5FI8A

Crystal structure of plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase bounded with dsm422 (tetrahydro-2-naphthyl and 2-indanyl triazolopyrimidine)
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
374
structure length
363
Chain Sequence
NPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNDEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Plasmodium falciparum (isolate 3d7)
publication title Tetrahydro-2-naphthyl and 2-Indanyl Triazolopyrimidines Targeting Plasmodium falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Display Potent and Selective Antimalarial Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
total genus 139
structure length 363
sequence length 374
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2015-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5fi8A00
2QUVA 2BSLA 2A6NA 3QW4B 2E5BA 1VYRA 4Z1BA 4DF1A 4ZQOA 1JCJA 3M6YA 3TQKA 4O18A 4JXCA 2GQ8A 3L0GA 4FEZA 3EXRA 1JCNA 2TPSA 3BW4A 4O0KA 4YMZA 2QCMA 2NUYA 2Y63A 3P62A 4EOUA 5AHFA 3AO0A 4JYDA 3LLFA 4ZQMA 2CLEA 4LS0A 4O14A 3P74A 2V2DA 3EXSA 1I2RA 3MW7A 4MPQA 3LTPA 2YFOA 5EY5A 1KLZA 3TSBA 1QR7A 3U8GA 3MBFA 3N3MA 4JTLA 4GC4A 3W7RA 2EKCA 3A22A 4IMCA 1HO1A 1TO3A 4M7SA 4WY0F 2TSYA 5H91A 3NL6A 2KZHA 4Z1AA 4NUWA 4ICNA 4FIQA 4HSNA 4LV9A 4WOQA 1TSIA 1UJPA 3NQ6A 1LLZA 3EWZA 4CCCA 3QMSA 4H3DA 1W8SA 3KVLA 3HGSA 3JR2A 1Q6RA 2VEIA 3QF0A 3QW3A 5T26A 5KINA 1T96A 1TYGA 4LVGA 1F5ZA 2G96A 4UR8A 5FEZA 3W7JA 1KA9F 4ZQRA 5KZEA 3NZ1A 3UWQA 2FPVA 4YXGA 4EVZA 1EP1A 1QAPA 3W7EA 1SO4A 3MYOA 5F2LA 3DKJA 2A6LA 4RJEA 1AW5A 3B4UA 3W6YA 5J5RA 4GUHA 2YGYA 2C14A 1NAL1 3EEGA 5D38A 3TMQA 2V2HA 3BW2A 4JNMA 4QAIA 3TW7A 3TW6A 5HMSA 1KM3A 4JD4A 3LTSA 2Y61A 3RMJA 2YX0A 3KFTA 3KX6A 3IIVA 3V75A 3S5YA 5FEPA 3G1YA 3E96A 3EX4A 3G24A 1B9BA 1PIIA 4ZQPA 3PUOA 1KM5A 1OFQA 4XWUA 1W3TA 3N9RA 2NUWA 1AK5A 1F6KA 1ICPA 4YL2A 1KLYA 5L6UA 5G1YA 2E6FA 4GFSA 5HUOA 1TPH1 1P0NA 2ZFAA 3BLFA 3L65A 2FDSA 3T44A 3W1UA 4IXXA 1KBIA 3CEUA 3KXQA 1JUBA 2J88A 1G69A 5G1TA 2Y7GA 3VKJA 2A21A 3HO8A 3I65A 3LXCA 3FEMA 3FOKA 3WK0A 4CQ8A 2ABAA 4RXFA 4UMAA 3UWWA 1RV8A 3W1NA 3PSVA 1JJKA 2ZDRA 1W54A 1VPXA 3DZ1A 4JGDA 2V2CA 4UMBA 2NV1A 4AVFA 4AF0A 3PAJA 4JTKA 5I3IA 1GT8A 1YTEA 4QIUA 2I1OA 1UUMA 5LHFA 5LGZA 3NA8A 2WNNA 1VRDA 4ALDA 4PC8A 4JTEA 5AHNA 3CU2A 2JKAA 1F74A 1Y0EA 3M0ZA 4K7YA 1D3HA 4PTNA 1R2SA 4N9EA 4UFIA 3HGJA 3NQCA 1YADA 1LCOA 2QUTA 5FESA 4UFLA 1RD5A 4M6QA 1OX4B 2JBMA 4LRSA 5F1UA 4MJMA 4UTIA 1DJNA 1IIGA 5CSSA 1KFLA 1BWKA 4GWEA 2QCGA 3CC1A 1O5KA 2P1FA 1D9EA 1VCGA 1DHPA 3W86A 4QM1A 4XBKA 5CZTA 4N9CA 5HWNA 2OZ0A 1GVOA 1YXYA 1KW1A 4J9JA 5IBXC 5LKYA 4A2RA 3EX3A 3CWNA 1VYPX 4H4IA 4AHPA 4DBDA 3I6RA 5IBXA 1VHCA 3UNDA 3O15A 1OJXA 4LWWA 4WY0B 3UXAA 3BLIA 1I4NA 2WNQA 4FIRA 2DZWA 2V0TA 4K8EA 4BI7A 3CT7A 3BARA 5AYXA 5KSWA 5F2IA 1KFEA 1AL7A 1ONRA 5G2HA 1XFBA 2NLIA 4AB4A 2YR1A 3QC3A 2CZ5A 1JCLA 1FWWA 1A50A 2FPTA 3S1UA 1H7WA 3QZEA 4X2RA 1GOXA 2P0OA 1VGAA 2V30A 3DFTA 4IX2A 3DFSA 3ZWSA 5LGXA 4LT9A 1KM1A 4O4VA 1MZHA 3QMTA 1R2RA 3UPWA 1S5TA 5LNSA 3P5YA 3HG3A 4A2SA 3N9SA 3PC0A 2NX1A 4WOZA 4O53A 4NNAA 3ABSA 1G4TA 3CPRA 4POCA 4UCGA 3MYPA 1YXCA 2QR6A 1KFJA 2QCDB 1HUVA 2YCEA 3WJWA 5I3HA 4RK8A 3LHVA 3LV6A 3O07A 3STEA 5DCEA 3S9YA 3TE9A 3EWYA 1K7EA 3N19B 4TR9A 4W9TA 3W2JA 4PL1A 2W79A 2DJXA 3KVMA 3W7IA 3PBUA 5ABTA 5LNRA 3QM3A 5CPOA 2ZRWA 1NSJA 3W1MA 2ALDA 1LORA 2Y7FA 2H3DA 4ADTA 3G3MA 5HWJA 1QPRA 3C3NA 1PE1A 4XBSA 3SR7A 2H8XA 4HSOA 1SSGA 4U28A 4MYAA 2DZTA 3RF9A 3UY8A 3TIMA 2DZUA 4ML9A 5AYYA 4GXMA 1W31A 2QAPA 3TXZA 4I7VA 4UC5A 1FCVA 2TRSA 5AC7A 4HNUA 1YLVA 2H6RA 3FA5A 4JTFA 2PRLA 3VE7A 4E2BA 3LXBA 1XUZA 2CLMA 3EX1A 2QCLA 3IIXA 3KRZA 3C2FA 4JTUA 3RFAA 2X1UA 3LI1A 5LHEA 3O6DA 1Q45A 1DQWA 2QEZA 2YYUA 3OVQA 4MZ8A 5TQLA 1XM3A 4KFPA 5K9DA 4O4WA 1DJQA 3HF3A 2I9EA 4OT7A 4N4PA 4S2CA 2ABBA 4L4MA 4JIQA 2F84A 2DZVA 2XFWA 2ZZ1A 4O0ZA 5D2VA 3NEVA 4CQAA 1MEIA 2J9YA 2C0AA 2OT0A 5A5WA 1W56A 1NFBA 4OV4A 3DHFA 2TYSA 2QAFA 1TPFA 4PA8A 1GYLA 3OA3A 4M5PA 3SZ8A 2CZEA 3GR7A 2Z6JA 1FY6A 3PB0A 3F03K 3TC6A 3NNTA 1L9WA 4BF9A 1LRQA 1DQXA 1H7PA 3P84A 1NVMA 2A85A 1WXJA 2ZRVA 4IUOA 3MHUA 4IGHA 3W73A 1SU5A 3TNOA 4Z1CA 1KM4A 3P7YA 1H63A 2PRHA 2WQPA 4IMDA 3KVKA 1K8ZA 3DI1A 1JCYA 3BK0A 4QITA 4FNUA 4NX5A 1EUNA 4DF2A 3W3OA 3LX9A 1OK4A 3W7GA 4DO5A 4UR7A 1TQXA 3G0SA 2WKJA 1C29A 5HR6A 1TTJA 2WSRA 2HTMA 4N6FA 3THQA 3WK2A 3BLEA 3FJ6A 3CB8A 1ZAHA 3B8DA 1G4EA 2VEMA 3GDRA 5HJLA 3GXPA 4GUGA 1QPNA 3TSMA 1J5TA 3PVFA 2R8WA 1OFEA 3TH6A 2ISVA 2R94A 5D02A 1LM1A 3QSTA 1SPQA 4JDBA 3NM3A 4M7TA 4O52A 4JTJA 3TXVA 2A1YA 1KM0A 4O15A 3GB6A 4ORMA 3A24A 3R89A 3W1PA 5DLCA 1JUKA 1UUOA 4ORIA 2DZXA 4HKPA 1M7OA 3GKAA 4RZ5A 4TX9A 3W85A 4JR5A 3NL5A 4LUJA 3FKKA 5BW6A 2X16A 1TCDA 3DKLA 2ZA3A 4I9AA 1VCVA 3TAOA 1BWLA 4WZHA 3G3DA 1KFBA 1ZY9A 3I7SA 1KFKA 1R30A 3V1PA 3P61A 5IM51 4OBTA 1LOSA 5G4WA 5F1VA 1DVJA 2QCFA 3F4NA 4ZQCA 3G0XA 2BWGA 2Y89A 4ZL1A 3EKLA 5KITA 4IPJA 2FJKA 4JTIA 5CPNA 1R46A 4M6VA 1GVRA 3CM4A 1TRIA 3W88A 1H5YA 2DU2A 5L9FA 4HNNA 3C0JA 2C3ZA 3G1XA 4NJHA 4NJIA 1YTDA 3G1DA 1YYAA 1PVNA 4WUIA 3M41A 3WJYA 2E1DA 4NU7A 4R53A 1OYBA 3IIZA 1OK6A 1EIXA 1GG0A 3HG4A 3HOJA 1R47A 5DN1A 4OE7A 2PURA 3UWYA 4WJEA 4CCDA 3M5ZA 1RQEA 4KFOA 4ADUA 3S1WA 3W7NA 1TJPA 2R14A 1W5QA 3G1VA 3TAKA 3P8JA 3RNDA 4PEKA 4KWVA 1SZEA 1JQVA 4YWIA 4HIBA 4NJJA 4JY8A 5LNVA 1M7PA 1SFLA 3C52A 3FYOA 1K8YA 3QRHA 4G1KA 3W83A 5DELA 3PY2A 4E0CA 1WDWA 4EF9A 1FWTA 1MEHA 4IMEA 3BGGA 4IMGA 5AYZA 1ZFJA 2A5HA 3IRDA 3G1AA 3TSDA 1Q6QA 1PCKA 1QO5A 3F1QA 2RDUA 3W7LA 1S3HA 3KVJA 5EYWA 4JTTA 4K7VA 1K7FA 4IXHA 3OHIA 1FCQA 2V8ZA 3W1TA 1YDVA 5F2MA 1GVSA 1A5CA 5HQEA 5MHBA 3CTLA 3LRKA 4LRTA 4FXRA 4NNCA 5DCDA 4A29A 5DBTA 1LOQA 1PV8A 3CIWA 4U4MA 4PL2A 4Z08A 3M44A 4O13A 5E1QA 2FPYA 1VH7A 3USBA 2HMCA 2O7QA 5TIMA 2F7FA 1TV7A 5AC8A 1AW2A 2WNZA 1FDJA 2ZA2A 3GXNA 3U2OA 4P61A 4K36A 3T4CA 1H62A 3MHFA 3IIPA 3CIXA 3S5ZA 4AAJA 5D2WA 3UY7A 1QOPA 1H1YA 4RXGA 2VENA 3W7QA 4QSHA 4Z1DA 3MP5A 2X30A 3VNDA 1H51A 2FB2A 3NZRA 4LY8A 2WOQA 4K8HA 3NQ8A 3LGEA 5EPDA 1VJIA 3WJXA 4KWWA 2VXNA 2A7PA 5AHIA 3TKFA 4OV9A 3GYEA 3TC7A 3GDTA 2PRMA 1LBMA 1W3IA 3CEPA 5C54A 2EPHA 2Z1BA 4QJ1A 2Q3RA 1J2WA 3L5AA 5K2ZA 1SW3A 3MI2A 4JX4A 3NYZA 4Z0JA 1TPVA 4Y8FA 1H7XA 3U6WA 4UNLA 4ZMGA 4N4QA 1P0KA 3W9ZA 1VC4A 2CLKA 2OJPA 3W71A 2YW3A 3LCXA 1O94A 4UTWC 4UTMA 3TMLA 3MI6A 2I14A 3IVSA 3QEZA 5KZMA 2EAWA 4UTWA 1G4PA 4LS2A 2NWRA 1LOLA 3LM7A 2A4AA 2PC4A 1TIMA 3C4UA 1EEPA 1ML1A 3N34A 1GJPA 4A22A 3KAOA 3LCHA 1HG3A 3M43A 3PS7A 3DENA 4XKYB 1EA0A 1GEQA 4UFHA 5EA9A 4GUIA 3M5YA 1WOAA 4DELA 2Z6IA 2YZRA 3BO9A 4X9SA 1O5XA 2W6RA 1KV5A 1WBJA 4TIMA 1JRBA 1RPXA 3D0CA 3O16A 1F2JA 2QUUA 4UFMA 1N8FA 3OG3A 3NQDA 3B05A 3W2LA 1OF8A 3BVJA 1LZOA 3R2GA 1BKSA 5AHEA 5E93A 2WO5A 2ATSA 2QCNA 1OX4A 3OVPA 3LHUA 4RLIA 4DO6A 3BPWA 4MUZA 5TBOA 5CZ0A 5D2TA 6TIMA 5I3JA 1H7OA 2EHHA 2Y85A 4O8RA 3TFCA 2GUUA 5FEXA 3IGSA 1FDZA 3I7RA 1LROA 3LCFA 1N7KA 2DZSA 3NPVA 1IXOA 5FI8A 3E02A 4JN6A 4UTKA 5E0KA 2NWSA 1H1ZA 4DBEA 2RFGA 3DHDA 3GVGA 3IV3A 5C55A 3ZFHA 1XL9A 1OFPA 2VEPA 4Y9AA 4MVAA 4CNPA 1FCUA 3ABOA 2AAMA 3UPBA 2X1TA 1WOBA 4RV8A 2CLFA 4XUGA 2JGYA 3ZWTA 2C13A 2D73A 3EWUA 5F4XA 4AXKA 1VS1A 2Q8ZA 1A53A 3M9YA 4P2VA 2RDWA 3GZ3A 5F2GA 3A21A 4BFAA 3TA6A 3N2XA 3HMJG 4AH7A 1EB3A 1I8JA 1L6YA 3TQVA 2CLLA 2CW6A 3VE9A 3SW6A 3E49A 3LHWA 1Q6LA 1NF7A 1WBHA 4MY8A 1TRDA 5DXXA 4M6PA 5K4ZA 4PODA 2ZA1A 3NPUA 3DI0A 4AWSA 3NL3A 4ONVA 3STGA 2FFCA 4BR1A 4KFNA 2A7NA 3W1AA 1F73A 1ADOA 1KBJA 3TJXA 5G2IA 4O54A 6ALDA 2QCDA 1GPWA 4NQ1A 5I3GA 3B0PA 1ZAJA 4EF8A 4HNTA 4TU1A 1VLWA 4NXSA 4CQ9A 3RLUA 4WXZA 3GDLA 1L2UA 4JYFA 5HINA 5K9XA 5HUPA 2RDTA 3BG9A 4XTIA 1OHLA 2E09A 1AMKA 2E77A 4FX6M 1K02A 1U5JA 1U83A 3PBVA 4TMBA 4B5NA 1TPEA 1T8XA 3T78A 1SQ7A 5CPLA 4X3ZA 1C9DA 1FWSA 2NX9A 1S5WA 3I7QA 1DL3A 1FX6A 3UQNA 1CW2A 4JTHA 1P4CA 2J6XA 3E0IA 3G22A 2EGZA 4GRSA 3G0UA 4LVAA 4YCOA 2J9XA 4IPIA 3R12A 4M19A 3NQMA 4NT0A 3VI2A 3PB2A 3EWXA 3S1VA 2ZZ6A 2GPTA 2O7SA 2FIQA 1GQNA 2QJGA 1L6WA 1EX5A 4O57A 1PHWA 4C1LA 1TTQA 3HJZA 4QNEA 5DY3A 3CLMA 3LCWA 1FCBA 3DU0A 4BWLC 5G4EA 1TPUA 3O06A 4LUIA 4BWLA 2TMDA 3A5FA 2VKZG 3W7HA 1FDYA 3LRLA 3ANYA 2C1HA 1UBSA 1JULA 2ISSA 3GX9A 4AWUA 1XBYA 1YTKA 3L0KA 3UZ5A 1H61A 2HS6A 3W70A 3L5LA 4N2YA 4LC6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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