5FIPA

Discovery and characterization of a novel thermostable and highly halotolerant gh5 cellulase from an icelandic hot spring isolate
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
MVKKPSLAGRLKIIEIDGRKTLGDQHGNPIQLRGMSTHGLQWFPQIINNNAFSALSKDWEANVIRLAMYVGEGGYSTDPSVKEKVIEGINLAIKNDMYVIVDWHILNPGDPNAKIYSGAKEFFKEIASKYPNDLHIIYELANEPNPTESDITNDIAGWEKVKKYAEPIIKMLRDMGNENIIIVGNPEWSTRPDLAVNDPIDDKNVMYSAHFYTGSASVWENGNKGHIARNIEKALENGLTVFVTEWGTSEASGDGGPYLNEADEWLEFLNSNNISWVNWSLANKNEASAAFLPTTSLDPGNGKVWAVNQLSLSGEYVRARIKGIPYKPISR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery and Characterization of a Thermostable and Highly Halotolerant Gh5 Cellulase from an Icelandic Hot Spring Isolate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GH5 CELLULASE
molecule tags Hydrolase
total genus 123
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fipA00
4OIFA 1Q4NX 4NRSA 3RM8A 1ZB5A 5GNXA 1VF8A 4BZYA 1TA3A 2W92A 2BXYA 4EE9A 3CUGA 2YDQA 3ZR6A 4H04A 3TA9A 2YL5A 4CKQA 1FH8A 1CNVA 1BYDA 2JFEX 2WMGA 1OBAA 2XM1A 4W8BA 4WF7A 3AQUA 4PMXA 2VR5A 1NH6A 5GQBA 1K6AA 2YA1A 2BVDA 1C93A 2GFTA 3RJYA 4HA3A 3SUVA 2WMFA 3WDIA 1F4HA 4PBGA 1E6ZA 1BAGA 2D0HA 3WNPA 1OD8A 1CXLA 2ZUWA 4GQQA 1EOKA 1BQCA 2X09A 1MW1A 4PMQA 5ABHA 2PI6A 2V3DA 3ARYA 2VCBA 3GH5A 4AZCA 1QBBA 2WLZA 1EGZA 1QHOA 3VD7A 1E43A 2J77A 1UD6A 3SCUA 4AEFA 4W87A 2JEPA 4MNKA 2OSWA 3WBAA 3W53A 1HJSA 1PX8A 4AW7A 4Z2LA 2D20A 1ZU8A 3GM8A 5I77A 1PEZA 1FHDA 2WM0A 1KFWA 3ECQA 3ARTA 4CCCA 4C7GA 4DUVA 2XUCA 1E6PA 4LPCA 3U57A 4V27A 5CPTA 3ALGA 4DWSD 5E70A 3ZIZA 2X0HA 3OLGA 4H8UA 4WSJA 1IT0A 1CDGA 3HN3A 1W9PA 2WWDA 1GQKA 3WELA 2DGAA 2CHOA 1WDQA 2AAAA 1JG9A 3VD3A 4LYQA 4D6CA 5ABFA 4FLRA 1JDAA 2AMGA 1H0IA 4GXPA 1W3JA 1JDCA 1CXFA 1QHPA 1FA2A 3GH7A 5I2UA 9CGTA 3SURA 1L8NA 1E0WA 2VTFA 5CQ1A 5CG0A 3OLDA 3K8LA 2WYSA 1QW8A 1ITCA 2V3FA 1J18A 1KCLA 2WHLA 3GTNA 4PMZA 1GW1A 5E6ZA 1Q6GA 3WQWA 1UQYA 2G3JA 1LJYA 3OB8A 1Q6EA 2W4XA 1CENA 1VBUA 3W82A 2O9TA 1XH2A 1V08A 8A3HA 1GQIA 4MB4A 3CO4A 3I3DA 3T2OA 3MO4A 1BVNP 3SCNA 1PJ9A 3MUY1 1HJQA 4AD3A 2YKKA 1X6NA 5I79A 3BAXA 1MYRA 4GZEA 3WDJA 2Z1KA 3WH7A 1KWGA 4OZOA 2YDRA 3A4WA 3SUTA 4M1RA 1EO7A 1E4IA 4JFWA 4WJXA 2Y24A 1QI3A 1J0ZA 3CGTA 3W0KA 1MQPA 3WF4A 1W9BM 1MQQA 4P8VA 2YL6A 3THDA 4MDOA 3M46A 1CPUA 4LXFA 1E6NA 2VRKA 2C8NA 2J8FA 3UG4A 3FAWA 5C70A 4M24A 3VGEA 2CBUA 4AZ6A 4HP5A 4IM4A 1XSIA 3AS1A 1XH1A 1OT2A 3PBGA 3GBDA 3WDRA 3ARRA 3SUUA 3VUPA 4ZE4A 4P7NA 3B9EA 1PBGA 1J12A 4NRRA 5FL0A 6A3HA 4M56A 5DO8A 4MTVA 4GZJA 2OWCA 1UH4A 4BQ2A 2XHYA 5I78A 2J25A 2WVTA 4AIOA 2FHFA 2PWGA 4CU6A 5AYIA 3VDAA 2ZOXA 2PWEA 1B0IA 4H8VA 3UEQA 5LA1A 4ZFMA 3BCDA 1B3WA 4HMDA 2QLYA 1J9YA 1OINA 4MNMA 2QF8A 3DYOA 4B9YA 2OSXA 2WZHA 4MJ4A 3K46A 1EXPA 1SMAA 2XWEA 3UR7A 2A3AA 1TFVA 4CCDA 4CU7A 2YA0A 3AHVA 2NW0A 3VGDA 4XX6A 2VX7A 4CD8A 1D2KA 2DSVA 3MS8A 3AMKA 1DWHM 3WNLA 3AFBA 4PRWA 2YOCA 2OYMA 5DT5A 2XG9A 3UCQA 3UG3A 2VR4A 7TAAA 4J3TA 5E0CA 3SCRA 5M03A 3PZ9A 3A4AA 1XV8A 1O6IA 1FHLA 3HU7A 5GPRA 5CJ5A 3RO8A 5AY7A 3S6TA 1JFXA 1BGAA 1PX3A 3VIPA 3CPUA 3W26A 1DTUA 1NWTA 4B16A 1VB9A 1KQZA 1ISZA 4U3AA 1XGZA 4CGTA 2BHUA 3L4XA 3WNOA 1MW3A 4KWUA 1JZ4A 2WMKA 1G94A 4ZEPA 5A6KA 1HKKA 3WF1A 3W38A 1V6VA 3I3EA 4JAWA 1B3VA 2CESA 4CN4A 3VU2A 2YL9A 4JFSA 2FDMA 1TMQA 2G3MA 4PSRA 1QPKA 2O9RA 2BVYA 4NF7A 1MW2A 3VOCA 3O9NA 3N1AA 2OWWA 1CGTA 3AXHA 3ZJ8A 1VIWA 5HNNA 1K9FA 2WVUA 1BG4A 2WZEA 2ZWYA 3WFLA 1GQJA 6CGTA 1PZ2A 3WF3A 4TTGA 4U3CA 3T0AA 3ZT6A 3RCNA 3DHUA 5A8QA 1HL8A 4JKKA 4M81A 4MADA 4YN5A 1JZ5A 4PMYA 4NZCA 2VX5A 3VGFA 1B3XA 2BVTA 1Z32X 2FH8A 3I3BA 2VC9A 5BXTA 1W3KA 5HDRA 1H4PA 2WMIB 1RP8A 1ZBWA 2EBNA 4PMVA 2OYKA 3OGRA 4TVCA 2V3EA 2GJXA 1EDGA 1JAEA 5I23A 1CXIA 3NUKA 3WQ8A 3CIVA 5M3WA 1VEMA 4LGXA 3WN6A 1PX4A 1GHSA 5BXSA 1GVYA 1QVBA 4J7RA 3GNRA 3IJ7A 4WKHA 3BCFA 3OZPA 4H2CA 2VZSA 2GUYA 3HMCA 2DEPA 3CZJA 4TX6A 4AYSA 4CVUA 3BMWA 4Y7EA 1HP4A 3SCOA 2VCCA 3AS2A 4GI9A 3M7SA 3WMCA 3WDHA 3LPOA 4P7RA 4YPJA 3W24A 1UWRA 1P6WA 2GSJA 5A95A 1R8LA 2CBIA 1UD2A 2WZIA 3AMGA 1BTCA 2VO5A 3AYRA 5FKYA 3D3AA 1UH3A 2CXGA 2J74A 1DWAM 4PMDA 4FF5A 2UY5A 3TOPA 4F8XA 1CEOA 2XIIA 3QHOA 4UOQA 1LQ0A 1AQ0A 1H0GA 5A6BA 2W61A 2GJPA 2ZX7A 4L4PA 4PCSA 3TTQA 1AMYA 1JYWA 3AICA 3PHAA 4D71A 3IJ9A 1HVXA 1MVYA 5GNYA 5E9AA 2DDXA 2ZX5A 1CLVA 1HT6A 1W3HA 1VRXA 2ZXQA 2QMJA 5D9NA 2PB1A 1ITXA 1U2YA 3CHFA 2QHAA 4GO8A 1H41A 3DYPA 4PTMA 4P7LA 4HA1A 2BFGA 2VZVA 5I5RA 1D7FA 3NIYA 4J27A 2WKLA 4H7VA 3POHA 2G41A 1NP0A 4WSKA 4W7WA 5IFTA 5AC5A 3GXMA 2A3CA 1GOKA 1V0MA 2WMJA 2JIWA 1H3GA 5DT7A 1UR9A 3FW6A 2GDVA 4F9JA 5F7UA 4C7DA 1VEOA 4UQBA 4PYSA 3WH6A 1CTNA 3OBAA 3W25A 1KCKA 5A69A 1ODUA 5A2AA 4MNLA 2QPUA 2WPGA 3GH4A 4P7OA 2EPOA 2WCAA 5A6AA 1DP0A 3IANA 3VIGA 3KL3A 4NI3A 4P8UA 1UR1A 3WENA 4PUDA 2GK1B 1KGUA 5GNZA 3EDDA 4QDMA 4ATWA 2E3ZA 2J7CA 4YHGA 3UR8A 1X1NA 3WQ5A 3NCOA 1ISVA 7CGTA 1G1YA 4ACZB 4AD1A 5JIWA 2VZOA 1WZMA 1JIBA 1AQMA 4W7UA 4XUYA 5A8OA 1XSJA 4E2OA 3K8KA 3PN8A 4OUEA 2WWCA 3FNDA 4J3XA 1V3HA 4RL3A 4EKJA 4AMCA 2W5FA 1UKQA 1HXJA 1JAKA 3PTKA 1HKMA 2WB5A 1QI2A 3CHDA 4UR9A 3K1DA 4IPLA 2VL4A 4JHZA 1TE1A 5D9OA 4MPKA 1MW0A 1W9DM 4GINA 4X9YA 3EDFA 2WAGA 4S3JA 1JI1A 4Z2KA 4DWSB 2XJ7A 1E4LA 3BAIA 3ARUA 4RE2A 1JXKA 2J47A 1PZ3A 1Y7VA 2Y2WA 5M5DA 3CBWA 5EMYA 2XFFA 1GONA 2G3IA 4JL1A 4BQ5A 1E6QM 3W6MA 5CLTA 2WSKA 4UTFA 1GPFA 1W9VA 3E1F1 4TOQA 1EIBA 5I0DA 4YHEA 1E5NA 1J10A 4OBRA 3M07A 4JCMA 4CD4A 4HZ8A 5A6BD 1ISWA 1ECEA 2WVVB 1UR0A 2B31A 4U33A 1UD5A 2VZUA 3WNMA 2VURA 3OG2A 3L4VA 4BS0A 4WKAA 3AZSA 5BROA 4AD4A 2ZUVA 1R86A 5BXPA 2EPMX 1CGXA 1GORA 5EBAA 1D3CA 5CGTA 1VFFA 3AIUA 4AZ7A 3MV11 3DYMA 1B1YA 2D23A 3ZT7A 1C8YA 2WCGA 1W2VA 1J0JA 1S46A 4UOZA 3VIHA 5KEZA 2J8GA 2NT0A 4QFUA 3ZJ6A 1ESWA 1DWIM 3VM5A 1TA3B 4AZ5A 3WD2A 5I3DA 3B9AA 2GJRA 3RMEA 3W29A 2J7BA 1QHZA 4UFMA 3AZRA 3MMDA 2DT1A 2WXDM 4BF7A 3RIKA 5C71A 1CGWA 4AEEA 4PN2A 1QBAA 5EFFA 3GZAA 3WD3A 3PZUA 5D9MA 1DWFM 1I75A 1LWJA 3N12A 3VILA 2CNCA 1K9EA 3K8MA 2ZXBA 4JZ5A 1JI2A 4Z2JA 3VMOA 1YHTA 3QR3A 2DT2A 2XM2A 3O6AA 3RILA 1UHVA 2EPKX 3ZMRA 4UCFA 3CH9A 3ZQ9A 1UUQA 3CZ8A 2ZE0A 3VIMA 2ZX6A 3L2LA 4AZGA 2XWDA 3BSGA 4AZCB 4KRUA 1WE5A 1C3FA 1HVQA 1KXVA 2WLYA 1LLOA 4OJYA 3WY1A 3QOKA 2D1ZA 3KZSA 2ZWZA 3U7BA 2WK2A 4F79A 1CBGA 1E15A 4ZXOA 3ARWA 4Q22A 3AIRA 1VENA 5TD4A 4ACYA 4HU0A 3BAJA 3T08A 5ABGA 5C8BB 5A1AA 2EQDA 3PZNA 4EAMA 1H5VA 4LQ1A 4JFUA 1UA7A 1HL9A 1KB3A 2D3NA 4W84A 2XVNA 4GI8A 1V6YA 4LYRA 3OLIA 3FAXA 1XC6A 2WBGA 1AVAA 2CBJA 4KRTA 3VX1A 4D6EA 3VKKA 4JL2A 1UR8A 3KEHA 4QLJA 4J3VA 2FHBA 3VM7A 2W62A 5A94A 3AHZA 3MSGA 3AOFA 1XD0A 3DC0A 2XVGA 4GQRA 3UG5A 3NJ3A 1JZ3A 5ABFB 2EXOA 1WDRA 4N0RA 3AYSA 2NSXA 3G6LA 3MV01 2Y5EA 2E9BA 3GXFA 2VI0A 1R7AA 2WHJA 1V0KA 4R27A 1UA3A 3WNKA 1JNEA 1HJVA 2OSYA 3NDZA 1OGGA 3VDHA 3SCPA 1QNRA 3VVGA 4B3LA 2VUYA 3WL1A 3VMNA 1FOBA 3L2MA 4B3KA 1HJXA 3VGHA 4W8LA 1A3HA 1IZJA 1WO2A 2VMFA 4MDPA 1WCGA 2ZUTA 1B30A 1BSIA 3BAKA 2O9PA 1JD9A 3TTYA 4P7QA 5FCZA 4Z2HA 2YIHA 3FN9A 3WNNA 2J7HA 1QOXA 1E3XA 3SIMA 1LL6A 3EDKA 3AXXA 3WD0A 2E9LA 1VJSA 1CIUA 2VNCA 4TUFA 3AIVA 4JIEA 3EDJA 1J0HA 4AD5A 4PMOA 1CZ1A 3U7VA 3IAPA 2G4FA 3MUAA 1CGUA 2XYLA 3WSUA 4J3SA 1CXEA 1WB0A 2OWXA 2BY1A 2DSWA 2GVYA 1ODZA 5A8MA 3CUFA 3N11A 2EJ1A 4BCEA 2E40A 1CECA 1TG7A 3CZGA 4HZ6A 4D6IA 1M01A 1Q6CA 2PBOA 4W8AA 2F8QA 3WDQA 2IXVA 1UKTA 4TVUA 4CN1A 1KXHA 1GOMA 4FLSA 1O7AA 2CKSA 3WH8A 1E72M 2D0FA 1ZJBA 1NQ6A 2CBVA 2WHKA 5KZ6A 5A8NA 4URIA 5HPCA 4K68A 1JNDA 2QV4A 2WSPA 4PTVA 3VNZA 4NSBA 3ARXA 3HJEA 2A3HA 2DH3A 1BFNA 1UD4A 1E70M 3TTOA 3WBEA 3IAQA 1PAMA 4QCEA 3ZOAA 1UR4A 1W32A 1F4AA 2D0GA 1DHKA 1LWHA 1V6UA 1J0YA 1WDPA 2BHYA 2DT3A 3BGAA 4D6HA 4AIUA 1M04A 1UWTA 5JBEA 3BC9A 3CZKA 2VT0A 1U30A 1M03A 4RE4A 4UQDA 4AZBA 3F4VA 4JKMA 3N15A 1JD7A 2VQTA 1EDQA 2UY4A 2CPUA 1K9TA 3BH4A 5CGMA 2WHMA 4MB1A 4GKLA 3AROA 1M53A 4CD5A 1OWQA 4AY1A 5DMYA 5IXEA 2XGBA 1J11A 4UQCA 1HP5A 1J0IA 2VZTA 4Z2IA 4BQ3A 1OGSA 3IK2A 2VVNA 3NSNA 3ARQA 1SR0A 5IFPA 1TCMA 5BXRA 1V0LA 4V2XA 2CIPA 4JCLA 4RE3A 1B3ZA 1WKYA 4ZE5A 4D1JA 5JBFA 5AYBA 2IUZA 4PTWA 1EHNA 2WVSA 1JYNA 2VJXA 1V02E 3WQVA 1MFVA 1XSKA 1QNOA 4MB3A 3AMDA 1C91A 1BGGA 5A8PA 3EMQA 1WP6A 3PZIA 4UQ9A 1LG2A 4IPNB 1JDDA 5EFDA 2ZUSA 3WUEA 2VX6A 2E9MA 4D1IA 3ARPA 3VIIA 4OKDA 3QHNA 3GXIA 4W88A 4UFLA 4B15A 3PZMA 1W1PA 1DEDA 1W9UA 3VIFA 3WH9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4OIF A;  1Q4N X;  4NRS A;  3RM8 A;  1ZB5 A;  5GNX A;  1VF8 A;  4BZY A;  1TA3 A;  2W92 A;  2BXY A;  4EE9 A;  3CUG A;  2YDQ A;  3ZR6 A;  4H04 A;  3TA9 A;  2YL5 A;  4CKQ A;  1FH8 A;  1CNV A;  1BYD A;  2JFE X;  2WMG A;  1OBA A;  2XM1 A;  4W8B A;  4WF7 A;  3AQU A;  4PMX A;  2VR5 A;  1NH6 A;  5GQB A;  1K6A A;  2YA1 A;  2BVD A;  1C93 A;  2GFT A;  3RJY A;  4HA3 A;  3SUV A;  2WMF A;  3WDI A;  1F4H A;  4PBG A;  1E6Z A;  1BAG A;  2D0H A;  3WNP A;  1OD8 A;  1CXL A;  2ZUW A;  4GQQ A;  1EOK A;  1BQC A;  2X09 A;  1MW1 A;  4PMQ A;  5ABH A;  2PI6 A;  2V3D A;  3ARY A;  2VCB A;  3GH5 A;  4AZC A;  1QBB A;  2WLZ A;  1EGZ A;  1QHO A;  3VD7 A;  1E43 A;  2J77 A;  1UD6 A;  3SCU A;  4AEF A;  4W87 A;  2JEP A;  4MNK A;  2OSW A;  3WBA A;  3W53 A;  1HJS A;  1PX8 A;  4AW7 A;  4Z2L A;  2D20 A;  1ZU8 A;  3GM8 A;  5I77 A;  1PEZ A;  1FHD A;  2WM0 A;  1KFW A;  3ECQ A;  3ART A;  4CCC A;  4C7G A;  4DUV A;  2XUC A;  1E6P A;  4LPC A;  3U57 A;  4V27 A;  5CPT A;  3ALG A;  4DWS D;  5E70 A;  3ZIZ A;  2X0H A;  3OLG A;  4H8U A;  4WSJ A;  1IT0 A;  1CDG A;  3HN3 A;  1W9P A;  2WWD A;  1GQK A;  3WEL A;  2DGA A;  2CHO A;  1WDQ A;  2AAA A;  1JG9 A;  3VD3 A;  4LYQ A;  4D6C A;  5ABF A;  4FLR A;  1JDA A;  2AMG A;  1H0I A;  4GXP A;  1W3J A;  1JDC A;  1CXF A;  1QHP A;  1FA2 A;  3GH7 A;  5I2U A;  9CGT A;  3SUR A;  1L8N A;  1E0W A;  2VTF A;  5CQ1 A;  5CG0 A;  3OLD A;  3K8L A;  2WYS A;  1QW8 A;  1ITC A;  2V3F A;  1J18 A;  1KCL A;  2WHL A;  3GTN A;  4PMZ A;  1GW1 A;  5E6Z A;  1Q6G A;  3WQW A;  1UQY A;  2G3J A;  1LJY A;  3OB8 A;  1Q6E A;  2W4X A;  1CEN A;  1VBU A;  3W82 A;  2O9T A;  1XH2 A;  1V08 A;  8A3H A;  1GQI A;  4MB4 A;  3CO4 A;  3I3D A;  3T2O A;  3MO4 A;  1BVN P;  3SCN A;  1PJ9 A;  3MUY 1;  1HJQ A;  4AD3 A;  2YKK A;  1X6N A;  5I79 A;  3BAX A;  1MYR A;  4GZE A;  3WDJ A;  2Z1K A;  3WH7 A;  1KWG A;  4OZO A;  2YDR A;  3A4W A;  3SUT A;  4M1R A;  1EO7 A;  1E4I A;  4JFW A;  4WJX A;  2Y24 A;  1QI3 A;  1J0Z A;  3CGT A;  3W0K A;  1MQP A;  3WF4 A;  1W9B M;  1MQQ A;  4P8V A;  2YL6 A;  3THD A;  4MDO A;  3M46 A;  1CPU A;  4LXF A;  1E6N A;  2VRK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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