A 4PMVA 5I0DA 4U33A 2J62A 3TTYA 2D3LA 2J7CA 3PHAA 3RILA 4P8VA 1V08A 1GQLA 1US3A 4E8DA 5DEZA 1E6XM 1CGTA 1E5JA 2YIHA 3SEPA 1JI2A 1UR0A 3BSGA 2WANA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XVP A;  3K4D A;  1XHG A;  3BSH A;  3FND A;  2G41 A;  2DEP A;  3ZR6 A;  1JFH A;  2PWH A;  5M17 A;  2OWC A;  1GON A;  2WHK A;  2YJQ A;  1SFS A;  1GVI A;  1PZ2 A;  4MB5 A;  3GNR A;  3PZV A;  2ZUT A;  1V6Y A;  4H8H A;  2BXY A;  5TD4 A;  1E6R A;  4Z2G A;  5JBE A;  2E9M A;  1E6S M;  3BH4 A;  3WH9 A;  4FLR A;  2XM1 A;  3W6L A;  3WH6 A;  3L2L A;  4D6G A;  1KGW A;  1EO7 A;  5A6B A;  3OG2 A;  1PEZ A;  1JZ6 A;  3AS2 A;  4NRR A;  1Y7V A;  1E56 A;  2O9T A;  4ATD A;  1NQ6 A;  5F7U A;  1E1E A;  1HKK A;  3AMK A;  4AIS A;  3WFL A;  1OT1 A;  3J7H A;  4AZ7 A;  3A4W A;  1VRX A;  5CLT A;  2CHN A;  2G3J A;  2YLL A;  3MUZ 1;  3SUT A;  2W4X A;  4HP5 A;  3VIK A;  1EH9 A;  2VZS A;  3OLI A;  5E9A A;  3THC A;  2ZXQ A;  2O9P A;  1JAK A;  2WMF A;  1UZ1 A;  1CIU A;  3EDJ A;  2EBN A;  3CZE A;  4B16 A;  4DUW A;  5A6L A;  3QGV A;  1PX4 A;  3KL0 A;  3PN8 A;  2WBG A;  1ZJA A;  3APG A;  4P8X A;  3DEC A;  4H2C A;  5A2A A;  1OGB A;  4HA4 A;  2A3H A;  4WK9 A;  4TX8 A;  2BY1 A;  3VII A;  4D1J A;  3RIK A;  1BYD A;  1CXE A;  3T08 A;  1XCX A;  2OYM A;  3SCV A;  3WY1 A;  3AHT A;  5C8B B;  1D7F A;  4J27 A;  4QLK A;  2Z1K A;  9CGT A;  4C91 A;  3T0D A;  1JZ7 A;  1VAH A;  4W87 A;  1LWJ A;  1OCQ A;  2JAL A;  2VX5 A;  1B3W A;  2G4F A;  3CGT A;  1XGZ A;  1ITC A;  1WKY A;  2VVN A;  4JIE A;  3UR8 A;  2D22 A;  2X05 A;  3U57 A;  3B8S A;  1DP0 A;  4TOQ A;  5E6Y A;  3IAP A;  1FP9 A;  2CXG A;  2E8Z A;  2WSP A;  1ODU A;  4FF5 A;  1U2Y A;  2UY4 A;  2V3D A;  4LX4 A;  2ZIC A;  2WMJ A;  3VGB A;  2MAN A;  3FAW A;  4R5E A;  4P7O A;  5D9P A;  1GOI A;  1NP2 A;  4ACY A;  1DWF M;  1UWS A;  2BHY A;  5HDR A;  3W24 A;  1BSI A;  3ARY A;  3CHC A;  4A3H A;  1W9D M;  2BY0 A;  1CGW A;  2YDS A;  1VBU A;  4NRS A;  4URI A;  2JIE A;  1DWG M;  2YDQ A;  1JI1 A;  4GI8 A;  2NT1 A;  1OM0 A;  2XWD A;  2RGL A;  3WQ4 A;  2DDX A;  3VGH A;  4YHG A;  3CHD A;  4J3V A;  1JYV A;  1GJW A;  4CD4 A;  1S46 A;  1VEM A;  1V6W A;  3A4X A;  1MXG A;  5DT5 A;  3WNP A;  3KWX A;  4PUE A;  4W85 A;  1R7O A;  3A47 A;  3AIW A;  2J78 A;  1JAE A;  2VRK A;  3MV1 1;  1YQ2 A;  1FH7 A;  2J8F A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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