5FIPA

Discovery and characterization of a novel thermostable and highly halotolerant gh5 cellulase from an icelandic hot spring isolate
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
MVKKPSLAGRLKIIEIDGRKTLGDQHGNPIQLRGMSTHGLQWFPQIINNNAFSALSKDWEANVIRLAMYVGEGGYSTDPSVKEKVIEGINLAIKNDMYVIVDWHILNPGDPNAKIYSGAKEFFKEIASKYPNDLHIIYELANEPNPTESDITNDIAGWEKVKKYAEPIIKMLRDMGNENIIIVGNPEWSTRPDLAVNDPIDDKNVMYSAHFYTGSASVWENGNKGHIARNIEKALENGLTVFVTEWGTSEASGDGGPYLNEADEWLEFLNSNNISWVNWSLANKNEASAAFLPTTSLDPGNGKVWAVNQLSLSGEYVRARIKGIPYKPISR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery and Characterization of a Thermostable and Highly Halotolerant Gh5 Cellulase from an Icelandic Hot Spring Isolate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GH5 CELLULASE
molecule tags Hydrolase
total genus 123
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fipA00
2CCRA 1CXIA 1GORA 2A3HA 4XUYA 1GONA 3UCQA 4CCEA 3VD5A 4AZCB 5FKYA 5D8WA 3GNOA 5CZKA 1M53A 5EMYA 1PZ2A 2DSZA 3G6MA 3VINA 4GINA 3PZIA 4H7VA 3POHA 1TA3B 3VVGA 2VZUA 4UFMA 1B2YA 2ZXQA 4JZ5A 4WKHA 3ZSTA 1B3ZA 1JFXA 1V3KA 3KEHA 2XJ7A 5GNZA 3GXDA 4BA0A 1TZ7A 2YL8A 3UR8A 3GNRA 4BQ2A 1CWYA 1KXVA 5IDIA 3N9KA 1UR2A 2X09A 1UQYA 2Y5EA 3WY1A 3WD0A 1KQZA 1E1FA 3FAWA 3KE0A 2A3BA 3WUFA 3DC0A 4NRRA 1J0ZA 1MW3A 4NSBA 3WBEA 5EBAA 4CVWA 1V6XA 3NDZA 2EBNA 4GPNA 3WIJA 2V3DA 3FHQA 3SCQA 1OGGA 1BG9A 3GDBA 4P8VA 3T0AA 1UA3A 1JDCA 4DUXA 4R27A 1D3CA 1CXLA 1V02E 1B3XA 3VUPA 3SUTA 3N18A 5M17A 5D9OA 3HJEA 4E2OA 1H1NA 3OG2A 1GCYA 4AD2A 3ARWA 1BYAA 5C8BB 3N13A 1ISYA 4WIWA 3NSNA 4TTGA 4M82A 1DWHM 2VZTA 1V3MA 1NWTA 1O6IA 3VIPA 3VO0A 4ZXOA 1JZ7A 3OZPA 4TOQA 1JIBA 2Y24A 2XUCA 3FHAA 2GDUA 1VBRA 5CQ1A 2D22A 2VZOA 4W8BA 3A4XA 3ARYA 5D9PA 2YBTA 2VRKA 2A3CA 5CPQA 1MW0A 1ZL1A 4IUGA 4BS0A 4JL1A 1JZ3A 2VT0A 1CDGA 3WQ6A 3VOCA 2WBKA 4UR9A 5D9NA 2VCCA 1H3GA 1OGSA 2DSUA 1TCMA 1JF5A 3VMPA 4DUVA 3FXYA 1JYWA 3FN9A 1H5VA 3CHEA 1JAEA 1XH0A 1CGVA 2VOTA 4JHOA 1H09A 4U5IA 2Z1KA 3ZM8A 1E4LA 1W2VA 2WSKA 2ZX6A 3AXXA 2WLYA 3CH9A 1S46A 2EPOA 1VB9A 4KH2A 4AIOA 5C71A 2VX6A 3I3BA 2VRJA 1D7FA 1UH2A 4JFVA 1QBBA 3L2MA 5DO8A 3F4VA 1KFWA 5AC5A 5D4YA 4TXEA 4P7OA 1GZJA 5A8PA 3W53A 4W7WA 1UD5A 1LWHA 2WHMA 3RDKA 1SFSA 2Q8XA 3UG3A 2Z1SA 3VMOA 4W7VA 3BCDA 3N1AA 3SCNA 1O7AA 4WSJA 2YDQA 5CGTA 2DDXA 4CGTA 4DWSC 4U3AA 1MW2A 3W82A 1XV8A 1ZBKA 5I23A 3GH5A 1UR1A 3BAXA 4DM2A 4YN5A 1OT2A 1L0PA 2WB5A 4CU7A 4AISA 1EHAA 1HL9A 3GNPA 3UG4A 3CMJA 4IM4A 2J79A 2UWFA 1QHOA 5A8OA 2VZVA 1CXFA 4MB1A 3A4WA 1ITXA 5GNXA 3M07A 1K6AA 3DECA 5I77A 1W9VA 1I1WA 1JF6A 2WWCA 4U2ZA 3NCOA 3AOFA 1E15A 4JKKA 3D5HA 2ZWYA 1K9DA 1PIGA 4W5UA 2CIPA 4Z2LA 1WB0A 4LX4A 4ACZB 3ARUA 7CGTA 3CZKA 4UFLA 3K4DA 4OZOA 1ITCA 2ZUUA 1MWOA 3BXWA 4QLJA 2X2YA 4GZIA 3K46A 1JYNA 3KL3A 3T2OA 3IJ8A 3WKZA 1ZB5A 4RE3A 1UD4A 1VAHA 3J7HA 3PHAA 3WFZA 3ZOAA 1XSIA 3VGDA 1E40A 3VGEA 1XSKA 4UOJA 3N15A 1JYVA 2XFYA 4IISA 1A47A 1ZJAA 2QV4A 4LQ1A 2XVNA 4AD1A 4W85A 2D0FA 4D6HA 4PMOA 3OGRA 3VM7A 1WP6A 3K4AA 4TUFA 2BY2A 1J12A 2CERA 4AMCA 1GOOA 2DT3A 4Z2GA 5FL1A 2G3NA 3VDHA 1NH6A 5JBDA 1W1TA 1JGIA 1JNDA 1MFVA 2G3IA 3W0KA 1GVIA 2E8YA 4UQAA 3POCA 1E6PA 1M01A 1EDGA 5CG0A 2F8QA 1EA9C 3TTSA 3WL1A 3E1F1 3GH7A 3VGFA 3W37A 5I78A 2D2OA 1HP4A 5TD4A 2OWWA 1EO7A 4DM1A 6TAAA 5A6JA 3IAQA 1OB0A 3CUIA 3UETA 1JL8A 3T08A 1UOKA 1CLXA 2CBIA 4H8UA 3WUBA 4CCCA 3WNPA 2A3AA 4XB3A 4J3XA 2CEQA 2XSBA 1PX3A 2E40A 1D2KA 2D3LA 1ZS2A 2J4GA 5ABGA 3WUEA 4MNLA 4BQ4A 3ARQA 2W4XA 3PTQA 2GJXA 2OSWA 2J8GA 4HZ8A 5JBEA 4P7NA 5ABEA 5FD0A 1C93A 4AD5A 3VNZA 4TX6A 2VNCA 2WMIB 3K8KA 3VD4A 1KGUA 2EQDA 5GQBA 3CZGA 1OD0A 2E9LA 4D6DA 4CU8A 3GXMA 3W26A 4XZBA 1OCQA 4B15A 3AZTA 2V5DA 5A8QA 3AMLA 1NWUA 1CLVA 1GQIA 1ZBCA 3DYMA 4HU8A 2WAGA 3UR7A 2UY3A 4OBSA 5I2UA 1KR0A 3VGHA 1DWIM 4ZENA 3CZLA 1ZJBA 3CUJA 3GTNA 3BAWA 3WUGA 3AMKA 3B9EA 1GOIA 1GJUA 1OWQA 2GK1B 1BVNP 4PMZA 2V3FA 1RP9A 2V38A 1G1YA 3WH9A 1UHVA 2QF8A 1WDPA 2X0HA 2CITA 1JNEA 1UR9A 3AQUA 5FIPA 1BVZA 1UR8A 1E72M 3CPUA 1JG9A 2JEPA 1RP8A 4Z2IA 2J78A 3MMWA 1C8QA 3B9DA 5GNYA 3WN6A 5BRQA 3GBEA 1FHDA 4QLKA 4L4PA 3GH4A 1MFUA 3EYPA 1IZKA 2AAAA 5DT5A 2CXGA 1OGBA 2PWDA 3O9NA 5E9AA 3B9AA 1B3YA 5LYRA 2FHCA 1LL7A 4D1JA 3VGGA 3K8MA 3HU7A 3TONA 2GDVA 5DT7A 2E9MA 2Y8VA 2D1ZA 2XFRA 1R7OA 5A69A 5ABFA 2CETA 4EE9A 3T0BA 4ZE4A 5BXPA 5BWFA 2D0HA 3MSDA 3KL0A 3WMCA 1HP5A 1W3JA 2C0HA 3DYOA 4D72A 3AIBA 2X1IA 3OLEA 3RM8A 3EDKA 2WBGA 4D6EA 3L4UA 4AW7A 1TMQA 3ZJKA 1E4NA 2XVGA 1G9HA 1EIBA 2PB1A 4D6IA 5IHRA 2VJXA 2WVUA 2ZIDA 4GQQA 4GQRA 4U33A 3AMCA 3DYPA 4P7QA 2W66A 2W92A 4MB3A 1J0YA 2CHOA 3AIUA 4NZCA 1GOMA 1AMYA 1V6YA 2WMHA 2J25A 1ISVA 3SCUA 2WVTA 3ECQA 2G41A 4MJ4A 3WNKA 1FH9A 2XVKA 2WNWA 4B9YA 2BVDA 3II1A 4HA4A 1XYZA 2OLHA 1SMAA 1V3HA 5HDRA 1J9YA 1JZ2A 3CZEA 1E9LA 4F9DA 4H2CA 5A2CA 3VNYA 4JHZA 1W3KA 3RCNA 4FLOA 4AEEA 1WKYA 3CHDA 4PMVA 3WNMA 1WCGA 1CENA 1E4MM 1VRXA 1CPUA 1FOBA 4UFIA 2WC7A 2JF7A 3WNNA 2IXUA 5CSUA 3PZTA 4XZWA 1B31A 1XH2A 1XD0A 1E6SM 1OIFA 2OSYA 3SCWA 5E6YA 1RPKA 2VL4A 3VM5A 1KBBA 2YLAA 4E8CA 2J62A 3AJ7A 1E3ZA 2ZOXA 1WZLA 3WD1A 4HPGA 4JFUA 1P6WA 4AY1A 2JIEA 4MPKA 3CTTA 2G3JA 1R85A 1ODZA 1VF8A 4KGLA 3AICA 1HJXA 3OGVA 3AS2A 1HKIA 1NOWA 3WQWA 4JCMA 1JZ5A 1GOKA 1Q6DA 2VC9A 3A4AA 2WHKA 1UKOA 4HOZA 2XGBA 2FH8A 3VD7A 2G4FA 2O9OA 3AIWA 7TAAA 1E56A 4PMDA 3IANA 1H41A 2WVSA 3W24A 4GO9A 4V28A 5DF0A 4AD0A 1UZ4A 5EB8A 4Q7NA 5DFAA 3QHMA 1FFRA 2BY3A 3WH7A 3CO4A 3WEMA 4FLQA 4HA3A 4RE2A 3WDQA 1DP0A 5BYWA 3RPMA 2VTFA 1UWSA 2UY4A 4LYRA 2OYKA 4TVDA 1GQKA 4AYSA 2IXVA 4F9JA 4CD4A 3KL5A 2CESA 3MU7A 2W91A 2J7CA 3ARRA 2XIIA 2O92A 1E5JA 4ZFMA 3F5LA 3NJ3A 4BCEA 5IFPA 3W25A 2V5CA 4M29A 4XV0A 3WDRA 3WF4A 1KBKA 1W32A 2YL9A 3AHZA 3AIEA 3WDJA 1UKTA 1OINA 3I3DA 3PZUA 3SCSA 4H8VA 1QI3A 1E73M 5FOOA 2DSWA 4D6CA 1W2PA 5E0CA 4Q22A 5E70A 2C7FA 1UWIA 4KRUA 1MXGA 2WCAA 1BHGA 2QMKA 1DWFM 2FDMA 3L2LA 1I1XA 4MADA 2WYSA 5M5DA 1I75A 4PMUA 4HP5A 1UWQA 1TA3A 5IHSA 4D6GA 3SUWA 5LA2A 2DSVA 5BXRA 3TOPA 1J01A 3BAJA 1M04A 4PSPA 4GKLA 3BCFA 2ZUTA 4X0NA 3CZJA 4BQ5A 4KGJA 5A3HA 2XPKA 3AYSA 4HPHA 2VRQA 1TG7A 1NOUA 3GYCA 1MQRA 5BXTA 1LJYA 1XRVA 4GXPA 2ZXDA 4CCDA 3MSGA 3K8LA 1EO5A 4EAMA 1L8NA 1HIZA 1UKSA 4JIEA 3VIJA 1ECEA 1JI1A 2FGZA 5JUVA 2X8RA 1JD9A 1VFFA 1FP9A 3WMSA 4L4OA 3ARZA 1QI5A 3ZO9A 4GI8A 3BMWA 4ATDA 1W9DM 3CHCA 1BYDA 1IV8A 3W6LA 4WF7A 1GHSA 1KB3A 1US2A 3PZGA 2VO5A 5GPRA 1G0CA 5JIWA 2FH6A 4TX8A 4RE4A 2C8NA 1M03A 3QHOA 3DHUA 2VCBA 1BF2A 1HJVA 5A8MA 6A3HA 4P8WA 1TVNA 1UUQA 1XSJA 1RH9A 5DEZA 2WZIA 1GOWA 1FHLA 2YIHA 3OBAA 4F79A 2W5FA 4HMCA 2QPSA 3VDBA 4J28A 1KQYA 4MTVA 3O6AA 3PZMA 3MUZ1 2DT1A 1CZ1A 1UQZA 2OWXA 4PMRA 2XM2A 3VIOA 1PAMA 4D6JA 2EEXA 4ZE5A 3CLWA 2PBGA 2RGMA 5A6MA 4DUWA 4KMQA 1VBUA 1J18A 4MJ2A 3AHTA 1E3XA 3WF1A 3D3AA 3EDEA 4GZEA 1CYGA 4JFWA 5F7UA 1QOXA 1A3HA 3T09A 3VDAA 3UERA 3BSGA 1AQ0A 3S2CA 1V03A 3U5YA 2MANA 4W8AA 1VIWA 2DGAA 1MXDA 2PWFA 9CGTA 2ZX7A 3OIHA 4MNJA 5CXPA 1WNOA 2JE8A 4JFSA 1CECA 3HMCA 1W91A 5CGMA 3MUIA 2BVYA 4CN6A 3W28A 4OOUA 1QW9A 1U33A 1E4IA 2F2HA 1W1YA 2E0PA 3MMDA 4DWSB 5E09A 3VIMA 4LXFA 4CUCA 2VURA 3ARTA 2WSPA 3APGA 2O9TA 4HMDA 3VIIA 1DWGM 1SR0A 2E3ZA 4LYPA 1W9PA 4M8UA 3WQ8A 5HNNA 3WF3A 1UKPA 1Q6EA 1VEOA 1B0IA 4B3KA 3AIQA 1OT1A 1UR0A 5A2AA 4LPCA 3WBAA 3BAIA 4W89A 1UZ1A 2WMKA 2F61A 4MNKA 2GFTA 5A95A 2ESCA 4J3SA 1U2YA 1VFUA 2DH2A 2XHYA 2XFFA 2J77A 2VMFA 2JF6A 1SMDA 2DT0A 1C91A 1UD2A 3VILA 3CIVA 4B16A 3WQ4A 4UFJA 1DHKA 3W4RA 1E6QM 5CJ5A 2B31A 1V3LA 3SUSA 3CUGA 3G6LA 1QBAA 1OM0A 4CD5A 2YJQA 3BLKA 2J7EA 1QI4A 2WC3A 1EDTA 3WH5A 4UTFA 4ACZA 1Q6CA 3ALGA 5D8ZA 3ZR6A 4P8UA 1WZKA 2ZUVA 3WNOA 4AZ6A 2W67A 2X0YA 4FMVA 4NI3A 1G5AA 5HPOA 3ZJ6A 1GVYA 4CVUA 3ZMRA 4N0RA 3PTKA 2WK2A 3QOKA 1DWJM 2XVPA 1WO2A 4ATLA 3T2QA 2FHFA 1UWRA 2WXDM 4AD3A 4C7DA 1E0VA 2QHAA 3WFLA 2BHZA 3NUKA 2VQUA 1CXKA 1H11A 3VIFA 4OKDA 3MV11 4YPJA 1GJWA 3O2LA 1PJ9A 5I6SA 2ZX8A 1B90A 3VKKA 3SIMA 1Y7VA 5ABFB 5A6KA 3QHNA 2Y2WA 3WD4A 3EDFA 3K1DA 1ISZA 3VD3A 1MW1A 1EOKA 3BSHA 3HN3A 4PTWA 2VX4A 2NW0A 1NWSA 1CIUA 2VVSA 4S3KA 3AHVA 5JIPA 3OLDA 4PBGA 2BFGA 2WVVB 4NF7A 3RIKA 5KEZA 1QHPA 2BY1A 3AROA 4B3LA 2IUZA 4ZEPA 5HBFA 3WQVA 1BGAA 2D24A 1TFVA 3VX1A 2YL6A 1ODUA 3CBWA 3W27A 2PWHA 2XIBA 4PMQA 1AVAA 3AS1A 3NSXA 4CD7A 2WCGA 2DH3A 1J0JA 4D6FA 6CGTA 4GZJA 2J7DA 1C7SA 3M46A 1TR1A 2OWCA 1QNOA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2CCR A;  1CXI A;  1GOR A;  2A3H A;  4XUY A;  1GON A;  3UCQ A;  4CCE A;  3VD5 A;  4AZC B;  5FKY A;  5D8W A;  3GNO A;  5CZK A;  1M53 A;  5EMY A;  1PZ2 A;  2DSZ A;  3G6M A;  3VIN A;  4GIN A;  3PZI A;  4H7V A;  3POH A;  1TA3 B;  3VVG A;  2VZU A;  4UFM A;  1B2Y A;  2ZXQ A;  4JZ5 A;  4WKH A;  3ZST A;  1B3Z A;  1JFX A;  1V3K A;  3KEH A;  2XJ7 A;  5GNZ A;  3GXD A;  4BA0 A;  1TZ7 A;  2YL8 A;  3UR8 A;  3GNR A;  4BQ2 A;  1CWY A;  1KXV A;  5IDI A;  3N9K A;  1UR2 A;  2X09 A;  1UQY A;  2Y5E A;  3WY1 A;  3WD0 A;  1KQZ A;  1E1F A;  3FAW A;  3KE0 A;  2A3B A;  3WUF A;  3DC0 A;  4NRR A;  1J0Z A;  1MW3 A;  4NSB A;  3WBE A;  5EBA A;  4CVW A;  1V6X A;  3NDZ A;  2EBN A;  4GPN A;  3WIJ A;  2V3D A;  3FHQ A;  3SCQ A;  1OGG A;  1BG9 A;  3GDB A;  4P8V A;  3T0A A;  1UA3 A;  1JDC A;  4DUX A;  4R27 A;  1D3C A;  1CXL A;  1V02 E;  1B3X A;  3VUP A;  3SUT A;  3N18 A;  5M17 A;  5D9O A;  3HJE A;  4E2O A;  1H1N A;  3OG2 A;  1GCY A;  4AD2 A;  3ARW A;  1BYA A;  5C8B B;  3N13 A;  1ISY A;  4WIW A;  3NSN A;  4TTG A;  4M82 A;  1DWH M; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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