5FEWA

Hyde from t. maritima in complex with s-adenosyl-l-cysteine (final product)
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
346
structure length
346
Chain Sequence
TGREILEKLERREFTREVLKEALSINDRGFNEALFKLADEIRRKYVGDEVHIRAIIEFSNVCRKNCLYCGLRRDNKNLKRYRMTPEEIVERARLAVQFGAKTIVLQSGEDPYYMPDVISDIVKEIKKMGVAVTLSLGEWPREYYEKWKEAGADRYLLRHETANPVLHRKLRPDTSFENRLNCLLTLKELGYETGAGSMVGLPGQTIDDLVDDLLFLKEHDFDMVGIGPFIPHPDTPLANEKKGDFTLTLKMVALTRILLPDSNIPATTAMGTIVPGGREITLRCGANVIMPNWTPSPYRQLYQLYPGKISVFEKDTASIPSVMKMIELLGRKPGRDWGGRKRVFET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Carbon-sulfur bond-forming reaction catalysed by the radical SAM enzyme HydE.
pubmed doi rcsb
molecule keywords [FeFe] hydrogenase maturase subunit HydE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Thermotoga maritima
total genus 143
structure length 346
sequence length 346
ec nomenclature ec 1.8.-.-:
pdb deposition date 2015-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF06968 BATS Biotin and Thiamin Synthesis associated domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5fewA00
3UWUA 4WXYA 4KFNA 2ZA3A 3E12A 4XUGA 2QEZA 3KX6A 5BW6A 4Q4KA 2RFGA 2EHHA 4IOTA 3O6DA 3DBPA 1DOSA 2YXGA 1T0OA 4HSNA 3W2JA 3KRUA 1ONRA 1ZAJA 2ATSA 3QC3A 3W1UA 2CLMA 1A53A 1QO2A 4O57A 3MI6A 2V5LA 2Z0IA 5BMXA 1S3HA 4TMBA 4N9EA 3CWOX 4B5NA 3Q2DA 2PE4A 3IIXA 2ZRZA 4O14A 2ZCGA 1W31A 3O63A 1B3OA 4DF0A 3QZEA 5G2HA 4GUJA 1OABA 3N9RA 3W1QA 3W7QA 1GVSA 2YX0A 5ABTA 1TPEA 4JTIA 1AG1O 1JUBA 2QR6A 2C6QA 3I7RA 4O17A 3MP5A 3ATZA 5KSWA 4EF8A 1UB3A 2I14A 3MP4A 1SR9A 1SW3A 1M6JA 1TJPA 1IF2A 4O12A 2A7RA 1QMLA 4NXSA 1YXDA 4O13A 2NV2A 2VFFA 4PFMA 4UTHA 3G24A 1UJPA 1K7XA 1AL8A 1U83A 4PODA 5G5IA 5TIMA 5CPMA 2NUYA 4IWWA 4UFHA 4JYDA 1QR7A 3NQ7A 5D02A 3M47A 4CLMA 5KMYA 3IGUA 1R2SA 1YDOA 5GVJA 1MEWA 2VFDA 4JIPA 4O4VA 4XBSA 1QO5A 4N6FA 4HHPA 1RR2A 2FPYA 2FPVA 2CLLA 1MO0A 1WBJA 3SFKA 2BZNA 1XM3A 3PAJA 1W3NA 1LTDA 2H3DA 4GUGA 3EXRA 1EUAA 1A5CA 3G1SA 5J5DA 3GDRA 1NAL1 3H53A 5LGXA 3LXBA 3SJ3A 2C18A 1HUVA 1VYSX 3L0KA 3PUDA 2C13A 4CCDA 3IEBA 1Q6OA 4PA8A 4A2RA 3QH2A 3C3NA 1RD5A 3DFTA 4YWIA 5D2VA 4LS1A 4O4WA 3P62A 5EY5A 3PBVA 1QPQA 4O52A 3G0XA 1YTEA 4WY0B 3F4WA 2J9YA 1ZAHA 3IIPA 3W1MA 3PSWA 1VQTA 4QJ1A 3C0JA 3STEA 3V1PA 4POCA 3DH7A 3ZS4A 1JQVA 3TE9A 4AB4A 1PS9A 1FBAA 2P10A 3GR8A 4N9BA 3C6CA 3P80A 1KFKA 1JJKA 3BG3A 1SSDA 5I3FA 5K9DA 3WJYA 3NQEA 4A29A 3TW6A 3M6YA 4IX2A 1E51A 3I68A 3KXQA 5F2GA 3F1QA 1W54A 5F1UA 1QDSA 2NV1A 2PC4A 4NT0A 3LTSA 1BWLA 2YZRA 2NUXA 1H7RA 1HG3A 1VYPX 1A5AA 3W7GA 1H7OA 4RCXA 5SWUA 1OHLA 5G2IA 3GVGA 2E6DA 3HJZA 1F76A 1Q45A 3G1HA 1SW7A 4MIMA 5EPDA 2J27A 2DU2A 3RU6A 1KLYA 2YYUA 4DPPA 4O1CA 4JYFA 3T78A 2BTMA 2DORA 3GXPA 3DFSA 4J9JA 2X1TA 4QIUA 1OF6A 2WO5A 2A1YA 1Q6QA 2A6LA 3ELFA 5D09A 4MOZA 5BMWA 4JIQA 5CGQA 3NQDA 4LT9A 1NVMA 4X3ZA 3O05A 2QCGA 3ATYA 1ZAIA 4IMGA 2A85A 1QOPA 1FCUA 3TC6A 3VFLA 5DY2A 3CQ0A 1TTJA 2JK2A 3IGXA 3LCHA 5AYZA 4IQLA 1WA3A 4MLRA 2J9XA 3KAOA 5C55A 2QCDA 1F74A 1TYGA 1TPFA 4LWWA 2YSWA 2C19A 3M44A 3C2RA 3MO7A 3LV6A 1X6UA 4WQ6A 1KM1A 3EX3A 3U2OA 4R53A 4XTIA 2FFCA 2OZ0A 5EMUA 3Q94A 1FQ0A 5AHFA 3WK2A 3TQ0A 2F84A 4O0KA 2YCEA 1WOBA 3LI1A 4XQ6A 3ABSA 4ZVJA 4N4PA 3TKFA 1T99A 5FEZA 1FWRA 2V2CA 3FIGA 1VGAA 4AWSA 4ORMA 4EVZA 1TPVA 5J5RA 3WJZA 1TRDA 5FF0A 2B0MA 1VC4A 3LM7A 3PVFA 1FWNA 4ADUA 3B0VC 3B03A 4U4MA 1TV5A 1OYCA 1LROA 4R33A 5AB3A 1MXSA 5AYYA 4YLWA 2W0UA 1VCVA 5IBXC 4DO4A 4G1KA 3E9AA 1ME8A 5FESA 4UMCA 4LS0A 1TPWA 3S5ZA 4BI6A 1EP3A 1Q6RA 3QW4B 4HNVA 3ABOA 3M5ZA 3QPZA 4JTKA 1J4EA 3SECA 1PHWA 4NQ1A 3WFAA 4NJJA 1RQHA 2OMAA 1W5NA 3EX6A 3M1ZA 3W85A 4AEOA 5F4SA 5LZLA 2YDAA 1P1XA 3I65A 3GLCA 1PVNA 3UYCA 1FXQA 3W7CA 1LYXA 1SFLA 5D2XA 3SR7A 4AF0B 5E1QA 3W7JA 4HIBA 3W23A 2RDTA 1DKWA 2E6FA 3FEMA 3LRMA 3TROA 3TV8A 2YW3A 3D0CA 5MHBA 2H8ZA 5K9XA 2QJHA 1TIMA 4O1BA 3QMTA 3LCXA 3JS3A 4YL2A 3W72A 4FNTA 1K8YA 3GK0A 1D3GA 3NQAA 4AH7A 3H54A 5KZEA 3N19B 1TV7A 1XBVA 1Z41A 1F73A 3CTLA 3L2IA 3M9YA 3UQNA 3BW4A 3NPVA 1XBYA 4DXVA 3PBYA 1G7UA 3JR2A 3QM3A 1PHQA 5DN1A 2C14A 2QAFA 2VFHA 4GRSA 3FLUA 2VFEA 3NNTA 1NSJA 5HWNA 3TAKA 1J2WA 2OT0A 3NDOA 3UZJA 4OV4A 3W73A 3RK8A 3P8IA 1C9DA 3W1PA 2CLKA 1X7FA 3U6WA 5H2ZA 3UWWA 3P8JA 3KFTA 3LCLA 5F4XA 2GVLA 1KLZA 1F6KA 2FJKA 2ZA1A 3C4UA 3NQCA 3UXAA 1MEHA 1KM0A 2W6RA 2ZYFA 4FXRA 4WY0F 2QUTA 1JRBA 4M6PA 5LHEA 4LS2A 4Y6GA 4O1DA 3NQFA 3CLMA 2EGZA 1EIXA 2X16A 4HKPA 3UPBA 4LVGA 1QPNA 1GJPA 3THAA 4UFJA 2YFNA 3LHUA 3RFAA 3S1UA 3P60A 2ATMA 1KW1A 2OX1A 1F7BA 4BWLA 3NQ2A 3NYZA 1OFQA 3MHFA 1LDCA 3IIOA 2YFOA 5G2WA 1XL9A 4JYEA 4MFDA 4UTUA 1G6CA 1YTKA 3HIJA 5CSRA 1VLWA 3AJXA 4XKYA 5BRBA 1SZNA 3MUXA 5K4XA 5DELA 3W2KA 1XI3A 3KOFA 2QKFA 4LU0A 5EL1A 1WDWA 1P5BA 2Y85A 2RKXA 1UASA 2JKPA 3PBWA 1GYNA 3WK0A 1SFJA 4FHAA 3WK3A 1OJXA 1BEUA 1M7PA 4IMFA 3TU9A 3NR0A 1G4TA 3TSMA 3DKLA 3W7OA 2Q3RA 2HTMA 2J6XA 1O4UA 2X30A 4UTWA 3W84A 3UY8A 3DHDA 4LVDA 4GWEA 3IVTA 4JX6A 4BWLC 4DF1A 3OHIA 1LRNA 3MW7A 4LTSA 3W6YA 4E2BA 4X9SA 4M7TA 1JCNA 3NL2A 1W5PA 1OFOA 2PRMA 1SZEA 1KBIA 4RZ5A 5I3KA 1H1ZA 3GZ3A 2HS8A 3IIVA 4GUFA 4RLIA 1D3HA 3NL6A 1SO4A 3GX9A 4IXXA 5D2WA 4FEZA 1LOLA 3ZWTA 1KFJA 4KKXA 4BF9A 1R30A 3IGSA 4IJBA 5IM51 1QCWA 2ZRXA 4FNUA 1LM1A 4K7VA 4PL1A 3P67A 3HF3A 4A22A 5D30A 1LBLA 2AQWA 3C2OA 3OA3A 3MP3A 4FO4A 1G4SA 4NX0A 2TYSA 4Z0SA 1IGSA 3RLUA 4JNMA 1GVFA 4PH6A 4WXZA 4EIVA 2QUUA 4NNCA 1MZHA 2ZBTA 1FCBA 2QCLA 3LTPA 4IX0A 4LRSA 2GQ8A 3HPZA 1ICPA 3LCGA 4HT3A 1VZWA 3IRDA 6TIMA 2QJGA 3CM4A 3O6YX 1GPWA 4JD4A 1SU5A 1XXXA 1W5MA 2Z2UA 2A7PA 3PUOA 4AWTA 4O53A 1EUNA 1H7PA 1WAUA 4LC8A 1B57A 2TPSA 1JCJA 1FCVA 2V2DA 4FF7A 1I2OA 1OFPA 1LOQA 2WPBA 4H6KA 1X1OA 4MVAA 3W7HA 1ADOA 1AL7A 3CIXA 3S5YA 3R2GA 3DU0A 2X1UA 2VFGA 4UR7A 3W2MA 1TTIA 4Z1AA 5LNUA 5D2TA 3LI0A 1GVRA 4C1LA 3I6RA 2BWGA 4HN4A 3MBFA 4DBDA 4R34A 3CIWA 3QEZA 2NX9A 2E1DA 3W70A 1AMKA 2V5BA 2DZUA 4WOZA 3GR7A 3NPWA 3V75A 3VCRA 2QAPA 3FKKA 3CWNA 1VLIA 4O8RA 4O28A 1TTQA 3NPXA 4Z0JA 5AHNA 4FX8A 1XDMA 3L68A 4JTSA 1YDVA 5F4WA 1QPRA 2VEKA 3FS2A 3NA8A 4YXGA 4LC6A 3GAYA 2VEMA 1ICSA 1G67A 3DZ1A 3NQ6A 1QPOA 2X1SA 3HGSA 4O18A 4GUHA 2FLIA 3NQGA 2YGYA 3EWYA 2TMDA 2DZSA 5F1VA 3K30A 3TH6A 2A2IA 4JTGA 4QNWA 3TK7A 3M43A 4ZZ9A 1KM5A 4FIRA 4NJHA 1VJIA 2X2GA 3BW3A 2CLFA 4OU1A 1B4EA 3PULA 2YPIA 2G96A 4TX9A 1IIGA 4X22A 1MEIA 1XBXA 3N14A 3QMSA 2JKAA 4GE8A 3B0UX 3STCA 4RK8A 5G4WA 4OGZA 2TSYA 1M5WA 4AWUA 2CLOA 2CZFA 3S1XA 3LHZA 4ADTA 1JULA 3M16A 4P61A 4O1AA 3UY7A 2GVGA 4I9AA 3DGRA 1W5OA 1AW5A 1KFEA 3G1AA 2Z6IA 1H51A 3NQ8A 5EA9A 4RZ6A 4LUIA 4NJGA 1NF0A 2DZTA 4ZQRA 5G4EA 3UWQA 3BVJA 3MYOA 4TIMA 1LCOA 3LCFA 3FJLA 3G8EA 3TFCA 2V81A 3VI2A 2QF7A 1FWSA 1FY6A 2OCZA 5AHLA 1JVNA 3W1NA 4HNNA 1FDZA 2W79A 3EKZA 4HSOA 2QCEA 3NXFA 4UNKA 3ZFHA 4AVFA 1VCFA 2XN2A 2FTPA 4R7JA 3HG2A 2Y7DA 5HULA 3G18A 3GKAA 2ZRYA 3TQKA 2VEIA 3WJSA 1H5YA 2Z6JA 1ZJIA 3T4CA 5CKSA 3DFOA 1CX9A 1TMHA 2ZA2A 2QCMA 3C52A 3QSTA 4N4QA 3B4UA 3W1XA 2ZTKA 2RH9A 4JY8A 1H7WA 1KTNA 3W3OA 4PEKA 1L6YA 3NVTA 3M7WA 3S42A 1DV7A 3PB2A 4I7VA 2ISSA 1H50A 1ZENA 4ZMGA 2Y6ZA 2VXNA 4I7UA 4M6QA 1O5XA 2E5CA 1QOQA 1KM6A 1QWGA 5LSMA 3QQ1A 2DJLA 5F2LA 1NFBA 1Q3NA 1VS1A 3L5AA 1ZY9A 4ZQCA 4CQ9A 3WJXA 1OX6A 3TMQA 2WQPA 3N73A 4AHOA 3TUUA 5FEXA 4O11A 2JGQA 5DCEA 2FPTA 3PB0A 4TO8A 1IXPA 1VPXA 3BLFA 3TFXA 5U7SA 3QJAA 3CEPA 4Y9AA 1G4PA 5FF3A 5KZMA 1IXNA 3GYEA 2C1HA 3W7DA 1GG1A 4ZQMA 5TBOA 1PIIA 3L0NA 2RDWA 4KWVA 3DI1A 3JRKA 4QQ3A 1C29A 3S1WA 3PSVA 1I4NA 3CT7A 4OT7A 4DF2A 2G5WA 4QNEA 3W2LA 1QNVA 3FFSA 4N2YA 3S6DA 1G7VA 2ZZ2A 3S8HA 3LB0A 4D2JA 2IQTA 4JGDA 4MKNA 3KRZA 5LGZA 3OBKA 1DQWA 5C2XA 1JR1A 5I3JA 4HPJA 2DZPA 3TAOA 1AW2A 3GNDA 5LNWA 1Y0EA 5DXXA 1KV8A 5LNVA 1BTMA 3OVRA 3E96A 2Y89A 5IBXA 5EYWA 3W1RA 1LLWA 4UTIA 4Z1DA 3HPSA 1R47A 2VELA 3N2MA 4PC8A 5DBUA 2E68A 4GUIA 1TRIA 1YDNA 5C54A 3KRSA 8TIMA 2RHGA 2QDGA 4ZQOA 3TXVA 4N9DA 3NEVA 3NGJA 4IPIA 3OEXA 4XZ9A 5DCBA 3TSBA 2P1FA 3E0IA 2GPTA 4UFLA 5AC8A 3LHVA 2E09A 1JCXA 3NZRA 1HO1A 1F05A 2CLEA 3C61A 4S2CA 3UWVA 3L21A 1UUOA 2PRHA 5KTLA 3R8RA 4W9TA 1TPC1 4H3DA 3FOKA 3M0ZA 3R5EA 4GBUA 3MBDA 5AHMA 4NXKA 1C8VA 1ZHAA 3BK0A 4UFKA 1R2TA 5K3VA 3P74A 3W7KA 3HG4A 4FIQA 2QCCA 1LP6A 2R8WA 5CPOA 3DFNA 3HO8A 3QYQA 2ZRWA 3SSJA 1Z48A 4GNJA 1PV8A 3MYPA 4N02A 3O1NA 5LNSA 2GJNA 3QF0A 4AHPA 4FNQA 4Z08A 5DBTA 2E5DA 1SPQA 3A5VA 3O07A 1ZNNA 1KM4A 1H1YA 3A5FA 3N2XA 1KA9F 5DCDA 3C56A 1K7FA 2YYTA 2YW4A 2Q3OA 3SIZA 3IVSA 4UR8A 1I2QA 1WV2A 1XCFA 4IXHA 4JEQA 4JTFA 1TO3A 3TW7A 3HMJG 1DJNA 5CG7A 3GDKA 1LRQA 3GNNA 2CLIA 5KITA 5FF4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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