5FIPA

Discovery and characterization of a novel thermostable and highly halotolerant gh5 cellulase from an icelandic hot spring isolate
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
MVKKPSLAGRLKIIEIDGRKTLGDQHGNPIQLRGMSTHGLQWFPQIINNNAFSALSKDWEANVIRLAMYVGEGGYSTDPSVKEKVIEGINLAIKNDMYVIVDWHILNPGDPNAKIYSGAKEFFKEIASKYPNDLHIIYELANEPNPTESDITNDIAGWEKVKKYAEPIIKMLRDMGNENIIIVGNPEWSTRPDLAVNDPIDDKNVMYSAHFYTGSASVWENGNKGHIARNIEKALENGLTVFVTEWGTSEASGDGGPYLNEADEWLEFLNSNNISWVNWSLANKNEASAAFLPTTSLDPGNGKVWAVNQLSLSGEYVRARIKGIPYKPISR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery and Characterization of a Thermostable and Highly Halotolerant Gh5 Cellulase from an Icelandic Hot Spring Isolate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GH5 CELLULASE
molecule tags Hydrolase
total genus 123
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fipA00
4BQ2A 2WC7A 2D0HA 4D6CA 3FW6A 3AMDA 2ZUNA 3MMUA 1Z32X 2J7CA 3MO4A 1CXEA 2J8FA 2OSXA 3TTOA 4WJXA 3AJ7A 4UFIA 1EOMA 4B9YA 3VD4A 4QAWA 3GXMA 1VRXA 4CGTA 3W38A 1FHLA 4M24A 4EKJA 3AXHA 4PMVA 4UQEA 1CENA 2BHYA 4TX8A 1JXKA 1XH2A 2OWXA 3AROA 4A4AA 3VPLA 3AQUA 1TG7A 1XRVA 2J74A 1TVNA 3LPOA 4H04A 1UR0A 1ZB5A 2G4FA 2BVDA 5BCAA 4PMRA 1JF5A 2J79A 2XTKA 1DWGM 3OBAA 1B1YA 1VBUA 1W3JA 3A4WA 1QHZA 3AIVA 4P8VA 3VDBA 5AY7A 4UOZA 3VIGA 2VO5A 1EO5A 3WNKA 1PIFA 1W1VA 2YA1A 2PWGA 4UFHA 1Q6FA 3ZQ9A 2WWCA 3EMQA 1D3CA 3EDFA 1OCQA 7TAAA 3GBDA 1R7AA 2E9LA 2F8QA 2FHBA 4Z2KA 1G5AA 3MUZ1 1US3A 5EBAA 3KL0A 2YA0A 4Z2LA 1H11A 2X09A 3N9KA 4V2XA 4MADA 2PC8A 3GDBA 2V3EA 3PHAA 1GW1A 2MANA 1UH2A 1V0MA 3WQ5A 1EQPA 1Y7VA 3WH5A 4HOXA 3GYCA 3AFBA 1CPUA 2IXUA 4QLLA 4CU8A 5C8BB 2DSKA 2VOTA 4FLRA 2ZUUA 1AMYA 2JEPA 4YPJA 3ZJ8A 4CCEA 3MUIA 3MMDA 1JZ2A 5ABFA 2JF6A 3PZGA 4JL2A 2AAAA 1HVXA 4PEEA 1VJSA 1HKKA 4H41A 4UFLA 1HJSA 4UFJA 4EK7A 4MB4A 1CNVA 5CG0A 2Z1KA 4AIEA 1PZ2A 1QI3A 1BTCA 2XSBA 5A8OA 3OLEA 3FHAA 3DYPA 4AZHA 3EDKA 3CUHA 5A6AA 3UETA 1WP6A 4B3LA 1E3ZA 2ZIDA 1UKSA 2XGBA 2WVSA 3W6LA 1R8LA 1TA3B 1Q6DA 3AMLA 3GNPA 4AZCB 4B16A 4NSBA 4J3WA 4TVUA 3NDZA 3AHTA 1B30A 2PBGA 2ESCA 1V02A 4QP0A 1JYXA 3WEZA 5DFAA 3G6MA 1E40A 2XFYA 3D5HA 4JCMA 1OINA 5ABHA 1OGBA 4AZ5A 3KWXA 2NT1A 2J62A 4UOQA 1B3YA 2AOSA 5BXPA 1QBAA 3HN3A 1C3FA 1UHVA 3CBWA 1QVBA 4N42A 4CN1A 2W67A 1FA2A 3WNMA 4B3KA 1JYNA 1W91A 3VO0A 3TP4A 3FHQA 3DYMA 1MW3A 2VQTA 1V3HA 4CCDA 2TAAA 1CXKA 1XD0A 1FH8A 1HXJA 2JIEA 2VCAA 4XB3A 3WDQA 3T2PA 1ZJBA 4UCFA 5M5DA 4P7QA 3BAWA 2WMJA 5HPOA 3W82A 4AZIA 1CEOA 3UEQA 3PZOA 1CXLA 4W7WA 1ZL1A 4JIEA 1CXIA 3POCA 1TUXA 1UD6A 3WD0A 4RE3A 1JZ4A 4X9YA 7CGTA 1BLIA 1BPLB 2GJRA 1KCLA 4HP5A 5CSUA 4ML4A 3WH7A 2WKGA 2YKKA 2V3DA 3RM9A 5I3DA 5E09A 3U57A 3WFZA 2EJ1A 5I6SA 3KEHA 2PI6A 3DECA 1GJWA 3ZT5A 1GPFA 3AS2A 4HOZA 4JFUA 4FLSA 2EPLX 4WLCA 4MJ4A 1J12A 3AYRA 3NSNA 1EQCA 4W85A 2VX7A 3BMWA 3N1AA 1V0LA 3RIKA 1WDQA 2EEXA 1DHKA 3VDAA 1WE5A 4OOZA 5BXRA 4RL3A 2J78A 1MFVA 3II1A 3MUY1 3VINA 3VIKA 5FL0A 2ZXQA 1JL8A 1UD5A 3WUBA 5E9AA 3ARXA 1WDRA 4HA3A 1ISZA 2QPSA 4JFVA 1W1YA 2BNJA 1IZKA 3JUGA 1NWRA 3QHNA 4M56A 1E70M 5ABGA 3AXXA 4CVUA 1ZJAA 3VIHA 5LA2A 1OBAA 1LL6A 2QHAA 1JAKA 2Q8XA 3WF3A 3WSUA 4J27A 2ZX5A 3SCWA 2FHFA 1PBGA 2VNCA 2WMKA 1R87A 1TCMA 4JKLA 5IXEA 1JI1A 1JNEA 1PJ9A 3WH6A 2ZUMA 3SEPA 1KR1A 1BGGA 1IV8A 4KWUA 4GKLA 3W25A 3N17A 3FNDA 3IK2A 2YOCA 1SYTA 3CMGA 1WB0A 9CGTA 1C92A 1EO7A 3L4ZA 3SCRA 3ZOAA 1W3LA 2PWHA 5LA0A 2UWFA 3BC9A 5FCZA 4GI8A 2VX5A 1LJYA 2WVTA 2QMKA 3GNRA 2JFEX 1RP8A 4PMDA 1LL7A 3MSDA 1NWUA 3OLIA 2EPNA 4TXEA 1US2A 1WKYA 1AVAA 4J7RA 1L8NA 2YL8A 2WB5A 4IPLA 2XSAA 2XG9A 2XIBA 4PMNA 2PBOA 3IJ9A 1QHPA 3M7SA 1JFHA 4QFUA 1BVZA 4GZJA 3BAKA 3U5UA 1DEDA 2XYLA 4R27A 2VQUA 1V3IA 1V3MA 3PBGA 1E3XA 3SCOA 4DWSC 4UQCA 2WMIA 4MNLA 3T0DA 3G6LA 1H0IA 1BQCA 3WNLA 1R86A 2BY0A 4W8BA 1HJWA 1KBKA 1EDGA 2WC4A 5IHRA 4JKKA 2Y24A 3RM4A 5FOOA 1UR1A 1UKTA 5EFFA 5E6YA 2G41A 5GQBA 3VD5A 4ZFMA 3T09A 2JALA 1E6QM 3TTSA 3GXFA 4D71A 1EGZA 3L2LA 3L2MA 1K9TA 4H8HA 1TA3A 1CYGA 1E0VA 3N18A 1ITXA 1TE1A 4AZCA 3PTMA 3IAQA 1HIZA 1JDDA 2XVKA 4CU7A 1HVQA 2YIHA 1UUQA 4W7VA 3VMOA 4OBRA 2XWEA 5A8NA 3RILA 1ZU8A 3ZO9A 1KQYA 3KE0A 5BRQA 3NJ3A 2X05A 1UWRA 1HNYA 3VOCA 3L4VA 1E6ZA 2VRJA 3EMZA 2OYLA 3NDYA 5A8QA 1NH6A 3VDCA 4NRRA 2DSUA 1BG9A 2VT0A 1A3HA 3AOFA 4PMOA 2DT2A 2J7FA 5ABEA 1FFQA 1CXHA 1CGUA 1OM0A 2CXGA 3IAPA 5I77A 4D1JA 2WAGA 4UQBA 2XVPA 1GCYA 1J0IA 3W26A 2ZX6A 5JBFA 1JYVA 1UKPA 4OJYA 4TTGA 2WANA 2HISA 4AMCA 2BXZA 2C8NA 1UQZA 3A47A 4U5KA 3GH5A 4P8UA 4W84A 1UKQA 1GORA 4PTWA 2XFRA 3WMCA 3SURA 3TA9A 4S3KA 1E73M 1HKIA 3D3AA 4ZXOA 3EDDA 1HN1A 1Q4NX 2BS9A 3AHVA 7A3HA 2X0YA 2CERA 4AD0A 1JZ6A 1LL4A 3RMEA 1VEMA 2D0GA 4WKFA 4C7FA 3ARPA 4WKHA 5DEZA 3SCTA 5CQ1A 1VAHA 5A2AA 1H2JA 2CPUA 5I5RA 3RDKA 4AD5A 1E6NA 1JXJA 1J18A 4V27A 1B3VA 1TZ7A 4MAZA 4D6IA 2YDQA 1O7AA 1G9HA 3K1DA 4PMUA 3U5YA 4UR9A 3ARYA 1G94A 2C7FA 4JFWA 5LYRA 1O6IA 1H41A 2VMFA 2VZOA 2O9PA 4M80A 1QBBA 3WDPP 4J3UA 1QNRA 3BAIA 5BXSA 3CLWA 4OUEA 4IUGA 1N82A 4HZ7A 1FH7A 4PTMA 1HJVA 3VVGA 4DM2A 3WL1A 2BHUA 2CBUA 4W88A 3OGSA 4D72A 1MVYA 1HJQA 1OD0A 1W9XA 4UQ9A 1NOUA 1W9PA 1ODZA 1W3KA 3QGVA 3VGFA 1EH9A 3WQVA 1CGXA 1C91A 3K8KA 2G3IA 4R5EA 1UQYA 3CIVA 2ZXAA 3ZT6A 2YLAA 1OD8A 2X1IA 4KGLA 2VZVA 2JIWA 1GOKA 1XSJA 2DH2A 5I23A 3KZSA 4FK9A 2GSJA 3FXYA 2CESA 3GBEA 4Q7NA 1J9YA 2JEQA 3AHZA 4LXFA 4EANA 2UY4A 1H0GA 3WF4A 1UH4A 4D6DA 4F9DA 1VEOA 1UYQA 5A6SA 1E6XM 1MQQA 4U2YA 1RP9A 6TAAA 1V03A 5JUVA 2J47A 1QNPA 5JBDA 1NQ6A 4YN5A 2WLYA 2VJXA 4F8XA 4IPNB 3VIJA 1GUVA 1H1NA 1PPIA 1FP8A 3U7BA 3W4RA 1AQ0A 2PWFA 1XV8A 1D2KA 1G0CA 4J3TA 1VJZA 1NP2A 3VGEA 2WCAA 1KGUA 5GNZA 5CLWA 3OLDA 1QNOA 4HOWA 1BYAA 4PTXA 4PN2A 5I0DA 1C8YA 3WUGA 2D23A 1WDPA 2WHJA 4MB3A 4PRWA 2YJQA 1HL8A 5CPQA 5M3WA 2OSYA 1TMQA 1UR8A 2XPKA 1BGAA 1IT0A 4MTVA 2J25A 1H49A 4JKMA 3VIFA 2PWDA 3F5JA 4E4PA 3WELA 4DUXA 5I79A 4AEEA 3QOMA 4WIWA 1LF1A 1JGIA 3ARQA 5GPRA 4HU8A 1P6WA 4LYPA 1KXVA 4TVDA 3ZT7A 4IM4A 1LG2A 2ZX7A 4AW7A 3VM7A 4XUYA 4PMXA 3SCSA 1UKOA 2BY1A 4H2CA 2WNWA 2DGAA 4TOQA 4GINA 1B9ZA 3T2QA 2GUYA 5IFTA 1R85A 5HNNA 5M03A 2VRKA 1LWJA 5JIPA 4AD3A 1UG6A 4DWSB 2XVNA 3A4XA 3DHPA 2X0HA 2FH6A 2YA2A 1D7FA 2NSXA 3AIBA 5A3HA 5D9PA 2C0HA 2YBTA 1WNOA 4LX4A 3TOPA 1HP5A 2D2OA 3VIMA 1YHTA 1FFRA 3OIHA 1NWTA 4PMQA 1BHGA 1FH9A 4E8DA 4P8WA 3WDRA 2ZX8A 4CCCA 1E71M 1JDCA 2QLYA 1OT2A 3WIJA 3WUFA 1CTNA 3GM8A 3AMGA 1H3GA 4E2OA 3ZM8A 1M04A 2YLLA 5CGTA 2DIJA 1KWKA 4QCFA 5EMYA 2WZIA 2VVNA 4FLOA 2WHLA 4UZSA 4AIUA 1PX8A 2DH3A 4TUFA 3I3BA 1UD2A 1V3KA 3OGVA 4CN4A 3WMSA 2Y8KA 3BMVA 3CH9A 1V0KA 4UOJA 4HZ8A 4L4PA 5E70A 3VMPA 4CVWA 2Z1SA 3NCOA 5GNYA 2XVGA 5BYWA 1L0PA 1E4IA 4ZEPA 1CDGA 4PSPA 5D9MA 2VCBA 1XGZA 5A69A 2XFFA 2W92A 4P7RA 5E0FA 1CLVA 1E43A 2EO7A 2VURA 1PX3A 1GOIA 2WK2A 3VM5A 2CCRA 3DYOA 1NP0A 1J10A 4PSRA 3GXIA 1EIBA 2ZX9A 4CD8A 2CKRA 3BSHA 1QI4A 4JHOA 1JZ7A 3A6OA 1ESWA 2VX6A 4RE4A 4AC1X 5CXPA 3GH4A 1C8XA 4KGJA 1H09A 4GI6A 1V0NA 1QHOA 2VR4A 3CZ8A 2E3ZA 2J8GA 1HF6A 3T0BA 3WDIA 4W5ZA 3UR7A 1ZBVA 3HJEA 3OZPA 1FP9A 1DWAM 4P7OA 2QF8A 3L4TA 2EXOA 3PZQA 4MB1A 5KZ6A 3UCQA 4QDMA 3S6TA 3NUKA 5A8MA 1HP4A 2WLZA 4JZ5A 3ZR5A 4BS0A 4U31A 2E4TA 1QNSA 1XH0A 4LQ1A 5C70A 1UR2A 4YHEA 1XSIA 1GJUA 1MXDA 4BQ5A 1GNXA 3W29A 1E6PA 3UG3A 1XC6A 3OG2A 4AD1A 2VZUA 3WBAA 4X0NA 4FF5A 1UH3A 1W9VA 1QPKA 1E5JA 1C7SA 1WO2A 4HMEA 2DEPA 1OSEA 3AS1A 8A3HA 4V28A 1ISYA 1BYDA 3K4DA 4GQQA 3VUPA 1CLXA 3CZGA 4F79A 2A3CA 4HPGA 3ARSA 3T0AA 4HU0A 3FN9A 1BG4A 1CWYA 4FMVA 3K8MA 3N12A 2QMJA 2XUCA 3AS0A 1MQPA 5D8ZA 1PX4A 2E8YA 1F4HA 2IXVA 5A95A 2V5DA 2UY2A 1E9LA 1VF8A 2VUYA 4UFMA 3VD9A 4AEFA 3UR8A 2O9OA 2GJPA 3WF1A 8CGTA 3NSMA 3ARRA 3WH8A 3M6DA 1W3HA 3KL5A 3K46A 1EHNA 4CUCA 1I1XA 3BAJA 2HVMA 4PCSA 4ATDA 2DQXA 1JZ3A 1MFUA 3PTKA 3AISA 2VVSA 2AMGA 5F7UA 1E15A 4JFTA 3RM8A 4P8XA 3WQ4A 4WSJA 4MDPA 5LA1A 1CIUA 5CPSA 1KBBA 4BA0A 4ATWA 1E5NA 4AZGA 4L4OA 3WEMA 2XWDA 4RE2A 4F66A 1UOKA 1J0JA 5HXMA 3UESA 3AHYA 3N15A 4X0VA 5EB8A 3W24A 1DWJM 3AIRA 5D4YA 1SR0A 4U3CA 2WCGA 3WQ8A 1B3WA 2ZUTA 2CNCA 1I1WA 1PEZA 2IUZA 1WZLA 1XCXA 5D8WA 1K9EA 3LMYA 2DT1A 4LYQA 1B31A 4W89A 3ZSSA 4DWSA 4H8UA 3VX0A 3GZAA 3SUWA 2XM1A 3CHDA 3VIOA 4KH2A 1BSIA 2XGIA 2E9BA 1UA7A 3ZJ6A 1CZ1A 1LWHA 2JE8A 5HPCA 3BSGA 1E72M 2V3GA 5HDRA 3VU2A 3ARWA 1ISVA 5D9OA 4BQ4A 5CJ5A 3MMWA 2YBUA 2D22A 3GNOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4BQ2 A;  2WC7 A;  2D0H A;  4D6C A;  3FW6 A;  3AMD A;  2ZUN A;  3MMU A;  1Z32 X;  2J7C A;  3MO4 A;  1CXE A;  2J8F A;  2OSX A;  3TTO A;  4WJX A;  3AJ7 A;  4UFI A;  1EOM A;  4B9Y A;  3VD4 A;  4QAW A;  3GXM A;  1VRX A;  4CGT A;  3W38 A;  1FHL A;  4M24 A;  4EKJ A;  3AXH A;  4PMV A;  4UQE A;  1CEN A;  2BHY A;  4TX8 A;  1JXK A;  1XH2 A;  2OWX A;  3ARO A;  4A4A A;  3VPL A;  3AQU A;  1TG7 A;  1XRV A;  2J74 A;  1TVN A;  3LPO A;  4H04 A;  1UR0 A;  1ZB5 A;  2G4F A;  2BVD A;  5BCA A;  4PMR A;  1JF5 A;  2J79 A;  2XTK A;  1DWG M;  3OBA A;  1B1Y A;  1VBU A;  1W3J A;  3A4W A;  1QHZ A;  3AIV A;  4P8V A;  3VDB A;  5AY7 A;  4UOZ A;  3VIG A;  2VO5 A;  1EO5 A;  3WNK A;  1PIF A;  1W1V A;  2YA1 A;  2PWG A;  4UFH A;  1Q6F A;  3ZQ9 A;  2WWC A;  3EMQ A;  1D3C A;  3EDF A;  1OCQ A;  7TAA A;  3GBD A;  1R7A A;  2E9L A;  2F8Q A;  2FHB A;  4Z2K A;  1G5A A;  3MUZ 1;  1US3 A;  5EBA A;  3KL0 A;  2YA0 A;  4Z2L A;  1H11 A;  2X09 A;  3N9K A;  4V2X A;  4MAD A;  2PC8 A;  3GDB A;  2V3E A;  3PHA A;  1GW1 A;  2MAN A;  1UH2 A;  1V0M A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4BQ2 A;  2WC7 A;  2D0H A;  4D6C A;  3FW6 A;  3AMD A;  2ZUN A;  3MMU A;  1Z32 X;  2J7C A;  3MO4 A;  1CXE A;  2J8F A;  2OSX A;  3TTO A;  4WJX A;  3AJ7 A;  4UFI A;  1EOM A;  4B9Y A;  3VD4 A;  4QAW A;  3GXM A;  1VRX A;  4CGT A;  3W38 A;  1FHL A;  4M24 A;  4EKJ A;  3AXH A;  4PMV A;  4UQE A;  1CEN A;  2BHY A;  4TX8 A;  1JXK A;  1XH2 A;  2OWX A;  3ARO A;  4A4A A;  3VPL A;  3AQU A;  1TG7 A;  1XRV A;  2J74 A;  1TVN A;  3LPO A;  4H04 A;  1UR0 A;  1ZB5 A;  2G4F A;  2BVD A;  5BCA A;  4PMR A;  1JF5 A;  2J79 A;  2XTK A;  1DWG M;  3OBA A;  1B1Y A;  1VBU A;  1W3J A;  3A4W A;  1QHZ A;  3AIV A;  4P8V A;  3VDB A;  5AY7 A;  4UOZ A;  3VIG A;  2VO5 A;  1EO5 A;  3WNK A;  1PIF A;  1W1V A;  2YA1 A;  2PWG A;  4UFH A;  1Q6F A;  3ZQ9 A;  2WWC A;  3EMQ A;  1D3C A;  3EDF A;  1OCQ A;  7TAA A;  3GBD A;  1R7A A;  2E9L A;  2F8Q A;  2FHB A;  4Z2K A;  1G5A A;  3MUZ 1;  1US3 A;  5EBA A;  3KL0 A;  2YA0 A;  4Z2L A;  1H11 A;  2X09 A;  3N9K A;  4V2X A;  4MAD A;  2PC8 A;  3GDB A;  2V3E A;  3PHA A;  1GW1 A;  2MAN A;  1UH2 A;  1V0M A; 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